摘 要:分子遺傳標(biāo)記利用基因組中的遺傳多態(tài)性DNA、RNA序列作為遺傳標(biāo)記對基因遺傳的傳遞過程進(jìn)行追蹤。文章探討了分子遺傳標(biāo)記在家畜育種中的應(yīng)用,主要分析了RFLP、AFLP、STRs等分子遺傳標(biāo)記技術(shù),以及分子遺傳標(biāo)記技術(shù)在分子育種、遺傳多樣性分析、遺傳圖譜構(gòu)建與抗病選育中的具體應(yīng)用。
關(guān)鍵詞:分子遺傳標(biāo)記;家畜育種;應(yīng)用探究
家畜育種是改良家畜群體的關(guān)鍵基礎(chǔ)手段。通過家畜育種,能夠有效提高家畜的生產(chǎn)性能,使家畜相關(guān)產(chǎn)品的產(chǎn)量得到提高,如肉、蛋、毛等產(chǎn)品產(chǎn)量,從而提高飼料的轉(zhuǎn)化效率,降低家畜產(chǎn)品生產(chǎn)成本。在提高產(chǎn)品質(zhì)量、滿足市場需求方面,家畜育種也起到重要作用。家畜育種也能夠改善家畜品種的抗病能力,減少疾病個體。由此,家畜育種行為能夠促進(jìn)經(jīng)濟效益的提升,實現(xiàn)疾病有效防控,在環(huán)境保護(hù)、遺傳資源與生物多樣性保護(hù)等方面都起到重要作用。
1 分子遺傳標(biāo)記
分子遺傳標(biāo)記技術(shù)主要有限制性片段長度多態(tài)性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)、擴增片段長度多態(tài)性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)、微衛(wèi)星標(biāo)記(Simple Sequence Repeats,STRs)三種,其中RELP以分子雜交為基礎(chǔ),AFLP、STRs以PCR為基礎(chǔ),此外還有以DNA測序為基礎(chǔ)的單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)。
RELP利用了限制性內(nèi)切酶的識別與切割能力,基于此識別并切割DNA序列中的特定限制性識別位點,即DNA序列中特定的核苷酸序列,進(jìn)而產(chǎn)生長度不一的DNA片段。核苷酸的變化會導(dǎo)致識別點位的出現(xiàn)或消失,若識別點位消失,產(chǎn)生的片段為長片段,若識別點位存在,則會產(chǎn)生兩個較短片段,若識別點位僅存在于兩個親本基因中的其中一個,則會產(chǎn)生兩種不同的電泳圖譜[1]。
AFLP將聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)與RELP相結(jié)合,綜合了PCR法的靈敏性特點與RELP的穩(wěn)定性特點。操作時先使用RELP法進(jìn)行基因組DNA切割,隨后將DNA片段進(jìn)行連接,使用PCR法對片段進(jìn)行擴增,擴增后的片段經(jīng)電泳分析判斷遺傳多樣性。
STRs是短串聯(lián)重復(fù)序列,由1~6個核苷酸組成,在基因的非編碼區(qū)和編碼區(qū)中廣泛分布,因此能夠提供較為全面的基因組遺傳信息。因滑鏈錯配等機制的作用,STRs會發(fā)生不穩(wěn)定重復(fù)擴展現(xiàn)象,形成了STRs的多樣性。
上述三種技術(shù)從信息量角度考慮,AFLP具有高通量特性,能夠提供的信息量更多,從靈敏度角度考慮,AFLP也能提供較高的靈敏度,但AFLP是操作復(fù)雜度最高的技術(shù)。RELP技術(shù)是第一代分子遺傳標(biāo)記技術(shù),在信息量、靈敏度上都落后于AFLP與STRs,但也有其適用范圍。
2 分子遺傳標(biāo)記在家畜育種中的應(yīng)用
2.1 分子育種
分子遺傳標(biāo)記法在家畜育種中主要通過DNA序列的差異來提高育種效率,也使得家畜育種結(jié)果的準(zhǔn)確性獲得提升,遺傳改良后代的優(yōu)良性狀更加穩(wěn)定[2]。通過分子遺傳標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行連鎖分析,能夠確定特定性狀相關(guān)基因在基因組中的具體位置,輔助育種人員研究定位基因功能,并進(jìn)一步挖掘出能夠?qū)倚笊a(chǎn)性狀產(chǎn)生顯著影響的基因,如家畜生長、肉質(zhì)、抗病性等。家畜的早期選擇是提高家畜育種效率的關(guān)鍵,利用分子遺傳標(biāo)記技術(shù)可以分析家畜幼年時期的遺傳信息,直接進(jìn)行家畜的早期選擇,確定具有優(yōu)良遺傳基因的家畜,能夠有效避免表型選擇的誤差。家畜育種中,分子遺傳標(biāo)記還可以用于輔助雜交設(shè)計,通過識別不同品種的遺傳差異進(jìn)行最佳雜交組合設(shè)計,進(jìn)而提高雜交家畜的生產(chǎn)性能。此外,分子遺傳標(biāo)記可以追蹤特定的性狀遺傳,育種者可以根據(jù)這種遺傳來分析基因在品種改良中起到的作用,并進(jìn)行基因的流動管理,限制不良基因在繁育種群中的擴散。也可以利用分子標(biāo)記進(jìn)行基因的篩選和淘汰,改良家畜品種。
RELP、AFLP、SNP、STRs等都是廣泛應(yīng)用于家畜分子育種中的分子遺傳標(biāo)記技術(shù)。在家畜分子育種中,這些分子遺傳標(biāo)記技術(shù)可以幫助育種者進(jìn)行繁育種群目標(biāo)經(jīng)濟性狀的定位。以經(jīng)濟動物羊為例,體重、產(chǎn)肉量、肉質(zhì)、脂肪含量、繁殖性能等都是重要的經(jīng)濟性狀,利用分子遺傳標(biāo)記技術(shù)能夠有效定位這些經(jīng)濟性狀,并進(jìn)行進(jìn)一步的選育,具體內(nèi)容如表1所示。經(jīng)濟動物牛的分子遺傳標(biāo)記中,可以利用這一技術(shù)進(jìn)行選擇性育種,提高牛種群的生產(chǎn)力與抗病性,以牛產(chǎn)乳為例,相關(guān)基因與標(biāo)記具體內(nèi)容如表2所示。
2.2 遺傳多樣性分析
群體內(nèi)個體遺傳特征的差異被稱為遺傳多樣性,家畜的遺傳多樣性表現(xiàn)為DNA序列的多態(tài)性、基因表達(dá)水平差異或表型變異。在分析家畜遺傳多樣性時,利用分子遺傳標(biāo)記能夠進(jìn)行直接的遺傳變異測定,并輔助研究人員判斷群體的遺傳結(jié)構(gòu)與進(jìn)化歷程。通過家畜遺傳多樣性的分析,育種者可以評估育種資源質(zhì)量,選擇具有優(yōu)良性狀的家畜進(jìn)行繁育。也能夠輔助育種者識別具有高遺傳多樣性的個體,將其作為育種親本使用[3]。遺傳結(jié)構(gòu)與進(jìn)化歷程的識別可以形成對家畜群體的近交監(jiān)測,以避免育種近交導(dǎo)致群體衰退。在雜交育種方面,家畜遺傳多樣性也發(fā)揮著重要作用,可以用于雜交育種研究,培育新品種。
2.3 抗病選育
家畜育種中的抗病選育是確保家畜群體健康的關(guān)鍵途徑,在育種中通過識別健康個體及健康個體與疾病抗病性相關(guān)的遺傳變異基因進(jìn)行進(jìn)一步繁殖。將分子遺傳標(biāo)記技術(shù)應(yīng)用于家畜抗病選育中可以通過QTL定位與基因組選擇技術(shù)實現(xiàn)。首先對疾病相關(guān)的基因與變異及時進(jìn)行識別或預(yù)測,基于已知基因采用分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行篩選。QTL可以進(jìn)行抗病基因的精細(xì)定位,基因組選擇能夠準(zhǔn)確預(yù)測個體的抗病性能。通過基因的選育可以有效改良家畜品種,積累抗病基因或培育抗病新品種。以羊泰勒蟲病診斷為例,可根據(jù)羊泰勒蟲表面蛋白基因開發(fā)出相應(yīng)的分子標(biāo)記,結(jié)合PCR擴增實現(xiàn)有效診斷。后續(xù)在羊生產(chǎn)性能與健康品種選擇中,可以利用這一方法進(jìn)行疾病的快速診斷,識別處理感染個體以保持羊群健康,或選擇具有抗羊泰勒蟲病信息的個體進(jìn)行繁殖。此外還有利用基因敲入、基因敲除、基因編輯的遺傳修飾技術(shù),通過精確控制基因表達(dá),可以在不影響動物整體健康和福利的前提下,提高其經(jīng)濟性狀。例如,通過基因編輯技術(shù),可以在綿羊中引入特定的疾病抗性基因,從而減少對抗生素的依賴,這對于提高動物健康和食品安全都具有重要意義[4]。
結(jié)語
本研究分析了分子遺傳標(biāo)記技術(shù)在家畜育種中的具體應(yīng)用,討論了RELP、AFLP、STRs等分子遺傳技術(shù)的應(yīng)用范圍與應(yīng)用條件。利用分子遺傳標(biāo)記,育種者可以進(jìn)行家畜目標(biāo)性狀的早期選擇,評估育種資源的優(yōu)良程度,對個體優(yōu)良性狀進(jìn)行有效識別與特定性狀的遺傳跟蹤,也可以利用相關(guān)技術(shù)輔助雜交設(shè)計,培育更具經(jīng)濟效益、抗病性的雜交個體。進(jìn)而提高家畜的生產(chǎn)性能,實現(xiàn)對家畜資源多樣性的保護(hù)與品種的改良,促進(jìn)家畜的經(jīng)濟效益提升。
參考文獻(xiàn):
[1]楊建琦,龔一鳴,江炎庭,歐陽依娜,洪瓊花,儲明星.山羊BPTF基因多態(tài)性與產(chǎn)羔性能的關(guān)聯(lián)分析[J].中國草食動物科學(xué),2022,42(4):23-2660.
[2]馮娜,曹凱鑫,劉小東,李宜璇.DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其在羊育種中的應(yīng)用研究[J].現(xiàn)代畜牧獸醫(yī),2024(7):80-84.
[3]馬敏彪,武利恒,丁琳,金慧佳,趙麗莉,曹丁壬,王爭光.基于SNP分子標(biāo)記的湖羊群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J].畜牧與獸醫(yī),2024,56(6):1-8.
[4]王維英,周玉青,楊濤,孫武,馬世科,金夏陽,馬曉涓.藏綿羊多胎性狀育種:遺傳基礎(chǔ)、分子標(biāo)記應(yīng)用及未來發(fā)展策略[J].青??萍迹?024,31(2):86-91.
收稿時間:2024-02-26
作者簡介:劉一錕(2004—),女,本科。研究方向:動物遺傳育種與繁殖。