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    基于抗體-適配體夾心生物傳感器檢測(cè)大腸桿菌O157: H7

    2024-01-12 12:40:58侯煒辰葉柯李潔張洋子許文濤朱龍佼李相陽(yáng)
    生物技術(shù)通報(bào) 2023年12期
    關(guān)鍵詞:磁珠靶標(biāo)菌液

    侯煒辰 葉柯 李潔 張洋子 許文濤 朱龍佼 李相陽(yáng)

    (1. 北京農(nóng)學(xué)院食品科學(xué)與工程學(xué)院 食品質(zhì)量與安全北京實(shí)驗(yàn)室 農(nóng)產(chǎn)品有害微生物及農(nóng)殘安全檢測(cè)與控制北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 102206;2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營(yíng)養(yǎng)工程學(xué)院,北京 100083;3. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)營(yíng)養(yǎng)與健康系 食品精準(zhǔn)營(yíng)養(yǎng)與質(zhì)量控制教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100083)

    大腸桿菌(Escherichia coli)是一種革蘭氏陰性短桿菌,作為正常菌群存在于人或溫血?jiǎng)游锏捏w內(nèi),同時(shí)也被用作多種基質(zhì)糞便污染的指標(biāo)[1-3]。然而,一些進(jìn)化的大腸桿菌群體已經(jīng)積累了致病性,對(duì)人類造成潛在威脅。

    腸出血性大腸桿菌O157: H7 是一種產(chǎn)志賀毒素大腸桿菌,是主要致病性大腸桿菌之一。大腸桿菌O157: H7 是一種罕見的大腸桿菌血清型,1980 年首次作為腸道病原體報(bào)道,從食用半熟漢堡后患出血性結(jié)腸炎的患者中分離[4]。此后,陸續(xù)報(bào)告了由大腸桿菌O157: H7 導(dǎo)致的出血性和非出血性腹瀉以及溶血性尿毒癥綜合征(haemolytic uraemic syndrome,HUS)、出血性結(jié)腸炎(haemorrhagic colitis,HC)、血栓性血小板減少性紫癜(thrombocytopenic purpu?ra,TTP),如果未進(jìn)行及時(shí)的治療會(huì)危及生命[5-6]。

    目前對(duì)于大腸桿菌的檢測(cè)方法主要依據(jù)國(guó)標(biāo)GB 4789.36-2016[7]、免疫學(xué)鑒定法[8]和分子學(xué)中基于核酸擴(kuò)增的檢測(cè)方法[9],此外還有一些光學(xué)[10]和電化學(xué)[11]等檢測(cè)手段。目前的標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)方法仍是傳統(tǒng)培養(yǎng)方法,通常基于選擇性預(yù)富集、富集和鍍膜,然后使用菌落形態(tài)、糖發(fā)酵模式和溶血特性來(lái)確認(rèn)疑似菌落。雖然這種方法廉價(jià)且簡(jiǎn)單,但由于其耗時(shí)長(zhǎng)且操作繁雜,并不適用于致病菌的快速篩查和即時(shí)檢測(cè)。

    適配體是基于DNA 或RNA 的短單鏈寡核苷酸,當(dāng)其折疊成獨(dú)特的三維結(jié)構(gòu)時(shí),可以選擇性地靶標(biāo)結(jié)合,具有高親和力和特異性[12-13]。目前已有報(bào)道多種適配體作為診斷工具和疾病治療藥物靶向不同的目標(biāo)。利用適配體進(jìn)行檢測(cè)、分析和量化小分子和蛋白質(zhì)已經(jīng)成為時(shí)下熱點(diǎn)。使用適配體作為探針的一個(gè)最重要的優(yōu)點(diǎn)是該技術(shù)不需要?jiǎng)游锘蝮w內(nèi)免疫,從而最大限度地減少批次與批次之間的差異[14-15]。

    傳統(tǒng)方法由于耗時(shí)長(zhǎng),需要培養(yǎng)和核酸提取等步驟,無(wú)法滿足快速檢測(cè)需求。為了克服這些限制,及時(shí)采取措施防止疾病傳播和擴(kuò)散,本研究旨在開發(fā)一種快速、準(zhǔn)確的大腸桿菌檢測(cè)方法,以便在醫(yī)療、食品安全和環(huán)境監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,為保護(hù)公共衛(wèi)生和人民的健康提供有力支持。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    本研究涉及的核酸適配體序列在上海生工生物技術(shù)有限公司合成(表1);大腸桿菌、副溶血性弧菌、金黃色葡萄球菌、阪崎腸桿菌、單核增生李斯特菌、鼠傷寒沙門氏菌、兔多克隆抗體由中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)估(食品)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供;NaCl、MgCl2、KCl、Na2HPO4、KH2PO4購(gòu)自國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;乙二胺四乙酸(EDTA)購(gòu)自山東拓普生物工程有限公司;吐溫20(Tween?20)購(gòu)自天津富宇精細(xì)化工有限公司;1?(3?二甲氨基丙基)?3?乙基碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)、N?羥基琥珀酰亞胺(NHS)購(gòu)自上海麥克林生化科技有限公司;2?(N?嗎啉)乙磺酸(MES)購(gòu)自南京都萊生物技術(shù)有限公司。自配制PBS 緩沖溶液(pH 7.4,8 g NaCl,0.2 g KH2PO4,2.9 g Na2HPO4·12H2O,0.2 g KCl,使用蒸餾水定容至1 L)、PBST 緩沖溶液(1 L PBS 緩沖溶液,0.5 mL Tween?20)、TE(稱取1.211 4 g Tris,0.033 6 g EDTA,使用蒸餾水定容至100 mL。)、SPSS(稱取NaCl 0.45 g,使用蒸餾水定容至50 mL)、BB結(jié)合緩沖液(pH 7.5,6.06 g Tris,8.775 g NaCl 和0.476 g MgCl2溶于800 mL 去離子水中,使用蒸餾水定容至1 L)。

    LineGene 9600plus 熒光定量PCR 檢測(cè)儀購(gòu)于杭州博日科技有限公司);CF1524R 臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)購(gòu)于杭州恒流科技有限公司;可調(diào)式混勻儀旋渦混合器購(gòu)于北京開源國(guó)創(chuàng)科技有限公司。

    1.2 方法

    1.2.1 抗體-適配體夾心法檢測(cè)原理 以免疫磁珠(immune magnetic beads, IMB)和裁剪后得到的具有高親和力的適配體S1?3 為識(shí)別分子,搭建生物傳感器檢測(cè)致瀉性大腸桿菌O157:H7。IMB 識(shí)別靶標(biāo)上抗原區(qū)域和靶標(biāo)進(jìn)行特異性結(jié)合,形成IMB?靶標(biāo)復(fù)合物。當(dāng)在體系中進(jìn)一步加入適配體S1?3 后,靶標(biāo)上的適配體結(jié)合區(qū)域會(huì)進(jìn)一步被結(jié)合,從而形成IMB?靶標(biāo)-適配體三明治夾心復(fù)合物。當(dāng)加入不同濃度的靶標(biāo)時(shí),復(fù)合物的形成比例也將不同,對(duì)其進(jìn)行qPCR 實(shí)驗(yàn),根據(jù)其閾值周期數(shù)值(cycle thr?eshold value,Ct)變化即可對(duì)靶標(biāo)進(jìn)行量化(圖1)。

    圖1 抗體-適配體夾心法檢測(cè)大腸桿菌原理圖Fig. 1 Schematic diagram of antibody aptamer sandwich method for detecting Escherichia coli

    1.2.2 適配體的裁剪 取生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期的大腸桿菌培養(yǎng)物1 mL 于6 000 r/min 4℃離心5 min 移去上清,使用BB 清洗3 遍,再使其重懸于1 mL BB 中。將合成的適配體溶解于BB 中(100 μmol/L)并稀釋至1μmol/L,95℃孵育10 min,冰上立即冷卻10 min 以使核酸變性,便于后續(xù)與靶標(biāo)的充分結(jié)合。取20 μL(1 μmol/L)適配體與180 μL 重懸在BB 中的大腸桿菌于25℃,200 r/min 孵育1 h 后,8 000 r/min 離心5 min,并用BB 漂洗5 次。將漂洗完成的菌體內(nèi)加入100 μL TE 緩沖溶液,95℃下孵育10 min,立即4℃ 12 000 r/min 離心15 min,將上清稀釋至合適倍數(shù)后做qPCR 擴(kuò)增模板。qPCR 反應(yīng)體系總體積為20 μL:0.6 μL FP 和RP,10 μL 2×Universal SYBR qPCR Mix,2 μL 模板Apt,去離子水6.8 μL。反應(yīng)體系在95℃下預(yù)變性10 min;95℃下變性10 s,在60℃下退火及延伸30 s,經(jīng)過(guò)39 個(gè)循環(huán)。設(shè)置陰性對(duì)照組為不加入適配體其他操作相同,利用其Ct 值得出適配體裁剪效果。

    1.2.3 免疫磁珠的制備 本實(shí)驗(yàn)采用EDC/NHS 兩步法進(jìn)行IMB 的制備。取100 μL 磁珠(magnetic beads,MB)至離心管中,磁性分離去除上清液,用200 μL MEST 溶液進(jìn)行磁性分離洗滌2 次,然后移除上清液。迅速加入新鮮配制的100 μL EDC 溶液和100 μL NHS 溶液到裝有磁珠的離心管中,漩渦混勻使磁珠充分懸浮,25℃活化30 min,期間保持磁珠的懸浮狀態(tài),200 μL 偶聯(lián)液反復(fù)洗滌3 次,磁分離去除上清;向其中加入40 μL 純化抗體置于搖床200 r/min 振蕩1 h,保持MB 處于單分子懸浮狀態(tài);然后加入100 μL 封閉液孵育30 min,以封閉未反應(yīng)的活化基團(tuán),磁分離洗滌3 次棄上清;最后加入200 μL PBS 緩沖液放于4℃冰箱備用。

    1.2.4 抗體- 適配體夾心qPCR 法檢測(cè)大腸桿菌 制備完成IMB 后,加入不同濃度的培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的大腸桿菌,室溫孵育1 h,使用BB 反復(fù)清洗磁珠3 次,以充分去除未結(jié)合的靶標(biāo)。向IMB中加入100 nmol/L 裁剪適配體充分反應(yīng)30 min,進(jìn)行3 次磁分離以去除未結(jié)合的融合適配體。qPCR反應(yīng)體系總體積為20 μL:0.6 μL FP 和RP,10 μL 2×Universal SYBR qPCR Mix,2 μL 制備完成的生物傳感器,去離子水6.8 μL。對(duì)擴(kuò)增曲線Ct 值進(jìn)行數(shù)據(jù)分析??瞻讓?duì)照不添加靶標(biāo)物質(zhì),其余操作與陽(yáng)性樣本同步進(jìn)行。除非特殊說(shuō)明,所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行3 次重復(fù)。

    1.2.5 條件優(yōu)化 由于生物傳感器是通過(guò)兩步反應(yīng)法完成,且為避免IMB?適配體偶聯(lián),不改變?cè)荚O(shè)定IMB?靶標(biāo)和裁剪適配體孵育時(shí)間30 min,對(duì)IMB?靶標(biāo)孵育時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化,在30-60 min 內(nèi)改變反應(yīng)時(shí)間,測(cè)定其Ct 值變化,選取IMB?靶標(biāo)最佳反應(yīng)時(shí)間。

    1.2.6 檢測(cè)性能探究 在最佳條件下,對(duì)生物傳感器在純培養(yǎng)物中定量檢測(cè)大腸桿菌的性能進(jìn)行了探究。將濃度為106CFU/mL 的大腸桿菌進(jìn)行10 倍梯度稀釋,使用稀釋后的菌液進(jìn)行1.2.4 的操作,根據(jù)Ct 值和靶標(biāo)濃度之間的關(guān)系繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,利用Ct值對(duì)靶標(biāo)濃度進(jìn)行量化。

    1.2.7 特異性驗(yàn)證 為探究傳感器是否具有特異性,選取金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、克羅諾桿菌屬(阪崎腸桿菌)、副溶血性弧菌、單增李斯特菌(屬間特異性驗(yàn)證)和大腸桿菌ATCC 25922、大腸桿菌ATCC 35218、大腸桿菌CICC 10389、大腸桿菌CICC 10663(種間特異性測(cè)試)作為非特異性靶標(biāo),和大腸桿菌O157: H7進(jìn)行對(duì)比測(cè)試傳感器傳感能力。

    1.2.8 實(shí)際樣品檢測(cè) 在實(shí)際檢測(cè)中,往往無(wú)法實(shí)現(xiàn)對(duì)單純培養(yǎng)基質(zhì)中大腸桿菌的研究,因此本實(shí)驗(yàn)探究了傳感器在食品基質(zhì)中的檢測(cè)性能。在最佳條件下,對(duì)生物傳感器在購(gòu)自華聯(lián)超市的金典純牛奶基質(zhì)中定量檢測(cè)大腸桿菌的性能進(jìn)行了探究。對(duì)牛奶中3×103、3×104、3×105CFU/mL 的大腸桿菌進(jìn)行加標(biāo)回收實(shí)驗(yàn),測(cè)定其回收率和相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差。

    2 結(jié)果

    2.1 適配體裁剪

    在對(duì)適配體S1 進(jìn)行截短前,首先對(duì)該適配體的親和力進(jìn)行評(píng)估。通過(guò)改變其與菌液結(jié)合的適配體的濃度和菌液濃度,評(píng)估其Ct 值變化。如圖2 所示,當(dāng)改變與靶標(biāo)結(jié)合適配體的濃度,從10 μmol/L 變?yōu)? μmol/L 時(shí),其Ct 值呈現(xiàn)了10 倍梯度變化的趨勢(shì)(Ct:8.93-12.02);當(dāng)改變菌液濃度,從約為108CFU/mL 變?yōu)?07CFU/mL,而不改變適配體濃度1 μmol/L 時(shí),其Ct 值呈現(xiàn)了10 倍梯度變化的趨勢(shì)(Ct:12.02-14.96)。且由于適配體濃度在1 μmol/L 時(shí),其梯度變化趨勢(shì)更為明顯,后續(xù)裁剪實(shí)驗(yàn)中均采用此濃度與靶標(biāo)結(jié)合。

    圖2 適配體裁剪可行性分析Fig. 2 Feasibility analysis of adaptor clipping

    確定適配體S1 具有可行性后,開始對(duì)其進(jìn)行裁剪。通過(guò)對(duì)其二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),其在接近5'端區(qū)域存在一個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),推測(cè)核心序列位于該區(qū)域,因此首先裁剪得到接近5'端22 nt 的裁剪適配體S1?1,發(fā)現(xiàn)其和原適配體序列相比Ct 值從12.46下降至11.66,親和力有所上升(圖3?A)。雖然變化較小,但相比于原長(zhǎng)已經(jīng)減少了23 nt。第二步驗(yàn)證了減少的23 nt 序列的冗余。裁剪適配體S1?2 和原始適配體S1 相比,Ct 從12.46 變?yōu)榱?3.69(圖3?B),因此可得出結(jié)論減去接近5'端的莖環(huán)結(jié)構(gòu)后的適配體S1?2 的親和力有所下降。第三步繼續(xù)對(duì)適配體S1 的中間部分進(jìn)行探究,保留11-30 位堿基即長(zhǎng)達(dá)20 nt 的序列S1?3,發(fā)現(xiàn)其和原始適配體相比Ct 值明顯下降,由12.46 下降至9.87,親和力大幅度提升,因此得到核心序列S1?3(圖3?C)。最后對(duì)S1?3 繼續(xù)進(jìn)行裁剪至12 nt 得到適配體S1?3?1,其Ct值為13.28,親和力明顯下降,推測(cè)由于序列太短導(dǎo)致其加上引物后占比過(guò)小從而失去和靶標(biāo)結(jié)合能力(圖3?D)。

    2.2 免疫磁珠的表征

    本實(shí)驗(yàn)對(duì)IMB 的制備結(jié)果進(jìn)行了動(dòng)態(tài)光散射表征,主要從粒徑變化和zeta 電位兩方面進(jìn)行評(píng)估。當(dāng)羧基磁珠與抗體分子經(jīng)過(guò)偶聯(lián)時(shí),激活羧基官能團(tuán)并形成穩(wěn)定的NHS 酯中間體,形成穩(wěn)定的酰胺鍵,將抗體與羧基磁珠連接起來(lái),由于羧基磁珠表面的羧基官能團(tuán)帶有負(fù)電荷,而抗原分子中的氨基官能團(tuán)是中性的,因此在偶聯(lián)過(guò)程中,抗原的連接會(huì)引入正電荷,導(dǎo)致電位點(diǎn)升高。如圖4?A 所示,MB 粒徑約為1 000 nm,與抗體偶聯(lián)后顯著增加至約1 271 nm,表明成功合成了IMB。同時(shí)zeta 電位值(圖4?B)表明,偶聯(lián)前后MB 表面上的電荷也發(fā)生了變化,再次驗(yàn)證IMB 的成功合成。

    圖4 IMB 的表征Fig. 4 Characterization of IMB

    2.3 可行性驗(yàn)證

    當(dāng)生物傳感器分別加入IMB、靶標(biāo)和適配體后,生物傳感器出現(xiàn)較高響應(yīng)(圖5?A),當(dāng)菌液濃度在8×106CFU/mL 時(shí),其Ct 值為7.27。當(dāng)向生物傳感器中加入IMB 和適配體時(shí),傳感器出現(xiàn)較低響應(yīng)(Ct:18.85),推測(cè)由于體系中不存在任何菌細(xì)胞時(shí),適配體和IMB 出現(xiàn)了非特異性結(jié)合從而出現(xiàn)了較低響應(yīng)。當(dāng)向生物傳感器中加入IMB 和靶標(biāo)時(shí),生物傳感器未出現(xiàn)響應(yīng),和預(yù)想一致。因此對(duì)8×106CFU/mL 菌液連續(xù)10 倍梯度稀釋4 次,測(cè)試其傳感能力,結(jié)果表明其梯度良好(圖5?B)。

    圖5 生物傳感器可行性分析Fig. 5 Feasibility analysis for biosensor

    2.4 條件優(yōu)化結(jié)果

    在適配體裁剪過(guò)程中,對(duì)菌液清洗去除培養(yǎng)基時(shí),將緩沖液由BB 分別替換為PBS、PBST、TE、SPSS。由圖6?A 可得,除PBS 的Ct 值15.45 接近BB 的Ct 值15.23 外,其余緩沖液結(jié)合效果均更差,因此緩沖液確定為BB 結(jié)合緩沖液。確定緩沖液類型后,改變緩沖液pH 為5.7、6.6、7.5 和8.4,由圖6?B 可得,適配體和靶標(biāo)在pH 為7.5 時(shí)結(jié)合效果最好,因?yàn)樵谥行原h(huán)境中適配體穩(wěn)定性更好。由圖6?C可得,孵育溫度在25℃時(shí)適配體和靶標(biāo)結(jié)合效果更好,因此選用更便于實(shí)驗(yàn)操作的25℃完成后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

    圖6 條件優(yōu)化結(jié)果Fig. 6 Condition optimization results

    在傳感過(guò)程中,IMB 和靶標(biāo)結(jié)合,由圖6?D 可得,在30-50 min 內(nèi),Ct 值有所變化,當(dāng)50 min 以后,結(jié)合趨于飽和,Ct 值基本不再發(fā)生變化。為保證IMB 和靶標(biāo)充分結(jié)合,減少IMB 和適配體的偶聯(lián),選取1 h 作為IMB?靶標(biāo)孵育時(shí)間。

    2.5 靈敏度分析

    為了確定生物傳感器的檢測(cè)限,將在培養(yǎng)條件下的菌液從8×106CFU/mL 連續(xù)10 倍梯度稀釋至8×103CFU/mL。由圖7 可得,隨著細(xì)菌細(xì)胞濃度的增加,Ct 值也成比例地降低。在(8×103)-(8×106)CFU/mL 范圍內(nèi),存在良好的線性關(guān)系,線性方程為y=18.973 43-1.858 3LgC,回歸系數(shù)為0.999 74。其中y表示Ct 值,C 表示菌液濃度。通過(guò)該線性方程,可以計(jì)算出定量限為8×103CFU/mL,檢測(cè)限為800 CFU/mL。

    圖7 靈敏度測(cè)定Fig. 7 Sensitivity measurement

    2.6 特異性驗(yàn)證

    首先檢測(cè)了裁剪適配體的特異性。由圖8?A 可以看到,當(dāng)加入相同濃度(100 nmol/L)的適配體時(shí),靶標(biāo)菌和其他非特異性靶標(biāo)相比,具有較高響應(yīng),Ct 值為9.44,而非特異性靶標(biāo)副溶血性弧菌(Ct:16.17)、金黃色葡萄球菌(Ct:15.00)、克羅諾菌屬(阪崎腸桿菌Ct:17.94)、單核細(xì)胞增生李斯特菌(Ct:18.14)和沙門氏菌(Ct:17.92)均與之有所差距。靶標(biāo)菌Ct 值和非靶標(biāo)菌之間存在顯著差異(P<0.05),證明該適配體具有良好的特異性。

    圖8 大腸埃希菌 O157∶H7 檢測(cè)方法的特異性Fig. 8 Specificity of detection method for E. coli O157∶H7

    其次檢測(cè)生物傳感器的特異性,向傳感器中加入不同靶標(biāo)測(cè)試其傳感能力。由于不同菌生長(zhǎng)情況不同,為盡可能地減小誤差,且更好展現(xiàn)出生物傳感器的特異性,靶標(biāo)濃度稀釋至8×104CFU/mL,其他均復(fù)蘇4 h 后使用。由圖8?B 可以看到,在屬間測(cè)試中,當(dāng)加入靶標(biāo)菌時(shí),生物傳感器具有較高響應(yīng),Ct 值為12.19,而非特異性靶標(biāo)金黃色葡萄球菌(Ct:24.79)、沙門氏菌(Ct:29.43)、克羅諾菌屬(阪崎腸桿菌Ct:34.22)、副溶血性弧菌(Ct:34.61)、單核細(xì)胞增生李斯特菌(Ct:35.06)均與靶標(biāo)有較大差距,靶標(biāo)菌Ct 值和非靶標(biāo)菌之間存在顯著差異(P<0.05)。由圖8?C 可以看到,在種間測(cè)試中,當(dāng)加入靶標(biāo)菌時(shí),生物傳感器具有較高響應(yīng),Ct 值為12.25,而非特異性靶標(biāo)大腸桿菌ATCC 25922(Ct:33.67)、大腸桿菌ATCC 35218(Ct:29.35)、大腸桿菌CICC 10389(Ct:29.81)、大腸桿菌CICC 10663(Ct:32.26)均與靶標(biāo)有較大差距,靶標(biāo)菌Ct 值和非靶標(biāo)菌之間存在顯著差異(P<0.05)。因此認(rèn)為該生物傳感器對(duì)大腸桿菌O157: H7 具有高度特異性。

    2.7 實(shí)際樣品檢測(cè)

    由于生物傳感器最終目的是用于食品中大腸桿菌O157: H7 的檢測(cè),因此有必要將生物傳感器應(yīng)用于人工污染的食品樣品中,對(duì)生物傳感器在食品中的檢測(cè)性能進(jìn)行驗(yàn)證。市面上的食品樣品被證實(shí)沒有可檢測(cè)到的病原體。在牛奶樣品中人工接種約108CFU /mL 的大腸桿菌O157: H7。接種4 h 后,通過(guò)傳統(tǒng)培養(yǎng)法測(cè)得實(shí)際細(xì)胞數(shù)約為3×107CFU/mL。連續(xù)10 倍梯度稀釋后選取細(xì)胞數(shù)為3×103、3×104、3×105CFU/mL 使用生物傳感器對(duì)其進(jìn)行回收實(shí)驗(yàn),測(cè)得其回收率分別為96.3%、103%、108%,RSD 分別為2.15%、2.07%、1.35%(表2)。

    表2 實(shí)際樣品檢測(cè)Table 2 Actual sample testing

    3 討論

    大腸桿菌O157: H7 是最主要的致病菌之一,常與食源性疾病相關(guān),每年都會(huì)引起疾病發(fā)生和甚至造成死亡,因此對(duì)其構(gòu)建檢測(cè)方法十分有必要。傳統(tǒng)常規(guī)培養(yǎng)法雖然準(zhǔn)確度高,但耗時(shí)耗力。因此近年來(lái)更為快速的基于抗原和抗體的特異性結(jié)合的免疫學(xué)技術(shù)備受青睞。辛思培等[16]建立了一種針對(duì)大腸桿菌O157: H7 的雙抗夾心化學(xué)發(fā)光酶聯(lián)免疫檢測(cè)方法,檢測(cè)限為2.5×104CFU/mL,雖然與傳統(tǒng)ELISA 方法相比有更好的特異性和靈敏度,但仍需擴(kuò)增培養(yǎng)10 h,同時(shí)單純的免疫學(xué)檢測(cè)方法易出現(xiàn)假陰性和假陽(yáng)性結(jié)果。核酸類的分子檢測(cè)方法是檢測(cè)大腸桿菌和其他食源性病菌的常用手段。除了單一技術(shù)的使用,研究者們也已經(jīng)嘗試將免疫學(xué)與分子學(xué)技術(shù)相結(jié)合,王淑娟等[17]開發(fā)了一種基于金屬有機(jī)骨架免疫磁珠富集結(jié)合多酶恒溫核酸快速擴(kuò)增的檢測(cè)大腸桿菌O157:H7 的方法,檢測(cè)限為1.18×105CFU/mL。

    近年來(lái)生物傳感器技術(shù)在致病菌菌株檢測(cè)方面取得了巨大的進(jìn)步,并成為一種備受大眾認(rèn)可的通用分析工具[18]。樊凱等[19]開發(fā)了用于檢測(cè)食品中大腸桿菌O157:H7,通過(guò)測(cè)量HRP 酶催化之后的過(guò)氧化氫的氧化還原電流,來(lái)實(shí)現(xiàn)電化學(xué)免疫生物傳感器,能在(5.2×10)-(5.2×106) CFU/mL 的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)食品中大腸桿菌的檢測(cè)。以適配體作為識(shí)別原件,將生物識(shí)別事件轉(zhuǎn)化為可測(cè)量的物理或化學(xué)信號(hào),信號(hào)檢測(cè)與處理系統(tǒng)則負(fù)責(zé)將信號(hào)轉(zhuǎn)化為可讀的結(jié)果的優(yōu)勢(shì)更為突出。

    本文章利用免疫磁珠的捕獲作用和磁分離,并通過(guò)多克隆抗體和裁剪得到的適配體搭建生物傳感器。使用傳統(tǒng)的PCR 檢測(cè)由于取樣小,磁珠技術(shù)在檢測(cè)的過(guò)程中可以排除樣品基質(zhì)性質(zhì)的干擾,從而提高檢出率,縮短樣品中病原菌富集的時(shí)間[20]。在前人研究的基礎(chǔ)上,將45 nt 長(zhǎng)的適配體序列裁剪至20 nt,得到其核心序列。從核酸文庫(kù)中選擇的全長(zhǎng)適配體長(zhǎng)度一般約為80 nt,但發(fā)揮靶體接觸作用的區(qū)域通常為10-15 nt[21]。在某些條件下,非必需核苷酸的存在會(huì)干擾適配體與靶分子的結(jié)合。多余的和不必要的核苷酸被消除后會(huì)提高其親和力。當(dāng)在體系中進(jìn)一步加入適配體S1?3 后,靶標(biāo)上的適配體結(jié)合區(qū)域會(huì)進(jìn)一步被結(jié)合,從而形成IMB?靶標(biāo)-適配體三明治夾心復(fù)合物。加入不同濃度的靶標(biāo)時(shí),復(fù)合物的形成比例也將不同,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR 對(duì)靶標(biāo)進(jìn)行檢測(cè),可以根據(jù)其Ct 值變化即可對(duì)靶標(biāo)進(jìn)行量化,最終實(shí)現(xiàn)對(duì)大腸桿菌O157:H7 的定量檢測(cè)。將該生物傳感器引入紙基技術(shù)或微流控技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)高通量的樣品處理和便捷快速檢測(cè),能夠進(jìn)一步縮短在實(shí)際應(yīng)用中的檢測(cè)時(shí)間。

    4 結(jié)論

    本文成功構(gòu)建了一種用于檢測(cè)大腸桿菌O157:H7 的抗體-適配體夾心生物傳感器。實(shí)現(xiàn)了對(duì)大腸桿菌O157: H7 在(8×103)-(8×106) CFU/mL 范圍內(nèi)的定量檢測(cè),該檢測(cè)限為800 CFU/mL,該方法具有良好的特異性,操作簡(jiǎn)便成本低廉,可以在2 h內(nèi)完成檢測(cè)。

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