姚元謙,呂建林,毛德文,王光耀,陳瑋鈺,黃 嫻
(1.廣西中醫(yī)藥大學研究生院,廣西 南寧 530001;2.廣西中醫(yī)藥大學第一附屬醫(yī)院,廣西 南寧 530023)
慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)在我國的肝衰竭患者中占有很大的比例,主要與乙型肝炎病毒(HBV)感染相關(guān),常在短時間內(nèi)發(fā)生肝內(nèi)或肝外多器官衰竭,其病情進展較快,短期病死率極高[1-2]。目前對于ACLF的治療缺少特效藥物。近年來,隨著人工肝技術(shù)的不斷發(fā)展及對肝衰竭患者管理認識的加強,一定程度上提高了ACLF的治療效果,但其預后仍較差。肝移植是目前最有效的治療措施,但受到肝源及患者經(jīng)濟條件的制約[3-4]。
解毒化瘀顆粒是毛德文教授在“毒邪病因”原理指導下,總結(jié)得出治療肝衰竭的臨床經(jīng)驗方,具有解毒祛邪、化瘀消癥之效,全方由茵陳、大黃、白花蛇舌草、赤芍、郁金、石菖蒲組成[5]。前期研究[6]已表明,解毒化瘀顆??赏ㄟ^NO-cGMP、NF-κB、c-Met等信號通路治療肝衰竭,涉及Caspase、TNFR I、Gadd45a、SOCS、TGF-β等作用靶點。本研究基于系統(tǒng)評價和生物信息學方法進一步探討解毒化瘀顆粒治療ACLF的臨床療效和作用機制。
1.1 文獻檢索 以“解毒化瘀顆粒”“肝衰竭”“JIEDUHUAYU”“Liver Failure”“Hepatic failure”“Acute-on-chronic liver failure”為檢索詞,采用主題詞加自由詞的方式檢索PubMed、Web of Science、Cochrane、Embase、SinoMed、CNKI、VIP、WanFang數(shù)據(jù)庫,檢索時間為建庫至2022年2月。
1.2 納入標準及排除標準
1.2.1 納入標準 (1)研究類型:隨機對照試驗(RCT),文獻語種為中文或英文;(2)研究對象:符合《肝衰竭診治指南》[7]中對ACLF的診斷;(3)干預措施:治療組需使用解毒化瘀顆粒治療,允許兩組采用同樣的常規(guī)內(nèi)科藥物治療;(4)所納入的文獻應含有以下結(jié)局指標之一:總有效率、死亡率、MELD評分、血清總膽紅素(TBiL)、血清白蛋白(ALB)、血清丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)、凝血酶原活動度(PTA)。
1.2.2 排除標準 (1)非隨機對照試驗(RCT),包括綜述類、回顧性研究、動物研究等;(2)數(shù)據(jù)重復的研究僅納入1項;(3)數(shù)據(jù)無法提取的文獻。
1.3 資料提取及質(zhì)量評價 為確保文獻篩選及數(shù)據(jù)提取錄入準確無誤,由2名數(shù)據(jù)員進行交叉核對。提取信息包括:作者及發(fā)表年份、試驗人數(shù)、試驗設(shè)計、結(jié)局指標等。利用改良Jadad量表進行文獻質(zhì)量評估,總分為7分,0~3分為低質(zhì)量文獻,4~7分為高質(zhì)量文獻。
1.4 統(tǒng)計學方法 運用R軟件進行數(shù)據(jù)分析,計數(shù)資料采取相對危險度(RR)、計量資料則采用均數(shù)差(MD)進行表示,且均選其95%置信區(qū)間(CI)進行描述。使用I2定量檢驗進行異質(zhì)性分析,當I2≤50%時可采取固定效應模型(FE),反之則采用隨機效應模型(RM)進行合并分析。
1.5 解毒化瘀顆粒的化學成分篩選及靶點預測 檢索TCMSP(https://tcmsp-e.com/)、SymMap(www.symmap.org)數(shù)據(jù)庫獲取各藥物的化學成分,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18為篩選條件進行收集。通過TCMSP數(shù)據(jù)庫下載各化學成分的mol2格式數(shù)據(jù)文件,依次上傳至PharmMapper數(shù)據(jù)庫(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper/)預測各化學成分的潛在作用靶點,并以Norm Fit≥0.5為條件篩選出高概率靶點,然后將各靶點ID上傳至UniProt平臺(https://www.uniprot.org/)統(tǒng)一轉(zhuǎn)換為GeneSymbol。
1.6 挖掘GEO芯片數(shù)據(jù)并獲取ACLF差異靶點 檢索GEO數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)獲取GSE139602芯片數(shù)據(jù)集,下載該芯片的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及GPL13667注釋文件,該組數(shù)據(jù)包括6個健康肝臟樣本及8個ACLF肝臟樣本。運用R包“l(fā)imma”等程序包,對2組樣本進行差異分析,其中差異靶點的篩選條件為|lgFC|≥1、P<0.05。使用R包“WGCNA”等程序包進行加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(Weighted correlation network analysis,WGCNA),該方法首先計算出每2個靶點之間的Pearson相關(guān)系數(shù),通過加權(quán)算法構(gòu)建一個靶點間的無尺度連接網(wǎng)絡(luò),將具有高度協(xié)同表達的靶點聚類成模塊,然后計算每個模塊與ACLF樣本、正常樣本之間的關(guān)聯(lián)系數(shù),最終篩選出與ACLF顯著相關(guān)且具有共表達、共調(diào)控屬性的模塊靶點,結(jié)合差異分析進一步篩選出其中的差異靶點,這些靶點可能通過協(xié)同作用在ACLF復雜的調(diào)控機制中起到重要影響。
1.7 獲取交集靶點并進行PPI、富集分析 應用R包“Venn”繪制藥物靶點、差異靶點及WGCNA顯著相關(guān)靶點的韋恩圖,并映射出三者的交集靶點。將交集靶點提交至STRING平臺(https://string-db.org/)獲取PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò),將該網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)導入Cytoscape 3.9.0進行拓撲分析。使用R包“clusterProfiler”對交集靶點進行GO、KEGG富集分析。運用Cytoscape軟件繪制化學成分-基因靶點-作用通路網(wǎng)絡(luò)圖,并通過網(wǎng)絡(luò)連接度預測解毒化瘀顆粒治療ACLF的主要化學成分。
1.8 分子對接驗證 選取主要化學成分和核心靶點進行分子對接,從TCMSP數(shù)據(jù)庫下載主要化學成分的MOL2文件,從PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org)下載蛋白受體的pdb文件,使用PyMOL軟件刪除蛋白受體的水分子及配體,運用AutoDock-Tools1.5.6軟件將MOL2文件及pdb文件轉(zhuǎn)換為pdbqt文件,并確定蛋白受體的活性口袋,最后通過AutoDock Vina軟件進行分子對接。
2.1 文獻檢索結(jié)果 共檢索獲得文獻201篇,嚴格按照納入與排除標準篩選文獻,最終納入10項[8-17]RCTs進行數(shù)據(jù)分析。文獻篩選過程及文獻基本資料見圖1、表1。
表1 納入文獻的基本資料
圖1 文獻篩選流程圖
2.2 文獻質(zhì)量評價結(jié)果 改良Jadad評分量表評估顯示,有8篇文獻[8-9,11-16]達到4分,表明分析質(zhì)量較高。(見表1)有2篇文獻[10,17]僅提及隨機未描述具體隨機方法,其余文獻均使用了隨機數(shù)字表法,除1項文獻[17]外,其他文獻均報告了死亡病例,其中有4篇文獻[10,12-14]描述了因失訪或退出造成病例脫落,10篇文獻均未提及分配隱藏、盲法等具體內(nèi)容。利用Cochrane提供的偏倚風險評價工具進行偏倚評估。(見圖2)
圖2 偏倚風險評估圖
2.3 Meta分析結(jié)果 根據(jù)隨訪時間的不同,分成4周和8周兩個亞組進行分析。分析結(jié)果顯示,在總有效率、死亡率、MELD評分、TBiL、ALB、ALT和PTA指標上,治療組均優(yōu)于對照組(P<0.05)。在治療時間方面,總體上第8周的治療效果優(yōu)于第4周,表明持續(xù)使用解毒化瘀顆粒進行治療,可使ACLF患者獲得更佳的療效。Meta分析結(jié)果見表2。
表2 Meta 分析結(jié)果
續(xù)表2:
2.4 篩選藥物靶點和疾病靶點 通過TCMSP、SymMap數(shù)據(jù)庫檢索、篩選獲得84個化學成分,上傳至PharmMapper篩選獲得682個藥物靶點。對GSE139602芯片數(shù)據(jù)進行差異分析,篩選獲得768個差異靶點,其在ACLF樣本中表達上調(diào)的靶點有381個、表達下調(diào)的靶點有387個。(見圖3)通過WGCNA分析,篩選出與正常樣本、ACLF樣本相關(guān)性最高的靶點,圖中綠色模塊和棕色模塊相關(guān)性最高,共1 175個靶點。(見圖4)
圖3 差異分析火山圖
圖4 WGCNA 分析
2.5 獲取交集靶點及PPI分析 將藥物靶點、差異靶點及WGCNA靶點導入R軟件,繪制韋恩圖,共映射出52個交集靶點。構(gòu)建交集靶點的蛋白互作網(wǎng)絡(luò),進行拓撲分析發(fā)現(xiàn),該網(wǎng)絡(luò)的核心靶點有CYP3A4、CYP1A2、CYP1A1、ABCG2等。(見圖5)
圖5 交集靶點分析
2.6 交集靶點富集分析 對52個交集靶點分別進行GO、KEGG富集分析,得到生物學進程(BP)219條,主要包括類固醇代謝、激素代謝、酒精代謝過程等;得到細胞組分(CC)9條,主要包括細胞基質(zhì)連接、黏著斑、囊泡腔等;得到分子功能(MF)41條,主要包括鐵離子結(jié)合、四吡咯結(jié)合、血紅素結(jié)合等;得到信號通路19條,主要包括化學致癌作用-受體激活、亞油酸代謝、類固醇激素生物合成、細胞色素P450代謝、花生四烯酸代謝、膽汁代謝通路等。(見圖6~7)
圖6 交集靶點GO 富集分析
圖7 交集靶點KEGG 富集分析
2.7 構(gòu)建化學成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò) 為了更清晰地展示解毒化瘀顆粒治療ACLF的化學成分、交集靶點與作用通路之間的關(guān)系,故構(gòu)建關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。(見圖8)通過網(wǎng)絡(luò)圖可直觀看出,解毒化瘀顆粒對ACLF具有多途徑、多成分的作用機制。根據(jù)Degree值,預測其治療ACLF的主要化學成分。(見表3)
圖8 化學成分-靶點-通路圖
表3 解毒化瘀顆粒治療ACLF 的主要化學成分
2.8 分子對接驗證 選取7個主要化學成分及8個核心靶點進行分子對接,一般認為結(jié)合能(Affinity)<-4.25 kcal/mol則配體與靶點受體之間有結(jié)合活性,Affinity<-5.0 kcal/mol表明匹配活性較佳,Affinity<-7.0 kcal/mol提示具有較強的對接活性。分子對接結(jié)果見圖9,56組對接得分均<-5.0 kcal/mol,最低得分為-6.2 kcal/mol(NQO1-β谷甾醇),最高得分為-11.9 kcal/mol(CYP1A1-鞣花酸),平均得分為-8.78 kcal/mol,表明篩選出的靶點與化學成分間具有較好的匹配度。選取部分對接結(jié)果進行展示。(見圖10)
圖9 主要化學成分-核心靶點分子對接熱圖
圖10 分子對接展示圖
中醫(yī)學將肝衰竭歸屬于“急黃”“瘟黃”等范疇,病位在肝膽,連及脾腎,病機上多屬于正虛邪實[18]。面對ACLF發(fā)病機制的復雜性及證候的多變性,中醫(yī)學從整體出發(fā)辨證施治,在常規(guī)治療的基礎(chǔ)上,配合中醫(yī)藥治療,極大程度改善了患者預后,降低了病死率。解毒化瘀顆粒是毛德文教授根據(jù)多年臨床經(jīng)驗擬定的驗方,多項臨床研究和基礎(chǔ)實驗研究表明其能有效干預肝衰竭的進展,如柏文婕等[19]對68例肝衰竭患者加用解毒化瘀顆粒發(fā)現(xiàn),其能夠調(diào)節(jié)肝衰竭患者的免疫功能、減輕肝臟炎癥;呂建林等[20]對180只SPF級Wistar大鼠的研究表明,解毒化瘀顆??赡芡ㄟ^上調(diào)Mfn1和Mfn2的表達抑制線粒體分裂,推動線粒體結(jié)合,降低碎片化現(xiàn)象,保護線粒體,從而對肝衰竭大鼠發(fā)揮保護作用。
本研究對10項RCTs進行Meta分析(共601例患者)發(fā)現(xiàn),加用解毒化瘀顆粒(治療組)治療ACLF優(yōu)于單用西醫(yī)治療(對照組)。經(jīng)過4周、8周的治療周期后,在總有效率、死亡率、MELD評分、TBiL、ALB、ALT、PTA指標方面,治療組均優(yōu)于對照組(P <0.05),如在ALT 指標上,第4 周的分析結(jié)果為MD=-33.88,95%CI(-45.66,-22.10),P<0.000 01,第8周的分析結(jié)果為MD=-19.45,95%CI(-25.63,-13.27),P<0.000 01。同時可以看出,第8周的治療效果優(yōu)于第4周,表明持續(xù)使用解毒化瘀顆粒進行治療,可使ACLF患者獲得更佳的療效。
通過生物信息學進一步分析解毒化瘀顆粒治療ACLF的作用機制,PPI拓撲分析發(fā)現(xiàn)核心靶點主要為細胞色素P450(CYP450)氧化酶家族成員,如CYP3A4、CYP1A2、CYP2C9等,此外還有ABCG2、ADK、NQO1。CYP450酶在藥物、類固醇、致癌物及許多化學品的代謝中起到重要作用。臨床上90%的藥物需經(jīng)CYP450酶代謝,能力最強的成員為CYP3A4,是人體含量最豐富的肝藥酶。其活性被誘導或被抑制會導致某些外源性物質(zhì)產(chǎn)生肝毒性,從而引起肝損傷,甚至有研究認為該基因的高表達與惡性腫瘤進展有關(guān)[22]。醌氧化還原酶(NQO1)在肝細胞內(nèi)起到抗氧化作用,其表達水平受Nrf2信號通路調(diào)控,NQO1的誘導或敲除分別與氧化應激易感性的降低或增加有關(guān)[23]。研究發(fā)現(xiàn)增強肝衰竭大鼠NQO1等因子的表達,能夠緩解細胞炎癥反應和細胞凋亡[24]。
對52個交集靶點進行富集分析發(fā)現(xiàn),解毒化瘀顆粒干預ACLF的生物途徑主要涉及類固醇代謝、激素代謝、酒精代謝、細胞基質(zhì)連接、黏著斑、囊泡腔、鐵離子結(jié)合、四吡咯結(jié)合等,而KEGG信號通路主要有化學致癌作用-受體激活、亞油酸代謝、類固醇激素生物合成、細胞色素P450代謝通路、花生四烯酸代謝、膽汁代謝等。亞油酸是不飽和脂肪酸的一種,屬于人體必需脂肪酸。它們的衍生物如前列腺素、血栓素和白三烯等,參與炎癥和免疫等重要病理過程[25]。研究[26]發(fā)現(xiàn)亞油酸可通過抑制肝星狀細胞的激活或增殖來改善脂肪肝纖維化?;ㄉ南┧崾巧矬w內(nèi)分布最廣泛的一種omega-6多不飽和脂肪酸,是許多生物活性物質(zhì)的直接前體[27];細胞色素P450代謝途徑能將花生四烯酸代謝為二十碳三烯酸和類花生酸等;研究表明兩者能起到抑制肝臟炎癥、減少細胞凋亡、抗肝纖維化的作用[28-29]。
解毒化瘀顆粒中治療ACLF的主要化學成分有7個,這些化學成分均具有廣泛的藥理活性,如8-異戊烯基山奈酚有抗氧化、抗腫瘤、抗炎、抗菌等作用[30]。異鼠李素同樣有著豐富的藥理作用,研究發(fā)現(xiàn)其能夠有效緩解藥物誘導的小鼠肝損傷,且保護作用與其抗炎和抗氧化作用有關(guān),可能是通過調(diào)控MAPK/Nrf-2等信號通路發(fā)揮作用[31]。亦有研究表明,異鼠李素可抑制肝星狀細胞活化并降低細胞外基質(zhì)的形成和自噬,有顯著的抗肝纖維化作用[32]。
綜上所述,解毒化瘀顆粒治療ACLF具有多途徑、多成分的作用機制,包括抑制肝臟炎癥、抗肝纖維化、減少脂質(zhì)蓄積、抗氧化、改善肝功能等作用。本研究通過對解毒化瘀顆粒的Meta分析及生物信息學分析表明,其治療ACLF療效確切,且具有豐富的作用機制。