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    夏大豆重組自交系群體遺傳圖譜構(gòu)建及開花期QTL 分析

    2020-02-28 01:48:44曹永策李曙光張新草孔杰杰趙團結(jié)
    中國農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年4期
    關(guān)鍵詞:開花期表型圖譜

    曹永策,李曙光,張新草,孔杰杰,趙團結(jié)

    (1 延安大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/陜西省紅棗重點實驗室(延安大學(xué)),陜西延安 716000;2 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆研究所/國家大豆改良中心/農(nóng)業(yè)部大豆生物學(xué)與遺傳育種重點實驗室(綜合)/作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點實驗室/江蘇省現(xiàn)代作物生產(chǎn)協(xié)同創(chuàng)新中心,南京 210095)

    0 引言

    【研究意義】大豆是典型的短日照植物,對光溫變化敏感,日照長度必須短于一定時長才能開花[1-2]。單一的大豆品種只能適應(yīng)狹窄的緯度范圍,在不同大豆產(chǎn)區(qū)都具有與之相適應(yīng)的生態(tài)類型[3-4]。開花期是重要的生育期性狀,不僅是大豆光溫反應(yīng)的直接體現(xiàn),同時對其他的產(chǎn)量和品質(zhì)性狀具有重要影響[5-7]。因此,深入解析大豆開花期的遺傳基礎(chǔ),對大豆品種的栽培區(qū)域合理劃分以及培育廣適應(yīng)的大豆品種具有重要意義?!厩叭搜芯窟M展】大豆開花期是典型的數(shù)量性狀,在遺傳上既受主效基因控制,又受微效多基因影響[8]。目前,通過遺傳分析報道了E1[9]、E2[9]、E3[10]、

    E4[11]、E5[12]、E6[13]、E7[14]、E8[4]、E9[2]、E10[15]、J[16]

    和E11[17]共12 個控制大豆生育期的基因。其中,E1[1]、E2[18]、E3[19]、E4[20]、E9[21]、E10[15]和J[22]位點的功能基因已被克隆或預(yù)測。E6還沒有被定位,E5可能不是一個真實存在的位點[23]。除了這些被命名的基因位點外,還有許多數(shù)量控制位點(QTL)被報道[24-32]。目前,在SoyBase 數(shù)據(jù)庫中至少報道了100 個控制大豆開花期的QTL(www.soybase.org)。另外KIM 等[33]通過同源比對分析發(fā)現(xiàn)在大豆中有118 個與擬南芥生育期相關(guān)的同源基因;同時,ZHAI 等[34]研究也發(fā)現(xiàn)即使E1—E4等開花期位點遺傳背景相同,群體的開花期仍有分離。以上結(jié)果均表明仍有許多未知的QTL/基因控制開花期。【本研究切入點】上述研究使用的材料多為春大豆類型,而江淮地區(qū)是中國重要的大豆產(chǎn)區(qū),品種以麥?zhǔn)蘸笙拇蠖诡愋蜑橹?,不同于國?nèi)外春大豆類型。但目前對該地區(qū)夏大豆開花期性狀遺傳基礎(chǔ)的研究相對較少?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究以2 個夏大豆材料科豐35(KF35)和南農(nóng)1138-2(NN1138-2)為親本雜交衍生的1 個重組自交系群體(NJK3N-RIL)為試驗材料,基于高密度遺傳圖譜,對大豆開花期性狀進行QTL 分析,以揭示夏大豆開花期的遺傳構(gòu)成;同時鑒定出能在多個環(huán)境下穩(wěn)定表達的QTL,為分子標(biāo)記輔助選擇育種和基因圖位克隆提供有用信息。

    1 材料與方法

    1.1 試驗材料與田間試驗設(shè)計

    以2 個夏大豆材料KF35 和NN1138-2 為親本,雜交得到F1代,經(jīng)單籽傳法,衍生的91 個家系(F2:8)組成的重組自交系(RIL)群體(NJK3N-RIL)為試驗材料。

    NJK3N-RIL 群體以及2 個親本在2012 年分別種植于南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)試驗站(2012JP)和安徽科技學(xué)院鳳陽試驗田(2012FY);在2013 年分別種植于南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)試驗站(2013JP)和安徽科技學(xué)院鳳陽試驗田(2013FY);在2014 年分別種植于南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)試驗站(2014JP)和江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所(2014YC),共計6 個生長環(huán)境。采用隨機完全區(qū)組設(shè)計,3 次重復(fù),單行區(qū),行長1 m,每行10 個單株,株距10 cm,相鄰行距50 cm,常規(guī)田間管理。

    1.2 表型調(diào)查及數(shù)據(jù)分析

    在單個種植重復(fù)中,NJK3N-RIL 群體及其親本的開花期記錄為從播種當(dāng)日到試驗小區(qū)有一半以上植株主莖出現(xiàn)花朵的天數(shù),單個環(huán)境下表型值取該環(huán)境下3 個種植重復(fù)的平均值,記錄單位為“天”[29,35]。

    利用SPSS 20.0(SPSS Inc.,Chicago,IL,USA)軟件對表型數(shù)據(jù)進行描述性統(tǒng)計,包括性狀在環(huán)境下的變異范圍、平均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)和正態(tài)分布檢驗等。使用SAS 9.3(SAS Institute Inc. 2011)軟件的Proc GLM 過程進行多環(huán)境聯(lián)合方差分析,估計方差分量用來評估性狀在群體中的廣義遺傳率。廣義遺傳率計算公式如下:

    其中,σ2g為遺傳方差、σ2ge為基因型與環(huán)境互作方差、σ2e為誤差方差,n為環(huán)境數(shù),r為單環(huán)境下的重復(fù)次數(shù)[36]。

    1.3 基因型分型與遺傳圖譜構(gòu)建

    采用限制性酶切位點相關(guān)的DNA 測序(restriction- site Associated DNA sequencing,RAD-Seq)技術(shù),對NJK3N-RIL 群體進行全基因組SNP 開發(fā),然后根據(jù)親本和家系的基因型開發(fā)bin標(biāo)記用于構(gòu)建遺傳圖譜,具體方法參考HAN 等[37]和HUANG 等[38]方法。采用JoinMap 4.0 軟件構(gòu)建遺傳圖譜,以標(biāo)記間LOD 值大于3 進行連鎖群劃分,采用Regression mapping 算法和Kosambi 函數(shù)計算連鎖群內(nèi)標(biāo)記的線性排列以及標(biāo)記間的遺傳距離(centiMorgan,cM)[39]。

    1.4 QTL 分析

    使用QTL Network 2.2 和Windows QTL Cartographer V2.5_011 對大豆開花期進行QTL 分析[40-41]。首先利用QTLNetwork 2.2 軟件基于混合線性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法(MCIM)進行多環(huán)境下聯(lián)合分析,以檢測不同效應(yīng)(加性效應(yīng)、上位性、環(huán)境互作)對大豆開花期的影響。檢驗時設(shè)置參數(shù)如下:檢測窗口大小及步長分別設(shè)置為10 和1 cM,排列測驗(permutation test)1 000 次,以P=0.05 為統(tǒng)計檢測閾值確定顯著性QTL;其次利用Windows QTL Cartographer V2.5_011軟件的復(fù)合區(qū)間作圖法(CIM)進行單環(huán)境下QTL 定位及效應(yīng)檢測,以檢測能在多環(huán)境中穩(wěn)定表現(xiàn)的QTL。檢驗時設(shè)置參數(shù)如下:采用Zmapqtl 模型6(標(biāo)準(zhǔn)模型),窗口大小和步長分別設(shè)置為10 和1 cM,排列測驗1 000 次,以P=0.05 為統(tǒng)計閾值,判斷是否存在QTL。在不同環(huán)境或方法下,檢測到的QTL 置信區(qū)間重疊,且加性效應(yīng)方向一致,認(rèn)為是同一個QTL。

    表1 不同環(huán)境下NJK3N-RIL 群體及其親本開花期(天)性狀描述性統(tǒng)計Table 1 Results of descriptive statistics of flowering time (days) in NJK3N-RIL population grown in different environments

    2 結(jié)果

    2.1 NJK3N-RIL 群體開花期性狀表型變異特點

    NJK3N-RIL 群體及其親本在多個種植環(huán)境下的開花期表型如表1所示。在所有環(huán)境下,2個親本KF35和NN1138-2 的開花期平均值分別為40.4 和48.1 d,二者差異顯著(P<0.01)。并且NJK3N-RIL 群體的開花期性狀在單個環(huán)境中均呈連續(xù)分布;除2014JP環(huán)境外,其他5 個環(huán)境下該群體的開花期表型頻率分布的偏度和峰度值(絕對值)均小于1,基本符合正態(tài)分布。表明大豆開花期性狀為多位點控制的數(shù)量性狀(表1 和圖1)。

    大豆開花期具有較高的廣義遺傳率(h2,93.8%),多環(huán)境聯(lián)合方差分析結(jié)果表明(電子附表1),開花期性狀在家系間、環(huán)境間以及環(huán)境與家系互作上均存在極顯著差異(P<0.001),說明開花期在群體中存在較大的遺傳變異,且易受環(huán)境影響。但家系與環(huán)境互作的均方值遠(yuǎn)小于家系間的均方值,說明了開花期性狀在家系間的差異主要是由遺傳變異引起的。

    2.2 基因型分型與遺傳圖譜構(gòu)建

    采用RAD-seq 技術(shù)對NJK3N-RIL 群體及其親本進行基因型分型。以Williams 82(Glyma.Wm82.a1. v1.1)為參考基因組,經(jīng)過序列比對和過濾,共獲得36 778 個高質(zhì)量SNP 標(biāo)記,分布在大豆20 條染色體上(表2)。其中只有第1、12 和19 染色體的SNP數(shù)低于1 000 個。根據(jù)窗口滑動法,將36 778 個SNP劃分成1 733 個bin 標(biāo)記用于遺傳圖譜構(gòu)建和后續(xù)分析。

    根據(jù)標(biāo)記間的連鎖情況,1 733 個bin 標(biāo)記被劃分為20 條連鎖群,同大豆20 條染色體相對應(yīng)。以連鎖群為單位,計算標(biāo)記的線性排列,并估算相鄰標(biāo)記間的遺傳距離。最終構(gòu)建出一張包含20 條連鎖群,遺傳長度為2 362.4 cM 的遺傳圖譜(表2、圖2 和電子附圖1)。標(biāo)記間的平均距離為1.4 cM,平均每條連鎖群的遺傳長度為118.1 cM。其中,第1 染色體對應(yīng)的連鎖群上含有的bin 標(biāo)記數(shù)目最少,為57 個;第18 染色體對應(yīng)的連鎖群上的bin 數(shù)目最多,為110個。第14 染色體所對應(yīng)的連鎖群遺傳長度最短,為80.1 cM;第15 染色體所對應(yīng)的連鎖群遺傳長度最長為148.6 cM。

    圖1 NJK3N-RIL 群體開花期在不同環(huán)境中的分布Fig. 1 Frequency distribution of flowering time in NJK3N-RIL population grown in different environments

    表2 NJK3N-RIL 群體遺傳圖譜信息匯總Table 2 Summary of genetic map information of NJK3N-RIL population

    圖2 NJK3N-RIL 群體中bin 標(biāo)記在遺傳圖譜上的分布Fig. 2 Distribution of bin markers on 20 Linkage groups in the NJK3N-RIL population

    表3 NJK3N-RIL 群體開花期加性及QTL 與環(huán)境互作效應(yīng)的分析Table 3 Additive QTLs and QTL-by-environment interaction effect for flowering time in the NJK3N-RIL population

    2.3 利用MCIM 法檢測開花期性狀QTL

    利用MCIM 法,在多環(huán)境聯(lián)合分析下共檢測到9個控制開花期的加性QTL,分布在第8、10、11、13、15、16 和20 染色體上(表3 和圖3)。單個QTL 的加性效應(yīng)值在-0.5—0.7 d,能夠解釋3.0%—12.0%的表型變異。其中,qFT-16-1和qFT-20-1的表型解釋率均在10%以上,是該群體中主效QTL;qFT-11-1在2013FY 和2014JP 中與環(huán)境互作顯著,互作效應(yīng)值分別為0.6 和-0.8 d,互作效應(yīng)對表型變異的總解釋率為4.6%。在檢測到的9 個加性QTL 中,除qFT-10-1外,其他所有 QTL 的增效等位變異來均來自親本NN1138-2,這與NN1138-2 具有較晚的開花期相一致。

    在NJK3N-RIL 群體中共檢測到2 對上位性互作QTL,均為加性效應(yīng)QTL 構(gòu)成(表4 和圖3)。其中,第一對上位性QTL 對由qFT-11-1和qFT-16-1構(gòu)成,互作效應(yīng)值和表型解釋率分別為-0.2 d 和0.6%;并且該上位性互作QTL 對在2013FY 和2014JP 中與環(huán)境互作顯著,能夠解釋0.8%表型變異。第二對上位性QTL 對由qFT-13-1和qFT-16-2構(gòu)成,互作效應(yīng)值和表型解釋率分別為0.3 d 和1.5%,但與環(huán)境互作不顯著。

    表4 NJK3N-RIL 群體開花期QTL 上位互作效應(yīng)分析Table 4 Epistatic QTL pairs for flowering time in the NJK3N-RIL population

    2.4 利用CIM 法檢測開花期性狀QTL

    利用CIM 法,在NJK3N-RIL 群體中共檢測到10個控制開花期的QTL,分布于第5、6、8、11、15、16和20染色體(表5和圖3)。其中,qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1和qFT-16-1能夠在3 個及以上的環(huán)境中檢測到,是NJK3N-RIL 群體中控制開花期性狀的環(huán)境穩(wěn)定QTL。qFT-16-1能夠在所有環(huán)境中檢測到,單個環(huán)境中的LOD 值為4.7—13.9,解釋了10.8%—28.9%的表型變異,是NJK3N-RIL 群體中的最穩(wěn)定和主效QTL。qFT-11-1在5 個環(huán)境中檢測到,單個環(huán)境下LOD 值為8.6—18.2,解釋了17.7%—49.6%的表型變異,是NJK3N-RIL 群體中控制開花期性狀另一個主效位點。qFT-15-1在4 個環(huán)境檢測到,單個環(huán)境下LOD 值為4.0—9.3,解釋了7.6%—23.0%的表型變異。qFT-8-1在3 個環(huán)境中檢測到,單個環(huán)境下LOD 值在3.2—4.6,解釋了6.6%—9.1%的表型變異。qFT-8-2在2 個環(huán)境中檢測到,在單個環(huán)境中的LOD 值分別為3.8 和4.8,表型貢獻率分別為5.9%和9.4%。qFT-5-1、qFT-6-1、qFT-16-2、qFT-20-1和qFT-20-2僅能在單環(huán)境中檢測到,LOD 值為3.4—10.3,解釋了5.0%—19.1%的表型變異,為環(huán)境敏感QTL。在檢測到的10 個QTL 中,除qFT-5-1增效等位變異來自親本KF35 以外,其余9個QTL 的增效等位變異均來自親本NN1138-2。

    圖3 NJK3N-RIL 群體中開花期QTL 在連鎖群上的位置Fig. 3 Locations of QTL for flowering time in soybean linkage map in NJK3N-RIL population

    表5 NJK3N-RIL 群體不同環(huán)境中開花期QTL 分析Table 5 Detection of QTL associated with flowering time in the NJK3N-RIL population grown in different environments

    3 討論

    3.1 bin 標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建

    QTL 定位是解析植物數(shù)量性狀遺傳基礎(chǔ)的一種有效方法。遺傳圖譜的質(zhì)量顯著影響QTL 定位結(jié)果的精度,在特定群體中增加標(biāo)記密度可以提高圖譜的作圖分辨率[42-43]。如ZHANG 等[44]應(yīng)用一張包含6 159個SLAF 標(biāo)記的大豆高遺傳圖譜分析耐低磷性狀的QTL,發(fā)現(xiàn)同低密度遺傳圖譜相比,高密度遺傳圖譜的作圖精度會顯著提高。目前,下一代測序技術(shù),具有高通量、標(biāo)記開發(fā)周期短等特點,能夠方便的、快速的獲得全基因組范圍內(nèi)的SNP 標(biāo)記,為高密度遺傳圖譜構(gòu)建和數(shù)量性狀解析提供了方便[45-47]。其中,RAD-seq 技術(shù)近年來被廣泛應(yīng)用于大豆遺傳圖譜構(gòu)建、QTL 分析和候選基因挖掘等研究中。WANG 等[48]基于RAD-seq 技術(shù)構(gòu)建了2 張分別包含5 728 和4 354個bin 標(biāo)記的高遺傳圖譜,并對大豆花色、花期和種皮色等性狀進行了分析,發(fā)現(xiàn)大部分的QTL 都被定位在小的基因組區(qū)間內(nèi);CHENG 等[49]利用該技術(shù)構(gòu)建了一張包含3 469 個bin 標(biāo)記的遺傳圖譜,將抗疫霉病位點RpsWY定位在約100 kb 區(qū)間內(nèi),并預(yù)測了4 個候選基因;WANG 等[50]利用RAD-seq 技術(shù)構(gòu)建的圖譜將葉型相關(guān)的一些QTL 定位在較小的基因組區(qū)間內(nèi),并對相關(guān)位點的候選基因進行分析。以上結(jié)果均表明基于RAD-seq技術(shù)構(gòu)建的高密度遺傳圖譜具有較高的作圖分辨率,能夠方便地應(yīng)用于QTL 定位和候選基因分析等研究中。而本研究利用該技術(shù)構(gòu)建的圖譜包含1 733 個bin 標(biāo)記,標(biāo)記間的平均距離為1.4 cM,可以保證定位到的QTL都有2 個或以上的緊密連鎖標(biāo)記(5 cM 內(nèi)),能夠在一定程度上彌補作圖群體規(guī)模較小的缺陷,提高了作圖分辨率。相應(yīng)地,本研究的定位結(jié)果也顯示了絕大多數(shù)QTL 被定位在1 Mb 的物理區(qū)間內(nèi)。因此,本研究構(gòu)建的遺傳圖譜能夠有效地應(yīng)用于大豆農(nóng)藝、產(chǎn)量和品質(zhì)等相關(guān)性狀的遺傳解析、分子標(biāo)記輔助選擇育種以及基因圖位克隆的研究。

    3.2 夏大豆NJK3N-RIL 群體開花期的遺傳構(gòu)成

    本研究結(jié)果顯示夏大豆NJK3N-RIL 群體開花期性狀具有較高的遺傳率(93.8%),但多環(huán)境聯(lián)合方差分析結(jié)果也表明群體中材料的基因型差異、環(huán)境差異及基因型與環(huán)境互作效應(yīng)均對開花期存在極顯著影響,說明開花期受許多因素影響。XU 等[51]認(rèn)為大部分?jǐn)?shù)量性狀的表型除受主效QTL 或基因控制外,還可能會受QTL 上位性和環(huán)境互作效應(yīng)的影響。且當(dāng)QTL作圖模型中考慮了這些因素時,QTL 的定位精度會大大提高[52-53]。因此,本研究利用了具有加性、上位性及與環(huán)境互作效應(yīng)的完整遺傳模型進行QTL 分析。結(jié)果顯示加性QTL、上位性互作QTL 及環(huán)境互作效應(yīng)均對開花期表型變異有影響,多個QTL 存在環(huán)境互作或上位性互作效應(yīng),3 種效應(yīng)累積表型變異解釋率分別為63.9%、2.1%和4.6%。因此,如果在使用這些QTL 進行分子輔助育種時能夠充分考慮這些遺傳效應(yīng),將有利于更加準(zhǔn)確地估計育種表型值。但在開花期遺傳構(gòu)成中,加性QTL 效應(yīng)的貢獻率要遠(yuǎn)大于另外2 種因素,占絕對優(yōu)勢,暗示了在前期研究中有必要去發(fā)掘能夠在多個環(huán)境穩(wěn)定表達的加性QTL。

    3.3 與前人大豆開花期QTL 定位結(jié)果的比較

    利用MCIM 法共檢測到9 個控制開花期的加性QTL,利用CIM 法共檢測到10 個控制開花期的QTL,且有7 個QTL 使用2 種方法均能檢測到。綜合2 種分析方法,本研究共檢測到12 個開花期QTL。其中,qFT-6-1、qFT-10-1、qFT-11-1、qFT-16-1、qFT-16-2和qFT-20-1等分別與SoyBase 中報道的控制大豆開花期(first flower)位點First flower 1-1、First flower 24-4、First flower 11-2、First flower 13-7、First flower 9-3、First flower 21-2的區(qū)間相鄰或重疊,推測可能是相同的QTL(表3 和表5),與前人研究相一致,從側(cè)面驗證了這些位點的真實性;同時也有 6 個位點(qFT-5-1、qFT-8-1、qFT-8-2、qFT-13-1、qFT-15-1和qFT-20-2)是本研究新檢測到的開花期QTL(表3和表5),尤其是qFT-8-1和qFT-15-1能夠在多個環(huán)境和不同方法中檢測到,表明夏大豆NJK3N 群體中具有獨特的開花期遺傳基礎(chǔ)構(gòu)成。另外,本研究檢測的QTL 與E1、E2、E3、E4和E9等一些在春大豆材料中控制開花期起重要作用的位點并不重合,表明江淮地區(qū)夏大豆開花期調(diào)控方式與春大豆的調(diào)控方式具有差異。因此,有必要利用更多的種質(zhì)資源來揭示夏大豆開花期的遺傳基礎(chǔ)。

    雖然在SoyBase 中有100 多個與大豆開花期相關(guān)的QTL 被報道,但大多數(shù)位點只能在單個或特定的環(huán)境中被檢測到。鑒定出不同環(huán)境穩(wěn)定表達的QTL,將方便應(yīng)用于MAS 或基因圖位克隆解析大豆開花期分子機制的研究。本研究中,qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1和qFT-16-1能夠在3 個及以上環(huán)境和2 種方法同時檢測到,是NJK3N-RIL 群體中控制開花期的環(huán)境穩(wěn)定QTL(表3 和表5),能夠作為分子輔助育種及基因圖為克隆重要目標(biāo)位點。

    3.4 大豆開花期候選基因預(yù)測

    植物開花的過程既受內(nèi)在遺傳機制控制,又受外界環(huán)境條件影響,調(diào)控機制復(fù)雜,有許多基因可能參與開花期的調(diào)控。但在大豆中只有少數(shù)幾個開花期相關(guān)的基因被克隆和鑒定,發(fā)掘一些可能參與大豆開花調(diào)控的基因,能夠充實對其分子調(diào)控機制的認(rèn)識。本研究根據(jù)QTL 區(qū)間內(nèi)基因功能的注釋及相關(guān)文獻,對4 個環(huán)境穩(wěn)定QTL 的候選基因進行了預(yù)測。qFT-8-1區(qū)間內(nèi)發(fā)現(xiàn)2 個AP2 亞族轉(zhuǎn)錄因子(Glyma08g38190和Glyma08g38800),前人研究結(jié)果顯示AP2 亞族轉(zhuǎn)錄因子對花的增殖生長至關(guān)重要[54]。qFT-11-1區(qū)間內(nèi)發(fā)現(xiàn)Glyma11g18940和Glyma11g18290參與光周期調(diào)節(jié)和花形態(tài)建成(www.soybase.org)。qFT-15-1區(qū)間內(nèi)有 3 個基因最有可能參與調(diào)控大豆開花期,Glyma15g41740編碼一個MYB 家族蛋白,具有序列特異性DNA 結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的活性,可以激活FT 的互作蛋白FTIP1,實現(xiàn)促進開花[55];Glyma15g41770編碼一個未知功能的蛋白,但該基因可能參與花發(fā)育的生物過程(http://www.Soybase.org);Glyma15g41825編碼一個NAM 蛋白,是植物特異性轉(zhuǎn)錄因子,前人研究結(jié)果表明NAM 結(jié)構(gòu)域蛋白在植物發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用,包括參與頂端分生組織發(fā)育、花的形態(tài)建成和脅迫誘導(dǎo)開花響應(yīng)等[56-57]。qFT-16-1區(qū)間內(nèi)包含擬南芥同源基因GmFT5a,KONG 等[58]研究表明GmFT5a調(diào)控大豆光周期反應(yīng)。但這些區(qū)間內(nèi)的真正功能基因還需要通過分子生物學(xué)等手段進一步驗證??偟膩碇v,這些位點及其緊密相關(guān)的分子標(biāo)記為大豆分子育種及基因圖為克隆提供了重要的信息。

    4 結(jié)論

    夏大豆開花期遺傳構(gòu)成復(fù)雜,加性QTL 效應(yīng)占絕對優(yōu)勢,上位性互作及環(huán)境互作效應(yīng)對開花期影響較小。共檢測到12 個控制開花期的QTL,其中4 個QTL(qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1和qFT-16-1)能夠在多個環(huán)境和使用不同分析方法檢測到,是NJK3N-RIL群體中控制開花期重要位點。

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