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    Cu(I)催化合成六氫氮類雜卓衍生物反應(yīng)機理的研究

    2014-07-13 03:39:12李來才
    原子與分子物理學(xué)報 2014年4期
    關(guān)鍵詞:過渡態(tài)鍵長中間體

    張 林,張 明,李來才

    (四川師范大學(xué)化學(xué)與材料科學(xué)學(xué)院,成都610066)

    1 引 言

    近年來,隨著有機化學(xué)的高速發(fā)展以及人們對新型有機化合物的深入了解,發(fā)現(xiàn)芳雜環(huán)類化合物大量存在于天然有機分子中,并廣泛應(yīng)用于合成藥物、日用化工用品、農(nóng)藥、高分子有機材料等領(lǐng)域.因此,對于這類化合物的研究一直是化學(xué)界的重要課題之一[1,2].過渡金屬催化C—C、C—O、C—N 等偶聯(lián)反應(yīng)具有高度選擇性,反應(yīng)條件溫和及催化劑用量少等優(yōu)點,已經(jīng)成為當(dāng)今合成芳雜環(huán)類化合物的重要途徑.六氫氮雜卓衍生物多存在于核苷類抗生素和NK1/NK2拮抗劑等一些天然化合物和生物活性分子中,雜環(huán)類化合物具有多種藥理活性[3-5],尤其在藥物研發(fā)中占有重要地位,用于治療心臟病,副作用小且無耐藥性[6,7].單個C—N 鍵、C—O 鍵、C—C鍵偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)機理,在近些年的研究中已經(jīng)比較深入[8,9],但是單一的催化劑在 “一鍋法”反應(yīng)中反應(yīng)機理的研究目前報道很少.陳文明小組[10]研究的六氫氮雜卓系列化合物的合成引起了我們的興趣.陳等人利用連續(xù)投料的 “一鍋法”反應(yīng)完成C—N 鍵、C—O 鍵偶聯(lián)反應(yīng)得到六氫氮雜卓系列化合物,反應(yīng)如Scheme 1 所示.在這篇報道中,我們知道C—N 鍵、C—O 鍵偶聯(lián)反應(yīng)都有各自特有的反應(yīng)環(huán)境,在第二步繼續(xù)偶聯(lián)時催化劑CuI起到一個什么樣的作用,從反應(yīng)分子中脫離出來還是在反應(yīng)分子內(nèi)繼續(xù)催化;為什么先是C—N鍵偶聯(lián),隨后才是C—O 鍵偶聯(lián)等等.為了更深入的了解Cu—X催化芳基鹵分子間的N-芳基化和O-芳基化反應(yīng)特征,本文采用密度泛函理論對此反應(yīng)微觀機理進行研究,希望通過對其微觀反應(yīng)過程的解析和說明,為相關(guān)實驗提供一些理論信息.

    Scheme 1

    2 計算方法

    采用量子化學(xué)中的密度泛函理論[11,12],在B3LYP/6-31+G (d)基組水平上 (C 采用贗勢基組LANL2DZ,Br、I采用MIDIX 基組)對Cu(1)催化下對溴碘苯和六氫氮雜卓與苯酚三組份發(fā)生分子間的N-芳基化和O-芳基化反應(yīng)過程中所有的反應(yīng)物、中間體、過渡態(tài)和產(chǎn)物進行全參數(shù)優(yōu)化.在相同基組下進行了頻率計算,計算所得所有的過渡態(tài)有且只有唯一的虛頻,通過內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo) (IRC)計算和振動頻率分析進一步驗證了過渡態(tài)的合理性.在相同基組水平上運用自然鍵價軌道 (NBO)[13]分析方法分析了中間體、過渡態(tài)的軌道間相互作用,利用AIM2000 程序包[14]計算了相應(yīng)的成鍵臨界點 (BCP)電荷密度,分析了成鍵特征,通過振動分析得到零點能(ZPE)及其校正后的總能量.所有計算采用Gaussian 09程序完成[15].

    3 結(jié)果與討論

    Cu催化六氫氮雜卓系列化合物的反應(yīng)歷程如圖1所示,IM1→IM5有兩條可行反應(yīng)通道IA和IB,中間體IM1可通過IA路徑,先與反應(yīng)物R2作用再脫掉HI分子得到中間體IM5,也可以按IB路徑先脫去HI分子再與反應(yīng)物R2作用得到中間體IM5;IM8→IM12也有兩條可行反應(yīng)通道IC和ID,中間體IM8可通過IC路徑,先與產(chǎn)物P1 作用再脫掉HI分子得到中間體IM12,也可按ID路徑先脫去HI分子再與產(chǎn)物P1作用得到中間體IM12.反應(yīng)過程中所有反應(yīng)物、中間體、過渡態(tài)以及產(chǎn)物的優(yōu)化構(gòu)型和結(jié)構(gòu)參數(shù)的標(biāo)注見圖2,相關(guān)的反應(yīng)能量如表1,反應(yīng)能級示意圖如圖3.計算結(jié)果表明:所有中間體的力常數(shù)本征值為正,是反應(yīng)勢能面上的穩(wěn)定點,所有過渡態(tài)都具有唯一的虛頻.

    3.1 IA反應(yīng)通道機理分析

    圖1 六氫氮雜卓合成路線Fig.1 Detailed synthesis route of 2-Perhydroazepinone

    表1 反應(yīng)各駐點的能量E(a.u.),相對能量Erel(kJ·mol-1)Table 1 Energies E(a.u.),relative energies Erel(kJ·mol-1)

    研究發(fā)現(xiàn)反應(yīng)的第一步是催化劑CuI的Cu原子先與反應(yīng)物R1的N 原子形成配位鍵,得到絡(luò)合中間體IM1.計算發(fā)現(xiàn)R1 中C (1)-N、C(2)-N、N-H (1)鍵 長 分 別 為0.1374 nm、0.1464nm、0.1013nm,而在IM1中C (1)-N、C (2)-N、N-H (1)鍵長分別為0.1448nm、0.1507nm、0.1024nm,鍵長依次增加.在R1+CuI→IM1過程中,BCP電荷密度發(fā)生了相應(yīng)的變化:C (1)-N 由0.3141a.u.減少到0.2756a.u.,C(2)-N由0.2574a.u.減少到0.2326a.u.,N-H (1)由0.3312a.u.減少到0.3273a.u..另外,IM1中的Cu-I鍵長比催化劑CuI中Cu-I鍵長增加了0.0015 nm,BCP電荷密度減少了0.0006a.u..上述數(shù)據(jù)說明催化劑CuI的Cu原子與R1中的N 原子形成配位鍵,對原來的七元環(huán)進行拉扯使得與N 原子相連接的兩個C 原子之間均變長,而N-H (1)被削弱.從NBO 計算分析得知,中間體IM1中BD(σ)C (6)-N→LP* (6)Cu 二階穩(wěn)定化能E(2)為25.49kJ/mol,BD (1)N-H→LP* (6)Cu二階穩(wěn)定化能E (2)為30.56kJ/mol,表明它們之間存在軌道間相互作用.從能量表表1可以看出從催化劑CuI與R1 形成中間體IM1 后,能量降低了102.88kJ/mol,說明中間體IM1 易形成并穩(wěn)定存在.在催化劑CuI成功吸附反應(yīng)物R1后,繼續(xù)吸附反應(yīng)物R2中富電子I原子,計算發(fā)現(xiàn)中間體IM2 中Cu-N、Cu-O 鍵長分別為0.3210nm、0.2057nm,BCP 電荷密度分別為0.0122a.u.、0.0681a.u.,說明了IM2 中Cu 原子與R2 中I原子形成配位鍵導(dǎo)致Cu-N 鍵變?nèi)?,Cu-O鍵增強.IM2中C (3)-I(2)鍵長為0.2129 nm,比R2增長了0.0019nm,其BCP電荷密度由0.1603a.u.降低到0.1218a.u.,說明IM2中的Cu原子與R2中I原子形成了配位鍵導(dǎo)致C (3)-I(2)鍵變?nèi)?從NBO 計算分析得知,中間體IM2中BD (σ)C (15)-I(19)→LP* (7)Cu二階穩(wěn)定化能為25.91kJ/mol,LP (5)Cu→BD* (1)C(15)–I(19)二階穩(wěn)定化能為7.49kJ/mol,表明它們之間存在軌道間相互作用.從能量表表1可以看出IM1和R2配位形成中間體IM2,能量升高了13.68kJ/mol,說明中間體IM2易形成并穩(wěn)定存在,并在此過程完成了催化劑的整個吸附過程.催化劑CuI完成對R1和R2的活化絡(luò)合之后,經(jīng)過過渡態(tài)TS1形成中間體IM3,振動頻率證實了過渡態(tài)TS1其虛頻振動頻率為74.2icm-1.在TS1中,Cu-O的鍵長由0.2057nm 增加到0.2259nm,其BCP電荷密度由0.0.0652a.u.降低0.0454a.u.;而Cu-N 鍵長則縮短為0.2055nm.過渡態(tài)TS1中Cu-OC(1)-N-H (1)之間的成環(huán)臨界點 (RCP)電荷密度為0.0364a.u.,說明TS1是五元環(huán)狀過渡態(tài).從能量表表1可以看出IM2→TS1→IM3過程,反應(yīng)所需活化能為110.48KJ/mol.中間體IM3經(jīng)過渡態(tài)TS2脫HI分子形成中間體IM5,振動頻率證實TS2虛頻振動頻率為467.3icm-1.從能量表表1數(shù)據(jù)可知,IM3→TS2→IM4→IM5過程的活化能為13.53KJ/mol,說明脫掉HI分子過程容易進行.

    3.2 IB反應(yīng)通道機理分析

    圖2 反應(yīng)路徑中各駐點的分子構(gòu)型圖Fig.2 Geometric parameters of the compounds in pathway(Bond length in nm,BCP(in brackets)in a.u.)

    圖3 路徑中各駐點的能級圖Fig.3 The diagram of relative energies along the channel

    中間體IM1經(jīng)過過渡態(tài)TS1a轉(zhuǎn)化為中間體IM2a,通過計算證實了過渡態(tài)TS1a虛頻的振動頻率是513.5icm-1.在過渡態(tài)TS1a 中,N-H(1)鍵長為0.2017nm,比中間體IM1的0.1024 nm 增加了0.0993 nm,其BCP 電荷密度由0.3273a.u.減小到0;Cu-H (1)鍵長為0.1449 nm,比中間體IM1 的0.2474nm 縮短了0.1025 nm,其BCP電荷密度由0增加到0.1293a.u..以上構(gòu)型數(shù)據(jù)充分表明IM1→TS1a→IM2a過程,N-H (1)鍵逐步斷裂,而Cu-H (1)鍵逐步形成.在IM2a中,N-H (1)鍵長為0.3536nm,說明N-H (1)鍵已經(jīng)完全斷裂.從能量表表1數(shù)據(jù)可知,IM1→TS1a→IM2a 過程的活化能為193.68KJ/mol,活化能較高.中間體IM2a經(jīng)過過渡態(tài)TS2a轉(zhuǎn)化為中間體IM3a,通過計算證實了過渡態(tài)TS2a虛頻的振動頻率是316.5icm-1.在過渡態(tài)TS2a 中,Cu-H (1)的鍵長為0.2599 nm,比IM2a的0.1522nm 增加了0.1077nm,其BCP 電荷密度由0.1129a.u.減小到0;而I(1)-H (1)的鍵長為0.1653nm,比IM2a 的0.1962nm 縮短了0.0309nm,其BCP 電荷密度由0增加到0.1361a.u..以上構(gòu)型數(shù)據(jù)充分表明IM2a→TS2a→IM3a過程,Cu-H (1)鍵逐步斷裂,而I(1)-H (1)鍵逐步形成.在IM3a中,Cu-H (1)鍵長為0.3182nm,I(1)-H (1)鍵長為0.1649nm,說明Cu-H (1)鍵已經(jīng)完全斷裂,I(1)-H (1)已經(jīng)形成.從能量表表1數(shù)據(jù)可知,IM2a→TS2a→IM3a過程的活化能為14.76 KJ/mol,反應(yīng)活化能較低,該反應(yīng)容易進行.中間體IM3a 進一步脫去一分子HI 形成中間體IM4a.在IM3a中,Cu-I(1)鍵長為0.2436nm,其BCP電荷密度為0.0721a.u..在IM4a中Cu-I(2)鍵長為0.1964nm,IM4a與反應(yīng)物R2活化絡(luò)合形成中間體IM5 后,Cu-I(2)鍵長增加到0.1993 nm,相應(yīng)的BCP 電荷密度變化由0.0922a.u.減小到0.0874a.u..從能量表表1數(shù)據(jù)可知,IM4a+R2→IM5過程能量降低了114.52 KJ/mol,表明該反應(yīng)容易進行.中間體IM5經(jīng)過過渡態(tài)TS3轉(zhuǎn)化為中間體IM6,過渡態(tài)TS3虛頻的振動頻率為76.6icm-1.從能量表1上也可以看出,從IM5 到TS3 所需要的活化能為23.27 kJ/mol,活化能較小,說明該反應(yīng)很容易進行.中間體IM6經(jīng)過過渡態(tài)TS4得到中間體IM7,過渡態(tài)TS4虛頻振動頻率為133.4icm-1.從能量表表1可知,IM6→TS4→IM7過程的活化能為125.84 kJ/mol,活化能較大,是整個反應(yīng)的速控步驟.中間體IM7轉(zhuǎn)化到產(chǎn)品P1是催化劑CuI從反應(yīng)物上的裂解過程,表明是催化劑完成了一個催化單元,這步反應(yīng)的活化能是81.47kJ/mol,裂解較容易進行.

    3.3 IC反應(yīng)通道機理分析

    在此處催化劑CuI完成了N-C (3)的結(jié)合過程,接下來催化劑CuI繼續(xù)進攻含有孤對電子的反應(yīng)物R3上的O 原子形成中間體IM8.計算發(fā)現(xiàn)中間體R3 受CuI吸附作用與O 形成配位鍵,使C (5)-O (2)、O (2)-H (2)鍵長分別由R3的0.1373nm、0.0970nm 增加到0.1400nm、0.0971nm,相應(yīng)的BCP 電荷密度由R3 中的0.2786a.u.、0.3543a.u. 降 低 至 0.2519au、0.3496a.u..Cu-I也由CuI中的0.2367nm 增加至0.2373nm.從NBO 計算分析得知,中間體IM8中成鍵軌道BD(σ)C-O 的占據(jù)數(shù)為1.9951e小于反應(yīng)前占據(jù)數(shù)1.9954e;在中間體IM8中BD(σ)O (7)–H (10)→LP* (8)Cu的二階穩(wěn)定化 能E (2)為24.61kJ/mol,BD (σ)Cu-I(9)→LP* (8)Cu 的二階穩(wěn)定化能E (2)為16.74kJ/mol,表明它們之間存在軌道間相互作用.從能量表表1可以看出,CuI與R3的O 原子形成配位鍵得到IM8 后,能量降低了93.57kJ/mol,表明IM8易形成并穩(wěn)定存在.

    中間體IM9是中間體IM8中的Cu原子與產(chǎn)物P1中的Br原子形成的配體.從計算結(jié)果上看,IM9中Cu 與Br原子已經(jīng)成鍵,鍵長為0.2358 nm,BCP 電荷密度為0.0664a.u.,而C-Br鍵則從產(chǎn)物P1中的0.1914nm 增長到0.1949nm.從NBO 計算分析得知,成鍵軌道BD (σ)C-Br的占據(jù)數(shù)為1.9837e小于反應(yīng)前占據(jù)數(shù)1.9880e;BD(σ)C (11)–Br(14)→LP* (7)Cu的二階穩(wěn)定化能E (2)為27.92kJ/mol,LP (5)Cu→BD* (1)C (11)-Br(14)的二階穩(wěn)定化能E(2)為4.86kJ/mol,表明它們之間存在較強的軌道間相互作用.從能量表表1 可以看出,IM8 和產(chǎn)物P1配位形成中間體IM9,能量降低了31.62 kJ/mol,表明IM9易形成并穩(wěn)定存在.然而從計算結(jié)果上看,IM8→IM9過程,Cu-O (2)鍵長從0.1986nm 增長到0.3581nm,BCP 電荷密度由0.0723a.u.降低到0.0040a.u..這是由于CuI吸附過程中形成的空間位租和化學(xué)鍵不同造成的,在IM8中,Cu原子進攻苯酚中O 原子,與O 原子的孤對電子形成配位鍵;吸附產(chǎn)物P1 時,Cu原子與產(chǎn)物P1中的Br原子形成配體,產(chǎn)生強于配位鍵的化學(xué)鍵.在催化劑CuI完成對中間體IM8和產(chǎn)物P1的活化絡(luò)合形成中間體IM9之后,中間體IM9經(jīng)過過渡態(tài)TS5轉(zhuǎn)化為中間體IM10,過渡態(tài)TS5虛頻振動頻率為742.8icm-1,從能量變化上看,從中間體IM9轉(zhuǎn)化到過渡態(tài)TS5能量升高了179.78kJ/mol,活化能較大,是整個反應(yīng)的速控制步驟.中間體IM10經(jīng)過過渡態(tài)TS6轉(zhuǎn)化為復(fù)合物IM11,進一步脫去HI分子形成中間體IM12,計算得到過渡態(tài)TS6 虛頻振動頻率為477.2icm-1,IM10→TS6→IM11 的活化能為23.98KJ/mol,該能量較小,反應(yīng)很容易進行.M11→IM12是脫掉HI分子的過程,脫掉HI分子后能量升高了38.31KJ/mol,該過程也是比較容易進行的.

    3.4 ID反應(yīng)通道機理分析

    中間體IM8 經(jīng)過過渡態(tài)TS5a 形成中間體IM9a,過渡態(tài)TS5a 虛頻振動頻率為676.6 icm-1.在過渡態(tài)TS5a中,O (2)-H (2)鍵長為0.1782nm,比IM8中增加了0.0811nm;Cu-H (2)鍵 長 為0.1478 nm,比IM8 中 縮 短 了0.1124nm.IM8→TS5a過程BCP電荷密度變化:O (2)-H (2)由0.3496a.u.減小到0,Cu-H(2)由0增加到0.1196a.u..以上構(gòu)型數(shù)據(jù)說明,IM8→TS5a→IM9a過程,O (2)-H (2)鍵部分?jǐn)嗔眩珻u-H (2)鍵逐步形成.從能量變化上看,IM8→TS5a的活化能為176.94KJ/mol,活化能較大,為整個反應(yīng)的速控步驟,決定該反應(yīng)的反應(yīng)速率.中間體IM9a經(jīng)過過渡態(tài)TS6a形成中間體IM10a,過渡態(tài)TS6a虛頻振動頻率為497.2 icm-1.IM9a→TS6a→IM10a 過程的活化能為11.21 KJ/mol,該能量較小,反應(yīng)容易進行.IM10a脫掉一分子HI形成中間體IM11a,IM11a與產(chǎn)物P1活化絡(luò)合生成中間體IM12,IM11a→IM12過程中,IM11a+P1→IM12 過程能量降低了176.94 KJ/mol,該反應(yīng)容易進行.中間體IM12中的Cu原子繼續(xù)進攻分子內(nèi)的苯環(huán),IM12通過過渡態(tài)TS7完成Cu對目標(biāo)C (4)原子的絡(luò)合得到中間體IM13,TS7的虛頻振動頻率為76.9 icm-1,IM12→TS7→IM13 過程,能量升高了18.51kJ/mol,進而轉(zhuǎn)化到IM13 時能量降低了18.21kJ/mol,該反應(yīng)容易進行.Cu原子對目標(biāo)C (4)原子絡(luò)合形成中間體IM13 后,中間體IM13又經(jīng)過過渡態(tài)TS8形成中間體IM14,過渡態(tài)TS8 虛頻振動頻率為106.5icm-1.中間體IM13轉(zhuǎn)化到過渡態(tài)TS8 能量升高了36.00kJ/mol,表明該反應(yīng)是容易進行的.中間體IM14經(jīng)過過渡態(tài)TS9轉(zhuǎn)化成中間體IM15,IM14經(jīng)過過渡態(tài)TS9轉(zhuǎn)化到中間體IM15所需要的活化能為8.73 kJ/mol,能量比較小,說明反應(yīng)比較容易進行.最后,從中間體IM15到產(chǎn)物P2是CuBr離去的過程.

    由表1中能量數(shù)據(jù)可以看出,中間體IM1→中間體IM5有兩條可行反應(yīng)通道IA和IB,中間體IM8→中間體IM12 也有兩條可行反應(yīng)通道IC和ID.路徑IA的速控步驟是IM6→TS4→IM7,活化能為126.34KJ/mol;路徑IB的速控步驟為IM1→TS1a→IM2a,活化能為193.68KJ/mol;比較可知,路徑IA活化能較低,是主要的反應(yīng)通道.路徑IC的速控步驟是IM9→TS5→IM10,活化能為179.78 KJ/mol;路徑ID的速控步驟為IM8→TS5a→IM9a,活化能為176.94KJ/mol;比較可知,反應(yīng)通道IC和ID反應(yīng)控制步驟活化能相差不大,兩條反應(yīng)通道可同時進行.整個反應(yīng)的反應(yīng)歷程為:CuI+R1+R2→IM2→TS1→IM3→TS2→IM4→IM5→TS3→IM6→TS4→IM7→P1→P1+IM8→IM9a→TS5a→IM10a→TS6a→IM11a→IM12→TS7→IM13→TS8→IM14→TS9→IM15→P2.整個反應(yīng)的速控步驟為IM8→TS5a→IM9a,反應(yīng)活化能為176.94kJ/mol.

    為了更好地說明催化劑CuI在第二步反應(yīng)的作用,我們研究了沒有催化劑CuI該反應(yīng)的反應(yīng)過程如Scheme 2,反應(yīng)中所有反應(yīng)物、過渡態(tài)以及產(chǎn)物的優(yōu)化構(gòu)型和結(jié)構(gòu)有關(guān)參數(shù)的標(biāo)注見圖1.過渡態(tài)TS10虛頻振動頻率為389.3icm-1,證實了該過渡態(tài)的存在.沒有催化劑CuI的反應(yīng)過程的反應(yīng)活化能是199.01kJ/mol,比有催化劑CuI的最高反應(yīng)活化能高22.07kJ/mol.

    Scheme 2

    4 結(jié) 論

    本文采用密度泛函理論研究Cu催化的 “一鍋法”合成六氫氮雜卓化合物反應(yīng)的微觀反應(yīng)機理,優(yōu)化所有反應(yīng)物、中間體、過渡態(tài)和產(chǎn)物的幾何構(gòu)型,在相同條件下進行了頻率計算,通過頻率的正負(fù)值確定中間體和過渡態(tài)真實性.其反應(yīng)的歷程為:CuI+R1+R2→IM2→TS1→M3→TS2→IM4→IM5→TS3→IM6→TS4→IM7→P1→P1+IM8→IM9a→TS5a→IM10a→TS6a→IM11a→IM12→TS7→IM13→TS8→IM14→TS9→IM15→P2.整個反應(yīng)的速控步驟為IM8→TS5a→IM9a,反應(yīng)活化能為176.94kJ/mol.通過比較反應(yīng)速控步驟有無Cu催化劑對反應(yīng)活化能的影響,結(jié)果表明沒有Cu (I)催化劑時,比有Cu(I)催化時的反應(yīng)活化能升高了22.07kJ/mol,說明了Cu (I)催化劑促進了反應(yīng)的進行,這與實驗結(jié)果相一致.

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