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    煙草DUF538基因家族鑒定及根結(jié)線蟲(chóng)脅迫下表達(dá)分析

    2023-12-02 22:57:51張路陽(yáng)張有建饒聰穎許燕彪謝可李偉鄭聰
    江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年20期
    關(guān)鍵詞:根結(jié)線蟲(chóng)表達(dá)分析生物信息學(xué)

    張路陽(yáng) 張有建 饒聰穎 許燕彪 謝可 李偉 鄭聰

    摘要:DUF538基因是沒(méi)有功能注釋的蛋白,在根結(jié)線蟲(chóng)脅迫的響應(yīng)過(guò)程中,含有DUF538結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)的基因表達(dá)發(fā)生變化。鑒定煙草DUF538基因家族,為煙草DUF538基因功能研究提供理論依據(jù),有利于篩選防御根結(jié)線蟲(chóng)的有效基因。基于煙草全基因組數(shù)據(jù),通過(guò)BLAST對(duì)煙草DUF538基因家族進(jìn)行鑒定,利用生物信息學(xué)的方法分析了該家族成員的理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、染色體分布、系統(tǒng)進(jìn)化及啟動(dòng)子,并利用qRT-PCR驗(yàn)證了DUF538基因家族在K326各個(gè)組織的表達(dá)情況及響應(yīng)南方根結(jié)線蟲(chóng)侵染的表達(dá)情況。結(jié)果表明,煙草中共鑒定出8個(gè)NtDUF538基因,將其分為3類(lèi);已知的NtDUF538基因位于不同的染色體上且分布不均勻,所有NtDUF538基因均具有保守的結(jié)構(gòu)域;NtDUF538基因家族啟動(dòng)子區(qū)域顯著富集生長(zhǎng)發(fā)育和激素響應(yīng)的順式元件,部分NtDUF538基因還具有低溫脅迫的作用元件;7個(gè)NtDUF538基因在K326不同組織中存在不同程度的表達(dá),NtDUF538-7基因只在葉和花中表達(dá),其中NtDUF538-5和NtDUF538-6在遭受根結(jié)線蟲(chóng)侵染后表達(dá)量增加。研究結(jié)果揭示了煙草NtDUF538基因家族成員在根結(jié)線蟲(chóng)侵染過(guò)程中起到重要作用,為探究煙草NtDUF538基因家族的生物學(xué)功能提供了理論基礎(chǔ)。

    關(guān)鍵詞:煙草;DUF538基因;全基因組鑒定;生物信息學(xué);表達(dá)分析;根結(jié)線蟲(chóng)

    中圖分類(lèi)號(hào):S572.01文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

    文章編號(hào):1002-1302(2023)20-0034-09

    煙草(Nicotiana tabacum L.)是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物,病蟲(chóng)害是制約其生產(chǎn)的主要因素之一,每年因?yàn)椴∠x(chóng)害造成的經(jīng)濟(jì)損失到達(dá)15%以上,其中煙草根結(jié)線蟲(chóng)病是煙草上危害程度深、范圍廣、防治難度大的一類(lèi)病害[1-3]。目前,有關(guān)煙草根結(jié)線蟲(chóng)病防治的研究和報(bào)道主要在化學(xué)防治和生物防治方面,但是煙草根結(jié)線蟲(chóng)病并沒(méi)有得到徹底解決。煙草抗南方根結(jié)線蟲(chóng)基因的篩選為南方根結(jié)線蟲(chóng)抗性育種提供了新的基因資源,具有重要的理論及實(shí)際意義,有著廣闊的應(yīng)用前景[4-6]。未知功能域蛋白(domain of unknown function,DUF)家族是具有1個(gè)或多個(gè)沒(méi)有功能注釋的保守結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì),目前已有超過(guò)20%的蛋白含有未知功能域[7]。DUF538基因家族已被證實(shí)具有約19~21 ku的分子量并編碼大約170個(gè)氨基酸殘基。目前DUF538家族已經(jīng)廣泛被發(fā)現(xiàn)存在于單子葉和雙子葉植物中[8-9]。但是在藻類(lèi)和藍(lán)細(xì)菌中未發(fā)現(xiàn)DUF538蛋白[10]。盡管DUF538基因家族未明確功能,但目前已經(jīng)有大量研究證明DUF538基因家族參與植物多個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答反應(yīng)。據(jù)報(bào)道含有DUF538保守結(jié)構(gòu)域的基因參與毛狀體的發(fā)育,影響葉綠素的合成[8-10]。DUF538基因的表達(dá)變化存在于植物發(fā)育的各個(gè)階段以及響應(yīng)各種非生物脅迫。Ashraf等研究表明,DUF538基因(AJ535713)在雞冠花(Celosia cristata)葉片中表達(dá),在干旱脅迫下該基因顯著上調(diào)[11-12]。另外,有一些研究顯示DUF538基因也參與生物脅迫。Xu等通過(guò)QTL定位大豆(Glycine max)抗根結(jié)線蟲(chóng)基因,發(fā)現(xiàn)具有DUF538結(jié)構(gòu)域的大豆Glyma10g02180基因可能具有抗根結(jié)線蟲(chóng)的功能[13]。在Araujo等的研究中,首次驗(yàn)證了從野生花生分離出來(lái)的DUF538基因在轉(zhuǎn)基因擬南芥中過(guò)表達(dá)可以抵抗根結(jié)線蟲(chóng)的侵染[14]。一些報(bào)道發(fā)現(xiàn)DUF538基因響應(yīng)真菌病原體的感染。Elagamey等研究發(fā)現(xiàn)DUF538基因參與馬鈴薯(Solanum tuberosum)抵抗黃萎病的途徑;Brunings 等發(fā)現(xiàn)水稻DUF538基因(Os11g0594800)在感染稻瘟病后顯著上調(diào);此外也有報(bào)道DUF538基因跟植物抵抗赤霉病和灰霉病相關(guān)[15-18]。目前尚未有關(guān)于煙草DUF538基因家族及其成員表達(dá)的報(bào)道,因此,本研究以擬南芥DUF538家族蛋白質(zhì)序列為比對(duì)條件,在煙草全基因組的基礎(chǔ)上,利用生物信息學(xué)的方法鑒定煙草8個(gè)DUF538基因,并分析其家族成員的理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化,通過(guò) qRT-PCR 技術(shù)研究基因在煙草K326品種不同組織中的表達(dá)及接種南方根結(jié)線蟲(chóng)后DUF538基因家族的表達(dá)情況。通過(guò)分析DUF538基因家族在煙草中的表達(dá),為全面了解DUF538基因家族在煙草整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的生物學(xué)功能提供了新的信息,篩選有利于防御南方根結(jié)線蟲(chóng)抗病基因。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    試驗(yàn)材料為普通煙草K326,由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)煙草學(xué)院育種實(shí)驗(yàn)室提供。

    1.2 試驗(yàn)時(shí)間及地點(diǎn)

    本試驗(yàn)于2022年9月在河南農(nóng)業(yè)大學(xué)育種實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行。

    1.3 根結(jié)線蟲(chóng)的培養(yǎng)

    南方根結(jié)線蟲(chóng)在番茄(Solanum lycopersicum L.)感病品種中擴(kuò)繁,由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)煙草學(xué)院育種實(shí)驗(yàn)室提供。待番茄根部大量根結(jié)形成時(shí),對(duì)有南方根結(jié)線蟲(chóng)卵塊的根結(jié)進(jìn)行挑選,用1% NaClO溶液消毒,去離子水沖洗多次,去除表面的NaClO,然后放置于26 ℃恒溫培養(yǎng)箱中孵化。3 d左右,收集孵化出來(lái)的二齡幼蟲(chóng)(J2s),在顯微鏡下計(jì)數(shù),然后制成500條/mL的J2s懸浮液,懸浮液需在24 h內(nèi)進(jìn)行接種處理[19]。

    1.4 煙草DUF538基因家族成員鑒定及序列特征分析

    從擬南芥數(shù)據(jù)庫(kù)(www.arabidopsis.org)中下載擬南芥所有的DUF538蛋白序列,在茄科基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(https://solgenomics.net/)中進(jìn)行比對(duì)(BLASTP,E值<100),獲得普通煙草DUF538蛋白的氨基酸序列。通過(guò)在線網(wǎng)站(https://web.expasy.org/protparam/)分析煙草DUF538蛋白的氨基酸數(shù)目、等電點(diǎn)(pI)、相對(duì)分子量大小、親水性等理化性質(zhì)。

    1.5 煙草DUF538基因家族的進(jìn)化關(guān)系分析

    將煙草DUF538基因家族蛋白序列與模式植物擬南芥的DUF538基因家族蛋白序列,利用MEGA 11軟件進(jìn)行Clustal W比對(duì),使用鄰接法(neighbor-joining method,NJ),設(shè)置參數(shù)自展值(bootstrap replications)為1 000,利用J-T-T(Jones-Taylor-Thornton)模型構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。蛋白質(zhì)序列比對(duì)使用DNAMAN軟件,使用默認(rèn)參數(shù)。

    1.6 煙草DUF538基因結(jié)構(gòu)、保守基序及結(jié)構(gòu)域分析

    通過(guò)MEME在線網(wǎng)站(http://meme-suite.org/tools/meme)對(duì)煙草DUF538蛋白序列進(jìn)行motif分析,CBLs設(shè)置Motif數(shù)量為10,其他設(shè)置使用默認(rèn)參數(shù)。保守結(jié)構(gòu)域(Domain)分析采用NCBI中的CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi);利用TBtools中Gene Structure View進(jìn)行Motif和保守結(jié)構(gòu)域的可視化。

    1.7 煙草DUF538基因家族染色體定位

    從煙草基因組的數(shù)據(jù)中獲得DUF538基因在染色體上的位置信息,利用Tbtools(v1.082)軟件構(gòu)建可視化染色體定位圖[20]。

    1.8 煙草DUF538基因家族順式作用元件分析

    通過(guò)軟件TBtools對(duì)煙草DUF538家族基因起始密碼子上游1 500 bp的啟動(dòng)子區(qū)序列進(jìn)行提取,然后通過(guò)PlantCARE數(shù)據(jù)庫(kù)(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)對(duì)煙草DUF538家族基因啟動(dòng)子區(qū)序列進(jìn)行順式作用元件分析,最后利用TBtools對(duì)結(jié)果可視化。

    1.9 表達(dá)模式分析

    利用植物總RNA提取試劑盒,分別提取根、莖、葉、花瓣、幼蕾、萼片的RNA。然后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,取RNA溶液9 μL,(dT)18 引物 4 μL,在70 ℃反應(yīng) 10 min;加入5×buffer 4 μL,dNTP(10 nm)? 2 μL,反轉(zhuǎn)錄酶0.5 μL,RNA酶抑制劑 0.5 μL,在40 ℃反應(yīng)2 h,70 ℃反應(yīng)15 min,在-20 ℃保存。

    檢測(cè)cDNA的質(zhì)量,確認(rèn)反轉(zhuǎn)錄成功后,再進(jìn)行熒光實(shí)時(shí)定量PCR。根據(jù)煙草NtDUF538的CDS設(shè)計(jì)引物(表1),將引物序列交給北京擎科生物科技有限公司進(jìn)行合成。熒光實(shí)時(shí)定量PCR采用諾唯贊生物公司的Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix,采用的20 μL體系是:2×Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix 10 μL;模板0.4 μL;水 8.8 μL;引物0.8 μL。熒光實(shí)時(shí)定量PCR程序:95 ℃ 預(yù)變性30 s;95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,40個(gè)循環(huán);95 ℃ 15 s,60 ℃ 60 s,95 ℃ 15 s,生成熔解曲線。采用2-ΔΔCT法對(duì)基因相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行計(jì)算[21]。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 煙草DUF538基因家族鑒定及基本特征分析

    以擬南芥AtDUF538核苷酸序列為檢索序列,基于煙草全基因組數(shù)據(jù)庫(kù),總共鑒定出8個(gè)煙草NtDUF538基因(表2)。煙草DUF538基因家族編碼的氨基酸長(zhǎng)度范圍為170~203個(gè)氨基酸,分子量范圍為19.119~21.967 ku,等電點(diǎn)的值范圍為8.66~9.65。除了DUF538-1蛋白GRAVY值為正,其他煙草DUF538蛋白的GRAVY值為負(fù),表明它們都是親水性的蛋白。

    2.2 煙草DUF538基因家族結(jié)構(gòu)分析

    基因結(jié)構(gòu)分析(圖1)顯示,煙草的8個(gè)DUF538基因家族成員結(jié)構(gòu)比較簡(jiǎn)單,全部具有編碼區(qū)域(CDS),NtDUF538-3和NtDUF538-4不具有非翻譯區(qū)(UTR),8個(gè)基因都具有內(nèi)含子,且所有基因都具有DUF538結(jié)構(gòu)域(圖2)。

    此外,為了更好地了解煙草DUF538蛋白序列的結(jié)構(gòu)(motif)特征,采用MEME軟件分析對(duì)保守motif和數(shù)量進(jìn)行分析,鑒定了5個(gè)不同的保守基序(圖3),依次命名為motif 1~motif 5。結(jié)果發(fā)現(xiàn),煙草DUF538家族成員保守基序均呈現(xiàn)一定的排列方式,為motif 5-motif 2-motif 1-motif 3-motif 4。每個(gè)亞組內(nèi)的DUF538蛋白大部分具有高度保守的motif,而不同的亞組具有不同的保守motif。

    2.3 煙草DUF538基因家族成員的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析及染色體定位

    為了分析煙草DUF538基因家族的進(jìn)化關(guān)系,本研究選用了模式植物雙子葉植物擬南芥與煙草共同構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。8個(gè)煙草DUF538蛋白和13個(gè)擬南芥蛋白在系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)中呈現(xiàn)了明顯的聚類(lèi)現(xiàn)象。在圖4中,根據(jù)基因聚類(lèi)DUF538基因家族可分為3類(lèi)。8個(gè)煙草NtDUF538基因中NtDUF538-1分為一類(lèi);NtDUF538-2、NtDUF538-3和NtDUF538-4分為一類(lèi);NtDUF538-5、NtDUF538-6、NtDUF538-7和NtDUF538-8歸為一類(lèi)。

    從NtDUF538基因的染色體分布情況來(lái)看,在8個(gè)煙草NtDUF538基因中,4個(gè)基因在1條染色體上呈現(xiàn)不均勻分布,其余4個(gè)基因位于未組裝到染色體上的重疊群上,其余染色體不含煙草NtDUF538基因(圖4)。

    2.5 煙草DUF538家族基因啟動(dòng)子區(qū)的順式作用元件分析

    為進(jìn)一步了解煙草DUF538啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件特征,利用TBtools提取其轉(zhuǎn)錄起始位置上游1 500 bp序列上傳到 PlantCARE網(wǎng)站查找各類(lèi)順式作用元件。發(fā)現(xiàn)4個(gè)煙草DUF538存在光信號(hào)響應(yīng)順式作用元件,推測(cè)其功能與光響應(yīng)通路有關(guān)。還鑒定到5種激素響應(yīng)元件,其中2個(gè)煙草DUF538基因含有赤霉素響應(yīng)元件(Gibberellin-responsive element),這部分家族成員會(huì)響應(yīng)赤霉素的應(yīng)答反應(yīng);1個(gè)煙草NtDUF538基因含有水楊酸響應(yīng)(Salicylic acid responsiveness)元件,這部分基因家族成員會(huì)響應(yīng)水楊酸的應(yīng)答反應(yīng);5個(gè)煙草NtDUF538基因含有茉莉酸甲酯響應(yīng)(MeJA-responsiveness)元件,這些基因家族成員會(huì)響應(yīng)茉莉酸的應(yīng)答反應(yīng);4個(gè)煙草NtDUF538基因含有脫落酸響應(yīng)(Abscisic acid responsiveness)元件,這些基因家族成員會(huì)響應(yīng)脫落酸的應(yīng)答反應(yīng);1個(gè)煙草NtDUF538基因含有生長(zhǎng)素響應(yīng)(Auxin-responsive)元件,這些基因家族成員會(huì)響應(yīng)生長(zhǎng)素應(yīng)答反應(yīng)。另外,還有與生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫相關(guān)的順式作用元件,主要包括玉米蛋白代謝調(diào)節(jié)(Zein metabolism regulation)和低溫響應(yīng)(Low-temperature responsiveness)(圖5)。綜上,DUF538基因家族可能參與煙草生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控及多種脅迫調(diào)控途徑。

    2.6 煙草DUF538基因家族成員的表達(dá)分析

    2.6.1 煙草DUF538基因在不同組織的表達(dá)分析 為了分析NtDUF538基因在不同組織或器官中的表達(dá)情況 本研究利用qRT-PCR技術(shù)分析了8個(gè)NtDUF538基因在煙草K326根、莖、葉、花、蕾、萼片中的表達(dá)情況。結(jié)果顯示,在K326中不同的NtDUF538基因的表達(dá)差異較大,NtDUF538-1、NtDUF538-3、NtDUF538-4和NtDUF538-5基因主要蕾中表達(dá)較高;NtDUF538-4、NtDUF538-5、NtDUF538-6、NtDUF538-7和NtDUF538-8在葉中表達(dá)相對(duì)較高;NtDUF538-2基因在萼片中表達(dá)較高;所有NtDUF538基因在莖中的相對(duì)較低;NtDUF538-7基因在葉和花中表達(dá)較高,在其他部位幾乎不表達(dá)(圖6)。

    2.6.2 南方根結(jié)線蟲(chóng)侵染后煙草DUF538基因的表達(dá)分析

    為了驗(yàn)證NtDUF538基因?qū)δ戏礁Y(jié)線蟲(chóng)脅迫下的表達(dá)情況,本研究利用qRT-PCR技術(shù)分析了8個(gè)NtDUF538基因在南方根結(jié)線蟲(chóng)侵染煙草0、7、14、21 d的表達(dá)情況。結(jié)果表明:NtDUF538-1基因在遭受根結(jié)線蟲(chóng)7 d時(shí)相比未接種的煙草基因表達(dá)量增加;NtDUF538-2和NtDUF538-3基因在根結(jié)線蟲(chóng)侵染后基因表達(dá)量降低,在7、14 d時(shí)基因表達(dá)量與對(duì)照相比無(wú)顯著差異,在21 d時(shí)表達(dá)量與對(duì)照具有顯著差異;NtDUF538-4在遭受根結(jié)線蟲(chóng)侵染7 d后表達(dá)量降低,然后升高再降低,而對(duì)照在遭受根結(jié)線蟲(chóng)侵染后表達(dá)量逐漸降低;NtDUF538-5在根結(jié)線蟲(chóng)侵然后表達(dá)量增高,在 21 d 時(shí)與對(duì)照表達(dá)量相當(dāng);NtDUF538-6在根結(jié)線蟲(chóng)侵染后7 d表達(dá)量增加,在14 d時(shí)顯著降低;NtDUF538-8在根結(jié)線蟲(chóng)侵染后表達(dá)量先降低再升高,在14 d時(shí)表達(dá)量最低,而對(duì)照基因表達(dá)量逐漸降低,在21 d時(shí)表達(dá)量最低(圖7)。

    3 討論

    3.1 煙草DUF538家族基因的結(jié)構(gòu)特征及功能預(yù)測(cè)

    DUF538基因已經(jīng)被證明廣泛分布在植物中,并在多個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答過(guò)程起作用。目前的研究已經(jīng)在多種植物中鑒定出DUF538家族基因,玉米含有DUF538成員20個(gè),水稻和大麥都有14個(gè),菠蘿中有8個(gè),甘藍(lán)型油菜有40個(gè),大豆有22個(gè),擬南芥有13個(gè),葡萄有9個(gè)。本研究對(duì)煙草DUF538基因家族成員[JP+2]進(jìn)行了鑒定和分析,共鑒定了8個(gè)煙草DUF538基因,低于其他物種中DUF538基因數(shù)量[22]。

    目前,順式作用元件在植物生長(zhǎng)發(fā)育、植物激素反應(yīng)和脅迫反應(yīng)中具有重要的作用。煙草DUF538基因家族包含了大量的順式作用元件,如光響應(yīng)的元件、激素響應(yīng)元件、低溫響應(yīng)元件等(圖5)。煙草DUF538基因家族亞細(xì)胞定位分析顯示煙草DUF538蛋白位于細(xì)胞核中,NtDUF538s基因可能是煙草重要的一類(lèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因,參與了煙草生長(zhǎng)發(fā)育和抵抗逆境脅迫的調(diào)控過(guò)程。盡管DUF538尚未明確功能,但最近的研究表明,它們可能在植物脅迫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用,在40多種植物中發(fā)現(xiàn),DUF538基因表達(dá)行為響應(yīng)各種非生物脅迫,包括干旱、高溫、碳水化合物缺乏和氮毒性。據(jù)報(bào)道,DUF538蛋白還參與角質(zhì)蠟的細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸,影響葉片表面滲透性和水分損失控制[12,23-26]。

    3.2 根結(jié)線蟲(chóng)脅迫下,煙草DUF538基因家族的表達(dá)

    當(dāng)植物受到病原物侵染后,體內(nèi)的抗性基因上調(diào)表達(dá)促進(jìn)寄主發(fā)生抗性反應(yīng),破壞病原物的生存環(huán)境,阻止其生長(zhǎng)發(fā)育。植物中的抗根結(jié)線蟲(chóng)病基因,如番茄中的Mi基因、辣椒中的N基因等,在遭受根結(jié)線蟲(chóng)侵染時(shí)會(huì)產(chǎn)生過(guò)敏(HR)反應(yīng),同時(shí)該基因表達(dá)量顯著升高。在本研究中具有相似的情況,NtDUF538-5和NtDUF538-6基因在遭受根結(jié)線蟲(chóng)入侵時(shí),NtDUF538基因表達(dá)上調(diào),未接種根結(jié)線蟲(chóng)的根系NtDUF538基因相對(duì)表達(dá)量差異較?。▓D7),這表明根結(jié)線蟲(chóng)的入侵促進(jìn)了NtDUF538基因的上調(diào)表達(dá)[27-28]。而且從進(jìn)化關(guān)系看,NtDUF538-5和NtDUF538-6親緣關(guān)系最近 同屬一個(gè)分支(圖4),同時(shí)也與擬南芥根結(jié)線蟲(chóng)抗性基因距離較近。在之前的研究中已經(jīng)驗(yàn)證了DUF538基因在3種不同植物物種(花生、大豆和擬南芥)的RKN易感基因型中的過(guò)表達(dá)可以提高根結(jié)線蟲(chóng)的抗性,這也是DUF538基因的首次驗(yàn)證[14]。NtDUF538-5和NtDUF538-6還具有響應(yīng)茉莉酸和水楊酸的順式作用元件(圖5)。水楊酸(SA)和茉莉酸(JA)是參與許多植物抗病途徑的主要植物防御激素。對(duì)于RKN侵染,植物在取食部位受到其分泌效應(yīng)物的影響,導(dǎo)致體內(nèi)SA和JA生物合成途徑相關(guān)基因的表達(dá)降低,從而降低SA和JA水平并抑制植物防御[29-30]?;谝陨涎芯?,煙草NtDUF538-5和NtDUF538-6可能與根結(jié)線蟲(chóng)的抗性具有一定聯(lián)系。

    4 結(jié)論

    本研究利用生物信息學(xué)技術(shù),鑒定了煙草8個(gè)NtDUF538基因,進(jìn)行了理化性質(zhì)、遺傳進(jìn)化和表達(dá)模式分析,并研究了煙草K326侵染根結(jié)線蟲(chóng)后其表達(dá)情況,研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)煙草NtDUF538-5和NtDUF538-6基因遭受根結(jié)線蟲(chóng)侵染后表達(dá)量發(fā)生顯著變化,這證明了南方根結(jié)線蟲(chóng)入侵時(shí),DUF538基因起到了關(guān)鍵作用。本研究結(jié)果將為煙草NtDUF538基因的功能研究奠定堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ),篩選有利于防治根結(jié)線蟲(chóng)的抗性基因。

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    收稿日期:2023-01-06

    基金項(xiàng)目:浙江中煙工業(yè)有限責(zé)任公司項(xiàng)目(編號(hào):NYK2022-04-03)。

    作者簡(jiǎn)介:張路陽(yáng)(1997—),男,河南鄭州人,碩士研究生,主要從事煙草育種研究。E-mail:zhangluyang97@126.com。

    通信作者:鄭 聰,碩士,農(nóng)藝師。E-mail:npyczc@163.com。

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