(上海震旦職業(yè)學(xué)院,上海201908)
黃嘌呤氧化酶(xanthine oxidase,XO)是尿酸生成過程中一關(guān)鍵酶,主要存在于哺乳動物的乳汁和肝臟中。在人體內(nèi),XO能催化次黃嘌呤成黃嘌呤,最終生成尿酸[1],當(dāng)XO活性異?;钴S時,使尿酸大量的生成和過量積累在血液中,臨床表現(xiàn)為高尿酸血癥,隨著尿酸鹽沉積進(jìn)而引起痛風(fēng)的發(fā)作[2]。研究顯示,隨著經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,人民生活水平的提高,飲食結(jié)構(gòu)的改變,高尿酸血癥和痛風(fēng)的發(fā)病率逐年增高,呈年輕化趨勢,并與代謝紊亂、心腦血管疾病等相關(guān)[3]。因此抑制XO活性,從源頭減少尿酸的產(chǎn)生是臨床治療痛風(fēng)的重要手段?,F(xiàn)臨床上應(yīng)用的XO抑制劑主要是別嘌呤醇,然而可能會引發(fā)一些不良反應(yīng),如引起過敏及抑制骨髓,對部分充血性心臟功能不全的高尿酸血癥患者不利等,這在一定程度上限制了它的臨床應(yīng)用[4]。因此研究新的低毒、少副作用的XO抑制劑具有十分重要的意義。天然產(chǎn)物有效成分的XO抑制劑來源廣泛,安全性高,因此引起了廣泛的關(guān)注。
目前,黃酮類化合物在醫(yī)藥和食品方面有重要的應(yīng)用。天然的黃酮類化合物有多種生物活性[5],例如清除自由基、抗氧化、抗菌、抗病毒、保護(hù)肝臟、抗腫瘤、抗血栓、保護(hù)心肌和降血脂等作用。此外,研究表明,有些黃酮類化合物還能抑制XO的活性,從而抑制尿酸的合成以及一系列生理性損傷[6-7]。作為一種黃酮組分,芹菜素又稱芹黃素、洋芹素,廣泛分布于溫?zé)釒У氖卟撕退?,尤以芹菜中含量為高;在一些藥用植物如車前子、絡(luò)石藤等中也有很高的含量,植物源性飲料如茶、酒以及一些調(diào)味品中也有分布[8-9]。有文獻(xiàn)報道芹菜素對XO也具有較好的抑制活性[10],但其對XO的抑制機(jī)理尚未見深入的研究,因此本試驗利用多種光譜連用的方法(紫外光譜、熒光光譜和圓二色譜等)結(jié)合分子對接技術(shù)來探究芹菜素對XO活性的抑制機(jī)理,為芹菜素在臨床上的應(yīng)用提供理論依據(jù),有助于深入分析芹菜素對黃嘌呤氧化酶的作用機(jī)制和進(jìn)行藥物的臨床應(yīng)用評價。
美國黃嘌呤氧化酶(編號X4500-5UN,酶活1.0 units/mg~2.0 units/mg,來源于牛奶):Sigma公司;芹菜素(純度≥98.0%)、根皮素(純度≥99.0%)、別嘌呤醇(純度≥98.0%)、黃嘌呤(純度≥99.5%):上海阿拉丁試劑有限公司;其它試劑均為分析純。
pH211型精密pH計:意大利HANNA公司;UV-2550型紫外–可見分光光度計:日本SHIMADZU公司;F-4500型熒光光度計:日本Hitachi公司;J-810型圓二色譜儀:日本JASCO公司。
1.2.1 芹菜素抑制XO的酶活測定
采用Wang等[11]的方法進(jìn)行酶活測定,并在此基礎(chǔ)上稍作修正。XO催化黃嘌呤產(chǎn)生的尿酸在295 nm處有特征吸收峰,利用UV-2550型紫外-可見分光光度計的動力學(xué)版塊,將固定濃度的XO溶液(7.5×10-8mol/L)與含有不同濃度芹菜素(根皮素)溶液混合,制備一系列3 mL的反應(yīng)體系(在pH 7.4,0.05 mol/L,Tris-HCl緩沖液中),置于37℃水浴孵化3 h,待反應(yīng)達(dá)到平衡,加入底物黃嘌呤溶液(最終濃度為5.0×10-5mol/L)啟動反應(yīng),25℃下,以空白作對照,每隔15秒測定體系在295 nm處的吸光度,每種濃度做3個平行。
通過關(guān)系式:相對活性/%=(R/R0)× 100,計算 XO的相對活性,以別嘌呤醇作為陽性對照。
式中:R0為無抑制劑時吸光度變化率;R為在含有不同濃度抑制劑體系中吸光度變化率。以未加抑制劑組的酶活力為100%。
1.2.2 芹菜素對XO活性的抑制動力學(xué)研究
在上述相同條件下,固定XO的濃度(7.5×10-8mol/L),測定不同濃度芹菜素體系(0、2.5、5.0、10.0 μmol/L)中,不同濃度底物黃嘌呤(2.5、5.0、10.0、20.0×10-5mol/L)對反應(yīng)速率的影響,每種濃度做3個平行,并以Lineweaver-Burk雙倒數(shù)方程作圖,判斷芹菜素對XO抑制作用的可逆性和抑制類型,并求出抑制常數(shù)(Ki)和抑制系數(shù)(α)。
1.2.3 芹菜素與XO作用的熒光光譜研究
在3 mL反應(yīng)體系(Tris-HCl緩沖液)中,固定XO濃度(5.0×10-7mol/L),依次滴加一定量的芹菜素溶液(3 μL/次,使?jié)舛戎饾u增加)并混合均勻,待靜置3 min,分別掃描游離XO和芹菜素-XO混合體系的熒光光譜。掃描條件:激發(fā)波長280 nm,激發(fā)和發(fā)射狹縫均為5 nm,掃描范圍300 nm~500 nm。
1.2.4 圓二色譜測定
在上述緩沖介質(zhì)中,分別掃描游離XO以及芹菜素-XO樣品溶液(摩爾比1∶1和2∶1)的圓二色譜。掃描條件:波長范圍為190 nm~250 nm,掃描速度為60 nm/min,以相同緩沖液做空白。再通過在線Dichroweb 軟 件(http://dichroweb.cryst.bbk.ac.uk/html/home.shtml)計算XO的二級結(jié)構(gòu)含量變化[12]。
1.2.5 分子對接
從Protein Data Base數(shù)據(jù)庫下載XO的晶體模型(PDB ID:3ETR),從Pub Chem數(shù)據(jù)庫下載芹菜素的3D結(jié)構(gòu),分別進(jìn)行優(yōu)化處理。再通過AutoDock 4.2分子模擬軟件進(jìn)行100次結(jié)合模擬,選出最佳結(jié)合構(gòu)象進(jìn)行分析。
芹菜素對XO的抑制作用見圖1。
圖1 芹菜素對XO的抑制作用Fig.1 Inhibitory effect on XO of apigenin
如圖1所示,在一定濃度內(nèi),隨著芹菜素的不斷加入,XO的相對活性逐漸降低直至20%,芹菜素對酶的抑制作用呈現(xiàn)一定的濃度依賴關(guān)系,是有效的XO抑制劑;而根皮素只將相對酶活抑制到75%,最后趨于平緩,表明根皮素不是有效的XO抑制劑。分析其結(jié)構(gòu),根皮素與芹菜素的結(jié)構(gòu)差異只在于缺少一個2-苯基色原酮結(jié)構(gòu),由此可見黃酮組分芹菜素中的2-苯基色原酮結(jié)構(gòu)是抑制XO活性的重要結(jié)構(gòu)[10]。此外,芹菜素和陽性對照別嘌呤醇的IC50分別為(8.63±0.03)μmol/L和(3.02±0.02)μmol/L(n=3),數(shù)量級相同,表明芹菜素具有較好的抑制XO活性的潛力。
通過酶反應(yīng)動力學(xué)方法,用酶促反應(yīng)速度υ(ΔOD)對酶濃度作圖:當(dāng)不存在抑制劑時,速率直線通過原點;當(dāng)有可逆性抑制劑存在時,因抑制劑的量恒定,可得到一條通過原點而斜率較低的直線[11]。芹菜素對XO的抑制類型見圖2。
圖2 芹菜素對XO的抑制類型Fig.2 Inhibitory type of apigenin on XO
圖2顯示,每個抑制劑濃度下的直線都經(jīng)過原點,且隨著芹菜素濃度的增加直線的斜率不斷降低,表明芹菜素對XO的抑制是一個可逆的過程。按照動力學(xué)方法區(qū)分抑制劑對酶的可逆性抑制作用,以及抑制劑、底物和酶之間的相互關(guān)系,可逆性抑制又可分為競爭性抑制、非競爭性抑制、反競爭性抑制和混合競爭型抑制。采用Lineweaver-Burk雙導(dǎo)數(shù)法作圖,判斷芹菜素對XO的抑制作用類型,結(jié)果見圖2,測得的l/υ-1/[S]關(guān)系為一組相交于第二象限的直線,這說明芹菜素對XO是一種混合競爭型抑制劑[12]。對這種抑制類型,再分別以直線的斜率和Y-截距對芹菜素濃度二次作圖,如圖2所示,直線線性關(guān)系較好,表明芹菜素在XO上只有一個或一類結(jié)合位點[13],再計算得出Ki=(2.35±0.42)μmol/L 和 α=(4.07±0.06)μmol/L。
一般情況下,在激發(fā)波長為280 nm時,蛋白質(zhì)在340 nm附近有一個主要的熒光發(fā)射峰(主要因為蛋白質(zhì)中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸等熒光發(fā)射基團(tuán))。圖3是不同濃度芹菜素存在下XO熒光發(fā)射光譜。
圖3 不同濃度的芹菜素對XO熒光光譜的影響Fig.3 Effect of apigenin on fluorescence spectra of XO at different concentrations
芹菜素沒有內(nèi)源熒光,而隨著芹菜素溶液不斷加入,XO的熒光強(qiáng)度有規(guī)律地降低,并且最高峰的峰位出現(xiàn)了略微藍(lán)移,這說明芹菜素與XO之間發(fā)生了相互作用,并由此影響了XO內(nèi)熒光發(fā)色氨基酸周圍微環(huán)境,使其疏水性增強(qiáng)[14]。
為了進(jìn)一步闡明猝滅機(jī)理,在研究中利用Stern-Volmer方程對試驗數(shù)據(jù)進(jìn)行分析[15]:F0/F=1+Kqτ0[Q]=1+Ksv[Q],lg(F0-F)/F=lgKa+nlg[Q],式中:F0和 F 分別為未加入和加入芹菜素時XO的熒光強(qiáng)度;Kq為雙分子猝滅過程速率常數(shù);KSV為猝滅常數(shù);[Q]為芹菜素的濃度。并根據(jù)熱力學(xué)公式:lgKa=-ΔH/2.303RT+ΔS/2.303R,ΔG= ΔH-TΔS,計算焓變(ΔH)、熵變(ΔS)和吉布斯自由能變(ΔG)。根據(jù)反應(yīng)前后熱力學(xué)焓變ΔH和熵變ΔS的相對大小,可以判斷芹菜素與XO大分子相互作用的主要作用力類型[16]。結(jié)果列于表1。
表1中,Ksv隨著溫度的升高而減小且猝滅速率常數(shù)Kq值均遠(yuǎn)大于生物分子的最大擴(kuò)散速率常數(shù)值(2×1010L/(mol·s),這表明芹菜素對XO熒光猝滅為典型的形成復(fù)合物的靜態(tài)猝滅過程;結(jié)合常數(shù)(Ka)隨溫度升高而增大,說明復(fù)合物的穩(wěn)定性隨溫度升高而增強(qiáng);結(jié)合位點數(shù)(n)均趨于1,表明芹菜素在XO上存在唯一的結(jié)合位點,這與抑制動力學(xué)試驗結(jié)果吻合。
根據(jù)ΔG<0,表明芹菜素與XO的作用過程是一個Gibbs自由能降低的自發(fā)過程;ΔH>0、ΔS>0,說明形成復(fù)合物是熵驅(qū)動的吸熱反應(yīng),揭示芹菜素與XO結(jié)合的主要驅(qū)動力為疏水作用力[12]。
不同溫度下芹菜素-XO體系的猝滅常數(shù)(Ksv)、結(jié)合常數(shù)(Ka)、結(jié)合為點數(shù)(n)及熱力學(xué)參數(shù)見表1。
圓二色譜是研究蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)變化的有效工具,圖6為芹菜素與XO相互作用的圓二色譜圖,XO出現(xiàn)兩個負(fù)的特征峰譜帶是α-螺旋結(jié)構(gòu)的特征峰,并隨著芹菜素濃度增大,圖譜中特征負(fù)峰減小,且峰位峰形都沒有顯著變化,表明XO分子中α-螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生變化但仍占主導(dǎo)地位。在線SELCON3程序算得XO二級結(jié)構(gòu)含量的值列于表2,可見,當(dāng)芹菜素與XO的摩爾比增大時(從 0∶1,1∶1到 2∶1),α-螺旋(從36.8%、40.3%到47.6%)和β-折疊(11.8%、13.1%到14.4%)的含量都升高,而β-轉(zhuǎn)角(從26.3%、23.9%到20.6%)和無規(guī)卷曲(25.1%、22.7%到17.7%)含量逐漸降低,說明芹菜素的加入誘導(dǎo)XO的二級結(jié)構(gòu)發(fā)生部分改變,并且α-螺旋作為主要結(jié)構(gòu),含量增加可能使XO的二級結(jié)構(gòu)更加緊密,這不利于酶形成活性中心以及底物進(jìn)入活性中心。
表1 不同溫度下芹菜素-XO體系的猝滅常數(shù)(Ksv)、結(jié)合常數(shù)(Ka)、結(jié)合為點數(shù)(n)及熱力學(xué)參數(shù)Table 1 Quenching constant(Ksv),association constant(Ka),binding sites(n),and thermodynamic parameters of apigenin-XO system at different temperature
表2 XO和芹菜素-XO體系的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)含量Table 2 Secondary structure contents of XO and apigenin-XO systems
計算機(jī)分子對接方法可形象地展現(xiàn)出配體與生物大分子的結(jié)合情況,這有助于從理論上確定其相互作用的機(jī)理和模式。芹菜素與XO分子對接團(tuán)簇分析見圖4,芹菜素與XO分子對接見圖5。
如圖4,按最佳能量原理,結(jié)合能最低(-6.15)結(jié)合次數(shù)最多(33次)的結(jié)合構(gòu)象最穩(wěn)定,所得的最佳構(gòu)象如圖5所示,該圖僅顯示了XO活性空腔內(nèi)配體芹菜素周圍氨基酸殘基(Phe 649/1009/1013、Leu 648/873/1014、Glu 802/879、Arg 880、Ser 876、Thr 1011 等),并與陽性對照別嘌呤醇的位置進(jìn)行對比。從圖中可看出,與別嘌呤醇一樣,芹菜素的剛性雙環(huán)結(jié)構(gòu)嵌入XO的疏水腔,而這阻礙了底物分子進(jìn)入活性中心的通道,由此降低了酶的催化活性。而且芹菜素的疏水結(jié)構(gòu)被疏水氨基酸包圍(Leu 648/873/1014,Phe 649/1009/1013),說明芹菜素與XO之間存在疏水作用[11-12],這與熱力學(xué)研究結(jié)果基本一致。再者,考慮到其間近距離,芹菜素苯環(huán)結(jié)構(gòu)與周圍的芳香族氨基酸(Phe 649/1009/1013)的苯環(huán)之間可能存在π-π堆積作用,這有利于配體的結(jié)合。圖中還顯示芹菜素與XO的Leu 873、Phe 649之間形成了氫鍵,鍵長分別為3.37 ?和3.16 ?,進(jìn)一步利于芹菜素穩(wěn)定在空腔中。
圖4 芹菜素與XO分子對接團(tuán)簇分析Fig.4 Cluster analyses of the AutoDock docking runs of apigenin with XO
圖5 芹菜素與XO分子對接Fig.5 Molecular docking between apigenin and XO
芹菜素具有良好的XO活性抑制效果;通過研究抑制動力學(xué)特點,明確芹菜素對XO具有明顯可逆的混合競爭型抑制作用,其半抑制濃度IC50為(8.63±0.03)μmol/L,抑制常數(shù) Ki為(2.35 ± 0.42)μmol/L。再結(jié)合芹菜素與XO相互作用進(jìn)行分析,芹菜素抑制XO活性的機(jī)理為:芹菜素進(jìn)入XO的疏水腔,通過疏水作用力與XO活性中心周圍的主要氨基酸殘基發(fā)生作用;并引起XO的二級結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,α-螺旋含量增加使得XO的結(jié)構(gòu)更加緊密而不利于底物進(jìn)入疏水空腔;同時,芹菜素占據(jù)底物進(jìn)入活性中心的通道,也有效地抑制XO對黃嘌呤的催化活性。