郭宇,楊波,蘭德松,郁茵,楊冬梅,王旭紅,云濤,牧仁,李雷斌,孫雨
(1.內(nèi)蒙古自治區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心,內(nèi)蒙古呼和浩特 010051;2.鄂爾多斯市動物疫病預(yù)防控制中心,內(nèi)蒙古鄂爾多斯 017000;3.遼寧省動物疫病預(yù)防控制中心,遼寧沈陽 110164;4.北京市密云區(qū)動物疫病預(yù)防控制中心,北京 101500;5.廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,廣西南寧 530004;6.中國動物疫病預(yù)防控制中心,北京 102600)
牛傳染性鼻氣管炎(IBR)又稱牛病毒性鼻氣管炎(BVR)、壞死性鼻炎(NR)或紅鼻?。≧ND),是由牛傳染性鼻氣管炎病毒(IBRV)引起牛的一種急性、熱性傳染病。病毒學(xué)上,將IBRV 命名為牛皰疹病毒1 型,歸屬于皰疹病毒科皰疹病毒甲亞科水痘病毒屬。IBR 臨床上以呼吸困難、鼻漏,以及上呼吸道及氣管黏膜水腫發(fā)炎、淋巴結(jié)腫大、消瘦、產(chǎn)乳量大幅度降低等為主要特征。IBR 的危害在于病毒侵入牛體后可潛伏在一定部位,導(dǎo)致持續(xù)性感染,延緩育肥牛群的生長和增重,降低產(chǎn)奶量甚至停乳,使懷孕動物流產(chǎn)[1-2],因而給養(yǎng)殖業(yè)帶來較大危害,給本病的控制與消滅帶來不小困難。本研究旨在建立一種靈敏的IBRV 檢測方法,以推動該病的凈化、控制進(jìn)程。
IBRV 基因組為線性雙股DNA 分子?;蚪M分成特異長區(qū)(UL,106 kb)和短區(qū)(US,10 kb),其中短區(qū)被兩個反向重復(fù)序列(IRS、TRS 各11 kb)包圍,因此能夠反轉(zhuǎn)方向,使病毒DNA 具有兩種異構(gòu)體[3]。IBRV 基因組可編碼約70 個蛋白質(zhì),其中有15 個非結(jié)構(gòu)蛋白和33 個結(jié)構(gòu)蛋白,蛋白結(jié)構(gòu)和功能目前大部分已知。研究[4]表明,IBRV 的12個囊膜蛋白中有10 個是糖蛋白(gB、gC、gD、gE、gG、gH、gI、gK、gL 和gM),還有2 個未進(jìn)行糖基化修飾。其中g(shù)B、gC、gD 和gE 4 個主要糖蛋白已完成測序并已在哺乳動物中表達(dá)。病毒糖蛋白可以刺激機(jī)體產(chǎn)生具有中和活性的抗體,并在病毒感染細(xì)胞過程中發(fā)揮十分重要的作用[5-7]。gD 蛋白位于基因組的短特異區(qū),是病毒的一個重要結(jié)構(gòu)蛋白。gD 蛋白被認(rèn)為是病毒粒子表面和病毒感染細(xì)胞的主要分子,參與病毒吸附、侵入細(xì)胞的過程,是病毒復(fù)制的必需蛋白。gD 蛋白能夠誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生體液免疫和細(xì)胞免疫,并使機(jī)體產(chǎn)生中和抗體來中和病毒。
為獲得在Sf9 細(xì)胞中高效表達(dá)的IBRV gD 蛋白,本研究通過優(yōu)化IBRV gD 密碼子序列,瞬時轉(zhuǎn)染Sf9 昆蟲細(xì)胞,改進(jìn)抗原制備純化條件,使用昆蟲桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)制備出病毒的gD 抗原。以純化的抗原為基礎(chǔ),成功建立了相關(guān)抗體檢測方法。
大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞(DH10Bac)、Sf9 昆蟲細(xì)胞、IBRV gD pFastBacHTA 質(zhì)粒,由中國動物疫病預(yù)防控制中心保存。
質(zhì)粒小提試劑盒,購自Promega 公司;SF900昆蟲細(xì)胞培養(yǎng)基,購自GIBCO 公司;CellfectinTMII Reagen 轉(zhuǎn)染試劑、BCA 蛋白定量試劑盒,購自Thermo Fisher公司;Casein Tryptone、Yeast extract、酶標(biāo)兔抗牛二抗、Ni-Berpharose FF 純化試劑盒等,購自北京康為世紀(jì)公司。
利用TMHMM 跨膜區(qū)在線預(yù)測系統(tǒng)、SignalIP在線預(yù)測系統(tǒng)等生物信息學(xué)分析軟件,分析并預(yù)測經(jīng)典IBRV(GenBank 登錄號AFH08294.1)gD 蛋白的跨膜區(qū)序列、疏水區(qū)序列和稀有密碼子。優(yōu)化目的序列密碼子并使用化學(xué)合成方法合成IBRVgD核苷酸序列,構(gòu)建重組IBRV gD-pFastBacHTA 質(zhì)粒。使用DNAman 軟件設(shè)計IBRVgD基因擴(kuò)增引物gD-F 和gD-R。上述引物序列由生工生物工程股份有限公司合成。
表1 IBRV gD 基因引物與M13 通用引物序列信息
合成上游引物gD-F 及下游引物gD-R,對重組質(zhì)粒進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,PCR 擴(kuò)增后對目的序列產(chǎn)物進(jìn)行測序并鑒定。
將重組質(zhì)粒以三線法的方式劃線接種于LB平板,挑單克隆、搖菌,提取重組質(zhì)粒IBRV gDpFastBacHTA,利用1.3 中構(gòu)建的IBRVgD基因上、下游引物進(jìn)行驗證,將PCR 鑒定為陽性的質(zhì)粒進(jìn)行測序并鑒定。
將生長狀態(tài)良好的Sf9 昆蟲細(xì)胞平鋪于細(xì)胞六孔板中,待貼壁1~2 h 后,按照CellfectinTMII Reagen 轉(zhuǎn)染試劑說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染;細(xì)胞培養(yǎng)96 h后,反復(fù)凍融收集上清,將其命名為第1 代病毒;從第2 代病毒開始,加入第1 代病毒液和Sf9 細(xì)胞培養(yǎng)基,覆蓋細(xì)胞,1~2 h 后棄去上清,加入2 mL的SF900 II 型細(xì)胞培養(yǎng)基;病毒轉(zhuǎn)染細(xì)胞培養(yǎng)72 h,傳至第5 代后,反復(fù)凍融離心收集上清,分裝于無菌管做好標(biāo)記,置于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
將構(gòu)建的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染入Sf9 細(xì)胞進(jìn)行表達(dá)。使用PBS 對收集的細(xì)胞沉淀進(jìn)行洗滌,并加入細(xì)胞裂解液,冰浴離心后收集上清,使用鎳原料純化試劑盒對抗原進(jìn)行初步純化;純化后,利用SDSPAGE 進(jìn)行電泳鑒定,同時使用BCA 蛋白定量試劑盒測定純化的蛋白濃度。
利用Western-blot 進(jìn)一步鑒定目的蛋白表達(dá)情況。以Anti-6x HisTagAntibody 為一抗,室溫孵育1.5 h,用TBST 洗滌3 次;以抗鼠二抗作為二抗,室溫?fù)u床孵育1 h,用TBST 洗滌3 次;加入DAB顯色液,觀察條帶的相對分子質(zhì)量大小、清晰度及有無非特異條帶。
1.9.1 ELISA 檢測方法建立 將制備純化后的gD抗原,按照8.000、4.000、2.000、1.000、0.500、0.250、0.125 μg/mL 的梯度稀釋后,包被于96 孔酶標(biāo)板中;將IBRV 標(biāo)準(zhǔn)抗體陽性血清及陰性血清分別按1:10、1:20、1:50、1:100、1:200 的稀釋度稀釋后加入包被好的酶標(biāo)板中,按照棋盤滴定法驗證抗原的最優(yōu)包被濃度與血清稀釋度。使用不同濃度稀釋后的牛血清白蛋白(BSA)封閉ELISA 酶標(biāo)板,并通過不同稀釋濃度確定最優(yōu)封閉濃度。酶標(biāo)二抗的最佳稀釋濃度與作用時間,使用棋盤滴定交叉方法驗證。按照IBRV 標(biāo)準(zhǔn)抗體陽性樣本與陰性樣本的OD450計算P/N值,將P/N最大值對應(yīng)的ELISA 檢測條件作為gD 抗體間接ELISA 檢測方法的最佳反應(yīng)條件。
1.9.2 Cut-off臨界值確定 為確定IBRV gD ELISA 抗體檢測方法的臨界值,使用經(jīng)血清抗體中和試驗鑒定的223 份臨床陰性牛血清,通過本研究建立的IBRV gD ELISA 抗體檢測方法進(jìn)行檢測,根據(jù)檢測出相應(yīng)血清抗體OD450值分析檢測出的結(jié)果,計算血清抗體的平均OD450值(X)及對應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)偏差值(SD)。Cut-off臨界值按公式計算:Cut-off臨界值=陰性牛血清平均OD450(X)+4SD。當(dāng)OD450>X+4SD 判定為陽性,否則判定為陰性。
1.9.3 特異性檢測 使用本研究建立的間接ELISA 方法,對牛病毒性腹瀉病毒抗體陽性血清、牛A 型口蹄疫病毒抗體陽性血清、牛O 型口蹄疫病毒抗體陽性血清、牛結(jié)節(jié)性皮膚病病毒抗體陽性血清進(jìn)行檢測,根據(jù)檢測的OD450,計算Cut-off臨界值,以此判定建立的間接ELISA 檢測方法與其他牛類病毒是否存在非特異性交叉反應(yīng)。
1.9.4 敏感性檢測 使用采購的IBRV 標(biāo)準(zhǔn)抗體陽性血清,對本研究建立的間接ELISA 檢測方法進(jìn)行敏感性驗證。將IBRV 標(biāo)準(zhǔn)抗體陽性血清按1:8、1:16、1:32、1:64、1:128、1:256、1:512的比例進(jìn)行倍比稀釋后檢測,根據(jù)檢測的OD450計算結(jié)果,得出陽性臨界值時的最大血清稀釋度,并將結(jié)果同血清中和試驗的中和效價結(jié)果進(jìn)行比對。
1.9.5 重復(fù)性檢測 使用上述完善的ELISA 方法,對10 份不同中和效價的臨床陽性血清進(jìn)行批內(nèi)與批間重復(fù)性測試,每個陽性血清樣本做5個重復(fù),根據(jù)檢測的OD450計算批內(nèi)、批間變異系數(shù)(CV)。
1.9.6 臨床血清樣品測試 使用本研究建立的ELISA 抗體檢測方法與血清中和試驗,對農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸醫(yī)診斷中心保存的480 份臨床樣本進(jìn)行比對檢測,并計算兩種檢測方法的總符合率(包括特異性符合率、敏感性符合率)。
使用特異性引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,結(jié)果得到了與預(yù)期大小一致的PCR 產(chǎn)物片段(305 bp,圖1)。將PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物送測序公司進(jìn)行測序發(fā)現(xiàn),PCR 產(chǎn)物序列與目的基因序列相同(圖2),表明IBRV gD-pFastBacHTA 重組質(zhì)粒初步構(gòu)建成功。
圖1 gD 片段PCR 擴(kuò)增鑒定結(jié)果
圖2 Bacmid-IBRV-G 測序比對結(jié)果
使用通用引物與目的序列特異性引物進(jìn)行交叉PCR 鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn)4 對交叉引物均擴(kuò)增出清晰、明確的目的條帶,由此證明除正確目的基因外,連接上的穿梭載體也是正確的,表明IBRV gDpFastBacHTA 重組質(zhì)粒完全構(gòu)建成功(圖3)。
圖3 Bacmid-IBRV gD 的PCR 擴(kuò)增鑒定結(jié)果
對細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染接毒后,在顯微鏡下觀察第3代次細(xì)胞。結(jié)果(圖4)顯示:陰性對照組的Sf9細(xì)胞生長正常,且在高營養(yǎng)培養(yǎng)基環(huán)境下出現(xiàn)部分疊加生長而導(dǎo)致的輕微聚堆現(xiàn)象;感染病毒組的Sf9 細(xì)胞發(fā)生了特異性細(xì)胞病變,出現(xiàn)了明顯的增殖抑制、細(xì)胞外觀變圓、細(xì)胞核變大、細(xì)胞分散間隙大、細(xì)胞質(zhì)內(nèi)出現(xiàn)黑色顆粒及雜質(zhì)等特征。
圖4 轉(zhuǎn)染Bacmid-IBRV gD 細(xì)胞病變(40×)
將第3~5 代重組桿狀病毒感染的Sf9 細(xì)胞提取基因組后,使用桿狀病毒的gD-F/gD-R 為上下游引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,檢測各代次病毒基因組有無突變等特殊情況。檢測發(fā)現(xiàn),每個代次的擴(kuò)增片段均一致,且條帶明確(305 bp),說明gD序列已成功進(jìn)入桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng),并持續(xù)穩(wěn)定存在于各代次的細(xì)胞中(圖5)。
圖5 不同代次桿狀病毒目的基因PCR 擴(kuò)增鑒定結(jié)果
純化后的重組IBRV gD 蛋白經(jīng)SDS-PAGE 電泳鑒定后,結(jié)果在大小約為40 kDa 位置處存在一清晰條帶,且前后沒有明顯雜質(zhì),表明純度非常高(圖6);進(jìn)行WB 試驗,結(jié)果在與染色膠圖目的條帶的相同位置出現(xiàn)了明顯棕色印記(圖7),說明重組IBRV gD 可溶性蛋白成功表達(dá),并且具有較好的反應(yīng)原性。
圖6 重組IBRV gD 蛋白SDS-PAGE 鑒定結(jié)果
圖7 重組IBRV gD 蛋白Western-blot 檢測結(jié)果
2.6.1 抗原包被濃度與樣品稀釋度優(yōu)化 對抗原包被濃度與樣品稀釋度進(jìn)行優(yōu)化后發(fā)現(xiàn),當(dāng)抗原濃度為0.5 μg/mL、4℃條件下作用18 h,2.5%BSA、4 ℃條件下封閉24 h,一抗血清稀釋度為1:20 倍時,反應(yīng)45 min,計算得出的P/N值最大。當(dāng)酶標(biāo)二抗的稀釋度為1:30 000、二抗37 ℃條件下反應(yīng)45 min,底物反應(yīng)10 min 條件下的P/N值最高(表2)。
表2 IBRV gD 間接ELISA 檢測方法的建立與優(yōu)化結(jié)果
2.6.2 陰陽性臨界值(Cut-off值)確定 使用本研究建立的IBRV gD ELISA 抗體檢測方法,對經(jīng)血清抗體中和試驗鑒定的223 份臨床陰性牛血清進(jìn)行檢測,結(jié)果223 份陰性血清平均OD450值()為0.118,SD 為0.061,Cut-off值為+4SD=0.362。
2.7.1 特異性驗證 使用建立的IBRV gD ELISA抗體檢測方法,分別檢測了牛結(jié)節(jié)性皮膚病病毒抗體陽性血清、牛O 型口蹄疫病毒抗體陽性血清、牛A 型口蹄疫病毒抗體陽性血清、牛病毒性腹瀉病毒抗體陽性血清,檢測到的OD450值分別為0.093、0.086、0.107、0.094,均小于Cut-off值0.362,表明重組IBRV gD 抗原對上述牛病毒的抗體陽性血清無任何非特異性交叉反應(yīng),證明本研究所建立的方法特異性較好。
2.7.2 敏感性驗證 使用購自英國WOAH 參考實驗室的IBRV 標(biāo)準(zhǔn)抗體陽性血清(血清中和效價為1:256),對建立的IBRV gD ELISA 抗體檢測方法對進(jìn)行驗證。結(jié)果顯示,建立的IBRV gD ELISA 檢測方法在稀釋度1:512 時仍為陽性,表明檢測敏感性高于傳統(tǒng)的血清中和試驗方法。
2.7.3 重復(fù)性驗證 使用建立的間接ELISA 檢測方法,將10 份不同中和抗體效價的IBRV 抗體陽性血清分別在同批次板(批內(nèi))和不同批次(批間)的酶標(biāo)板上進(jìn)行重復(fù)性驗證,結(jié)果批內(nèi)、批間檢測的重復(fù)性變異系數(shù)均小于10%,表明所建立的ELISA 檢測重復(fù)性好、變異較小,抗原穩(wěn)定性較高,可用于不同抗體效價樣本不同批次的IBRV 抗體檢測(表3)。
表3 間接ELISA 檢測方法的重復(fù)性驗證結(jié)果
2.7.4 臨床血清樣品測試 使用建立的間接ELISA 檢測方法結(jié)合血清中和試驗,對中國動物疫病預(yù)防控制中心(農(nóng)業(yè)農(nóng)村部獸醫(yī)診斷中心)保存的480 份臨床血清樣品進(jìn)行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩種方法的敏感性符合率為98.18%,特異性符合率為93.33%,總符合率為96.67%(表4)。
表4 臨床血清樣品的測試結(jié)果 單位:份
IBR 作為農(nóng)業(yè)農(nóng)村部規(guī)定的二類動物疫病,長久以來給養(yǎng)殖戶以及養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展都帶來了不小的影響,其一旦發(fā)病,尚無有效的藥物治療方法。對于本病的防控,主要采取疫苗免疫、抗體與病原監(jiān)測,配合種畜群凈化等綜合措施。檢測IBR 疫苗免疫后的中和抗體是評價疫苗免疫效果的重要途徑。WOAH《陸生動物診斷檢測與疫苗手冊》(Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals)11.11章有關(guān)于IBR的診斷方法,涉及病毒中和試驗、病毒分離、電鏡觀察、常規(guī)PCR、間接免疫熒光抗體等,國內(nèi)只有行標(biāo)《牛傳染性鼻氣管炎診斷技術(shù)》(NY/T 575—2019)[8]。這些方法為我國現(xiàn)有疫情防控提供了技術(shù)支撐。
分子生物學(xué)檢測方法相較于病毒分離、中和試驗等檢測方法,具有檢測速度快,檢測結(jié)果量化、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn),但存在病毒血癥期短、動物機(jī)體樣本取樣困難、臨床檢測中不利于大面積監(jiān)測推廣等問題。血清中和試驗作為傳統(tǒng)的經(jīng)典檢測技術(shù),是檢測IBRV 的金標(biāo)準(zhǔn)方法,但其檢測周期長、檢測成本高、操作繁瑣、判據(jù)復(fù)雜,不適于檢測大量樣本。本研究選用昆蟲表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)gD 蛋白,保留了蛋白原有的糖基化、乙酰化、磷酸化位點(diǎn)。蛋白折疊、二硫鍵形成更接近于天然蛋白,且表達(dá)量高。在此基礎(chǔ)上,建立的IBRV 抗體間接ELISA 方法具有諸多優(yōu)勢,其中試驗材料獲取途徑簡單,檢測速度快、結(jié)果準(zhǔn)確,對試驗環(huán)境、設(shè)備及人員的要求較低,并且相較于血清抗體中和試驗敏感性更高,特異性更強(qiáng)、準(zhǔn)確性極佳,可以客觀評價IBR 疫苗免疫動物后的抗體免疫保護(hù)水平,對臨床樣本可實現(xiàn)大批量檢測,對基層樣本可進(jìn)行大批量篩查,從而可以加快IBR 防控凈化進(jìn)程[8-10]。
目前檢測IBRV 抗體的ELISA 試劑盒大多依賴于國外品牌,成本較高,且進(jìn)口周期長,給基層動物防疫檢測工作帶來了較大困難。本研究建立的IBRV gD 抗體間接ELISA 檢測方法與傳統(tǒng)的血清中和試驗方法相比,符合率可達(dá)96.67%,在保證檢測方法特異性的同時,檢測敏感性比血清中和檢測方法更有優(yōu)勢,臨床陽性血清樣品檢出率也更高,所以檢測性能更具優(yōu)勢,具有較好的市場應(yīng)用前景。同時本研究所建立的方法適合臨床樣本的大批量檢測,可以用于基層IBRV 疫苗免疫效果評價、疫情監(jiān)測等工作,應(yīng)用前景廣闊。