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    馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族全基因組鑒定與表達(dá)分析

    2022-03-10 04:26:54馮建英李立芹魯黎明
    生物技術(shù)通報(bào) 2022年2期
    關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)域染色體馬鈴薯

    馮建英 李立芹 魯黎明

    (四川農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,成都 611130)

    轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors,TFs)是植物中一類(lèi)極其重要的調(diào)節(jié)因子,在應(yīng)激調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和信號(hào)傳導(dǎo)通路中起著關(guān)鍵性的作用[1-2]。它們可參與DNA結(jié)合和蛋白質(zhì)二聚化活動(dòng),從而在植物不同發(fā)育階段對(duì)不同組織中的基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控[3]。bHLH轉(zhuǎn)錄因子是植物體內(nèi)存在的第二大類(lèi)調(diào)節(jié)蛋白,因具有特定的bHLH結(jié)構(gòu)域而得名[4]。bHLH轉(zhuǎn)錄因子既可作為轉(zhuǎn)錄激活子又可作為轉(zhuǎn)錄抑制子,參與植物生長(zhǎng)發(fā)育、形態(tài)建成及應(yīng)答環(huán)境脅迫等過(guò)程,如調(diào)節(jié)類(lèi)黃酮與花青素的合成等[5]。研究植物bHLH基因的基本性質(zhì)、結(jié)構(gòu)及功能,對(duì)理解其在植物生長(zhǎng)發(fā)育及響應(yīng)脅迫中的作用有重大幫助。

    目前,已鑒定的植物bHLH家族成員數(shù)量較多,如在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中有162個(gè)[6],小 麥(Triticum aestivumL.)中有225個(gè)[7],白 菜(Brassica rapassp.pekinensis)中有230個(gè)[8],蘋(píng)果(Malus pumilaMill.)中有188個(gè)[9],桑樹(shù)(Morus notabilis)中有173個(gè)[10],苦蕎(Fagopyrum tataricum)中有164個(gè)[11],茄子(Solanum melongenaL.)中有121個(gè)[12],銀杏(Ginkgo biloba)91個(gè)[13],玉米(Zea maysL.)161個(gè)[14]。研究表明,擬南芥轉(zhuǎn)錄因子bHLH104和bHLH115在其鐵穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮重要作用,bHLH104和bHLH115突變使擬南芥在鐵缺乏時(shí)耐受性明顯降低,而其過(guò)表達(dá)會(huì)強(qiáng)烈促進(jìn)鐵的積累[15-16]。在缺鐵條件下存在的NtbHLH1作為轉(zhuǎn)錄激活子定位于煙草細(xì)胞核,其過(guò)表達(dá)會(huì)導(dǎo)致根系變長(zhǎng),鐵螯合物還原酶的活性增強(qiáng)[17]。OsbHLH107可通過(guò)影響穗殼縱向細(xì)胞數(shù)量,進(jìn)而調(diào)節(jié)水稻籽粒大 ?。?8]。FtbHLH2、FtbHLH55及FtbHLH155等 基因在苦蕎花中高表達(dá),而FtbHLH67、FtbHLH70及FtbHLH157等基因卻在果實(shí)中高表達(dá),證實(shí)了苦蕎bHLH基因的組織表達(dá)特異性[11]。121個(gè)茄子bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員中,SmbHLH1與SmbHLH117參與到茄子花青素的生物合成過(guò)程中[12]。SlbHLH95表達(dá)上調(diào)會(huì)促進(jìn)番茄果實(shí)的成熟,并且對(duì)乙烯的敏感度會(huì)升高[19]。與此同時(shí),植物的bHLH成員還參與了脅迫響應(yīng)。如,西瓜的ClabHLH32、ClabHLH41、ClabHLH71、ClabHLH58以及擬南芥bHLH68、水稻bHLH035均參與了脫落酸(ABA)脅迫應(yīng)答[20-22];甜橙的bHLH18能夠調(diào)控抗氧化酶基因的表達(dá),從而增強(qiáng)其抗寒能力[23]。

    馬鈴薯(Solanum tuberosum)屬于茄科茄屬的一年生草本植物,適應(yīng)力強(qiáng)且產(chǎn)量大,是世界四大糧食作物之一,具有較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與藥用價(jià)值。目前,國(guó)內(nèi)外關(guān)于馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子方面的報(bào)道較少,劉玉匯[24]發(fā)現(xiàn)StbHLH1是調(diào)控花色素苷重要的協(xié)同調(diào)控因子,Tai等[25]研究發(fā)現(xiàn)bHLH家族在馬鈴薯中可能具有一定程度抗霜凍的能力。

    本研究通過(guò)對(duì)馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行全基因組鑒定,分析其序列特征、理化性質(zhì)、組織表達(dá)與脅迫響應(yīng)表達(dá)情況,并構(gòu)建其蛋白互作網(wǎng)絡(luò),以期為其功能研究提供理論基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    供試材料為馬鈴薯組培苗,品種為川芋10號(hào),由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)馬鈴薯研究中心提供。

    1.2 方法

    1.2.1 馬鈴薯bHLH家族的鑒定 從Pfam獲得bHLIH保守結(jié)構(gòu)域PF00010,并以此為參考序列,利用HMMER3.0軟件對(duì)馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(http://solanaceae.plantbiology.msu.edu/index.shtml)進(jìn)行檢索獲得候選序列。為保證候選序列的可靠性,運(yùn)用SMART在線軟件和NCBI-CDD(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd/)對(duì)其進(jìn)行完整保守域檢測(cè),去除冗余及不完整序列,保留僅有一個(gè)HLH結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列。

    1.2.2 bHLH蛋白理化性質(zhì)分析 利用在線軟件ExPASy中 的ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/),對(duì)馬鈴薯bHLH家族候選蛋白的氨基酸數(shù)、分子量等理化性質(zhì)進(jìn)行分析[26]。

    1.2.3 功能保守域和保守基序分析 利用WebLogo網(wǎng)站,對(duì)馬鈴薯bHLH氨基酸序列進(jìn)行保守域分析。同時(shí)利用MEME在線程序(http://meme-suite.org/tools/meme)對(duì)馬鈴薯bHLH基因序列進(jìn)行保守基序分析。

    1.2.4 同源性分析 從PlantTFDB網(wǎng)站下載擬南芥bHLH家族蛋白在TAIR上的序列號(hào),并獲取其氨基酸序列。使用軟件MEGA-X的NJ法和iTOL(https://itol.embl.de/itol.cgi)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),bootstrap值設(shè)為1 000[27]。

    1.2.5 馬鈴薯bHLH家族成員在染色體上的位置從馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中查找每個(gè)StbHLH基因的染色體位置信息,利用在線軟件MG2C(http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/)進(jìn)行染色體定位作圖。

    1.2.6 表達(dá)模式分析及qRT-PCR驗(yàn)證

    1.2.6.1 生物信息學(xué)分析 從馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)庫(kù)獲得StbHLHs基因在根、葉、塊莖組織及鹽、熱、甘露醇與脫落酸脅迫下的FPKM值[28-29],利用軟件TBtools繪制出其表達(dá)模式圖。

    1.2.6.2 組織表達(dá)模式分析 分別采集馬鈴薯組培苗的根、莖、葉,液氮速凍后,進(jìn)行總RNA的提取,并 采 用qRT-PCR方 法,對(duì)StbHLH2、StbHLH14、StbHLH15、StbHLH34、StbHLH39、StbHLH53、StbHLH57、StbHLH59、StbHLH66、StbHLH80、StbHLH90、StbHLH108等12個(gè)基因在馬鈴薯根、莖、葉中的表達(dá)量進(jìn)行分析。引物如表1所示。

    表1 引物序列Table 1 Primer sequences

    總RNA的提取方法以及qPCR的反應(yīng)程序如下:采用Trizol法提取總RNA,再將其反轉(zhuǎn)錄為cDNA,利用熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行基因相對(duì)表達(dá)量的測(cè)定。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4℃ 2 min;94℃ 5 s,60℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)。選用馬鈴薯EF1αL為內(nèi)參基因(EF1αL-F:5′-CTTGTACACCACGCTAAGGAG-3′;EF1αL-R:5′-GTCAATGCAAACCATTCCTTG-3′)。

    1.2.6.3 響應(yīng)非生物脅迫的表達(dá)模式分析 對(duì)生長(zhǎng)30 d的馬鈴薯組培苗進(jìn)行低鉀(10 μmol/L)、ABA(1 μmol/L)、干旱(5% PEG-6000)、高鹽(200 mmol/L Nacl)以及H2O2(10 mmol/L)處理,在處理后0、3、6和12 h取樣。采用qRT-PCR的方法,分析上述12個(gè)基因響應(yīng)非生物脅迫的表達(dá)模式??俁NA的提取方法以及qPCR的反應(yīng)程序見(jiàn)1.2.6.2。

    1.2.6.4 總RNA的提取及qPCR反應(yīng)程序 總RNA的提取方法以及qPCR的反應(yīng)程序見(jiàn)1.2.6.2。所有樣品設(shè)置為3次生物學(xué)重復(fù),用2-ΔΔCt方法計(jì)算相對(duì)表達(dá)量,運(yùn)用Excel 2010進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

    2 結(jié)果

    2.1 馬鈴薯bHLH家族成員的鑒定

    利用軟件HMMER 3.0對(duì)馬鈴薯蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,并通過(guò)NCBI和SMART等網(wǎng)站對(duì)保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)一步驗(yàn)證,剔除冗余,最后篩選出108個(gè)具有典型bHLH結(jié)構(gòu)域的馬鈴薯bHLH家族成員。根據(jù)各家族成員所在染色體的位置,將其編號(hào)為StBHLH1-StbHLH108。

    通過(guò)分析馬鈴薯bHLH家族蛋白的基本理化性質(zhì)(表2)。馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子蛋白序列所含的氨基酸數(shù)目為62(StbHLH62)-694(StbHLH84)。分子量為7 527.78(StbHLH62)-75 939.94 Da(StbHLH84)。理論等電點(diǎn)為4.55(StbHLH46)-10.40(StbHLH62)。

    表2 基本理化性質(zhì)分析Table 2 Analysis of basic physical and chemical properties

    續(xù)表Continued

    2.2 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析

    利用WebLogo在線程序,對(duì)馬鈴薯bHLH家族保守域進(jìn)行分析(圖1)。并通過(guò)在線工具M(jìn)EME對(duì)馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員進(jìn)行Motif的預(yù)測(cè),得到5個(gè)不同Motif保守元件(圖2)。其中,Motif1和Motif2為馬鈴薯bHLH家族成員所共有,并且位置相鄰。而Motif5卻僅在StbHLH1、StbHLH11、StbHLH12、StbHLH14這4個(gè)成員中存在。以上結(jié)果表明,HLH結(jié)構(gòu)域不是由一個(gè)或幾個(gè)特定的保守元件構(gòu)成的。

    圖1 bHLH保守結(jié)構(gòu)域的logoFig. 1 Logo of bHLH conservative domain

    圖2 馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析Fig. 2 Conserved motif analysis of bHLH transcription factor in S. tuberosum

    2.3 馬鈴薯bHLH家族蛋白的同源性分析

    根據(jù)鑒定出的馬鈴薯bHLH家族蛋白序列與隨機(jī)選取的擬南芥bHLH家族的30條氨基酸序列間的相似度,使用軟件MEGA-X構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)。結(jié)果(圖3)表明,138個(gè)bHLH轉(zhuǎn)錄因子被劃分為16個(gè)亞家族,其中,第10亞族的bHLH成員最少,為2個(gè),第16亞族最多,為27個(gè)。同一亞族成員具有相似保守基序。表明同一亞家族成員可能具有相類(lèi)似的功能,在馬鈴薯生長(zhǎng)發(fā)育中發(fā)揮類(lèi)似的作用。

    圖3 馬鈴薯bHLH家族蛋白系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)Fig. 3 Phylogenetic tree of bHLH family proteins in S. tuberosum

    2.4 馬鈴薯bHLH基因在染色體上的位置

    根據(jù)馬鈴薯基因組數(shù)據(jù)庫(kù)提供的StbHLHs的染色體位置信息,繪制其染色體定位模式圖(圖4)。結(jié)果表明,108個(gè)StbHLHs在馬鈴薯12條染色體上呈現(xiàn)不均勻分布。第1染色體分布的StbHLHs數(shù)量最多,為15個(gè);第11染色體分布的StbHLHs數(shù)量最少,為3個(gè)。其中第9和第10染色體上分布的StbHLH家族成員均為7個(gè)。以上結(jié)果表明,StbHLHs在馬鈴薯染色體上分布密度是不等的。第1和第2染色體上共有3對(duì)基因緊密連鎖,分 別 為StbHLH11/StbHLH13、StbHLH12/StbHLH14、StbHLH24/StbHLH26,屬于旁系同源基因。

    圖4 馬鈴薯bHLH家族基因的染色體定位Fig. 4 Chromosome localization of bHLH family genes in S. tuberosum

    2.5 馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)模式分析

    利用數(shù)據(jù)庫(kù)信息,分析108個(gè)StbHLHs在根、葉、塊莖中的表達(dá)模式,以及響應(yīng)鹽(150 mmol/L NaCl)、甘露醇、生長(zhǎng)素、脫落酸及赤霉素、熱(35℃)等非生物脅迫的表達(dá)行為,并利用軟件TBtools繪制了聚類(lèi)表達(dá)模式圖(圖5)。

    從圖5可以看出,StbHLHs在不同組織中的表達(dá)具有特異性。StbHLH2、StbHLH5、StbHLH18和StbHLH99等在3個(gè)組織中均具有較高的表達(dá)豐度,尤其是前兩者在葉片和塊莖中的表達(dá)值均為最高,表明它們可能主要參與馬鈴薯葉片及塊莖發(fā)育過(guò)程。然而,也有基因在這3個(gè)組織中均不表達(dá),如StbHLH1、StbHLH4、StbHLH10等。StbHLH12和StbHLH13僅在馬鈴薯葉片中有較低的表達(dá)量,而StbHLH17和StbHLH76卻只在葉片中不表達(dá)。StbHLHs的組織表達(dá)特異性進(jìn)一步揭示了馬鈴薯StbHLHs行使功能時(shí)的空間特征。

    圖5 馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)模式分析Fig. 5 Expression pattern analysis of bHLH transcription factor in S. tuberosum

    馬鈴薯StbHLHs還響應(yīng)了非生物脅迫的誘導(dǎo)。在鹽(150 mmol/L NaCl)、甘露醇、生長(zhǎng)素、赤霉素及脫落酸、熱(35℃)等脅迫處理下,這108個(gè)StbHLHs的表達(dá)模式明顯不同。其中,StbHLH84、StbHLH87及StbHLH89等基因,在所有脅迫處理下表達(dá)均上調(diào);StbHLH47、StbHLH56及StbHLH80等 基 因 表 達(dá) 均 下 調(diào);StbHLH12、StbHLH14及StbHLH55等基因表達(dá)無(wú)變化。在鹽和甘露醇脅迫下,StbHLH83表達(dá)程度明顯提高,StbHLH20表達(dá)量下降,而StbHLH11、StbHLH74和StbHLH82等基因均無(wú)明顯響應(yīng)。內(nèi)源激素誘導(dǎo)條件下,StbHLH46和StbHLH65相較其他成員有較高的表達(dá)豐度;StbHLH103唯獨(dú)在ABA脅迫下表達(dá)量明顯增加,暗示其可能正調(diào)控ABA信號(hào)傳導(dǎo)途徑,從而提高馬鈴薯抗旱性。熱處理時(shí),StbHLH15、StbHLH50及StbHLH73等基因表達(dá)均顯著下調(diào);StbHLH20、StbHLH48及StbHLH60等基因表達(dá)均顯著上調(diào),表明這些基因在馬鈴薯熱激反應(yīng)中具有正向調(diào)節(jié)的作用。

    2.6 馬鈴薯部分bHLH轉(zhuǎn)錄因子的組織表達(dá)模式分析

    采用qRT-PCR方法分析StbHLH14等12個(gè)基因在馬鈴薯根、莖、葉中的表達(dá)情況(圖6)??傻肧tbHLH14、StbHLH34、StbHLH66及StbHLH90均在莖中相對(duì)較高的表達(dá)量;StbHLH39在葉中的表達(dá)量是最高的;而StbHLH59在根中有較高表達(dá)量。StbHLH2和StbHLH15在馬鈴薯根、莖及葉中的表達(dá)量均無(wú)明顯差異。

    圖6 馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子組織表達(dá)模式分析Fig. 6 Tissue expression pattern analysis of bHLH transcription factor in S. tuberosum

    2.7 馬鈴薯部分bHLH轉(zhuǎn)錄因子在非生物脅迫下的表達(dá)模式分析

    為了對(duì)生物信息學(xué)分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,分析了StbHLH2等12個(gè)基因在低鉀、脫落酸(ABA)、干旱、高鹽及H2O2處理不同時(shí)間的表達(dá)量(圖7)。StbHLH15和StbHLH53在低鉀及ABA處理下,表達(dá)量有明顯的上調(diào);StbHLH15和StbHLH59在模擬干旱脅迫環(huán)境下,表達(dá)豐度顯著增加,說(shuō)明其可能參與調(diào)控ABA信號(hào)通路;StbHLH90在高鹽處理3 h后表達(dá)量達(dá)到了最高;StbHLH108在5個(gè)脅迫處理下的表達(dá)均明顯增加,暗示其可能在馬鈴薯響應(yīng)逆境中起著至關(guān)重要的作用。StbHLH2在低鉀和高鹽處理下,表達(dá)量均有顯著的上調(diào);StbHLH15在高鹽處理后發(fā)生了下調(diào);StbHLH39在低鉀、高鹽、H2O2處理后均有顯著下調(diào)。

    圖7 馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子脅迫處理表達(dá)模式分析Fig. 7 Expression pattern of bHLH transcription factor in S. tuberosum under stress

    3 討論

    bHLH轉(zhuǎn)錄因子廣泛存在于植物體內(nèi),它主要調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育,如花的形態(tài)建成、表皮毛的發(fā)育及種子萌發(fā)等,同時(shí)在植物養(yǎng)分吸收、生物合成及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中具有重要作用[30-31]。本研究鑒定出108個(gè)馬鈴薯bHLH家族成員,保守元件分析后,共獲得5個(gè)Motifs。其中,Motif1和Motif2相鄰,并存在于所有bHLH家族成員中,推測(cè)兩者共同組成了bHLH保守結(jié)構(gòu)域,該結(jié)果與陳紅霖等[6]對(duì)綠豆全基因組的研究結(jié)果相似。聚類(lèi)分析表明,138個(gè)bHLH被分為16個(gè)亞家族,而同一亞族的成員大多具有相似的保守元件。進(jìn)化及染色體定位表明,108個(gè)馬鈴薯bHLH家族成員不均勻地分布在12條染色體上。在1號(hào)和2號(hào)染色體上共存在3對(duì)旁系同源基因,并且緊密連鎖,該結(jié)果與王尋等[32]研究結(jié)果相吻合。

    植物的bHLH基因往往具有組織表達(dá)特異性。黃芩bHLH3在根中表達(dá)值最高,而葉片中基本不表達(dá),bHLH6的表達(dá)情況與其恰恰相反[33]。NtbHLH93在煙草盛花期子房組織,及不同生育期側(cè)根中的表達(dá)量很高[34]。與上述研究結(jié)果相似,馬鈴薯轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,StbHLH18和StbHLH99等在根、葉及塊莖組織中均具有較高的表達(dá)豐度,StbHLH13僅在葉片中有低表達(dá)。此結(jié)果表明,馬鈴薯bHLH家族成員在其特定發(fā)育階段及特定組織中有獨(dú)特的表達(dá)特點(diǎn)。

    植物的bHLH轉(zhuǎn)錄因子,也參與了生長(zhǎng)發(fā)育及脅迫響應(yīng)過(guò)程。番茄bHLH22過(guò)表達(dá)會(huì)促進(jìn)乙烯生成及激活SlSFT或SlLFY,從而促進(jìn)果實(shí)成熟[35]。在ABA脅迫誘導(dǎo)下,西瓜的ClabHLH32和ClabHLH71隨著時(shí)間的推移表達(dá)量呈先降低后升高的趨勢(shì),而ClabHLH41和ClabHLH58先上調(diào)后下降[20]。擬南芥bHLH68參與了ABA信號(hào)傳導(dǎo)及代謝過(guò)程,并在干旱脅迫響應(yīng)時(shí)有重要功能[21]。鹽脅迫下,水稻bHLH035突變體出現(xiàn)種子萌發(fā)延遲的現(xiàn)象,且鹽誘導(dǎo)的ABA分解基因在種子萌發(fā)過(guò)程中表達(dá)下調(diào),導(dǎo)致了ABA過(guò)度積累[22]。甜橙bHLH18可直接或間接地調(diào)控抗氧化酶基因的表達(dá),從而能夠增強(qiáng)其抗寒能力[23]。

    本研究熱圖分析中,在鹽(150 mmol/L NaCl)、甘露醇、生長(zhǎng)素、脫落酸及赤霉素、熱(35℃)等非生物脅迫下,馬鈴薯StbHLHs呈現(xiàn)出不同的表達(dá)模式,暗示了其參與植物發(fā)育進(jìn)程及環(huán)境脅迫的普遍性。其中,StbHLH84、StbHLH87和StbHLH89均上調(diào)表達(dá),則說(shuō)明了其可能以正向調(diào)控的方式,參與馬鈴薯生長(zhǎng)以及響應(yīng)多種逆境脅迫的調(diào)節(jié)。StbHLH103在ABA的誘導(dǎo)下,表達(dá)量顯著上升,說(shuō)明該基因可能參與了ABA的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,并可能在馬鈴薯的ABA依賴(lài)的非生物脅迫(如干旱)響應(yīng)中發(fā)揮重要作用。

    qRT-PCR分析結(jié)果表明,StbHLH14、StbHLH34在莖中表達(dá)量較高,而StbHLH59和StbHLH39分別在根和葉中有高表達(dá),說(shuō)明了馬鈴薯bHLH轉(zhuǎn)錄因子具有不同的組織表達(dá)特異性。StbHLH15和StbHLH53在不同的脅迫處理后會(huì)有明顯的上調(diào),然而有少數(shù)基因在脅迫處理后表達(dá)會(huì)減少,如StbHLH39等,說(shuō)明這些基因分別作為不同信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途中的正調(diào)控及負(fù)調(diào)控因子。StbHLH108在低鉀、脫落酸、高鹽、干旱及H202這5個(gè)脅迫處理下均發(fā)生了上調(diào)。綜上,馬鈴薯bHLH家族成員在響應(yīng)逆境脅迫時(shí)均發(fā)揮著一定的作用。

    4 結(jié)論

    在馬鈴薯全基因組中,共鑒定出同屬于bHLH基因家族的108個(gè)StbHLHs。它們不均勻地分布在馬鈴薯12條染色體上,均具有典型的HLH結(jié)構(gòu)域,且同一亞族成員的保守基序相似。馬鈴薯bHLH基因具有組織表達(dá)特異性,并且響應(yīng)鹽、熱、旱、ABA等非生物脅迫。

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