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    ETS2基因表達(dá)與肝細(xì)胞肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)的相關(guān)性及機(jī)制研究

    2016-03-30 10:53:26吳其肯劉玉君陳紅旭王海江王利平梅勇舟山市婦幼保健院外科浙江舟山36004中國人民解放軍第四一三醫(yī)院外科浙江舟山36004
    肝膽胰外科雜志 2016年1期

    吳其肯,劉玉君,陳紅旭,王海江,王利平,梅勇(.舟山市婦幼保健院外科,浙江舟山36004,.中國人民解放軍第四一三醫(yī)院外科,浙江舟山36004)

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    ETS2基因表達(dá)與肝細(xì)胞肝癌術(shù)后復(fù)發(fā)的相關(guān)性及機(jī)制研究

    吳其肯1,劉玉君1,陳紅旭2,王海江1,王利平2,梅勇2
    (1.舟山市婦幼保健院外科,浙江舟山316004,2.中國人民解放軍第四一三醫(yī)院外科,浙江舟山316004)

    [摘 要]目的 探究E26轉(zhuǎn)錄因子2(E26 oncogene homolog 2,ETS2)與肝細(xì)胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)術(shù)后復(fù)發(fā)的相關(guān)性以及其分子機(jī)制。方法 利用熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)與Western blotting檢測ETS2基因在HCC術(shù)后兩年內(nèi)復(fù)發(fā)的8例患者以及10例未復(fù)發(fā)患者癌組織樣本內(nèi)的表達(dá)差異。同時,利用斯皮爾曼等級相關(guān)計算ETS2表達(dá)與樣本臨床及病理資料間的相關(guān)性。然后利用三種交叉驗證實驗(留一交叉驗證、十折交叉驗證以及蒙特卡羅交叉驗證)分析ETS2的表達(dá)對HCC樣本(本研究18例樣本以及ArrayExpress數(shù)據(jù)庫76例樣本)的術(shù)后復(fù)發(fā)預(yù)后的分型準(zhǔn)確性。此外,進(jìn)一步預(yù)測ETS2下游調(diào)控基因,并分析下游調(diào)控基因顯著參與的生物學(xué)功能以及信號通路,探究ETS2可能的分子機(jī)制。結(jié)果 ETS2基因在術(shù)后復(fù)發(fā)的HCC樣本中顯著高表達(dá),且其表達(dá)與血管侵襲(r=0.451,P=0.021)、有無包膜(r=0.324,P= 0.047)、病理分級(r=0.422,P=0.024)以及臨床分期(r=0.404,P=0.026)間存在顯著的相關(guān)性。通過交叉驗證實驗發(fā)現(xiàn)ETS2對HCC樣本有較好的分型準(zhǔn)確性[本研究樣本:81%(79%~82%)、78%(76%~79%)、75%(74%~76%);數(shù)據(jù)庫樣本:62%(59%~63%)、63%(61%~63%)、62%(60%~63%)]。通過對ETS2下游調(diào)控基因的功能富集分析發(fā)現(xiàn),ETS2基因顯著參與到細(xì)胞增殖、凋亡、分化以及血管增生等HCC術(shù)后發(fā)展相關(guān)的功能與通路中。結(jié)論 ETS2基因表達(dá)與血管侵襲、有無包膜、病理分級以及臨床分期顯著相關(guān),兩套數(shù)據(jù)的分型準(zhǔn)確性結(jié)果說明其可做為HCC術(shù)后復(fù)發(fā)的潛在分子標(biāo)記物,且其是HCC術(shù)后復(fù)發(fā)相關(guān)分子機(jī)制中重要的參與者。

    [關(guān)鍵詞]E26轉(zhuǎn)錄因子2(ETS2);癌,肝細(xì)胞;術(shù)后復(fù)發(fā);分子標(biāo)記物

    Correlation and mechanism between ETS2 expression and postoperative recurrence of hepatocellular carcinoma WU Qi-ken1, LIU Yu-jun1, CHEN Hong-xu2, WANG Hai-jiang1, WANH Li-ping2, MEI Yong2.1Department of Surgery, Zhoushan Maternal and Child Care Service Centre, Zhoushan, Zhejiang 316004, China;2Department of Surgery, the 413rdHospital of PLP, Zhoushan, Zhejiang 316004, China

    Abstract ObjectiveTo explore the correlation and mechanism between E26 oncogene homolog 2 (ETS2) expression and postoperative recurrence of hepatocellular carcinoma (HCC).MethodsETS2 expression difference between 8 postoperative recurrence of HCC patients and 10 no recurrence of HCC patients was detected by qRT-PCR and Western blotting.Meanwhile, correlation between ETS2 expression and the clinical pathological indicators were calculated by Spearman rank correlation.Then, the classi■ed power of ETS2 for two datasets (18 samples from this study and 76 samples from ArrayExpress database) were analyzed by three cross-validation algorithms (leave-one-out cross validation (LOOCV), 10-fold cross validation (10-fold CV), montecarlo cross validation (MCCV)].Moreover, the downstream genes regulated by ETS2 were predicted, and then biological functional enrichment analysis was used to detect the functions and processes related to these regulated genes.ResultsETS2 gene was high expressed in postoperative recurrence of HCC patients, and significantly correlated with angiogenesis (r=0.451, P=0.021), tumor capsule (r=0.324, P=0.047), pathological grade (r=0.422, P=0.024) and clinical stage (r=0.404, P=0.026), and ETS2 had a high prediction accuracy for classi■ed HCC[samples from this study:81% (79%~82%), 78% (76%~79%), 75% (74%~76%); samples from ArrayExpressdatabase:62% (59%~63%), 63% (61%~63%), 62% (60%~63%)].Functional enrichment analysis showed that genes regulated by ETS2 were signi■cantly involving in functions of cell proliferation, apoptosis, differentiation, angiogenesis and HCC progression related functions and pathways.ConclusionETS2 expression is signi■cantly correlated with angiogenesis, tumor capsule, pathological grade and clinical stage, which shows a great classi■ed power for recurrence of HCC in two independent datasets, and may be biomarkers of postoperative recurrence of HCC.Moreover, ETS2 plays an important role in HCC progression.

    Key words E26 oncogene homolog 2 (ETS2); hepatocellular carcinoma (HCC); postoperative recurrence;biomarker

    肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是臨床上常見的惡性程度極高的一類肝臟腫瘤。目前外科手術(shù)切除可以有效延長患者的生存期,然而大約66%的患者會在幾年之內(nèi)術(shù)后復(fù)發(fā)[1-3]。因此,在HCC尚未出現(xiàn)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移之前,及早預(yù)測、診斷,并及時采取有效措施進(jìn)行防治就成為能否進(jìn)一步提高HCC治療效果的關(guān)鍵。目前,研究已經(jīng)積累了很多HCC預(yù)后相關(guān)的臨床病理特征,例如:淋巴血管入侵、囊腫入侵、微衛(wèi)星損傷以及腫瘤是否單發(fā)等。這些臨床病理特征已經(jīng)開始用于HCC的預(yù)后診斷與預(yù)測,但其預(yù)測能力有限[4-5]。近年來,隨著高通量技術(shù)如基因表達(dá)譜技術(shù)的快速發(fā)展和廣泛應(yīng)用,為研究HCC的分子機(jī)理與分子診斷提供了新的方法與思路[6-8]。

    E26轉(zhuǎn)錄因子2(E26 oncogene homolog 2,ETS2)是ETS轉(zhuǎn)錄因子家族成員之一,屬于細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的核效應(yīng)物,調(diào)控下游基因表達(dá)。目前已有大量研究發(fā)現(xiàn)ETS2蛋白與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展高度相關(guān),是一個經(jīng)典的癌基因[9-10]。為了研究ETS2與HCC腫瘤預(yù)后的關(guān)系,我們分別檢測ETS2基因在HCC術(shù)后兩年內(nèi)復(fù)發(fā)的8例患者以及10例未復(fù)發(fā)患者癌組織樣本內(nèi)的表達(dá),并進(jìn)一步分析ETS2可調(diào)控的下游基因所涉及的生物學(xué)功能。

    1 材料和方法

    1.1HCC組織樣本

    樣本取自我院2010年內(nèi)手術(shù)切除的HCC組織樣本,篩選術(shù)后兩年內(nèi)復(fù)發(fā)的HCC患者組織樣本8例,其中男6例,女2例,年齡58~71歲。篩選術(shù)后未復(fù)發(fā)的HCC患者組織樣本10例,其中男6例,女4例,年齡52~73歲。所有樣本速凍于液氮,-80 ℃冰箱保存。

    1.2qRT-PCR分析

    利用TRIZol試劑盒(Invitrogen,USA)提取細(xì)胞總RNA,具體步驟參考試劑盒說明。采用SYBR Green法檢測ETS2基因的表達(dá)。ETS2基因PCR引物(產(chǎn)物<200 bp,由上海生工)。采用10 μL ABI體系,包括單鏈cDNA 1 μL,SYBR Green Real-time PCR Master Mix 5 μL,上游引物和下游引物各0.45 μL(1 μmol/ L),再加去離子水3.1 μL。采用ABI Stepone qRTPCR儀檢測。PCR循環(huán)參數(shù)為:95 ℃(60 s),95 ℃(15 s),60 ℃(15 s),72 ℃(35 s)共40個循環(huán)。以β-actin基因作為內(nèi)參照進(jìn)行PCR,用計算機(jī)軟件(StepOneTMSoftware v3.0)分析各反應(yīng)的熒光強(qiáng)度得出反應(yīng)的循環(huán)閾值(Cycle threshold,Ct)。使用比較Ct值法計算目的基因的相對表達(dá)量。

    1.3Western blotting檢測

    提取跨膜蛋白,具體步驟參照試劑盒說明書(碧云天公司)。BCA法蛋白定量。SDS-PAGE電泳后將蛋白轉(zhuǎn)至PVDF膜。膜在5% BSA溶液中室溫孵育1 h以封閉膜上的非特異結(jié)合。TBS/T洗膜3次,每次5 min。封閉過的膜加入一級抗體(CST,貨號5513,1:1 000稀釋)4 ℃過夜,抗原抗體結(jié)合。TBS/T洗膜3次,每次5 min。加入HRP標(biāo)記的二級抗體(CST,貨號7074,1:3 000稀釋)以結(jié)合一級抗體及HRP標(biāo)記的抗生物素抗體以結(jié)合分子量標(biāo)準(zhǔn),室溫孵育膜1 h。TBS/T洗膜3次,每次5 min。加入化學(xué)發(fā)光底物發(fā)光,用凝膠成像系統(tǒng)(Chemilumines-cenceimaging system,USA)掃描圖像,Image J分析軟件將圖片上每個特異條帶灰度數(shù)值化,統(tǒng)計ETS2蛋白與β-actin的OD比值。

    1.4樣本分型準(zhǔn)確性分析

    為了進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量證明ETS2基因表達(dá)的分型準(zhǔn)確性,本研究收集了一套包括76個HCC腫瘤樣本的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)來自歐洲分子生物學(xué)實驗數(shù)據(jù)庫ArrayExpress(編號E-MEXP-84與E-TABM-292),包括35例術(shù)后兩年內(nèi)復(fù)發(fā)的HCC患者樣本,41例未復(fù)發(fā)的HCC患者樣本[11],其表達(dá)譜實驗平臺:Affymetrix GeneChip Human Genome HG-U133A與Affymetrix GeneChip Human Genome HG-U133B。表達(dá)譜原始數(shù)據(jù)預(yù)處理均采用基因表達(dá)控制臺軟件。采用RMA算法進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理。然后,使用R語言CMA包[12]分別進(jìn)行留一交叉驗證、十折交叉驗證以及蒙特卡羅交叉驗證,計算ETS2表達(dá)對樣本分型準(zhǔn)確性,驗證實驗重復(fù)1 000次,得到平均的分型準(zhǔn)確率。

    1.5統(tǒng)計學(xué)分析

    使用斯皮爾曼等級相關(guān)計算ETS2基因表達(dá)值與各臨床指標(biāo)間的相關(guān)性。用TRANSFAC數(shù)據(jù)庫[13]預(yù)測ETS2下游靶基因,共得到65個ETS2調(diào)控的靶基因。然后用DAVID數(shù)據(jù)庫[14]分析靶基因所富集到的GO功能與生物學(xué)通路,設(shè)定閾值為FDR<0.05。采用R軟件對結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,組間采用One-Way ANOVA分析。以P<0.05為統(tǒng)計學(xué)檢驗標(biāo)準(zhǔn)。

    圖1 ETS2基因在不同組HCC樣本中的表達(dá)差異

    表1 ETS2表達(dá)與臨床病理資料相關(guān)性

    表2 ETS2基因的分類效能

    2 結(jié)果

    2.1ETS2在HCC組織中的表達(dá)

    通過qRT-PCR實驗檢測ETS2基因在術(shù)后復(fù)發(fā)與未復(fù)發(fā)兩組樣本中的表達(dá),結(jié)果如圖1A所示,ETS2基因在HCC術(shù)后復(fù)發(fā)樣本中顯著高表達(dá)(P=0.014)。同時Western blotting實驗也發(fā)現(xiàn)ETS2蛋白表達(dá)在術(shù)后復(fù)發(fā)的樣本中有明顯增高(見圖1B)。這些結(jié)果說明,ETS2的表達(dá)與HCC術(shù)后復(fù)發(fā)明顯相關(guān)。

    2.2ETS2基因表達(dá)與樣本臨床資料相關(guān)性

    本研究利用斯皮爾曼等級相關(guān)計算了ETS2表達(dá)值與樣本臨床資料間的相關(guān)性,結(jié)果如表1所示,ETS2表達(dá)與血管侵襲(r=0.451,P=0.021)、有無包膜(r=0.324,P=0.047)、病理分級(r=0.422,P= 0.024)以及臨床分期(r=0.404,P=0.026)存在顯著的相關(guān)性,而與年齡、性別、術(shù)前AFP值、腫瘤最大徑以及是否單發(fā)之間不存在顯著的相關(guān)關(guān)系。

    2.3ETS2基因的分型準(zhǔn)確性

    本研究分別使用留一交叉驗證、十折交叉驗證以及蒙特卡羅交叉驗證對我院的18個樣本以及ArrayExpress數(shù)據(jù)庫內(nèi)76個HCC樣本(35例復(fù)發(fā),41例未復(fù)發(fā))的表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分型準(zhǔn)確性分析,結(jié)果如表2所示。對于我院的18個樣本,三種驗證方法的分型準(zhǔn)確率分別為81%(79%~82%)、78%(76%~79%)與75%(74%~76%)。對于數(shù)據(jù)庫中76個樣本,三種驗證方法的分型準(zhǔn)確率分別為62%(59%~63%)、63%(61%~63%)與62%(60%~63%)。該結(jié)果說明,無論是在我院的樣本還是其他研究的樣本中,甚至在不同檢測方法情況下(基因芯片檢測技術(shù)),針對ETS2的表達(dá)的檢測,都可以較好地對HCC術(shù)后復(fù)發(fā)進(jìn)行預(yù)測。因此ETS2可作為HCC術(shù)后復(fù)發(fā)的潛在分子標(biāo)記物。

    2.4ETS2下游調(diào)控基因以及相關(guān)功能的分析

    本研究用利用TRANSFAC數(shù)據(jù)庫預(yù)測ETS2下游的調(diào)控基因,得到65個ETS2靶向調(diào)控基因。其中包括大量的與腫瘤相關(guān)的經(jīng)典基因,如TP53、FOS以及MYC等[15]。為了進(jìn)一步分析這些靶向調(diào)控基因所涉及的生物學(xué)功能與通路,我們利用DAVID數(shù)據(jù)庫對這65個基因進(jìn)行功能富集分析,結(jié)果如表3所示。這些基因大量富集到“細(xì)胞增殖”、”“細(xì)胞凋亡”、“細(xì)胞死亡”以及“血管生成”等相關(guān)的生物學(xué)功能,而這些功能都與HCC的發(fā)展轉(zhuǎn)移高度相關(guān)[16-17]。同時,我們發(fā)現(xiàn)這些基因也富集到了“Jak-STAT信號通路”以及其他腫瘤相關(guān)通路。而“Jak-STAT信號通路”已經(jīng)被大量文獻(xiàn)報道與腫瘤的復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移高度相關(guān)[18]。

    表3 ETS2調(diào)控基因的功能富集分析結(jié)果(FDR<0.05)

    HCC術(shù)后復(fù)發(fā)是制約HCC外科手術(shù)治療效果的重要因素[19-20]。尋找HCC術(shù)后復(fù)發(fā)相關(guān)的標(biāo)記物以及挖掘其相關(guān)分子機(jī)制,對HCC治療診斷非常重要。隨著

    3 討論

    高通量、整合性“組學(xué)”技術(shù)的應(yīng)用,眾多新型肝癌預(yù)后標(biāo)記物被發(fā)現(xiàn),例如血清樣本的中的預(yù)后標(biāo)記物AFP,組織樣本中的P53,細(xì)胞角蛋白10或19等[21-22]。但這些潛在的肝癌預(yù)后判斷標(biāo)記物多來源于科研機(jī)構(gòu)的獨立研究報道,缺乏多中心和規(guī)?;炞C資料,還有很多臨床前工作需要開展。

    ETS2是腫瘤發(fā)展過程中非常關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄因子,參與多種組織的生長發(fā)育過程,包括細(xì)胞增殖、分化、遷移、凋亡和細(xì)胞間相互作用。Wolvetang等[23]研究發(fā)現(xiàn)ETS2可通過調(diào)控P53基因的表達(dá)激活P53相關(guān)的腫瘤信號通路,同時Sevilla等[24]發(fā)現(xiàn)其與PU.1因子協(xié)同顯著增加bcl-x基因的活化,這對巨噬細(xì)胞的生存和吞噬功能起著重要作用。在本研究中,ETS2基因在術(shù)后復(fù)發(fā)的HCC組織樣本中表達(dá)明顯增高,同時還發(fā)現(xiàn)其與血管侵襲、有無包膜、病理分級以及臨床分期顯著相關(guān),這些結(jié)果說明ETS2基因表達(dá)與HCC的預(yù)后顯著相關(guān),其表達(dá)越高,腫瘤的臨床以及病理分級越高,且血管侵襲程度加深,包膜更趨向于不完整。

    此外,本研究通過對兩套獨立HCC樣本的交叉驗證實驗發(fā)現(xiàn)ETS2的表達(dá)對HCC術(shù)后復(fù)發(fā)的預(yù)準(zhǔn)確性與穩(wěn)定性較好。其中值得注意是本院的18例樣本使用的是PCR技術(shù),而數(shù)據(jù)庫中的76例樣本使用的是基因芯片技術(shù),而交叉驗證的結(jié)果發(fā)現(xiàn),在不同的檢測技術(shù)下,ETS2表達(dá)對兩套不同的樣本都具有較好的分型能力,這有力證明了該基因具有成為HCC預(yù)后的分子標(biāo)記物的潛力。本研究通過進(jìn)一步分析ETS2下游調(diào)控基因及其參與的生物學(xué)功能與通路,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ETS2下游調(diào)控基因顯著富集到血管生成、細(xì)胞增殖分化與凋亡等生物學(xué)功能,更是從側(cè)面證明了ETS2基因的表達(dá)與血管侵襲、包膜以及臨床病理分級高度相關(guān),也反映出ETS2在HCC的術(shù)后復(fù)發(fā)過程中具有重要作用。

    當(dāng)然,本研究只是基于本院收集的少量樣本,ETS2真正臨床診斷價值的確認(rèn),還需要更高樣本量并多中心規(guī)?;尿炞C,這也是我們下一步工作的主要方向。此外,我們將進(jìn)一步篩選其他HCC相關(guān)的基因或分子,并與ETS2基因聯(lián)合形成HCC預(yù)后診斷的分子標(biāo)記物組合,致力于增加HCC預(yù)后預(yù)測的普適性以及準(zhǔn)確率。

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    (本文編輯:魯翠濤)

    ·論著 基礎(chǔ)研究·

    [通訊作者簡介]劉玉君,教授,主任醫(yī)師,E-mail:yujunliu66@163.com。

    作者簡介][第一吳其肯(1980-),男,浙江舟山人,主治醫(yī)師。

    [收稿日期]2015-06-11

    [中圖分類號]R735.7

    [文獻(xiàn)標(biāo)識碼]A

    DOI:10.11952/j.issn.1007-1954.2016.01.009

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