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    石珊瑚共附生真菌次級代謝產(chǎn)物的抗炎活性及化學(xué)多樣性研究

    2024-01-12 12:41:22廖清楠周龍建楊志友馮昀鎧黃誼君胡雪瓊3張翼劉亞月
    生物技術(shù)通報(bào) 2023年12期
    關(guān)鍵詞:粗提物糙米鹽度

    廖清楠 周龍建,2,3 楊志友,2,3 馮昀鎧 黃誼君 胡雪瓊,3張翼,2,3 劉亞月,2,3

    (1. 廣東海洋大學(xué)食品科技學(xué)院 廣東省水產(chǎn)品加工與安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 廣東海洋大學(xué)深圳研究院海洋醫(yī)藥研發(fā)中心 湛江市腦健康海洋藥物與營養(yǎng)品重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湛江 524088;2. 南方海洋科學(xué)與工程廣東省實(shí)驗(yàn)室(湛江),湛江 524006;3. 海洋食品精深加工關(guān)鍵技術(shù)省部共建協(xié)同創(chuàng)新中心 大連工業(yè)大學(xué),大連 116034)

    炎癥是臨床常見的一個(gè)病理過程,是機(jī)體組織受到刺激或損傷后所產(chǎn)生的一種防御性應(yīng)答反應(yīng),主要以紅、腫、熱、痛甚至組織器官功能喪失為癥狀[1-2]。炎癥是一把雙刃劍,適度的炎癥反應(yīng)對人體是有益的;但過度、失控的炎癥反應(yīng)則會導(dǎo)致組織的病變和二次損傷,是許多疾病的發(fā)病基礎(chǔ)?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明,在系統(tǒng)性血管炎、腸道克羅恩病等一些自身免疫性疾病以及神經(jīng)系統(tǒng)病變的疾病中,炎癥反應(yīng)發(fā)生時(shí),白細(xì)胞介素?1、白細(xì)胞介素?6、PGE2 等炎性相關(guān)因子的表達(dá)都有所上升,進(jìn)而傷害到人體內(nèi)部細(xì)胞,并對人體產(chǎn)生危害。目前,這些疾病正在全球范圍蔓延,并且已演變成嚴(yán)重危害人類健康和社會經(jīng)濟(jì)可持續(xù)發(fā)展的重要公共衛(wèi)生問題,越來越受到各國政府和社會的高度重視。因此,開發(fā)治療炎癥的有效藥物對多種疾病的治療具有重要的意義。

    珊瑚,隸屬于腔腸動物門中的珊瑚蟲綱,是一種常見的海洋低等無脊椎動物。作為珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,廣泛分布于我國海南、西沙群島及南沙群島等熱帶海岸地區(qū)。珊瑚表面和組織內(nèi)部聚集著豐富的微生物資源[3],這些微生物與珊瑚宿主在長期的共同進(jìn)化過程中,通過合成如抗菌、抗腫瘤、抗病毒和抗污損等[4-5]具有生物活性的次級代謝產(chǎn)物,共同抵御外敵入侵和病害防御,一直是藥物先導(dǎo)化合物的重要來源之一。從珊瑚共附生的真菌中分離的代謝產(chǎn)物化學(xué)結(jié)構(gòu)多樣,涉及生物堿、聚酮、萜類、內(nèi)酯類、環(huán)肽類、聚醚類、甾醇類、多糖類及不飽和脂肪酸等非甾體類化合物類型。目前,人們已經(jīng)對多種珊瑚來源的共附生真菌進(jìn)行了研究,并從中獲得了一系列具有抗腫瘤、抗炎、抗氧化、抗癌等多種生物活性物質(zhì)。如李金鳳等[6]從乳白肉芝軟珊瑚(Sarcophyton glaucum)分離得到1 個(gè)新型西松烷型二萜,顯現(xiàn)出良好的抗炎活性。李旺盛等[7]對軟珊瑚Dendronephthyasp.的化學(xué)成分和抗炎活性進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),化合物11?acetoxy?3β,6α-dihydroxy?9, 11?seco?5α-cholest?7?en?9?one 對LPS 誘導(dǎo)的BV?2 細(xì)胞的炎癥反應(yīng)具有抑制作用。Liu 等[8]在珊瑚真菌土曲霉中發(fā)現(xiàn)10 種丁烯內(nèi)酯類化合物,活性結(jié)果表明,versicolactone B 對LPS 誘導(dǎo)的RAW 264.7 小鼠巨噬細(xì)胞中 NO 的產(chǎn)生有很強(qiáng)的抑制作用,比陽性對照吲哚美辛的作用更顯著,這表明它可能是一種潛在的新型抗炎藥的先導(dǎo)化合物。中山大學(xué)的Liu 等[9]從柳珊瑚真菌Penicillium sclerotiorum中分離得到4 種新的聚酮化合物,均能顯著抑制 LPS 誘導(dǎo)的巨噬細(xì)胞 RAW 264.7 中NO 的產(chǎn)生,且sclerketide B 和C,以及iso?chromophilone IX 在mRNA 水平上表現(xiàn)出下調(diào)iNOS和COX?2 表達(dá)。Shen 等[10]從軟珊瑚Lobophytum sarcophytoides中分離到2 種cembrane 型二萜類化合物,其中cembratriene?4,8,11?triol 能顯著抑制LPS 激活的RAW 264.7 細(xì)胞中NO 的產(chǎn)生。但是,現(xiàn)有活性先導(dǎo)化合物的研究只涉及珊瑚資源中的一小部分,且國內(nèi)外對珊瑚共附生微生物的研究多集中在柳珊瑚或軟珊瑚等,對其他珊瑚科,尤其是石珊瑚及其共附生真菌來源的抗炎活性先導(dǎo)化合物的發(fā)掘及其作用機(jī)制的研究卻鮮有報(bào)道。

    本研究中以徐聞石珊瑚來源共附生真菌為研究對象,探究不同培養(yǎng)條件對其次級代謝產(chǎn)物抗炎活性和化學(xué)多樣性的影響。分別選用PDB 和糙米培養(yǎng)基,并設(shè)置 3 種鹽度(0.3%、3% 和 10%),對 31株石珊瑚來源共附生真菌進(jìn)行小規(guī)模發(fā)酵培養(yǎng)。以LPS 誘導(dǎo)的BV?2 小膠質(zhì)細(xì)胞為炎癥模型,從中篩選出具有抗炎活性的菌株;并通過TLC 指紋圖譜、UPLC?QTOF?MS 以及FBMN 等技術(shù)手段進(jìn)一步分析抗炎活性菌株次級代謝產(chǎn)物的化學(xué)多樣性,以期為后續(xù)深入挖掘石珊瑚共附生真菌中的抗炎活性次級代謝產(chǎn)物奠定基礎(chǔ)。

    1 材料和方法

    1.1 材料

    1.1.1 真菌菌株和細(xì)胞 本實(shí)驗(yàn)的31 株石珊瑚共附生真菌均采自廣東徐聞珊瑚礁自然保護(hù)區(qū),目前保藏在廣東海洋大學(xué)海洋藥物研究所,菌株種屬及珊瑚來源如表1 所示;BV?2 小膠質(zhì)細(xì)胞購于武漢大學(xué)中國典型培養(yǎng)物保藏中心。

    表1 31 株珊瑚共附生真菌菌屬及珊瑚來源Table 1 31 coral symbiotic fungal genera and coral sources

    1.1.2 培養(yǎng)基 PDB 培養(yǎng)基:配置好的馬鈴薯葡萄糖粉24.0 g,海鹽適量(鹽度為0.3%時(shí)添加量為3.0g,鹽度3.0%時(shí)添加量為30.0 g,鹽度10.0%時(shí)添加量為100.0 g),加水定容至1 L,pH =7.0,121℃滅菌30 min 備用。糙米培養(yǎng)基 :糙米50.0 g,海鹽適量(鹽度為0.3%時(shí)添加量為3.0 g,鹽度3.0%時(shí)添加量為30.0 g,鹽度10.0%時(shí)添加量為100.0 g),加水定容至1 L,pH =7.0,121℃滅菌30 min 備用。完全培養(yǎng)基:向500 mL DMEM(dulbecco’s modified eagle medium)高糖培養(yǎng)基中加入50 mL 過濾后的澳洲胎牛血清(fetal bovine serum, FBS)和5 mL 雙抗(青霉素-鏈霉素混合液100×)。

    1.1.3 主要試劑與儀器 DMEM 高糖培養(yǎng)基,Gibco公司;胰蛋白酶?EDTA(0.25%),Gibco 公司;FBS,美國Zeta Life 公司;青霉素-鏈霉素混合液(100×),Gibco 公司;LPS,Sigma 公司;磷酸鹽緩沖液(PBS),Gibco 公司;NO 檢測試劑盒,碧云天公司;3?(4,5?二甲基?2?噻唑基)?2,5?二苯基溴化四唑(MTT),源葉生物。

    多功能紫外透射儀,上海精科實(shí)業(yè)有限公司;霉菌培養(yǎng)箱及生物安全柜,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療器械廠;生物安全柜,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療器械廠;UPLC/Xevo G2?XS QTOF 超高效液相/串聯(lián)四極桿飛行時(shí)間質(zhì)譜儀,沃特世科技(上海)有限公司;旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀,上海愛朗儀器有限公司;超凈工作臺,上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱,美國精騏有限公司;倒置顯微鏡,日本島津儀器有限公司;細(xì)胞計(jì)數(shù)儀,Countstar BioMed;Epoch2 酶標(biāo)儀,購自美國BioTek 公司;離心機(jī),湖南湘儀實(shí)驗(yàn)室儀器開發(fā)有限公司;高效薄層層析板(GF254),購自青島凱邦公司。

    1.2 方法

    1.2.1 種子液的制備 將31 株石珊瑚來源共附生真菌凍存管置于溫度 28℃、濕度 80% 的霉菌培養(yǎng)箱活化過夜后,接種到已滅菌的海水馬鈴薯瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基的平板上,將平板置于霉菌培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待菌落孢子生長茂盛,接種到預(yù)先裝有200 mL 滅菌PDB 培養(yǎng)基的錐形培養(yǎng)瓶中培養(yǎng) 3-4 d,待菌落孢子生長茂盛備用。

    1.2.2 OSMAC[11]策略下菌株的小規(guī)模培養(yǎng) 將平板長勢良好的31 株菌株在無菌條件下制備成種子液并分別接種到6 種不同培養(yǎng)基(鹽度0.3%、3%、10%的PDB 培養(yǎng)基,鹽度0.3%、3%、10%的糙米培養(yǎng)基),每組設(shè)3 個(gè)平行組,于室溫條件下靜置培養(yǎng)28 d。

    1.2.3 菌株次級代謝產(chǎn)物的提取 將培養(yǎng)后的菌株分別用不同方法提取次級代謝產(chǎn)物,PDB 培養(yǎng)基的菌體和菌液分開,菌體用等體積甲醇進(jìn)行超聲提取3 次,菌液用等體積的乙酸乙酯萃取3 次,減壓濃縮得粗提物;糙米培養(yǎng)基用等體積甲醇浸泡,超聲提取30 min,重復(fù)3 次,甲醇提取液減壓濃縮得粗提物。

    1.2.4 細(xì)胞培養(yǎng)及給藥 將凍存的BV?2 細(xì)胞迅速解凍后,將細(xì)胞凍存液轉(zhuǎn)移到離心管中并加入5 mL 完全培養(yǎng)基混合,1 000 r/min 離心5 min,棄去培養(yǎng)基,重新加入5 mL 完全培養(yǎng)基將貼壁的細(xì)胞吹打下來轉(zhuǎn)移到培養(yǎng)瓶繼續(xù)培養(yǎng),備用。把處于對數(shù)生長期的細(xì)胞制成細(xì)胞懸液,將細(xì)胞以2×104個(gè)/孔的密度100 μL/孔的體積接種到96 孔板中,分為多組培養(yǎng)(control 組,LPS 組(1 μg/mL),試驗(yàn)組(1、10、20、50、100 μg/mL),每組設(shè)5 個(gè)平行,放入培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h。

    1.2.5 NO 測定 本實(shí)驗(yàn)通過碧云天NO 試劑盒測定細(xì)胞中的NO 含量。其原理是:在有機(jī)酸條件下,對氨基苯磺酸和NO2-發(fā)生重氮化反應(yīng),然后再與鹽酸-萘胺偶合生成紫紅色物質(zhì),測定OD540nm值易知NO2-含量,進(jìn)而推算出NO 含量。待測樣品所用溶液將1 mol/L 標(biāo)準(zhǔn)品稀釋為不同濃度(0、1.56、3.13、6.25、12.5、25、50、100 μmol/L),吸取30 μL 稀釋好的標(biāo)準(zhǔn)品于96 孔板中,加入磺胺溶液30 μL,室溫下避光反應(yīng)5-10 min,再加入鹽酸-萘胺溶液30μL,繼續(xù)在室溫避光孵育5-10 min,用酶標(biāo)儀檢測540 nm 處的吸光度。繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到回歸方程:y= 0.008 7x+ 0.049 3(R2= 0. 997)。細(xì)胞接種到96孔板分組培養(yǎng)24 h 后,分別吸取control 組、LPS 組和試驗(yàn)組中培養(yǎng)基30 μL 于新的96 孔板,每孔加入30 μL 磺胺溶液反應(yīng)5 min 后再加入30 μL 鹽酸-萘胺溶液繼續(xù)反應(yīng)5 min,使用酶標(biāo)儀檢測540 nm 處的吸光度。

    1.2.6 細(xì)胞存活率 將細(xì)胞以5×103個(gè)/孔的密度和100 μL/孔的體積接種到96 孔板中培養(yǎng),24h 后,加入待測樣品,使加入后樣品的終濃度分別為1、10、20、50、100 μg/mL;24 h 后,每孔加入10 μL 的MTT 溶液(用PBS 溶解成5 mg/mL),置于37℃、5% CO2的培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)4 h,棄去培養(yǎng)基,每孔加入DMSO 溶液100 μL 溶解甲瓚,振蕩混勻后檢測波長540 nm 處的吸光度(λ)值,計(jì)算細(xì)胞存活率:細(xì)胞存活率(%)=樣品組OD540/空白組OD540×100%。

    1.2.7 菌株次級代謝產(chǎn)物的TLC 分析 將上述粗提物用甲醇配置成10 mg/mL 的濃縮液,采用高效硅膠薄層層析板對各粗提物的化學(xué)多樣性進(jìn)行分析。選擇乙酸乙酯∶正己烷=2∶1 二元溶劑體系作為TLC分析展開劑,并在波長254 和365 nm 下觀察代謝產(chǎn)物的分布情況。酚類化合物在自然界中廣泛存在,在治療炎癥方面也起到了良好的效果[12],用鐵氰化鉀-三氯化鐵試劑進(jìn)行顯色,對次級代謝產(chǎn)物中的酚類化合物進(jìn)行追蹤分析[13]。

    1.2.8 LC?MS/MS 分析 將各粗提物用色譜級甲醇配成等濃度樣品溶液進(jìn)行液質(zhì)分析。液相色譜條件:進(jìn)樣量為1.0 μL,洗脫條件為:0.00-0.50 min,30%的乙腈水溶液(含0.1%甲酸);0.50-4.00 min,30%-80%的乙腈水溶液(含0.1%甲酸);4.00-7.00min,80%的乙腈水溶液(含0.1%甲酸);7.00-7.20 min,80%-30%的乙腈水溶液(含0.1%甲酸);7.20-8.50 min,30% 的乙腈水溶液(含0.1%甲酸),流速:0.3 mL/min。DAD 檢測器信號采集波長為190-600 nm,監(jiān)測波長為 254 和 360 nm。色譜柱為:Waters ACQUITY UPLC BEH RP18(2.1 mm×50 mm,1.7 μm),質(zhì)譜的質(zhì)量掃描范圍設(shè)置為m/z50-2 000,電噴霧離子化,正離子模式。

    1.2.9 FBMN[14]可視化分析 將原始液質(zhì)數(shù)據(jù)文件的格式轉(zhuǎn)換為.abf 格式后,將其上傳至MS?DIAL 基于化合物的母離子精確質(zhì)量和二級質(zhì)譜的相似度與數(shù)據(jù)庫中的化合物進(jìn)行匹配。然后通過MSFINDER Ver 3.52 將特征點(diǎn)列表里的化合物與不同的數(shù)據(jù)庫如PubChem、NPASS、COCONUT 和ChEBI 等進(jìn)行比較,以注釋每個(gè)特征點(diǎn)可能代表的化合物。然后上傳至全球天然產(chǎn)物分子網(wǎng)絡(luò)集群數(shù)據(jù)庫(global natural products social molecular networking,GNPS)數(shù)據(jù)庫計(jì)算分析,將分析結(jié)果導(dǎo)入Cytoscape 軟件繪制分子網(wǎng)絡(luò)圖,利用FBMN 基于GNPS 的二級質(zhì)譜相似度匹配功能可注釋樣品所含的已知化合物,并根據(jù)分子網(wǎng)絡(luò)圖中不同節(jié)點(diǎn)的關(guān)系,結(jié)合質(zhì)譜數(shù)據(jù),以推斷化合物種類及結(jié)構(gòu)。

    1.2.10 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析 采用GraphPad Prism 8 軟件,采用單因素方差分析(ANOVA)進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,P<0.05 被認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.001 被認(rèn)為差異有高度統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    2 結(jié)果

    2.1 菌株次級代謝產(chǎn)物的抗炎活性分析

    小膠質(zhì)細(xì)胞(BV?2)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的固有免疫細(xì)胞,響應(yīng)中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病,特別是神經(jīng)炎癥相關(guān)疾病的病理刺激。本文以LPS 誘導(dǎo)的BV?2 小膠質(zhì)細(xì)胞為炎癥模型,對31 株石珊瑚來源共附生真菌次級代謝產(chǎn)物的抗炎活性進(jìn)行篩選,結(jié)果如表2和表3 所示。PDB 培養(yǎng)基條件下,共有17 株菌株的次級代謝產(chǎn)物在不同濃度下顯示出一定的抗炎活性,其余14 株菌株均不顯示或者顯示弱(P≤ 0.05)的抗炎活性。且隨著鹽度的增加,具有抗炎活性菌株明顯增加。而糙米培養(yǎng)基條件下,27 株菌株的次級代謝產(chǎn)物呈現(xiàn)出顯著的抗炎活性,但隨著鹽度的增加,菌株抗炎活性無明顯差異。上述結(jié)果表明,不同培養(yǎng)條件對菌株抗炎活性的影響很大,如C1?5、C3?3、C3?8、C3?9 和C14?17 在PDB 培養(yǎng)條件下菌株次級代謝產(chǎn)物均不顯示抗炎活性,但在糙米培養(yǎng)基的3 個(gè)鹽度條件下均表現(xiàn)出良好的抗炎活性。同時(shí)上述5 株真菌的粗提物對NO 的抑制能力均表現(xiàn)出顯著的濃度依賴性,即隨著濃度的增大抑制NO產(chǎn)生的能力也隨之加強(qiáng)(圖1),尤其是菌株C3?9在低濃度條件下(10 和20 μg/mL)也表現(xiàn)出了顯著的NO 抑制活性。

    圖1 糙米培養(yǎng)基條件下5 株共附生真菌粗提物對BV-2 細(xì)胞NO 產(chǎn)生的影響Fig. 1 Effects of crude extracts from five strains of symbiotic fungi on NO production in BV-2 cells under brown rice medium conditions

    表2 PDB 培養(yǎng)基條件下各菌株粗提物的抗炎活性Table 2 Anti-inflammatory activities of crude extracts extracted from different strains under PDB medium conditions

    表3 糙米培養(yǎng)基條件下各菌株粗提物的抗炎活性Table 3 Anti-inflammatory activity of crude extracts obtained from different strains under brown rice medium conditions

    通過MTT 實(shí)驗(yàn)檢測樣品對BV?2 小膠質(zhì)細(xì)胞存活率的影響,進(jìn)而確定實(shí)驗(yàn)的樣品濃度水平。如圖2 所示,大部分實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞在用粗提物(濃度依次為1、10、20、50、100 μg/mL)處理24 h 后,其OD540nm值和空白組OD540nm值的比值約為100%,說明在這個(gè)濃度范圍里,粗提物對BV?2 小膠質(zhì)細(xì)胞的存活率無顯著性影響。因此,在此濃度梯度下,大部分粗提物沒有細(xì)胞毒性,可用此濃度梯度繼續(xù)實(shí)驗(yàn)。

    圖2 糙米培養(yǎng)基條件下5 株共附生真菌粗提物對BV-2 細(xì)胞存活率的影響Fig. 2 Effect of crude extracts of five strains of symbiotic fungi on the viability and survival of BV-2 cells under brown rice medium conditions

    2.2 菌株次級代謝產(chǎn)物的TLC圖像分析

    2.2.1 5 株具有抗炎活性的菌株表觀形態(tài)對比 根據(jù)上述抗炎活性結(jié)果,選擇C1?5、C3?3、C3?8、C3?9 和C14?17 等5 株具有顯著抗炎活性的菌株作為目標(biāo)菌株。通過對比菌株的表觀形態(tài)(圖3)和DNA 測序可知,5 株菌株分別屬旋孢腔菌屬Cochliobolussp.(C1?5),土曲霉A. terreus(C3?3 和C3?9),青霉屬P. citrinum(C3?8)和葡萄穗霉屬Stachybotryssp.(C14?17),其中3 株來源于牡丹珊瑚,1 株來源于普哥濱珊瑚,1 株來源于叢生盔形珊瑚。

    圖3 5 株具有抗炎活性的菌株生長形態(tài)Fig. 3 Growth morphology of five strains with anti-inflammatory activity

    2.2.2 5 株菌株次級代謝產(chǎn)物的TLC 圖像分析 利用 TLC 對上述5 株具有抗炎活性菌株的粗提物進(jìn)行了不同波長下的紫外吸收、熒光斑點(diǎn)、三氯化鐵-鐵氰化鉀顯色斑點(diǎn)的 TLC 指紋譜圖綜合比較,結(jié)果如圖4 所示,不同培養(yǎng)條件下各菌株次級代謝產(chǎn)物差異較大。相比其他菌株,C3?9 在波長 254 和 365nm 下吸收斑點(diǎn)明顯更多(圖4?C1、C2),這意味著其含有的次級代謝產(chǎn)物種類更為豐富。從圖4?C3 可看出菌株C3?9 在三氯化鐵-鐵氰化鉀顯色劑作用下顯現(xiàn)出豐富的藍(lán)色斑點(diǎn),這表明其具有豐富的酚類產(chǎn)物。進(jìn)一步分析菌株C3?9 的TLC 圖像可知,PDB和糙米培養(yǎng)基下菌株代謝產(chǎn)物具有較大的差異。且隨著鹽度的增加,同一培養(yǎng)基下菌株的次級代謝產(chǎn)物也發(fā)生了一定的差異,部分次級代謝產(chǎn)物的斑點(diǎn)強(qiáng)度明顯降低,這表明鹽度的增加,會導(dǎo)致部分代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量降低。

    2.3 菌株C3?9次級代謝產(chǎn)物化學(xué)多樣性分析及FBMN可視化分析

    為了進(jìn)一步分析不同培養(yǎng)條件對菌株C3?9 代謝情況的影響,對6 個(gè)不同培養(yǎng)條件下的提取物進(jìn)行了 LC?MS/MS 和FBMN 分析。從提取物的色譜基峰圖(圖5)可知,菌株C3?9 在PDB 和糙米培養(yǎng)基中的代謝產(chǎn)物具有一定的差異性,且與上述TLC 分析結(jié)果一致。PDB 培養(yǎng)基條件下,菌株次級代謝產(chǎn)物無明顯差異,但隨著鹽度的增加,部分產(chǎn)物的峰面積明顯減少,這表明其產(chǎn)量的降低,說明在PDB培養(yǎng)基中鹽度對次級代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量影響較大。而糙米培養(yǎng)基中,0.3%和3%鹽度的條件下的粗提物的種類沒有表現(xiàn)出明顯的差異性。但是隨著鹽度的增加,10%鹽度下菌株的次級代謝產(chǎn)物豐富度明顯降低,且與3%鹽度的產(chǎn)物表現(xiàn)出了明顯的差異性,這與2.1 部分觀察到的3%鹽度產(chǎn)物抗炎活性顯著高于10%鹽度產(chǎn)物的現(xiàn)象具有很好的相關(guān)性。而MS?DIAL 特征離子表積分面積的對應(yīng)峰在3%和10%兩種鹽度條件下的積分面積比進(jìn)一步表明不同鹽度條件下的產(chǎn)物產(chǎn)量具有明顯的差異(表4),且在3%鹽度條件下產(chǎn)生的主要次級代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量顯著高于10%鹽度條件下。從中選擇8 個(gè)質(zhì)譜可檢測的產(chǎn)量發(fā)生顯著變化的主峰(峰1-8,差異性倍數(shù)>2),將其質(zhì)譜數(shù)據(jù)提交到FBMN,并結(jié)合COCONUT、PubChem、LOTUS 等多數(shù)據(jù)庫做注釋分析(圖6),最終確定了這8 個(gè)主峰依次為cordycepin、visnagin、thymol、6?methoxyflavone、periplogenin、spathulenol、ectoine、gallocatechin。查閱文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn),這8 個(gè)化合物均具有抗炎活性。這對于3%鹽度產(chǎn)物明顯優(yōu)于10%鹽度產(chǎn)物提供了合理的解釋。

    圖5 不同培養(yǎng)條件下菌株C3-9 發(fā)酵產(chǎn)物的LC-MS/MS色譜基峰圖Fig. 5 LC-MS/MS base-peak chromatograms of the fermented products of strain C3-9 under different culture conditions

    圖6 菌株C3-9 在0.3%和10%鹽度糙米培養(yǎng)基的代謝產(chǎn)物基于二級質(zhì)譜聯(lián)系的分子網(wǎng)絡(luò)局部放大圖Fig. 6 Local magnification of metabolites of strain C3-9 in 0.3% and 10% salinity brown rice medium based on secondary mass spectrometric correlation of molecular network

    表4 3% 和10% 鹽度下菌株C3-9 基峰色譜圖中產(chǎn)量具有差異主峰的數(shù)據(jù)庫挖掘及其峰面積的變化倍數(shù)Table 4 Database mining of strain C3-9 base peak chromatograms with differential primary peaks in yield at 3% and 10% salinity and the multiplicity of changes in their peak areas

    3 討論

    OSMAC 策略[15-17],亦稱單菌株多次級代謝產(chǎn)物策略,是通過改變培養(yǎng)基營養(yǎng)成分、狀態(tài),添加酶抑制劑,調(diào)控表觀遺傳,混合培養(yǎng)等方法,充分挖掘微生物合成次級代謝產(chǎn)物的能力,從而獲得更多類型的次級代謝產(chǎn)物。彭艾等[18]通過OSMAC策略從深海真菌Stachybotryssp.3A0009 中得到7 個(gè)單體化合物,其中包括3 個(gè)對人口腔上皮癌KB細(xì)胞有較強(qiáng)增殖抑制作用的化合物。Si 等[19]用OSMAC 策略從黃曲霉菌株中分離到8 個(gè)化合物,其中新化合物flavichalasines N 和O 及已知化合物aspochalasins I 和D 對3 種人癌細(xì)胞株有明顯的毒作用。通過OSMAC 策略,da Silva 等[20]從A. sydowii中激活沉默的代謝產(chǎn)物,得到具有較好AChE 抑制活性的5 個(gè)化合物:cyclo?(L?Leu?L?Pro)、cyclo?(L?Val?L?Pro)、cyclo?(L?Val?L?Leu)、cyclo?(L?Phe?L?Val)和ergosterol peroxide,且cyclo?(L?Val?L?Pro)的抑制活性最強(qiáng)。

    本文采用OSMAC 策略,研究了不同培養(yǎng)條件和鹽度對31 株石珊瑚共附生真菌次級代謝產(chǎn)物抗炎活性和化學(xué)多樣性的影響??寡谆钚越Y(jié)果表明,多數(shù)菌株粗提物在10%的PDB 和糙米培養(yǎng)基條件下顯示出了顯著的抗炎活性,且糙米培養(yǎng)基的粗提物的抗炎活性明顯大于PDB?;瘜W(xué)多樣性分析結(jié)果表明,菌株在PDB 和糙米培養(yǎng)基條件下次級代謝產(chǎn)物具有一定的差異性。推測可能的原因是糙米培養(yǎng)基與PDB 培養(yǎng)基營養(yǎng)源的不同,使得產(chǎn)生的次級代謝產(chǎn)物有所區(qū)別。糙米培養(yǎng)基以淀粉作為碳源,而PDB 培養(yǎng)基則均以葡萄糖為碳源,碳源為菌體生長與代謝提供了物質(zhì)基礎(chǔ)與能量,是培養(yǎng)基中重要的營養(yǎng)物質(zhì)之一。碳源不同,菌株對碳源種類的利用程度不同,從而造成菌體產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物種類和產(chǎn)量不同[21]。而在高鹽條件下表現(xiàn)出更好的抗炎活性推測可能的原因是高鹽條件下部分菌株細(xì)胞內(nèi)編碼抗炎活性組分的沉默基因被激活了,從而導(dǎo)致更多的抗炎活性的代謝產(chǎn)物能夠被合成,使得粗提物的抗炎活性增加。

    GNPS 是一個(gè)開放的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫,能夠?qū)崿F(xiàn)分子網(wǎng)絡(luò)的公共基礎(chǔ)平臺[22],能快速對LC?MS/MS 生成的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析[23-24]。馬小翔等[25]對一株高產(chǎn)丁內(nèi)酯I 的海洋來源土曲霉C23?3進(jìn)行化學(xué)調(diào)控,運(yùn)用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法以及基于質(zhì)譜的分子網(wǎng)絡(luò)分析其次生代謝產(chǎn)物的產(chǎn)量和多樣性發(fā)現(xiàn),菌株C23?3 經(jīng)化學(xué)調(diào)控后的次生代謝產(chǎn)物產(chǎn)生了不同程度的變化。Wang 等[26]基于 MS/MS的分子網(wǎng)絡(luò)來研究A. caelatus的化學(xué)成分,從而發(fā)現(xiàn)了新的二酮哌嗪二聚體和曲霉素。Freire 等[27]通過GNPS 對海綿Agelas dispar的甲醇部分進(jìn)行研究,從中發(fā)現(xiàn)了新的溴吡咯衍生物。

    FBMN 是一種基于高分辨質(zhì)譜的改進(jìn)GNPS 方法[28]。在本研究中,利用FBMN 進(jìn)行了活性菌株次生代謝產(chǎn)物的注釋,從數(shù)據(jù)庫中匹配到了8 個(gè)抗炎化合物[29-36],且基于二級質(zhì)譜相似性可發(fā)現(xiàn)多樣化的衍生物,從而獲得更多的抗炎活性物質(zhì)。但從匹配結(jié)果可看出化合物的生物來源主要來自于植物和細(xì)菌,在珊瑚共附生真菌中尚未被發(fā)現(xiàn),或尚未被GNPS 數(shù)據(jù)庫所收錄,說明珊瑚共附生真菌中的次級代謝產(chǎn)物值得進(jìn)行深入研究。

    4 結(jié)論

    不同培養(yǎng)條件下石珊瑚共附生真菌次級代謝產(chǎn)物的抗炎活性和化學(xué)多樣性表現(xiàn)出明顯差異。其中5 株菌株在糙米培養(yǎng)基條件下表現(xiàn)出顯著的抗炎活性,而菌株C3?9 粗提物在低濃度條件下也表現(xiàn)出了顯著的抑制NO 產(chǎn)生的作用。進(jìn)一步的TLC 和FBMN 分析顯示,菌株C3?9 的次級代謝產(chǎn)物中含有豐富的抗炎活性化合物,這為后續(xù)抗炎活性化合物的深入研究提供了基礎(chǔ),對抗炎藥物的研發(fā)具有一定的科學(xué)意義。

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