王 震 , 董 彬 , 樊振川 ,2,3, 孟德梅 *,2,3
(1.天津科技大學(xué) 教育部食品營(yíng)養(yǎng)與安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300457;2.天津市食品營(yíng)養(yǎng)與安全和藥物化學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,天津300457;3.天津科技大學(xué) 新農(nóng)村發(fā)展研究院,天津 300457)
纖毛是存在于細(xì)胞表面具有運(yùn)動(dòng)或感知功能的細(xì)胞器,多項(xiàng)研究報(bào)道,纖毛的結(jié)構(gòu)或功能障礙會(huì)導(dǎo)致許多疾病[1-4],如多囊腎病、視網(wǎng)膜變性、慢性呼吸疾病、腦積水和不孕等。為了預(yù)防和治療這些疾病,許多研究者對(duì)纖毛內(nèi)各種蛋白質(zhì)組分、結(jié)構(gòu)及其作用機(jī)理進(jìn)行了大量研究[5-7]。纖毛的運(yùn)動(dòng)和感知是由馬達(dá)蛋白、IFT顆粒、BBS等元件來維持的,其中IFT顆粒是維持纖毛功能所必須的[8]。研究表明,IFT顆粒包含至少20種蛋白質(zhì)組分,這些組分形成一個(gè)復(fù)合物整體,可以運(yùn)送細(xì)胞體內(nèi)蛋白質(zhì)進(jìn)出纖毛[9]。IFT顆粒中蛋白質(zhì)組分的構(gòu)象改變或缺失將會(huì)引起纖毛的組裝和功能障礙[4,6]。
IFT顆粒包含IFT-A和IFT-B復(fù)合物,兩者分別包含6種和14種組分,還有一些新成員將不斷被發(fā)現(xiàn)[8,10]。IFT顆粒的各個(gè)組分在各個(gè)物種間幾乎呈高度保守性,但是在秀麗隱桿線蟲和果蠅中卻沒有發(fā)現(xiàn)IFT-B復(fù)合物的組分IFT25,暗示著IFT25可能區(qū)別于其他常規(guī)的IFT-B復(fù)合物組分,在纖毛運(yùn)輸系統(tǒng)中發(fā)揮特殊的作用[10]。在萊茵衣藻中研究發(fā)現(xiàn),IFT25是一種磷酸化蛋白質(zhì),可以和IFT27結(jié)合,促進(jìn)IFT27的穩(wěn)定性和可溶性,說明兩者可能有功能上的關(guān)聯(lián)[11]。在小鼠中研究發(fā)現(xiàn),IFT25缺陷型不出現(xiàn)纖毛結(jié)構(gòu)和長(zhǎng)度的明顯變化,說明IFT25不參與纖毛的組裝,但是發(fā)現(xiàn)其在維持Hedgehog信號(hào)正確傳導(dǎo)中發(fā)揮作用。同時(shí)在小鼠的研究中,IFT25缺陷型細(xì)胞中沒有發(fā)現(xiàn)有絲分裂缺陷,這可能表明哺乳動(dòng)物中不需要IFT25調(diào)控細(xì)胞周期[12]。目前關(guān)于IFT25的作用機(jī)制尚不清晰,因此深入研究模式生物萊茵衣藻中IFT25在纖毛組裝、纖毛內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸及信號(hào)傳導(dǎo)中的作用機(jī)制具有重要意義。
制備特異性和靈敏性的萊茵衣藻IFT25抗體,是順利完成IFT25在蛋白水平表達(dá)模式、以及IFT25與其他蛋白質(zhì)互作機(jī)制研究的重要前提。作者雖在2009年對(duì)萊茵衣藻IFT25和IFT27的互作進(jìn)行了詳細(xì)研究[11],但是至今沒有商品化的萊茵衣藻IFT25抗體可供研究者使用,也沒有關(guān)于萊茵衣藻IFT25抗體制備方法的報(bào)道。作者采用經(jīng)濟(jì)和簡(jiǎn)單的方法,以原核表達(dá)萊茵衣藻IFT25為抗原制備兔源多克隆抗體,并運(yùn)用多種方法進(jìn)行抗體純化以提高抗體的特異性,從而為全面闡明IFT25在纖毛中的具體作用機(jī)制及理解纖毛相關(guān)疾病的致病機(jī)理奠定了重要基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株和質(zhì)粒大腸桿菌 XL1-blue,BL21(DE3) 感受態(tài),pGEX-2T-ift25-lcc-his-ift27 質(zhì)粒:均為作者所在實(shí)驗(yàn)室保存;萊茵衣藻cc125藻種:作者所在實(shí)驗(yàn)室保存。
1.1.2 主要試劑DNA Marker(1 000 bp、100 bp)、dNTPs:購(gòu)自全式金公司;T4DNA連接酶、Pfu DNA聚合酶、限制性內(nèi)切酶(BamH I、Hind III)、彩色預(yù)染蛋白Marker、IPTG:購(gòu)自 Fermentas公司;質(zhì)粒小提試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒:均購(gòu)自索萊寶公司;引物合成和基因測(cè)序:由北京奧科鼎盛公司完成;HRP標(biāo)記的山羊抗兔IgG:購(gòu)自康為世紀(jì);Dextrin SepharoseTMHigh Performance、Ni SepharoseTM6 Fast Flow、Protein ASepharoseTM:購(gòu)自 GE 公司。
1.1.3 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物新西蘭大白兔2只,8周齡大,體重1.5~2.0 kg,由天津歐陽實(shí)驗(yàn)種兔場(chǎng)提供。
1.2.1 原核表達(dá)載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)室保存的pMAL-c2X 和 pET-28a(+)表達(dá)載體用 BamH I、Hind III進(jìn)行雙酶切,并進(jìn)行切膠回收;以表1中設(shè)計(jì)的引物PCR擴(kuò)增出ift25,用BamH I、Hind III進(jìn)行雙酶切,產(chǎn)物純化回收目的基因;將目的基因分別與兩個(gè)載體用T4DNA連接酶連接后,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌XL1-blue 中,分別涂到含氨芐青霉素(120 μg/mL)、卡那霉素(30 μg/mL)的LB平板上篩選陽性菌落;挑取陽性菌落過夜培養(yǎng),提取質(zhì)粒,酶切和測(cè)序驗(yàn)證。
表1 擴(kuò)增ift25所用引物序列Table 1 Sequences of the PCR primers for the gene of ift25
1.2.2 重組質(zhì)粒在大腸桿菌中誘導(dǎo)表達(dá)驗(yàn)證將正確重組質(zhì)粒用熱激法轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21中,在分別含氨芐青霉素(120 μg/mL)和卡那霉素(30 μg/mL)的LB平板上篩選含pMAL-c2X-ift25和pET-28a(+)-ift25陽性菌落;挑取陽性菌落過夜培養(yǎng),然后按照5%接種體積分?jǐn)?shù)分別轉(zhuǎn)接到5 mL含氨芐青霉素(120 μg/mL)和卡那霉素(30 μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,37℃、200 r/min培養(yǎng)至 OD600值到0.6~0.8, 加入終濃度 0.2 mmol/L的 IPTG,25℃、180 r/min誘導(dǎo)表達(dá)6 h,收集菌體進(jìn)行SDS-PAGE分析[13-14]。
1.2.3 融合蛋白MBP-IFT25的純化將含pMAL-c2X-ift25重組質(zhì)粒的大腸桿菌BL21經(jīng)過誘導(dǎo)表達(dá)后,超聲波破碎菌體細(xì)胞,離心收集上清液。含融合蛋白上清液用Dextrin SepharoseTMHigh Performance進(jìn)行親和純化,純化條件為:結(jié)合緩沖液 A(20 mmol/L Tris,300 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA,0.1% β-巰基乙醇,pH 7.4), 洗脫緩沖液 A(20 mmol/L Tris,300 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA,0.1% β-巰基乙醇,10 mmol/L 麥芽糖,pH 7.4),將洗脫出的蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行SDS-PAGE分析[15]。
1.2.4 融合蛋白6×His-IFT25的純化含pET-28a(+)-ift25重組質(zhì)粒的大腸桿菌BL21經(jīng)過誘導(dǎo)表達(dá)后,菌體細(xì)胞進(jìn)行超聲波破碎,離心收集包涵體。包涵體用洗滌液緩沖液 (50 mmol/L Tris,100 mmol/L NaCl,1 mol/L 尿素,1%TritonX-100,pH 8.0)洗滌 3次后,然后用變性緩沖液 (20 mmol/L NaH2PO4,8 mol/L 尿素,500 mmol/L NaCl,pH 7.4) 進(jìn)行變性溶解。融合蛋白在變性條件下用Ni SepharoseTM6 Fast Flow進(jìn)行親和純化,純化條件為:結(jié)合液緩沖液B(20 mmol/L NaH2PO4,8 mol/L 尿 素 ,500 mmol/L NaCl,pH 7.4),分別用含有 60、100、300 mmol/L 咪唑的洗脫液緩沖液B (20 mmol/L NaH2PO4,8 mol/L尿素,500 mmol/L NaCl,pH 7.4) 進(jìn)行梯度洗脫,洗脫出的蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行SDS-PAGE分析[16-17]。
1.2.5 多克隆抗體的制備取兩只8周大的新西蘭大白兔,在實(shí)驗(yàn)室適應(yīng)一周后準(zhǔn)備免疫。初次免疫前在耳源靜脈取血,分離血清,在后續(xù)試驗(yàn)中作為陰性血清;初次免疫,取2 mg MBP-IFT25與等體積的完全弗氏佐劑充分乳化,在兔子頸背部選多點(diǎn)皮下注射;10~14 d后進(jìn)行加強(qiáng)免疫,取2 mg MBPIFT25與等體積的不完全弗氏佐劑充分乳化,在兔子頸背部多點(diǎn)皮下注射;之后每次加強(qiáng)免疫前耳源取血,ELISA測(cè)定抗血清的效價(jià),當(dāng)效價(jià)滿足試驗(yàn)要求,加強(qiáng)免疫后一周取血分離抗血清[18-20]。
1.2.6 ELISA測(cè)定抗血清效價(jià)酶標(biāo)板每孔包被1 μg融合蛋白MBP-IFT25,0.5%的脫脂奶粉封閉,抗血清和陰性血清設(shè)定稀釋梯度為 1∶2 000、1∶4 000、1∶8 000、1∶16 000、1∶32 000、1∶64 000、1∶128 000、1∶256 000,二抗為辣根過氧化物酶(HPR)標(biāo)記的山羊抗兔 IgG(1∶20 000),TMB(3′,3′,5′,5′,-四甲基聯(lián)苯胺)顯色后測(cè)定OD450,抗血清OD450/陰性血清OD450≥2.0為陽性,其最高稀釋倍數(shù)為抗血清的效價(jià)[19]。
1.2.7 抗血清的純化分離完的抗血清用Protein A SepharoseTM進(jìn)行純化,純化條件為:結(jié)合緩沖液C(12 mmol/L Na2HPO4,8 mmol/L NaH2PO4,pH 7.0),洗脫緩沖液C(0.1 mol/L甘氨酸,pH 2.7),流速 0.5 mL/min。收集吸收峰對(duì)應(yīng)的洗脫液,用1 mol/L Tris-HCl(pH 9.0)將洗脫液pH值調(diào)至中性。Protein ASepharoseTM純化完的抗體用硝酸纖維素膜親和法[21]進(jìn)一步純化,將6×His-IFT25經(jīng)過SDS-PAGE和電印跡轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜(PVDF)上,麗春紅染色后剪下目的條帶,5%脫脂奶粉封閉后與經(jīng)過Protein A SepharoseTM的抗體4℃結(jié)合過夜,用洗脫緩沖液C進(jìn)行洗脫,收集洗脫液并將pH值調(diào)至中性。
1.2.8 Western blotting檢測(cè)多克隆抗體的特異性萊茵衣藻cc125接種到Tris-Acetate-Phosphate(TAP)[22]培養(yǎng)基中室溫光照培養(yǎng) 3 d,取 1 mL加入離心管中,2 000 r/min離心5 min,棄去上清液;向沉淀中加入54 μL Buffer A (工作濃度0.1 mol/L的Na2CO3)和 6 μL DTT(1 mol/L),渦旋振蕩器振蕩 5 s重懸衣藻細(xì)胞;向離心管中繼續(xù)加入40 μL Buffer B(5%SDS、30%蔗糖),室溫振蕩 45 min;10 000 r/min離心5 min,收集上清液。取4 μL衣藻上清液加入1 μL 5×上樣緩沖液混勻,進(jìn)行SDS-PAGE和電轉(zhuǎn)印后,衣藻蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,5%的脫脂奶粉封閉;多克隆抗體稀釋度1:1000,二抗為辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗兔 IgG(1:5000),加入顯色液后曝光壓片顯色或曝光照相[20]。
兩套重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證,結(jié)果見圖1。兩套重組質(zhì)粒均獲得了570 bp的片段,并將重組質(zhì)粒送到金唯智公司測(cè)序,測(cè)序引物選擇通用引物,經(jīng)過對(duì)比序列完全正確,說明表達(dá)載體構(gòu)建成功,將其分別命名為 pMAL-c2X-ift25 和 pET-28a(+)-ift25。
圖1 重組質(zhì)粒的雙酶切驗(yàn)證Fig.1 Double enzyme verification of recombinant plasmid
pMAL-c2X-ift25和 pET-28a (+)-ift25均轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21中。含pMAL-c2X-ift25的菌體經(jīng)過IPTG誘導(dǎo),SDS-PAGE在60 000處出現(xiàn)目的條帶,而未經(jīng)誘導(dǎo)的含重組質(zhì)粒的菌體蛋白沒有此帶,說明目的MBP-IFT25成功表達(dá);將誘導(dǎo)完的菌體經(jīng)過超聲破碎,目的條帶主要出現(xiàn)在上清液中,而沉淀中則幾乎沒有,說明融合蛋白呈水可溶性,見圖2。含pET-28a(+)-ift25的菌體經(jīng)過IPTG誘導(dǎo),SDS-PAGE在20 000附近出現(xiàn)目的條帶,而未經(jīng)誘導(dǎo)的空白對(duì)照則沒有此帶,說明6×His-IFT25成功表達(dá),而且主要分布在沉淀中,說明6×His-IFT25主要以包涵體形式表達(dá)。這與之前報(bào)道相同,即MBP對(duì)融合蛋白有促水溶作用[14];本試驗(yàn)中6×His與IFT25融合表達(dá)時(shí)融合蛋白的水溶性較差。
圖2 SDS-PAGE檢測(cè)重組表達(dá)載體pMAL-c2X-ift25和pET-28a(+)-ift25 在 E.coli BL21(DE3)中的表達(dá)及融合蛋白的可溶性Fig.2 SDS-PAGE analyzed the expression of recombinant vector pMAL-c2X-ift25 and pET-28a(+)-ift25 in E.coli BL21 (DE3) and the solubility of fusion protein
因?yàn)槌仕苄偷哪康牡鞍卓梢员3值鞍踪|(zhì)的天然構(gòu)象,制備的抗體可以更特異性的結(jié)合目的蛋白,包涵體在變性溶解、復(fù)性操作后可以恢復(fù)蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象,但是在提高復(fù)性效率上存在諸多難度和挑戰(zhàn),而且不能達(dá)到完全復(fù)性。因此,作者選擇呈水溶性的MBP-IFT25作為免疫動(dòng)物的抗原;包涵體6×His-IFT25則用于抗體的膜純化[21]。
融合蛋白MBP-IFT25和6×His-IFT25經(jīng)過親和純化后,用SDS-PAGE進(jìn)行分析,見圖3。結(jié)果表明兩個(gè)融合蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量正確,且經(jīng)灰度分析(SAGECREATION凝膠成像儀)表明,兩者純度均達(dá)90%以上。
圖3 MBP-IFT25和6×His-IFT25的親和純化Fig.3 Affinity purification of MBP-IFT25 and 6×His-IFT25
融合蛋白MBP-IFT25作為抗原免疫兩只新西蘭大白兔,用ELISA測(cè)定免疫過程中的抗血清效價(jià),結(jié)果在第四次免疫后12 d,兩只兔子的抗血清效價(jià)均超過1 280 000,見圖4,滿足試驗(yàn)要求,于第五次免疫后一周取血分離抗血清。
圖4 間接ELISA法測(cè)定抗血清的效價(jià)Fig.4 Results of ELISA test of anti-IFT25 polyclonal antiserum
取兔子1抗血清首先經(jīng)過Protein A純化,結(jié)果見圖5,再進(jìn)行抗原-抗體膜純化。用Western blotting檢測(cè)其識(shí)別萊茵衣藻中IFT25的特異性,經(jīng)過顯色可以在20 000附近識(shí)別出單一條帶,條帶相對(duì)分子質(zhì)量大小符合預(yù)期,見圖6,即制備的多克隆抗體可以特異性識(shí)別IFT25,可以直接用于后續(xù)對(duì)IFT25的研究。
圖5 Protein A純化IFT25的抗血清Fig.5 Anti-IFT25 was purified by protein A
圖6 Western blotting分析IFT25多克隆抗體的特異性Fig.6 Western blotting analysis of the specificity of IFT25polyclonal antibody
IFT25作為纖毛內(nèi)運(yùn)動(dòng)蛋白IFT復(fù)合物B中的一個(gè)重要組分,在纖毛運(yùn)動(dòng)和感知中的作用機(jī)制仍不清晰。制備特異性和靈敏性的IFT25抗體,來檢測(cè)其在模式生物萊茵衣藻中的表達(dá)模式及與其他IFT成員的互作機(jī)制是闡明IFT25在生物體內(nèi)作用機(jī)制的重要方式。作者成功構(gòu)建了MBP-IFT25和6×His-IFT25兩種融合蛋白,親和純化后蛋白質(zhì)純度超過90%。并用水溶性的MBP-IFT25融合蛋白作為抗原制備其多克隆抗體,ELISA測(cè)定效價(jià)超過128 000。依次經(jīng)Protein A和硝酸纖維素膜純化制備的抗體,用Western blotting檢測(cè)具有很好的特異性,能夠正確的特異性識(shí)別萊茵衣藻中的IFT25蛋白質(zhì),表明所制備的IFT25抗體可以直接用于ELISA、Western blotting及活體中的檢測(cè),為IFT25作用機(jī)制的闡明和纖毛相關(guān)疾病的診斷提供了重要理論和方法支持。