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      一株拮抗放線菌T151的鑒定及其抑菌活性物質(zhì)分析

      2013-01-16 08:52:30李曉鳳李淑英聶瑩杜歡楊帆童大磊韋日清趙仲麟唐選明
      生物技術通報 2013年3期
      關鍵詞:指示菌放線菌枯草

      李曉鳳 李淑英 聶瑩 杜歡 楊帆 童大磊 韋日清 趙仲麟 唐選明

      (1. 中國農(nóng)業(yè)科學院農(nóng)產(chǎn)品加工研究所,北京 100193; 2. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學,呼和浩特 010018; 3. 河南農(nóng)業(yè)大學理學院,鄭州 450002)

      從微生物代謝產(chǎn)物中尋找控制有害生物的生物農(nóng)藥是新農(nóng)藥研究的一個重要方向[1]。隨著環(huán)境保護、綠色食品及農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的需要,農(nóng)用抗生素作為低毒低殘留的生物農(nóng)藥日益受到人們的重視[2]。目前,從微生物中發(fā)現(xiàn)的大約8 000種生物活性物質(zhì)中近70%是由放線菌產(chǎn)生的[3]。

      T151是從土壤中分離純化得到的一株具有抑菌活性的放線菌,為了研究該菌株是否具有潛在生防利用價值和田間應用前景,我們對發(fā)酵液中活性代謝產(chǎn)物的抑菌作用范圍及其在不同條件下抑菌活性的穩(wěn)定性作了初步分析,旨在為T151的進一步研究和應用提供理論指導。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 菌種來源 放線菌T151本實驗室從海南??谑薪嫉耐寥乐蟹蛛x得到;指示菌:枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)、大腸桿菌(Escherichia coli)和根霉(Rhizopus)均由本實驗室保存。

      1.1.2 儀器 恒溫培養(yǎng)振蕩器(ZHWY-200H,上海智城分析儀器制造有限公司)、電熱恒溫培養(yǎng)箱(DHP-9082型,上海一恒科學儀器有限公司)、立式壓力蒸汽滅菌鍋(YXQ-LS-50A,上海博迅實業(yè)有限公司醫(yī)療設備廠)、三目生物顯微鏡(XSP-BM10A,上海光學儀器六廠)、大型離心機(CR22GⅡ,日本日立)、透射電子顯微鏡(H-T500,日本日立)。

      1.1.3 培養(yǎng)基 根霉培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基??莶菅挎邨U菌和大腸桿菌培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基。T151發(fā)酵培養(yǎng)基:淀粉2%、黃豆餅粉0.2%、大米粉0.2%、葡萄糖0.5%、酵母粉0.2%、KNO30.2%、NaCl 0.1%、K2HPO40.1%、MgSO40.05%、CaCO30.3%。 所 有 培養(yǎng)基均在120℃下滅菌40 min備用。

      1.2 方法

      1.2.1 菌種鑒定 形態(tài)學鑒定:采用埋片法[4]在發(fā)酵培養(yǎng)基上培養(yǎng)菌株T151,用光學顯微鏡和掃描電子顯微鏡觀察拍照。分子生物學鑒定:提取T151的基因組,放線菌16S rDNA擴增引物及方法參照文獻[5],擴增片段送Invitrogen公司測序。測序結(jié)果在NCBI網(wǎng)站利用Blast進行比對,調(diào)出相似序列,用Clustal X1.83和MEGA 3.1 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[6]。

      1.2.2 抑菌活性分析 采用管碟法[3,7-9],分別以大腸桿菌,枯草芽孢桿菌和根霉為指示菌,測定T151發(fā)酵液的抑菌活性。試驗重復3次,以十字交叉法測量抑菌圈直徑大小。

      1.2.3 發(fā)酵液活性物質(zhì)穩(wěn)定性分析 以枯草芽孢桿菌為指示菌,采用管碟法測定發(fā)酵液在不同條件下處理后的抑菌活性,根據(jù)抑菌圈直徑的改變確定其穩(wěn)定性[3,9-11]。

      熱穩(wěn)定性分析:各取發(fā)酵液2 mL,分別置于80℃、90℃、100℃和110℃條件下加熱20 min和30 min,測抑菌活性,試驗重復3次。

      酸堿穩(wěn)定性分析:各取5 mL發(fā)酵液,分別用1 mol/L的HCl或1 mol/L的NaOH調(diào)節(jié)pH,分別調(diào)到pH為3、5、7、9、11和12,并放置于冰箱4℃,12 h,然后將各pH調(diào)回7左右,測抑菌活性,試驗設3個重復。

      2 結(jié)果

      2.1 T151菌種鑒定結(jié)果

      2.1.1 形態(tài)特征 T151菌落緊密、多皺,菌絲體呈淡紫灰色。如圖1所示,光學顯微鏡下菌絲體呈直立或柔曲。如圖2所示,掃描電鏡下其孢子絲呈鏈狀直絲,孢子表面光滑無突起,孢子呈圓柱狀兩端方正平滑,參照《鏈霉菌鑒定手冊》,該菌株總體表現(xiàn)為鏈霉菌屬特點。

      圖1 T151光學顯微鏡形態(tài)觀察

      圖2 T151電子顯微鏡形態(tài)觀察

      2.1.2 16S rDNA序列分析及系統(tǒng)發(fā)育構(gòu)建 PCR擴增所得T151菌株16S rDNA全長1 486 bp,將T151的16S rDNA測序結(jié)果經(jīng)Blast 比對,與T151菌株16S rDNA同源性較高的菌株均為鏈霉菌屬放線菌,從中選擇15條同源性高于99%的16S rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖3所示,T151菌株與Streptomycessp. SHXFF-2 partial 在同一分枝上,結(jié)合菌株形態(tài)特征,初步鑒定T151為鏈霉菌新種。

      2.2 T151發(fā)酵液抑菌活性分析

      從表1可以看出,T151的發(fā)酵產(chǎn)物對3種指示菌均有明顯的抑菌活性。對G-細菌大腸桿菌的抑菌效果最好,抑菌圈面積為593.66 mm2;其次為G+細菌枯草芽孢桿菌,抑菌圈面積達到490.63 mm2;對真菌根霉也有明顯的抑制作用,抑菌圈面積為200.96 mm2。

      2.3 T151發(fā)酵液的穩(wěn)定性分析

      圖3 T151的系統(tǒng)發(fā)育樹

      表1 T151發(fā)酵液對3種指示菌的抑制效果

      2.3.1 熱穩(wěn)定性 如圖4所示,隨著對T151發(fā)酵液處理溫度的升高,處理時間的延長,抑菌圈直徑減小。菌株T151發(fā)酵液分別在80℃、90℃和100℃處理20和30 min,抑菌活性變化不是很大;而發(fā)酵液在110℃條件下處理20 min后,抑菌活性大幅度降低,處理30 min后活性消失。以上結(jié)果表明,T151發(fā)酵液在80-100℃內(nèi)相對穩(wěn)定性,而當溫度升高到110℃時,穩(wěn)定性急劇下降。

      圖4 T151發(fā)酵液的熱穩(wěn)定性

      2.3.2 酸堿穩(wěn)定性 如圖5所示,T151發(fā)酵液在pH5-11條件下抑菌活性比較穩(wěn)定,抑菌圈直徑幾乎沒有變化,而pH 在3和12時,抑菌效果明顯降低,特別是在堿性環(huán)境下。說明T151發(fā)酵液中活性成分對強酸強堿的穩(wěn)定性較差。

      圖5 T151發(fā)酵液的酸堿穩(wěn)定性

      3 討論

      隨著對土壤放線菌代謝特性的深入研究,以及分離和培養(yǎng)方法的進一步改進,越來越多的土壤放線菌將得到分離,土壤放線菌豐富的多樣性將不斷地被揭示。鏈霉菌一直被認為是產(chǎn)生各種抗生素的主要來源。遺傳多樣性分析表明,鏈霉菌屬可產(chǎn)生的抗生素約有上萬種,而目前發(fā)現(xiàn)的只是很小一部分。隨著微生物對已有抗生素抗藥性的增加,人類對新的藥物資源的需求越來越迫切。但隨著已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的微生物源化合物數(shù)量的增加,從普通環(huán)境中分離篩選新的活性物質(zhì)產(chǎn)生菌的難度日益上升??梢?,從土壤環(huán)境中篩選稀有菌種已經(jīng)成為當前微生物資源開發(fā)利用的重要研究課題。

      本研究所用放線菌T151是從海南??谑薪嫉耐寥乐蟹蛛x得到,綜合形態(tài)學特征和分子生物學鑒定,該菌株屬于鏈霉菌屬。抑菌試驗結(jié)果表明,該菌株發(fā)酵液具有廣譜的抗菌活性,對G+細菌、G-細菌和真菌均有較強的抑制作用,并且對細菌的抑菌作用強于對真菌的抑菌作用。穩(wěn)定性分析表明,發(fā)酵液中具有抗菌作用的活性成分對熱、酸堿具有極強的穩(wěn)定性,這些研究對于活性物質(zhì)的進一步分離、純化、結(jié)構(gòu)解析和功能研究等提供了理論依據(jù)。

      后續(xù)研究中,還有待對該菌種進行系統(tǒng)的鑒定;還需要分離純化活性成分,對活性成分進行鑒定和系統(tǒng)的抗菌譜研究等。

      4 結(jié)論

      T151的形態(tài)學觀察表明,該菌株具有典型的鏈霉菌屬特征;16S rDNA鑒定結(jié)果證實,該菌株與Streptomycessp. SHXFF-2 partial處于同一分枝上,是鏈霉菌屬新種;發(fā)酵液的抗菌活性研究表明,T151的發(fā)酵液具有較強的抗菌活性,該菌株對G+細菌枯草芽孢桿菌、G-細菌大腸桿菌和真菌根霉均有較強的抑制作用;穩(wěn)定性分析表明,T151發(fā)酵液具有較強的熱、酸堿穩(wěn)定性,具有較強的可操作性。

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