孫濤,彭映潮,史卓,高春林,夏正坤
腎發(fā)育不良和腎發(fā)育不全(renal agenesis and hypodysplasia,RAH)是導致兒童慢性腎臟病的主要原因之一,包括腎發(fā)育不良、腎發(fā)育不全,具有高度遺傳異質(zhì)性。突變的 GREB1L(growth regulation by estrogen in breast cancer 1-like)基因在2017年被首次報道為RAH易感基因[1]。作為新型易感基因,GREB1L基因突變導致RAH的報道較少,其確切發(fā)病率尚不明確。大型全外顯子測序研究顯示,2.8%的RAH患兒合并有GREB1L基因突變[1]。GREB1L基因突變所致的患者臨床表現(xiàn)異質(zhì)性大,主要表現(xiàn)為先天性單側(cè)或雙側(cè)RAH,病變甚至可累及膀胱、子宮、骨骼、耳朵[2],遺傳上具有不完全外顯的特點。迄今為止,該基因的遺傳和表達特點仍不清楚。本文報道1例GREB1L基因突變患兒的臨床特征和遺傳特點,有利于加深臨床醫(yī)生對該基因的認識。本研究通過中國人民解放軍東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院倫理委員會批準(批準文號:2021NZGKJ-023),患兒監(jiān)護人均簽署知情同意書。
患兒,男,5歲2個月,因“反復蛋白尿3年余”于2021-04-14就診中國人民解放軍東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院。2018年無明顯誘因出現(xiàn)全身水腫伴尿量減少于外院就診,查24 h尿蛋白定量4.864 g,血生化示:白蛋白14.9 g/L(參考范圍:40~55 g/L),總膽固醇11.02 mmol/L(參考范圍:0~5.18 mmol/L),診斷為“腎病綜合征(nephrotic syndrome,NS)”,外院給予足量醋酸潑尼松誘導治療,足量激素治療4周,尿蛋白未轉(zhuǎn)陰,加用環(huán)孢素口服液早晚各40 mg治療,1周后尿蛋白轉(zhuǎn)陰。其后激素及環(huán)孢素按規(guī)律減量,減至小劑量時易復發(fā),每年復發(fā)1~2次。病程中定期復查發(fā)現(xiàn)右腎進行性萎縮,左側(cè)腎臟大小正常,行泌尿系統(tǒng)CT及血管造影等檢查排除了血栓、尿路梗阻、腫瘤及結(jié)核等繼發(fā)因素所致的后天性腎萎縮。2021-04-14因尿蛋白再次復發(fā),至本院兒科門診就診,查腎臟超聲示:右腎65 mm×25 mm,左腎大小正常。入院診斷:(1)NS;(2)右腎萎縮。入院查體:身高110 cm,體質(zhì)量22 kg,智力正常,心肺查體無明顯異常,雙下肢輕度水腫。
入院完善相關(guān)檢查,腎臟超聲示:右腎,上下徑63 mm,左右徑29 mm;左腎,上下徑96 mm,左右徑39 mm。腎臟發(fā)射單光子計算機斷層掃描儀(ECT)檢查示:(1)右腎體積偏小,右腎腎小球濾過率(GFR) 28.3 ml/min;(2)左腎GFR 93.6 ml/min;考慮右腎功能不全。全腹CT示:右腎萎縮,右腎血管未見狹窄,未見局部壓迫。
因患兒出現(xiàn)右腎進行性萎縮,已排除繼發(fā)因素所致,故高度懷疑可能存在基因突變。為進一步明確病因,經(jīng)患兒家長同意后,取患兒及父母外周靜脈血各2 ml,使用北京智因東方公司全基因組測序方法進行測序,結(jié)果顯示患兒存在GREB1L基因c.4688A>G雜合突變,突變源自母親,但母親尚無臨床表型。
該患兒GREB1L基因的突變在第18號常染色體19088505位置的第4 688位堿基。該處在正常情況下為腺嘌呤(A),先證者的父親表型正常且基因型與野生型相同,而其母親雖表型正常但基因發(fā)生改變,由A突變成鳥嘌呤(G)并遺傳給后代。先證者此處的堿基由A變異成G,使得其第1 563位氨基酸由天冬酰胺(Asn)變?yōu)榻z氨酸(Ser),為錯義突變,該位點為A/G雜合,見表1、圖1。該突變在先證者上的變異深度與總深度的比值為563/1 174,其父親為野生型,比值為0/729;而其母親為雜合型,比值為307/590。
表1 全基因測序顯示基因變異結(jié)果Table 1 Whole genome sequencing shows the results of gene variation
圖1 患兒GREB1L基因c.4688A>G雜合突變及家系驗證Figure 1 Heterozygous mutation of GREB1L gene c.4688A>G of this child case and pedigree verification
致病性分析:根據(jù)美國遺傳學及基因組學學會(ACMG)指南(2015年)[3],該病例基因錯義變異被評級為可能致?。╨ikely pathogenic),致病證據(jù):PM1+PM2+PP2+PP3。中等致病證據(jù)PM1:變異位于致病熱點區(qū)(突變左右10 bp范圍內(nèi)存在3個以上有害突變);中等致病證據(jù)PM2:在所有正常人群數(shù)據(jù)庫中頻率<0.000 5,為罕見變異;支持致病證據(jù)PP2:在GnomAD數(shù)據(jù)庫中屬于z-score≥3.09的基因突變;支持致病證據(jù)PP3:多種蛋白質(zhì)危害預測軟件(Polyphen2和mutationtaster等)預測出變異對基因(基因產(chǎn)物)有影響。本例患兒臨床表現(xiàn)符合GREB1L基因突變相關(guān)的部分臨床特征,因該基因突變不完全外顯,或可解釋母親攜帶同樣突變基因但表型正常的現(xiàn)象。以上均提示本例GREB1L基因變異的危害性與患兒表型存在相關(guān)性。
本研究中患兒就診時以NS、右腎萎縮為主要表現(xiàn),不明原因腎萎縮提示可能為復雜的遺傳性疾病。經(jīng)全基因組測序技術(shù)確診存在GREB1L基因突變。近幾年,GREB1L基因被鑒定是RAH的致病新基因。2017年BROPHY等[1]首次在2個腎發(fā)育不全的家系中發(fā)現(xiàn)了GREB1L基因變異,通過CRISPR/Cas9技術(shù)將變異引入斑馬魚和小鼠模型并證實GREB1L基因變異和腎發(fā)育不良相關(guān)。
繼2017年以來,全球共報道了76個GREB1L基因突變位點[2,4-7],攜帶致病突變的個體可能存在各種系統(tǒng)器官的發(fā)育異常,包括腎臟、膀胱、子宮、骨骼、耳朵[2]。本報道的先證者及其母親存在相同的GREB1L基因雜合突變位點(c.4688A>G),目前未見有關(guān)此突變位點的文獻報道,可能擴展了與RAH相關(guān)基因突變譜。WANG等[4]在一個中國家系中發(fā)現(xiàn)GREB1L基因雜合突變,先證者為2歲女孩,臨床表現(xiàn)為右腎萎縮,祖父患左側(cè)腎萎縮,父親為致病基因攜帶者,但無臨床表現(xiàn)。HERLIN等[8]在一個家系中發(fā)現(xiàn)了一個GREB1L的共分離錯義突變,該家系2名女性表親有生殖系統(tǒng)發(fā)育不全合并單側(cè)腎發(fā)育不全,1名男性親屬單側(cè)腎發(fā)育不全,還包含1例因雙側(cè)腎發(fā)育不全而未能出生的男性胎兒。SCHRAUWEN等[6]報道了1例GREB1L基因突變合并先天性內(nèi)耳畸形、聽力異常,但缺乏腎臟系統(tǒng)異常表現(xiàn)。臨床表現(xiàn)的異質(zhì)性說明了GREB1L基因表達的復雜性。即便攜帶相同致病變異位點,患者的臨床表現(xiàn)可能不完全相同。
GREB1L基因的遺傳方式為常染色體顯性遺傳,具有不完全外顯性。同一家系中即便多人攜帶同樣的雜合變異,有人癥狀嚴重,有人癥狀輕微,有人無臨床表現(xiàn)[9-10]。本病例先證者出現(xiàn)右腎萎縮,攜帶相同突變位點的母親無臨床表型,與國外相關(guān)報道發(fā)病特點相符合,本研究認為GREB1L雜合變異可能需要額外的遺傳因素或環(huán)境因素來實現(xiàn)完全外顯率。HERLIN等[11]認為同卵雙胞胎存在不同表型也一定程度上支持環(huán)境病因?qū)W,其還指出GREB1L變異基因只有來自母親時,才會出現(xiàn)表型[8]。但有報道發(fā)現(xiàn)如果GREB1L的突變來自父親,也可出現(xiàn)腎發(fā)育不良表型,但死亡率更高[5]。據(jù)統(tǒng)計,約75%的病例中的變異基因源自母親,這種母性偏差可能與基因印跡有關(guān),還有可能是由于GREB1L變異對男性生育能力影響更大,導致父系遺傳率較低[8-9]。
GREB1L基因變異導致RAH的機制尚未明確。有研究表明GREB1L基因是視黃酸受體基因的共激活因子,而視黃酸參與胚胎發(fā)育過程中的多種生物過程,GREB1L基因的表達對脊柱動物腎臟系統(tǒng)的細胞分化、形態(tài)發(fā)生和細胞穩(wěn)態(tài)有重要影響[11]。DE TOMASI等[9]使用RNA原位雜交技術(shù)通過原位雜交,證實了GREB1L基因在小鼠胚胎期的腎源性區(qū)表達,提示GREB1L基因在小鼠和人類的胚胎期腎臟發(fā)育起著重要作用。目前多認為GREB1L基因與先天性RAH相關(guān),現(xiàn)有報道均未對攜帶致病突變但無臨床表型的患者進行隨訪,因此GREB1L基因?qū)和砷L期間腎臟發(fā)育的作用有待進一步探討。本病例患兒2歲時超聲提示雙腎大小正常,隨后出現(xiàn)右腎進行性萎縮,屬于在生長發(fā)育過程中出現(xiàn)的單側(cè)腎萎縮,可能是國內(nèi)外首例后天性腎萎縮合并GREB1L基因突變的報道,可能拓寬了GREB1L基因變異的臨床譜,提示該基因異??赡軐е聝和L發(fā)育過程中出現(xiàn)腎臟萎縮?;诖?,本研究將對該患兒的腎臟發(fā)育情況進行長期隨訪。未來需要更深入的機制研究,以及相關(guān)位點的驗證,以明確GREB1L基因?qū)θ祟惸I臟發(fā)育的作用機制。
綜合文獻分析,GREB1L基因突變臨床表現(xiàn)多為先天性RAH,且存在不完全外顯性。本例患兒可能為國內(nèi)外首例GREB1L基因突變合并后天性單側(cè)腎萎縮。GREB1L基因突變位點c.4688A>G雜合突變?yōu)樾掳l(fā)位點,未見文獻報道。本病例可能拓展了與RAH相關(guān)的基因突變譜和臨床譜。
作者貢獻:孫濤負責文章的構(gòu)思與設(shè)計及論文的撰寫和修訂;彭映潮、史卓負責文獻資料收集和圖表繪制;高春林負責文章審校,參與分析與討論;夏正坤負責文章的質(zhì)量控制,整體監(jiān)督,對論文負責。
本文無利益沖突。