序列分析
- 麥魚線粒體基因組序列測(cè)定與結(jié)構(gòu)特征分析
粒體基因組；序列分析；系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化；物種鑒定 麥魚（Rhinogobius sp.） 屬鱸形目（Perciformes），鰕虎魚亞目（Gobioidei），鰕虎魚科（Gobiidae），吻鰕虎魚屬（Rhinogobius），為安徽省池州市東至縣所特有的小型魚類之一，因盛產(chǎn)于刈麥季節(jié)而定名，與著名的廬山石魚屬于同一種類[1]。迄今對(duì)于麥魚的研究甚少，麥魚準(zhǔn)確的物種鑒定、分類地位及遺傳多樣性尚未確定，現(xiàn)僅有根據(jù)形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行的分類研究，其養(yǎng)殖潛力尚待評(píng)估與開(kāi)
河北漁業(yè) 2023年9期2023-09-28
- 河南省一例番鴨源小鵝瘟病毒株的鑒定及VP1基因序列分析
鴨；小鵝瘟；序列分析中圖分類號(hào)：S858.32 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：B 文章編號(hào)：1673-1085（2023）08-0054-05小鵝瘟（Gosling plague）是由小鵝瘟病毒（Gosling plague virus，GPV）引起的一種急性或亞急性的敗血性傳染病。該病具有傳播快、發(fā)病率高及致死率高等特點(diǎn)，給水禽生產(chǎn)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。小鵝瘟病毒主要侵害30日齡以內(nèi)的雛鵝或雛番鴨，而隨著雛鵝或雛番鴨日齡的增大，其發(fā)病率及致死率會(huì)顯著下降[1-3]。GP
家禽科學(xué) 2023年8期2023-08-28
- 信息化創(chuàng)新課堂的實(shí)踐診斷與優(yōu)化之道
進(jìn)行特征環(huán)節(jié)序列分析，借助樣本數(shù)據(jù)中教學(xué)課例的信息技術(shù)應(yīng)用特征進(jìn)行分析以了解課堂教學(xué)中的技術(shù)應(yīng)用特點(diǎn)，依據(jù)課堂教學(xué)課例視頻對(duì)教師的TPACK知識(shí)能力進(jìn)行評(píng)分。通過(guò)研究獲取技術(shù)支持下的課堂教學(xué)特點(diǎn)、課堂技術(shù)應(yīng)用特點(diǎn)、教師的TPACK知識(shí)能力現(xiàn)狀及未來(lái)的改進(jìn)提升路向，為持續(xù)推進(jìn)教師數(shù)字素養(yǎng)提升培訓(xùn)、技術(shù)與課堂教學(xué)的深度融合提供數(shù)據(jù)支撐和學(xué)理建議。關(guān)鍵詞：創(chuàng)新課堂；技術(shù)應(yīng)用；序列分析；TPACK中圖分類號(hào)：G434 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A本文系教育部教育技術(shù)與資源發(fā)展中
中國(guó)電化教育 2023年8期2023-08-26
- 教師間接語(yǔ)言助力課堂“提質(zhì)增效”
過(guò)聚類分析和序列分析對(duì)教師間接語(yǔ)言的數(shù)量結(jié)構(gòu)進(jìn)行了探索。此外，研究選取接納情感、表?yè)P(yáng)、接受或利用學(xué)生想法三類研究不足且數(shù)量較少的間接語(yǔ)言，結(jié)合定量數(shù)據(jù)對(duì)其語(yǔ)句本身的教學(xué)意義進(jìn)行了歸納與總結(jié)。研究發(fā)現(xiàn)，教師間接語(yǔ)言促進(jìn)了課堂互動(dòng)質(zhì)量提升和學(xué)生高效學(xué)習(xí)。文章最后提出了三類間接語(yǔ)言的設(shè)計(jì)和使用策略：及時(shí)接納學(xué)生感受、深度利用學(xué)生觀點(diǎn)、多運(yùn)用描述式表?yè)P(yáng)，以期為教師課堂教學(xué)提供具體的教學(xué)指導(dǎo)。[關(guān)鍵詞] 自然語(yǔ)言處理； 話語(yǔ)分析； 教師間接語(yǔ)言； 聚類分析； 序列分
電化教育研究 2023年7期2023-07-21
- 小麥光溫敏雄性不育系BS237ω-黑麥堿基因克隆及序列分析
：基因克隆：序列分析：乳糜瀉中圖分類號(hào)：S512.1：Q785 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2023） 03-0001-08黑麥（Secale cereale L.）1R染色體短臂（1RS）取代普通小麥1B染色體短臂（1BS）形成的1BL/1RS易位系攜帶了抗葉銹、條銹和白粉病等優(yōu)良基因，具有抗性好、豐產(chǎn)性好、適應(yīng)性廣等優(yōu)點(diǎn)，在育成的小麥品種中占有30％以上的比例。黑麥種子中的醇溶性儲(chǔ)藏蛋白被稱作黑麥堿（seca-lin），1RS的引入使
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年3期2023-05-30
- 紡織品霉變微生物的分離純化與鑒定
NA-ITS序列分析，并在NCBI核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)里比較序列同源性，鑒定為5個(gè)種，分別為謝瓦式曲霉、指狀青霉、聚曲多霉、米根霉和黑曲霉。文章利用形態(tài)學(xué)方法結(jié)合ITS序列分析鑒定霉菌種類，使得獲取結(jié)果更加快速和精準(zhǔn)，為紡織品防霉基礎(chǔ)研究與抗霉材料研發(fā)提供參考。 關(guān)鍵詞： ?棉織物;霉菌;形態(tài)學(xué);序列分析;純化與鑒定中圖分類號(hào)： TS117.6 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)： 1001 7003（2022）03 0040 05引用頁(yè)碼： 031106DOI： 10.
絲綢 2022年3期2022-03-19
- 雞傳染性喉氣管炎實(shí)驗(yàn)室診斷與序列分析
斷;PCR;序列分析中圖分類號(hào)：S816.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：B文章編號(hào)：1673-1085（2022）01-0006-06傳染性喉氣管炎（infectious laryngotracheitis， ILT）是由傳染性喉氣管炎類病毒（infectious laryngotracheitis virus， ILTV）引起的雞的一種急性、高度接觸性呼吸道傳染病。該病主要侵害雞喉頭和氣管的上皮細(xì)胞，同時(shí)也對(duì)鼻竇、氣囊和肺等組織產(chǎn)生影響，其特征為呼吸困難、咳嗽，喉和氣
家禽科學(xué) 2022年1期2022-03-17
- 黃獨(dú)微型塊莖環(huán)阿屯醇合酶基因克隆與序列分析
序列，并進(jìn)行序列分析。通過(guò)黃獨(dú)微型塊莖轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選得到 CAS基因的核心片段，利用RT-PCR 技術(shù)獲得CAS 基因保守片段，采用cDNA末端快速擴(kuò)增（RACE）技術(shù)獲得CAS 基因的 3′及 5′末端序列，并采用生物信息學(xué)方法進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明，黃獨(dú)微型塊莖CAS基因編碼序列長(zhǎng)2 280 bp，編碼814 bp的氨基酸序列，相對(duì)分子量為86 665.17 u，等電點(diǎn)為 6.21。CAS蛋白主要是由α螺旋（3366%）、延伸鏈（21.62%）以及無(wú)
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2022年4期2022-03-11
- 侵染廣西番茄的番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定
分子鑒定; 序列分析中圖分類號(hào)： S 436.412.11文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2020278Molecular identification of Tomato yellow leaf curl virus in Guangxi provinceSU Qin1#， CUI Lixian1#， CHEN Qimin2， XIE Huiting1， CHEN jinqing1，QIN Bixia1， ZHU Yingzhi
植物保護(hù) 2021年5期2021-10-12
- “SH6”蘋果矮化中間砧SnRK2基因的克隆及生物信息學(xué)分析
征。[結(jié)果]序列分析表明，SnRK2的CDS序列長(zhǎng)度：SnRK2.6為956 bp，SnRK2.7為1 013 bp，SnRK2.8為1 072 bp，分別編碼318、337和357個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì);SnRK2蛋白無(wú)明顯的疏水性，主要定位于細(xì)胞質(zhì);3種SnRK2序列相似性較高，都具有PKc_like超級(jí)家族和S_TKc家族特有的結(jié)構(gòu)。[結(jié)論]這3種SnRK2基因可能在蘋果非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用。關(guān)鍵詞?“SH6”;SnRK2;非生物脅迫;基因克隆;序列
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年9期2021-06-22
- 芒果細(xì)菌性角斑病菌內(nèi)切葡聚糖酶基因的克隆與表達(dá)分析
糖酶;克隆;序列分析中圖分類號(hào)：S435? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：ACloning and Expression Analysis of Endo-1，4-β-D-glucanase Gene of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicaeYAO Quansheng， YANG Qian， LIU Feng*， ZHAN RulinSouth Subropical Crops Research Institute， Ch
熱帶作物學(xué)報(bào) 2021年4期2021-06-15
- 毛頭鬼傘漆酶基因的預(yù)測(cè)及其生物信息學(xué)分析
生物信息學(xué);序列分析;三維結(jié)構(gòu)中圖分類號(hào)： S188文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2021）05-0067-08漆酶（laccase，E.C.1.10.3.2）也稱對(duì)苯二酚氧化還原酶，能對(duì)酚類物質(zhì)進(jìn)行單電子氧化，利用氧作為最終的電子受體，生成水作為唯一副產(chǎn)品。漆酶主要參與生物合成、木質(zhì)素降解、形態(tài)發(fā)生及色素的生物合成等過(guò)程[1]。漆酶廣泛存在于植物[2]、真菌[3]、細(xì)菌[4]和昆蟲[5]中，真菌漆酶參與黑色素的產(chǎn)生、子實(shí)體的形成及植物發(fā)病
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年5期2021-04-22
- 新西蘭兔RBM4基因的克隆、序列分析及組織表達(dá)
基因;克隆;序列分析;表達(dá);新西蘭兔中圖分類號(hào)： S852.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2021）02-0033-04收稿日期：2020-11-09基金項(xiàng)目：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)（編號(hào)：CARS-43-C-1）。作者簡(jiǎn)介：魏后軍（1986—），男，江蘇南京人，碩士，助理研究員，主要從事家兔疾病防治與獸醫(yī)生物技術(shù)研究。E-mail：whj280941235@126.com。通信作者：王芳，博士，研究員，主要從事家兔重要疫病致病機(jī)制
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年2期2021-03-22
- 廚余垃圾堆肥腐熟降解菌株的篩選與鑒定
S rDNA序列分析進(jìn)行菌株種屬的鑒定，菌株Y1、Y3均屬于芽孢桿菌菌屬（Bacillus），其中菌株Y1為枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis），菌株Y3為貝萊斯芽孢桿菌（Bacillus velezensis）。關(guān)鍵詞：腐熟降解菌;纖維素酶活性;序列分析;芽孢桿菌中圖分類號(hào)：S182;S141.4?? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2021）23-0213-06收稿日期：2021-07-02基金項(xiàng)目：國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年23期2021-01-02
- 癭蚊科3種昆蟲核糖體DNA的克隆及序列分析
克隆、測(cè)序及序列分析，并對(duì)ITS-1在麥紅吸漿蟲4個(gè)地理種群中的遺傳變異情況進(jìn)行分析。結(jié)果表明，從3種昆蟲中獲得的核糖體DNA序列包括：部分的18S rDNA（44 bp）、28S rDNA（37 bp），全部的ITS-1（487～535 bp），5.8S rDNA（121 bp）及ITS-2（336～352 bp）序列。3種昆蟲ITS序列的堿基差異百分比在17.21%～29.59%之間，共含有206個(gè)變異位點(diǎn)。ITS-1序列在麥紅吸漿蟲4個(gè)地理種群中比較
植物保護(hù) 2020年6期2020-12-28
- 基于數(shù)據(jù)場(chǎng)與3-D圖形表示的DNA序列分析
-I基因? 序列分析中圖分類號(hào)：Q78 ? ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1672-3791（2020）07（c）-0027-03DNA Sequence Analysis Based on Data Field and 3-D Graphical RepresentationZHENG Zhuo1? ZHAO Jialing1? LI Chun2*（1.School of Mathematics and Physics， Bohai Univ
科技資訊 2020年21期2020-12-24
- 番茄黃化曲葉病毒侵染危害海南番茄及其分子特征
;分子鑒定;序列分析;海南中圖分類號(hào)： S432.41? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A 文章編號(hào)：2095-1191（2020）08-1970-07Tomato yellow leaf curl virus infecting tomato in Hainanand its molecular characteristicsTANG Ya-fei1，2， ZHOU Yang3， ZHANG Li1， LI Zheng-g
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年8期2020-11-02
- 基于rDNA-ITS序列的甘肅甘南野生羊肚菌遺傳多樣性分析
S;羊肚菌;序列分析;甘肅甘南中圖分類號(hào)： S646.701 ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A ?文章編號(hào)：1002-1302（2020）17-0081-04羊肚菌（Morchella spp.）是羊肚菌科羊肚菌屬所有種類的總稱，是一類經(jīng)濟(jì)價(jià)值很高的珍稀野生食（藥）用真菌，具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值[1]。據(jù)有關(guān)資料顯示，羊肚菌含有多種生理活性物質(zhì)，尤其是蛋白質(zhì)含量極為豐富，同時(shí)還含有人體必需的各類氨基酸、維生素和鐵、鋅等多種礦質(zhì)元素[2-3]。在羊肚菌的分類學(xué)研究中
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年17期2020-10-26
- 長(zhǎng)春花茉莉酸-異亮氨酸合成酶CrJAR1生物信息學(xué)分析與原核表達(dá)
酸合成酶， 序列分析， 三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)， 原核表達(dá)中圖分類號(hào)：Q943文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：1000-3142（2020）08-1181-07Abstract：Catharanthus roseus can produce a variety of terpeniod indole alkaloids， including a variety of natural anti-cancer， but the biosynthesis content is v
廣西植物 2020年8期2020-10-20
- 雞皮刺螨病的PCR診斷及18S rRNA·ITS·28S rRNA基因序列分析
刺螨;診斷;序列分析中圖分類號(hào) S831.7 ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A文章編號(hào) 0517-6611（2020）18-0104-03Abstract An ectoparasite infection occurred in a laying hen farm in Jiangsu Province. It was suspected to be Dermanyssus gallinae disease by clinical inspection and micr
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年18期2020-10-09
- 柑橘大實(shí)蠅NPC2基因的序列分析和組織表達(dá)模式
C2基因; 序列分析; 組織表達(dá)模式中圖分類號(hào)： Q 966， S 436.66文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2019235Sequence analysis and tissue expression pattern of Niemann-Pick type C2 gene in Bactrocera minaxCHEN Jian， WANG Zhaoxiang， YANG Ling， YE Haixia， MAO Li， G
植物保護(hù) 2020年4期2020-08-25
- “自上而下”高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法分析德谷胰島素的序列
自上而下”的序列分析策略，采用高分辨串聯(lián)質(zhì)譜法對(duì)德谷胰島素的氨基酸序列及B鏈C末端側(cè)鏈非蛋白修飾序列進(jìn)行了全面的分析。優(yōu)化了德谷胰島素的還原條件及串聯(lián)質(zhì)譜的碰撞條件，結(jié)果表明，聯(lián)合使用50 mmol/L三（2-羧乙基）膦及6 mol/L鹽酸胍，在45℃下反應(yīng)40 min即可充分還原德谷胰島素為兩條獨(dú)立的肽鏈;還原產(chǎn)物經(jīng)Accucore C18色譜柱分離，采用靜電場(chǎng)軌道阱高分辨串聯(lián)質(zhì)譜分析，當(dāng)高能碰撞誘導(dǎo)裂解能量分別為20（A鏈）與25（B鏈）時(shí)，可獲得最豐
分析化學(xué) 2020年8期2020-08-21
- 蝴蝶蘭PhNAC1基因序列分析及對(duì)低溫脅迫的響應(yīng)
低溫脅迫， 序列分析中圖分類號(hào)： Q785;Q786 ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼： A文章編號(hào)： 1000-3142（2020）06-0845-09開(kāi)放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID） ：Abstract： NAC transcription factors are involved in many processes of plant development， which play an important role in stress response. The
廣西植物 2020年6期2020-07-30
- 羰基鐵對(duì)小鼠腸道大腸桿菌豐度的影響
物;胃腸道;序列分析，DNA;大腸桿菌;小鼠[中圖分類號(hào)] R574.4;R378.21 ?[文獻(xiàn)標(biāo)志碼] A ?[文章編號(hào)] 2096-5532（2020）02-0137-03doi：10.11712/jms.2096-5532.2020.56.072 [開(kāi)放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID）][網(wǎng)絡(luò)出版] http：//kns.cnki.net/kcms/detail/37.1517.R.20200417.1001.020.html;2020-04-1
- 兔出血癥病毒2型的分離鑒定與序列分析
vp60基因序列分析和病毒復(fù)制試驗(yàn)，對(duì)采集的病死家兔肝臟樣本進(jìn)行病原鑒定。HA結(jié)果顯示，部分病死家兔的肝臟樣本不能引起血凝現(xiàn)象;RT-PCR結(jié)果顯示，樣品中出現(xiàn)了RHDV2的特異性條帶。對(duì)新發(fā)現(xiàn)毒株cDNA的RT-PCR產(chǎn)物進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，所擴(kuò)增vp60基因核苷酸序列與經(jīng)典RHDV vp60基因核苷酸序列的一致性為77.5%～80.1%，與RHDV2 vp60基因核苷酸序列的一致性為93.6%～96.1%，并且與RHDV2處于同一個(gè)進(jìn)化分支。病毒復(fù)制試驗(yàn)結(jié)
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2020年2期2020-05-27
- 百日菊白粉菌的分子檢測(cè)與鑒定
轉(zhuǎn)錄間隔區(qū);序列分析中圖分類號(hào)：S435.672? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A? 文章編號(hào)：1002-1302（2020）06-0098-06百日菊（Zinnia elegans Jacq.）別稱百日草，為中藥材，以全草入藥。百日菊也是一年生草花主栽品種之一，其色彩豐富，花大、艷麗，花期長(zhǎng)達(dá)百日，故得百日菊之美名。白粉病是百日菊常見(jiàn)的最重要病害之一，在生長(zhǎng)區(qū)幾乎每年都普遍發(fā)生[1-3]。百日菊被白粉菌侵染后，最初葉片出現(xiàn)白色粉狀斑點(diǎn)，后病斑擴(kuò)大或相連成片，發(fā)病后期葉
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年6期2020-05-21
- 16種微生物蛋白酶的生物信息學(xué)分析
物;蛋白酶;序列分析;生物信息學(xué);理化性質(zhì);蛋白結(jié)構(gòu);信號(hào)肽中圖分類號(hào)： S188+.3文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2020）04-0065-08收稿日期：2018-12-14基金項(xiàng)目：北京市自然科學(xué)基金（編號(hào)：2182019）;北京市教育委員會(huì)項(xiàng)目（編號(hào)：1-PXM2018-014306-000057/7）;國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金（編號(hào)：51708005）;北京電子科技職業(yè)學(xué)院重點(diǎn)課題（編號(hào)：2019-KXZ）;北京市優(yōu)秀人才資助
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年4期2020-04-16
- 交互行為分析軟件GSEQ在課堂觀察中的應(yīng)用
的規(guī)律。滯后序列分析法能解決這一問(wèn)題，交互行為分析軟件GSEQ能夠有效地處理行為序列數(shù)據(jù)，幫助分析課堂中的師生交互模式。本文以小學(xué)科學(xué)課的觀察數(shù)據(jù)為例，通過(guò)數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)處理、數(shù)據(jù)分析三個(gè)步驟完成交互行為分析?！娟P(guān)鍵詞】序列分析;GSEQ;數(shù)據(jù)處理;數(shù)據(jù)分析【中圖分類號(hào)】G434? 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A【論文編號(hào)】1671-7384（2020）02、03-116-04GSEQ軟件介紹GSEQ是一種用于分析基于時(shí)間先后順序的觀測(cè)數(shù)據(jù)的計(jì)算機(jī)程序。它可以計(jì)算各種簡(jiǎn)
中小學(xué)信息技術(shù)教育 2020年3期2020-04-03
- 白樺8個(gè)MYB基因的克隆及其序列分析
MYB基因;序列分析中圖分類號(hào)： S188文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2019）18-0093-05收稿日期：2018-05-15基金項(xiàng)目：黑龍江省教育廳項(xiàng)目（編號(hào)：1352MSYYB002）;研究生創(chuàng)新項(xiàng)目（編號(hào)：kjcx2018-80mdjnu）。作者簡(jiǎn)介：王蓮萍（1994—），女，黑龍江省鶴崗人，碩士研究生，主要從事植物分子生物學(xué)與基因工程研究。E-mail：928718821@qq.com。通信作者：任如意，博士，教授，主要從事植
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年18期2019-11-28
- 一株新城疫病毒Ｆ基因的克隆及其遺傳進(jìn)化分析
基因;克隆;序列分析;遺傳進(jìn)化;雞中圖分類號(hào)：Q78? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：0439-8114（2019）15-0132-04DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.15.031? ? ? ? ? ?開(kāi)放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID）：Cloning and genetic evolution analysis of one strain of newcastle disease virusXU
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年15期2019-09-15
- 苧麻BnNramp2基因的克隆與生物信息學(xué)分析
基因;克隆;序列分析;苧麻中圖分類號(hào)：S563.101文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)： 1000-4440（ 2019） 03-0749-04重金屬是主要的環(huán)境污染物之一，所有重金屬對(duì)生物都有潛在的危害作用[1-6]。天然抗性相關(guān)巨噬細(xì)胞蛋白家族（Natural resistance-associated macrophage protein， NRAMP）是一類廣泛存在于微生物、植物、動(dòng)物中的古老且高度保守的膜整合蛋白家族，參與大多數(shù)有機(jī)體的金屬離子（如Fe2+
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年3期2019-09-10
- 青花菜BoMYB基因的克隆與序列分析
息學(xué)手段進(jìn)行序列分析，包括尋找同源序列、同源序列蛋白質(zhì)翻譯比對(duì)、分析翻譯所得蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和二級(jí)結(jié)構(gòu)，預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)域和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。從青花菜中克隆得到的BoMYB基因，其編碼263個(gè)氨基酸，蛋白序列中具有2個(gè)SANT結(jié)構(gòu)域。對(duì)比在擬南芥中的研究推測(cè)，該基因可能在滲透脅迫響應(yīng)中起作用。系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明，BoMYB與歐洲油菜的MYB聚為一組，它們與擬南芥的MYB處于不同分支。對(duì)BoMYB基因的克隆與序列進(jìn)行分析，為探究青花菜MYB基因的表達(dá)、功能及抗逆機(jī)理
種子科技 2019年1期2019-09-10
- 亞麻COBRA基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析
A基因家族;序列分析;系統(tǒng)進(jìn)化分析中圖分類號(hào)：S565.9 ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A ? ? ?文章編號(hào)：1001-1463（2019）09-0033-06doi：10.3969/j.issn.1001-1463.2019.09.009Abstract：The COBRA gene encodes the glycosylphosphatidylinositol anchoring protein， which is a regulator of seco
甘肅農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-09-10
- 小麥TaBESl/BZR1基因的克隆及其在祖先種和六倍體小麥中的序列比較
/BZRl;序列分析中圖分類號(hào)：$512.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1000-4440（2019）01-0238-03高溫、凍害、土壤鹽漬化等非生物脅迫已經(jīng)成為小麥穩(wěn)產(chǎn)高產(chǎn)的重要限制因素。解決這一問(wèn)題的根本途徑在于培育抗逆性強(qiáng)的小麥新品種，并在生產(chǎn)上進(jìn)行大面積應(yīng)用，而挖掘和利用與抗逆性密切相關(guān)的關(guān)鍵基因能夠?yàn)榕嘤鼓嫘詮?qiáng)的小麥品種提供重要的基因資源，因而與抗逆性相關(guān)的信號(hào)通路及信號(hào)通路上的關(guān)鍵基因的功能及序列特征的解析業(yè)已成為研究人員關(guān)注的熱點(diǎn)。油菜素
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年1期2019-09-10
- 菜粉蝶HSP20基因的克隆及溫度脅迫下表達(dá)分析
;基因克隆;序列分析;溫度脅迫;表達(dá)分析中圖分類號(hào)： S433.4? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A 文章編號(hào)：2095-1191（2019）02-0286-06Abstract：【Objective】Heat shock protein 20 gene（HSP20） from Pieris rapae was cloned and its expression under temperature stress was detected
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2019年2期2019-09-10
- 高活性纖溶酶菌株篩選與基因克隆表達(dá)
基因克隆; 序列分析; 表達(dá)中圖分類號(hào)：Q939.9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1008-0457（2019）02-0001-07 ? ? 國(guó)際DOI編碼：10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2019.02.001Abstract： In this study， 13 Maotai-flavor producing strains isolated from samples such as daqu， fermented grains and
山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報(bào) 2019年2期2019-09-10
- 大花杓蘭親環(huán)素基因的克隆及生物信息學(xué)分
統(tǒng)發(fā)育樹(shù)， 序列分析中圖分類號(hào)：Q949.95文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：1000-3142（2019）05-0633-08Cloning and bioinformatics analysis of cyclophilin gene（CmCyP） from Cypripedium macranthumFU Yajuan1，2， ZHANG Jian3， LIU Huan1， HOU Xiaoqiang1，2*（ 1. College of Life Scie
廣西植物 2019年5期2019-09-10
- 廣東省番茄黃化曲葉病毒的分子鑒定及序列分析
分子鑒定; 序列分析中圖分類號(hào)： S 432.41文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2018333番茄黃化曲葉病是世界范圍內(nèi)嚴(yán)重影響番茄生產(chǎn)的一種重要病害，已給熱帶和亞熱帶地區(qū)的番茄生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失[1]。在我國(guó)，蔡健和等1994年首次在廣西報(bào)道了該病害的發(fā)生[2]。2006年以來(lái)，番茄黃化曲葉病在全國(guó)范圍大面積暴發(fā)和流行。在廣東，何自福等2003年率先報(bào)道番茄黃化曲葉病危害番茄[3]，到目前為止，廣東省幾乎所有番茄產(chǎn)區(qū)均有該病害的
植物保護(hù) 2019年4期2019-09-04
- 侵染‘舞美’蘋果的蘋果銹果類病毒檢測(cè)與全序列分析
-PCR; 序列分析中圖分類號(hào)： S 432.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼： ADOI： 10.16688/j.zwbh.2018233蘋果銹果病在遼寧[1]、新疆[2]、山東[3]、河北[4]等蘋果主產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生，近年來(lái)呈不斷蔓延趨勢(shì)，已成為制約我國(guó)蘋果產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展的主要限制因子。該病的病原為蘋果銹果類病毒Apple scar skin viroid （ASSVd），屬于馬鈴薯紡錘塊莖類病毒科Pospiviroidae蘋果銹果類病毒屬Apscarviroid[5]。AS
植物保護(hù) 2019年4期2019-09-04
- 椰子織蛾CSP基因的克隆與序列分析
;基因克隆;序列分析;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)中圖分類號(hào)： S433.4? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A? 文章編號(hào)：1002-1302（2019）03-0043-03高度發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)對(duì)昆蟲與環(huán)境中的化學(xué)信息聯(lián)系具有重要作用。昆蟲在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中，發(fā)展演變出復(fù)雜的化學(xué)信息感受機(jī)制。例如，在覓食、尋偶、產(chǎn)卵等行為中，通過(guò)敏銳的嗅覺(jué)、味覺(jué)、觸覺(jué)等功能，感受各種環(huán)境化學(xué)因子的刺激，從而進(jìn)行精巧的化學(xué)通信，以適應(yīng)環(huán)境選擇，保持種群繁衍[1]。昆蟲發(fā)達(dá)的化學(xué)感受系統(tǒng)功能的發(fā)揮是基于昆蟲
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年3期2019-08-10
- 豬流行性腹瀉毒株S基因分離鑒定及序列分析
毒;S基因;序列分析中圖分類號(hào)：S858.285.3?? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A? 文章編號(hào)：1002-1302（2019）11-0071-03豬流行性腹瀉病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）引起的豬流行性腹瀉病（porcine epidemic diarrhea，PED）是一種高死亡率的腸道傳染病，會(huì)在豬群中引起各個(gè)年齡段豬暴發(fā)急性腹瀉，多發(fā)于仔豬和胎豬，其臨床癥狀主要以豬水樣腹瀉、嘔吐和脫水為主。1971年，英國(guó)首
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年11期2019-07-22
- 中華鱘免疫分子CD22的克隆及生物信息學(xué)挖掘
;CD22;序列分析;功能預(yù)測(cè)中圖分類號(hào)? ? S917.4? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼? ? A? ? ? ? 文章編號(hào)? ?1007-5739（2019）09-0204-03Abstract? ? In order to study the structure of CD22 and its possible corresponding functions，the Acipenser sinensis CD22 cDNA（CsCD22）was clone
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技 2019年9期2019-07-03
- 江蘇省揚(yáng)州市水仙病毒檢測(cè)鑒定與序列分析
經(jīng)克隆測(cè)序和序列分析發(fā)現(xiàn)，所得序列包含3種不同的類型，分別與水仙普通潛隱病毒 Narcissus common latent virus （NCLV）、水仙退化病毒 Narcissus degeneration virus （NDV）和水仙黃條病毒Narcissus yellow stripe virus （NYSV）有93%、98%和99%的相似性，表明江蘇水仙受到了NCLV、NDV、NYSV 3種病毒侵染。這是江蘇水仙上第一次發(fā)現(xiàn)NCLV、NDV、NY
植物保護(hù) 2019年6期2019-02-10
- 豬流行性腹瀉病毒ＨＢ２０１６０２株的分離鑒定及Ｓ１基因序列分析
;分離鑒定;序列分析;系統(tǒng)發(fā)育樹(shù);遺傳變異中圖分類號(hào)：S852.65+1 ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：0439-8114（2019）24-0227-05DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.24.055 ? ? ? ? ? 開(kāi)放科學(xué)（資源服務(wù)）標(biāo)識(shí)碼（OSID）：Isolation and identification of HB201602 strain of porcine epidemicdiarr
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年24期2019-02-06
- 杜梨響應(yīng)鹽脅迫CIPK01的克隆及表達(dá)分析
IPK基因;序列分析;基因表達(dá);抗逆基因;抗逆機(jī)制中圖分類號(hào)： S661.201文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2019）21-0115-05收稿日期：2018-08-03基金項(xiàng)目：國(guó)家自然科學(xué)基金（編號(hào)：31372051、31772287）;江蘇省自然科學(xué)基金（編號(hào)：BK20151361）。作者簡(jiǎn)介：王影（1993—），女，安徽宿州人，碩士研究生，主要從事果樹(shù)種質(zhì)資源與分子育種研究。E-mail：1759068060@qq.com。通信作者
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年21期2019-01-03
- 一株犬瘟熱病毒部分基因片段的特性分析
測(cè)；L基因；序列分析犬瘟熱（canine distemper，CD）是一種由犬瘟熱病毒（can‘inedistemper virus，CDV）引起的多宿主的烈性、急性、高度接觸性的病毒性傳染病。CDV可引發(fā)多種動(dòng)物患病，致死率極高。CD分布全球，很多國(guó)家和地區(qū)均有報(bào)道家養(yǎng)或野生動(dòng)物感染CD的案例，同時(shí)在過(guò)去的幾十年中，其感染宿主范圍在不斷擴(kuò)大。我國(guó)很多地區(qū)大型毛皮動(dòng)物養(yǎng)殖場(chǎng)、動(dòng)物園甚至保護(hù)區(qū)內(nèi)均有動(dòng)物感染CD而死亡的報(bào)道。同時(shí)國(guó)寶大熊貓、旗艦物種東北虎等多
中國(guó)動(dòng)物保健 2018年3期2018-12-27
- 大白菜、蘿卜蕪菁花葉病毒系統(tǒng)進(jìn)化及CP序列分析
；系統(tǒng)進(jìn)化；序列分析中圖分類號(hào)：S436.341.1+1+S436.31 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2018）08-0100-06Phylogenetic Evolution and CP Nucleotide Sequence Analysis ofTuMV in Chinese Cabbage and RadishWu Bin1， Zhang Mei1， Jiang Shanshan1， Zhang Ansheng1，Cui Han
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年8期2018-11-22
- 云南切梢小蠹熱激蛋白20基因克隆及序列分析
）進(jìn)行克隆和序列分析，為研究該蟲在高溫環(huán)境下的抗逆機(jī)制打下基礎(chǔ)?！痉椒ā坎捎胏DNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)（Rapid amplification of cDNA ends，RACE）克隆云南切梢小蠹成蟲TynHSP20基因cDNA序列，并對(duì)其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析?！窘Y(jié)果】克隆獲得的TynHSP20基因cDNA序列長(zhǎng)671 bp，含開(kāi)放閱讀框597 bp，5'端非編碼序列和部分3'端非編碼序列分別為44和33 bp。該基因編碼198個(gè)氨基酸，預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)分子量為
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年12期2018-09-10
- 芒果乙烯受體ETR1和ERS1基因的克隆及序列分析
；基因克隆；序列分析中圖分類號(hào)： S667.703.6 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：2095-1191（2018）06-1053-08Abstract：【Objective】Ethylene receptor ETR1 and ERS1 genes（MiETR1 and MiERS1） from mango（Mangnifera indica L.） were cloned，and bioinformatics analysis was conducted
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2018年6期2018-09-10
- 沙田柚生長(zhǎng)素響應(yīng)基因SAUR的鑒定及序列分析
53。氨基酸序列分析表明，該基因編碼的氨基酸與克萊門柚和甜橙SAUR基因編碼的氨基酸的同源性分別為100%、99%。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示，沙田柚SAUR基因與克萊門柚和甜橙的親緣關(guān)系很近，屬同一進(jìn)化分支。[結(jié)論]研究結(jié)果可為今后深入研究沙田柚自交不親和機(jī)理提供參考。關(guān)鍵詞 沙田柚；自交不親和；SAUR基因；序列分析中圖分類號(hào) S188 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611（2018）22-0081-04Abstract[Objective]To stud
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年22期2018-05-14
- 大鼠MKK3蛋白的生物信息學(xué)分析
；MKK3；序列分析；生物信息學(xué)分析中圖分類號(hào) Q789 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A 文章編號(hào) 0517-6611（2018）13-0114-04Bioinformatic Analysis of Rat MKK3 ProteinZHAO Xiaofeng，WU Guimei，JIN Lei et al（National Demonstration Center for Experimental Basic Medical Science Education， Xuzh
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年13期2018-05-14
- 青楊天牛觸角味覺(jué)受體基因的鑒定
；味覺(jué)受體；序列分析中圖分類號(hào) S763.38 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 0517-6611（2018）13-0111-03Identification of Saperda populnea Antennal Gustatory Receptor GeneWANG Jiatong1， ZHANG Jian2， CHENG Bin2 et al（1.School of Life Sciences， Northeast Normal University，
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年13期2018-05-14
- 青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的克隆、序列分析及原核表達(dá)
了測(cè)序鑒定和序列分析，同時(shí)構(gòu)建了原核表達(dá)載體pET28a（+）-RPL11，轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL21（DE3）后利用IPTG 誘導(dǎo)外源蛋白質(zhì)表達(dá)并利用SDS-PAGE凝膠電泳檢測(cè)?！窘Y(jié)果】成功擴(kuò)增出了青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長(zhǎng)序列，得到了重組蛋白。【結(jié)論】青稞核糖體蛋白基因HbRPL11的CDS全長(zhǎng)序列大小為543 bp。經(jīng)生物信息學(xué)分析，HbRPL11編碼的蛋白質(zhì)含有181個(gè)氨基酸，相對(duì)分子質(zhì)量為24KD，理論等電點(diǎn)（pI）為5.17，總
農(nóng)家科技下旬刊 2017年9期2017-11-12
- 大鯢泛素結(jié)合酶玞gsUBE2L3基因克隆及其在免疫應(yīng)答中的表達(dá)分析
BE2L3；序列分析；免疫應(yīng)答中圖分類號(hào)S966.6文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào)0517-6611（2017）22-0093-05Abstract[Objective] To study the role of ubiquitinconjugating enzyme cgsUBE2L3 gene during the immune response in Chinese giant salamander （Andrias davidianus）. [Method]
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年22期2017-10-14
- 沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鑒定及序列分析
脂肪酶基因；序列分析；鑒定中圖分類號(hào)： S666.301文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2017）11-0045-04[HS）][HT9.SS]植物自交不親和是指具有完全花且能夠產(chǎn)生雌雄配子，雌蕊的柱頭或花柱能特異性識(shí)別與自體基因型相同的花粉，導(dǎo)致花粉不萌發(fā)或花粉管停止生長(zhǎng)的一種現(xiàn)象[1]。在高等植物中，據(jù)估計(jì)有超過(guò)一半的顯花植物表現(xiàn)出自交不親和性，這種現(xiàn)象在被子植物中尤其明顯[2]。自交不親和對(duì)植物保持遺傳多樣性以及雜種優(yōu)勢(shì)有著極其重要的作
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年11期2017-08-12
- 新城疫病毒SD強(qiáng)毒株全長(zhǎng)cDNA克隆的構(gòu)建及序列分析
的成功構(gòu)建和序列分析為后續(xù)的反向遺傳操作奠定了關(guān)鍵的技術(shù)基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞：新城疫病毒；基因組全長(zhǎng)cDNA；重組質(zhì)粒；序列分析中圖分類號(hào)：S852.65+9.5：Q781 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2017）07-0012-04Abstract The whole genomic cDNA sequence of SD virulent strain of Newcastle disease virus was amplified in se
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年7期2017-07-29
- 山東省芋花葉病毒病的田間調(diào)查及鑒定
病病原鑒定、序列分析和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示，芋花葉病毒的檢出率為55.9%，在5個(gè)地區(qū)皆有分布。5個(gè)DsMV分離物cp基因的核苷酸序列相似性為88.5%～91.9%，氨基酸序列相似性為93.4%～97.5%；與國(guó)內(nèi)外已報(bào)道代表性DsMV分離物cp基因的核苷酸與氨基酸的序列相似性分別為74.8%～99.4%、79.7%～99.1%。遺傳進(jìn)化分析顯示，DsMV山東分離物與日本分離物（Ds23）、中國(guó)分離物（ND和ZAN）和美國(guó)分離物（DsMV-U2）親緣關(guān)系
中國(guó)蔬菜 2017年7期2017-07-10
- 新疆油雞禽流感病毒Xj14分離株P(guān)A基因的克隆與序列分析
基因；克??；序列分析中圖分類號(hào)： S852.65+7文獻(xiàn)標(biāo)志碼： A文章編號(hào)：1002-1302（2017）08-0020-03禽流感（avian influenza，AI）是由A型流感病毒（avian influenza virus，AIV）引起的病毒性傳染病。自Homme等1966年從威斯康辛州患有溫和呼吸道疾病的火雞中分離到第1株H9N2亞型禽流感病毒之后，該亞型病毒在世界范圍內(nèi)呈廣泛流行的趨勢(shì)[1-4]。我國(guó)1994年首次從廣東省的發(fā)病雞群中分離到
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年8期2017-06-30
- 洋蔥AcPME基因的克隆及序列分析
E）；克隆；序列分析中圖分類號(hào)：S633.201文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A文章編號(hào)：1001-4942（2017）06-0007-07AbstractThe sequence of AcPME gene was obtained through rapid amplification of cDNA ends （RACE） based on the sample of onion flower bud. The GenBank accession number was
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年6期2017-06-29
- 廣西家蠶核型多角體病毒株gp64基因克隆與序列分析
基因；克?。?span id="j5i0abt0b" class="hl">序列分析；微進(jìn)化；廣西中圖分類號(hào)： S884.51 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A 文章編號(hào)：2095-1191（2017）02-0328-08Abstract：【Objective】This research aimed to understand gp64 gene conservation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus（BmNPV） Guangxi isolates and master the specific
南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 2017年2期2017-05-30