許小君 廖達文 王星琛 魏元元 黃啟超 杜鈺璐
作者單位:712046 咸陽1陜西中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院;710032 西安2空軍軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生理與病理生理學(xué)教研室
線粒體是細胞內(nèi)能量代謝的主要場所,并通過三羧酸(tricarboxylic acid,TCA)以及氧化磷酸化(oxidative phosphorylation,OXPHOS)生成三磷酸腺苷(adenosine 5'-triphosphate,ATP),為細胞各種生命活動提供能量。盡管線粒體蛋白質(zhì)由細胞核基因組編碼,但電子傳遞鏈(electron transport chain,ETC)的13 個亞單位仍由線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)編碼。因此,線粒體OXPHOS 復(fù)合體的表達、翻譯和組裝需要線粒體與細胞核之間持續(xù)進行信息交流,進而確保線粒體發(fā)揮正常生理功能[1-2]。線粒體與細胞核間的信息交流,一方面取決于核基因編碼線粒體蛋白調(diào)控線粒體功能(正向信號);另一方面線粒體可通過細胞內(nèi)信號分子,例如Ca2+、mtDNA、活性氧(reactive oxygen species,ROS)、TCA循環(huán)代謝物(如2-羥基戊二酸)等將線粒體異常以及細胞代謝變化信號呈遞給細胞核(逆行信號),細胞核通過動員一系列核轉(zhuǎn)錄因子引起重要信號通路的激活、進而促進線粒體轉(zhuǎn)錄及線粒體生物合成等過程[3-4]。
在腫瘤發(fā)生過程中,ROS生成顯著增加、mtDNA 突變大量累積等都可導(dǎo)致線粒體OXPHOS功能被抑制,進而擾亂線粒體與細胞核間的交流,引發(fā)基因表達模式的改變及腫瘤惡性進展[5]。在能量缺乏、ROS 大量產(chǎn)生情況下,線粒體可向細胞核傳遞信號,引發(fā)轉(zhuǎn)錄重編程以進行代謝適應(yīng)[1]。線粒體和細胞核之間的通信為細胞提供了一個動態(tài)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),使細胞能夠?qū)Σ粩嘧兓拇x條件或壓力作出響應(yīng)。本綜述主要討論線粒體代謝產(chǎn)物和壓力信號如何通過表觀遺傳改變調(diào)控腫瘤的進展,為進一步理解線粒體功能的復(fù)雜維度及其參與疾病發(fā)生發(fā)展的機制提供新視角。
線粒體TCA 循環(huán)代謝中間產(chǎn)物2-羥基戊二酸(2-hydroxyglutarate,2-HG)、琥珀酸以及富馬酸[6]等可作為底物,通過介導(dǎo)表觀遺傳學(xué)修飾推動腫瘤的發(fā)生和惡性進展。
異檸檬酸脫氫酶1 和2(isocitrate dehydrogenase 1 and 2,IDH1和IDH2)是人類腫瘤中常見的突變基因,多存在于膠質(zhì)瘤、急性髓細胞性白血?。╝cute myelogenous leukemias,AMLs)和骨髓增生異常綜合征(myelodysplastic syndromes,MDS)[7]。突變型IDH 將TCA循環(huán)中間產(chǎn)物α-酮戊二酸(α-ketoglutarate,α-KG)還原成2-HG[8-9],后者與α-KG 結(jié)構(gòu)相似,因此能作為α-KG 的競爭性抑制物。有研究表明α-KG 可作為組蛋白賴氨酸去甲基酶(JMJD/JHDM)[7]和DNA去甲基酶TET[10]的底物。因此,作為α-KG 類似物,2-HG 會引起DNA 及組蛋白的高甲基化,廣泛參與基因的表達調(diào)控,促進腫瘤進展[9,11](圖1)。例如,2023 年RAHME 等[12]研究表明,IDH1 和IDH2突變膠質(zhì)瘤中積累的2-HG 可競爭性抑制去甲基化酶與α-KG 結(jié)合,導(dǎo)致DNA 抑癌基因CDKN2A啟動子和致癌基因PDGFRA附近的絕緣子結(jié)合蛋白(CCCTC binding factor,CTCF)高甲基化后失活,最終驅(qū)動體內(nèi)膠質(zhì)瘤發(fā)生;2020 年SULKOWSKI 等[13]報道,2-HG、延胡索酸水合酶(fumarate hydratase,F(xiàn)H)、琥珀酸脫氫酶(succinate dehydrogenase,SDH)等代謝物的積累可通過抑制組蛋白去甲基化酶KDM4B 的活性,造成基因組廣泛H3K9me3 高甲基化,從而使DNA 同源重組修復(fù)(homology directed repair,HDR)關(guān)鍵分子TIP60 和ATM 及下游修復(fù)因子RPA、BRCA1、RAD51 等在DNA 斷裂位點富集減少,使DNA 累積突變增加,進而增加神經(jīng)膠質(zhì)瘤對多聚ADP 核糖聚合酶(poly-ADP-ribose polymerase,PARP)抑制劑的敏感。
圖1 線粒體代謝調(diào)控核基因表達示意圖Fig.1 Schematic diagram of mitochondrial metabolites regulating nuclear gene expression through epigenetic modification
近年來,琥珀酸在腫瘤生物學(xué)中的作用引起了科研人員的廣泛關(guān)注,主要原因在于SDH 的失活突變在遺傳性平滑肌瘤[14-15]、腎細胞癌[16]、胃腸道間質(zhì)瘤[17]等多種腫瘤中被檢測到,而且此種突變可導(dǎo)致腫瘤細胞內(nèi)琥珀酸的堆積。與2-HG 類似,琥珀酸也可通過與α-KG 競爭,抑制α-KG 依賴的酶活性,從而誘導(dǎo)腫瘤細胞的超甲基化表型(圖1)。例如,2019 年FLAVAHAN 等[18]報道,SDH 缺陷型胃腸道間質(zhì)瘤中DNA 甲基化異常增強,破壞致癌基因FGF3、FGF4與周圍DNA 結(jié)合絕緣體蛋白CTCF 的結(jié)合,從而導(dǎo)致上述致癌基因高表達,最終促進胃腸道間質(zhì)瘤生長。2021 年AGGARWAL 等[19]發(fā)現(xiàn),在腎透明細胞癌中由于泛素連接酶Von Hippel-Lindau(VHL)蛋白缺失,缺氧誘導(dǎo)因子(hypoxia-inducible factor-α,HIF-α)降解減少,其下游基因miR-210 表達上調(diào)而使其靶標(biāo)蛋白SDH 表達降低,琥珀酸堆積加速,從而抑制TET2 活性,促進DNA 甲基化的發(fā)生,進而顯著增強了腎透明細胞癌的侵襲能力。
此外,琥珀酸的累積還參與蛋白翻譯后修飾過程,即賴氨酸殘基的琥珀?;揎?。蛋白的琥珀酰化修飾廣泛存在于細胞質(zhì)和細胞核蛋白(如組蛋白)中。浙江大學(xué)呂志民教授團隊研究發(fā)現(xiàn),組蛋白H3K79 位點的琥珀?;瘏⑴c多個腫瘤生長相關(guān)信號分子的轉(zhuǎn)錄并促進腫瘤生長[20]。該研究表明α-酮戊二酸脫氫酶(α-ketoglutarate Dehydrogenase,α-KGDH)與組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(lysine acetyltransferase 2A,KAT2A)結(jié)合后,發(fā)揮琥珀酰轉(zhuǎn)移酶的功能,可通過琥珀?;M蛋白H3K79 促進神經(jīng)膠質(zhì)瘤生長[20]。2020 年南開大學(xué)張曉東教授課題組報道了一個新的琥珀酰轉(zhuǎn)移酶--組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶1(histone acetyltransferase1,HAT1),其可通過對組蛋白H3K122位點和糖酵解關(guān)鍵酶PGAM1 K99位點的琥珀?;揎?,促進糖酵解和肝癌細胞的生長[21]。
FH 是參與TCA 循環(huán)的一個關(guān)鍵酶,在細胞內(nèi)能催化延胡索酸(fumarate)轉(zhuǎn)變成L-蘋果酸(malate)。既往研究表明在遺傳性平滑肌瘤、腎細胞癌[22]等多種腫瘤組織中發(fā)生FH 失活性突變,導(dǎo)致延胡索酸異常積累并促進腫瘤進展。2015 年,JIANG 等[23]研究指出,延胡索酸酶的酶活性及其產(chǎn)物延胡索酸是DNA 損傷反應(yīng)的關(guān)鍵元件,延胡索酸酶缺陷可通過延胡索酸積累增多而降低組蛋白去甲基化酶KDM2B活性,導(dǎo)致組蛋白H3K36me2 增強,進而增加非同源末端連接DNA 修復(fù)和腫瘤細胞存活。2017 年,該團隊又發(fā)現(xiàn)在葡萄糖缺乏時,AMP 依賴的蛋白激酶(adenosine 5'-monophosphate-activated protein kinase,AMPK)能磷酸化FH,導(dǎo)致后者在負責(zé)生長停滯的轉(zhuǎn)錄因子ATF2基因啟動子區(qū)富集,局部高濃度延胡索酸可通過抑制去甲基化酶KDM2A 活性,導(dǎo)致H3K36me2 甲基化增強,進而促進ATF2 靶向轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致細胞生長停滯,這種反應(yīng)可被FH 磷酸化位點的糖基化抑制[21]。在高水平表達N-乙酰氨基葡萄糖轉(zhuǎn)移酶的胰腺癌細胞中,葡萄糖缺失時可通過維持高濃度的FH 糖基化,進而抑制FH-ATF2 信號通路導(dǎo)致的細胞周期阻滯,維持腫瘤細胞生長[24]。
線粒體代謝中間產(chǎn)物可作為蛋白翻譯后修飾的重要底物,該結(jié)論已受到廣泛認可。最近有研究表明,部分線粒體TCA 關(guān)鍵酶在惡性腫瘤細胞中可從線粒體轉(zhuǎn)運到細胞核而促進組蛋白修飾[25-26],進而將細胞代謝與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控直接聯(lián)系起來。例如乙?;羌毎麅?nèi)蛋白翻譯后修飾的主要方式之一。由線粒體丙酮酸脫氫酶產(chǎn)生的乙酰輔酶A(Acetyl CoA)是TCA 循環(huán)的重要代謝中間產(chǎn)物。同時,Acetyl CoA 也是蛋白乙?;闹饕孜铮稍诮M蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferase,HATs)催化下介導(dǎo)組蛋白乙酰化,從而調(diào)控基因表達(圖1)。最近有研究發(fā)現(xiàn)致癌基因KRAS和AKT的表達增多可促進線粒體內(nèi)的丙酮酸脫氫酶轉(zhuǎn)位到細胞核,并與HATs 形成復(fù)合物,從而使組蛋白乙?;?7-28]。而組蛋白的乙酰化常導(dǎo)致DNA 與組蛋白八聚體解離,核小體結(jié)構(gòu)松弛和基因的表達,進而促進腫瘤發(fā)生[29]。
ROS 是細胞代謝重要產(chǎn)物之一,包括超氧陰離子(O2-)、過氧化氫(H2O2)和羥基自由基(OH-)等[30-31]。90%的ROS 由線粒體電子傳遞鏈傳遞電子時向O2直接泄露高能電子產(chǎn)生[32]。由于O2-的強反應(yīng)活性,極易造成細胞氧化損傷,因此一旦產(chǎn)生會迅速被細胞內(nèi)超氧化物歧化酶(super oxide dismutase,SOD)轉(zhuǎn)化為H2O2[30],而后再被過氧化物酶還原為H2O(圖2)。
圖2 線粒體ROS的產(chǎn)生及其作為逆行信號調(diào)控核內(nèi)基因表達機制圖Fig.2 The production of mROS and its mechanism as a retrograde signal to regulate gene expression in the nucleus
ROS 與腫瘤的發(fā)生、浸潤和轉(zhuǎn)移關(guān)系密切。組織損傷、細胞死亡及病原感染引發(fā)炎癥遷延不愈、腫瘤中浸潤的巨噬細胞釋放NADPH 氧化酶增多、腫瘤細胞中存在的缺氧環(huán)境等[33]均可使細胞氧化還原平衡失調(diào),導(dǎo)致線粒體產(chǎn)生ROS 及中間體增多,進而激活多種信號通路促進腫瘤發(fā)生和進展。例如,在正常生理條件下,KEAP1 可與抗氧化蛋白NRF2 結(jié)合并通過泛素-蛋白酶體途徑降解后者,當(dāng)ROS 水平升高時,NRF2與KEAP1解離并易位至細胞核內(nèi),與Smaf蛋白以及ARE(抗氧化反應(yīng)元件)結(jié)合形成異二聚體,從而啟動下游細胞抗氧化基因的轉(zhuǎn)錄(圖2)。2020年,Karen H Vousden 團隊研究指出,胰腺導(dǎo)管腺癌中NRF2 的負調(diào)節(jié)因子KEAP1 突變和NRF2 的功能獲得性突變皆會導(dǎo)致NRF2 失活,從而下調(diào)抗氧化基因TIGAR的表達,使細胞抗氧化作用減弱,ROS 持續(xù)增多而激活MAPK 通路,進而促進腫瘤轉(zhuǎn)移[5]。在非小細胞肺癌細胞中,線粒體內(nèi)產(chǎn)生的過量ROS可激活腫瘤細胞和腫瘤相關(guān)成纖維細胞分泌促瘤細胞因子IL-6,進一步激活STAT3 通路,然后通過改變E-鈣黏蛋白、N-鈣黏蛋白、波形蛋白和Snail 等細胞遷移相關(guān)蛋白的表達,促進腫瘤轉(zhuǎn)移[34]。此外,腫瘤細胞缺氧,有限的氧分子充當(dāng)電子傳遞鏈中的終電子受體,使線粒體ROS 產(chǎn)生增多,進而進入細胞核穩(wěn)定HIF-1α 亞單位,并與HIF-1β 形成二聚體,驅(qū)動缺氧應(yīng)答相關(guān)基因(如促血管生成因子)表達,增加腫瘤血管生成,進一步促進腫瘤存活與增殖[35](圖2)。
細胞質(zhì)中環(huán)鳥苷酸合酶(cyclic GMP-AMP Synthase,cGAS)可識別外源DNA 并催化產(chǎn)生環(huán)鳥苷酸(cyclic-GMP-AMP,cGAMP),隨后cGAMP 會通過活化轉(zhuǎn)錄因子(stimulator of interferon genes,STING)誘導(dǎo)干擾素的表達,引發(fā)細胞的免疫反應(yīng)[36](圖3)。由于mtDNA的原核屬性,當(dāng)其由線粒體釋放至細胞漿時同樣會激活cGAS-STING信號通路。
圖3 mtDNA激活cGAS-STING 信號通路促進抗腫瘤免疫機制圖Fig.3 Mechanism diagram of promoting anti-tumor immunity by mtDNA- cGAS-STING pathway
當(dāng)腫瘤細胞應(yīng)激時,如線粒體損傷、缺氧、炎癥等都可導(dǎo)致腫瘤細胞內(nèi)mtDNA的釋放[37-38]。激活的cGASSTING信號通路可以誘導(dǎo)腫瘤細胞產(chǎn)生大量的轉(zhuǎn)錄因子IFN調(diào)節(jié)因子3(interferon regulatory factor 3,IRF3)、核因子NF-κB和干擾素-β(interferon-β,INF-β),進而激活細胞免疫,促進對腫瘤細胞的免疫識別和殺傷[39](圖3)。但也有研究表明,在腫瘤細胞中mtDNA的釋放以及cGASSTING 信號通路的激活與腫瘤進展密切相關(guān)[40-42]。2022年,KIRTONIA 等[33]研究顯示在食管鱗狀細胞癌中線粒體分裂關(guān)鍵蛋白Drp1上調(diào),可誘導(dǎo)線粒體功能障礙并誘導(dǎo)mtDNA釋放,激活cGAS-STING通路,促進腫瘤細胞增殖;2017年,SANSONE 等[43]研究表明在內(nèi)分泌治療后的乳腺癌細胞中,細胞外小泡可攜帶癌旁組織中的mtDNA 至腫瘤干細胞,激活cGAS-STING 信號通路,使腫瘤干細胞脫離休眠狀態(tài),導(dǎo)致內(nèi)分泌治療失敗。
綜上所述,線粒體-細胞核逆行信號在腫瘤細胞內(nèi)的重要通信機制有以下方面:第一,通過表觀遺傳修飾,線粒體代謝中間產(chǎn)物(如SDH、FH)和核定位線粒體代謝酶(如PDH)促進腫瘤進展。第二,過量積累的ROS 可以推動腫瘤細胞的增殖和侵襲。第三,mtDNA的釋放和識別激活cGAS-STING 信號通路促進腫瘤進展。這些機制均通過線粒體釋放的信號分子調(diào)控細胞核的基因表達和功能,從而促進腫瘤的惡性進展。深入研究線粒體-細胞核逆行信號的機制和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對理解細胞內(nèi)信號傳遞和腫瘤進展的機制具有重要意義,也有助于探索新的腫瘤預(yù)防和治療策略。