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      參附注射液治療急性心力衰竭的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究*

      2022-11-23 03:25:18張紫嫣韋岳昆李陳星黃代政
      中國(guó)中醫(yī)急癥 2022年11期
      關(guān)鍵詞:靶點(diǎn)注射液心肌

      張紫嫣 韋岳昆 傅 永 李陳星 黃代政

      (廣西醫(yī)科大學(xué),廣西 南寧 530021)

      急性心力衰竭(AHF)是指由心臟功能異常導(dǎo)致的心衰癥狀和體征突然發(fā)作或迅速加重的急性綜合征。因其起病急、可危及生命、預(yù)后差、住院病死率高等特點(diǎn),已成為臨床最嚴(yán)重常見急癥之一[1]。目前,AHF的常規(guī)治療包括血管緊張素轉(zhuǎn)換酶抑制劑、利尿劑、血管緊張素受體腎上腺素抑制劑、洋地黃、β受體阻滯劑等。雖然這些藥物可取得一定的治療效果,但持續(xù)成本高、療效短,醫(yī)療負(fù)擔(dān)仍然不斷增加[2]。研究表明[3],中西醫(yī)結(jié)合治療AHF具有良好的效果。中醫(yī)學(xué)認(rèn)為,AHF的常見證型為陽(yáng)氣虛衰、血瘀水滯。參附注射液(參附注射液)具有回陽(yáng)救逆、益氣固脫的作用,能補(bǔ)陽(yáng)固氣,增強(qiáng)心肌收縮力,保護(hù)心肌,改善血流動(dòng)力學(xué)指標(biāo)并調(diào)節(jié)心率[4],常用于AHF的中西醫(yī)結(jié)合急救。中藥具有多成分、多靶點(diǎn)、多途徑的特點(diǎn)。本文應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,分析參附注射液主要成分,找出參附注射液和AHF的共同靶點(diǎn),從靶點(diǎn)、生物過(guò)程、通路的角度探究參附注射液治療AHF的作用機(jī)制,為臨床和科研提供參考。

      1 資料與方法

      1.1 藥物有效成分及相關(guān)靶點(diǎn)獲取 在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)TCMSP(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)中分別輸入?yún)⒏阶⑸湟旱闹饕煞帧凹t參”“附子”進(jìn)行搜索,根據(jù)TCMSP網(wǎng)站上提供的信息與已發(fā)表的文獻(xiàn)[5],設(shè)置ADME屬性值“口服生物利用度(OB)≥30%和類藥性(Drug likeness,DL)≥0.18”為篩選條件,搜索這兩個(gè)藥物的有效化合物。鑒于以“紅參”“附子”進(jìn)行搜索得到的結(jié)果具有匹配靶點(diǎn)較少,與疾病靶點(diǎn)的相交部分僅有9項(xiàng),且其間相關(guān)太低,不足以建立PPI網(wǎng)絡(luò)。故本研究考慮使用“人參”替代“紅參”進(jìn)行搜索,篩選條件仍同前。

      1.2 疾病靶點(diǎn)獲取 以“Acute heart failure”為關(guān)鍵詞,在GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.genecards.org/)和Therapeutic Target Database藥物靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)(TTD數(shù)據(jù)庫(kù),http://db.idrblab.net/ttd/)中進(jìn)行搜索。

      1.3 疾病與藥物靶點(diǎn)交集及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將獲取到的參附注射液靶點(diǎn)和AHF靶點(diǎn)分別經(jīng)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org)進(jìn)行統(tǒng)一,經(jīng)Excel整理刪除重復(fù)值,得到相應(yīng)靶點(diǎn)的基因名。使用R軟件(版本4.1.3)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析后,利用VennDiagram包對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化,得到疾病與藥物的共同靶點(diǎn)和Venn圖。將共同靶點(diǎn)導(dǎo)入蛋白質(zhì)互作數(shù)據(jù)庫(kù)STRING(https://string-db.org/)設(shè)置物種為“Homo sapiens”進(jìn)行分析,構(gòu)建藥物-疾病靶點(diǎn)蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,系統(tǒng)分析靶點(diǎn)蛋白在生物系統(tǒng)中的相互作用關(guān)系,以期了解系統(tǒng)中蛋白質(zhì)的工作原理、疾病等特殊生理狀態(tài)中生物信號(hào)和能量物質(zhì)代謝的反應(yīng)機(jī)制及蛋白之間的功能聯(lián)系。

      1.4 富集分析及可視化 使用R軟件的Cluster Profiler包、org.Hs eg.db包等對(duì)共同靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(GO)功能富集分析和京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路富集分析。篩選出P-value<0.05的結(jié)果,并使用Ggplot2包對(duì)其結(jié)果進(jìn)行可視化。分別將GO富集分析結(jié)果,包括生物過(guò)程(BP)、細(xì)胞組分(CC)、分子功能(MF)繪制成柱狀圖,將KEGG通路富集分析結(jié)果繪制成氣泡圖,以期了解參附注射液治療AHF的機(jī)制。

      2 結(jié) 果

      2.1 參附注射液有效成分及相關(guān)靶點(diǎn)獲取 本研究在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)置ADME屬性值“OB值≥30%和DL值≥0.18”為篩選條件,以“人參”和“附子”為搜索關(guān)鍵詞,篩選有對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的化合物后,得到有效成分24個(gè),如表1所示。包括水黃皮素(Karanjin)、人參皂苷Rh2(Ginsenoside Rh2)、人參皂苷Rh4_qt(Ginsenoside Rh4_qt)、谷甾醇(Sitosterol)等。對(duì)應(yīng)到共計(jì)281個(gè)靶點(diǎn),經(jīng)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化、刪除重復(fù)值等處理后得到共104個(gè)基因。

      表1 參附注射液中有效成分

      2.2 AHF疾病靶點(diǎn)和藥物-疾病共同靶點(diǎn)的獲取 整合在Genecard數(shù)據(jù)庫(kù)和TTD數(shù)據(jù)庫(kù)中以“Acute Heart Failure”為關(guān)鍵詞搜索到的內(nèi)容,得到10 110個(gè)靶點(diǎn)。根據(jù)經(jīng)驗(yàn),篩選Genecard數(shù)據(jù)庫(kù)中Relation score大于等于中位數(shù)的值為異常潛在靶點(diǎn),得到5 056個(gè)靶點(diǎn)。經(jīng)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化后得到相應(yīng)基因共4 818個(gè),以“Reviewed”和 Popular organisms-“Human”為篩選條件過(guò)濾掉未認(rèn)證的和非人源的基因,得到基因共4 790個(gè)。經(jīng)過(guò)Excel“刪除重復(fù)值處理”后,得到基因共4 744個(gè)。通過(guò)R軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析與可視化,得到參附注射液-AHF共同靶點(diǎn)81個(gè),如圖1所示。

      圖1 參附注射液-AHF共同靶點(diǎn)Venn圖

      2.3 疾病與藥物靶點(diǎn)交集及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將“2.2”中得到的共同靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING網(wǎng)站,得到參附注射液-AHF的PPI圖,如圖2所示。圖中含有80個(gè)靶點(diǎn),和502條互作邊。其中1個(gè)節(jié)點(diǎn)表示1個(gè)共同靶點(diǎn)即蛋白,互作邊表示靶點(diǎn)間的作用關(guān)系。鑒于真核生物的可變剪切與轉(zhuǎn)錄后修飾,1個(gè)蛋白編碼基因可能會(huì)產(chǎn)生出多個(gè)蛋白,PPI圖上將由同一個(gè)基因產(chǎn)生的不同isoform進(jìn)行了合并,在節(jié)點(diǎn)上標(biāo)記的字母實(shí)際為編碼該蛋白的基因名。PPI圖上互作邊中,各色連線分別表示連接的兩者關(guān)系如下:綠色——在彼此的基因組鄰域中經(jīng)常觀察到的關(guān)系;紅色——融合關(guān)系;藍(lán)色——同現(xiàn)關(guān)系;黃色——文本挖掘關(guān)系;黑色——共表達(dá)關(guān)系;紫色——同源蛋白質(zhì);湖藍(lán)色連線——來(lái)自精選數(shù)據(jù)庫(kù)的關(guān)系;粉紫色——經(jīng)實(shí)驗(yàn)確認(rèn)的關(guān)系。越是處在PPI中心區(qū)域、與其他節(jié)點(diǎn)互作邊越多的靶點(diǎn),其在疾病中的重要性越高。導(dǎo)出結(jié)果,統(tǒng)計(jì)各個(gè)靶點(diǎn)與其他靶點(diǎn)相連的節(jié)點(diǎn)數(shù),得到連接節(jié)點(diǎn)數(shù)最多的前10位是AKT1(與44個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、TNF(與41個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、IL-1β(與36個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、PTGS2(與34個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、PPARG(與33個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、CASP3(與30個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、NOS3(與26個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、HMOX1(與25個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、ICAM1(與24個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))、RELA(與23個(gè)靶點(diǎn)相關(guān))。筆者推測(cè)這些靶點(diǎn)可能是參附注射液治療AHF的核心靶點(diǎn)。

      圖2 參附注射液-AHF PPI圖

      2.4 富集分析結(jié)果及可視化 使用R軟件的clusterprofiler包和org.Hs.eg.db包,對(duì)共同靶點(diǎn)進(jìn)行GO富集分析和KEGG通路分析。刪除結(jié)果中P值>0.05的部分,得到具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)果BP 315個(gè),CC 46個(gè),MF 76個(gè),KEGG 118條通路。根據(jù)GO分析的結(jié)果中富集到的基因數(shù)(Counts)從大到小排序,選擇BP、CC、MF各組的前10個(gè)結(jié)果,使用Ggplot2包進(jìn)行可視化作柱狀圖,如圖3所示。其中與AHF最為相關(guān)的生物過(guò)程為信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Signal transduction)、RNA聚合酶IF啟動(dòng)子(RNA polymerase if promoter)、正向調(diào)節(jié)及轉(zhuǎn)錄(Positive regulation,of transcription from)、藥物反應(yīng)(Response to drug);最為相關(guān)的細(xì)胞成分為質(zhì)膜(Plasma membrane)、胞漿(Cytosol)、胞質(zhì)(Cytoplasm)、膜整體組分(Integral component of membrane);最為相關(guān)的分子功能為蛋白質(zhì)結(jié)合(Protein binding)、相同的蛋白質(zhì)結(jié)合(Identical protein binding)、酶結(jié)合(Enzyme binding)、蛋白質(zhì)同聚活性(Protein homodimerization activity)。

      圖3 GO富集分析結(jié)果

      在KEGG分析的結(jié)果中,篩選出P值<0.05的結(jié)果,并按照P值從小到大排序,選擇前20的值進(jìn)行可視化作氣泡圖,如圖4所示。共同靶點(diǎn)主要富集于腫瘤通路(Pathways in cancer)、鈣信號(hào)通路(Calcium signaling pathway)、cGMP-PKG信號(hào)通路(cGMP-PKG sig-naling pathway)、糖尿病并發(fā)癥的AGE-RAGE信號(hào)通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、TNF信號(hào)通路(TNF signaling pathway)、C型凝集素受體信號(hào)通路(C-type lectin receptor signaling pathway)、NF-κB信號(hào)通路(NF-kappa B signaling pathway)、IL-17信號(hào)通路(IL-17 signaling pathway)等相關(guān)信號(hào)通路,同時(shí)與脂質(zhì)和動(dòng)脈粥樣硬化(Lipid and atherosclerosis)、甲型流感(Influenza A)、弓形蟲?。═oxoplasmosis)、肺結(jié)核(Tuberculosis)、麻疹(Measles)、卡波西肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)、丙型肝炎(Hepatitis C)、乙型肝炎(Hepatitis B)、小細(xì)胞肺癌(Small cell lung cancer)、化學(xué)致癌-受體激活(Chemical carcinogenesisreceptor activation)、流體剪切應(yīng)力與動(dòng)脈粥樣硬化(Fluid shear stress and atherosclerosis)等疾病存在關(guān)系。

      圖4 KEGG通路富集分析結(jié)果

      3 討 論

      AHF為臨床最常見的急危重癥之一,具有較高的發(fā)病率和病死率,嚴(yán)重危害生命安全,其主要病因和致病機(jī)制為血流動(dòng)力學(xué)障礙。本癥急救藥物應(yīng)用以強(qiáng)心、利尿、糾正血流動(dòng)力學(xué)狀態(tài)、針對(duì)病因治療為主,中西醫(yī)結(jié)合有更好的療效。中藥注射劑與傳統(tǒng)中藥湯劑相比,其有效成分可以通過(guò)靜脈注射的方式直接注入血液,藥物不會(huì)被消化系統(tǒng)代謝,從而保證有足夠的有效成分發(fā)揮作用。研究表明,參附注射液主要有效成分為烏頭類生物堿和人參皂苷[6-8],具有強(qiáng)心作用,可增加心排出量、改善心肌缺血狀況;在提高平均動(dòng)脈血壓、正?;穆省⑶宄迦樗?、降低死亡率方面比傳統(tǒng)的治療方法更高效[9]。參附注射液還具有清除自由基、抑制炎癥介質(zhì)、抑制細(xì)胞凋亡和調(diào)節(jié)宿主免疫應(yīng)答等多種作用[10-11]。因此,參附注射液在20世紀(jì)90年代即被列為“全國(guó)中醫(yī)醫(yī)院急診科室必備中成藥”,在AHF的防治方面發(fā)揮了良好作用,進(jìn)一步探尋其作用機(jī)制很有必要。

      本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探究參附注射液對(duì)AHF的作用機(jī)制。通過(guò)TCMSP篩選出參附注射液對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的有效成分24個(gè),包括穿心蓮內(nèi)酯、豆甾醇、山柰酚、谷甾醇、β-谷甾醇、人參皂苷Rh2、人參二醇、人參皂苷-Rh4_qt等。藥理學(xué)研究[12-13]表明,人參皂苷的作用有:1)改善缺血心肌代謝、增強(qiáng)心肌收縮力、增加心排出量;2)清除自由基、保護(hù)心肌超微結(jié)構(gòu);3)阻滯細(xì)胞膜鈣離子通道,減少鈣離子超載,從而減輕心肌損傷;4)增強(qiáng)前列腺素的合成和釋放,改善微循環(huán)與冠脈血流。豆甾醇可以降低氧化應(yīng)激[14]。山柰酚可以導(dǎo)致膜超極化,達(dá)到擴(kuò)張血管的作用[15]。穿心蓮內(nèi)酯能夠抑制糖酵解,恢復(fù)線粒體氧化磷酸化,促進(jìn)細(xì)胞氧化供能[16]。β-谷甾醇具有較強(qiáng)的清除活性氧自由基能力[17]。這些藥物有效成分的生物功能均與AHF機(jī)制相關(guān),筆者由此推斷這些有效成分可以共同作用于AHF,起到治療作用。

      通過(guò)對(duì)參附注射液的24個(gè)有效成分對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn)和AHF的靶點(diǎn)取交集和篩選處理后,得到81個(gè)參附注射液-AHF共同靶點(diǎn)。利用STRING工具構(gòu)造PPI圖,得到與其他蛋白互作最多的前10位是Akt1、TNF、IL1B、PTGS2、PPARG、CASP3、NOS3、HMOX1、ICAM1、RELA。將以上結(jié)果在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)(https://www.360zhyx.com/)上進(jìn)行搜索,得到結(jié)果如下:AKT1調(diào)節(jié)許多細(xì)胞過(guò)程,包括代謝、增殖、細(xì)胞生長(zhǎng)、血管生成和抗細(xì)胞凋亡;同樣參與調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡的還有CASP3、PTGS2、RELA、IL-1β;參與調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝的還有TNF、NOS3;參與氧化還原的還有PPARG、HMOX1、PTGS2。這些靶點(diǎn)所參與心肌活動(dòng)關(guān)系密切,由此筆者推測(cè)參附注射液通過(guò)作用于以上靶點(diǎn),達(dá)到對(duì)AHF的治療作用。

      通過(guò)對(duì)GO富集結(jié)果分析,可知“2.4”所得到的生物過(guò)程、細(xì)胞成分、分子功能結(jié)果均與心肌做功相關(guān),筆者推測(cè)這些結(jié)果可能會(huì)對(duì)血流動(dòng)力學(xué)產(chǎn)生影響,與AHF的疾病機(jī)制密切相關(guān)。通過(guò)分析KEGG結(jié)果,可知共同靶點(diǎn)主要富集于鈣信號(hào)通路、cGMP-PKG信號(hào)通路、糖尿病并發(fā)癥的AGE-RAGE信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、C型凝集素受體信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路、IL-17信號(hào)通路等相關(guān)信號(hào)通路。心肌屬于平滑肌,鈣是影響平滑肌收縮功能的重要因素,由此可知鈣信號(hào)通路與AHF密切相關(guān)。研究表明,cGMP-PKG信號(hào)通路在臨床上是保留射血分?jǐn)?shù)心衰的一個(gè)治療靶點(diǎn),激活cGMP-PKG轉(zhuǎn)導(dǎo)在動(dòng)物模型中有心臟保護(hù)作用[18]。TNF信號(hào)通路受競(jìng)爭(zhēng)性的泛素結(jié)合和去泛素化控制,從而控制蛋白酶體降解和去泛素化[19]。C型凝集素受體信號(hào)通路參與免疫應(yīng)答[20]。NF-κB通路對(duì)涉及的各種外部刺激作出炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng),調(diào)節(jié)細(xì)胞的增殖、分化和生存活動(dòng)[21]。IL-17信號(hào)通路在炎癥反應(yīng)中起著重要的作用[22]。筆者推測(cè)參附注射液通過(guò)對(duì)以上通路進(jìn)行調(diào)節(jié),提高AHF心肌做功,從而改善患者的血流動(dòng)力,以達(dá)到對(duì)AHF的臨床救治效果。

      本研究從網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的角度探討參附注射液治療AHF的作用機(jī)制,認(rèn)為參附注射液的有效成分可對(duì)AHF疾病靶點(diǎn)進(jìn)行代謝、增殖、細(xì)胞生長(zhǎng)、血管生成和抗細(xì)胞凋亡生理活動(dòng)調(diào)節(jié),具有改善缺血心肌代謝、增強(qiáng)心肌收縮力、增加心排出量、清除自由基、保護(hù)心肌超微結(jié)構(gòu)、減輕心肌損傷、改善微循環(huán)與冠脈血流、降低氧化應(yīng)激、擴(kuò)張血管作用、促進(jìn)細(xì)胞氧化供能、清除活性氧自由基等能力。綜上所述,參附注射液對(duì)AHF的治療有多成分、多靶點(diǎn)、多通路的特征。

      本研究的不足之處是,鑒于臨床上AHF主要表現(xiàn)為中醫(yī)學(xué)之“陽(yáng)氣虛衰、血瘀水?!弊C,其他證型不多,故僅從網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的角度整體探尋參附注射液對(duì)AHF的作用機(jī)制,未對(duì)AHF進(jìn)行辨證分型、討論。為了更深入研究參附注射液對(duì)AHF的作用機(jī)制,筆者考慮下一步將對(duì)AHF進(jìn)行辨證論治,使用的不同藥物進(jìn)行中醫(yī)復(fù)方網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究,為臨床工作和科學(xué)研究提供參考。

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