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    開(kāi)菲爾粒中微生物對(duì)苯并(α)芘的非靶向代謝組學(xué) 分析

    2022-06-10 03:25:44古麗加馬力艾薩邢軍李安張瑞
    生物技術(shù)通報(bào) 2022年5期
    關(guān)鍵詞:原兒茶酸菲爾鄰苯二甲酸

    古麗加馬力·艾薩 邢軍 李安 張瑞

    (1. 新疆特殊環(huán)境物種保護(hù)與調(diào)控生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室 新疆師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830054;2. 新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院, 烏魯木齊 830000)

    開(kāi)菲爾粒(Kerfir grains)是傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品——開(kāi)菲爾(kefir)的發(fā)酵劑,其主要成分除黏性多糖(由半乳糖和葡萄糖構(gòu)成)外,還有大量的水和少量蛋白、脂質(zhì)等成分[1-2]。本研究團(tuán)隊(duì)前期研究表明新疆傳統(tǒng)發(fā)酵劑開(kāi)菲爾粒在屬水平上的發(fā)酵優(yōu)勢(shì)細(xì)菌主要有乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、鏈球菌屬(Streptococcus)、芽胞桿菌屬(Bacillus)、乳球菌屬(Lactococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)和奈瑟氏菌屬(Neisseria)等[3],微生物的相互適應(yīng)和協(xié)同作用聚集成了復(fù)雜的菌相,使開(kāi)菲爾粒形成了整體“戰(zhàn)斗力”,能夠抑制雜菌和致病菌的溢生,特有的黏多糖能夠保護(hù)開(kāi)菲爾粒不受外界微生物侵染[4-5],使其具有很強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)能力和抗污染能力,因此開(kāi)菲爾??梢宰鳛橐粋€(gè)相對(duì)較為穩(wěn)定的生物反應(yīng)器[6-7]。開(kāi)菲爾發(fā)酵乳制品具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,含有消化性很高的乳蛋白質(zhì)和乳脂肪。蛋白質(zhì)中水溶性氮和氨基酸含量高,發(fā)酵過(guò)程中基本無(wú)損失;脂肪球能夠充分乳化,更易消化吸收,游離脂肪酸和揮發(fā)性脂肪酸含量高,風(fēng)味良好。另外開(kāi)菲爾由于多種有益微生物菌相作用使產(chǎn)品的營(yíng)養(yǎng)比原乳有了很大提高,且易于消化,成為具有豐富營(yíng)養(yǎng)的保健食品[8-11]。

    苯并(a)芘分子量較大,由5個(gè)苯環(huán)組成,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,難溶于水。環(huán)境和食品中的苯并(a)芘,雖然可以通過(guò)一些物理、化學(xué)方法降解和清除,但易帶來(lái)二次污染,且成本較高,而生物降解是非常重要和有效的措施,具有經(jīng)濟(jì)、安全、方便的特點(diǎn),其中最為關(guān)注的是微生物降解研究,并已取得了一定成績(jī)[12-16]。有研究表明,能夠降解苯并(a)芘的微生物,主要?dú)w屬于分枝桿菌屬(Mycobacterium)和假單胞菌屬(Pseudomonas),它們大多來(lái)自被污染的水體、土壤、海洋及其沉積物[17-19]。Zhao等[20]研究了乳酸菌菌株對(duì)苯并(α)芘的結(jié)合能力發(fā)現(xiàn), L. plantarum CICC 22135和 L. pentosus CICC 23163菌株的結(jié)合率分別為66.76%和64.31%。Zhang[21]等人發(fā)現(xiàn)了乳酸菌具有去除在淀粉基食品中苯并(α)芘的潛在能力。

    新疆地區(qū)少數(shù)民族自古以來(lái)就有制作和食用發(fā)酵乳制品的習(xí)慣,經(jīng)過(guò)幾千年的馴化,這些傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中保留了許多具有傳代性好,抗逆性強(qiáng),風(fēng)味濃郁獨(dú)特對(duì)人體健康有益的乳酸菌及其它微生物菌群[22-24]。本文針對(duì)傳統(tǒng)發(fā)酵劑開(kāi)菲爾粒中微生物對(duì)多環(huán)芳烴類化合物苯并(α)芘的作用機(jī)制這一問(wèn)題,研究在苯并(α)芘脅迫作用下,開(kāi)菲爾粒微生物在發(fā)酵乳中代謝產(chǎn)物發(fā)生的特征性變化,采用非靶向代謝組學(xué)技術(shù)[25-26],結(jié)合主成分分析和偏小二乘判別分析方法,尋找特征代謝產(chǎn)物,在KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中注釋特征代謝物參與可能的代謝途徑,進(jìn)而推導(dǎo)出開(kāi)菲爾粒中微生物對(duì)苯并(α)芘降解的可行代謝物通路。研究可以為微生物對(duì)苯并(α)芘的作用機(jī)制提供一定的理論基礎(chǔ),為降低苯丙(a)芘對(duì)人體的危害提出可能的生物防治策略,進(jìn)而為開(kāi)菲爾發(fā)酵乳制品在食品工業(yè)中的合理開(kāi)發(fā)應(yīng)用提供研究依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 樣品采集 采集新疆阿勒泰地區(qū)牧民家庭手工制作的開(kāi)菲爾發(fā)酵乳制品,采集后裝入滅菌自封袋中冷凍保藏運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室。

    1.1.2 主要試劑 苯并(α)芘(分析純,>96%)購(gòu)自上海麥克林生化科技有限公司,甲醇、乙腈(均為色譜純,≥99.9%)購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司,甲基叔丁醚(分析純,≥99.9%):購(gòu)自北京沃凱生物科技有限公司,甲酸銨(分析純,≥99.9%)購(gòu)自自美國(guó) Sigma-Aldrich 公司,甲酸、丙酮、ddH2O等試劑均購(gòu)自北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司。

    1.2 方法

    1.2.1 開(kāi)菲爾粒的活化與開(kāi)菲爾乳的制備 取適量開(kāi)菲爾發(fā)酵乳制品加入無(wú)菌水輕輕搖晃,清洗,過(guò)濾后留下傘狀開(kāi)菲爾粒備用。將清洗后的開(kāi)菲爾粒按1∶5的質(zhì)量比加入到滅菌牛乳中,在(37±1)℃培養(yǎng)24 h,重復(fù)上述活化步驟活化1-2次,備用。

    苯并(α)芘溶液的配置:將苯并(α)芘固體溶于丙酮中配制為1 mg/mL的苯并(α)芘貯備液,然后用水稀釋為苯并(α)芘濃度為100 μg/mL的工作液。

    1.2.2 樣品制備及處理 樣品制備:將牛奶在80-82℃下加熱20 min后冷卻至40℃,然后以2%的接種量添加已活化的開(kāi)菲爾粒,取剛接種開(kāi)菲爾粒的牛乳為發(fā)酵0 h的樣品作為對(duì)照樣;在發(fā)酵乳中添加苯并(α)芘儲(chǔ)備液,使其濃度為50 μg/mL,樣品在37℃的恒溫培養(yǎng)箱中發(fā)酵,從發(fā)酵8 h起每隔8 h取5個(gè)平行樣,直到發(fā)酵32 h共25份樣本,分別 編 號(hào) 為KBD001、KBD002…KBD005,KBD081、KBD082…KBD085,KBD161、KBD162…KBD165,依此類推,-80℃保藏備用。

    發(fā)酵樣品的前處理:將所有樣本在4℃下融化(樣品量不足按照等比例縮減);從每個(gè)樣本中取150 μL 于1.5 mL 離心管中;每個(gè)離心管加入200 μL 甲醇和200 μL 甲基叔丁基醚(MTBE),振蕩60 s,充分混勻;在12 000 r/min 4℃ 離心10 min,上清液使用0.22 μm 膜過(guò)濾,得到待測(cè)樣本;自每個(gè)待測(cè)樣本各取20 μL 混合成QC樣本(QC:quality control,用來(lái)校正混合樣品分析結(jié)果的偏差以及由于分析儀器自身原因所造成的失誤)。

    1.2.3 LC-MS分析 色譜條件:儀器采用Thermo Ultimate 3000,使用ACQUITY UPLC? HSST3 1.8 μm(2.1 mm×150 mm)色譜柱,自動(dòng)進(jìn)樣器溫度設(shè)為8℃,以0.25 mL/min 的流速,40℃的柱溫,進(jìn)樣2 μL 進(jìn)行梯度洗脫,流動(dòng)相為正離子0.1%甲酸水(C)- 0.1%甲酸乙腈(D);負(fù)離子5 mmol/L 甲酸銨水(A)-乙腈(B)。梯度洗脫程序?yàn)?-1 min,2% B/D;1-9 min,2%-50% B/D;9-12 min,50%-98% B/D;12-13.5 min,98% B/D;13.5-14 min,98%-2% B/D;14-20 min,2% D -正模式(14-17 min,2% B -負(fù) 模式)。

    質(zhì)譜條件:儀器使用Thermo Q Exactive Focus,電噴霧離子源(ESI),正負(fù)離子電離模式,正離子噴霧電壓為3.50 kV,負(fù)離子噴霧電壓為2.50 kV,鞘氣30 arb,輔助氣 10 arb。毛細(xì)管溫度325℃,以分辨率70 000 進(jìn)行全掃描,掃描范圍81-1 000,并采用HCD 進(jìn)行二級(jí)裂解,碰撞電壓為30 eV,同時(shí)采用動(dòng)態(tài)排除去除無(wú)必要的MS/MS信息。

    1.2.4 數(shù)據(jù)分析 所有的LC-MS圖譜使用R(v3.1.3)的XCMS程序包進(jìn)行峰識(shí)別、峰過(guò)濾、峰對(duì)齊得到包括質(zhì)核比(mass to charge ratio,m/z)和保留時(shí)間及峰面積等信息的數(shù)據(jù)矩陣,進(jìn)而得到正負(fù)離子模式下的前體分子,導(dǎo)出數(shù)據(jù)至R語(yǔ)言statTarget包的QC-RFSC算法對(duì)各個(gè)樣本的特征(每個(gè)代謝物)信號(hào)峰進(jìn)行校正,使用R2和Q2進(jìn)行主成分分析(principal components analysis,PCA)和最小二乘法判別分析PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis),根據(jù)t檢驗(yàn)的P <0.05,同時(shí) PLS-DA 模型主成分的VIP 值>1,進(jìn)行差異性代謝物的篩選。對(duì)篩選出的差異代謝物,通過(guò)KEGG Pathway 數(shù)據(jù)庫(kù)通路分析代謝物參與代謝途徑,推導(dǎo)出苯并(α)芘降解的代謝物通路。

    2 結(jié)果

    2.1 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段的開(kāi)菲爾代謝物主成分分析(PCA)

    采用PCA分析對(duì)苯并(α)芘脅迫下的5個(gè)不同的發(fā)酵時(shí)間段的開(kāi)菲爾樣品進(jìn)行PCA分析,結(jié)果見(jiàn)圖1。5個(gè)分組的點(diǎn)云(point cloud)明顯分布在不同區(qū)域,從總體上反映了各組樣品之間的總體差異和組內(nèi)樣品之間的變異度大小,5組不同發(fā)酵時(shí)間段的樣品組的平行樣品聚在一起,表明所有檢測(cè)具有良好的分析穩(wěn)定性和實(shí)驗(yàn)重現(xiàn)性;同時(shí),第一主成分(PC1)和第二主成分(PC2)解釋率分別為39%和14%,兩者累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到53%,可見(jiàn)苯并(α)芘脅迫條件下不同發(fā)酵時(shí)間內(nèi)開(kāi)菲爾樣品之間分離趨勢(shì)較明顯,從整體上反映出這些樣品之間的代謝物差異。A組未添加苯并(α)芘的對(duì)照樣品與其他樣品代謝物之間存在明顯分離,可能是在苯并(α)芘脅迫下開(kāi)菲爾粒中微生物產(chǎn)生的謝物物所導(dǎo)致的。

    圖1 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品主成分分析Fig. 1 Principal component analysis of the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    2.2 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段的開(kāi)菲爾代謝物PLS-DA分析

    偏最小二乘判別分析是有監(jiān)督的,即分析時(shí)需要提供分組信息,能夠?qū)ふ易畲蟪潭葏^(qū)分樣品分組的因子(因子可以理解為所有代謝物的加權(quán)和)。如圖2,不同分組的樣本的點(diǎn)云分布在不同區(qū)域,說(shuō)明PLS-DA模型的判別效果較好,分組間應(yīng)該存在有顯著差異的代謝物,其結(jié)果與PCA相似,正離子模式下所構(gòu)建模型對(duì)開(kāi)菲爾代謝物的累積判別解釋能力R2Y=0.997,對(duì)模型預(yù)測(cè)能力Q2=0.971,這兩個(gè)指標(biāo)越接近于1時(shí)表示模型越穩(wěn)定可靠,模型的擬合度較好。在OPLS-DA的置換檢驗(yàn)中,我們用Q2作為檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量,用置換的方法求得Q2的隨機(jī)分布。如圖3,如果箭頭所指的實(shí)際觀測(cè)Q2在隨機(jī)分布右側(cè)(觀測(cè)值明顯大于隨機(jī)值),說(shuō)明Q2是顯著的,模型的預(yù)測(cè)能力顯著。

    圖2 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段段樣品PLS-DA得分圖Fig. 2 PLS-DA score map of samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    圖3 OPLS-DA置換檢驗(yàn)的檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量(Q2)分布以及 P值Fig. 3 Distribution of the test statistic(Q2)of the OPLSDA substitution test and the P value

    2.3 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段的開(kāi)菲爾代謝物

    計(jì)算每個(gè)樣本內(nèi)各個(gè)代謝物的百分比含量,然后用堆積柱形圖可視化,能直觀的比較分組之間的代謝物組成結(jié)構(gòu)差異。圖4展示了含量排在前20的代謝物,橫坐標(biāo)是樣品名,根據(jù)分組順序排序,同時(shí)用不同顏色標(biāo)注了不同的分組樣本??v坐標(biāo)表示各個(gè)代謝物的百分比含量,從上而下對(duì)應(yīng)代謝物的柱的順序與圖例一致,其余的代謝物被包括進(jìn)Others中。從圖中可以看出,有機(jī)酸類物質(zhì)占主導(dǎo)地位,檸檬酸類物質(zhì)在發(fā)酵初期積累最多,隨著發(fā)酵時(shí)間的延長(zhǎng)逐漸減少。發(fā)酵0 h的樣品中代謝物豐度與其他組分之間有較大差異,可能原因是發(fā)酵時(shí)間的不同與苯并(α)芘的脅迫所導(dǎo)致的。開(kāi)菲爾粒中微生物在8 h時(shí)磷酸膽堿類物質(zhì)減少,甘油磷酰膽堿類物質(zhì)增加,苯乙胺物質(zhì)在開(kāi)菲爾發(fā)酵8 h與24 h的含量較高。

    圖4 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品中代謝物百分比堆積柱形圖Fig. 4 Stacked histogram of the percentages of metabolites in the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    在所有代謝物中,有的代謝物是在生物體內(nèi)扮演著特定角色的,比如激素、維生素等。我們將所有代謝物用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)br08001進(jìn)行注釋,得到代謝物所扮演的生物學(xué)角色,然后統(tǒng)計(jì)每個(gè)生物學(xué)角色的百分比含量,繪制百分比含量堆積柱形圖,如圖5所示。開(kāi)菲爾粒中微生物在經(jīng)過(guò)一系列代謝反應(yīng)過(guò)程之后,中間代謝產(chǎn)物逐漸轉(zhuǎn)變?yōu)轭惞檀碱愇镔|(zhì),激素和遞質(zhì),維生素,脂類物質(zhì),核酸類物質(zhì),碳水化合物以及有機(jī)酸類物質(zhì)。在發(fā)酵16 h時(shí)激素和遞質(zhì)類物質(zhì)也較之前有明顯遞增。

    圖5 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階樣品扮演生物學(xué)角色的代謝物百分比Fig. 5 Percentage of metabolites playing a biological role in the samples of different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    2.4 特征代謝物(biomarker)的篩選

    通過(guò)KEGG代謝物數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異代謝物進(jìn)行映射,為了更直接地了解關(guān)鍵代謝物,使用箱圖比較來(lái)自5個(gè)不同發(fā)酵時(shí)間段的開(kāi)菲爾粒中微生物代謝產(chǎn)物的含量豐度差異,結(jié)果見(jiàn)圖6,顯示具有極顯著差異排名前25的物質(zhì)。結(jié)果表明,胞核嘧啶、谷胱甘肽、4-胍基丁酸、胍丁胺、2-苯基乙醇、L-色氨酸、丙二酸、鞘氨醇、N-乙?;鵇-半乳糖胺、腺苷、X1-羧基乙烯基膦酸酯、N-乙酰膽堿、腺嘌吟、N6-乙酰L-賴氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、色氨酸、肌氨酸、甲基丙二酸等代謝產(chǎn)物在對(duì)照組與苯并(α)芘脅迫組之間存在明顯差異。

    圖6 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品代謝物差異箱式圖Fig.6 Box plot of the differences in metabolites of the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    同時(shí)為能夠?qū)ふ以谂袆e分析過(guò)程中作用(value importance in projection,VIP,重要性)最大的代謝物,將這些代謝物作為區(qū)分不同分組的biomaker。一般來(lái)說(shuō),VIP大于1的代謝物對(duì)判別分析的貢獻(xiàn)是較大的,這些代謝物在分組間有較大差異。如圖7黃色區(qū)域中,鄰苯二甲酸(C8H6O4)、原兒茶酸 ((HO)2C6H3COOH)與苯乙酸(C8H8O)是校正后P<0.05,VIP大于1的代謝物,這些代謝物在分組間有顯著差異,在PLS-DA中起到重要作用。

    圖7 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品PLS-DA代謝物重要性圖Fig.7 Importance map of PLS-DA metabolites in the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    如圖6、7所示,對(duì)開(kāi)菲爾粒中微生物在代謝過(guò)程中產(chǎn)生的重要代謝物進(jìn)行分析,結(jié)果顯示出原兒茶酸和鄰苯二甲酸雖然在含量圖中并未顯示,但在代謝物重要性中可以看出原兒茶酸與鄰苯二甲酸雖然含量不高,但在代謝過(guò)程中對(duì)代謝通路的判斷有著重要的方向引導(dǎo)。

    結(jié)合圖1、2中PCA以及PLS-DA分析得出,在B組間明顯有差異代謝物的產(chǎn)生,實(shí)驗(yàn)通過(guò)LC-MS分析,深入研究了開(kāi)菲爾粒中微生物在對(duì)苯并(α)芘降解過(guò)程中產(chǎn)生的中間代謝產(chǎn)物,其中通過(guò)圖3、4可明顯看出在開(kāi)菲爾粒中微生物在降解苯并(α)芘第8小時(shí)產(chǎn)生了苯乙酸等物質(zhì)。

    2.5 降解菌代謝苯并(α)芘的途徑推測(cè)

    富集分析是尋找在某個(gè)生物學(xué)過(guò)程中起關(guān)鍵作用的生物通路,從而揭示和理解生物學(xué)過(guò)程的基本分子機(jī)制。通過(guò)與KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),可以獲得代謝物參與的代謝通路信息,不同發(fā)酵階段的開(kāi)菲爾乳中間代謝產(chǎn)物共注釋到56條代謝通路。對(duì)于代謝組數(shù)據(jù),在富集分析之前,需要尋找特征代謝物,通常是那些在分組間有顯著差異(t檢驗(yàn),P<0.05)的代謝物。

    為了了解苯并(α)芘脅迫下開(kāi)菲爾不同發(fā)酵階段關(guān)鍵的代謝途徑,通過(guò)計(jì)算這些代謝通路的過(guò)表達(dá)分析(over-representation analysis,ORA)P值,從而判斷顯著差異的代謝物是否在這些代謝通路中顯著富集。圖8中顯示了差異代謝物顯著富集的代謝通路。這些途徑包括:精氨酸和脯氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、三羧酸循環(huán)、甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝、嘧啶代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸生物合成等。顏色越深的通路表示這些代謝通路在重要代謝物鄰苯二甲酸、原兒茶酸以及苯乙酸在代謝過(guò)程中富集程度越大。

    圖8 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品差異代謝物顯著富集的代謝通路(ORA富集分析)Fig.8 Metabolic pathways with significant enrichment of differential metabolites in the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress(ORA enrichment analysis)

    即便關(guān)注的代謝物在某個(gè)通路中顯著富集,目前仍然不知道這些代謝物在這個(gè)代謝通路中是否起到關(guān)鍵作用,代謝物對(duì)代謝通路究竟有多大影響。拓?fù)浞治瞿軌蛴?jì)算顯著差異的代謝物在代謝通路中的作用大?。ㄓ肐mpact衡量)。圖9中虛線右側(cè)區(qū)域的代謝通路是ORA富集分析中顯著的代謝通路,縱坐標(biāo)展示了這些代謝通路在拓?fù)浞治鲋械淖饔么笮。浣Y(jié)果與ORA富集分析結(jié)果一致。由拓?fù)浞治鰣D顯示,原兒茶酸不僅在代謝過(guò)程中有著重要作用,同時(shí)原兒茶酸所在的這些代謝通路在苯并(α)芘降解的過(guò)程中也起到了關(guān)鍵性作用。

    圖9 苯并(α)芘脅迫下不同發(fā)酵階段樣品差異代謝物顯著富集的代謝通路拓?fù)浞治鯢ig.9 Topological analysis of metabolic pathways with significant enrichment of different metabolites in the samples at different fermentation stages under benzo(α)pyrene stress

    代謝通路圖能夠比較直觀的反映代謝物的上下游關(guān)系,作用模式,以及代謝通路的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),同時(shí)能找到與代謝物關(guān)聯(lián)的基因,是同時(shí)包含代謝物和基因的代謝通路(KEGG完整的代謝通路),有顏色的代謝物是在分組間有顯著差異的代謝物,顏色對(duì)應(yīng)分組,表示在對(duì)應(yīng)分組中代謝物含量較高(相對(duì)其它分組)。

    經(jīng)過(guò)圖8、9的代謝通路顯著性分析,結(jié)合在PCA以及PLS-DA中分析得到的差異代謝物鄰苯二甲酸、原兒茶酸、苯乙酸、鄰苯二甲酸二異丙酯和苯酚等,可推斷開(kāi)菲爾粒中微生物在代謝苯并(α)芘時(shí)經(jīng)過(guò)的代謝通路,如圖10、11所示,苯乙酸在開(kāi)菲爾粒中微生物降解苯并(α)芘時(shí)所經(jīng)過(guò)的一條途徑為苯丙氨酸途徑,鄰苯二甲酸由鄰苯二甲酸二異丙酯通過(guò)鄰苯二甲酸途徑代謝產(chǎn)生。

    圖10 苯丙氨酸途徑Fig. 10 Phenylalanine pathway

    與空白對(duì)照樣比較,開(kāi)菲爾粒中微生物的代謝體系中發(fā)現(xiàn)5種物質(zhì)。分別為保留時(shí)間635.17、444.83、65.98、692.45和463.93 min的鄰苯二甲酸、原兒茶酸、苯乙酸、鄰苯二甲酸二異丙酯和苯酚。其中苯乙酸和苯酚推測(cè)為氫化肉桂酸進(jìn)一步氧化代謝所產(chǎn)生,而在有氧的情況下,鄰苯二甲酸首先被轉(zhuǎn)化為原兒茶酸,接著原兒茶酸在雙加氧酶的作用下被開(kāi)環(huán),從而進(jìn)一步被利用[18];而鄰苯二甲酸推測(cè)由鄰苯二甲酸二異丙酯代謝產(chǎn)生。而鄰苯二甲酸二異丙酯的存在推測(cè)是由1-羥基-2-萘甲酸在脫氫酶、雙加氧酶、脫氫異構(gòu)酶等一系列酶的作用下苯環(huán)裂解產(chǎn)生的[27]。

    圖11 鄰苯二甲酸途徑Fig. 11 Phthalic acid pathway

    3 討論

    由于苯并(α)芘具有較強(qiáng)的致癌性、致突變性和致畸性,所以在研究高分子量多環(huán)芳烴的生物轉(zhuǎn)化中,主要集中在苯并(α)芘的降解領(lǐng)域中,馬靜等[28]研究得出假單胞菌屬(Pseudomonas)細(xì)菌是將多環(huán)芳烴化合物降解成為水楊酸和鄰苯二酚等代謝產(chǎn)物最終進(jìn)入三羧酸循環(huán);分枝桿菌屬(Mycobacterium)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、糞產(chǎn)堿桿菌屬(Alcaligenes)、微球菌屬(Microcoecus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)[29],是將多環(huán)芳烴化合物代謝成為鄰苯二甲酸和原兒茶酸再進(jìn)入三羧酸循環(huán)[30]。還有一些菌株同時(shí)擁有兩條甚至兩條以上的苯并(α)芘代謝路徑,如楊璐溪等[31]的研究表明新鞘氨醇桿菌US6-1以鄰苯二酚代謝路徑和原兒茶酸代謝路徑。

    細(xì)菌降解苯并(α)芘的過(guò)程中,中間代謝產(chǎn)物變化快且累積少,代謝產(chǎn)物的分離難度也大,因此有些學(xué)者研究發(fā)現(xiàn)降解苯并(α)芘時(shí)出現(xiàn)的中間代謝產(chǎn)物,未能進(jìn)一步研究降解途徑,只有少數(shù)研究表明,分離到苯并(α)芘代謝的中間產(chǎn)物并對(duì)其降解途徑進(jìn)行了分析。Kamlesh等[32]在枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis BMT4i’deki MTCC 9447)對(duì)苯并(α)芘的降解產(chǎn)物中檢測(cè)到了苯并(a)芘-11、12-環(huán)氧化物,苯并(a)芘順式7、8-二氫二醇等7種代謝產(chǎn)物,并由此推斷表明枯草芽孢桿菌中苯并(α)芘降解有多種途徑。苯并(α)芘在最初階段由氧化還原反應(yīng)活化,通過(guò)氫原子的還原和飽和碳原子中的碳-碳鍵被氧化而形成1-羥基-2-萘甲酸。而1-羥基-2-萘甲酸被認(rèn)為是多環(huán)芳烴生物降解的關(guān)鍵中間產(chǎn)物[27]。雖然在本研究中并未測(cè)得1-羥基-2-萘甲酸,但在許多推定芳烴雙加氧酶基因的研究可以支持這一推論[33-35]。而1-羥基-2-萘甲酸通??梢酝ㄟ^(guò)“鄰苯二甲酸途徑”或“萘途徑”的兩種不同途徑進(jìn)行降解[34]。通過(guò)已經(jīng)測(cè)得的鄰苯二甲酸經(jīng)由“鄰苯二甲酸途徑”進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為原兒茶酸[36],推測(cè)開(kāi)菲爾粒中微生物對(duì)苯并(α)芘的降解是經(jīng)過(guò)“鄰苯二甲酸途徑”代謝途徑。雖然1-羥基-2-萘甲酸通過(guò)“萘途徑”的代謝途徑可能產(chǎn)生的氫化肉桂酸并未檢出,但苯乙酸和苯酚的存在可以推斷出氫化肉桂酸為1-羥基-2-萘甲酸通過(guò)“萘途徑”代謝的降解產(chǎn)物。苯酚可以通過(guò)羥化酶基因的作用轉(zhuǎn)化成為兒茶酚進(jìn)入三羧酸(TCA)循環(huán)后被降解,羥化酶基因通過(guò)編碼苯酚降解途徑的第一個(gè)酶,負(fù)責(zé)將苯酚轉(zhuǎn)化為兒茶酚;將兒茶酚開(kāi)環(huán)裂解為T(mén)CA產(chǎn)物,是由鄰位和間位酶負(fù)責(zé)的;兒茶酚的進(jìn)一步降解具有不同的途徑和酶系統(tǒng):鄰苯二酚2,3-雙加氧酶(間位裂解)或鄰苯二酚1,2-雙加氧酶(鄰位裂解)[37]。苯酚也可通過(guò)羥基被氧化為羧基形成糖醛酸。通過(guò)以上分析,推測(cè)開(kāi)菲爾粒中微生物在降解苯并(α)芘時(shí)具有“萘途徑”“鄰苯二甲酸途徑”“苯丙氨酸途徑”3條代謝途徑,最后進(jìn)入TCA循環(huán)。研究結(jié)果表明開(kāi)菲爾粒中微生物在降解苯并(α)芘方面具有較大潛力,可以為微生物對(duì)苯并(α)芘的作用機(jī)制提供一定的理論基礎(chǔ),可以為降低苯丙(a)芘對(duì)人體的危害提出可能的生物防治策略,為開(kāi)菲爾發(fā)酵乳制品在食品工業(yè)中的合理開(kāi)發(fā)應(yīng)用提供研究依據(jù)。

    4 結(jié)論

    本研究基于LC-MS 的非靶向代謝組學(xué)技術(shù),對(duì)添加苯并(α)芘發(fā)酵0 h、8 h、16 h、24 h和32 h 的5個(gè)發(fā)酵時(shí)間段樣品的差異代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析。通過(guò)對(duì)差異代謝物和通路進(jìn)行相關(guān)性分析,獲得了鄰苯二甲酸、原兒茶酸、苯乙酸、鄰苯二甲酸二異丙酯和苯酚等特征代謝物。從以上5種物質(zhì)推測(cè)出開(kāi)菲爾粒中微生物在降解苯并(α)芘時(shí)可能經(jīng)過(guò)“萘途徑”“鄰苯二甲酸途徑”“苯丙氨酸途徑”3條代謝途徑,最后進(jìn)入TCA循環(huán)。

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