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    lysC定點突變及l(fā)ysC、asdA串聯(lián)表達對谷氨酸棒桿菌L-蘇氨酸積累的影響

    2019-03-15 05:52:12黃勤勤王慧梅梁玲黃欽耿吳松剛黃建忠
    生物技術通報 2019年2期
    關鍵詞:蘇氨酸天冬氨酸賴氨酸

    黃勤勤 王慧梅 梁玲 黃欽耿 吳松剛 黃建忠

    (福建師范大學生命科學學院 福建師范大學工業(yè)微生物教育部工程研究中心,福州 350117)

    L-蘇氨酸(L-Threonine)被認為是動物體內第二或第三限制性氨基酸,是人體和動物的必需氨基酸。已被廣泛應用于食品、飼料及醫(yī)藥行業(yè)[1-2]。目前,國內外生產(chǎn)L-蘇氨酸的主流方法是微生物直接發(fā)酵法[3-4]。其中,大腸桿菌(Escherichia coli)工程菌是目前生產(chǎn)中最為常用的宿主菌株[5]。但是由于其安全性不高,并且隨著代謝的進行,生產(chǎn)過程中會逐漸積累一些毒素,故在醫(yī)藥行業(yè)中不能使用大腸桿菌生產(chǎn)蘇氨酸。相對來說,無致病性的安全菌株谷氨酸棒狀桿菌同樣作為氨基酸的傳統(tǒng)生產(chǎn)菌株,其優(yōu)勢就展現(xiàn)出來了。隨著谷氨酸棒桿菌模式菌株ATCC 13032測序的完成,氨基酸合成途徑及代謝調控機理逐漸清晰,以及谷氨酸棒桿菌遺傳操作體系的建立和完善,谷氨酸棒桿菌正成為氨基酸代謝工程改造的基盤菌株[6]。

    L-蘇氨酸的生物合成是以TCA循環(huán)中間代謝物草酰乙酸為前體。底物葡萄糖代謝經(jīng)過糖酵解途徑、磷酸戊糖途徑、TCA循環(huán)及C3-C4回補途徑等中心代謝途徑,由草酰乙酸經(jīng)天冬氨酸轉氨酶催化生成L-天冬氨酸,即進入L-蘇氨酸合成途徑。L-天冬氨酸經(jīng)天冬氨酸激酶(AK,編碼基因lysC)和天冬氨酸半醛脫氫酶(ASD,編碼基因asdA)兩步酶催化反應后,再經(jīng)過高絲氨酸脫氫酶生成L-高絲氨酸,經(jīng)高絲氨酸激酶生成L-磷酰-高絲氨酸,最后經(jīng)蘇氨酸合酶形成L-蘇氨酸[7]。AK由LysC基因編碼,同時受L-蘇氨酸、L-賴氨酸、L-甲硫氨酸的協(xié)同反饋抑制。天冬氨酸激酶(AK,編碼基因lysC)是合成L-蘇氨酸中的關鍵酶之一,控制天冬氨酸族合成途徑總碳流量。因此,通過對一些經(jīng)傳統(tǒng)育種方法選育得到的L-蘇氨酸生產(chǎn)菌進行組學研究分析,發(fā)現(xiàn)AK和ASD是該合成途徑上影響L-蘇氨酸產(chǎn)量的關鍵酶之一[8]。

    圖1 L-蘇氨酸的生物合成途徑

    Dong等[9]將谷棒桿菌的lysC基因第279位突變點A突變?yōu)門解除了L-賴氨酸和L-蘇氨酸反饋抑制的能力。其表達lysC基因并且串聯(lián)表達hom基因和thrB基因使部分碳流量從L-賴氨酸(50%)轉移至L-蘇氨酸,使谷氨酸棒桿菌L-蘇氨酸產(chǎn)量達到4.85 g/L。徐德雨等[10]發(fā)現(xiàn)在高產(chǎn)菌的天冬氨酸激酶AK中存在 G359D 突變,驗證突變后可阻斷賴氨酸引起的別構效應,從而有效解除賴氨酸與蘇氨酸的協(xié)同抑制。通過體外天冬氨酸激酶野生型和G359D 突變體酶活檢測,其突變體在10 mmol/L賴氨酸和蘇氨酸同時存在時酶活達到76.94%±1.61%,而野生型酶活僅4.38%±1.28%。由此可見,AK酶定點突變可解除L-蘇氨酸、L-賴氨酸的協(xié)同抑制,提高酶活,從而使碳流量更多的流向產(chǎn)L-蘇氨酸方向,達到提高L-蘇氨酸產(chǎn)量目的。

    本文以選育獲得的一株甲硫氨酸和異亮氨酸缺陷(Met-/Ile-)及 α-氨基 -β-羥基戊酸抗性(AHVr)的谷氨酸棒狀桿菌T11(Corynebacterium glutamicumT11)為出發(fā)菌株,通過基因克隆和序列分析,在已有突變的基礎上,采用PCR介導的方式對lysC基因進行定點突變,構建L-蘇氨酸高效抗反饋抑制的關鍵酶基因lysCr-asdA串聯(lián)表達組件轉化出發(fā)菌株T11,篩選獲得過量積累L-蘇氨酸工程菌株,進行搖瓶和30 L全自動發(fā)酵罐分析工程菌的產(chǎn)酸能力、細胞生長及雜酸的積累情況,為進一步的L-蘇氨酸的代謝工程改造奠定基礎。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌株和質粒 谷氨酸棒狀桿菌T11(C.glutamicumT11)本實驗室選育并保藏;大腸桿菌JM109感受態(tài)細胞,購自于全式金;穿梭表達載體pZ8-1由中國科學院微生物所李寅研究員贈送。

    1.1.2 試劑和儀器 限制性內切酶、T4 DNA連接酶、DNA Marker、PrimeStar DNA聚合酶和PCR試劑:TaKaRa寶生物公司產(chǎn)品;引物合成、sanPreP 柱式膠回收DNA試劑盒、質粒小量提取試劑盒:生工生物工程(上海)股份有限公司產(chǎn)品;點突變試劑盒Fast Mutagenesis System:北京全式金生物技術有限公司;酵母粉和胰蛋白胨:Bio Basic Inc公司產(chǎn)品;其余試劑均為國產(chǎn)或進口分析純。

    PCR儀:ABI產(chǎn)品;電泳儀:DYY-6C北京六一儀器廠;紫外分光光度計:UV-282PCS,尤尼柯(上海)儀器有限公司;電轉儀:Eppendorf 2510,艾本德中國有限公司;高效液相色譜:島津公司;30L發(fā)酵罐:鎮(zhèn)江東方生物工程設備有限公司。

    1.1.3 培養(yǎng)基 LB 培養(yǎng)基(g/L):胰蛋白胨10,酵母提取物5,NaCl 10,若為固體培養(yǎng)基,則額外添加2.0%(w/v)的瓊脂粉。

    LBG 培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基添加0.5%(w/v)的葡萄糖,若為固體培養(yǎng)基,則額外添加2.0%(w/v)的瓊脂粉。

    上述培養(yǎng)基的pH均調至7.0±0.1大腸桿菌用LB培養(yǎng)基;C. glutamicum用LBG培養(yǎng)基,其中用于C.glutamicum和E. coli的篩選標記卡那霉素使用的終濃度分別為 25 μg/mL 和 50 μg/mL。

    種子培養(yǎng)基各組成質量分數(shù)分別為:葡萄糖2.5%,豆粕提取粉2.0%,尿素0.125%,玉米漿2.0%,KH2PO40.1%,MgSO40.05%,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.05%,VB1100 μg/L,VH150 μg/L,20% 的氨水調pH 6.9±0.1。

    發(fā)酵培養(yǎng)基組成質量分數(shù)分別為:葡萄糖8%,豆粕提取粉2.0%,(NH4)2SO43.5%,玉米漿2.0%,KH2PO40.1%,MgSO40.1%,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.05%,CaCO33.0%,VB1100 mg/L,VH150 mg/L,20%的氨水調pH 6.9±0.1。

    1.2 方法

    1.2.1lysC-asdA串聯(lián)基因簇的克隆 根據(jù)C. glutamicumT11菌株的16S rDNA的序列比對結果,以谷氨酸棒狀桿菌ATCC13869基因組序列為模板,設計lysC-asdA串聯(lián)基因簇的上下游引物CA-F、CA-R。

    CA-F:5'-CGGAATTCCG GTGGCCCTGGTCGTACAGAAATATGGC-3';CA-R :5'-CGGGATCCCG TTACTTAACCAGCAGCTCAGCG-3'。其中引物CA-F帶有EcoRⅠ酶切位點和保護堿基,CA-R帶有BamHⅠ酶切位點和保護堿基(下劃線序列)。

    以C. glutamicumT11菌株基因組為模板進行PCR擴增。反應體系為50 μL:10×Ex buffer 5 μL,引物CA-F、CA-R各2 μL,基因組DNA模板0.5 μL,dNTP 2.5 μL,Ex Taq 酶 1 μL,ddH2O 補 足 至50 μL。反應條件為:95℃預變性 5 min;95℃ 40 s,57℃ 40 s,72℃ 2.5 min,35個循環(huán);72℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物1%的瓊脂糖凝膠檢測,膠回收試劑盒純化回收,備用。

    1.2.2 pZ8-1-lysC-asdA重組載體的構建 采用限制性內切酶EcoRⅠ和BamHⅠ分別對串聯(lián)基因片段lysC-asdA和穿梭表達質粒pZ8-1進行雙酶切處理,分別回收目的片段,然后用 T4 DNA ligase進行連接,連接體系參考TaKaRa ligase kit 說明書。連接反應結束后,轉化E. coliJM109感受態(tài)細胞,轉化液涂布含50 μg/mL卡那霉素的LB平板,37℃ 倒置培養(yǎng)過夜。從平板上挑選單克隆,采用驗證引物(F:5'-TTCTGGCAAATATTCTGAAATGAGC-3'和R:5'-TTCGCAACGTTCAAATCCGC-3')進行菌落PCR驗證,并挑取陽性克隆進行37℃過夜培養(yǎng),提取質粒,并對質粒進行酶切和測序驗證。

    1.2.3 PCR介導的lysC基因的定點突變 為了將lysC基因的第279位密碼子定點突變,以陽性克隆質粒pZ8-1-lysC-asdA為模板,使用攜帶突變位點的引物Cr-A-F和Cr-A-R,參考Fast Mutagenesis System說明書,進行PCR介導的定點突變,擴增,挑取抗性平板克隆進行酶切驗證,并將陽性克隆送交上海生工進行測序驗證。

    lysC基因PCR介導的定點突變引物設計如下:Cr-A-F:5'-CCGATAAGCCAGGCGAGACTGCGAAGG TTTTCCG-3';Cr-A-R:5'-CAGCCTCGCCTGGCTTATC GGAAATACCCAGAACGG-3'

    其中加粗的堿基為引入的突變堿基。提取質粒并進行測序驗證,構建的表達載體命名為pZ8-1-lysCr-asdA,具體的構建原理如圖2所示。

    1.2.4 產(chǎn)L-蘇氨酸工程菌的構建和篩選

    1.2.4.1 構建 將獲得的陽性pZ8-1-lysCr-asdA重組質粒電轉導入谷氨酸棒狀桿菌T11感受態(tài)細胞中[11]。谷氨酸棒狀桿菌T11感受態(tài)細胞按文獻制備[12],抗性平板篩選及菌落PCR驗證,構建含有表達質粒pZ8-1-lysCr-asdA的工程菌株。

    1.2.4.2 篩選 從抗性平板中挑取菌落大的陽性克隆,直接接種至每孔含有1 mL發(fā)酵培養(yǎng)基的96微孔板初篩,30℃,220 r/min培養(yǎng)48 h,檢測發(fā)酵液中L-蘇氨酸含量,并對初篩L-蘇氨酸積累較多的菌株進行搖瓶發(fā)酵復篩和遺傳穩(wěn)定性驗證。遺傳穩(wěn)定性分析為每24 h斜面?zhèn)鞔淮?,傳?代,每隔一代進行搖瓶發(fā)酵,檢測工程菌株的L-蘇氨酸產(chǎn)量。最后選取L-蘇氨酸產(chǎn)量較高且遺傳穩(wěn)定的工程菌株進行進一步的發(fā)酵分析。

    1.2.5 L-蘇氨酸工程菌株的搖瓶發(fā)酵分析 所獲得的工程菌T11/pZ8-1-lysCr-asdA經(jīng)搖瓶發(fā)酵后分析其L-蘇氨酸含量、菌體生物量以及其他氨基酸的生成情況。搖瓶發(fā)酵采用一級發(fā)酵,培養(yǎng)條件為:30℃,220 r/min發(fā)酵60 h,同時以出發(fā)菌株T11為對照菌株。氨基酸的含量采用高效液相色譜系統(tǒng)(HPLC)自動柱前衍生化法測定。色譜柱為Venusil-AA柱。采用流動相組成為水相(1 L):7.6 g無水乙酸鈉,925 mL 高純水,冰醋酸調pH至6.5;有機相(1 L):80% 乙腈。色譜條件:柱溫40℃,流量1.0 mL/min,SPD-M20A檢測器。

    1.2.6 L-蘇氨酸工程菌株的30 L罐補料分批發(fā)酵 根據(jù)搖瓶發(fā)酵特性,結合已有的發(fā)酵工藝,采用二級發(fā)酵的方式對L-蘇氨酸工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA進行補料分批發(fā)酵,考察高密度發(fā)酵情形下的L-蘇氨酸產(chǎn)率、葡萄糖的利用率及細胞生長情況,綜合評價菌株的發(fā)酵潛力。

    搖瓶種子培養(yǎng):挑一環(huán)新鮮斜面上的菌體接種至裝有 30 mL LBG培養(yǎng)基的250 mL 三角瓶中,30℃,220 r/min 振蕩培養(yǎng)12 h至對數(shù)生長中后期,?OD562nm約為 0.2×100。

    種子罐培養(yǎng):按0.33%的接種量,將搖瓶種子液轉接至含有3 L種子培養(yǎng)基的5 L種子罐中,初始攪拌300 r/min,培養(yǎng)溫度30℃,種子罐周期8 h,移種?OD562nm約為0.30×100。

    補料發(fā)酵培養(yǎng):30 L發(fā)酵罐初始裝液量為15 L,移種量 20%,初始葡萄糖濃度約125 g/L,發(fā)酵溶氧維持在25%-35%,初始攪拌轉速 300 r/min,發(fā)酵溫度30℃,流加 25%的氨水以控制 pH在6.9-7.0,發(fā)酵期間每隔2 h 取樣檢測菌體生物量及殘?zhí)?,根?jù)耗糖速率確定補料量;當殘?zhí)墙抵?5.0 g/L 以下時連續(xù)流加700 g/L 的葡萄糖,維持殘?zhí)菨舛仍?.0-10 g/L,發(fā)酵結束前4 h,停止流加葡萄糖,當殘?zhí)腔竞谋M時,發(fā)酵結束,整個發(fā)酵周期約60 h。

    2 結果

    2.1 lysC-asdA串聯(lián)基因的克隆

    以谷氨酸棒狀桿菌生產(chǎn)菌T11基因組為模板,引物CA-F、CA-R為引物對擴增出一段約2 300 bp條帶,并對目的產(chǎn)物進行膠回收(圖3),其與相似基因組ATCC13869的lysC-asdA的理論大?。? 324 bp)基本一致。

    圖3 lysC-asdA基因PCR擴增及回收

    2.2 pZ8-1-lysC-asdA重組載體的構建及l(fā)ysC的定點突變

    轉化經(jīng)酶切的質粒與目的基因,長出單菌落后隨機挑取9個單克隆,用驗證引物直接進行菌落PCR驗證,隨機挑取的8個單克隆均為陽性克?。▓D4-A),篩選菌落PCR陽性的單克隆進行質粒抽提和單切和雙切驗證,確認質粒pZ8-1中插入大小約為2 400 bp的目的片段(圖4-B)。另外,測序結果顯示插入的基因片段確為目標片段,確認pZ8-1-lysC-asdA構建成功。

    值得注意的是,克隆的lysC-asdA基因較親緣關系最近(相似性為99%)的ATCC13869存在顯著差異,其lysC基因的ORF區(qū)域有多達8個堿基的突變,其中6個為無義突變,但該突變在理論上都與密碼子識別相關,另外兩個堿基的突變都導致了氨基酸的突變;asdA基因也有4個堿基的突變,但都是無義突變,這4個堿基的突變都同樣涉及到密碼子優(yōu)化的問題。這極有可能和出發(fā)菌株T11本身經(jīng)歷過多輪次的誘變選育有關。pZ8-1-lysC-asdA質粒載體經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ酶切后,出現(xiàn)7 000 bp和2 400 bp的兩條帶,與預期結果一致。

    A. 重組表達質粒pZ8-1-lysC-asdA的菌落PCR驗證;B. pZ8-1-lysC-asdA質粒的酶切驗證;(A:M:200 bp Ladder DNA marke;1-7:重組表達質粒pZ8-1-lysC-asdA菌落PCR驗證;8:pZ8-1空質粒對照;9:T11出發(fā)菌株對照;B:M:λ-Hind Ⅲ digest DNA marker;1:pZ8-1-lysC-asdA質粒經(jīng)BamHⅠ單酶切;2:pZ8-1質粒經(jīng)BamHⅠ單酶切;3:pZ8-1-lysC-asdA質粒經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切)

    為進一步提高lysC基因的抗反饋抑制的能力,采用PCR介導的方式對lysC基因進行另一關鍵位點的定點突變。獲得的陽性克隆中提取質粒并進行測序分析,結果顯示,突變后的lysCr-asdA基因與突變前的基因差異在第279位密碼子由GCT突變成ACT,所編碼的氨基酸由丙氨酸變?yōu)樘K氨酸,與定點突變設計目標一致,表明表達載體pZ8-1-lysCrasdA構建成功。

    2.3 工程菌株獲得及其篩選

    將獲得的含有抗反饋抑制突變的串聯(lián)表達質粒 pZ8-1-lysCr-asdA電轉化至L-蘇氨酸菌株C.glutamicumT11感受態(tài)細胞,采用含卡那霉素抗性平板進行篩選,隨機挑取單菌落,驗證引物F和R組成的引物對其進行菌落PCR鑒定,結果顯示在約2 800 bp的特異條帶,與理論預測大小一致,說明外源質粒導入宿主菌株,成功獲得含有表達載體的工程菌。

    挑選了300個單克隆進行96孔板初篩,并從中獲得10株生長速度較快且L-蘇氨酸含量較高的菌株進行搖瓶復篩和遺傳穩(wěn)定性驗證。結果顯示,選取的10株相對高產(chǎn)的菌株中,幾株菌株傳至第二代遺傳穩(wěn)定性逐漸降低,在斜面?zhèn)髦恋谌鷷r,產(chǎn)酸明顯下降,再繼續(xù)傳代,L-蘇氨酸產(chǎn)量下降最高達到14.4%。相對而言,其中一株菌株L-蘇氨酸產(chǎn)量最高,而且穩(wěn)定性維持在較高水平,具備進行進一步發(fā)酵驗證和分析的潛力,將該工程菌株菌株命名為T11/pZ8-1-lysCr-asdA。

    2.4 工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA搖瓶發(fā)酵產(chǎn)L-蘇氨酸能力分析

    為了分析工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA發(fā)酵合成L-蘇氨酸的能力,將其與菌株T11/pZ8-1和T11/pZ8-1-lysC-asdA及出發(fā)菌株T11在相同條件下進行搖瓶發(fā)酵培養(yǎng),考察L-蘇氨酸濃度、主要雜酸情況及菌株生物量(OD562nm),結果見表1。

    從L-蘇氨酸的生物合成和生物量來說,菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA的L-蘇氨酸的濃度和細胞密度都最高,T11/pZ8-1-lysC-asdA次之,這說明串聯(lián)基因簇的表達對于L-蘇氨酸的合成與積累作用顯著,而且通過調控其他氨基酸的生物合成,一定程度上對細胞的生長代謝帶來了益處;轉入空載體pZ8-1/T11菌株無論是細胞密度還是L-蘇氨酸濃度都是最低的,這可能與空載體在宿主細胞內消耗了一定的能量,從而影響細胞繁殖和氨基酸的代謝合成有關。

    表1 T11/ pZ8-1-lysCr-asdA發(fā)酵性能比較

    另外,從主要雜酸的生物合成情況來看,出發(fā)菌T11與對照菌株T11/pZ8-1的賴氨酸、丙氨酸、和甘氨酸含量接近,而含有串聯(lián)基因簇的工程菌株,其丙氨酸含量顯著降低,但賴氨酸和甘氨酸含量有所提高,說明lysC-asdA的串聯(lián)表達加速了前體物丙酮酸的轉化,有效地將碳流量引入了合成蘇氨酸的合成途徑,顯著提高天冬氨酸族合成代謝流,但這其中碳流向不僅包括蘇氨酸的生物合成,還有一部分流向了賴氨酸的生物合成,而甘氨酸作為蘇氨酸的降解途徑之一,其生物合成的增加意味著更多的蘇氨酸在細胞內被降解。

    相比較T11/pZ8-1-lysC-asdA與T11/pZ8-1-lysCrasdA菌株,lysC基因的突變對于L-蘇氨酸的生物合成有積極意義,其進一步提高了lysC基因編碼產(chǎn)物抗反饋抑制的能力,增強了L-蘇氨酸生物合成代謝流。而對于提高 L-蘇氨酸產(chǎn)量,lysCr-asdA的定點突變和串聯(lián)表達較lysC-asdA串聯(lián)表達具有更顯著的作用。

    2.5 工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA 30L罐的補料分批發(fā)酵

    為進一步分析T11/pZ8-1-lysCr-asdA工程菌株的代謝情況,以出發(fā)菌株T11為對照,在30 L 全自動發(fā)酵罐中進行補料分批發(fā)酵,考察菌株的發(fā)酵生產(chǎn)性能。發(fā)酵過程代謝曲線見圖5,工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdAL-蘇氨酸發(fā)酵產(chǎn)量達65.5 g/L,糖酸轉化率達 39.5%,較出發(fā)菌株分別提高29.5%和33.9%。

    發(fā)酵0-16 h,菌株處于適應期,細胞密度均增長較慢,但細胞的耗糖速率有差別,工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA的耗糖速率明顯要大,說明其細胞更為活躍,代謝更為旺盛;發(fā)酵16 h之后,細胞均進入對數(shù)生長期,菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA在發(fā)酵24 h開始流加補糖,36 h時達到最大菌濃,其最大菌濃時OD562nm為112.6,補糖時間和達到最大菌濃時間均較對照菌株提前6 h,最大菌濃也較對照菌株T11高16.8%;發(fā)酵36 h后,L-蘇氨酸的積累速率明顯加快,兩者均在發(fā)酵56 h時達到最大的產(chǎn)酸率,隨著發(fā)酵的進行,L-蘇氨酸的積累和生物量在56 h和60 h之間降低,因此,發(fā)酵在60 h終止。

    3 討論

    AK是整個天冬氨酸族氨基酸合成途徑上的第一個關鍵酶,由lysC基因編碼,控制合成天冬氨酸族氨基酸的碳流量。ASD是繼AK后另一個關鍵限速酶,這兩個基因的轉錄皆受L-賴氨酸、L-蘇氨酸反饋阻遏調控。故對于構建天冬氨酸族氨基酸如L-賴氨酸、L-甲硫氨酸、L-蘇氨酸、L-異亮氨酸高產(chǎn)菌株具有重要意義。Kalinowski等[13-14]發(fā)現(xiàn)lysC基因與asdA基因是同一基因簇的相鄰基因,其中l(wèi)ysC基因編碼蛋白由兩個亞基α和β相互重疊組成,而當β亞基中的一個堿基發(fā)生改變時,整個AK蛋白表現(xiàn)抗反饋特性。本研究以一株Met-、Ile-和蘇氨酸結構類似物抗性的蘇氨酸產(chǎn)生菌為出發(fā)菌株,在獲得已鑒定突變的基礎上,進一步對lysC基因的第279位密碼子進行定點突變,核苷酸由GCT突變?yōu)锳CT,所編碼的氨基酸由丙氨酸突變蘇氨酸,氨基酸由疏水性變?yōu)橛H水性,這可能進一步改變AK的分子構象,可能Ala279位點具有穩(wěn)定配體Lys與AK結合的作用,從而加強了Lys對AK的反饋抑制。故將該位點改變打破了其與Lys間的非共價鍵作用,從而解除賴氨酸對天冬氨酸激酶的反饋抑制,削弱L-蘇氨酸和L-賴氨酸對AK酶抑制能力,同時提升了磷酸-天冬氨酸對AK的親和能力,從而增強L-蘇氨酸代謝流。這一點,與工程菌株的蘇氨酸生物合成和積累的情況一致,lysC的突變有效的提高了蘇氨酸合成的碳流量,使L-蘇氨酸產(chǎn)量提高。

    加速限速反應作為菌株選育的常用策略,除了解除終產(chǎn)物的反饋抑制手段之外,關鍵酶基因的高效表達則更能從關鍵酶的表達量上實現(xiàn)限速反應的加速進程。Ishida等[15]通過構建重組質粒pDR34,在乳糖發(fā)酵短桿菌同時串聯(lián)表達了hom、thrB和thrC基因,發(fā)酵72 h使得L-蘇氨酸產(chǎn)量從17.9 g/L達到24.8 g/L。Dong等[16]將谷氨酸棒桿菌ATCC 13869 敲除ddh基因和lysE基因使蘇氨酸產(chǎn)量提高28%,賴氨酸的量降低95%,同時串聯(lián)表達lysC、hom和thrB基因進行72 h搖瓶發(fā)酵驗證蘇氨酸含量達到7.27 g/L。本研究以強啟動子tac作為起始元件,在已有菌株特性的基礎上,串聯(lián)表達抗反饋抑制的關鍵酶基因,極大的提高了蘇氨酸產(chǎn)量。但在甲硫氨酸和異亮氨酸合成受阻的基礎上,蘇氨酸的另一支路——賴氨酸的合成同樣得到了增強,不僅如此,作為蘇氨酸的分解代謝產(chǎn)物之一的甘氨酸的含量也有所增加,其實這些都和關鍵酶基因表達之后的代謝流增強有關。這也提示我們在關注蘇氨酸積累的同時,需要進一步系統(tǒng)的考慮其他的支路代謝和氨基酸轉運體系,比如阻斷蘇氨酸競爭代謝支路,即抑制或敲除賴氨酸的表達;降低蘇氨酸胞外降解途徑,即敲除合成甘氨酸相關酶基因,運用代謝流分析的原理與方法對蘇氨酸代謝途徑進行全面分析,為我們進一步的改造明確方向。

    與搖瓶發(fā)酵不同,30 L罐通過流加補料的方式保持細胞的生長和代謝性能,其目標產(chǎn)物的產(chǎn)量往往會得到大幅度的增長。值得注意的是,本研究中工程菌株T11/pZ8-1-lysCr-asdA相較出發(fā)菌株T11來說,其較出發(fā)菌株糖耗時間提前,菌株生長速度加快,最終體現(xiàn)為菌株發(fā)酵產(chǎn)酸時間提前,展現(xiàn)了更好的高密度發(fā)酵的適應性,較出發(fā)菌株其生長速率更快,原因可能一是改造后菌株的前體物丙酮酸轉化成生長抑制物如乳酸、乙酸量降低,從而減少了細胞生長的傷害,相對的加速其轉化成草酰乙酸方向,從而使碳流量更多的合成蘇氨酸的方向。二是lysCr-asdA基因與含強啟動子的pZ8-1載體串聯(lián)表達不僅使菌株的AK和ASD酶高效表達,也使碳流量方向途徑中其他的酶活得到促進,從而代謝速率加快,而且在流加補糖的過程中保持較高的L-蘇氨酸的比合成速率,這說明外源基因的表達不僅直接促進了蘇氨酸的合成,對于細胞生長和其他所需氨基酸的代謝調控也要一定的影響。

    4 結論

    本研究以一株Met-、Ile-和AHV抗性的蘇氨酸產(chǎn)生菌T11為出發(fā)菌株,在獲得已鑒定突變的基礎上,進一步對lysC基因的第279位密碼子進行定點突變同時串聯(lián)基因簇lysCr-asdA。成功構建pZ8-1-lysCr-asdA表達組件,串聯(lián)表達抗反饋抑制的關鍵酶基因,轉入出發(fā)菌株T11并通過96孔板高通量初篩和搖瓶復篩得到一株高產(chǎn)L-蘇氨酸且遺傳穩(wěn)定工程菌T11/pZ8-1-lysCr-asdA。發(fā)酵結果顯示其 L-蘇氨酸產(chǎn)量顯著提高,L-賴氨酸、L-甘氨酸含量均比出發(fā)菌株提高,而丙氨酸的含量下降,表明lysC的定點突變及l(fā)ysC、asdA基因的串聯(lián)表達對谷氨酸棒桿菌L-蘇氨酸的代謝流有明顯影響。

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