中圖分類號:S31 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1001-4330(2025)05-1102-09
0引言
Rodin,TKS)為菊科(Compositae)蒲公英屬多年生宿根草本植物,因其根部富含天然橡膠而稱其為橡膠草[1]。橡膠草根部除了含有天然橡膠外,【研究意義】橡膠草(Taraxacumkok-saghyz同時還富含總糖和菊糖\"'。總糖是橡膠草根部的主要組成部分之一,參與生長、發(fā)育等多種生物過程,去除橡膠草根部總糖分中的還原糖之后,剩余組分被稱為菊糖或菊粉[3」。菊糖是一種特殊的果聚糖,主要存在于菊科、龍膽科、桔??频戎参镏校怯蒁-呋喃果糖通過1,2-糖苷鍵連接而成的直鏈結(jié)構(gòu)多糖[4]。菊糖作為一種水溶性膳食纖維和生物活性前體,具有多種生理功能。因此,菊糖被廣泛應(yīng)用于低熱量、低糖、低脂食品中,作為一種天然甜味劑和食品添加劑[5],橡膠草的根部中菊糖和天然橡膠的合成競爭碳同化產(chǎn)物,與天然橡膠合成密切相關(guān)。但目前關(guān)于橡膠草根部總糖和菊糖含量測定方法的研究較少,僅有酶標(biāo)儀法報道3,且操作過程較為繁瑣。我國目前對橡膠草的研究和育種還處于雛形階段,亟需一種快速且低成本的總糖和菊糖含量檢測方法,對于實現(xiàn)橡膠草資源的最大化利用以及橡膠草的育種和栽培均具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】近紅外光譜(NIRS)技術(shù)與化學(xué)計量方法相結(jié)合可實現(xiàn)低成本、快速、高效、無損、綠色的檢測,植物中的糖類物質(zhì),如總糖和菊糖中含有大量的含氫基團(tuán),近紅外光譜對其具有較好的吸收,通過化學(xué)計量學(xué)方法便可以實現(xiàn)總糖和菊糖的定量檢測。目前基于近紅外光譜技術(shù)建立樣品糖類含量預(yù)測模型的研究報道較多,許生陸等以114個不同產(chǎn)區(qū)枸杞樣品為研究對象,建立預(yù)測枸杞中總糖含量的PLS模型,預(yù)測性能較優(yōu), Rc2 和 Rv2 分別達(dá)到了0.994和0.916。鄧亮等[9使用1056個煙葉樣品,基于PLS建立了煙葉總糖含量的近紅外光譜預(yù)測模型,相關(guān)系數(shù) r 達(dá)到了0.918,證明了近紅外光譜技術(shù)適合用于植物中總糖含量的預(yù)測,常常被作為總糖含量快速檢測的手段?!颈狙芯壳腥朦c】目前未見基于近紅外光譜技術(shù)預(yù)測菊糖含量的研究報道。目前橡膠草根部總糖和菊糖含量的檢測方法主要為酶標(biāo)儀法,該方法無法直接對菊糖含量的值進(jìn)行測定,需要先使用酶標(biāo)儀法測定出樣品總糖和還原糖的含量,再通過總糖和還原糖的含量推算出菊糖的含量3,檢測過程耗時耗力并且消耗的人工成本和材料成本較高,而近紅外光譜定量技術(shù)快速、低成本,可以彌補(bǔ)目前橡膠草總糖和菊糖含量檢測技術(shù)存在的缺陷?!緮M解決的關(guān)鍵問題】 |850~2500nm 采集橡膠草根部粉末樣品的光譜數(shù)據(jù),結(jié)合化學(xué)計量方法建立適用于橡膠草干根菊糖和總糖含量快速測定的近紅外光譜定量模型,為快速測定橡膠草根部總糖和菊糖含量提供技術(shù)支持。
1 材料與方法
1.1 材料
采用人工種植的K445品系橡膠草103份材料為樣品,其中包含部分與其他蒲公英屬植物雜交的橡膠草植株,樣品于 2021~2023 年不同月份種植,2023年于不同生長期采收。試驗樣品均來自于新疆維吾爾自治區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)院綜合試驗場橡膠草種植基地,位于 N43.94691° , E87.47567° 。橡膠草樣品會在采集后的 48h 內(nèi)處理,用剪刀減去樣品的地上部分,只留其根部,清洗掉根部泥王等雜質(zhì),放入烘箱內(nèi)在 80°C 下烘干至無水分,之后將樣品放入牛皮紙袋中待檢測。
1.2方法
1.2.1 樣品制備
將采集的橡膠草樣品根部用剪刀剪下并清洗干凈,放入烘箱中 80°C 烘干至無水分,之后將烘干后的樣品剪碎浸泡于液氮中冷凍脆化 1min ,使用凈信公司JXFSTPRP-CLN-48冷凍研磨儀研磨 3~5min ,研磨后的粉末粒徑小于 0.097mm (可過180目篩),用于光譜的采集以及菊糖和總糖含量的檢測。
1.2.2 光譜信息采集
使用福斯公司的FOSSNIRSTMDS2500F SR近紅外光譜儀對樣品進(jìn)行漫反射光譜采集,光譜的采集范圍為 850~2500nm ,光譜分辨率為0.5nm 。試驗使用橡膠草根部粉末樣品進(jìn)行光譜采集,將磨粉后的樣品送入光譜儀采集光譜,共采集103個橡膠草根部粉末樣品光譜數(shù)據(jù)。光譜采集時重復(fù)倒樣3次,取平均光譜。光譜采集前對儀器進(jìn)行至少預(yù)熱 1h ,每次采集光譜重復(fù)掃描7次,每次共采集3300分光譜點。采集后對光譜進(jìn)行簡化,將其調(diào)整為波長分辨率為 2nm 的光譜數(shù)據(jù),每個樣品光譜的波長數(shù)量為825個。圖1
1.2.3 菊糖和總糖含量測定
使用酶標(biāo)儀法測定研磨好的103份橡膠草根部粉末樣品的總糖和還原糖含量,基于式(1)計算出菊糖含量[3]。
圖1橡膠草根部粉末原始光譜
Fig. 1 Original spectra of TKS roots powder
菊糖含量 (%)= 總糖含量( % )-還原糖含 量 (%) 。 (1)
1.2.4 樣本集劃分
使用 SPXY 算法[10](sample set partitioningbasedonjoint x-y distance)劃分校正集和驗證集,SPXY是基于KS(Kolmogorov-Smirnov)算法提出的一種改進(jìn)方法,KS對數(shù)據(jù)集的劃分依據(jù)是計算不同樣本的 x 向量方向(即光譜數(shù)據(jù))的歐氏距離;而SPXY算法在此基礎(chǔ)上增加了對不同樣本的 y 向量方向(即樣品的實測值)的歐氏距離的計算,并通過正則化將 x 和 y 方向的距離結(jié)合,更加全面的評估和劃分?jǐn)?shù)據(jù)集。
1. 2.5 光譜數(shù)據(jù)
使用MATLAB2019b對光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理。由于研磨的粉末樣品形態(tài)、大小及粒徑存在差異,導(dǎo)致漫反射過程中的光程發(fā)生變化,進(jìn)而導(dǎo)致光譜重復(fù)性變差,因此需要對原始光譜進(jìn)行處理來減少光譜因為環(huán)境而帶來的誤差。對光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行移動窗口平均平滑(movingwindowsmoot-hing,MWS)變量標(biāo)準(zhǔn)化處理(standardnormalizedvariate,SNV)多元散射校正(multiplicativescattercorrection,MSC)、一階導(dǎo)數(shù)(Firstderivative,F(xiàn)D)的處理。MWS可以減少光譜中的部分噪音,從而減少光譜受到的環(huán)境誤差影響[\"]。SNV可以在一定程度上降低由于樣品的物理差異等方面對光譜產(chǎn)生的干擾[12,13],MSC可以消除樣品散射引起的波長偏移[14],F(xiàn)D算法的突出優(yōu)點是可消除基線漂移和疊加效應(yīng)、提高光譜分辨率,可以有效消除常數(shù)基線和背景的干擾[15]
糖類物質(zhì)主要由C、H、O構(gòu)成[16],其中含有大量的 -0H,-CH,-CH2 官能團(tuán)[17],近紅外波段對這些官能團(tuán)較敏感。但這些官能團(tuán)的特征波段只占近紅外波段的一部分,同時由于環(huán)境等因素近紅外光譜中難免會有一些影響模型預(yù)測性能的噪音波段,因此篩選波段往往可以提高模型的預(yù)測性能,研究使用競爭性自適應(yīng)重加權(quán)采樣法[18](competitive adapative reweighted sampling,CARS)篩選光譜,降維數(shù)據(jù),減少模型的計算量和部分噪音,降低過擬合風(fēng)險。
1.3 數(shù)據(jù)處理
使用Python3.10基于偏最小二乘法(partialleast-squaremethod,PLS)算法建立橡膠草根部菊糖含量預(yù)測模型,模型PLS是多元線性回歸模型的一種,集主成分、典型相關(guān)和多元線性回歸3種分析方法的優(yōu)點于一身,該方法將自變量和因變量的空間進(jìn)行一定的線性組合,使得自變量和因變量之間的協(xié)方差最大[9],常被用于建立基于近紅外光譜技術(shù)的糖類物質(zhì)含量預(yù)測模型,且具有不錯的預(yù)測性能。
在建立模型后,使用用驗證集的相關(guān)系數(shù)(CorrelationcoefficientofValidation, Rv )、均方根誤差(Root-mean-square error of Validation,RM-SEv 以及相對分析誤差(RelativepercentdeviationofValidation, RPDv )作為模型的評價參數(shù)評估模型的預(yù)測性能,更高的 R 以及更低的RMSE說明模型的預(yù)測性能更佳[2,在復(fù)雜樣品的檢測中,一般認(rèn)為 RPDgt;2 表明模型可以用于初篩,RPDgt;2.5 表明預(yù)測性能較優(yōu)[21.22]。對比全波段以及處理后的的光譜建立的預(yù)測模型的評價參數(shù),找出最優(yōu)預(yù)測模型的建立方法。使用酶標(biāo)儀法對總糖和還原糖含量進(jìn)行檢測[3]
2 結(jié)果與分析
2.1 橡膠草樣品總糖、還原糖、菊糖的數(shù)據(jù)采集
研究表明,樣品總糖含量區(qū)間為 9.79% ~ 51.85% ,變異系數(shù)為 34.18% ,樣品還原糖區(qū)間 為 3.11%~8.98% ,變異系數(shù)為 32.61% 。樣品 的菊糖含量區(qū)間為 6.41%~45.35% ,變異系數(shù) 為 39.46% 。表1
2.2 樣品集的劃分
研究表明,樣品被劃分為82個校正集數(shù)據(jù)和21個驗證集數(shù)據(jù)。表2
Tab.1 Statistical tableofInulinand Total Sugarcontentinsampleset
表2SPXY法劃分樣本集橡膠草菊糖和總糖含量
表1樣本集菊糖和總糖含量統(tǒng)計
2.3 光譜數(shù)據(jù)預(yù)處理
研究表明,菊糖和總糖含量光譜數(shù)據(jù)最優(yōu)預(yù)處理方法均為MWS-SNV,相對其他預(yù)處理方法,使用MWS-SNV改方法對光譜進(jìn)行預(yù)處理后,菊糖含量PLS預(yù)測模型的 Rv 和 RPDv 為0.925和2.635,RMSEv為2.871;總糖含量PLS預(yù)測模型的 Rv 和 RPDv 為0.939和2.902,RMSEv為2.720。表3
Tab.2 StatisticaldataofInulinand TotalSugarcontentofTKSinsample setdividedbySPXYmethod
表3 不同預(yù)處理方法的PLS模型效果比較
Tab.3Comparison of PLS model effects of different preprocessing methods
2.4 特征波長篩選
研究表明,隨著采樣次數(shù)的增加,低貢獻(xiàn)率的波長在不斷的被剔除,在采樣次數(shù)達(dá)到34次時交叉驗證集的均方根誤差RMSECV達(dá)到最低,而后開始升高,繼續(xù)采樣會剔除掉菊糖對應(yīng)的特征波長,用“*”組成的垂直線處為最佳的采樣次數(shù)34次,共篩選出了20個菊糖特征波長,約占總波長的 2.4% ;對總糖含量光譜特征波長的采樣次數(shù)在31次時RMSECV達(dá)到最低,為最佳采樣次數(shù),篩選出14個特征波長,占總波長的 1.7% 0圖2~3
2.5 最優(yōu)PLS模型的建立
研究表明,經(jīng)過波長篩選后模型預(yù)測性能上限有所提升,其中菊糖含量預(yù)測性能最佳的是光譜使用了MWS-SNV-CARS處理的PLS模型,Rv 從0.925提升至 0.942,RPDv 從2.635提升至2.977,RMSEv從2.841降低至2.515;總糖含量預(yù)測性能最佳的是光譜使用了MWS-FD-CARS處理PLS模型, Rv 從0.939提升至0.949,RPDv從2.211提升至 3.175,RMSEv 從3.576降低至2.490。表4,圖4
圖2 CARS篩選菊糖光譜特征波長過程
Fig.2 Process of CARS screening the spectral characteristic wavelength of Inulin
圖3 CARS篩選總糖光譜特征波長過程
Fig.3 Process of CARS screening thespectral characteristic wavelength of Total Sugar
表4全光譜和特征波長PLS模型比較
Tab.4 Comparison of full spectrum and characteristic band PLS models
圖4菊糖(a)和總糖(b)實測值-預(yù)測值散點
Fig.4 Scatter plot of the true value-predicted value of Inulin(a)and Total Sugar(b)
3討論
3.1周志磊[22]等利用聯(lián)合區(qū)間偏最小二乘(is-PLS)進(jìn)行波長篩選,建立了黑果枸杞中總糖含量的近紅外光譜PLS預(yù)測模型,其預(yù)測集相關(guān)系數(shù)Rp 達(dá)到了0.988,相對分析誤差RPD達(dá)到了4.84;陳淼[23]等建立了不同種皮顏色花生的總糖含量的PLS預(yù)測模型,其中使用黑色種皮花生光譜數(shù)據(jù)建立的模型預(yù)測性能最佳,交叉驗證集相關(guān)系數(shù) Rcv 達(dá)到了0.868,外部驗證集的相對分析誤差 Rp 達(dá)到了0.967,均方根誤差RMSECV為2.522;王凡[24]等使用便攜式近紅外光譜儀對番茄進(jìn)行光譜采集,建立了番茄總糖含量的PLS預(yù)測模型,其驗證集相關(guān)系數(shù) Rv 達(dá)到了0.966,均方根誤差RMSEv為0.128。目前利用近紅外光譜技術(shù)建立植物樣品中總糖含量預(yù)測模型的相關(guān)研究很多,但是尚無利用該技術(shù)對菊糖含量進(jìn)行檢測的研究報道,然而菊糖作為一種在植物中具有重要生理功能的糖類物質(zhì)[17]
3.2與試驗建立的模型預(yù)測精確度不算非常優(yōu)秀,可能是由于橡膠草根部含有大量的天然橡膠,天然橡膠主要成分為順式聚異戊二烯[25],其中包含大量-CH和 -CH2 官能團(tuán)[26.27],與糖類物質(zhì)官能團(tuán)的高度重疊,以至于近紅外光譜中的糖類物質(zhì)的官能團(tuán)相關(guān)波長被天然橡膠的官能團(tuán)相關(guān)波長大量覆蓋,難以提取其特征,在一定程度上影響了橡膠草根部糖類含量預(yù)測模型的精度。試驗中建立的橡膠草根部菊糖和總糖含量最優(yōu)PLS模型的RPDv分別達(dá)到了2.977和3.175,均超過2.5,說明具有較優(yōu)的預(yù)測性能。
4結(jié)論
基于近紅外光譜技術(shù)建立了橡膠草根部菊糖和總糖含量的PLS預(yù)測模型,最優(yōu)的菊糖含量PLS預(yù)測模型使用的光譜預(yù)處理方法是MWS-SNV -CARS, Rv 達(dá)到了 0.942,RMSEv 為2.515,RPDv 為2.977;最優(yōu)總糖含量PLS預(yù)測模型使用的光譜預(yù)處理方法是 MWS-FD-CARS,Rv 達(dá)到了0.949,RMSEv為2.490,RPDv為3.175。2個模型的 RPDv 均大于2.5,性能較優(yōu),可實現(xiàn)快速定量檢測橡膠草根部菊糖和總糖。
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CHEN Runfeng1,2,GAO Qiang1 , YAN Qingqing1, XU Lin1 ,Tuhanguli Touheti’,ZHANG Yan’,ZHENGLipeng',REN Hailong3,NIE Qiuhai4
(1. Institute of Crop Xinjiang Uyghur Asuronomous Region Academy of Agricultural Sciences,National Central Asian Characteristic Crop Germplasm Resources Medium -term Gene Bank (Urumqi),Urumqi 830091, China; 2. Colege of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830091,China; 3. Crops Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 5103O8, China; 4. Beijing Linglong Tyre Company Limited,Beijing 101102, China)
Abstract:【Objective】 This study aims to develop a green,low-cost,rapid detection technique for inulin and total sugar content in the roots of Taraxacum kok -saghyz Rodin(TKS)using near -infrared (NIR) spectroscopy,therebyadvancing research in cultivation and breeding of TKS.【Methods】This study involved 103 dry root powder samples of TKS(Rubber Grass). Spectra were collcted using the FOSS NIRSTM DS2500F SR near - infrared spectrometer (wavelength range 850-2500nm )by Foss Company. Enzyme labeling method was employed to measure the total sugar and reducing sugar content in the root samples and the inulin content was calculated by subtracting the reducing sugar content from the total sugar content. The SPXY algorithm was utilized to divide the samples into training and validation sets.Pretreatments on the raw spectral data included Moving Window Smoothing(MWS),Standard Normal Variate(SNV),Multiplicative Scatter Correction (MSC),and First Derivative (FD). Competitive Adaptive Reweighted Sampling(CARS) was applied for wavelength selection,followed by establishing Partial Least Squares (PLS) prediction models for inulin and total sugar content in TKS roots.【Results】The content range of total sugar,reducing sugar,and inulinin the sample setwas 9.79% -51. 85% , 3.11%-8.98% ,and 6.41%-45.35% ,respectively,with variation coefficients of 34.18% , 32.61% ,and 39.46% . The samples were divided into calibration and validation sets at a ratio of 4:1 using the SPXY algorithm,with each set containing 82 and 21 samples for both total sugar and inulin. The optimal PLS prediction model for inulin content utilized MWS-SNV-CARS preprocessing,achieving a validation set correlation coeffcient ( Rv )of 0.942,a root mean square error(RMSEv) of 2.515,and a relative performance deviation( RPDv )of 2.977. For total sugar,the best PLS model also employed MWS - SNV - CARS preprocessing,reaching an Rv of 0.949,RMSEv of 2.490,and RPDv of 3.175.Both models exhibited RPDu values exceeding 2.5,indicating good performance.【Conclusion】NIR spectroscopy proves to be an effective method for the green,low-cost,and rapid quantitative determination of inulin and total sugar contents in the roots of TKS.
Key words:Taraxacum kok -saghyz Rodin; near -infrared spectroscopy; inulin; total sugar; rapid detection;partial least squares