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    基于地衣芽孢桿菌表達(dá)系統(tǒng)搭建左旋多巴新合成體系

    2020-06-15 07:00:36李樂云李由然許銀彪張梁顧正華丁重陽(yáng)石貴陽(yáng)
    食品與發(fā)酵工業(yè) 2020年11期
    關(guān)鍵詞:底物緩沖液質(zhì)粒

    李樂云,李由然,許銀彪,張梁,顧正華,丁重陽(yáng),石貴陽(yáng)*

    1(糧食發(fā)酵工藝與技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室(江南大學(xué)),江蘇 無錫,214122) 2(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫,214122)

    左旋多巴(3,4-dihydroxylphenylalanine,L-DOPA)是一種人體內(nèi)L-酪氨酸(L-tyrosine, Tyr)的氨基酸類似物,是多巴胺、黑色素、生物堿等許多物質(zhì)的前體,是治療帕金森病的特效藥[1-3]。目前合成L-DOPA的方法主要有化學(xué)合成法[4]、植物提取法[5]和酶催化法[6-7]?;瘜W(xué)合成法多以香草醛和乙內(nèi)酰脲為原料,經(jīng)過8步反應(yīng)得到L-DOPA[4],過程復(fù)雜且對(duì)應(yīng)選擇性低,不符合綠色生產(chǎn)的發(fā)展趨勢(shì)。植物提取法的主要原材料是貓豆[5],但是其中L-DOPA含量最高僅有9%,原料來源限制難以滿足市場(chǎng)需求。酶催化法是一種環(huán)境友好、簡(jiǎn)便高效的新型合成途徑,受到越來越多的關(guān)注[7]。

    目前用于催化合成L-DOPA的酶主要有4種:酪氨酸酚解酶[8-10]、4-羥基苯乙酸酯3-單加氧酶(4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, 4HPA3H)[11]、酪氨酸酶[12]以及酪氨酸羥化酶(tyrosine hydroxylase, TH)[13-14]。酪氨酸酚解酶以鄰苯二酚、氨水以及丙酮酸為底物合成L-DOPA,其中鄰苯二酚是一種蛋白質(zhì)變性劑,可導(dǎo)致酪氨酸酚解酶發(fā)生不可逆失活[15-16]。4HPA3H、酪氨酸酶、酪氨酸羥化酶均以L-Tyr為底物催化合成L-DOPA。4HPA3H是一種由hpaB,hpaC基因編碼的雙組分酶,催化過程需要一種膜相關(guān)的細(xì)胞色素P450酶,而該酶很難在原核系統(tǒng)中功能表達(dá)[17]。酪氨酸酶具有單酚氧化酶和二酚氧化酶作用,前者將L-Tyr羥基化合成L-DOPA,后者可將L-DOPA氧化為多巴醌,進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為黑色素,對(duì)L-DOPA產(chǎn)物得率有較大影響。TH是一種以四氫生物蝶呤(tetrahydrobiopterin, BH4)和Fe2+為輔因子的單加氧酶,在L-Tyr的鄰位羥基化,不具有二酚氧化酶活性[18],減少了L-DOPA的氧化,應(yīng)用前景較好。

    目前關(guān)于TH的研究主要集中于昆蟲和哺乳動(dòng)物來源[19],隨著基因數(shù)據(jù)庫(kù)以及基因合成技術(shù)的發(fā)展,酶基因挖掘更加快捷和可靠。通過篩選不同來源的TH基因,分析其保守序列及催化機(jī)制,對(duì)拓展酶催化法合成L-DOPA具有重要意義。其中篩選出穩(wěn)定高效的TH基因以及實(shí)現(xiàn)輔因子BH4的供給是L-DOPA合成中的主要限制因素。

    Bacilluslicheniformis是一種重要的工業(yè)生產(chǎn)菌株,具有酶系豐富、產(chǎn)酶量高、耐熱、代謝改造可積累L-Tyr等諸多優(yōu)點(diǎn)[20],同時(shí)也是一種食品安全級(jí)(generally recognized as safe, GRAS)菌株[21]。值得注意的是,地衣芽孢桿菌存在BH4前體物質(zhì)6-丙酮酰四氫蝶呤的合成途徑,僅需一步墨蝶呤還原酶催化即可獲得BH4,為基于B.licheniformis表達(dá)系統(tǒng)過表達(dá)TH合成L-DOPA奠定基礎(chǔ)(https://www.genome.jp/kegg/pathway.html)。作為GRAS工業(yè)菌株,B.licheniformis生產(chǎn)的L-DOPA具有更廣闊的應(yīng)用前景,目前尚未有利用B.licheniformis合成L-DOPA的報(bào)道。

    本研究通過生物信息學(xué)方法基于動(dòng)物來源的TH基因保守序列分析,挖掘到StreptosporangiumroseumDSM 43021來源TH基因(srth),利用B.licheniformis表達(dá)系統(tǒng)其進(jìn)行胞內(nèi)外的重組表達(dá),并結(jié)合本實(shí)驗(yàn)室保藏的墨蝶呤還原酶重組菌以L-Tyr為底物進(jìn)行全細(xì)胞轉(zhuǎn)化,并對(duì)TH功能及催化過程進(jìn)行初步探究。構(gòu)建B.licheniformis的L-DOPA合成體系,為基于GRAS菌株酶催化法合成L-DOPA的工業(yè)應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料與試劑

    1.1.1 菌株與質(zhì)粒

    本研究所用菌株和質(zhì)粒見表1。

    表1 本研究所用的菌株及質(zhì)粒Table 1 Strains and plasmids used in this study

    1.1.2 主要試劑

    限制性核酸內(nèi)切酶(NdeI,NheI,KpnI,SalI)、T4DNA連接酶,美國(guó)Thermo Fisher;2×TaqPCR Master Mix、2×PfuPCR Master Mix,杭州寶賽公司;質(zhì)粒DNA提取試劑盒、DNA純化試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒,康寧生命科學(xué)有限公司(上海);卡那霉素、氨芐青霉素、四環(huán)素,Sigma公司;L-Tyr、L-DOPA、BH4,生工生物工程(上海)股份有限公司;蛋白胨、酵母粉、瓊脂粉,英國(guó)OXOID公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)或進(jìn)口分析純。

    1.1.3 培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件

    LB培養(yǎng)基 (g/L): 蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 10,LB固體培養(yǎng)基另加入質(zhì)量分?jǐn)?shù)2%的瓊脂粉。

    發(fā)酵培養(yǎng)基I (g/L): 乳糖 30,蛋白胨12,酵母粉24,甘油 5,K2HPO4·3H2O 16.43,KH2PO42.3,pH 7.0。

    發(fā)酵培養(yǎng)基II (g/L): 葡萄糖 30,蛋白胨FP321 20,酵母粉FM408 10,玉米漿干粉 5,K2HPO4·3H2O 9.12,KH2PO41.36,無水CaCl20.50,MgSO4·7H2O 0.50,(NH4)2HPO410。

    發(fā)酵培養(yǎng)條件I:

    種子培養(yǎng):接1環(huán)平板活化后的單菌落至LB培養(yǎng)基,添加終濃度為30 μg/mL卡那霉素,37 ℃、250 r/min 搖床培養(yǎng)12~16 h。

    發(fā)酵培養(yǎng):將種子液按照體積分?jǐn)?shù)3%接種量轉(zhuǎn)接至30 mL發(fā)酵培養(yǎng)基I,加入終濃度為30 μg/mL卡那霉素,37 ℃、250 r/min搖床培養(yǎng)48 h。

    發(fā)酵培養(yǎng)條件II:

    種子培養(yǎng):接1環(huán)平板活化后的單菌落至LB培養(yǎng)基,添加終濃度為20 μg/mL四環(huán)素,37 ℃、250 r/min 搖床培養(yǎng)12~16 h。

    發(fā)酵培養(yǎng):按照體積分?jǐn)?shù)3%接種量將種子液轉(zhuǎn)接至30 mL發(fā)酵培養(yǎng)基II,加入終濃度為20 μg/mL四環(huán)素,于37 ℃、250 r/min 搖床培養(yǎng)8~12 h至OD600為0.4~0.6,加入體積分?jǐn)?shù)1.5%D-山梨醇誘導(dǎo),于28 ℃、250 r/min搖床誘導(dǎo)36 h。

    1.2 實(shí)驗(yàn)方法

    1.2.1 氨基酸序列分析

    依據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中Streptosporangiumroseum來源的TH氨基酸序列(登錄號(hào):ACZ90985.1),利用ExPASy ProtParam、ProtScale、Compute pI/Mw在線工具分析編碼蛋白分子質(zhì)量、等電點(diǎn)、氨基酸組成、疏水性能、不穩(wěn)定指數(shù)等;進(jìn)一步在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)獲得動(dòng)物來源及其他微生物來源的TH氨基酸序列,利用DNAMAN進(jìn)行序列比對(duì)和保守序列分析;最后利用MEGA 6.0 繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析同源性。

    1.2.2 重組TH表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建

    依據(jù)B.licheniformis密碼子偏好性優(yōu)化合成srth,以合成的基因?yàn)槟0?,利用SnapGene軟件設(shè)計(jì)2對(duì)引物,第一對(duì)引物兩端引入酶切位點(diǎn)NdeI、NheI以及保護(hù)堿基,在后引物前端引入His標(biāo)簽;第二對(duì)引物兩端引入酶切位點(diǎn)KpnI、SalI以及保護(hù)堿基,2對(duì)引物序列及酶切位點(diǎn)見表2。利用合成的引物擴(kuò)增基因序列,擴(kuò)增的基因序列回收之后加A尾后,再連接至pMD19-T載體上,命名為pMD19-T-srth1、pMD19-T-srth2,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入感受態(tài)JM109。測(cè)序正確后用NdeI和NheI同時(shí)酶切pMD19-T-srth1和pMA5載體,用KpnI和SalI同時(shí)酶切pMD19-T-srth2和pHY載體,酶切后回收目的片段SrTH1、線性化的pMA5、srth2和線性化的pHY。按照基因和載體摩爾質(zhì)量比3∶1的比例各配制連接體系10 μL,在16 ℃干式恒溫器中過夜連接。將連接產(chǎn)物pMA5-srth、pHY-srth轉(zhuǎn)入JM109,分別命名為Eco/pMH、Eco/pHH,涂布氨芐青霉素抗性平板,挑取轉(zhuǎn)化子、提取質(zhì)粒,經(jīng)單雙酶切驗(yàn)證正確后,將2個(gè)重組質(zhì)粒采用電轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)入表達(dá)宿主B.licheniformis9945a,分別命名為Bl/pMH(胞內(nèi)表達(dá))、Bl/pHH(胞外表達(dá))。Bl/pMH涂布卡那霉素抗性平板,Bl/pHH涂布四環(huán)素抗性平板,挑取轉(zhuǎn)化子、提取質(zhì)粒,經(jīng)酶切驗(yàn)證及測(cè)序正確后,保藏菌種。

    表2 構(gòu)建TH表達(dá)質(zhì)粒所用引物Table 2 Primers for the construction of plasmids carrying tyrosine hydroxylase

    注:下劃線為酶切位點(diǎn)

    1.2.3 重組SrTH的表達(dá)和純化

    1.2.3.1 SrTH的表達(dá)

    SrTH重組菌Bl/pMH(胞內(nèi)表達(dá))按照發(fā)酵培養(yǎng)條件I培養(yǎng)48 h后4 ℃、12 000 r/min離心10 min收集細(xì)胞,50 mmol/L磷酸鈉緩沖液(pH 7.0) 洗滌細(xì)胞2次,緩沖液重懸細(xì)胞至OD600為10,加入溶菌酶于37 ℃培養(yǎng)箱反應(yīng)30 min后超聲破碎菌液,離心得到的上清液即為粗酶液。Bl/pHH菌株(胞外表達(dá))在發(fā)酵培養(yǎng)基II中誘導(dǎo)結(jié)束后,4 ℃、12 000 r/min離心10 min,上清液即為粗酶液。

    1.2.3.2 SrTH粗酶液的純化

    (1)濃縮:粗酶液置于-70 ℃冷凍后,于冷凍干燥機(jī)中凍干,用50 mmol/L磷酸鈉緩沖液(pH 7.0)重懸,使粗酶液濃縮10倍。

    (2)(NH4)2SO4沉淀:在冰浴狀態(tài)下緩慢加入飽和(NH4)2SO4溶液,至(NH4)2SO4質(zhì)量濃度為500 g/L,邊加邊攪拌使其在酶液中快速混合均勻,然后將溶液磁力攪拌6 h,使蛋白質(zhì)充分沉淀。

    (3)重懸沉淀:4 ℃、12 000 r/min離心10 min收集沉淀部分,用等體積50 mmol/L磷酸鈉緩沖液(pH 7.0)重懸。

    (4)透析:將重懸液放入透析袋中透析24 h,每隔6 h更換透析液除去(NH4)2SO4,收集透析后溶液,離心留上清液,透析液為20 mmol/L磷酸鈉緩沖液(pH 7.0)。

    (5)鎳柱親和層析:①40 mL結(jié)合緩沖液平衡鎳柱,流速2 mL/min;②上樣,流速1 mL/min;③40 mL結(jié)合緩沖液洗脫雜蛋白,流速2 mL/min;④100 mL解析緩沖液梯度洗脫重組蛋白,分別設(shè)置咪唑濃度為200、300、500 mmol/L三個(gè)梯度,流速2 mL/min。收集蛋白峰,將純化后樣品進(jìn)行SDS-PAGE分析。其中,結(jié)合緩沖液: Tris-HCl (pH 7.4) 25 mmol/L、NaCl 0.5 mol/L;解析緩沖液: Tris-HCl (pH 7.4) 25 mmol/L、NaCl 0.5 mol/L、咪唑500 mmol/L。

    1.2.4 全細(xì)胞轉(zhuǎn)化

    TH重組菌Bl/pMH與墨蝶呤還原酶重組菌Bl/pMF分別在發(fā)酵培養(yǎng)基I中發(fā)酵結(jié)束后檢測(cè)OD600,然后于4 ℃、12 000 r/min離心10 min,收集菌體,用50 mmol/L磷酸鈉緩沖液(pH 7.0)洗滌細(xì)胞2次,再用緩沖液重懸菌體至菌體濃度OD600為20。將重懸后的Bl/pMH與Bl/pMF按照1∶1的菌體濃度比例混合,加入2 g/LL-Tyr,在37 ℃、250 r/min進(jìn)行全細(xì)胞轉(zhuǎn)化36 h。以等菌體濃度的Bl/pMA、Bl/pMH和Bl/pMF菌株單獨(dú)轉(zhuǎn)化為對(duì)照。

    1.2.5 酶活力檢測(cè)

    TH酶活力檢測(cè)方法參考VERMEER等[22]的方法,稍作修改。

    樣品檢測(cè):①將酶液與終濃度為0.25 mmol/L的BH4、2.5 μmol/L Fe2+混合,冰浴10 min;②加入L-Tyr,37 ℃反應(yīng)20 min;③加入終濃度為2 mmol/L的高碘酸鈉,混勻后常溫反應(yīng)10 min,酶標(biāo)儀檢測(cè)37 ℃、475 nm的吸光值。總反應(yīng)體系為200 μL。

    標(biāo)準(zhǔn)曲線測(cè)定:用50 mmol/L磷酸鈉緩沖液配制一系列不同濃度的L-DOPA標(biāo)準(zhǔn)樣品與2 mmol/L高碘酸鈉混合液,相同條件下反應(yīng)10 min,檢測(cè)475 nm下的吸光值,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(y=0.000 4x+0.014 6,R2=0.99。式中,y,A475nm;x,L-DOPA濃度,μmol/L)。

    酶活力定義:每1 min生成1 nmolL-DOPA所需的酶量為1個(gè)酶活力單位,記為U:

    (1)

    式中:ρ,L-DOPA質(zhì)量濃度,g/L;V,酶反應(yīng)體系體積,L;M,L-DOPA相對(duì)分子質(zhì)量,197.19;t,反應(yīng)時(shí)間,min。

    1.2.6L-DOPA[23]與BH4[24]檢測(cè)

    樣品經(jīng)三氯乙酸沉淀,4 ℃、12 000 r/min離心10 min,取上清液進(jìn)行HPLC測(cè)定。HPLC液相檢測(cè)條件如下:

    L-DOPA:色譜柱(4.6 mm×250 mm,XSelect?HSS T3,Japan);柱溫30 ℃;波長(zhǎng)280 nm;流動(dòng)相為0.08%甲酸/乙腈;流速1 mL/min。配制一系列濃度的L-DOPA標(biāo)準(zhǔn)樣品,在相同條件下檢測(cè),以確定出峰時(shí)間并制作峰面積-濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線(y=27.6x,R2=0.999。其中:y,峰面積,μAU·s;x,L-DOPA濃度,μmol/L)。

    BH4:色譜柱(4.6 mm×250 mm,XSelect?HSS T3,Japan);柱溫40 ℃;波長(zhǎng)246 nm;流動(dòng)相為30 mmol/L乙酸鈉,體積分?jǐn)?shù)3%甲醇;流速:1 mL/min。配制一系列濃度的BH4標(biāo)準(zhǔn)樣品,在相同條件下檢測(cè),以確定出峰時(shí)間并制作峰面積-濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線(y=27.697x+0.809,R2=0.99。其中:y,峰面積,mAU·min;x,BH4濃度,mmol/L)。

    1.2.7 TH催化過程探究

    將酶液與終濃度為0.3 mmol/L的BH4、2.5 μmol/L Fe2+混合,冰浴10 min;加入一定濃度的L-Tyr,置于37 ℃培養(yǎng)箱反應(yīng),每隔10 min取樣。樣品加入終體積分?jǐn)?shù)為5%的三氯乙酸,在4 ℃放置3 h,然后4 ℃、12 000 r/min離心10 min取上清液,進(jìn)行HPLC測(cè)定。

    2 結(jié)果與討論

    2.1 TH的氨基酸序列分析

    在B.licheniformis中構(gòu)建L-DOPA合成途徑的關(guān)鍵是篩選出合適的TH基因。本研究選擇Streptosporangiumroseum來源的TH基因,并對(duì)其進(jìn)行氨基酸序列分析。查找NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)可得,srth全長(zhǎng)894 bp,編碼297個(gè)氨基酸殘基。通過ExPASy在線工具分析可知,srth基因編碼的SrTH蛋白分子式為C1511H2311N411O445S5,預(yù)測(cè)分子質(zhì)量約為33.5 kDa,等電點(diǎn)為5.00。在組成SrTH蛋白的所有氨基酸中,丙氨酸(Ala) 比例最高,占氨基酸總量的11.8%;其次是亮氨酸(Leu),占氨基酸總量的10.1%;半胱氨酸(Cys)比例最低,僅為總氨基酸量的0.3%;帶負(fù)電荷殘基總數(shù)(Asp+Glu)為46個(gè),帶正電殘基總數(shù)(Arg+Lys)為28個(gè);脂肪族氨基酸指數(shù)90.40,親水性的總平均值為-0.208,屬于親水性蛋白;計(jì)算失穩(wěn)指數(shù)(II)為35.62,歸類為穩(wěn)定蛋白質(zhì)。

    為了解SrTH與動(dòng)物來源TH的親緣關(guān)系,在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)下載獲得不同微生物及動(dòng)物來源TH氨基酸序列,利用MEGA 6.0 繪制了TH系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖1)。由進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),微生物來源和動(dòng)物來源的TH在進(jìn)化樹中各自聚集在一起,SrTH與TbTH(ThermobisporabisporaDSM 43833)的進(jìn)化距離最近,與動(dòng)物來源的TH較遠(yuǎn),與人類來源的TH進(jìn)化距離最遠(yuǎn),因此難以斷定該基因是否具有與動(dòng)物來源基因相同的生物學(xué)功能,有必要進(jìn)行氨基酸序列比對(duì),根據(jù)保守性初步判定其是否具備催化L-Tyr合成L-DOPA的功能。因此,利用DNAMAN進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)分析(圖2)。

    圖1 SrTH與其他來源的TH的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.1 Phylogenetic tree of SrTH and TH from other sources

    研究表明,動(dòng)物來源TH的活性受到N端的Ser19、Ser31、Ser40的磷酸化調(diào)節(jié),具有鐵原子和底物蝶呤結(jié)合的氨基酸殘基[25-27]。根據(jù)氨基酸序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),SrTH中存在參與鐵元素結(jié)合的保守氨基酸殘基His162、His167和Glu208以及參與底物喋呤結(jié)合氨基酸殘基Gly124、Leu126、Phe131、Glu163和 Glu208,與家蠶來源的TH一致[27]。此外,比對(duì)發(fā)現(xiàn)微生物來源與動(dòng)物來源的TH在參與底物喋呤結(jié)合的氨基酸殘基區(qū)域存在一定差異(動(dòng)物來源TH:Leu125、Tyr203;微生物來源TH:Val125和Phe203)。該差異殘基是否影響對(duì)酶與底物喋呤親和力,需進(jìn)一步驗(yàn)證。

    “▲”、“★”分別表示與鐵離子和底物蝶呤結(jié)合的保守氨基酸殘基圖2 SrTH與其他來源的TH氨基酸序列比對(duì)Fig.2 Comparison of the amino acids sequences ofSrTH and TH from other sources

    以上研究表明,SrTH與動(dòng)物來源TH存在基本一致的底物結(jié)合位點(diǎn),具備基于B.licheniformis表達(dá)系統(tǒng)合成L-DOPA的功能基礎(chǔ),接下來將SrTH在B.licheniformis中異源表達(dá)驗(yàn)證其酶功能。

    2.2 SrTH重組表達(dá)菌構(gòu)建

    按照1.2.2的方法構(gòu)建TH重組質(zhì)粒pMA5-srth、pHY-srth,重組質(zhì)粒的大小分別為7 954、6 314 bp;將2個(gè)重組質(zhì)粒分別用NdeI、NheI和KpnI、SalI雙酶切。Bl/pMH酶切后理論條帶大小是912和7 042 bp,Bl/pHH酶切后理論條帶大小是894和5 420 bp,結(jié)果如圖3所示,電泳條帶大小與理論值一致,說明TH重組質(zhì)粒pMA5-srth、pHY-srth構(gòu)建成功。

    M-DNA marker;1~2-重組質(zhì)粒pMA5-srth單、雙酶切;3~4-重組質(zhì)粒pHY-srth單、雙酶切圖3 重組質(zhì)粒pMA5-srth、pHY-srth單雙酶切驗(yàn)證Fig.3 Verification of recombinant plasmids pMA5-srthand pHY-srth through enzyme digestion reactions

    2.3 地衣芽孢桿菌中TH功能探究

    2.3.1 胞內(nèi)酶活力的測(cè)定

    將對(duì)照菌Bl/pMA及重組表達(dá)菌株Bl/pMH按1.2.3分別進(jìn)行搖瓶發(fā)酵。按照1.2.5酶活性檢測(cè)方法檢測(cè)粗酶液酶活力。結(jié)果顯示,空載菌株Bl/pMA未檢測(cè)到酶活力,重組菌株Bl/pMH胞內(nèi)檢測(cè)到酶活力。以Bl/pMA為空白對(duì)照,重組表達(dá)菌株Bl/pMH胞內(nèi)粗酶酶活性為30.7 U/mL。由此可知,酪氨酸羥化酶SrTH可在B.licheniformis中正常表達(dá)并具有酶活力。然而其是否具有生物學(xué)功能,有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

    2.3.2 全細(xì)胞轉(zhuǎn)化

    如圖4所示,在B.licheniformis中,L-DOPA的合成在TH、L-Tyr、輔因子BH4的共同參與下完成。由于B.licheniformis自身基因組中存在從GTP合成BH4前體的代謝途徑,通過表達(dá)墨蝶呤還原酶即可實(shí)現(xiàn)BH4的合成。因此,在底物L(fēng)-Tyr的存在下,只需提供墨蝶呤還原酶即可在重組菌Bl/pMH中實(shí)現(xiàn)L-DOPA合成。將酪氨酸羥化酶重組菌Bl/pMH與墨蝶呤還原酶重組菌Bl/pMF進(jìn)行混合,便可直接快速高效地利用全細(xì)胞聯(lián)合催化合成L-DOPA。

    將Bl/pMH與Bl/pMF菌株混合,以L-Tyr為底物進(jìn)行全細(xì)胞聯(lián)合轉(zhuǎn)化,并與空載及Bl/pMH、Bl/pMF單獨(dú)轉(zhuǎn)化進(jìn)行對(duì)照,結(jié)果如圖5所示。

    全細(xì)胞轉(zhuǎn)化36 h后,Bl/pMH與Bl/pMF全細(xì)胞聯(lián)合轉(zhuǎn)化反應(yīng)體系變成黑色,而在相同的培養(yǎng)條件下,空載及Bl/pMH、Bl/pMF的全細(xì)胞轉(zhuǎn)化反應(yīng)液未發(fā)生顏色變化(圖5-a)。

    虛線方內(nèi)框?yàn)锽. licheniformis中BH4前體物質(zhì)6-丙酮酰四氫蝶呤合成途徑圖4 地衣芽孢桿菌中TH催化L-Tyr合成L-DOPA途徑Fig.4 The biosynthesis of L-DOPA via L-tyrosine catalyzed by tyrosine hydroxylase in B. licheniformis

    a-L-DOPA的氧化;b-L-DOPA的液相檢測(cè)圖5 不同重組菌株的全細(xì)胞轉(zhuǎn)化Fig.5 Whole-cell biotransformation of differentrecombinant strains

    由于L-DOPA很容易被氧化成多巴醌并進(jìn)一步氧化成黑色素[28],因此我們推斷,B.licheniformis中srth基因成功表達(dá),并在墨蝶呤還原酶的存在下,實(shí)現(xiàn)L-DOPA積累,并一定程度上被空氣氧化為黑色素[30],使得發(fā)酵液變?yōu)楹谏?/p>

    進(jìn)一步將發(fā)酵液進(jìn)行HPLC檢測(cè),結(jié)果如圖5-b所示??蛰d菌株Bl/pMA5、Bl/pMF單獨(dú)全細(xì)胞轉(zhuǎn)化均沒有L-DOPA產(chǎn)生,Bl/pMH與Bl/pMF全細(xì)胞聯(lián)合轉(zhuǎn)化后L-DOPA產(chǎn)量為335.92 μmol/L。分析其原因是B.licheniformis具有從GTP合成BH4前體6-丙酮酰四氫蝶呤的代謝途徑,墨蝶呤還原酶的過表達(dá)成功催化前體6-丙酮酰四氫蝶呤合成BH4,為TH催化L-Tyr合成L-DOPA提供了輔因子。同時(shí),該結(jié)果說明BH4在TH催化L-Tyr合成L-DOPA過程中至關(guān)重要,這與文獻(xiàn)報(bào)道相一致[29]。在不存在BH4下,SrTH可以催化L-Tyr合成少量L-DOPA,具體原因有待進(jìn)一步研究。

    由以上結(jié)果可知,在墨蝶呤還原酶重組菌Bl/pMF輔助下,SrTH在B.licheniformis中具有催化L-Tyr合成L-DOPA的能力。但是催化過程中底物L(fēng)-Tyr與輔因子BH4需求量及消耗比例尚不可知,后續(xù)使用純化后SrTH對(duì)底物與輔因子比例進(jìn)行初步探索,為后期B.licheniformis“從頭”合成L-DOPA代謝改造奠定基礎(chǔ)。

    2.4 地衣芽孢桿菌中TH的分離純化與酶活性分析

    為了更加清晰明了表達(dá)后的SrTH酶催化過程底物與輔因子的消耗比例關(guān)系,選擇用純化后的酶進(jìn)行探究。為便于酶的分離純化和酶活性分析,選擇重組菌Bl/pHH進(jìn)行胞外表達(dá)。將按照1.2.3獲得純化后的SrTH蛋白。將純化后酶液進(jìn)行SDS-PAGE,結(jié)果如圖6所示。

    M-蛋白質(zhì)marker;1-空載Bl/pHY;2-Bl/pHY-srth純化后重組蛋白圖6 重組蛋白SrTH SDS-PAGE結(jié)果Fig.6 SDS-PAGE results of recombinant protein SrTH

    在35 kDa位置有目的蛋白條帶,與SrTH預(yù)測(cè)分子質(zhì)量33.5 kDa相符,獲得了純度較高的目的蛋白,可用于進(jìn)一步研究。

    將目的蛋白經(jīng)鎳柱親和層析純化并收集洗脫組分進(jìn)行透析復(fù)性,結(jié)果如表3所示。SrTH蛋白酶活力為22.79 U/mL,總酶活力為113.94 U,回收率為10.67%,比酶活力為70.77 U/mg,純化倍數(shù)達(dá)33.38。相比于桂江[19]在大腸桿菌中異源表達(dá)家蠶來源TH基因,同樣以L-Tyr為底物,僅獲得0.13 U/mg的比酶活力,SrTH蛋白具有較好的表現(xiàn)。

    表3 酶純化過程中酶活力及蛋白濃度Table 3 Enzyme activities and protein concentrationsduring purification proces

    2.5 TH催化過程探究

    在TH轉(zhuǎn)化L-Tyr合成L-DOPA過程中,L-Tyr在BH4存在下轉(zhuǎn)化為L(zhǎng)-DOPA,同時(shí)BH4參與反應(yīng)后轉(zhuǎn)化為4a-OH-BH4[30],因此若要實(shí)現(xiàn)B.licheniformis中TH轉(zhuǎn)化L-Tyr合成L-DOPA過程的持續(xù)進(jìn)行,保證L-Tyr與BH4的充足供給,有必要探究催化過程中底物L(fēng)-Tyr與輔因子BH4的消耗比例。利用純化后的SrTH和商業(yè)來源的BH4標(biāo)準(zhǔn)樣品設(shè)計(jì)酶反應(yīng)實(shí)驗(yàn)。對(duì)酶反應(yīng)過程中L-Tyr、L-DOPA、BH4以及4a-OH-BH4的變化情況進(jìn)行分析。結(jié)果如圖7所示。

    圖7 SrTH催化L-Tyr合成L-DOPA過程圖Fig.7 The process of the synthesization for L-DOPAvia L-tyrosine catalyzed by SrTH

    從圖7可以看出,隨著反應(yīng)的進(jìn)行,底物L(fēng)-Tyr與輔因子BH4不斷被消耗,產(chǎn)物L(fēng)-DOPA與4a-OH-BH4逐漸增多。在0~20 min內(nèi),L-Tyr濃度迅速由1 681 μmol/L降至1 498 μmol/L,隨后基本不再變化,L-DOPA逐漸積累至13 μmol/L,20 min后出現(xiàn)略微降低,這是因?yàn)長(zhǎng)-DOPA在空氣中不穩(wěn)定,逐漸被氧化為黑色素導(dǎo)致的[28]。同時(shí)觀察到BH4由302 μmol/L降至較低水平,在30 min時(shí)已基本檢測(cè)不到,因此推測(cè)是輔因子BH4不足導(dǎo)致反應(yīng)無法繼續(xù)進(jìn)行。在第40 min補(bǔ)加BH4至728 μmol/L,L-Tyr在10 min內(nèi)減少了145 μmol/L,證明輔因子BH4是限制酶反應(yīng)進(jìn)行的重要因素;60~70 min 反應(yīng)逐漸停止,該階段L-DOPA 最高積累量為25 μmol/L。然而此時(shí)酶反應(yīng)體系尚存在BH4,我們猜測(cè)反應(yīng)的停止是酶量不足所致。因此酶反應(yīng)80 min同時(shí)補(bǔ)加酶液和BH4,L-Tyr在30 min內(nèi)減少量為224 μmol/L,L-DOPA增加量為20 μmol/L,BH4減少量為437 μmol/L。由此可知,BH4是酶反應(yīng)進(jìn)行的重要限制性因素,通過補(bǔ)充BH4和酶液可以使反應(yīng)持續(xù)進(jìn)行,計(jì)算可知L-Tyr的消耗量與輔因子BH4的需求量之比約為1∶2。同時(shí),根據(jù)酶反應(yīng)的結(jié)果推測(cè),全細(xì)胞轉(zhuǎn)化中Bl/pMF合成的BH4在 TH的催化過程中也可能是不充足的。

    3 結(jié)論

    本研究通過生物信息學(xué)方法篩選出一種具有底物保守結(jié)合位點(diǎn)的微生物來源TH基因,在B.licheniformis中成功表達(dá),胞內(nèi)外酶活性分別為30.7和22.79 U/mL。進(jìn)一步通過B.licheniformis重組菌(Bl/pMH與Bl/pMF)全細(xì)胞轉(zhuǎn)化法成功實(shí)現(xiàn)L-DOPA的積累。其次,通過在TH/墨蝶呤還原酶催化Tyr合成L-DOPA過程中進(jìn)行輔因子補(bǔ)給,我們得出L-DOPA合成過程中底物L(fēng)-Tyr與四氫生物蝶呤之間供給比例關(guān)系,為后續(xù)TH法催化L-Tyr合成L-DOPA提供可靠的理論支持。

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