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    灰葡萄孢Bromodomain轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定及表達分析

    2022-02-06 06:45:56鄧思琪馬宇馨曹宏哲邢繼紅
    河北農(nóng)業(yè)大學學報 2022年6期
    關(guān)鍵詞:乙?;?/a>分生孢子侵染

    鄧思琪,李 白,馬宇馨,曹宏哲,邢繼紅,張 康

    (河北農(nóng)業(yè)大學,華北作物改良與調(diào)控國家重點實驗室/河北省植物生理與分子病理學重點實驗室,河北 保定 071000)

    灰葡萄孢(Botrytis cinerea)是一種世界性分布的重要植物病原真菌[1],其寄主范圍廣泛、傳播十分迅速,以菌絲、分生孢子及菌核的形式侵染,常給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成嚴重經(jīng)濟損失[2-3]?;移咸焰叩木z可以在3 ~30 ℃的溫度范圍內(nèi)生長,其最適生長溫度為20 ~25 ℃,且在具有相對較高濕度的環(huán)境下會引起大范圍的灰霉病發(fā)生[4-5]。到目前為止,灰霉病的防治主要為化學防治,通過在作物葉表面噴灑化學藥劑來防控灰霉病。此方法雖然高效,但灰葡萄孢變異頻繁,會產(chǎn)生高抗藥性,導致防治效果逐漸減弱,從而殺菌劑用量不斷增加,嚴重威脅了農(nóng)產(chǎn)品的安全[6]。隨著基因組測序工作的完成,灰葡萄孢已經(jīng)成為發(fā)育生物學、微生物學、植物病理學研究的模式生物之一,也是研究病原微生物與寄主植物互作的一種重要的模式生物。因此,充分挖掘與灰葡萄孢生長發(fā)育和致病相關(guān)基因,探究調(diào)控病菌生長發(fā)育和致病力的分子機制,不僅可以為灰霉病的生物防治提供理論依據(jù),還可以為其他真菌的相關(guān)研究提供重要參考價值。

    組蛋白乙?;潜碛^遺傳研究的重要組成部分,是翻譯后修飾的重要方式之一。Bromodomain (BRD)是一類能夠特異性識別組蛋白中乙?;嚢彼岬谋J氐鞍捉Y(jié)構(gòu)域,可特異性識別組蛋白末端乙?;馁嚢彼嵛稽c,通過與乙?;嚢彼峤Y(jié)合促使染色質(zhì)重塑因子和轉(zhuǎn)錄因子等相關(guān)蛋白富集于特定的基因轉(zhuǎn)錄位點,改變RNA 聚合酶Ⅱ的活性,從而調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄表達[7]。Bromodomain 亦可通過對轉(zhuǎn)錄因子等非組蛋白的乙酰化修飾廣泛參與細胞周期調(diào)控、細胞分化、信號轉(zhuǎn)導等過程[8]。據(jù)研究報道,所有與組蛋白乙酰化酶有關(guān)的轉(zhuǎn)錄輔激活因子都包括Bromodomains,而BRDs 也是目前已知的唯一能對賴氨酸乙酰化物特異性識別的蛋白。BRD 存在于多種表觀遺傳調(diào)控蛋白中,包括轉(zhuǎn)錄激活因子、組蛋白乙酰化轉(zhuǎn)移酶以及染色質(zhì)等。BRD 蛋白不僅單獨存在,而且常與其他組蛋白密碼解讀蛋白結(jié)構(gòu)域相連[9-10],例如 PHD 這些結(jié)構(gòu)域通過協(xié)同方式調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄、細胞周期以及細胞凋亡。雖然其大部分功能未知但值得注意的是一種溴結(jié)構(gòu)域蛋白BS69,在基因轉(zhuǎn)錄抑制復合物中起著重要的作用,這表明組蛋白乙?;赡芎卸嘀氐?、不同的功能[11]。

    Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子最開始在果蠅的基因中發(fā)現(xiàn),隨后在人體組織和酵母中發(fā)現(xiàn)。目前的研究表明,Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子在人體中廣泛表達,主要參與染色質(zhì)重塑,具有調(diào)控相關(guān)基因表達、促進細胞分化等功能,這些功能參與了成人造血干細胞的功能維持,Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子表達異常會導致嚴重的造血缺陷,會引起骨髓衰竭和貧血等疾?。?2-15]。擬南芥中含有擬南芥溴多糖的蛋白質(zhì)BRD1、BRD2 和BRD13 可能是真正的SWI/SNF 亞基,與核心SWI/SNF 成分SWI3C 和SWP73B 相互作用,對擬南芥的基因組靶向至關(guān)重要[16-17]。在酵母中發(fā)現(xiàn)的一種溫度敏感的突變體Bromodomain factor 1,在體外可結(jié)合組蛋白H3 和H4,因此被認為在染色質(zhì)重塑中起重要作用[18]。而在禾谷鐮刀菌中首次發(fā)現(xiàn)保守結(jié)構(gòu)域Bromodomain 對研究FgGCN5的調(diào)控機制是必不可少的[19-20]。

    目前,有關(guān)灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的系統(tǒng)研究尚未見報道。因此,利用生物信息學的方法對灰葡萄孢中Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族進行分析,挖掘Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族成員的功能,并利用qPCR 技術(shù)分析該家族基因在NaCl 和剛果紅脅迫處理下的表達變化,探究Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族在灰葡萄孢生長發(fā)育以及致病力的分子機制,從而為灰葡萄孢防治和Bromodomain 家族基因功能和調(diào)控機制研究提供參考。

    1 材料與方法

    1.1 試驗材料

    本研究用到的灰葡萄孢(B.cinerea)B05.10 菌株由河北農(nóng)業(yè)大學真菌毒素與植物分子病理學實驗室提供并保存。

    1.2 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的篩選與鑒定

    在Ensembl Fungi(http://fungi.ensembl.org/)和 在Pfam(http://pfam. xfam. org) 中 獲 取 灰葡萄孢基因組相關(guān)數(shù)據(jù)以及隱馬爾可夫模型(HMM model),再利用Hmmsearch 軟件找出其Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白序列。

    1.3 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的理化性質(zhì)分析

    利用ProtParam(https://web. expasy. org/protparam/)在線網(wǎng)頁分析灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的理化性質(zhì),包括分子量、氨基酸組成、等電點等。

    1.4 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因染色體定位分析

    利用在線工具Gene Structure Dispaly Server (GSDS),將在Ensembl Fungi(http://fungi.ensembl.org/)查詢的灰葡萄孢染色體長度和灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因位置信息,使用TBtools 軟件繪制成Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因染色體定位圖。

    1.5 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的系統(tǒng)進化分析

    利用Ensembl 數(shù)據(jù)庫(http://fungi.ensembl.org/)和真菌轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(http://ftfd.snu.ac.kr/index.php?a=view)搜集灰葡萄孢(Botrytis cinerea)、禾谷鐮孢(Fusarium graminearum)、釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)以及黃曲霉(Aspergillus flavus)中含有Bromodomain 結(jié)構(gòu)域的蛋白序列,并利用MEGA7.0對40 條Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子蛋白序列(其中包含灰葡萄孢蛋白序列8 條、禾谷鐮孢蛋白序列7 條、釀酒酵母蛋白序列10 條、稻瘟病菌蛋白序列9 條、黃曲霉蛋白序列6 條)進行多序列比對,然后用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,bootstrap 值設(shè)置為1 000。

    1.6 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu)分析

    在灰葡萄孢B05.10 基因組數(shù)據(jù)庫中找到灰葡萄孢Bromodomain 家族基因DNA 序列,利用IBS 軟件繪制灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu)圖。

    1.7 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族保守結(jié)構(gòu)域分析

    利用SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)和Pfam(http://pfam. xfam. org)網(wǎng)站對灰葡萄孢8 個Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白進行保守結(jié)構(gòu)域分析,然后利用IBS1.0.3 軟件繪制8 個Bromodomain轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白保守結(jié)構(gòu)域。

    1.8 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在分生孢子中的表達分析

    利用GEO(http://www. ncbi. nlm. nih. gov/geo/)數(shù)據(jù)庫獲得灰葡萄孢分生孢子發(fā)育時期的表達譜數(shù)據(jù),然后對Bromodomain 家族基因在不同發(fā)育時間的表達數(shù)據(jù)與對照(0 h)做比值,再取以2 為底的對數(shù)值,使用TBtools 軟件分析灰葡萄孢Bromodomain 家族基因分生孢子萌發(fā)期間的全基因組基因表達水平。

    1.9 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在侵染過程中的表達分析

    利 用GEO(http://www. ncbi. nlm. nih. gov/geo/)數(shù)據(jù)庫獲得灰葡萄孢侵染葡萄過程中的表達譜數(shù)據(jù),然后對Bromodomain 家族基因在侵染不同時間的數(shù)據(jù)與對照(0 h)做比值,再取以2 為底的對數(shù)值,使用TBtools 軟件分析灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在灰葡萄孢侵染葡萄過程中的表達變化。

    1.10 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在脅迫處理下的表達分析

    以0.8 mol/LNaCl 和2 mg/mL 剛果紅分別處理灰葡萄孢野生型B05.10 菌株,以未作處理的灰葡萄孢野生型B05.10 菌株為對照,處理7 d 取樣,提取RNA,利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA。以灰葡萄孢β-tubulin基因為內(nèi)參,用灰葡萄孢Bromodomain 家族基因的特異性引物進行qPCR 檢測(表1)。利用Primer Premier 5 設(shè)計引物,由北京博邁德基因技術(shù)有限公司合成。每個樣品重復3 次。PCR 反應(yīng)體系:PCR Mix 7 μL、cDNA 2 μL、基因特異性上下游引物各0.5 μL,總體積10 μL;PCR 程序:94 ℃預變性1 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火15 s, 72 ℃延伸30 s,30 個循環(huán)。利用GraphPad Prism 軟件對數(shù)據(jù)進行單因素方差分析,0.01 <P<0.05 為差異顯著,P<0.01 為差異極顯著。

    表1 用于qPCR 的引物Table 1 Primers used for qPCR

    2 結(jié)果與分析

    2.1 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的篩選與鑒定

    在Ensembl Fungi 和 在Pfam 中 獲 取 灰葡萄孢基因組相關(guān)數(shù)據(jù)以及隱馬爾可夫模型(HMM model), 再 利 用hmmsearch 找 出 其Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的蛋白序列。最終鑒定出8 個灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族 成 員:BCIN_05g00170、BCIN_02g08510、BCIN_14g05240、BCIN_02g06970、BCIN_04g04900、BCIN_13g01660、BCIN_05g01870、BCIN_10g03430(見表2)。

    2.2 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的理化性質(zhì)分析

    通過用保守結(jié)構(gòu)域Bromodomain 對灰葡萄孢進行全基因組檢索,獲得了8 個灰葡萄孢Bromodomain 家族基因(表2)。分析發(fā)現(xiàn),灰葡萄孢Bromodomain 家族基因編碼區(qū)CDS 長度在1 119 ~4 302 bp 之間變化;編碼蛋白的氨基酸數(shù)目為327 ~1 433 aa;相對分子質(zhì)量在42 755.37 ~163 110.01 D 之間變化;等電點在5.06 ~8.91 之間,其中pI <7.0 的Bromodomain 家族基因有3 個,占37.5%,呈弱酸性;62.5%的Bromodomain 家族基因pI >7.0,這表明該家族基因編碼的蛋白富含堿性氨基酸。

    表2 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的理化性質(zhì)Table 2 The physicochemical properties of Bromodomain transcription factor family genes in B. cinerea

    2.3 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因染色體定位分析

    利用在線工具GSDS,將在Ensembl Fungi 查詢的灰葡萄孢染色體長度和灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因位置信息,繪制成Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因染色體定位圖(圖1)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),灰葡萄孢Bromodomain 家族的8 個基因分別處于灰葡萄孢的6 條染色體中。其中,BCIN_02g06970和BCIN_02g08510位于2 號染色體,BCIN_04g04900位于4 號染色體,BCIN_05g00170和BCIN_05g01870位于5 號染色體,BCIN_10g03430位于10 號染色體,BCIN_13g01660位于13 號染色體,BCIN_14g05240位于14 號染色體。

    圖1 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因染色體定位Fig.1 Chromosomal localization of Bromodomain transcription factor family genes in B. cinerea

    2.4 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的系統(tǒng)進化分析

    利用Ensembl 數(shù)據(jù)庫和真菌轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫搜集灰葡萄孢(B.cinerea)、禾谷鐮孢(F.graminearum)、釀酒酵母(S.cerevisiae)、稻瘟病菌(M.oryzae)以及黃曲霉(A.flavus)中Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白序列,分別包含8、7、10、9、和6 條。用MEGA7.0 軟件對Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白進行系統(tǒng)發(fā)育分析(圖2)。

    圖2 灰葡萄孢Bromodomain 家族蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 2 Phylogenetic tree of Bromodomain family protein in B. cinerea

    結(jié)果發(fā)現(xiàn)40 個Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白 可 以 分 為4 個 亞 家 族:BROMO、BROMOBAH、DEXDc-HELICc-SnAC-BROMO、BROMOAT_hook。在8 個灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家 族 蛋 白 中BCIN_13g01660、BCIN_05g01870、BCIN_14g05240、BCIN_04g04900、BCIN_02g08510屬于BROMO 亞家族,BCIN_02g06970 屬于BROMOBAH 亞 家 族,BCIN_10g03430 屬 于DEXDc-HELICc-SnAC-BROMO 亞家族,BCIN_05g00170 屬于BROMOAT_hook 亞家族。

    2.5 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu)分析

    利用IBS 軟件繪制灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的基因結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)該基因家族的基因結(jié)構(gòu)存在明顯差異。其中BROMO 亞家族基因結(jié)構(gòu)較 為 復 雜,BCIN_13g01660和BCIN_05g01870包含1 個 內(nèi) 含 子,2 個 外 顯 子;BCIN_14g05240和BCIN_02g08510包 含2 個 內(nèi) 含 子,3 個 外 顯 子;而BCIN_04g04900沒有內(nèi)含子,只有1 個外顯子。BROMO-BAH 亞 家 族 的BCIN_02g06970包含3 個 內(nèi) 含 子,4 個 外 顯 子;DEXDc-HELICc-SnAC-BROMO 亞家族的BCIN_10g03430包含2 個內(nèi)含子,3 個外顯子;BROMO-AT_hook亞家族的BCIN_05g00170包含5 個內(nèi)含子,6 個外顯子(圖3)。

    圖3 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的基因結(jié)構(gòu)分析Fig. 3 Analysis of gene structure of Bromodomain transcription factor family genes in B. cinerea

    2.6 灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族的結(jié)構(gòu)域分析

    利 用SMART 和Pfam 網(wǎng) 站 對 灰 葡 萄 孢8 個Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族蛋白進行保守結(jié)構(gòu)域分析,并用IBS 軟件繪圖。結(jié)果如圖4 所示,8個Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族成員可分為4 類,BCIN_13g01660、BCIN_05g01870、BCIN_14g05240、BCIN_04g04900、BCIN_02g08510 屬 于BROMO 亞家 族, 其 中BCIN_13g01660、BCIN_05g01870、BCIN_04g04900、BCIN_02g08510 僅 有1 個BROMO結(jié)構(gòu)域,BCIN_14g05240 含有2 個BROMO 結(jié)構(gòu)域;BCIN_02g06970屬于BROMO-BAH 亞家族,含有2 個BROMO 和1 個BAH 結(jié) 構(gòu) 域;BCIN_10g03430屬于DEXDc-HELICc-SnAC-BROMO 亞家族,含有4 個 結(jié) 構(gòu) 域DEXDc、HELICc、SnAC 和BROMO;BCIN_05g00170 屬于BROMO-AT_hook 亞家族,包含2 個結(jié)構(gòu)域BROMO 和AT_hook。

    圖4 灰葡萄孢Bromodomain 保守結(jié)構(gòu)域分析Fig. 4 Analysis of conserved domains Bromodomain in B. cinerea

    2.7 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在分生孢子中的表達分析

    利用GEO 數(shù)據(jù)庫獲得灰葡萄孢分生孢子發(fā)育時期的表達譜數(shù)據(jù),對灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在分生孢子發(fā)育時期的表達水平進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),該家族基因在灰葡萄孢分生孢子發(fā)育過程中的表達水平存在明顯差異,BCIN_10g03430在0 ~2.5 h 呈 下 降 趨 勢、 在2.5 ~4 h表達水平短暫升高、 在4 ~15 h 再次下調(diào);BCIN_05g00170、BCIN_14g05240、BCIN_05g01870和BCIN_02g08510在0 ~15 h 持續(xù)下調(diào),下調(diào)程度略有不同;BCIN_02g06970在0 ~15 h 持續(xù)上調(diào),上調(diào)程度略有不同;BCIN_13g01660在0 ~4 h 呈下降趨勢、在4 ~15 h 上調(diào)表達;BCIN_04g04900在1 ~2.5 h 出現(xiàn)短暫的下調(diào)趨勢,其他時間幾乎無變化(圖5)。上述結(jié)果表明,灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在發(fā)育過程中呈現(xiàn)不同的表達規(guī)律,推測其參與灰葡萄孢不同時期的生長發(fā)育過程。

    圖5 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在分生孢子發(fā)育過程中的表達Fig. 5 Expression of Bromodomain family genes during conidial development of B. cinerea

    2.8 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在侵染過程中的表達分析

    利用GEO 數(shù)據(jù)庫獲得灰葡萄孢侵染葡萄過程中的表達譜數(shù)據(jù),對灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在侵染葡萄不同時期的表達水平進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)(圖6),BCIN_04g04900、BCIN_02g08510、BCIN_02g06970和BCIN_14g05240在病菌侵染過程中持續(xù)上調(diào)表達;BCIN_13g01660、BCIN_10g03430和BCIN_05g00170在病菌侵染0 ~48 h 過程中持續(xù)下調(diào)表達,下調(diào)程度有所不同;BCIN_05g01870在侵染0 ~16 h 出現(xiàn)短暫上調(diào)、在16 ~48 h 呈下調(diào)趨勢。

    圖6 Bromodomain 家族基因在灰葡萄孢侵染不同時期的表達Fig. 6 Expression of Bromodomain family genes at different infection stages of B. cinerea

    2.9 灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在脅迫處理下的表達分析

    利用qPCR 技術(shù)對灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在NaCl 和剛果紅處理后的表達水平進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在NaCl 和剛果紅脅迫處理下的表達水平均呈現(xiàn)下調(diào)趨勢,但下調(diào)程度有所不同(圖7)。以0.8 mol/L NaCl 處理7 d 后,BCIN_04g04900、BCIN_13g01660、BCIN_05g01870以及BCIN_10g03430基因下調(diào)最為顯著,并且BCIN_10g03430幾乎不表達。以2 mg/mL 剛果紅處理7 d 后,BCIN_04g04900、BCIN_05g01870和BCIN_10g03430基因下調(diào)最為顯著。

    圖7 脅迫處理對灰葡萄孢Bromodomain 家族基因表達的影響Fig.7 The effect of stress treatment on the gene expression of B. cinerea Bromodomain family

    3 結(jié)論與討論

    在真核細胞中,組蛋白乙?;饕山M蛋白乙?;负徒M蛋白去乙酰化酶共同調(diào)節(jié)。研究表明,大多數(shù)組蛋白乙?;赶嚓P(guān)的轉(zhuǎn)錄激活因子均存在Bromodomain,它可以與乙?;嚢彼崽禺惤Y(jié)合[21]。Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族在動物、植物、病菌中普遍存在,家族成員較多,功能較為復雜,對于病菌的生長發(fā)育及其致病力具有重要影響[22]。目前的研究表明,人體內(nèi)的Brd2 具有激酶活性,在某些白血病中激酶活性上升,它可以通過C 端序列與E2F1 或E2F2 相互作用,影響E2F 調(diào)控的細胞周期基因的轉(zhuǎn)錄[23];而BRD4 屬于BET 家族的成員,通過結(jié)合乙?;M蛋白并調(diào)節(jié)基因表達從而參與一系列重要的生物學過程,如細胞生長、凋亡、炎癥、免疫抑制等[24]。大鼠中含溴多胺的蛋白4 表達增強,最終導致傷害性神經(jīng)元興奮性增強和熱痛覺過敏[25]。在擬南芥中,組蛋白GTE9 和GTE11 與BT2相互作用,介導擬南芥中的ABA 和糖反應(yīng)[26]。

    Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子只有在模式物種酵母中有部分研究,但在其他真菌中研究較少。本研究發(fā)現(xiàn)灰葡萄孢包含了8 個Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族基因,系統(tǒng)進化分析將其分為4 個亞家族,不同成員在病菌分生孢子發(fā)育的不同時期、侵染時期和NaCl 以及剛果紅脅迫處理下的表達水平存在明顯差異,因此推測Bromodomain 家族基因在灰葡萄孢分生孢子發(fā)育、侵染過程以及脅迫應(yīng)答過程中具有比較重要的作用。

    本研究發(fā)現(xiàn)BCIN_02g06970在灰葡萄孢分生孢子發(fā)育的不同時期持續(xù)上調(diào)表達,推測其在灰葡萄孢分生孢子發(fā)育過程中具有重要作用。BCIN_04g04900、BCIN_02g08510、BCIN_02g06970和BCIN_14g05240在病菌侵染過程中持續(xù)上調(diào)表達,在侵染0 h 時表達水平最低,在16 ~48 h 時表達量明顯上調(diào),因此推測其在病菌侵染過程中發(fā)揮重要作用。本研究還發(fā)現(xiàn)在NaCl 以及剛果紅脅迫處理下,灰葡萄孢Bromodomain 轉(zhuǎn)錄因子家族不同基因均呈現(xiàn)下調(diào)表達趨勢,因此推測其在病菌脅迫應(yīng)答過程中可能發(fā)揮重要作用。本研究結(jié)果初步確定了灰葡萄孢Bromodomain 家族基因在分生孢子發(fā)育、侵染過程以及NaCl 和剛果紅脅迫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用,但機制尚不明確,還有待進一步探究。

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