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    乙型肝炎病毒rtA181T耐藥相關(guān)突變引起的sW172終止與非終止突變的臨床發(fā)生特點及表型差異分析

    2018-06-02 02:06:01趙麗李曉東陳容娟邵金曼周怡思蘭蘭許智慧劉妍徐東平
    解放軍醫(yī)學(xué)雜志 2018年5期
    關(guān)鍵詞:乙型肝炎耐藥性質(zhì)粒

    趙麗,李曉東,陳容娟,邵金曼,周怡,思蘭蘭,許智慧,劉妍,徐東平

    慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是一個嚴(yán)重的全球性公共衛(wèi)生問題,據(jù)統(tǒng)計,全球大約有2.4億慢性HBV感染者,其中我國有9300萬左右,每年死于HBV相關(guān)疾病的人數(shù)多達(dá)75萬[1-2]。目前核苷(酸)類似物(NAs)是治療HBV感染的主要藥物,主要包括核苷類藥物拉米夫定(LAM)、替比夫定(LDT)、恩替卡韋(ETV)和核苷酸類藥物阿德福韋酯(ADV)、替諾福韋酯(TDF)。ADV是繼LAM之后第2個應(yīng)用于臨床抗HBV治療的NAs藥物。與其他NAs類藥物作用原理相同,ADV通過抑制HBV反轉(zhuǎn)錄酶活性進(jìn)而抑制HBV復(fù)制,但對HBV原始復(fù)制模板cccDNA無直接抑制作用,因此需要長期用藥[3]。ADV的耐藥基因屏障較低,有研究顯示ADV初治患者5年耐藥發(fā)生率為29%[4]。

    rtA181T突變的出現(xiàn)與拉米夫定和阿德福韋用藥相關(guān),并可引起對ADV敏感性的輕微下降,但半數(shù)最大效應(yīng)濃度(EC50)值升高<2倍,單獨出現(xiàn)不足以引起ADV臨床耐藥[5-6]。大多數(shù)rtA181T突變可引起相應(yīng)sW172終止突變,產(chǎn)生的截短型HBsAg易于積聚在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)則產(chǎn)生內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力,引起氧化應(yīng)激反應(yīng),增加了肝細(xì)胞癌的發(fā)生風(fēng)險[7-9]。但少數(shù)rtA181T突變也可引起sW172位點非終止突變,包括sW172S和sW172L兩種。目前對非終止突變的臨床發(fā)生特點和意義及其表型變化的研究十分有限[10],缺乏基于大樣本研究的數(shù)據(jù)。針對上述問題,本研究分析大樣本慢性乙型肝炎患者中rtA181T突變引起S區(qū)終止型和非終止型HBsAg的臨床發(fā)生特點,并比較兩者在聯(lián)合原發(fā)ADV耐藥突變rtN236T時對HBsAg表達(dá)、病毒復(fù)制力和ADV耐藥性影響的差別,以幫助明確rtA181T/sW172非終止突變發(fā)生的臨床意義。

    1 資料與方法

    1.1 研究對象 收集2011年7月-2016年7月于解放軍302醫(yī)院就診的12 708例乙型肝炎患者血清樣本的測序檢測結(jié)果。排除HIV、HDV等混合感染者;排除原發(fā)性肝癌患者;排除酒精性肝病及自身免疫性肝病患者;排除原發(fā)性肝癌患者?;颊哐鍢颖颈4嬗讪C20℃,所有常規(guī)臨床指標(biāo)均由該院臨床檢驗中心完成。本研究經(jīng)解放軍302醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),患者均知情同意。

    1.2 主要試劑 血清中病毒DNA提取采用四川天澤公司DNAout試劑提取盒。PCR試劑盒購自北京全式金公司;pGEM-Teasy載體購自美國Promega公司;Xho Ⅰ/Sph Ⅰ內(nèi)切酶及T4DNA連接酶購自日本TaKaRa公司;pTriEx-HBV 1.1倍載體由法國里昂大學(xué)Zoulim教授惠贈;FuGENE HD轉(zhuǎn)染試劑盒購自美國Roche公司;DMEM培養(yǎng)基購自Gibco公司。

    1.3 方法

    1.3.1 臨床和實驗室檢查 收集每例患者接受NAs治療前后的臨床和實驗室數(shù)據(jù),包括人口統(tǒng)計資料、NAs治療史、血清HBV DNA水平和生化指標(biāo),包括丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)、天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(AST)、膽堿酯酶(CHE)等。

    1.3.2 HBV RT區(qū)基因突變分析及基因型分析 采用病毒DNA提取試劑提取患者血清中的HBV DNA,應(yīng)用本課題組建立的超靈敏巢式PCR方法擴(kuò)增HBV RT基因(國家發(fā)明專利ZL200910092331.1)[11]。送PCR產(chǎn)物進(jìn)行雙向測序,對rt80、rt173、rt180、rt181、rt184、rt202、rt204、rt214、rt236和rt250等經(jīng)典和潛在的LAM、ADV、ETV耐藥相關(guān)位點的序列峰圖進(jìn)行分析。按照文獻(xiàn)[12]中的方法進(jìn)行HBV基因分型。

    1.3.3 基因克隆 將PCR產(chǎn)物克隆到pGEM-Teasy載體,然后隨機(jī)挑選≥20個克隆進(jìn)行DNA測序并分析耐藥相關(guān)突變。

    1.4 1.1倍pTriEx-HBV重組質(zhì)粒構(gòu)建及鑒定 提取rtA181T/sW172S+N236T、rtA181T/sW172L+N236T、rtA181T/sW172stop+N236T和野生型質(zhì)粒,經(jīng)Xho Ⅰ和Sph Ⅰ雙酶切后將RT區(qū)片段連接至pTriEx–HBV(C)1.1倍載體上,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞,接種LB培養(yǎng)板(含有100μg/ml氨芐西林),37℃培養(yǎng)箱過夜,隨機(jī)挑取樣品進(jìn)行克隆測序,鑒定HBV表達(dá)載體構(gòu)建成功后,制備轉(zhuǎn)染級相關(guān)突變株克隆質(zhì)粒備用。

    1.5 定點突變 根據(jù)實驗需要,將rtA181T/sW172stop+N236T進(jìn)行定點突變回復(fù)為N236T突變株。根據(jù)原始序列設(shè)計1對正反向引物,引物長度為25~50個堿基。以原突變質(zhì)粒為模板,PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)甲基化酶Dpn Ⅰ處理,選擇性保留突變成功的質(zhì)粒。將消化后產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞,37℃過夜,挑選2~3個樣品測序驗證,獲得突變成功質(zhì)粒。具體方法按試劑盒說明書進(jìn)行。

    1.6 構(gòu)建1.1倍重組載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞檢測復(fù)制力及HBsAg水平 轉(zhuǎn)染前1d將HepG2細(xì)胞按1×105個/孔置于24孔板中,待細(xì)胞生長至60%~80%融合時,每孔加入0.25μg質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到HepG2細(xì)胞。轉(zhuǎn)染4h后,分別加入濃度梯度的ADV(0、3.125、6.25、12.5、25、50μmol/L),每2d更換相應(yīng)藥物濃度的新培養(yǎng)液,連續(xù)4d后收集細(xì)胞上清,采用實時熒光定量PCR檢測HBV DNA水平。重復(fù)實驗3次。病毒的復(fù)制力以無藥物壓力下自然產(chǎn)生的HBV DNA水平評價,病毒的藥物敏感性以EC50評價,EC50值越高表明藥物敏感性愈低。

    1.7 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS 18.0軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。定量數(shù)據(jù)以±s或M(Q1,Q3)表示,采用方差分析及兩樣本獨立t檢驗進(jìn)行比較。定性資料率及組成比較采用Wilcoxon秩和檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

    2 結(jié) 果

    2.1 HBV rtA181T突變患者的臨床特點 在12 708例慢性乙型肝炎患者中,有504例(3.96%)患者檢出rtA181T突變,其中男性443例,女性61例,年齡43.0±10.54歲,ALT 47(27~100)U/L,AST 43(27~90)U/L,TBIL 15.20(10.80~25.20)μmol/L,HBV DNA載量4.92±1.86log10IU/ml。根據(jù)rtA181T陽性突變患者的性別匹配相應(yīng)的rtA181T陰性突變患者并對二者進(jìn)行比較,結(jié)果顯示rtA181T陽性突變患者年齡、ALT、CHE、HBV DNA水平顯著高于rtA181T陰性突變患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。rtA181T陽性突變患者基因型分布(C型96.03%,B型3.97%)與rtA181T陰性突變患者(C型81.50%,B型18.50%)比較存在顯著差異(P=0.013)。相對于rtA181T陰性突變患者,rtA181T陽性突變患者接受ADV治療的比例更高(表1)。

    2.2 rtA181T突變與其他NAs耐藥突變共存情況直接測序結(jié)果顯示,有504例患者檢出rtA181T突變,其中有270例rtA181T突變單獨出現(xiàn),44例伴隨恩替卡韋耐藥突變,31例伴隨拉米夫定耐藥突變,13例伴隨多重耐藥突變(即同時出現(xiàn)核苷類與核苷酸類藥物的耐藥突變)。此外有146例伴隨ADV耐藥突變,包括17例rtA181T+A181V、81例rtA181T+N236T,40例rtA181T+A181V+N236T、5例V173L+L180M+A181T+A181V+N236T、2例L180M+A181T+A181V+N236T和1例L180M+A181T+A181V+N236T(表2)。

    表1 rtA181T陽性突變與rtA181T陰性突變患者的臨床資料分析Tab.1 Clinical features of the patients with and without rtA181T mutation

    2.3 rtA181T突變的測序峰圖結(jié)果 分析504例rtA181T突變病毒測序峰圖出現(xiàn),其對應(yīng)sW172突變有1種終止突變和2種非終止突變(L、S),包括409例(81.1%)sW172stop,29例(5.8%)sW172L,15例(3.0%)sW172L和51例(10.1%)sW172終止與非終止突變株共存;突變株可與野生株(wt)共存(圖1)。

    2.4 ADV耐藥患者中rtA181T/sW172stop終止突變與rtA181T/sW172非終止突變的臨床特點 表3比較了ADV耐藥患者中單獨出現(xiàn)的rtA181T/sW172stop突變聯(lián)合rtN236T突變與rtA181T/sW172L或sW172S聯(lián)合rtN236T突變患者的臨床資料和實驗室檢測指標(biāo),結(jié)果顯示,兩組患者在年齡、性別、ALT、AST、CHE等方面差異無統(tǒng)計學(xué)意義,但前一組患者血清HBV DNA水平明顯低于后一組(3.63log10IU/ml vs. 5.07log10IU/ml,P=0.013)。

    2.5 體外實驗突變株HBsAg、HBV DNA水平測定及表型耐藥分析 羅氏定量結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染rtA181T/sW172stop+N236T突變株重組質(zhì)粒后,HepG2細(xì)胞上清中的HBsAg低于檢測下限,而rtA181T/sW172L+N236T、rtA181T/sW172S+N236T突變株重組質(zhì)粒后HBsAg表達(dá)水平僅較野生株輕微降低(圖2A)。病毒復(fù)制力檢測顯示,rtA181T/sW172stop+N236T突變株復(fù)制力水平相對于野生株低于rtA181T/sW172L+N236T、rtA181T/sW172S+N236T突變株(P<0.05,圖2B)。表型耐藥分析結(jié)果顯示,rtA181T/sW172stop+N236T、rtA181T/sW172L+N236T、rtA181T/sW172S+N236T病毒株與對應(yīng)野生株相比,其對ADV的耐藥倍數(shù)分別為3.69倍、5.49倍、7.38倍。rtA181T/sW172stop+N236T病毒株對ADV的敏感性高于rtA181T/sW172L+N236T、rtA181T/sW172S+N236T病毒株(表4)。

    表2 rtA181T突變與其他NAs耐藥突變共存情況Tab.2 The mutants concomitancy of rtA181T mutant and other nucleoside (acid) analogues resistant mutants

    圖1 rtA181T突變引起S區(qū)172編碼序列改變的類型Fig.1 Changes of S gene 172 amino acid coding sequence caused by rtA181T mutation

    表3 ADV耐藥患者中rtA181T/sW172非終止突變與終止突變的臨床資料比較Tab.3 Clinical features of ADV resistant patients with rtA181T/sW172stop and non-stop mutations

    圖2 培養(yǎng)上清中HBsAg定量結(jié)果(A)和突變株復(fù)制力評價(B)Fig.2 Quantitation of HBsAg in supernatant (A) and assessment of viral replication capacity of mutant strain (B)Dashed line represents lower limit of detection for HBsAg (0.05IU/ml). (1)P<0.05 compared with wild type

    表4 ADV對野生型及4種突變型病毒株的EC50比較Tab.4 Phenotypic resistance of wild type and 4 ADV-resistant mutants

    3 討 論

    以往ADV曾經(jīng)作為臨床一線藥物被廣泛使用,雖然我國2015年的《慢性乙型肝炎防治指南》已將ETV和TDF列為一線臨床抗病毒藥物[13],但受經(jīng)濟(jì)條件和用藥習(xí)慣等因素的影響,臨床上ADV的應(yīng)用仍占有相當(dāng)比例。常見的ADV原發(fā)耐藥突變有rtN236T和rtA181V[14],此外還有本課題組前期發(fā)現(xiàn)的rtN236V和rtA181S[15-16]。一般認(rèn)為,當(dāng)突變株對ADV的EC50達(dá)到野生病毒株的2倍以上時可引起耐藥[17]。以往有研究顯示,rtA181T、rtAN236T、和rtA181V突變株對ADV的EC50值分別為野生株的1.2±0.5倍、7.0±4.1倍和4.3±1.2倍[5]。rt181T雖然不是原發(fā)ADV耐藥突變,但與ADV用藥相關(guān),被認(rèn)為是一種非典型的ADV耐藥相關(guān)突變。大多數(shù)rtA181T突變可導(dǎo)致sW172終止突變,影響HBsAg的表達(dá)和分泌[7],但以往缺少對rtA181T/sW172非終止突變的認(rèn)識,最近有研究揭示了rtA181T/sW172終止突變與rtA181T/sW172L突變對病毒復(fù)制、HBsAg表達(dá)和分泌具有不同影響[18],但至今尚未見rtA181T/sW172非終止突變發(fā)生特點的臨床大樣本分析及其聯(lián)合原發(fā)ADV耐藥突變時耐藥性變化的報道。

    本研究應(yīng)用直接測序法分析了12 708例慢性HBV感染者的耐藥突變信息,檢出的rtA181T突變患者占3.96%。74.6%的rtA181T突變患者有ADV治療史,表明rtA181T突變與ADV用藥相關(guān)。146例rtA181T突變與ADV耐藥突變共同出現(xiàn),其中有81例rtA181T與N236T共同出現(xiàn)。本研究結(jié)果顯示,rtA181T/sW172stop+N236T突變株的復(fù)制力顯著低于rtA181T/sW172L+N236T和rtA181T/sW172S+N236T突變株;rtA181T/sW172stop+N236T突變株對ADV的耐藥性與野生株相比提高了3.69倍,而rtA181T/sW172L+N236T和rtA181T/sW172S+N236T對ADV的耐藥性則分別提高了5.49倍和7.83倍。病毒的耐藥性及自然復(fù)制力是決定病毒株在藥物壓力下復(fù)制競爭力強(qiáng)弱的兩個要素,rtA181T/sW172非終止突變株的ADV耐藥性提高應(yīng)與其自然復(fù)制力較高密切相關(guān),但由于rtA181T/sW172非終止突變株需要同時出現(xiàn)兩種核苷酸突變,限制了其發(fā)生。此外,病毒對機(jī)體免疫反應(yīng)性的適應(yīng)性也可影響病毒的復(fù)制競爭力。rtA181T/sW172終止突變可導(dǎo)致產(chǎn)生截短型HBsAg,引起一個CTL重要表位env335-343(即s172-180)的缺失[19]。HBV從rtA181T/sW172終止突變轉(zhuǎn)變?yōu)閞tA181T/sW172非終止突變時,雖然病毒的復(fù)制力可增加,但可能引起該表位特異性CTL的攻擊。總之,rtA181T/sW172非終止突變的發(fā)生取決于病毒、藥物與機(jī)體免疫三方面的綜合影響,其具體機(jī)制還需要更深入的研究。

    本研究證實,在體外實驗中rtA181T/sW172終止突變可導(dǎo)致HBsAg分泌表達(dá)缺陷,而rtA181T/sW172非終止突變對HBsAg分泌表達(dá)的影響較小,但攜帶兩種突變病毒的患者HBsAg水平并無明顯差異,分析原因是大多數(shù)患者體內(nèi)rtA181T突變株與野生株共存,即使未檢出與野生株共存,由于PCR直接測序法只能檢測到20%以上的病毒序列,仍可能與少量野生株共存,提供病毒所需的HBsAg。本研究結(jié)果還表明,rtA181T/sW172終止突變聯(lián)合rtN236T突變株的病毒復(fù)制力明顯低于兩種rtA181T/sW172非終止突變聯(lián)合rtN236T突變株,這與我們觀察到的臨床現(xiàn)象相符,即感染rtA181T/sW172stop+N236T突變病毒的患者HBV DNA水平顯著高于感染rtA181T/sW172L或sW172S+N236T突變病毒的患者(表2),提示與rtA181T/stop+N236T突變株相比,rtA181T/sW172L+N236T和rtA181T/sW172S+N236T突變株引起的病毒學(xué)反跳水平較高,更應(yīng)引起臨床重視。

    總之,本研究通過對大樣本的臨床患者進(jìn)行測序,明確了我國慢性HBV感染患者rtA181T/sW172非終止突變的臨床發(fā)生特點,明確了在聯(lián)合rtN236T突變時,rtA181T/sW172非終止突變可較非終止突變賦予病毒更高的ADV耐藥性,這些發(fā)現(xiàn)加深了對HBV耐藥突變的認(rèn)識,可為臨床合理監(jiān)控耐藥提供幫助。

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