關(guān)鍵詞煙草培養(yǎng)基;津巴布韋煙葉;宏基因組;優(yōu)勢微生物群落
中圖分類號 文獻(xiàn)標(biāo)識碼A
文章編號 0517-6611(2025)08-0001-06
doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2025.08.001
開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識碼(OSID):
AbstractIndetetrentifytedominantmrorganssonthelaesofZmbabweantbacctobcoompoentsaoctatios (volume fractions) of 0 % 2 . 5 % 5 . 0 % and 1 0 . 0 % were added to simulate the microbial growth environment on the surface of tobacco leaves , toscreentheoncetratooftbaccoeavessitableficoialgowthtoexploesiableobacocuemedmpreparatioodiiost analyzetheesipooffbctcatistatedf cificmicrorgansms.Thesultssowedthatorespeificmicrobalcommunitiescouldbeisolatedenthetbaccoleafculturemedimwas adjusted to at concentrations of 2 . 5 % and 5 . 0 % after sterilization.Metagenomic sequencing technology was used to determine the communitydistributionofmicrorgansmsontesufaceof tobaccoleavesin Zimbabwe.ItwasfoundtatBacilusadaighrelativeabundancin the culture medium at concentrations of 0 % , 2 . 5 % and 5 . 0 % ,and after the addition of tobacco to the culture medium,Terribacillus became the dominant species.The genera with higher relative abundance on tobacco culture medium at concentrations of 2 . 5 % and 5 . 0 % included Piscibaillu,Amplsiohd,sofateof were identified,such as Bacillus species of the genus Bacillus,Bacillus veleis and Bacillus subtilis.
Key wordsTobacco-containing medium; Zimbabwean tobacco;Metagenomics;Dominant microbial community
煙草發(fā)酵是提升煙草品質(zhì)的重要過程,未發(fā)酵的煙葉具有刺激性氣味,而發(fā)酵會改善煙葉的香氣和口感,利于制成煙草產(chǎn)品[1]。微生物在煙葉發(fā)酵過程中對于形成獨特香味具有至關(guān)重要的作用。煙草發(fā)酵過程中的微生物種類較豐富,優(yōu)勢微生物有細(xì)菌、霉菌和放線菌,細(xì)菌數(shù)量最多,霉菌數(shù)量次之[2-3]。許多研究表明,微生物在煙葉表面的生長加速了煙葉的發(fā)酵,并關(guān)聯(lián)著發(fā)酵的強度和質(zhì)量[4-6]。此外,不同產(chǎn)地的煙葉往往有不同的香氣,可能也是煙葉微生物種群間的交聯(lián)作用使得煙葉產(chǎn)生特殊增香氣味[7-9]。目前推測微生物促進(jìn)煙葉發(fā)酵的方式有: ① 微生物通過代謝煙葉中的致香物質(zhì)來改善煙葉香氣; ② 微生物自身合成分泌的酶可發(fā)酵分解煙葉中的大分子物質(zhì); ③ 微生物的代謝產(chǎn)物激活了煙葉內(nèi)的酶系統(tǒng),進(jìn)而使煙葉中的物質(zhì)組成發(fā)生變化[10-12]
津巴布韋煙葉是中式卷煙不可或缺的重要原料之一,具有油分足、香氣獨特飄逸、刺激性小等特點[13-14]。若能分離、鑒定、培養(yǎng)出特殊的增香微生物并將其添加于其他煙葉發(fā)酵過程,可顯著提高其他煙葉的增香效果,提升煙草的經(jīng)濟價值。目前,煙葉表面微生物的培養(yǎng)主要依賴于多種常規(guī)培養(yǎng)基,包括Luria-Bertani(LB)培養(yǎng)基[15]、馬鈴薯葡萄糖瓊脂(PDA)培養(yǎng)基[16-17]、營養(yǎng)肉湯(NB)培養(yǎng)基[18]、營養(yǎng)瓊脂(NA)培養(yǎng)基[19等,這些培養(yǎng)基雖然能夠提供微生物生長所需的基本營養(yǎng)物質(zhì),如碳、氮、微量元素、無機鹽和水分等,但其營養(yǎng)成分和理化性質(zhì)與煙葉表面的實際環(huán)境存在明顯差異。這種差異可能導(dǎo)致煙葉原始微生物群落的生長受到抑制,進(jìn)而影響微生物分離的特異性和代表性。為更好地模擬煙葉表面的微生態(tài)環(huán)境,研究者開發(fā)了基于煙末浸提液的培養(yǎng)基[10,20-22],但這種液態(tài)培養(yǎng)方式與煙草實際生產(chǎn)中的固態(tài)發(fā)酵過程仍存在較大差異,難以完全再現(xiàn)自然狀態(tài)下的微生物生長環(huán)境。該研究通過在LB固體培養(yǎng)基中加入破碎的煙草勻漿改良培養(yǎng)基配方,比較不同濃度煙草培養(yǎng)基及煙草培養(yǎng)基配制流程對微生物生長的影響,更好地模擬煙草表面微生物生長環(huán)境,分離獲得更為接近煙葉自然狀態(tài)中存在的微生物組分。此外,該試驗還利用宏基因組測序技術(shù),分析添加煙葉成分的培養(yǎng)基與未添加煙葉成分的培養(yǎng)基在微生物群落結(jié)構(gòu)上的差異,并通過分離鑒定獲得了優(yōu)勢菌株,為進(jìn)一步的增香種鑒定和增香物質(zhì)篩選提供數(shù)據(jù)支撐和材料。
1材料與方法
1.1 試驗材料
1.1.1試材。供試煙草品種為2019年的陳化津巴布韋煙葉#60L10,由廣東中煙工業(yè)有限公司提供
1.1.2主要試劑。胰蛋白肺(賽默飛,LP0042);酵母提取物(賽默飛, );瓊脂粉(生工生物,A505255);氯化鈉(生工生物,A501218);十二烷基硫酸鈉(生工生物,A500228)。1.1.3主要儀器。Westinghouse西屋牌破壁料理機(WFB-A617);恒溫培養(yǎng)箱(力辰科技公司,LICHENHHSH-L800);恒溫?fù)u床(艾本德,AGI26);PCR儀(賽默飛,LIFETechnolo-giesVeritiFast96)。
1.2 試驗方法
1.2.1不同比例煙葉培養(yǎng)基的制備。除去陳化煙葉的莖脈組織,稱取相應(yīng)質(zhì)量的煙葉,加入對應(yīng)體積的蒸餾水,用破壁機均勻破碎,按比例加入LB固體培養(yǎng)基其他成分,混勻后進(jìn)行滅菌,滅菌前或者滅菌后調(diào)節(jié) 至7.0左右,搖勻,倒置平板。
1.2.2煙葉表面微生物的洗脫及培養(yǎng)。稱取 煙葉,用滅菌剪刀將其剪碎之后,置于
無菌蒸餾水中,加入0 . 1 % (即
)的十二烷基硫酸鈉(SDS)均勻混合,于
的搖床中搖勻
,得到菌原液[20]。采用平板涂布法進(jìn)行涂板,取菌原液
,分3次(30、30、
)均勻涂布,將培養(yǎng)皿置于
培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)
統(tǒng)計各組的細(xì)菌菌落數(shù)量及種類。
1.2.3微生物基因組DNA的提取及宏基因組測序。收集培養(yǎng) 的各組菌落平板各9個,其中每3個平板富集的菌落為一個重復(fù),每組各設(shè)置3個重復(fù)。微生物基因組提取、PCR擴增、文庫構(gòu)建、上機測序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成,簡要過程如下:稱取
菌粉,用E.Z.N.
Mag-BindSoilDNAKit提取試劑盒(OMEGA)進(jìn)行DNA提取,檢測DNA的濃度并進(jìn)行電泳檢測DNA質(zhì)量。進(jìn)一步利用Hieff NGS @MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumi-na試劑盒構(gòu)建二代測序文庫,并在華大DNBSEQ-T7平臺上完成測序分析。
1.2.4宏基因組數(shù)據(jù)分析。宏基因組數(shù)據(jù)分析由生工生物工程(上海)股份有限公司負(fù)責(zé)。使用 vegan進(jìn)行基因組多樣性分析。使用DIAMOND將基因集蛋白序列與Nr數(shù)據(jù)庫進(jìn)行蛋白同源性比對,得到功能注釋和同源物種信息,篩選條件為
。同時根據(jù)NCBI的微生物分類學(xué)信息數(shù)據(jù)庫,獲得基因的物種分類注釋信息,并在界(Kingdom)、門(Phylum)、綱(Class)、目(Order)、科(Fami-ly)、屬(Genus)、種(Species)各個分類學(xué)水平上統(tǒng)計物種的相對豐度。使用DIAMOND將基因集蛋白序列與KEGG數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,得到序列對應(yīng)的KEGGORTHOLOGY(KO)號,根據(jù)KO與Pathway數(shù)據(jù)庫和Module數(shù)據(jù)庫的聯(lián)系得到序列的注釋信息。
1.2.5煙葉表面微生物的分離純化。挑取煙草培養(yǎng)基平板上具有不同形態(tài)特征(如菌落大小、顏色、邊緣清晰度、菌落是否黏稠等)的單菌落進(jìn)行平板劃線并培養(yǎng) ,觀察單菌落大小。
1.2.616SrDNA測序鑒定菌株。挑取針尖大小的單菌落于PCR 管中,加入 裂解液,利用PCR儀進(jìn)行裂解,程序為
。裂解完成后,進(jìn)行16SrRNA片段的PCR擴增,引物為16S-27F(
- AGAGTTTGATCCTG-GCTCAG -
)和16S-1492R(
-TACGGCTACCTTGT-TACGACTT-
)。PCR反應(yīng)體系: T a q 酶(
)
上下游引物(
各
(
模板(
)
、
(
))
,單一條帶的PCR產(chǎn)物由生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行Sanger測序。
1.2.7菌株的序列分析與保種。對分離得到菌株的測序結(jié)果與NCBI Basic Local Alignment Search Tool數(shù)據(jù)庫中的16SrDNA基因信息進(jìn)行比對,確定其物種種類。對鑒定后的菌株進(jìn)行保種,選取各菌株加至 LB培養(yǎng)液中,在
搖床中培養(yǎng)
左右,將菌種置于甘油管中,于
冰箱中保存。
1.3數(shù)據(jù)處理采用Microsoft Excel和GraphPad Prism軟件對試驗數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,包括不同濃度煙草培養(yǎng)基的菌落生長狀況的對比、不同 調(diào)節(jié)情況下培養(yǎng)基菌落生長狀況的對比、不同濃度煙草培養(yǎng)基的菌種富集情況對比。繪圖采用GraphPadPrism軟件以及Chiplot在線繪圖工具(https://www.chiplot.online/)。
2 結(jié)果與分析
2.1不同濃度煙草培養(yǎng)基的培養(yǎng)效果為評估不同濃度煙草培養(yǎng)基的培養(yǎng)效果,該研究通過菌落計數(shù)法對培養(yǎng)基表面微生物的生長情況進(jìn)行定量分析。每個濃度的平板在滅菌后調(diào)pH至7.0左右,然后涂布等體積的煙葉菌原液,在相同培養(yǎng)條件下培養(yǎng) 。結(jié)果顯示(圖1和表1),對照組培養(yǎng)基( 0 % 煙草培養(yǎng)基)的菌落數(shù)量最高,達(dá)到
。隨著培養(yǎng)基中煙葉成分的增加,菌落數(shù)量明顯下降, 2 . 5 % 煙草培養(yǎng)基的菌落數(shù)量為50CFU, 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基的菌落數(shù)量進(jìn)一步減少至
。而當(dāng)煙草培養(yǎng)基濃度達(dá)到 1 0 . 0 % 時,培養(yǎng)基表面未觀察到無肉眼可見的菌落形成。這一現(xiàn)象可能歸因于以下2個因素: ① 高濃度煙草成分可能對微生物生長產(chǎn)生抑制作用; ② 隨著煙草添加量的增加,煙葉破碎程度不足導(dǎo)致培養(yǎng)基表面形貌粗糙化,影響菌液的均勻涂布。基于上述試驗結(jié)果, 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基在保持良好表面形貌(有利于菌液均勻涂布)和適宜菌落數(shù)量(便于觀察和統(tǒng)計)方面表現(xiàn)出最佳平衡,因此被選定為后續(xù)試驗的培養(yǎng)條件。
2.2培養(yǎng)基滅菌前后調(diào)節(jié) 對煙草培養(yǎng)基培養(yǎng)效果的影響在培養(yǎng)基優(yōu)化過程中,該研究考察了
調(diào)節(jié)時機(滅菌前或滅菌后)對培養(yǎng)效果的影響。為控制試驗變量,采用0 % 煙草培養(yǎng)基作為對照,并在調(diào)節(jié)煙草培養(yǎng)基
的同時向培養(yǎng)基中加入等體積無菌水以排除操作干擾。培養(yǎng)
后,菌落計數(shù)結(jié)果顯示(圖2),在 0 % 煙草培養(yǎng)基中,滅菌前調(diào)節(jié)
組和滅菌后調(diào)節(jié)
組的菌落數(shù)量分別為99和105CFU,兩組間無顯著差異(
)。但在含煙草成分的培養(yǎng)基中觀察到顯著差異, 2 . 5 % 煙草培養(yǎng)基滅菌前和滅菌后調(diào)節(jié)pH組的菌落數(shù)量分別為 $3 3 . 4 6 ~ \mathrm { C F U } ; 5 . 0 \%$ 煙草培養(yǎng)基中,滅菌前和滅菌后調(diào)節(jié)
組的菌落數(shù)量分別為25和36CFU。統(tǒng)計分析表明, 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基中,滅菌前后調(diào)節(jié)
對菌落數(shù)量的影響均具有統(tǒng)計學(xué)顯著性(
)。上述結(jié)果表明,滅菌后調(diào)節(jié)
至7.0更有利于煙草表面微生物的生長繁殖,可獲得更優(yōu)的培養(yǎng)效果。基于此,后續(xù)試驗均采用滅菌后調(diào)節(jié)
至7.0的培養(yǎng)條件。
Fig.1Growth statusand morphologyof bacterial colonies onthesurface of diferentconcentration tobacco culture media
注: 0
2.3煙草表面微生物在屬和種水平上的豐度分析為整合各組重復(fù)間的所有菌落基因信息,將3次重復(fù)的測序結(jié)果整合,總共分為3組 ( 0 % , 2 . 5 % , 5 . 0 % )。對測序所得原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾,過濾后數(shù)據(jù)占樣本所有數(shù)據(jù)比例超過 9 9 % ,堿基質(zhì)量在Q20以上的比例超過 9 8 % ,堿基質(zhì)量在Q30以上的比例超過 94 % ,說明數(shù)據(jù)可靠,可用于后續(xù)分析??傮w來看,3種培養(yǎng)基平板上生長的微生物基本為細(xì)菌,真菌的豐度很低,基本可以忽略不計,因此推測增香種大概率為細(xì)菌。該研究選取屬水平和種水平對不同濃度煙草培養(yǎng)基表面細(xì)菌微生物進(jìn)行分析。
圖3A展示了基于屬水平分類的各組培養(yǎng)基微生物群落相對豐度分布。通過比較3種不同濃度煙草培養(yǎng)基的微生物組成,可以觀察到明顯的群落結(jié)構(gòu)差異。從整體群落組成來看,芽孢桿菌屬(Bacilus)在3種煙草培養(yǎng)基中均表現(xiàn)出最高的相對豐度,表明該屬微生物對培養(yǎng)基環(huán)境具有廣泛的適應(yīng)性。值得注意的是,對照組( 0 % 煙草培養(yǎng)基)中相對豐度次高的類群為普里斯特氏菌屬(Priestia),而在 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基組中,土地芽孢桿菌屬(Terribacillus)取代普里斯特氏菌屬成為第二優(yōu)勢菌群。不同培養(yǎng)基上相對豐度第二高的屬的差異也說明煙草培養(yǎng)基具有較好的篩選作用,在一定程度上抑制了普里斯特氏菌屬菌種的生長,更利于土地芽孢桿菌屬菌種的繁殖,因此土地芽孢桿菌屬中極大可能包含著增香種。而芽孢桿菌屬作為相對豐度最高的優(yōu)勢菌群,即使添加了煙草成分依舊不會影響其生長,其中必然存在著與煙草發(fā)酵密切相關(guān)的菌種,因此也可能從中找到增香種
圖3B是以種為分類單位展示了3種煙草培養(yǎng)基上各微生物的相對豐度。其中,沙福芽孢桿菌(Bacillussafensis)在0 % 煙草培養(yǎng)基中相對豐度最高,但隨著煙草成分的增加,其相對豐度不斷下降,在 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基中相對豐度已很少,說明煙草成分的加入反而使其生長受到抑制。在培養(yǎng)基中添加煙草成分后相對豐度下降的菌種還有巨大普里斯特氏菌(Priestiamegaterium)短小芽孢桿菌(Bacilluspumilus)。未分類的芽孢桿菌(unclassifiedBacillusspecies)在各個培養(yǎng)基中的相對豐度則基本相同,說明煙草成分的加入不會影響它的生長。而枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)、貝萊斯芽孢桿菌(Bacillusvelezensis)解淀粉芽孢桿菌(Bacillusamylolique-faciens)和嗜鹽土地芽孢桿菌(Terribacillushalophilus)在煙草培養(yǎng)基上的相對豐度有明顯提升,說明它們更適應(yīng)煙草培養(yǎng)基環(huán)境。
除此之外,在 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基中,毛竹林土地芽孢桿菌(Terribacillusgoriensis)嗜糖土地芽孢桿菌(Terribacil-lussaccharophilus)、特基拉芽孢桿菌(Bacillustequilensis)、
7520-G土地芽孢桿菌(Terribacillussp.7520-G)得到了富集,相對豐度都有一定的上升,也是潛在的可培育優(yōu)勢種,其中可能也包含著使津巴布韋煙葉具有特殊香氣的增香種。
2.4煙草培養(yǎng)基特有微生物在屬和種水平上的數(shù)量分析通過宏基因組測序可探究煙草表面微生物的群落分布特征,發(fā)現(xiàn)并鑒定出其中相對豐度較高的微生物種類,并且可通過橫向比較不同濃度煙草培養(yǎng)基上微生物的群落分布狀況和優(yōu)勢種差異,為增香種的分離純化提供理論依據(jù)。如表2所示,宏基因組測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)部分微生物種屬只存在于2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基,說明煙草培養(yǎng)基篩選培育出了部分不能在LB固體培養(yǎng)基上生存的津巴布韋煙葉表面微生物。其中在 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基上相對豐度較高的屬有魚芽孢桿菌屬(Piscibacillus)雙芽孢桿菌屬(Amphibacillus)、Margalitia等。并且 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基分別存在特有的微生物種屬。相比 2 . 5 % 煙草培養(yǎng)基, 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基特有的菌種更多。 2 . 5 % 煙草培養(yǎng)基中特有的微生物在屬水平上的個數(shù)為4個,而 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基特有菌種在屬水平上的個數(shù)可達(dá)44個(圖4)。但這些煙草培養(yǎng)基中特有菌種的相對豐度往往較低, 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基是否具有更高的群落多樣性仍需要更進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析。
進(jìn)一步對 2 . 5 % 煙草培養(yǎng)基( 2 . 5 % 組和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基( 5 . 0 % 組)特有與對照組( 0 % 煙草培養(yǎng)基)的菌種進(jìn)行分析。如表2所示, 2 . 5 % 組和 5 . 0 % 組共同特有的菌種包括Ba-cillaceae bacterium SAS-127 、Cohnella abietis、Oceanobacillus sp.Castelsardo等共57種。 2 . 5 % 組中特有的菌種有某種未分類的嗜鹽芽孢桿菌(unclassified Halobacillus species)泛酸枝芽胞桿菌(Virgibacilluspantothenticus)Alkalihalobacillusalcalo-philus等共33種。 5 . 0 % 組中特有的相對豐度較高的菌種有PenicilliumbrasilianumPenicilliumsubrubescensPenicilliumde-cumbens等共231種。因此,種水平上的結(jié)果與屬水平上的相似,同樣是 5 . 0 % 組存在更多特有菌種。但各組獨有的種相對豐度依舊不高,在 0 . 1 % 左右。
Fig.4Venn diagram of species number on diferent concentration tobaco media at genus (A)and species (B)levels
2.5煙草表面相對豐度較高微生物的分離鑒定通過宏基 因組數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),部分菌種在添加了煙葉成分的煙草培養(yǎng)
基中有更好的生長狀況,而這些被煙草培養(yǎng)基成功富集的菌種也可能是潛在的增香種。盡管不是每種被富集的菌種都可以被培養(yǎng),但是相對豐度高的富集菌種中也大概率存在增香種。為了進(jìn)一步鑒定具體的菌落種屬,從煙草培養(yǎng)基中挑取并分離純化出單菌落,再對單菌落進(jìn)行16SrDNA序列擴增和測序分析。
表3顯示的是目前已分離純化并且鑒定出的菌種,一共有15種。其中包括了多種在3種培養(yǎng)基中都有較高相對豐度的菌種,如芽孢桿菌、貝萊斯芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌等。同時,也鑒定出了部分在煙草培養(yǎng)基中生長狀態(tài)良好、相對豐度較 0 % 組有所增加的細(xì)菌,如解淀粉芽孢桿菌和嗜鹽土地芽孢桿菌。而土地芽孢桿菌屬在煙草培養(yǎng)基上微生物群落中的相對豐度有明顯上升,也成功挑取鑒定出了4種土地芽孢桿菌屬的菌種。
3討論
上述研究表明,培養(yǎng)基中煙草成分的添加量在 2 . 5 % 和5 . 0 % 會有較好的培養(yǎng)效果,而添加量達(dá)到 1 0 . 0 % 時,在表面無法形成菌落;其原因可能是添加煙草成分會降低培養(yǎng)基pH(煙草的 普遍在
,普通的LB 固體培養(yǎng)基
為7.0左右),最終導(dǎo)致
過低而不適宜微生物生長。在滅菌后將培養(yǎng)基的
統(tǒng)一調(diào)至 7 . 0 , 1 0 . 0 % 煙草培養(yǎng)基可能也會因煙葉破碎釋放出的有毒物質(zhì)濃度過高,從而抑制微生物的生長,表現(xiàn)出很不理想的菌落生長效果。此外, 1 0 . 0 % 煙草培養(yǎng)基因加入煙草量過多,不能很好地將煙葉破壁成細(xì)小的顆粒,導(dǎo)致培養(yǎng)基表面凹凸不平,不利于菌液的涂布和菌落的生長??偠灾囵B(yǎng)基中煙葉添加量在 2 . 5 % 和 5 . 0 % 是有較好的培養(yǎng)效果,但煙草濃度為 5 % ~ 1 0 % 的煙草培養(yǎng)基是否能培育出具有更高的多樣性群落還需進(jìn)一步的試驗驗證。對于培養(yǎng)基配制過程中因
調(diào)節(jié)操作在滅菌前還是滅菌后的順序產(chǎn)生的培養(yǎng)效果差異,可能是煙葉中的某些成分在高壓蒸汽滅菌過程中發(fā)生了反應(yīng)變化,導(dǎo)致原本調(diào)節(jié)至
的培養(yǎng)基pH又產(chǎn)生了變化,使得培養(yǎng)效果下降;另一種可能是預(yù)先將pH調(diào)至7.0,可能為煙草中某些成分的反應(yīng)提供了條件,在高溫作用下發(fā)生反應(yīng),使得部分營養(yǎng)物質(zhì)被消耗,最終的煙草培養(yǎng)基成分發(fā)生改變。而具體的原因需要進(jìn)一步的試驗證明。
宏基因組測序分析結(jié)果顯示,在3種不同濃度煙草培養(yǎng)基中,芽孢桿菌屬(Bacillus)均為相對豐度最高的菌屬,這一發(fā)現(xiàn)與韓錦峰等[3和邱立友等[2的研究結(jié)果一致。然而,在次優(yōu)勢菌屬方面,該研究結(jié)果與先前研究存在差異,在該研究中, 2 . 5 % 和 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基的次優(yōu)勢菌屬為土地芽孢桿菌屬(Terribacillus), 0 % 煙草培養(yǎng)基的次優(yōu)勢菌屬為普里斯特氏菌屬(Priestia);相比之下,韓錦峰等[3]和邱立友等[24]的研究中次優(yōu)勢菌屬為梭狀芽孢桿菌屬(Clostridium)或芽孢乳桿菌屬(Sporolactobacillus)。這種差異可能源于研究所用煙葉品種的不同,韓錦峰等使用的是河南省的NC89品種煙葉,邱立友使用的是來自不同產(chǎn)地的紅大、NC89和 也有研究表明,不同品種煙葉的表面微生物群落組成存在顯著差異[20,25],這可能是導(dǎo)致研究結(jié)果不一致的主要原因。上述結(jié)果均證明,使用津巴布韋煙草培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),對于篩選煙葉表面特有微生物是可行的。此外,新型煙草培養(yǎng)基能夠篩選出某些在LB固體培養(yǎng)基上無法生存的菌種,但其相對豐度均不高。其中可能的原因有: ① 那些被篩選出的菌種在煙葉表面的含量較少,在煙葉發(fā)酵過程中作用較為有限;② 煙草培養(yǎng)基中煙葉成分的配比仍不夠理想,使得某些菌株在培養(yǎng)基上生長緩慢。值得注意的是, 5 . 0 % 組中前3個相對豐度較高的菌種皆為青霉菌屬的真菌,而不是細(xì)菌,且在界水平上 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基上生長有古菌,表現(xiàn)出 5 . 0 % 煙草培養(yǎng)基上微生物種類的廣度,其中涵蓋的微生物種類較大。
該試驗還對部分煙草表面微生物進(jìn)行了分離純化和鑒定操作,最終鑒定得到15種菌株。其中涵蓋了大部分的優(yōu)勢種和煙草培養(yǎng)基中的富集種,也可能包含煙草增香種。參考殷爽等[20的研究結(jié)果,該試驗也分離得到了枯草芽孢桿菌,但大多數(shù)分離得到的菌種都不太相同,可能是因為煙葉種類不同。雖然趙銘欽[\"]的研究結(jié)果中分離得到不少芽孢桿菌屬的菌種,但與該試驗的分離結(jié)果相同的菌種也只有枯草芽孢桿菌。而使用同種津巴布韋煙葉且對煙葉表面微生物種進(jìn)行分離和鑒定的研究仍較少,因此無法參考比較。此外該試驗篩選分離操作是在煙草培養(yǎng)基上進(jìn)行的,也會對菌種分離鑒定結(jié)果造成一定影響。試驗結(jié)果中分離得到的菌種后續(xù)可繼續(xù)進(jìn)行發(fā)酵檢測,進(jìn)一步驗證其在煙葉物質(zhì)轉(zhuǎn)變中的作用,后續(xù)也應(yīng)分離出更多種類的煙葉表面微生物,并對其進(jìn)行發(fā)酵檢測嘗試找出增香種。總之,該研究結(jié)合宏基因組測序和微生物分離得到的不同組別的菌群分布差異和優(yōu)勢菌種可為后續(xù)煙草增香種的分離純化試驗提供有力的數(shù)據(jù)支撐和理論依據(jù)。
4結(jié)論
在LB固體培養(yǎng)基中添加濃度為 2 . 5 % 和 5 . 0 % 的煙草成分具有較好的微生物培養(yǎng)效果,在擁有良好的表面形貌的同時,有較好的菌落生長狀況。將調(diào)節(jié) 步驟放至滅菌操作后制成的煙草培養(yǎng)基,比滅菌操作前調(diào)節(jié)
制成的煙草培養(yǎng)基有更好的培養(yǎng)效果。宏基因組測序結(jié)果也說明津巴布韋煙葉表面的微生物主要是細(xì)菌,優(yōu)勢屬為芽孢桿菌屬。此外,土地芽孢桿菌屬在煙草培養(yǎng)基上得到了富集。非煙草培養(yǎng)基和煙草培養(yǎng)基上菌群種類的差異說明煙草培養(yǎng)基具有一定的篩選作用,能篩選出部分LB固體培養(yǎng)基無法培養(yǎng)的菌種。進(jìn)一步通過單菌落分離純化和16SrDNA測序,鑒定出15種煙葉表面優(yōu)勢微生物,如芽孢桿菌屬的芽孢桿菌、貝萊斯芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌等。
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