摘要:研究發(fā)現(xiàn)異源表達(dá)擬南芥(Arabidopsis thaliana)QQS基因可顯著提高紫花苜蓿的抗逆性,而MsNF-YB5是其發(fā)揮功能的關(guān)鍵內(nèi)源基因。為探究MsNF-YB5在紫花苜蓿(Medicago sativa"L.)脅迫響應(yīng)過程中的功能,本研究克隆并完成了MsNF-YB5的生物信息學(xué)分析、亞細(xì)胞定位、轉(zhuǎn)錄自激活檢測及脅迫下的表達(dá)模式分析。結(jié)果顯示,克隆獲得的MsNF-YB5"cDNA編碼156個氨基酸,與蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)MtNF-YB5相似度最高,該基因啟動子區(qū)域含有參與茉莉酸甲酯、脫落酸、防御與脅迫反應(yīng)的順式作用元件;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示其具有細(xì)胞核定位,截短N端后具有酵母轉(zhuǎn)錄自激活活性。MsNF-YB5受鹽脅迫、滲透脅迫、低氮脅迫、冷脅迫及脫落酸處理誘導(dǎo)表達(dá)。本研究為進(jìn)一步研究MsNF-YB5功能以提高紫花苜??鼓嫘蕴峁┝嘶A(chǔ)。
關(guān)鍵詞:紫花苜蓿;MsNF-YB5;亞細(xì)胞定位;自激活活性;脅迫表達(dá)模式
中圖分類號:S541.9 """""""文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A """""""文章編號:1007-0435(2025)03-0686-10
Cloning and Expression Analysis of MsNF-YB5"in Alfalfa
WANG Zhi-jie,"ZHANG Wan-jun*
(College of Grassland Science and Technology,"China Agricultural University,"Beijing 100193,"China)
Abstract:Our previous research has demonstrated that the heterologous expression of the QQS"gene from Arabidopsis thaliana"significantly enhances the stress resistance of alfalfa (Medicago sativa L.),"and MsNF-YB5"is identified as a critical endogenous gene contributing to this effect. To elucidate the role of MsNF-YB5"in the stress response of alfalfa,"we cloned the MsNF-YB5"gene and conducted a comprehensive bioinformatics analysis,"subcellular localization studies,"transcriptional self-activation assessments,"and expression pattern analyses under various stress conditions. The findings revealed that the cloned MsNF-YB5"cDNA encoded a protein consisting of 156 amino acids,"exhibiting the highest similarity to MtNF-YB5 from Medicago truncatula. The promoter region of this gene contained cis-acting elements associated with methyl jasmonate,"abscisic acid,"and the responses to defense and stress. Subcellular localization studies indicated that the protein was localized in the nucleus,"and exhibited yeast transcriptional self-activation activity,"which was only observed following truncation of the N-terminus. Furthermore,"MsNF-YB5 expression was found to be upregulated under salt stress,"PEG treatment,"abscisic acid (ABA)"treatment,"low nitrogen availability and cold stress. This study established a foundation for further investigation into the role of MsNF-YB5"in enhancing the stress resistance of alfalfa.
Key words:Alfalfa;MsNF-YB5;Subcellular localization;Self-activation activity;Stress expression
紫花苜蓿(Medicago sativa"L.)是世界上重要的豆科牧草,具有粗蛋白含量高、產(chǎn)量高、適口性好等優(yōu)點,有“牧草之王”的美稱。我國的苜蓿種植區(qū)主要集中于東北、華北、西北地區(qū),干旱、土壤貧瘠、鹽堿、寒冷等非生物因素嚴(yán)重制約著我國苜蓿的產(chǎn)量和品質(zhì)[1-2]。植物在進(jìn)化過程中為應(yīng)對各種非生物脅迫,形成了復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),因此深入了解紫花苜蓿脅迫響應(yīng)分子機制,挖掘重要調(diào)控基因,對紫花苜蓿的遺傳改良具有重要意義。
轉(zhuǎn)錄因子是植物生長發(fā)育和逆境響應(yīng)的重要調(diào)節(jié)因子[3]。核因子Y(Nuclear factor-Y,NF-Y)是廣泛存在于各種真核生物中的一類轉(zhuǎn)錄因子,分為NF-YA,NF-YB和NF-YC 三種亞基,三種亞基之間可形成異源三聚體,特異性識別結(jié)合啟動子和增強子上的CCAAT-box,從而調(diào)控下游基因的表達(dá),因此NF-Y又被稱為CCAAT結(jié)合因子(CCAAT-binding factor,"CBF)[4]。研究表明,NF-Ys在調(diào)節(jié)植物的脅迫應(yīng)答進(jìn)程中具有重要作用。例如,玉米(Zea mays L.)ZmNF-YA1與ZmNF-YB16和ZmNF-YC17形成三聚體調(diào)控下游基因表達(dá),提高了玉米的耐旱性和耐鹽性[5];水稻(Oryza sativa L.)OsNF-YC5影響ABA依賴性和非依賴性途徑負(fù)調(diào)控水稻耐鹽性[6];StNF-YC9通過提高光合作用速率、抗氧化酶活性和脯氨酸積累,增強了馬鈴薯(Solanum tuberosum"L.)的耐旱性[7];MsNF-YC2受到干旱、鹽堿等多種非生物脅迫的誘導(dǎo),過表達(dá)MsNF-YC2基因增強了紫花苜蓿的堿適應(yīng)能力[8]。
AtQQS是僅在擬南芥中存在的孤兒基因,研究表明其在調(diào)節(jié)碳氮平衡、抗逆性等方面發(fā)揮重要作用,異源表達(dá)該基因可以顯著的提高土豆、煙草的蛋白質(zhì)含量和生物脅迫抗性[9-11]。研究發(fā)現(xiàn)異源表達(dá)AtQQS基因可以顯著提高紫花苜蓿的抗逆性[12],而MsNF-YB5的表達(dá)量在轉(zhuǎn)基因植株中顯著提高,推測其可能是紫花苜蓿植株抗逆性響應(yīng)的重要調(diào)節(jié)基因。因此,為進(jìn)一步揭示其功能,本研究克隆了紫花苜蓿MsNF-YB5基因并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析、亞細(xì)胞定位、轉(zhuǎn)錄自激活檢測及非生物脅迫下的表達(dá)模式分析,為MsNF-YB5轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能研究及紫花苜蓿的遺傳改良提供了基因資源和理論參考。
1 材料與方法
1.1 試驗材料
試驗所用的紫花苜蓿品種為‘中苜1號’,煙草(Nicotiana benthamiana L.)為本氏煙草。
1.2 試驗方法
1.2.1 引物設(shè)計 依據(jù)已公布的紫花苜蓿‘新疆大葉’的參考基因組序列設(shè)計引物(如表1),其中MsNF-YB5-F/R用于MsNF-YB5基因克?。籅D-NF-YB5-F和BD-NF-YB5-R 用于pGBKT7-MsNF-YB5載體構(gòu)建;BD-MsNFYB5-C-F與BD-MsNFYB5-N-R用于pGBKT7-MsNF-YB5-?N,pGBKT7-MsNF-YB5-ΔC和pGBKT7-MsNF-YB5-Min載體的構(gòu)建;B5-GFP-XbaI-F和B5-GFP-HindIII-R用于pCGW-MsNF-YB5-GFP 載體構(gòu)建;Actin-qPCR-F/R和MsNFYB5-qPCR-F/R分別用于內(nèi)參基因Actin及目的基因MsNF-YB5熒光定量PCR檢測。
1.2.2 MsNF-YB5基因克隆 選取生長狀態(tài)良好的紫花苜蓿葉片,采用Trizol法提取葉片總RNA,依據(jù)試劑盒(TaKaRa,貨號RR037A)方法反轉(zhuǎn)錄得到cDNA。以引物MsNF-YB5-F和MsNF-YB5-R為引物對cDNA進(jìn)行擴增,擴增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,分離純化后回收,回收產(chǎn)物連接克隆載體,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α中,轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌送至生工生物工程有限公司測序鑒定,鑒定正確的菌液,提取質(zhì)粒,保存菌液。
1.2.3 MsNF-YB5的生物信息學(xué)分析 對MsNF-YB5的蛋白序列保守結(jié)構(gòu)域(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/)、一級結(jié)構(gòu)及親/疏水性(https://web.expasy.org/protparam/)、二級結(jié)構(gòu)(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)、三級結(jié)構(gòu)(https://swissmodel.expasy.org/)、跨膜結(jié)構(gòu)(https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?TMHMM-2.0)及信號肽(https://dtu.biolib.com/SignalP-6)進(jìn)行預(yù)測分析。
1.2.4 pCGW-MsNF-YB5-GFP載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位 以B5-GFP-XbaI-F和B5-GFP-HindIII-R為引物對cDNA進(jìn)行擴增,將反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳純化回收,回收產(chǎn)物和表達(dá)載體pCGW雙酶切后連接為pCGW-MsNF-YB5-GFP融合表達(dá)載體,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α中,提取測序鑒定正確菌株的質(zhì)粒,轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101(P19)中,菌株經(jīng)PCR鑒定后保存菌液。將保存的菌液與含有細(xì)胞膜標(biāo)記(CBL)、細(xì)胞核標(biāo)記(AT-hook)的菌株在酵母提取物蛋白胨肉湯(Yeast extract peptone broth medium,YEP)培養(yǎng)基(10 g·L-1"酵母提取物,10 g·L-1"NaCl,5 g·L-1胰蛋白胨,滅菌后添加50 mg·L-1卡那霉素和50 mg·L-1利福平)中培養(yǎng)至菌液OD600為0.6~0.8,5000 r·min-1離心5 min收集菌體,使用重懸液[10 mmol·L-1"MgCl2,10 mmol·L-1"MES(2-嗎啉乙磺酸),200 μmol·L-1乙酰丁香酮]重懸至OD600為0.6~0.8,三種菌液1∶1∶1混合后室溫放置1~2小時,后將農(nóng)桿菌注入生長健康的煙草葉片,避光環(huán)境下放置2~3 h,48~72 h內(nèi)在激光共聚焦顯微鏡(Nikon A1 HD25)觀察綠色熒光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)信號在細(xì)胞中的表達(dá)情況。
1.2.5 MsNF-YB5蛋白酵母自激活檢測 以BD-NF-YB5-F和BD-NF-YB5-R為引物對目的基因進(jìn)行擴增,反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖電泳后純化回收。將回收產(chǎn)物和表達(dá)載體pGBKT7雙酶切后連接為pGBKT7-MsNF-YB5載體,后轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α中,測序鑒定后提取質(zhì)粒轉(zhuǎn)入酵母AH109中,涂布SD-T篩選平板,30℃倒置培養(yǎng)3 d。挑取直徑1~2 mm的陽性菌斑溶于30 μL無菌水中即為酵母菌液,將菌液稀釋10倍、100倍,吸取酵母菌液和其稀釋液各6 μL,分別點斑于SD/-Trp,SD/-Trp/-His和SD/-Trp/-His/-Ade固體培養(yǎng)基,倒置于30℃培養(yǎng)箱中2~3 d,觀察酵母菌生長狀況并使用X-α-gal染色。
1.2.6 轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域分析 依據(jù)保守結(jié)構(gòu)域,以BD-NF-YB5-F,BD-NF-YB5-R,BD-MsNFYB5-C-F,BD-MsNFYB5-N-R為引物,將MsNF-YB5蛋白10~156氨基酸序列構(gòu)建為pGBKT7-MsNF-YB5-ΔN載體,將1~140氨基酸序列構(gòu)建為pGBKT7-MsNF-YB5-ΔC載體,將10~140氨基酸序列構(gòu)建為pGBKT7-MsNF-YB5-Min載體(圖4B),后轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α中,測序鑒定后提取質(zhì)粒轉(zhuǎn)入酵母AH109中,涂布SD-T篩選平板,30℃倒置培養(yǎng)3 d。挑取直徑1~2 mm的陽性菌斑溶于30 μL無菌水中即為酵母菌液,將菌液稀釋10倍、100倍、1000倍,吸取酵母菌液和其稀釋液各6 μL,分別點斑于SD/-Trp和SD/-Trp/-His固體培養(yǎng)基,倒置于30℃培養(yǎng)箱中2~3 d,觀察酵母菌生長狀況并使用X-α-gal染色。
1.2.7 MsNF-YB家族進(jìn)化分析及關(guān)鍵順式作用元件預(yù)測 從紫花苜蓿‘新疆大葉’的參考基因組[13]數(shù)據(jù)庫中提取MsNF-YB基因家族的氨基酸序列,擬南芥、大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿的NF-YBs氨基酸序列來自plantTFDB(https://planttf-db.gao-lab.org/),采用最大似然法(MEGA11)對紫花苜蓿MsNF-YB基因家族進(jìn)行蛋白進(jìn)化分析。在紫花苜?!陆笕~’基因組數(shù)據(jù)庫中選取MsNF-YBs基因起始密碼ATG上游2 kb序列,使用PlantCARE在線軟件(https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)預(yù)測啟動子的順式作用元件及功能。
1.2.8 脅迫下表達(dá)模式分析 為探究MsNF-YB5在聚乙二醇(Polyethylene glycol,"PEG)、低氮、NaCl、寒冷脅迫和脫落酸(Abscisic acid,ABA)處理條件下的表達(dá)情況,以扦插生長2個月的‘中苜1號’紫花苜蓿植株為材料,分別置于添加250 mmol·L-1"NaCl的0.1×霍格蘭溶液、添加"20 μmol·L-1"ABA的0.1×霍格蘭溶液、添加0.36 mmol·L-1"KNO3的無氮營養(yǎng)液中、添加15% PEG6000的0.1×霍格蘭溶液中,在組培室條件(26℃ 16 h 5000 lx光照/8 h黑暗,相對濕度50%~60%)培養(yǎng)24 h,對于0℃處理,以生長于混合土(營養(yǎng)土∶蛭石∶黑土=1∶1∶1)中的植株為材料,置于溫室生長2個月后,放置于0℃培養(yǎng)箱中,分別在處理第0 h,1 h,3 h,6 h,12 h,24 h時收取植株頂端第2,3葉或根尖向上5 cm根系樣品。每個處理設(shè)置3個重復(fù),分別提取葉片和根系樣品總RNA反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行熒光定量檢測,以紫花苜蓿Actin基因作為內(nèi)參基因,計算MsNF-YB5基因的相對表達(dá)量,分析其表達(dá)模式。
2 結(jié)果與分析
2.1 MsNF-YB5基因的克隆
以MsNF-YB5-F和MsNF-YB5-R為引物,以‘中苜1號’cDNA為模板,進(jìn)"PCR擴增,獲得特異性條帶。將PCR產(chǎn)物回收測序獲得的序列與"MsNF-YB5核苷酸序列(MS.gene033001)進(jìn)行比對,序列相似度為97%,其編碼序列(Coding sequence,CDS)長度為471 bp(圖1)。
2.2 生物信息學(xué)分析
克隆所獲MsNF-YB5基因共編碼156個氨基酸,保守結(jié)構(gòu)預(yù)測分析顯示MsNF-YB5屬于HFD-Dr1超家族(圖2A),其蛋白分子式為C752H1219N209O246S11,分子量為17 476.86 Da,帶負(fù)電的殘基總數(shù)為28,帶正電的殘基總數(shù)為19,理論等電點為4.80,親水性總平均值為-0.537,推測為親水蛋白。無跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽,推測其不屬于膜蛋白或分泌蛋白。蛋白二級結(jié)構(gòu)主要以α螺旋為主,占比為63.46%,其次為無規(guī)則卷曲,占比30.77%,延伸鏈和β轉(zhuǎn)角占比分別為3.21%和2.56%(圖2B)。
2.3 亞細(xì)胞定位
使用轉(zhuǎn)入pCGW-MsNF-YB5-GFP載體的GV3101(P19)菌液侵染煙草葉片細(xì)胞,轉(zhuǎn)入pCGW-GFP載體的GV3101(P19)菌液的葉片細(xì)胞為正對照,激光共聚焦顯微鏡下觀察GFP表達(dá)情況。結(jié)果顯示,MsNF-YB5-GFP在細(xì)胞核與核定位標(biāo)記蛋白表達(dá)位置重疊,證明MsNF-YB5蛋白在煙草細(xì)胞中具有核定位,除此之外,MsNF-YB5-GFP在核外部位也具有表達(dá)信號。
2.4 轉(zhuǎn)錄激活活性分析
使用轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsNF-YB5載體的AH109酵母菌株檢測MsNF-YB5蛋白的轉(zhuǎn)錄自激活性,以轉(zhuǎn)入pGBKT7載體酵母菌作為負(fù)對照,以前期驗證具有激活性的轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsSPL12載體的酵母菌[14]作為正對照。結(jié)果顯示(圖4A),轉(zhuǎn)入三種質(zhì)粒的酵母菌在SD/-Trp培養(yǎng)基上生長正常,并在X-α-gal染色后呈現(xiàn)為藍(lán)色,證明載體成功在酵母菌中表達(dá);在SD/-Trp/-His培養(yǎng)基上三種表達(dá)載體的酵母菌生長受抑制,在SD/-Trp/-His/-Ade培養(yǎng)基上轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsNF-YB5載體和pGBKT7的酵母菌無法生長,而轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsSPL12載體的酵母菌仍可生長,以上結(jié)果表明MsNF-YB5全長序列無轉(zhuǎn)錄自激活活性。
為了進(jìn)一步驗證以上結(jié)果,依據(jù)MsNF-YB5蛋白的保守結(jié)構(gòu)域,分別使用轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsNF-YB5、pGBKT7-MsNF-YB5-ΔN,pGBKT7-MsNF-YB5-ΔC,pGBKT7-MsNF-YB5-Min載體的AH109酵母菌株檢測MsNF-YB5蛋白的轉(zhuǎn)錄自激活性,以轉(zhuǎn)入pGBKT7載體酵母菌作為對照。結(jié)果顯示(圖4B),轉(zhuǎn)入5種質(zhì)粒的酵母菌在SD/-Trp培養(yǎng)基上生長正常,并在X-α-gal染色后呈現(xiàn)為藍(lán)色,證明載體成功在酵母菌中表達(dá);在SD/-Trp/-His培養(yǎng)基上,轉(zhuǎn)入pGBKT7-MsNF-YB5-ΔN載體的酵母菌正常生長,而其余四種表達(dá)載體的酵母菌生長均受到抑制。以上結(jié)果表明,MsNF-YB5全長序列無轉(zhuǎn)錄自激活活性,而截去N端后具有轉(zhuǎn)錄自激活活性。
2.5 MsNF-YB5蛋白進(jìn)化與啟動子元件分析
為了研究MsNF-YB5在不同物種中的進(jìn)化關(guān)系,預(yù)測其功能,以紫花苜蓿、擬南芥、大豆和蒺藜苜蓿的NF-YB蛋白序列構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,并預(yù)測了紫花苜蓿NF-YB基因家族部分關(guān)鍵啟動子順式作用元件。結(jié)果顯示,紫花苜蓿的NF-YB家族共26個基因,可分為三個亞族:"LEC,Non-LEC,Dr1-like(圖5A),啟動子區(qū)域含有較多的CGTCA-motif(參與茉莉酸甲酯反應(yīng))、ABRE(參與脫落酸反應(yīng))和O2-site(參與玉米醇溶蛋白代謝調(diào)節(jié))元件(圖5B)。MsNF-YB5(MS.gene033001)屬于Dr1-like亞族,與蒺藜苜蓿MtNF-YB5最為接近,啟動子區(qū)域含有O2-site,ABRE,CGTCA-motif,TC-rich repeats(參與防御和應(yīng)激反應(yīng)),TCA-element(參與水楊酸反應(yīng))等元件,推測其在植物的防御與脅迫響應(yīng)中發(fā)揮重要作用。
2.6 脅迫表達(dá)模式分析
為進(jìn)一步預(yù)測MsNF-YB5的功能,分別檢測了MsNF-YB5在不同條件(鹽脅迫、滲透脅迫、低氮脅迫、冷脅迫和ABA處理)下的表達(dá)模式。結(jié)果顯示(圖6),MsNF-YB5的表達(dá)顯著受鹽脅迫誘導(dǎo),250 mmol·L-1"NaCl處理0~12 h期間,MsNF-YB5表達(dá)量持續(xù)升高,在12 h時達(dá)到峰值,為處理前54倍,在處理24 h后MsNF-YB5的表達(dá)量雖有下降但仍顯著高于處理前水平(Plt;0.05)。滲透脅迫也可誘導(dǎo)MsNF-YB5的表達(dá),15% PEG6000處理后,MsNF-YB5的表達(dá)量在24 h內(nèi)持續(xù)上升,達(dá)到處理前的6.5倍;20 μmol·L-1"ABA處理下葉片中MsNF-YB5的表達(dá)量持續(xù)上升,根中呈先升高后下降再升高的趨勢。此外,MsNF-YB5還可能參與低氮脅迫和冷脅迫的響應(yīng)過程,在0.36 mmol·L-1"KNO3和0℃處理下,MsNF-YB5表達(dá)量在24 h時同比處理前表達(dá)量顯著增多(Plt;0.05)。以上結(jié)果說明MsNF-YB5可能參與調(diào)控鹽脅迫、滲透脅迫、低溫脅迫、低氮脅迫和ABA的響應(yīng)過程。
3 討論
轉(zhuǎn)錄因子是植物生長過程中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,被認(rèn)為是細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和基因調(diào)控之間的橋梁,典型的轉(zhuǎn)錄因子一般具有4個功能結(jié)構(gòu)域,即特異性結(jié)合順式作用元件的DNA結(jié)合域(DNA-binding domain)、激活或抑制靶基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控結(jié)構(gòu)域(Transcription regulation domain)、控制轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)核過程的核定位信號區(qū)(Nuclear location signal)和不同轉(zhuǎn)錄因子間發(fā)生相互作用的功能域寡聚化位點區(qū)(Oligomerization site)[15],轉(zhuǎn)錄因子通過這些功能結(jié)構(gòu)域與靶基因啟動子的順式元件相互作用或與其他蛋白質(zhì)相互結(jié)合,調(diào)節(jié)下游基因的轉(zhuǎn)錄過程,進(jìn)而影響植物的生長發(fā)育和脅迫響應(yīng)[16]。大部分的轉(zhuǎn)錄因子具備轉(zhuǎn)錄激活活性,但是有些轉(zhuǎn)錄因子內(nèi)部存在抑制結(jié)構(gòu)域或缺少激活結(jié)構(gòu),導(dǎo)致其全長或單獨存在時并不具有轉(zhuǎn)錄激活活性。例如,大豆的GmNAC20具有一個轉(zhuǎn)錄活性抑制結(jié)構(gòu)域,導(dǎo)致其全長序列無轉(zhuǎn)錄激活活性,但GmNAC20的羧基末端結(jié)構(gòu)域具有較高的轉(zhuǎn)錄激活活性[17];小麥中B基因并不具有激活結(jié)構(gòu)域,但其氨基末端結(jié)構(gòu)域可以與C1基因相互作用招募轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域,從而激活下游基因轉(zhuǎn)錄[18]。本研究克隆獲得的MsNF-YB5蛋白截短N端后具有轉(zhuǎn)錄自激活性,推測其N末端存在轉(zhuǎn)錄抑制結(jié)構(gòu)域。轉(zhuǎn)錄因子的亞細(xì)胞定位通常定位于細(xì)胞核中,然而一些轉(zhuǎn)錄因子也可以在細(xì)胞膜或細(xì)胞壁中發(fā)揮功能。例如,紫花苜蓿MsMYB58基因定位于細(xì)胞核、細(xì)胞壁及細(xì)胞膜中[19]。也有研究表明,部分轉(zhuǎn)錄因子儲存在細(xì)胞膜中,只有在接受到一定信號并且經(jīng)過修飾后,這些轉(zhuǎn)錄因子才會從膜中釋放出來[20]。本試驗克隆所獲MsNF-YB5在細(xì)胞核外也具有定位信號,其可能參與其他生理響應(yīng)調(diào)控過程。
高等植物中存在著許多不同的NF-Y轉(zhuǎn)錄因子,具有多種不同的異源二聚體或異源三聚體組合方式,在植物不同組織器官內(nèi)各生長階段發(fā)揮不同的功能。NF-Y基因家族目前已在多種植物中進(jìn)行了研究報道。例如在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中已經(jīng)鑒定了10個NF-YA基因、13個NF-YB基因和13個NF-YC基因,參與調(diào)控種子形成、胚胎發(fā)育、養(yǎng)分獲取、形態(tài)建成、花發(fā)育、果實形成和微生物共生等過程[21];Quach等[22]在大豆(Glycine max)中鑒定確認(rèn)了的NF-YA,NF-YB和NF-YC家族成員數(shù)目分別為21,32和15,并通過轉(zhuǎn)錄分析認(rèn)為大豆的NF-Y轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)節(jié)根瘤活性方面發(fā)揮重要作用;水稻中鑒定出11個OsNF-YAs,11個OsNF-YBs和12個OsNF-YCs[23],并且多名研究者發(fā)現(xiàn)OsNF-YB1和OsNF-YC12的互作可以調(diào)控蔗糖轉(zhuǎn)運、乙烯響應(yīng)、淀粉合成等相關(guān)基因的表達(dá),從而影響水稻灌漿、胚乳發(fā)育過程[24-27];An等[28]在紫花苜?!陆笕~’參考基因組中共鑒定出9個NF-YA,26個NF-YB和25個NF-YC,并發(fā)現(xiàn)多個MsNF-Ys基因分別響應(yīng)冷脅迫、ABA處理、干旱脅迫和鹽脅迫,但是目前有關(guān)紫花苜蓿NF-Y轉(zhuǎn)錄因子的功能和機制研究報道較少。本試驗克隆的MsNF-YB5編碼長度僅為471 bp,編碼176個氨基酸,與蒺藜苜蓿MtNF-YB5的氨基酸序列相似度為100%,依據(jù)啟動子元件預(yù)測結(jié)果分析,推測其可能在紫花苜蓿的激素響應(yīng)和脅迫響應(yīng)等方面發(fā)揮作用。
NF-YB家族基因廣泛參與植物的非生物脅迫響應(yīng)過程[29]。在擬南芥中,有多篇報道指出,干旱和滲透脅迫會誘導(dǎo)擬南芥AtNF-YB1,2,3,5,6,9,10等基因的上調(diào)表達(dá)[29-31]。其中AtNF-YB1,AtNF-YB2和AtNF-YB3已被證明可正向調(diào)節(jié)擬南芥的耐旱性和耐熱性[30-31]。在玉米中,干旱脅迫或鹽脅迫誘導(dǎo)了ZmNF-YB2,4,8,10,13,16等基因的表達(dá)[32]。進(jìn)一步研究結(jié)果表明ZmNF-YB2和ZmNF-YB16均可顯著提高玉米的干旱耐受能力[30,33]。Du等[34]在紫花苜蓿中鑒定出了15個受干旱或鹽處理下高度誘導(dǎo)表達(dá)的MsNF-YBs基因。堅偉寧等[35]研究發(fā)現(xiàn)表達(dá)MsNF-YB3和MsNF-B4能提高轉(zhuǎn)基因苜?;驘煵莸目鼓嫘浴kS著對NF-YB家族基因研究的深入,研究者發(fā)現(xiàn)NF-YB基因可以通過ABA依賴途徑介導(dǎo)植物的非生物脅迫抗性。例如,大豆的GmNF-YB2與GmNF-YA16和GmNF-YC14形成異源三聚體,激活GmPYR1介導(dǎo)的ABA信號通路,從而提高大豆的脅迫耐受性[36];StNF-YB3.1可通過ABA介導(dǎo)促進(jìn)馬鈴薯氣孔閉合[37];玉米NF-YB家族基因在ABA處理、鹽脅迫、干旱脅迫后表達(dá)水平整體明顯升高,說明其可能具有通過ABA依賴途徑調(diào)控作物抗旱性的功能[34]。本試驗中MsNF-YB5表達(dá)量在鹽脅迫、滲透脅迫、冷脅迫、ABA處理、低氮處理下表達(dá)量顯著升高,推測其可能響應(yīng)紫花苜蓿的脅迫應(yīng)答過程,具有調(diào)節(jié)抗逆性的潛在功能。
4 結(jié)論
本研究克隆獲得紫花苜蓿MsNF-YB5基因,該基因開放閱讀框為471 bp,共編碼156個氨基酸,屬于Dr-like亞族,與蒺藜苜蓿MtNF-YB5相似度為100%,其啟動子區(qū)域含有參與茉莉酸甲酯、脫落酸、防御與脅迫反應(yīng)的順式作用元件。MsNF-YB5蛋白具有核定位信號,截短N端后具有轉(zhuǎn)錄自激活活性,響應(yīng)鹽脅迫、PEG處理、ABA處理、低氮處理和冷脅迫。本研究為進(jìn)一步研究MsNF-YB5抗逆功能和調(diào)控機制以及改良紫花苜??鼓嫘蕴峁┝藚⒖?。
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(責(zé)任編輯""閔芝智)
引用格式:王之杰, 張萬軍.紫花苜蓿MsNF-YB5基因的克隆及表達(dá)特性分析[J].草地學(xué)報,2025,33(3):686-695
Citation:WANG Zhi-jie, ZHANG Wan-jun.Cloning and Expression Analysis of"MsNF-YB5"in Alfalfa[J].Acta Agrestia Sinica,2025,33(3):686-695
基金項目:國家自然科學(xué)青年基金項目(32201454);國家草業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心(籌)項目(CCPTZX2023B01)資助
作者簡介:王之杰(2002-),男,漢族,山東濰坊人,本科生,主要從事苜蓿轉(zhuǎn)基因育種研究,E-mail:wangzhijie@cau.edu.cn;*通信作者Author for correspondence,E-mail:wjzhang@cau.edu.cn