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    水稻類病斑突變體基因克隆及發(fā)生機制研究進展

    2022-07-16 11:47:23沈旺鑫史小品杜海波馮志明陳宗祥胡珂鳴范江波左示敏
    江蘇農(nóng)業(yè)學報 2022年3期
    關鍵詞:分子機制基因克隆表型

    沈旺鑫 史小品 杜海波 馮志明 陳宗祥 胡珂鳴 范江波 左示敏

    摘要: 類病斑突變體 (Lmms) 是研究植物細胞死亡和防御反應機制的重要材料。本文對水稻類病斑突變體的最新研究進展進行了綜述。在此基礎上,對進一步加強類病斑突變體及其抑制突變體基因的鑒定與克隆、解析病健組織間細胞命運的精細調控機制,以及如何利用類病斑突變體開展抗逆分子設計育種進行了討論。

    關鍵詞: 水稻; 類病斑突變體; 表型; 基因克隆; 分子機制

    中圖分類號: Q785?? 文獻標識碼: A?? 文章編號: 1000-4440(2022)03-0837-12

    Research advances in gene cloning and occurrence mechanism of rice lesion mimic mutants

    SHEN Wang-xin 1 , SHI Xiao-pin 1 , DU Hai-bo 1 , FENG Zhi-ming 1,2 , CHEN Zong-xiang 1,2 , HU Ke-ming 1 , ?FAN Jiang-bo 3 , ZUO Shi-min 1,2,4

    (1.Jiangsu Key Laboratory of Crop Genomics and Molecular Breeding, Yangzhou University/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou 225009, China; 2.Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province, Yangzhou University/Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province, Yangzhou 225009, China; 3.School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China; 4.Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China)

    Abstract:? Lesion mimic mutants (Lmms) are important materials for studying the mechanisms of plant cell death and defense responses. The current research progress of rice Lmms was summarized in this article. Furthermore, we discussed the strengthen of identification and characterization of more rice ?Lmms ?genes and relative inhibition genes, the elucidation of sophisticated regulating mechanism for the fate of cells between lesion tissue and its adjacent healthy tissue, and how to design biotic and abiotic stress resistance/tolerance breeding using the knowledge from Lmms.

    Key words: rice; lesion mimic mutants; phenotype; gene cloning; molecular mechanism

    植物在應對一些病原菌或病原小種侵染時會在侵染點附近產(chǎn)生過敏反應(Hypersensitive response, HR),即引起侵染點附近的細胞程序性死亡(Programmed cell death,PCD),以限制病原菌的侵染定殖,使植物產(chǎn)生抗病反應。當然,在寄主-病原菌間的長期協(xié)同進化過程中,不少病原菌或生理小種可以通過多種方式適應或抑制抗病反應,在寄主植物上成功定殖進而殺死寄主細胞,產(chǎn)生病斑,危害植物生長發(fā)育。自然界中,由于基因突變,有些植物材料在沒有病原菌侵染的情況下,其葉片、葉鞘、莖稈等不同部位也會自發(fā)形成類似病斑癥狀的表型,研究人員將這類材料命名為類病斑或假病斑突變體 [1] 。絕大多數(shù)類病斑突變體被發(fā)現(xiàn)與植物抗病性密切相關,可顯著增強防御相關基因的表達,激活防御反應,抑制病原菌的生長,增強抗病性 ?[2-17] ,因此,類病斑突變體的產(chǎn)生多數(shù)被認為與植物的PCD有關。然而,由于防御系統(tǒng)的持續(xù)或不當激活,多數(shù)類病斑突變體均存在不同程度的生長發(fā)育不良,但也有少數(shù)突變體表現(xiàn)正?;蚴苡绊戄^小 [18-19] ,這暗示其在作物廣譜抗病育種中具有重要的應用前景。因此,廣泛篩選不同類型的類病斑突變體,克隆相應基因并解析其發(fā)生機制,是研究植物抗病分子機制的重要策略,也將為植物抗病分子育種提供新思路,具有重要的理論價值和實際意義。

    有關類病斑突變體基因的定位克隆,早期在擬南芥中的研究較多,目前在擬南芥 [2-3] 、水稻 [4-5,7,10-11] 、玉米 [6] 、花生 [8] 和大豆 [9,12] 等作物中也有廣泛報道。水稻是重要的糧食作物,為全世界一半以上的人口提供食物,研究和鑒定水稻中的類病斑突變體基因具有重要的意義。截至目前,人們已報道了水稻中近100個水稻類病斑突變體,克隆了40余個相關基因 [13-106] 。本文對這些類病斑突變體的表型特征和遺傳行為進行總結,進而對已克隆的基因及其影響類病斑產(chǎn)生的機制進行歸納,在此基礎上對水稻類病斑突變體的下一步研究重點進行討論和展望。本文希望對從事或欲了解該領域的研究者提供最新的進展介紹,同時希望吸引更多研究者在水稻類病斑的產(chǎn)生機制以及如何利用其產(chǎn)生機制開展抗病分子育種研究等方面開展深入思考與討論,最終為水稻抗病機制解析及育種實踐提供新理論和新思路。

    1 水稻類病斑突變體的類型

    1.1 水稻類病斑突變體的表型復雜多樣

    自水稻第一個類病斑突變體( Sekiguchi lesion, sl ) [17] 被發(fā)現(xiàn)以來,已報道的近百個水稻類病斑突變體 [4-5,7,10-11,13-106] 在類病斑表型上存在明顯差異,這也可能是不同學者采用差異化命名方式的緣故,但多數(shù)是以spot leaf(spl)、lesion mimic(lm)和lesion resembling disease(lrd)等開頭進行命名。

    總體而言,類病斑突變體間的癥狀差異主要表現(xiàn)在病斑形狀和顏色上,如突變體spl31 [38] 和spl y181? [43] 的類病斑形狀為不規(guī)則型,而spl24 [19,34] 和 dj-lm? [88] 等則表現(xiàn)出非常規(guī)則的類病斑形狀。在顏色上,分別有黑色(SPL3 [6] 和spl16 [30] )、棕紅色(spl18 [31] 和lrd33 [54] )、黑褐色(spl33 [40] 和SPL35 [42] )和白色(spl20 [30] )等多種類型。

    另外,不少突變體的類病斑表型呈現(xiàn)一定的組織特異性、發(fā)育依賴性以及易受環(huán)境因素誘導等特征,同時,多數(shù)類病斑突變體的表型會隨著植株的生長發(fā)育而顯著加重(尤其是在孕穗期后期)。如此復雜多樣的類病斑表型,表明水稻類病斑形成的機制網(wǎng)絡十分復雜。

    1.2 多數(shù)類病斑突變體呈現(xiàn)發(fā)育依賴性特征

    絕大多數(shù)類病斑突變體的病斑產(chǎn)生與植株生長發(fā)育的進程相關,呈現(xiàn)出一定的發(fā)育依賴性特征。如spl1和lbsl1等突變體在播種后15 d左右的早期幼苗中就會出現(xiàn)明顯的類病斑癥狀 [30] ,spl29 [36] 和lmm1 [40] 等突變體的幼苗則分別要到3葉期或4葉期時才會出現(xiàn)類病斑癥狀,而spl11 [25] 和lmm4 [83] 等突變體在苗期基本沒有癥狀,要到分蘗期后才會出現(xiàn)類病斑癥狀。總體而言,隨著生長發(fā)育的進行,大多數(shù)類病斑突變體的癥狀會逐漸加重,說明生長發(fā)育進程對類病斑的形成會產(chǎn)生顯著影響。

    1.3 外界環(huán)境因素會誘導或抑制類病斑癥狀的發(fā)生

    外界環(huán)境因素包括光照、濕度、溫度等,不少研究發(fā)現(xiàn)這些環(huán)境因素會或多或少影響類病斑癥狀的發(fā)生或發(fā)生程度。研究結果顯示,絕大部分水稻類病斑突變體都是受光照影響。通過鋁箔片等遮光處理,發(fā)現(xiàn)spl30 [37] 和SPL35 [42] 等水稻類病斑突變體葉片的遮光部分不會出現(xiàn)類病斑癥狀,說明它們的表型是受光照誘導的。spl7 [23,54] 和lrd32 [86] 等的類病斑表型受溫度影響,如spl7在26 ℃以下不會出現(xiàn)類病斑,但在高于35 ℃時葉片上會出現(xiàn)明顯的類病斑癥狀;與之相反,lrd32的類病斑癥狀在低溫(23 ℃)條件下則發(fā)生得非常明顯。在類病斑突變體 lrds 的研究中還發(fā)現(xiàn),類病斑癥狀的產(chǎn)生還受光波長的影響,如lrd32和lrd40在紅光(波長626~ 629 nm)、藍光(波長465~ 468 nm)和白光(藍光+黃光混合,波長分別為465~ 468 nm 和556~ 559 nm)下均可產(chǎn)生類病斑癥狀,而lrd35和lrd37在藍光和白光下、lrd36只在白光下產(chǎn)生類病斑表型 [54] 。有關濕度影響類病斑癥狀的研究在水稻上還未見報道,但在擬南芥中,有研究者發(fā)現(xiàn),濕度較高的環(huán)境會抑制 cpnine 突變體的類病斑癥狀產(chǎn)生 [84] 。總體而言,多數(shù)研究結果顯示,外界環(huán)境因素對水稻類病斑的產(chǎn)生存在顯著影響。

    1.4 類病斑癥狀呈現(xiàn)一定的組織特異性和非特異性特征

    比較不同類病斑突變體的癥狀表型,發(fā)現(xiàn)不同突變體的類病斑癥狀在發(fā)生位置上存在明顯差別(圖1)。如,突變體spl22 [30] 、lmes1 [50] ?和ltn1 [53] ?的類病斑癥狀會特異地出現(xiàn)在葉尖上;而spl2 [18] 和spl30 [37] 的類病斑則分布在葉片的一側。突變體spl19 [30] 、spl26 [34] 和lrd33 [54] 無論在苗期還是生育后期,其在葉脈附近均沒有類病斑癥狀,而主要發(fā)生在葉脈兩側。與之相反,spl31的類病斑癥狀則會特異地出現(xiàn)在葉脈上 [17] 。

    絕大部分類病斑突變體的類病斑癥狀均出現(xiàn)在葉片上,但也有少數(shù)突變體的類病斑癥狀會同時在葉鞘和莖稈等組織部位發(fā)生。如,突變體rlin1 [65] 除了在葉片上有類病斑癥狀外,在葉鞘上也有分布,但是突變體nls-1D [74] 的類病斑癥狀則特異地出現(xiàn)葉鞘上。一般而言,組織非特異性通常是指類病斑發(fā)生在多個組織部位,而發(fā)生在多個組織部位的類病斑突變體通常會出現(xiàn)早衰特征,如突變體spl29 [36] 和SPL35 [42] 。類病斑突變體的組織特異性和非特異性特征,說明突變的相應基因在植物生長發(fā)育中具有組織/功能特異性或非特異性表達。

    2 水稻類病斑突變體的遺傳方式與基因克隆

    2.1 水稻類病斑突變體的遺傳方式

    截至目前,所有已報道的水稻類病斑突變體的遺傳模式均符合孟德爾遺傳定律,其中絕大多數(shù)都呈現(xiàn)單基因隱性遺傳,且多為靶基因功能喪失型突變 [10-99] 。但是,也有少數(shù)突變體表現(xiàn)為單基因顯性和/或半顯性遺傳,如spl18 [31] 、OsNPR1/NH1 [58-59] 和rlr1 [69] 等突變體。此外,突變體lrd32 [54] 、nls-1D [74] 和 lmm5 [93] 中的類病斑癥狀受雙基因控制,呈現(xiàn)雙基因隱性遺傳和/或雙基因半顯性遺傳模型。

    2.2 水稻類病斑突變體及抑制突變體的基因克隆

    隨著遺傳學和分子生物學的快速發(fā)展,目前已有41個水稻類病斑突變體中的目標基因被克隆(表1)。其中,大多數(shù)是通過圖位克隆獲得的,但也有少數(shù)采用其他方法,如最新報道的突變體nbl3 [99] ,是采用T-DNA插入位點的側翼序列法分離獲得的。這表明,經(jīng)典的圖位克隆仍然是目前分離水稻類病斑突變體基因的最主要方法。

    表1歸納了目前已克隆的41個引起類病斑癥狀的基因及其相關信息。從基因號上可知,這些基因分布在水稻12條染色體上,其中1號、3號和12號染色體上分布得最多,各有5個基因被克隆;最少的為6號和9號染色體,均只克隆到1個基因。這些基因編碼的蛋白質涉及多種功能類別,但總體以酶類居多,有20個,如?;D移酶、脂氫過氧化物裂解酶、脂肪酸脫氫酶和ATP-檸檬酸裂解酶A等;其次為編碼未知生理功能的蛋白質,總計有16個,如鋅指蛋白、錨定蛋白、含NB-ARM結構域的新型蛋白質等;其余5個分別編碼具有轉錄因子、真核生物翻譯釋放因子、剪切因子等功能的蛋白質因子。這些基因廣泛涉及葉綠體、線粒體和高爾基體等細胞器發(fā)育調控,水楊酸(SA)、乙烯(ET)、茉莉酸(JA)和脫落酸(ABA)等激素合成與代謝信號,免疫信號、光合作用以及泛素化等多種生理生化途徑。另外,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)突變體均表現(xiàn)對稻瘟病或白葉枯病的抗性增強,不同程度地激活免疫反應。最近報道了一個編碼五肽重復序列蛋白質的基因OsNBL3,其突變除了表現(xiàn)抗病性之外,還表現(xiàn)出對非生物逆境如鹽害具有較強的抗性 [99] 。相比于類病斑突變體基因,水稻類病斑抑制突變體基因的克隆進展總體較慢,迄今只有1例關于spl11類病斑表型的抑制基因SDS2被鑒定克隆的報道 [26] 。研究結果顯示,SDS2編碼1個特異性類受體激酶,參與調控免疫反應過程中的一個重要信號分子活性氧(Reactive oxygen species,ROS)的生產(chǎn)。

    總體而言,目前已克隆的這些類病斑及類病斑抑制基因所編碼的蛋白質涉及的細胞功能復雜多樣,但多數(shù)均會激活對生物甚至非生物逆境的抗性,這將為進一步研究細胞死亡相關的免疫調控網(wǎng)絡提供重要的基因資源。

    3 水稻類病斑的產(chǎn)生機制

    植物細胞在受到各種環(huán)境刺激后的早期階段一般都會產(chǎn)生ROS,主要包括超氧陰離子(O2? ·- )、過氧化氫(H2 O2 )、羥基自由基以及一氧化氮(NO)等成分。ROS迸發(fā)是一個十分復雜的過程,過量積累會產(chǎn)生氧化脅迫,破壞細胞的結構,損傷DNA、脂類、蛋白質等生物大分子,并最終導致細胞死亡 [107] 。ROS也是調控植物生長發(fā)育、逆境響應和PCD等生理過程的重要信號分子 [108-111] 。已報道的幾乎所有類病斑突變體中均檢測到了ROS過度積累現(xiàn)象,因此,盡管這些突變體基因的信號調控網(wǎng)絡/機制還不清楚,但結合ROS的生理功能,似乎均可將這些類病斑的產(chǎn)生歸結為ROS的異常迸發(fā)(圖1)。為此,我們從可能誘導ROS產(chǎn)生的因素出發(fā),結合已克隆的類病斑突變體基因的生物學功能,將當前水稻類病斑的產(chǎn)生機制歸納為以下3個方面:

    3.1 防御反應異常引起的類病斑

    泛素化修飾在調節(jié)植物免疫反應上具有極其重要的作用,很多防御蛋白質在完成信號傳遞后會通過泛素化修飾途徑被及時降解,以免引起過度免疫反應影響正常生長發(fā)育。在哺乳動物中,研究發(fā)現(xiàn) BAG 家族基因直接參與啟動PCD。ebr1基因編碼一個E3泛素連接酶,在細胞內(nèi)可與BAG家族蛋白質OsBAG4直接互作并通過泛素化促進其降解;相反,ebr1突變體中OsBAG4的蛋白質積累水平明顯增高,激發(fā)了PCD和免疫反應(圖1),導致類病斑的產(chǎn)生 [67] 。G蛋白復合體在植物免疫信號調控中也具有重要作用 [112] 。其中編碼小G蛋白的基因OsRac1激活表達,會引起ROS積累、激活植物免疫反應 [87] 。spl11基因編碼U-box類型E3泛素連接酶,可促進RhoGAP蛋白SPIN6的泛素化降解,而SPIN6蛋白具有RhoGAP活性并可與OsRac1結合,促進OsRac1-GTP水解,使其轉變?yōu)镺sRac1-GDP失活態(tài)。因此,spl11和SPIN6基因的突變均可引起OsRac1基因的持續(xù)激活,造成ROS過度積累,引起細胞壞死 ?[25,27] 。通過誘變,在spl11背景中獲得1個無類病斑表型的抑制突變體sds2 [97] 。圖位克隆結果顯示,SDS2可與SPL11直接互作并磷酸化SPL11,SPL11又可以泛素化SDS2引起其降解;進一步研究發(fā)現(xiàn),SDS2可以與類受體胞質激酶OsRLCK118相互作用,后者可通過磷酸化OsRbohB,促進ROS的積累。這說明SDS2能否被及時地泛素化降解與ROS過度積累間密切相關,也解釋了SDS2的突變?yōu)楹文芤种苨pl11類病斑表型的機制 [26] 。此外,SPL35編碼1個包含CUE結構域的蛋白質,能直接與泛素結合酶OsUBC5a和Delta-COP1、Delta-COP2發(fā)生互作,這些互作蛋白質表達水平的下調均會形成類似SPL35突變體的類病斑表型和激活防衛(wèi)反應,暗示SPL35突變體的類病斑癥狀產(chǎn)生也與泛素化途徑受影響有關 [42] 。

    SA、ET、JA和ABA是調控植物免疫反應的重要激素信號分子。NPR1是水楊酸介導的免疫反應中的重要中樞性調節(jié)因子 [100] 。OsCUL3a突變體中的靶基因OsCUL3a編碼1個基于Cullin3的環(huán)型E3泛素連接酶,其可以與OsRBX1a、OsRBX1b互作形成1個多亞基環(huán)型E3泛素連接酶;同時OsCUL3a也可與OsNPR1互作,并通過26 S蛋白酶體系統(tǒng)促進OsNPR1的降解。因此,OsCUL3a突變體的類病斑產(chǎn)生應該與OsNPR1持續(xù)激活引起免疫反應有關 [85] 。hpl3突變體表現(xiàn)整片葉的類病斑表型,研究結果顯示,OsHPL3可通過影響JA等的含量來調控免疫反應 [55,104] ,最終影響類病斑的產(chǎn)生。OsEDR1的同源基因SPL3可通過影響ABA和ET的生物合成,調控活性氧代謝和葉片衰老,導致類病斑表型 [6] 。Osssi2突變體中的SA和/或苯丙噻唑硫代乙酸甲酯(BTH)含量明顯增加,并特異性誘導了OsWRKY45的微弱表達,從而持續(xù)激活免疫反應,產(chǎn)生類病斑癥狀 [63] 。

    RAR1是植物防衛(wèi)反應中的關鍵調控因子 [105] 。研究結果顯示,突變體ttm1的類病斑表型與OsPti1a基因被破壞有關,該基因編碼一個蛋白質激酶,負調控水稻的防御反應;而ttm1抑制OsRAR1基因表達時,可顯著抑制突變體中的免疫反應,表明OsPti1a基因負向調節(jié)OsRAR1 介導的免疫反應 [60] ??共∠嚓P蛋白OsEDR1可與OsMPKK10.2互作并抑制其活性,當病原菌入侵時,OsMPKK10.2被激酶磷酸化后會激活OsMPK6,OsMPK6進而又磷酸化OsEDR1并促進其降解,進一步釋放OsMPKK10.2,使得OsMPKK10.2-OsMPK6信號級聯(lián)被放大,增強水稻的免疫反應。因此,在OsEDR1突變體中,OsMPKK10.2和OsMPK6的活性均得到了明顯增強,免疫反應被持續(xù)激活,引起類病斑癥狀。在OsEDR1突變體中,如果敲除OsMPKK10.2,則雙突變體的類病斑癥狀明顯減弱,證明OsEDR1突變體產(chǎn)生的類病斑癥狀與OsMPKK10.2激活的免疫反應有關 [103] 。

    總體而言,目前有關免疫反應中如何快速誘導PCD和ROS的產(chǎn)生機制還不清楚,利用更多的類病斑突變體有望加快這一調控網(wǎng)絡的解析。

    3.2 光合系統(tǒng)和細胞器異常引起的類病斑

    目前,在已克隆的類病斑突變基因中,有6個基因編碼的蛋白質亞細胞定位于葉綠體、4個定位于內(nèi)質網(wǎng)、2個定位于線粒體和1個定位于過氧化物酶體。有報道顯示,植物細胞的細胞壁、質膜、葉綠體、線粒體、過氧化物酶體和內(nèi)質網(wǎng)等部位均可產(chǎn)生ROS,其中葉綠體、線粒體、過氧化物酶體是ROS 產(chǎn)生的最主要細胞器 [113] 。不少研究結果顯示,光合系統(tǒng)中存在1個精準的穩(wěn)態(tài)調控系統(tǒng),該系統(tǒng)失衡一般均會引起ROS積累 [71] 。如,SPL32編碼1個鐵氧還蛋白依賴性谷氨酸合酶 Fd-GOGAT ,該基因編碼產(chǎn)物定位于葉綠體,其突變會降低光呼吸速率,破壞ROS清除途徑,導致ROS大量積累,引起細胞死亡 [39] 。ELL1編碼細胞色素P450單加氧酶,參與葉綠體發(fā)育,其突變體ELL1的葉綠素含量明顯下降,葉綠體降解相關基因上調表達,葉綠體降解嚴重,最終導致ROS的過量積累,引起細胞壞死 [86] 。有研究結果顯示,葉綠素合成途徑中許多酶的功能喪失或葉綠素合成受阻均可能導致類病斑表型 [65] 。葉綠素合成關鍵酶 LPOR和NADPH 可催化原葉綠素酸酯生成葉綠素酸酯, fgl 突變體中總葉綠素酸酯和感光葉綠素酸酯含量均明顯下降,在強光照條件下,突變體 fgl 中新出的葉片會迅速黃化并產(chǎn)生類似病變的癥狀 [70] 。WLL1編碼二氧四氫蝶啶合成酶,參與核黃素合成,由于WLL1基因功能的缺失引發(fā)ROS積累和葉綠體的退化,從而引起突變體發(fā)生細胞死亡 [106] 。

    突變體 dj-lm 中的靶基因編碼蛋白質OsDRP1E,其突變直接影響線粒體嵴的形態(tài)發(fā)生變化。在哺乳動物中,線粒體嵴異常會導致細胞色素c從線粒體釋放到細胞質中,誘導細胞內(nèi)富含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶產(chǎn)生活性,發(fā)生凋亡蛋白酶的級聯(lián)反應,降解細胞內(nèi)的重要蛋白質,導致細胞死亡 [114] 。因此,推測突變體 dj-lm 中的類病斑表型可能也與線粒體嵴異常導致線粒體中細胞色素c不正常釋放有關,但是具體機制尚不明確 [88] 。最近報道的OsNBL3基因編碼一個PPR蛋白,也是線粒體發(fā)育和功能發(fā)揮的重要組成部分,其破壞可使水稻發(fā)生類病斑 [99] 。SPL28蛋白參與高爾基體的物質運輸途徑,可能參與囊泡運輸調控,其突變體會破壞H2 O2 的平衡、光合系統(tǒng)的穩(wěn)定以及光合脅迫適應性,引起類病斑癥狀和早衰現(xiàn)象 [35,71] 。這些研究結果表明,光合系統(tǒng)及一些細胞器的功能正常與否可能是影響一些突變體產(chǎn)生類病斑的原因之一,但是具體的分子調控機制還不清楚,有待深入研究。

    3.3 其他途徑異常引起的類病斑

    研究結果顯示,一些涉及生長發(fā)育信號等途徑的異常,也會引起ROS的過度積累,最終觸發(fā)細胞死亡(圖1)。如,OsLOL1編碼水稻中的1個C2C2型鋅指蛋白,可與OsbZIP58互作并通過其激活OsKO2基因表達,進而影響赤霉素生物合成和超氧化物歧化酶的活性,導致ROS清除能力下降,造成局部的細胞死亡 [57,101] 。 LMR 編碼1個與多種細胞活性相關(AAA-type)的ATP酶,可介導多囊泡體的囊泡運輸,抑制水稻的免疫反應和細胞死亡,因此其突變體表現(xiàn)為免疫反應過度激活和細胞壞死 [51] 。noe1編碼水稻過氧化氫酶 OsCATC ,負責降解H2 O2 ,在noe1突變體中的H2 O2 含量明顯增高,同時激活硝酸還原酶活性并且促發(fā)一氧化氮(NO)的產(chǎn)生,而NO也是參與水稻中H2 O2 ?誘導葉片細胞死亡的重要因子 [14] 。spl7 編碼1個熱脅迫轉錄因子,在其敲除和過表達時均會引起ROS積累,導致類病斑表型,在spl7突變體中抑制 NADPH 氧化酶活性時,可明顯抑制突變體中的ROS積累,減弱類病斑表型 [24] 。

    在醫(yī)學研究中,5-羥色胺是一種神經(jīng)遞質,能保護神經(jīng)元免受興奮神經(jīng)毒素的損害,但5-羥色胺有致死細胞的作用 [17] 。SPL5編碼SF3b3剪切因子,可能是通過調節(jié)植物RNA剪接來負調控細胞死亡和抗性應答 [22] 。最新的研究結果顯示,SPL5可能是通過OsWRKY14負向調控5-羥色胺代謝,因此,SPL5突變體中的類病斑癥狀可能與其積累過多的5-羥色胺有關,當然,SPL5基因突變也可能會影響其他觸發(fā)類病斑的生物學途徑 [28] 。rlin1編碼1個可能參與四吡咯生物合成途徑的糞卟啉原Ⅲ氧化酶,因為堿基替換產(chǎn)生了錯義突變,形成氨基酸的變化,異源表達rlin1時可以互補rlin1的類病斑表型,進一步通過組織化學分析結果表明,rlin1突變體中伴隨著ROS的積累,表明四吡咯參與了水稻類病斑的形成 [65] 。spl29編碼尿苷二磷酸- N -乙酰葡糖胺焦磷酸化酶,在spl29突變體中,超氧化物歧化酶活性增加而過氧化氫酶活性正常,這導致ROS的積累,造成葉片早衰(細胞死亡加快的一種)等類病斑表型 [36] 。

    上述研究結果顯示,植物中的細胞死亡及其調控網(wǎng)絡異常復雜,通過發(fā)掘更多類病斑突變體材料并解析其分子機制是解析相關網(wǎng)絡的重要途徑之一。

    4 研究展望

    綜上可知,類病斑突變體的鑒定及基因克隆將有力推進免疫信號網(wǎng)絡的研究,加上多數(shù)類病斑突變體均具有較強的抗病表現(xiàn),因此加強類病斑突變體基因的鑒定、克隆具有十分重要的理論價值和實際意義。結合當前研究中存在的問題,我們提出3個圍繞類病斑突變體材料的未來重點研究方向。

    4.1 加強類病斑突變體及其抑制基因的克隆和相關調控網(wǎng)絡研究

    迄今為止,大約有100個水稻類病斑突變體的遺傳研究被報道,但只有41個基因被克隆,有關類病斑表型的抑制子基因僅克隆到個別。造成這一狀況的主要原因可能與不少類病斑突變體的表型微弱、易受環(huán)境影響、不易鑒定有關,也可能與從事這一領域的研究人員偏少有關。細胞凋亡無論在動物還是在植物的生命活動中均是一個極其重要的生命事件,因此解析其中的信號調控網(wǎng)絡/機制無疑具有十分重要的理論價值和意義。植物類病斑突變體材料是研究植物細胞凋亡控制機制的重要材料,因此,未來應該加強水稻類病斑突變體尤其是微弱表型突變體及類病斑抑制基因的鑒定和克隆工作。對于已克隆的類病斑突變體基因,應加強其互作蛋白質的篩選、鑒定及在調控類病斑表型上的生物學功能解析。

    此外,目前報道的類病斑突變體涉及組織特異性、時空特異性、病斑規(guī)則和不規(guī)則等多種類型,分離其中的靶基因固然重要,但對這些靶基因之間的遺傳關系研究也是一個十分重要的內(nèi)容,目前卻鮮有相關的研究報道。因此,未來可通過廣泛配制不同類型突變體之間的雜交分析群體,加強相關突變體基因間的遺傳關系分析。

    4.2 加強病、健組織間的細胞精細調控機制研究

    已報道的類病斑突變體中有些癥狀呈現(xiàn)大小、形狀一致的規(guī)則特征,也有些規(guī)則性不強。但是,無論哪種突變體,其細胞壞死癥狀均不可能無限制地擴大,或者說有一種機制能被快速激活以確保病斑周邊的細胞存活,解析這一精細調控機制具有極其重要的理論價值和實際意義。在寄主與病原菌互作中,由病原菌效應子觸發(fā)的免疫反應ETI通常伴隨著PCD,但也不可能無限制地擴展。最近研究發(fā)現(xiàn),SA免疫信號中的關鍵基因OsNPR1,是ETI中決定病斑與健康組織間細胞死亡或生存的關鍵調控因子,這一成果發(fā)表在國際著名期刊《Cell》上 [100] 。值得注意的是,在類病斑突變體中,有些引起細胞壞死的基因似乎并不是免疫信號中的基因,而是參與葉綠體、線粒體等細胞器發(fā)育的關鍵基因。這暗示在這些突變體中,類病斑周邊健康細胞中有快速替代該基因完成相應功能的其他基因;但是,由于類病斑還是有規(guī)則地出現(xiàn),這又說明這一功能替代機制與基于SA和OsNPR1激活的長距離細胞生存調控機制間存在明顯不同。因此,未來有必要加強類病斑毗鄰的健康細胞存活機制的研究。

    4.3 加快類病斑突變體在抗病耐逆分子設計育種中的應用研究

    絕大多數(shù)類病斑突變體均表現(xiàn)出對白葉枯病和/或稻瘟病的較強、較廣譜的抗性。然而,由于持續(xù)激活免疫反應,多數(shù)類病斑突變體的生長發(fā)育和谷粒產(chǎn)量均存在不同程度的下降。因此,如何合理利用這些類病斑突變體的廣譜抗病機制,開展抗病分子設計育種研究,值得深入探索。為此,我們初步提出3個研究設想:一是選擇時空特異表達的類病斑突變體或弱病斑突變體,開展育種應用,實現(xiàn)不顯著減少產(chǎn)量損失的同時提高抗病性;二是結合絕大多數(shù)突變體中的靶基因均為功能喪失型突變的特征,未來可以嘗試采用病原菌特異誘導的RNAi技術,創(chuàng)建一些特異誘導表達的轉基因廣譜抗病水稻;三是可以嘗試通過基因編輯技術,創(chuàng)制一些類病斑突變體基因不同等位變異材料,嘗試從中篩選弱突變等位變異,實現(xiàn)產(chǎn)量與抗性的平衡。另外,最近研究結果顯示,類病斑突變體顯著增強了對非生物逆境的耐性,這明顯拓寬了以往對類病斑突變體抗病性增強的認識,因此,未來可以加強觀測類病斑突變體在各種非生物逆境中的表型,探討在抗逆性育種中的潛在應用前景。總體而言,隨著各種分子技術及更多類病斑突變體的形成機制被解析,未來應該會有更多利用類病斑突變體開展抗病和抗逆分子設計育種的新思路產(chǎn)生。

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    (責任編輯:陳海霞)

    收稿日期:2021-11-23

    基金項目:國家自然科學基金項目(31872858);江蘇省重點研發(fā)計劃項目(BE2019339);江蘇省作物基因組學和分子育種重點實驗室開放課題(PL201905)

    作者簡介:沈旺鑫(1994-),男,江蘇揚州人,碩士研究生,主要從事水稻抗病遺傳分子育種。(E-mail) shen_wangxin@163.com

    通訊作者:左示敏, (E-mail) smzuo@yzue.edu.cn

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