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    漆酶BmLac 的異源表達(dá)、酶學(xué)特性及棉酚降解的研究

    2024-01-12 12:41:32魏婷柳苗華彪吳倩黃遵錫
    生物技術(shù)通報 2023年12期
    關(guān)鍵詞:漆酶棉酚棉籽

    魏婷柳 苗華彪,2 吳倩,2 黃遵錫,2

    (1. 云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,昆明 650500;2. 生物能源持續(xù)開發(fā)利用教育部工程研究中心,昆明 650500)

    隨著畜牧業(yè)的快速發(fā)展,我國飼料原料極其緊缺。我國是棉花生產(chǎn)大國,每年都會有棉花副產(chǎn)品產(chǎn)生,如棉籽粕、棉籽殼[1]。棉籽粕粗蛋白含量34%-40%,優(yōu)質(zhì)蛋白含量約22.5%[2],可作為植物性蛋白原料[3],部分緩解飼料原料緊缺的現(xiàn)狀,但棉籽粕中含有游離棉酚(free gossypol)抗?fàn)I養(yǎng)因子,限制了其在飼料工業(yè)上的應(yīng)用[4]。游離棉酚會引起人體、動物組織和器官高度中毒[5],導(dǎo)致生殖功能障礙[6],肝功能受損,呼吸窘迫[7-10]。目前降解棉籽粕中游離棉酚的方法有物理法、化學(xué)法、微生物發(fā)酵法、酶解法[11],前兩種方法會影響棉籽粕的風(fēng)味,脫毒效率低[12],微生物發(fā)酵法是目前最佳脫除棉籽粕中游離棉酚的方法[4],但是此法操作復(fù)雜,對所用菌株類型及其用量要求嚴(yán)格。酶解法相比于其他方法是安全、綠色的方法。

    漆酶(laccas,EC 1.10.3.2)屬于多銅氧化酶(MCOs)家族,MCOs 是一類在自然界中廣泛分布,氧化多種底物時以氧為電子受體將O2還原為H2O 的一類含銅的蛋白質(zhì)[13]。漆酶由3 個銅氧還蛋白結(jié)構(gòu)域(D1-D3)組成,其活性中心是4 個銅離子,I 型銅有共價銅-半胱氨酸鍵,是底物氧化的部位;II型銅有2 個組氨酸殘基配體,在電子順磁共振(EPR)下有一個特征信號;Ш 型銅是一個具有抗偶磁性并有6 個組氨酸殘基配體的雙核銅中心,與II 型銅形成三核中心成為氧的還原部位[14-17]。

    漆酶在高等植物、昆蟲、細(xì)菌和真菌中均能產(chǎn)生[18]。目前細(xì)菌和真菌來源的漆酶研究較多,真菌漆酶雖然是被用于工業(yè)生產(chǎn)最多的漆酶,但其產(chǎn)酶量低、發(fā)酵周期長、高溫下穩(wěn)定性差[19-21]。細(xì)菌漆酶能在較寬的溫度和pH 下作用,高溫下穩(wěn)定性良好,對抑制劑有一定的穩(wěn)定性[22-23]。在Azospirillum lipoferum中較早發(fā)現(xiàn)原核漆酶[24],隨后從Pseud?omonassp.[25]、Escherichia coli[26]和B.subtilis[27]中相繼發(fā)現(xiàn)漆酶。枯草芽孢桿菌的芽孢外殼蛋白CotA是細(xì)菌漆酶的典型代表,目前已報道產(chǎn)生漆酶的芽孢桿菌有B.clausii[28]、B.amyloliquefaciens[29]、B.licheniformis[30]、B.pumilus[31]和B. thuringiensis[32]。Wang 等[33]首次發(fā)現(xiàn)漆酶能催化棉酚的分子內(nèi)環(huán)化反應(yīng),將棉酚的醛基和羥基氧化為半醌自由基,并產(chǎn)生釋放的羥基自由基。本文通過菌株篩選,獲得一株B.amyloliquefaciensXP?13并從中挖掘漆酶基因,并在畢赤酵母中異源表達(dá)獲得BmLac 蛋白,測定其酶學(xué)性質(zhì)及對棉酚的降解效果。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌株、質(zhì)粒 解淀粉芽孢桿菌、大腸桿菌DH5α、畢赤酵母GS115、pPic9k 由本實驗室保存。

    1.1.2 主要試劑 ABTS(羅恩公司),棉酚(上海源葉),細(xì)菌基因組提取試劑盒及質(zhì)粒提取試劑盒購自O(shè)mega 公司,pMD?18?T、rTap 酶、EcoR I、NotI、SalI 均購自TaKaRa 公司,其他試劑均為分析純。

    1.1.3 培養(yǎng)基 篩選培養(yǎng)基:0.5%酵母浸粉、1%胰蛋白胨、1%NaCl、2%瓊脂、0.25 mmol/L CuSO4。

    Amp?LB:0.5%酵母浸粉、1%胰蛋白胨、1%NaCl、2%瓊脂、終濃度100 μg/mL 的Amp。

    YEPD:1%酵母浸粉、2%蛋白胨、2%葡萄糖、2%瓊脂。

    發(fā)酵培養(yǎng)基BMGY、BMMY 根據(jù)畢赤酵母操作手冊配制(由Invitrogen 公司提供)。

    1.2 方法

    1.2.1 菌株的篩選 土樣采集于普洱市思茅區(qū)茶山,稱取1 g 土樣于含0.25 mmol/L CuSO4的LB 培養(yǎng)基中37℃,180 r/min 培養(yǎng)12-24 h,稀釋倍數(shù)涂布于含0.25mmol/L CuSO4的LB 固體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4-5 d,在菌落周圍滴加1 mmol/L ABTS,菌落周圍出現(xiàn)綠色,表示有漆酶活性。將顯色菌落進(jìn)行多次平板劃線純化,進(jìn)行鑒定。

    1.2.2 菌株鑒定 XP?13 菌株基因組用細(xì)菌基因組試劑盒提取,以基因組為模板,27F、1492R 為引物,PCR 程序:94℃ 5 min;94℃ 30 s;55℃ 30 s;72℃90 s;72℃ 10 min,30 個循環(huán)進(jìn)行16S rDNA 擴(kuò)增,膠回收純化,與pMD?18?T 載體連接后轉(zhuǎn)化到DH5α感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行菌落PCR 陽性克隆驗證。測序結(jié)果16S rDNA 序列在NCBI 進(jìn)行BLAST 同源比對,用MEGA?X 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。使用光學(xué)顯微鏡觀察XP?13 的芽孢。

    1.2.3 漆酶BmLac 的分析、克隆與表達(dá)

    1.2.3.1 漆酶BmLac 的分析 將BmLac基因序列在NCBI 進(jìn)行BLASTX 分析,用ExPASY 進(jìn)行BmLac 的PI/MW 以及帶正負(fù)電荷總數(shù)預(yù)測,用Pfam 進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預(yù)測,PSIPRED 二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,SWISS?MODEL 進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測。

    1.2.3.2 漆酶BmLac 的克隆與表達(dá) 根據(jù)pPic9k 序列設(shè)計BmLac 上下游引物,引物序列如下:

    F:5'?GCTGAAGCTTACGTAGAATTCATGGCAC TAGAAAAATTTGCAG?3';

    R:5'?AAGGCGAATTAATTCGCGGCCGCCTGCT TATCCGTGACGTCCA?3'。

    以XP?13 菌株基因組為模板,以F、R 為上下游引物,以PCR 程序:94℃ 5 min;94℃ 30 s;60℃1 min;72℃ 90 s;72℃ 10 min,30 個循環(huán)進(jìn)行目的基因擴(kuò)增,將pPic9k 用EcoR I、NotI 雙酶切,膠回收純化,回收產(chǎn)物用Exnase II 重組酶連接,獲得重組質(zhì)粒pPic9k?BmLac。用SalI 酶線性化pPic9k?BmLac 質(zhì)粒,電轉(zhuǎn)到畢赤酵母GS115 中,稀釋涂布在含G418 抗生素的YEPD 平板篩選陽性轉(zhuǎn)化子。

    挑取陽性克隆于BMGY 培養(yǎng)基,30℃培養(yǎng)48 h,離心10 min,加入BMMY 培養(yǎng)基,30℃培養(yǎng)48 h,離心10 min,取上清液以ABTS 為底物測酶活,進(jìn)行SDS?PAGE:煮沸失活的酶液進(jìn)行SDS?PAGE后用考馬斯亮藍(lán)染色;具有活性的酶液進(jìn)行SDS?PAGE 后用0.5 mmol/L ABTS 進(jìn)行染色,目的條帶顯示綠色。

    1.2.4 漆酶酶活測定 酶活測定[34]:50 mmol/L 檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液2.83 mL,50 mmol/L ABTS 120 μL,酶液50 μL,反應(yīng)10 min,冰浴1 min 終止反應(yīng),分光光度計420 nm 讀值,對照組調(diào)零。

    酶活定義(U):在特定條件下,在1 min 內(nèi)轉(zhuǎn)化1 μmol 底物所需的酶量。酶活計算公式:U/mL=(A×V0×106)/(V1×ε×d×T),其中A 是吸光度值,V0是反應(yīng)總體系(mL),V1酶液體積(mL),ε 消光系數(shù)(εABTS=36 000 L/(cm·mol·L),d 比色皿直徑(cm),T 反應(yīng)時間(min)。

    1.2.5 漆酶酶學(xué)性質(zhì)的測定

    1.2.5.1 漆酶最適pH 及pH 穩(wěn)定性測定 最適pH測定:將酶液于37℃、pH 2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7 的檸檬酸-磷酸氫二鈉50 mmol/L 緩沖液反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,以最高酶活為100%。

    pH 穩(wěn)定性測定:將酶液與pH 2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7 檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液混勻在37℃下孵育1 h,在pH 4,55℃反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,以未處理酶液酶活為100%。

    1.2.5.2 最適溫度及溫度穩(wěn)定性測定 最適溫度測定:酶液在最適pH、溫度10、20、30、40、50、55、60、65、70、80、90℃下反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,以最高酶活為100%。

    溫度穩(wěn)定性測定:酶液在70℃、80℃、90℃下分別耐受0、10、20、30、40、50、60 min,在pH 4,55℃反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,以0 min酶液酶活為100%。

    1.2.5.3 金屬離子及有機(jī)試劑對酶活性的影響 酶液反應(yīng)體系中分別加入終濃度1 mmol/L、10 mmol/L的NaCl、KCl、LiCl、CaCl2、ZnSO4、CoCl2、CuSO4、MgSO4、MnSO4、Pb(CH3CO2)2、FeSO4、NiSO4、FeCl3、AlCl3金屬離子和有機(jī)試劑溶液Guanidine Hydrochloride、Urea、EDTA,在pH 4,55℃反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,以不加金屬離子或有機(jī)試劑酶液酶活為100%。

    1.2.5.4 漆酶動力學(xué)參數(shù)測定 配制不同濃度的ABTS,濃度分別是1、3、5、7、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50 mmol/L,在pH 4,55℃反應(yīng)10 min,分光光度計測吸光度,計算酶活。

    1.2.6 漆酶對棉酚的降解效果 總反應(yīng)體系1 mL 中含:50 mmol/L 檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液、終濃度0.05 mg/mL 的棉酚、酶液(或終濃度1.25 mmol/L ABTS)。在反應(yīng)體系中不加介體ABTS,在55℃下分別反應(yīng)0 h、1 h、2 h;在反應(yīng)體系中加入終濃度1.25mmol/L 的介體ABTS,在55℃下分別反應(yīng)0 h、1 h、2 h;均以0 h 為對照。反應(yīng)結(jié)束后過濾膜,通過高效液相色譜(HPLC)進(jìn)行定性定量分析。HPLC 條件[35]:色譜柱型號:LCMS?2020(C18,4.6 nm×250 nm,5 μm),流動相是乙腈∶0.2%磷酸=85∶15,流速1 mL/min,進(jìn)樣量20 μL,紫外檢測波長235 nm,柱溫25℃。

    2 結(jié)果

    2.1 XP?13菌株鑒定

    PCR 產(chǎn)物片段大小是1 500 bp 左右(圖1?A),在100 倍物鏡下觀察到大小均勻,呈圓柱形的芽孢(圖1?B),XP?13 菌株的16S rDNA 測序結(jié)果通過NCBI 比對并構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1?C),XP?13 菌株與B.amyloliquefaciens是在同一分支,并且與B.amyloliquefaciens stiandB15 的同源性是99.93%,由此初步將該菌鑒定為解淀粉芽孢桿菌。

    圖1 XP-13 菌株鑒定Fig. 1 Identification of XP-13 strain

    2.2 漆酶BmLac的分析、克隆與表達(dá)

    2.2.1 漆酶BmLac 的分析 通過NCBI blastx 比對顯示,BmLac 與來源于解淀粉芽桿菌的多銅氧化酶家族的 WP_031378818.1 具有100%同源性;與Lysinibacillus fusiformis的漆酶AYW03784.1 的同源性是77.25%,與報道過具有降解棉酚效果的漆酶WP_161541154.1 同源性是19%。經(jīng)ExPASY 預(yù)測了BmLac 的PI/MW 是6.34/58.07 kD,帶負(fù)電荷氨基酸殘基(Asp+Glu)總數(shù)是63 個,帶正電荷氨基酸殘基(Arg+Lys)總數(shù)是56 個。通過Pfam 結(jié)構(gòu)域分析BmLac 具有1 個Cu oxidase、1 個Cu?oxidase_2 和2個Cu?oxidase_3 結(jié)構(gòu)域(圖2?A),PSIPRED 預(yù)測二級結(jié)構(gòu)有α-helix(4.10%)、β-sheet(31.45%)、Coli(64.45%),說明該酶具有以β-sheet 為主,α-helix 為輔的二級結(jié)構(gòu)。通過SWISS?MODEL 預(yù)測BmLac 的三維結(jié)構(gòu)(圖2?B)。

    圖2 漆酶BmLac 的分析Fig. 2 Analysis of laccase BmLac

    2.2.2 漆酶BmLac的克隆與表達(dá)BmLac基因全長是1 536 bp,編碼512 個氨基酸,PCR 產(chǎn)物驗證條帶大小正確(圖3?A),與pMD?18?T 載體連接測序結(jié)果正確。pPic9k 雙酶切結(jié)果如圖3?B 所示。把重組質(zhì)粒pPic9k?BmLac 轉(zhuǎn)入到畢赤酵母GS115,進(jìn)行發(fā)酵誘導(dǎo),取上清發(fā)酵液進(jìn)行SDS?PAGE 電泳驗證。結(jié)果表明蛋白條帶大小在58 kD 左右,與理論分子量一致(圖4,泳道1),經(jīng)ABTS 染色顯示只有一條單一的目的條帶,大小與理論分子量一致(圖4,2 泳道)。

    圖3 BmLac 和pPic9k 凝膠電泳圖Fig. 3 BmLac and pPic9k gel electrophoresis

    圖4 BmLac 的SDS-PAGEFig. 4 SDS-PAGE of BmLac

    2.3 漆酶BmLac酶學(xué)特性分析

    2.3.1 最適pH 及pH 穩(wěn)定性 對漆酶BmLac 進(jìn)行最適pH 測定,結(jié)果表明在pH 4 時漆酶BmLac 的酶活達(dá)到最高(圖5?A);酶液分別在37℃,pH 2.5-7保持60 min 后測定酶活,結(jié)果表明pH 2.5-3 相對酶活在50%以上,pH 3.5-7 之間相對酶活在90%以上(圖5?B),說明該酶作用的pH 范圍較廣。

    圖5 BmLac 最適pH 及pH 穩(wěn)定性Fig. 5 Optimal pH and pH stability of the BmLac

    2.3.2 最適溫度及溫度穩(wěn)定性 在最適pH 4 測定不同溫度下漆酶BmLac 的酶活,結(jié)果表明在40-65℃之間的相對酶活在70%以上,在55℃時酶活達(dá)到最高(圖6?A)。在pH 4,55℃條件測定的酶活是101.56 U/mL。漆酶BmLac 分別在70、80、90℃下保持60 min 后,在55℃,pH 4 下測定酶活,結(jié)果表明其相對酶活均在70%以上,未到達(dá)半衰期(圖6?B),說明該酶具有良好的熱穩(wěn)定性。

    圖6 BmLac 最適溫度及溫度穩(wěn)定性Fig. 6 Optimal temperature and temperature stability of the BmLac

    2.3.3 金屬離子及有機(jī)試劑的影響 漆酶BmLac 在金屬離子及有機(jī)試劑的存在下測定酶活,結(jié)果表明加入終濃度1 mmol/L Cu2+后酶活提高了1.93 倍,1mmol/L 的Mn2+、Pb2+、Mg2+、Zn2+、Ni2+、K+、Na+、Ca2+等對酶活的影響不明顯,而Fe2+幾乎完全抑制;10 mmol/L 的Cu2+、Mn2+、Mg2+對酶活影響不明顯,Pb2+、Ni2+、K+、Na+、Ca2+、Li+起到部分抑制作用,F(xiàn)e3+、Al3+、Fe2+完全抑制酶活。1 mmol/L的Guanidine Hydrochloride、Urea 的相對酶活均保持在92%以上,10 mmol/L 的Guanidine Hydrochloride、EDTA 對酶活有部分抑制作用;10 mmol/L 的Urea 對酶活沒有影響(表1)。

    表1 金屬離子和化學(xué)試劑對BmLac 的影響Table 1 Effects of metal ions and chemical reagents on BmLac

    2.3.4 動力學(xué)曲線 以不同濃度1-5 mmol/L 的ABTS 為底物,在pH 4、55℃下測定酶活,利用GraphPad Prism 5.0 軟件對結(jié)果進(jìn)行非線性曲線擬合,如圖7 所示,曲線計算得Vmax=(126.7±1.829)μmol/(min·mL)、Km=(0.451 9±0.034 9)mmol/L。

    圖7 BmLac 的動力學(xué)曲線Fig. 7 Enzyme kinetic curves of BmLac

    2.4 漆酶BmLac對棉酚的降解

    結(jié)果表明,不加介體反應(yīng)1 h 后的棉酚降解率為84.07%,反應(yīng)2 h 后的棉酚降解率為94.57%;加1.25 mmol/L ABTS 反應(yīng)1 h 后棉酚降解率為95.68%,反應(yīng)2 h 后棉酚降解率達(dá)到98.73%(圖8)。該酶在無ABTS 存在時對棉酚降解的比較慢,而加入1.25mmol/L ABTS,反應(yīng)1 h 后降解率比不加時提高了11.61%。

    圖8 BmLac 降解棉酚的HPLC 分析Fig. 8 HPLC analysis of BmLac degrading gossypol

    3 討論

    棉籽粕不經(jīng)處理飼喂動物,長時間積累會導(dǎo)致中毒,通過食物鏈傳遞直接或間接危害人類健康[36]。降低棉籽粕中游離棉酚的含量是提高棉籽粕利用率的重要途徑。Wang 等[33]以小鼠體重的100 mg/kg棉酚和漆酶催化棉酚后的環(huán)化產(chǎn)物飼喂小鼠,結(jié)果表明經(jīng)過漆酶催化的棉酚能降低棉酚對肝臟、生殖器官的毒性。王雨辰等[37]驗證了棉酚在漆酶BA4、終濃度1 mmol/L ABTS 存在下,30℃和40℃分別反應(yīng)1 h 后,棉酚的降解率均是30%。本文通過用漆酶BmLac 降解棉酚,不加介體反應(yīng)1 h 后降解率是84.07%,反應(yīng)2 h 后降解率是94.57%;加1.25 mmol/L ABTS 反應(yīng)1 h 后降解率是95.68%,反應(yīng)2 h后降解率達(dá)到98.73%,但沒有證明BmLac 蛋白對棉酚是否發(fā)生分子內(nèi)環(huán)化作用及催化產(chǎn)物種類分析。

    近年對漆酶的研究越來越多,獲得了來源廣泛的漆酶基因,但是基于漆酶自身的局限性,還未獲得滿足工業(yè)生產(chǎn)需求的漆酶。解淀粉芽孢桿菌漆酶是芽孢外壁CotA 蛋白,有良好的熱穩(wěn)定性[38],適合應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn),如B. amyloliquefaciensTCCC 111018 漆酶在80℃中孵育120 min 后留有酶活[30];B. amyloliquefaciensA1 在80℃孵育10 min,相對酶活剩余79%[39]。真菌漆酶的熱穩(wěn)定性相比于其是較差的,如Ganoderma lucidumTR6 中通過RT?PCR獲得漆酶基因的cDNA,在最適溫度60℃下孵育1 h,酶活幾乎完全喪失[40];Botrytis cinerea241 的Bcl1 漆酶在60℃孵育1 h 達(dá)到了半衰期,相對酶活剩余50%[41]。此外,其他細(xì)菌漆酶的熱穩(wěn)定性也比真菌漆酶好,如Li 等[42]從短小芽孢桿菌中獲得漆酶rLAC,在最適溫度80℃孵育1 h 后相對酶活剩余40%左右。Zhang 等[43]從宏基因組中得到漆酶Lacz1 蛋白,最適pH 4.5,最適溫度75℃,在85℃下孵育60 min,相對酶活剩余20%。漆酶BmLac 最適pH 4,最適溫度55℃,80℃下孵育1 h 后相對酶活剩余80%,在90℃下孵育1 h,相對酶活剩余70%,均未到達(dá)半衰期。該酶的最適溫度比其他漆酶低,但其耐熱性較好,具備用于工業(yè)生產(chǎn)的潛能。

    金屬離子、有機(jī)試劑對漆酶的影響也非常重要,BmLac 添加1 mmol/L CuSO4相對酶活提高了93%,添加1 mmol/L FeSO4卻幾乎完全抑制酶活。研究表明Cu2+對漆酶有激活作用,Zhang 等[43]在乙酸鈉緩沖液中添加10 mmol/L 的CuSO4,酶活從0.10 U/mg提高至16.39 U/mg;Lin 等[44]在10 mg/L Cu2+下酶活提高15%,這可能是由于II 型銅的銅離子結(jié)合位點(diǎn)被Cu2+占據(jù)[45]。其他金屬離子低濃度下對BmLac的影響不是很大,除了Fe2+幾乎完全抑制酶活。

    本研究從B.amyloliquefaciensXP?13 獲取漆酶基因,進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)測定及其對棉酚的降解效果。為后期降解棉籽粕中游離棉酚奠定基礎(chǔ),讓棉籽粕成為植物性蛋白飼料原料成為可能,同時也能緩解飼料原料緊缺的現(xiàn)狀。后續(xù)研究可通過對BmLac 漆酶進(jìn)行分子改造,如蛋白質(zhì)工程、酶分子修飾等,進(jìn)而提高酶活、穩(wěn)定性及游離棉酚降解效率,旨在獲得一種適合于工業(yè)生產(chǎn)的漆酶。

    4 結(jié)論

    本研究從土壤中篩選得到一株產(chǎn)漆酶菌株B.amyloliquefaciensXP?13,從中獲得漆酶基因BmLac在畢赤酵母GS115 中異源表達(dá)獲得漆酶BmLac 蛋白,最高酶活為101.56 U/mL,最適反應(yīng)條件為55℃,pH 4,具有較好的熱穩(wěn)定性,對棉酚降解效果好,不加介體反應(yīng)1 h 后棉酚降解率為84.07%,反應(yīng)2 h后棉酚降解率為94.57%;加1.25 mmol/L ABTS 反應(yīng)1 h 后棉酚降解率為95.68%,反應(yīng)2 h 后棉酚降解率達(dá)到98.73%,具有成為漆酶酶制劑規(guī)?;a(chǎn)及用于棉籽粕中游離棉酚降解的潛力。

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