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    苦瓜McAPX2基因及其啟動(dòng)子的克隆與表達(dá)分析

    2016-05-30 13:16:32高山許端祥陳中釤杜文麗傅睿清溫慶放
    熱帶作物學(xué)報(bào) 2016年12期
    關(guān)鍵詞:表達(dá)分析苦瓜

    高山 許端祥 陳中釤 杜文麗 傅睿清 溫慶放

    摘 要 基于苦瓜葉片均一化文庫(kù)克隆得到McAPX2基因的cDNA全長(zhǎng)序列(GenBank登錄號(hào):KJ722767.1),采用染色體步移法獲得該基因的啟動(dòng)子序列,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)該基因在不同器官中的表達(dá)量及低溫脅迫對(duì)McAPX2表達(dá)量的影響。結(jié)果表明:McAPX2基因全長(zhǎng)1 086 bp,開放閱讀框747 bp,編碼249個(gè)氨基酸;McAPX2屬于過氧化物酶家族ClassⅠ的成員,其脂肪族氨基酸指數(shù)為83.90,是一個(gè)親水性蛋白,可推測(cè)定位于細(xì)胞質(zhì)中;與甜瓜(NP_001284378.1)、黃瓜(ACO90193.1)、南瓜(AHF27424.1)、苦瓜(AGJ72851.1)同源性較高,分別為95%,94%,94%和93%;qRT-PCR結(jié)果顯示,在苦瓜的根、莖、葉、雌花和幼果等組織器官中McAPX2的表達(dá)量存在顯著差異,其中根的表達(dá)量最大,而在葉片中的表達(dá)量最低;在低溫脅迫下,隨著脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),McAPX2表達(dá)量逐漸上調(diào),處理12 h時(shí)達(dá)到最大,隨后下降,說明該基因的表達(dá)與苦瓜耐低溫脅迫相關(guān)。分離得到McAPX2基因上游調(diào)控序列1 267 bp,其啟動(dòng)子含有與GA、ABA、CTK、乙烯等激素和病原菌等生物脅迫以及熱激、干旱、低溫、光等非生物脅迫的相關(guān)元件。

    關(guān)鍵詞 苦瓜;McAPX2基因;啟動(dòng)子;表達(dá)分析

    中圖分類號(hào) S642.5 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

    低溫脅迫打破植物細(xì)胞內(nèi)活性氧(active oxygen, ROS)產(chǎn)生和消除的平衡機(jī)制,造成活性氧含量大幅增加,引發(fā)氧化脅迫,致使植物生長(zhǎng)發(fā)育受阻,甚至死亡[1]。H2O2是一種較穩(wěn)定的ROS物質(zhì),可以輕易地穿過植物細(xì)胞膜,生成最活躍的ROS物質(zhì)——羥自由基(·OH-),進(jìn)而干擾植物細(xì)胞光電子傳遞,影響膜系統(tǒng)穩(wěn)定性,氧化大分子物質(zhì),造成細(xì)胞程序性死亡[2-4]。因此,及時(shí)清除過多H2O2對(duì)維持植物正常生理功能起重要作用。

    抗壞血酸-谷胱甘肽循環(huán)(ascorbate-glutathione cycle, AGC)是高等植物長(zhǎng)期進(jìn)化產(chǎn)生的有效清除活性氧的保護(hù)機(jī)制之一[5],抗壞血酸過氧化物酶(APX, ascorbate peroxidase)是AGC清除H2O2的關(guān)鍵酶,其以抗壞血酸(AsA)為特殊電子供體(AH2),催化H2O2還原成H2O[6-7]。目前已從多種作物克隆出APX基因,許多研究發(fā)現(xiàn)APX基因參與植物響應(yīng)氧化脅迫應(yīng)答[8-14]。

    中國(guó)南方冬春持續(xù)低溫是影響設(shè)施大棚苦瓜(Momordica charantia L.)生長(zhǎng)、發(fā)育、產(chǎn)量與品質(zhì)形成的主要限制因子,但有關(guān)苦瓜低溫脅迫分子機(jī)制研究尚未見報(bào)道。本試驗(yàn)從前期構(gòu)建的苦瓜葉片均一化cDNA文庫(kù)中獲得一個(gè)EST序列,發(fā)現(xiàn)其與抗壞血酸過氧化酶基因高度同源。本研究以該序列設(shè)計(jì)特定引物,利用RACE技術(shù)克隆出苦瓜APX基因全長(zhǎng)序列,分析其特征特性和在低溫脅迫下時(shí)空表達(dá)模式,分離并分析McAPX基因的啟動(dòng)子,為進(jìn)一步研究苦瓜APX在低溫脅迫下的功能奠定基礎(chǔ),以期為苦瓜耐低溫育種提供理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    供試材料為苦瓜強(qiáng)雌系‘24-K(Subgynoecious line,24-K),由福州市蔬菜科學(xué)研究所苦瓜課題組提供,參照高山等[14]方法,采用DSN與SMARTTM技術(shù)相結(jié)合構(gòu)建苦瓜葉片均一化全長(zhǎng)cDNA文庫(kù),基因克隆與表達(dá)在福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所內(nèi)完成。

    1.2 方法

    1.2.1 初花期苦瓜低溫處理 試驗(yàn)于2013年9月中旬進(jìn)行,將供試‘24-K的苦瓜種子用60 ℃溫水處理30 min,常溫浸種12 h后,播種于10 cm×15 cm的營(yíng)養(yǎng)缽中,營(yíng)養(yǎng)基質(zhì)為泥炭土 ∶ 珍珠巖 ∶ 蛭石=7 ∶ 1 ∶ 2(體積比),每個(gè)營(yíng)養(yǎng)缽中保按照常規(guī)方法管理。待苦瓜長(zhǎng)至9葉1心,出現(xiàn)雌蕊時(shí),選擇生長(zhǎng)勢(shì)一致的植株分別移置2臺(tái)智能型人工氣候箱(MGC-350HP-2)進(jìn)行處理。(1)處理組A:溫度8 ℃,濕度為60%,光強(qiáng)為200 μmol/(m2·s),光周期12 h/12 h;(2)處理組B或?qū)φ战M:溫度25 ℃,其它條件相同。在0~24 h內(nèi)分別于0、1、3、6、12、

    24 h定時(shí)取各處理單株第5片功能葉,經(jīng)液氮速凍后,置于-80 ℃冰箱備用,進(jìn)行基因表達(dá)分析。每個(gè)處理隨機(jī)取6株,設(shè)3次重復(fù)。

    1.2.2 苦瓜基因組DNA和總RNA提取純化 采用改良CTAB法提取苦瓜強(qiáng)雌系24-K的基因組DNA[15];采用改良Trizol RNA提取試劑盒(Invitrogen)方法,分別提取苦瓜強(qiáng)雌系24-K開花初期(9葉1心)根、莖、葉、雌花和授粉5 d幼果的總RNA,用于McAPX2在苦瓜不同部位的表達(dá)分析。采用上述方法分別提取經(jīng)不同時(shí)間低溫處理和對(duì)照處理的苦瓜葉片總RNA,用于McAPX2表達(dá)模式分析。用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA、總RNA 完整性,用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)基因組DNA、總RNA的濃度和純度。

    1.2.3 McAPX2基因的克隆 在已構(gòu)建苦瓜葉片均一化cDNA文庫(kù)基礎(chǔ)上,測(cè)序后去除引物和載體片段,在Blast(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)進(jìn)行序列同源性比對(duì)分析,獲得一個(gè)與多種植物APX基因有很高同源性的EST序列,該基因cDNA全長(zhǎng)1 086 bp。利用軟件Primer 5.0 設(shè)計(jì)ORF上下游引物McAPX-ORF-F/R(見表1),以稀釋100倍文庫(kù)為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,回收的目的條帶,克隆到TaKaRa的pMD18-T載體上,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,篩選出陽(yáng)性克隆,委托上海英駿生物技術(shù)公司測(cè)序,進(jìn)行新基因驗(yàn)證。

    1.2.4 McAPX2啟動(dòng)子的分離 根據(jù)苦瓜McAPX2的全長(zhǎng)cDNA序列,從起始密碼子下游200 bp內(nèi)設(shè)計(jì)巢式引物A2GSP-1,A2GSP-2和A2GSP-3。參照劉志欽等[16]方法和Genome Walking kit試劑盒說明書,以純化的苦瓜‘24-K基因組DNA為模板,進(jìn)行3輪巢式PCR,分離克隆McAPX2上游調(diào)控區(qū)域的啟動(dòng)子序列。PCR產(chǎn)物純化回收并克隆至pMD18-T載體上,委托上海英駿生物技術(shù)公司測(cè)序。

    1.2.5 McAPX2生物信息學(xué)分析 由在線軟件ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)尋找McAPX2最大開放閱讀框,使用Blastn(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進(jìn)行同源性分析;采用Maga5.01軟件繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹;利用在線軟件Blastp、SOSUI、Signal3.0、TMHMM、TargetP1.1、SOPMA等(http://www.expasy.org/tools)分析McAPX2編碼的氨基酸序列、蛋白結(jié)構(gòu)、疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、磷酸化位點(diǎn)等。利用在線軟件PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)預(yù)測(cè)其順式作用元件。

    1.2.6 熒光定量PCR分析 以稀釋10倍的反轉(zhuǎn)錄cDNA為模板,根據(jù)McAPX2基因序列設(shè)計(jì)熒光定量引物McAPX2-RT-F/R,以苦瓜環(huán)素基因(GenBank:HQ171897)作為內(nèi)參基因[15],以McCYP-RT-F/R為熒光定量引物(表1),RT-qPCR分析在ABI7500熒光定量PCR儀上進(jìn)行,每個(gè)樣品進(jìn)行3次重復(fù)。20 μL PCR擴(kuò)增體系為:10 μL 2×Real Master Mix混合液、5~10 ng cDNA、上下游引物各0.5 μL,補(bǔ)ddH2O至20 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性10 min;94 ℃ 15 s,60 ℃ 34 s,40次循環(huán),清水模板為陰性對(duì)照。采用2-△△Ct法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量。原始數(shù)據(jù)用Excel2007軟件處理,用SPSS10.0軟件進(jìn)行相關(guān)分析。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 McAPX2基因全長(zhǎng)的克隆

    從苦瓜葉片均一化文庫(kù)中克隆得到1個(gè)APX相關(guān)的EST片段,去除引物和載體片段,經(jīng)blastn比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)與黃瓜L-ascorbate peroxidase(NM_001280706.1)的cDNA序列相似性為67.5%,經(jīng)測(cè)序及序列分析,得到APX基因cDNA全長(zhǎng)序列(圖1、2),該序列全長(zhǎng)為1 086 bp,包括89 bp的5′-UTR,250 bp的3′-UTR。起始密碼子ATG附近有Kozak保守序列“A/GCCATGG”,cDNA末端含有PolyA序列,在PolyA之前20 bp含保守加尾信號(hào)“TGTAA”序列,這些均符合能有效翻譯基因的全長(zhǎng)cDNA特征,命名為McAPX2,GenBank登錄號(hào)為KJ722767.1。

    2.2 McAPX2基因推導(dǎo)氨基酸序列的生物信息學(xué)分析

    經(jīng)ORF Finder分析,McAPX2的開放閱讀框?yàn)?47 bp,編碼249個(gè)氨基酸。ProtParam軟件分析表明,McAPX2蛋白分子式為C1 236H1 912N326O365S5,相對(duì)分子量27.34 ku,理論等電點(diǎn)pI為5.43;負(fù)電荷殘基(Asp+Glu)為36個(gè),正電荷殘基(Arg+Lys)為28個(gè);脂肪系數(shù)為83.90,平均熟疏水性為-0.280;不穩(wěn)定指數(shù)為34.80,屬于穩(wěn)定蛋白。經(jīng)ProtScale軟件推測(cè)該蛋白為親水性蛋白。

    采用TargetP1.1對(duì)McAPX2蛋白進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)定位預(yù)測(cè),結(jié)果顯示定位在線粒體內(nèi)(mTP值為0.131)或分泌到胞外(SP值為0.047)的可能性較小,極有可能在其它部位(other值為0.906)。經(jīng)SignalP 4.1 Server軟件分析,McAPX2蛋白不含信號(hào)肽,不是分泌蛋白。經(jīng)TMpred程序分析,McAPX2蛋白不含跨膜區(qū)域。結(jié)果推測(cè)McAPX2蛋白定位在細(xì)胞質(zhì)中。

    經(jīng)SOPMA預(yù)測(cè)McAPX蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)顯示,McAPX蛋白包含有104處α-螺旋(Alpha helix),占41.77%;22處β-轉(zhuǎn)角(beta-turn),占8.84%;25處延伸鏈(Extended strand),占10.04%;98處無(wú)規(guī)則卷曲(Random coil),占39.36%。

    通過NCBI的CDS軟件分析,McAPX2蛋白屬于植物來(lái)源的過氧化物酶超家族,該蛋白含有1個(gè)過氧化物酶活性位點(diǎn)或底物結(jié)合位點(diǎn)(33-44: APLMLRLAWHSA)區(qū)域,1個(gè)亞鐵血紅素配基結(jié)合區(qū)域或血紅素結(jié)合位點(diǎn)(155-165:DIVALSGAHTL),發(fā)現(xiàn)7個(gè)與形成二聚體靜電作用相關(guān)的保守氨基酸。利用DNAMAN軟件進(jìn)行氨基酸同源比對(duì)(圖3),發(fā)現(xiàn)APX蛋白序列C-端高度保守,N-端相對(duì)不保守,與同屬的甜瓜(Cucumis melo NP_001284378.1)、黃瓜(Cucumis sativus ACO90193.1)、南瓜(Cucurbia moschata AHF27424.1)、苦瓜(Momordica charantia AGJ72851.1)同源性分別為95%,94%,94%,93%,說明葫蘆科APX氨基酸序列具有較高的保守性。

    利用MEGA5.0軟件,將McAPX2蛋白與其他27種植物的APX蛋白進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建(圖4),參與構(gòu)建進(jìn)化樹的27個(gè)APX蛋白已被證明或預(yù)測(cè)定位于細(xì)胞質(zhì)中。結(jié)果顯示,苦瓜McAPX蛋白與葫蘆科植物甜瓜(NP_001284378.1)、黃瓜(ACO90193.1)的APX蛋白親緣關(guān)系最近,與茄科的番茄(NP_001234782.1)、煙草(AAA86689.1)和辣椒(CAA57140.1)的APX具有相對(duì)較近的親緣關(guān)系,與豆科的大豆(NP_001237785.1)、苜蓿(AES88707.1)、豇豆(AAB03844.1)等的APX蛋白親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),而與無(wú)患子科植物柚(ACM17463.1)和龍眼(ABS50864.1)的APX親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。結(jié)果表明,苦瓜McAPX2基因與其它植物的APX具有較高的保守性,這些APX蛋白功能在進(jìn)行化上保守,推測(cè)McAPX2蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)中。

    2.3 McAPX2在苦瓜不同器官表達(dá)

    采用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)分別檢測(cè)McAPX2在苦瓜開花初期不同組織器官的表達(dá)情況,以葉片中相對(duì)表達(dá)量為1。從圖5可見,McAPX2在根、莖、葉、雌花和授粉5 d幼果等器官中的表達(dá)量存在極顯著的差異。在根、莖、幼果中大量表達(dá),其中根的表達(dá)量最大,而在葉片中的表達(dá)量最低。

    2.4 低溫脅迫下McAPX2的表達(dá)模式

    采用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)檢測(cè)在低溫脅迫下苦瓜初花期葉片中McAPX2表達(dá)情況,以對(duì)照處理McAPX2相對(duì)表達(dá)量為1。結(jié)果發(fā)現(xiàn),低溫脅迫處理1 h時(shí),苦瓜葉片McAPX2表達(dá)量與對(duì)照處理McAPX2表達(dá)量無(wú)顯著差異;低溫處理3 h時(shí)McAPX2表達(dá)量有顯著的上調(diào)趨勢(shì);低溫處理6 h時(shí),McAPX2表達(dá)量是對(duì)照處理的16倍;低溫處理12 h時(shí)McAPX2表達(dá)量達(dá)到最大,是對(duì)照處理表達(dá)量的23倍;低溫處理24 h時(shí),McAPX2表達(dá)量降低,仍比對(duì)照處理的表達(dá)量高17倍(圖6)。

    2.5 McAPX2啟動(dòng)子分離與序列分析

    將啟動(dòng)子PCR擴(kuò)增產(chǎn)物克隆到pMD18-T載體上,經(jīng)酶切鑒定、測(cè)序,獲得序列片段長(zhǎng)為1 276 bp(圖7)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),所獲得的序列3′端116 bp序列與McAPX2 cDNA的5′端序列比對(duì)一致,表明所得序列為McAPX2基因上游的啟動(dòng)子區(qū)域。

    使用在線neural network promoter prediction軟件預(yù)測(cè)出轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)為T,位于起始密碼子上游214 bp處;采用在線軟件PlantCare分析,在轉(zhuǎn)錄起始位置上游30 bp位置預(yù)測(cè)到1個(gè)TATA-BOX,在上游68 bp位置預(yù)測(cè)到1個(gè)CAAT-BOX。發(fā)現(xiàn)該段序列上含有植物激素響應(yīng)元件,如赤霉素響應(yīng)元件GARE1OSREP1、赤霉素反應(yīng)瞬時(shí)作用元件PYRIMIDINEBOXOSRAMY1A、脫落酸響應(yīng)元件ABRE、乙烯響應(yīng)元件ERELEE4和細(xì)胞分裂素響應(yīng)元件ARR1AT;器官特異表達(dá)元件,如根器官特異表達(dá)元件ROOTMOTIFTAPOX1、花粉特異表達(dá)元件POLLEN1LELAT52;病原菌響應(yīng)元件,如ASF1MOTIFCAMV、ELRECOREPCRP1、WBOXATNPR1;防御與脅迫響應(yīng)元件,如DOFCOREZM、WBBOXPCWRKY1;光調(diào)控元件BOX4;逆境響應(yīng)元件,如干旱誘導(dǎo)元件,如MYB1AT、MYB2CONSENSUSAT、MYBCORE,干旱和黑暗響應(yīng)元件ACGTATERD1,熱激鹽誘導(dǎo)表達(dá)GT1GMSCAM4,低溫誘導(dǎo)響應(yīng)元件LTRE1HVBLT49(圖8)。

    3 討論

    本試驗(yàn)從苦瓜葉片均一化文庫(kù)中克隆出1 086 bp的McAPX2全長(zhǎng)cDNA序列,該基因編碼含有249個(gè)氨基酸的完整開放閱讀框。保守區(qū)分析發(fā)現(xiàn)該基因所編碼的蛋白屬于植物POD超家族,具有過氧化物酶活性位點(diǎn)和亞鐵血紅素配基結(jié)合區(qū)等與其他物種APX相同的保守域。在高等植物中APX是編碼多基因家族,APX蛋白根據(jù)不同細(xì)胞定位可劃分4種同工酶:葉綠體基質(zhì)(sAPX)及類囊體膜APX(tAPX),線粒體膜APX(mitAPX)、過氧化物酶體(pAPX)和胞質(zhì)APX(cAPX)[17]。4種APX同工酶的分子量、亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)和序列存在差異。McAPX2蛋白分子量為27.43 ku,與擬南芥胞質(zhì)型AtAPX1/2分子量27.5 ku相當(dāng)。該蛋白含有7個(gè)參與二聚體界面靜電作用的保守帶電殘基,說明McAPX2可能和擬南芥胞質(zhì)型AtAPX1/2一樣以二聚體結(jié)構(gòu)存在[18]。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)該蛋白序列的N-端不含信號(hào)肽,表明該蛋白不定位葉綠體或線粒體上,C-端不含跨膜區(qū)域,表明不定位在過氧化物酶體上,推測(cè)可能定位在細(xì)胞質(zhì)。同源比對(duì)發(fā)現(xiàn),該蛋白與同科植物甜瓜(95%),黃瓜(94%)和南瓜(94%)的cAPX有很高的同源性;系統(tǒng)聚類樹分析顯示,McAPX2與其它27種植物的cAPX具有較高的同源性,說明該基因家族在進(jìn)化上十分保守。由此可以推斷獲得的苦瓜McAPX2基因?qū)儆贏PX基因家族的cAPX基因亞族[7]。

    目前許多高等植物中不同類型的APX基因被克隆出來(lái),有研究表明,APX基因的表達(dá)受各種環(huán)境脅迫因子的誘導(dǎo)。APXs,尤其是cAPX更有助于使植物免受氧化應(yīng)激作用[17]。Park等[19]研究發(fā)現(xiàn),甘薯受傷害脅迫誘導(dǎo)后APX表達(dá)量明顯上調(diào);Koussevitzky等[20]發(fā)現(xiàn)干旱和熱激脅迫后擬南芥APX1的mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)量達(dá)到最高;王超等[21]發(fā)現(xiàn)鹽脅迫處理誘導(dǎo)白樺APX基因顯著表達(dá);Lu等[22]發(fā)現(xiàn)2種水稻cAPXs(OsAPXa和OsAPXb)基因均可以且在不同程度上提高轉(zhuǎn)基因煙草的耐鹽性,其中OsAPXb基因?qū)}脅迫更敏感。曾秀存等[23]發(fā)現(xiàn)低溫脅迫誘導(dǎo)白菜型冬油菜cAPX基因上調(diào)表達(dá),超強(qiáng)抗寒性品種‘隴油7號(hào)APX基因表達(dá)量高于抗寒性弱的品種‘天油4號(hào);本研究表明低溫脅迫下苦瓜McAPX表達(dá)量上調(diào),與曾秀存等[23]研究結(jié)果相一致;另外,低溫脅迫誘導(dǎo)植株體內(nèi)的APX活性上調(diào)在水稻[24],咖啡[25],山楂[26]和辣椒[27]中也得到了證實(shí)。然而,有研究表明,低溫脅迫可誘導(dǎo)cAPX下調(diào)表達(dá),Morita等[28]發(fā)現(xiàn)低溫處理水稻胞質(zhì)型OsAPX2的表達(dá)量下調(diào);Funatsuki等[29]發(fā)現(xiàn)大豆cAPX1缺失突變株比野生型更為耐寒。cAPX基因的表達(dá)差異可能與試驗(yàn)材料對(duì)低溫的敏感程度、試驗(yàn)條件和脅迫強(qiáng)度等相關(guān)。對(duì)于低溫敏感性植物而言,低溫脅迫下植物主要遭受氧化脅迫,植株體內(nèi)APX活性上調(diào),清除過量的H2O2,以利于植物在更低溫度或長(zhǎng)時(shí)間低溫下生存。對(duì)于特定處理?xiàng)l件下,低溫脅迫可誘導(dǎo)cAPX下調(diào)表達(dá)積累H2O2,H2O2作為低溫脅迫信號(hào)因子觸發(fā)誘導(dǎo)下游防御基因的表達(dá),表現(xiàn)出耐寒性[30]。

    啟動(dòng)子作為一種順式作用元件,是研究基因表達(dá)調(diào)控的重要因素之一。本研究通過染色體步移法從苦瓜果實(shí)中分離得到McAPX2基因上游1 276 bp的啟動(dòng)子序列。通過在線軟件PLACE和PlantCare分析,該序列具有啟動(dòng)子的普遍特征,在轉(zhuǎn)錄起始位置有基因轉(zhuǎn)錄必須的與RNA聚合酶結(jié)合或互作的保守元件TATA-BOX和CAAT-BOX,含有與GA、ABA、CTK、乙烯等激素和病原菌等生物脅迫以及熱激、干旱、低溫、光等非生物脅迫的相關(guān)元件,這些元件的發(fā)現(xiàn)說明McAPX2基因可能在轉(zhuǎn)錄水平上受到激素、生物脅迫和非生物脅迫等多種因素的調(diào)節(jié)。該序列上的低溫誘導(dǎo)響應(yīng)順式元件LTRE1HVBLT49[31-34]可能與低溫脅迫下APX基因的差異表達(dá)有著重要關(guān)系;3個(gè)增強(qiáng)子元件CAATBOX、EECCRCAH1、GATABOX可能與增強(qiáng)啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)下游McAPX2基因的表達(dá)相關(guān)。同時(shí)該序列中發(fā)現(xiàn)了器官特異表達(dá)元件,說明McAPX2在植物體內(nèi)的表達(dá)可能具有器官特異性。McAPX2啟動(dòng)子各元件的具體功能還有待進(jìn)一步研究驗(yàn)證。

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