顏因,曹莉莎,李敏,王繼生
(1.重慶市第九人民醫(yī)院,重慶 400700;2.綿陽市第三人民醫(yī)院,四川 綿陽 621000)
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氟西汀作用于慢性溫和不可預見性應激大鼠海馬組織前后的差異蛋白質(zhì)組學研究
顏因1,曹莉莎2,李敏2,王繼生2
(1.重慶市第九人民醫(yī)院,重慶400700;2.綿陽市第三人民醫(yī)院,四川 綿陽621000)
目的:采用蛋白組學方法研究氟西汀對慢性溫和不可預見性應激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)大鼠海馬組織蛋白質(zhì)表達的影響,以探討氟西汀抗抑郁的作用機制。方法:采用CUMS建立大鼠抑郁模型。造模完成后,氟西汀組給予氟西汀(3 mg/kg)灌胃給藥,每天1次,連續(xù)21 d。行為學實驗檢測大鼠抑郁行為的變化。提取的大鼠海馬組織蛋白質(zhì)樣品經(jīng)同位素標記相對和絕對定量標記、強陽離子柱分離、反相液相色譜分離、質(zhì)譜分析,獲取的串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過Protein.pilot 3.0軟件鑒定蛋白質(zhì),運用生物信息學分析差異表達的蛋白質(zhì)功能。結(jié)果:共鑒定出5 109個蛋白質(zhì),41個差異表達的蛋白質(zhì),其中36個蛋白質(zhì)表達上調(diào),5個蛋白質(zhì)表達下調(diào),涉及氧化還原、信號傳導、合成代謝、對外界刺激壓力的反應等過程。結(jié)論:同時篩選到了四個可能與氟西汀抗抑郁作用密切相關(guān)的差異蛋白,分別是Neuronal calcium sensor 1(NCS-1)、Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta、Neurocan core protein和Sodium-and chloride-dependent GABA transporter,但這些蛋白在抑郁癥的發(fā)生、發(fā)展過程中的作用尚未完全清楚,需進一步深入研究。
氟西?。灰钟?;蛋白質(zhì)組學;海馬組織;同位素標記相對和絕對定量
氟西汀是一種強效的、選擇性5-羥色胺(5-HT)再攝取抑制劑,通過高度選擇性抑制突觸前膜對5-HT的再攝取而發(fā)揮抗抑郁作用。臨床上廣泛用于治療各種抑郁性精神障礙。雖然氟西汀的抗抑郁效果非常顯著,但也存在藥效延遲、部分抑郁患者療效不佳、復發(fā)率高等現(xiàn)象。氟西汀抗抑郁作用的關(guān)鍵蛋白及其啟動機制至今無明確報道,找到氟西汀作用的關(guān)鍵蛋白,明確其作用機制,對我們研究新型抗抑郁藥物有著至關(guān)重要的作用。
同位素標記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,ITRAQ)聯(lián)合液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)的方法是研究藥物作用的關(guān)鍵蛋白,發(fā)現(xiàn)蛋白標志物的強有力工具。該方法可同時對多達8種樣品進行定量研究,并且對低豐度蛋白檢測的靈敏度高,重復性好[1]??赏瑫r分離和鑒定成百上千的蛋白質(zhì),最大化的獲得蛋白質(zhì)的“全組信”[2]。本研究以ITRAQ1技術(shù)聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)分析氟西汀作用于慢性溫和不可預見性應激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)大鼠海馬組織后的差異表達蛋白,以進一步探討氟西汀抗議與作用過程中的關(guān)鍵蛋白及機制。
1.1實驗動物
清潔級♂SD大鼠共40只,體重180~220 g,從重慶醫(yī)科大學實驗動物中心購買,合格證書編號SCXK(渝)2012-0001。實驗室環(huán)境溫度25 ℃,給予所有大鼠正常飲食飲水,實驗室內(nèi)黑暗與光照交替出現(xiàn),黑暗12 h,光照12 h,所有大鼠飼養(yǎng)1周適應環(huán)境。
1.2實驗試劑與儀器
H20(HPLC級別)(美國Sigma公司),ITRAQ 標記試劑盒(美國Applied Biosystems公司),BCA試劑盒(中國碧云天公司),胰酶(美國Sigma公司),Cocktail蛋白酶抑制劑(美國羅氏公司),全蛋白提取試劑盒(上海生工),蛋白裂解液(中國碧云天公司),尿素(美國Sigma公司),Anti-GABA Transporter(ab431),聚偏氟乙烯膜(PVDF)0.45 μm(Merck Millipore,IPVH00010),SDS-PAGE 蛋白上樣緩沖液(5×)(碧云天生物技術(shù)研究所,P0015),魯米諾化學發(fā)光液底物100 mL(Merck Millipore,WBLUC0100),TBST緩沖液(北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責任公司),電泳/電轉(zhuǎn)儀(BIO-RAD公司,041BR88778)。曠場實驗行為測試儀,強迫游泳行為測試儀,高架十字迷宮(重慶醫(yī)科大學藥理實驗室制)。低溫冰箱(-20 ℃)(德國西門子),Aallegra臺式高速冷凍離心機(美國Beckman Coulter公司),超低溫冰箱(-80 ℃)(美國Thermo Fisher),高效液相色譜儀(島津半制備型HPLC系統(tǒng)),RVT4104低溫冷凍干燥器(美國Thermo Fisher),SpeedVac真空離心器(美國Applied Biosystems公司),MALDI/TOF/TOF5800蛋白分析儀及配套軟件Mascot軟件(美國Applied Biosystems公司)。
1.3實驗方法
1.3.1CUMS大鼠模型按照文獻方法[3]進行抑郁癥大鼠模型的復制?!酳D大鼠共40只,先進行曠場試驗評分,采用隨機區(qū)組設(shè)計,按曠場試驗結(jié)果將其分為正常組和模型組,每組20只。正常組正常飼養(yǎng),模型組接受21 d各種不同溫和刺激,包括禁水24 h, 禁食24 h,4 ℃冰水游泳5 min,晝夜顛倒,熱刺激(45 ℃,5 min),濕墊料,異味刺激,45°鼠籠傾斜24 h,每天隨機選擇一種刺激,相同刺激不得重復出現(xiàn),同種刺激不能超過3次。
造模完成后,即第22天,進行曠場實驗、強迫游泳實驗、高架十字迷宮等行為學實驗以判斷造模是否成功。模型成功后,將模型組大鼠隨機分類兩組即氟西汀組和抑郁組,每組10只。氟西汀組給予氟西汀(3 mg/kg)灌胃給藥,抑郁組給予等體積生理鹽水,每天1次,連續(xù)21 d。實驗結(jié)束后,大鼠斷頸處死,冰臺上迅速分離出海馬組織,液氮速凍,-80 ℃冰箱保存。
1.3.2海馬組織蛋白質(zhì)的提取lysis buffer中加入5 μL磷酸酶抑制劑、1 μL蛋白酶抑制劑和10 mL 苯甲基磺酰氟(PMSF)混勻;冰上預冷玻璃勻漿器,2支lysis buffer;取凍存的大鼠海馬組織每組3只,PBS清洗,按組放入玻璃勻漿器,分別加預冷的lysis buffer,手動研磨,致均質(zhì)勻漿;加入TCA-冰丙酮,-20 ℃沉淀2 h后,3 000 rpm,4 ℃,離心30 min,棄上清液,取沉淀。再加入丙酮,-20 ℃沉淀30 min,4 ℃,離心30 min,反復操作,至沉淀變?yōu)榘咨?80 ℃凍存。
1.3.3ITRAQ標記蛋白溶解,定量:取凍存的兩組樣品,各加入40 mL裂解液和20 mL變性劑,震蕩混懸溶解,離心去除沉淀。用Bradford法進行蛋白定量,調(diào)整溶液的蛋白濃度,使每組蛋白樣品量為40 μg,體積20 μL;還原,封閉:按試劑盒提供方案進行還原、封閉;酶解:向各組蛋白溶液中加入1 μg胰酶,37 ℃溫育16 h;標記:各試管標記試劑中加入50 μL乙丙醇,混勻,分別加入各管樣品中,室溫反應1 h,之后各加入3倍體積水,使標記試劑分解。真空冷凍干燥;除鹽:將相關(guān)buffer和標記試劑的鹽除去。
1.3.4肽段的分離和鑒定(1)第一維強陽離子柱(SCX)分離:流動相A液:10 mMKH2PO4,25% CAN,pH=2.6;B 液:10 mMKH2PO4,350 mMKCl和25%ACN,pH=2.6。80 μL A液中溶解凍干樣品,上樣。將紫外檢測波長設(shè)置為214 nm/280 nm,然后將流速設(shè)置為200 μL/min。線性梯度洗脫:5~40 min,5%~25% B;40~45 min,25%~80% B;45~50 min,80% B;50~60 min,0%B。根據(jù)峰形和時間共收取20個梯度,真空離心濃縮后,每餾分用50 μL反相液相色譜的A相溶解,進樣量20 μL。(2)第二維反相液相色譜:流動相A液包含:5% (體積分數(shù))乙腈和0.1% 甲酸溶液。流動相B液包含:95% 乙腈和0.1% 甲酸溶液。RPLC柱線性梯度洗脫:0~5 min,上樣; 5~70 min,5%~35% B;70~75 min, 35%~80% B;75~80 min,80% B; 80~81 min, 80%~5% B;90 min 停止。(3)質(zhì)譜鑒定:噴霧針直接連接于反相色譜柱末端作為噴霧接口,噴霧電壓2.2 kV。MS掃描范圍:400~1 800 m/z,一個譜圖選擇4個最強母離子進行串級掃描,MS/MS掃描范圍100~2 000 m/z。
1.3.5生物信息學鑒定利用Protein.pilot 3.0軟件檢索質(zhì)譜分析所得數(shù)據(jù),差異蛋白篩選標準設(shè)定為:(1)肽段≥3;(2)模型組與正常組大鼠海馬組織蛋白分子質(zhì)量比≥2.0或≤0.5;(3)P<0.05。運用Uniport軟件分析各蛋白生物學過程及分子功能,運用David軟件從生物過程,細胞成分,分子功能注釋對蛋白進行分類,選擇KEGG數(shù)據(jù)庫對蛋白所涉及的通路進行分類和富集分析。
1.3.6Western-blot驗證通過文獻檢索選擇了差異蛋白Sodium-and chloride-dependent GABA transporter 3進行Western-blot驗證。按照碧云天SDS-PAGE凝膠試劑盒提供配方制備凝膠;選取凍存大鼠海馬組織每組3只,提取蛋白并定量,調(diào)整每管蛋白濃度致均值,加入含2-巰基乙醇和溴酚藍的2×蛋白上樣緩沖液,100 ℃孵育10 min, 冷卻到室溫后,將變性蛋白樣品直接上樣到SDS-PAGE膠加樣孔內(nèi);蛋白上樣后電壓設(shè)置在100 V,時間設(shè)定為90~120 min,當溴酚藍到達膠的底端處附近即可停止電泳;然后經(jīng)過轉(zhuǎn)膜,封閉,一抗孵育,二抗孵育,按1∶1加入AB顯影液,室溫放置5 min后,吸盡膜上水分,將膜放入暗盒,曝光5 min在Bio-Rad 的化學發(fā)光成像儀上顯影然后分析灰度值,再進行計算灰度系數(shù)比。
2.1行為學實驗結(jié)果
根據(jù)前期的研究結(jié)果顯示[4],21 d造模后,在曠場實驗中,模型組大鼠水平運動和垂直運動次數(shù)較正常組減少。在強迫游泳實驗中,模型組大鼠禁止不動時間較正常組增加。在高架十字迷宮實驗中,模型組大鼠進入開臂的次數(shù)及停留時間百分率明顯縮短,進入高架十字迷宮總次數(shù)明顯減少。說明CUMS致大鼠出現(xiàn)抑郁行為,模型建立成功。21 d氟西汀灌胃給藥后,氟西汀組大鼠抑郁行為得到明顯改善。
2.2ITRAQ實驗結(jié)果
本實驗基于ITRAQ技術(shù)聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)對氟西汀作用于CUMS大鼠后海馬組織內(nèi)蛋白質(zhì)表達的影響進行了差異分析。總共鑒定到5 109個蛋白,氟西汀組標記為119,模型組為121,設(shè)定蛋白豐度差異≥2.0倍(上調(diào));<0.5倍(下調(diào)),且經(jīng)統(tǒng)計檢驗其P<0.05為差異蛋白。共鑒定出差異蛋白41個,其中表達上調(diào)的蛋白有36個;表達下調(diào)的蛋白有5個,Uniport數(shù)據(jù)庫分析各個蛋白生物學過程及分子功能,見表1。
表1 Uniport數(shù)據(jù)庫分析各個蛋白生物學過程及分子功能
2.3生物學功能分析
通過David富集分析系統(tǒng)對41個差異蛋白進行GO分析和Pathway分析,通過GO分析發(fā)現(xiàn)這些蛋白共參與了29種生物學過程,31種細胞組分和17種分子作用,生物學進程分析(BP)分析發(fā)現(xiàn)差異表達蛋白主要參與了氧化還原、信號傳導、合成代謝、對外界刺激壓力的反應等。細胞成分分析(CC)分析得出差異蛋白廣泛分布在細胞膜、細胞質(zhì)及細胞器內(nèi)。分子功能分析(MF)分析得出這些蛋白的功能大多與離子束縛及核苷酸結(jié)合位點相關(guān),見圖1。通過KEGG PATHWAY發(fā)現(xiàn),共有19個蛋白參與了3條生物代謝通路。這3條通路分別是:檸檬酸循環(huán)、脂肪酸代謝及抗原加工提呈。
2.4Western-blot實驗結(jié)果
ITRAQ實驗結(jié)果顯示,蛋白Sodium-and chloride-dependent GABA transporter 3在氟西汀組大鼠海馬組織中表達下調(diào),且比值為0.37。Western-blot實驗結(jié)果表明相對于CUMS大鼠海馬組織,蛋白Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3在氟西汀組大鼠海馬組織中明顯低表達。見圖2。
有研究者發(fā)現(xiàn)氟西汀能夠增高CUMS大鼠海馬細胞神經(jīng)生長因子(NGF)陽性表達。NGF在體內(nèi)分布廣泛,具有營養(yǎng)神經(jīng)元及促突起生長雙重生物學功能,NGF含量的高低與抑郁癥密切相關(guān),這也可能是氟西汀抗抑郁的作用機制之一[5]。為深入探討氟西汀的抗抑郁作用機制,本實驗采用ITRAQ技術(shù)聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)分析氟西汀作用于CUMS大鼠后海馬組織蛋白的表達變化及這些差異表達蛋白與抑郁的關(guān)系。共鑒定出41個差異蛋白,其中表達上調(diào)36個,表達下調(diào)5個。通過GO分析發(fā)現(xiàn)這些差異蛋白主要參與了氧化還原、信號傳導、合成代謝及對外界刺激壓力的反應等生物學過程。通過KEGG發(fā)現(xiàn)這些差異蛋白總共參與3條代謝通路。這3條通路分別是:檸檬酸循環(huán)、脂肪酸代謝及抗原加工提呈。參與檸檬酸循環(huán)相關(guān)的主要的3個蛋白是Isocitrate dehydrogenase [NADP],Aconitate hydratase和Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex,這3個蛋白均是高表達,有利于檸檬酸循環(huán)的順利進行,保證機體的能量供應。kaibara等[6]發(fā)現(xiàn)該循環(huán)與抑郁癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。參與脂肪酸代謝主要的3個蛋白是Enoyl-CoA delta isomerase 2,Trifunctional enzyme subunit alpha和Acetyl-CoA acetyltransferase,流行病學和飲食研究均顯示n-3系多元不飽和脂肪酸的缺乏與抑郁癥的發(fā)生和嚴重程度直接相關(guān),而且存在反比關(guān)系[7]。本實驗發(fā)現(xiàn)參與脂肪酸代謝的這3個蛋白均高表達,但這些蛋白對脂肪酸代謝的影響及是否與抑郁癥的發(fā)生發(fā)展有關(guān)聯(lián)還待進一步研究。參與抗原加工提呈主要的3個蛋白是Calreticulin,Protein disulfide-isomerase A3和78 kDa glucose-regulated protein。均高表達。
結(jié)合GO分析,KEGG PATHWAY及Uniport分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)4個差異蛋白可能與氟西汀抗抑郁作用密切相關(guān)。這4個蛋白是Neuronal calcium sensor 1(NCS-1)、Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta、Neurocan core protein和Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3可能直接參與了氟西汀抗抑郁的過程。經(jīng)蛋白質(zhì)功能分析發(fā)現(xiàn)蛋白NCS-1參與了鈣離子跨膜運輸,負調(diào)節(jié)蛋白激酶活性,調(diào)節(jié)神經(jīng)元投射等生物學過程。de Rezende 等[8]也發(fā)現(xiàn)NCS-1不足時能夠引起類似焦慮、抑郁等行為,并且會損傷小鼠的記憶力。Amici 等[9]也證實NCS-1在調(diào)節(jié)突出可塑性的初始部分信號通路中起著關(guān)鍵作用。Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta與腦發(fā)育,學習記憶,海馬發(fā)育,軸突束狀,神經(jīng)元發(fā)育,少突細胞分化,樹突發(fā)育,調(diào)控神經(jīng)元死亡,神經(jīng)元投射,監(jiān)管纖維母細胞增值等有著密切的關(guān)系。有研究者發(fā)現(xiàn)大鼠額前皮質(zhì)高親和力受體酪氨酸激酶蛋白的表達減少與腦卒中后抑郁的發(fā)生直接相關(guān)[10]。Neurocan core protein可以調(diào)節(jié)神經(jīng)黏連和神經(jīng)突觸的生長。Dimatelis 等[11]發(fā)現(xiàn)Neurocan core protein參與調(diào)節(jié)大鼠母嬰分離所帶來的焦慮及抑郁癥狀。蛋白Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3對GABA的運輸與鈉離子同向轉(zhuǎn)運活動密切相關(guān),并且對其有高度的親和力,極易被再攝取到突觸前膜,終止GABA的活動,降低突觸間隙GABA的含量,加重抑郁。本研究發(fā)現(xiàn)氟西汀組大鼠海馬組織NCS-1、Neurocan core protein和Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta表達遠遠高于抑郁組。而Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3的含量確遠遠低于抑郁組。與國內(nèi)外研究人員所發(fā)表的結(jié)果相符合。
綜上所述,本研究通過ITRAQ技術(shù)聯(lián)合LC-MS/MS技術(shù)分析氟西汀抗抑郁作用機制,獲得了一系列與抑郁癥相關(guān)的差異表達蛋白,表明了該技術(shù)用于藥物抗抑郁蛋白質(zhì)組學研究具有良好的前景。同時發(fā)現(xiàn)了氟西汀抗抑郁的一些重要蛋白,但這些蛋白在抑郁癥的發(fā)生、發(fā)展過程中的作用尚未完全清楚,需進一步深入分析。
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(學術(shù)編輯:鄧世山)
Proteomics study of effects of fluoxetine on expression of proteins in hippocampus tissues of CUMS rats
YAN Yin1,CAO Li-sha2,LI Min2,WANG Ji-sheng2
(1.TheNinthPeople′sHospitalofChongqing,Chongqing400700;2.TheThirdPeople′sHospitalofMianyang,Mianyang621000,Sichuan,China)
Objective:The effects of fluoxetine on expression of proteins in hippocampus tissues of chronic unpredicted mild stress(CUMS) rats by proteomics study were studied to explore the anti-depression mechanism.Methods:CUMC was taken to establish rat depression model.Rats in fluoxetine group were administrated with fluoxetine (3 mg·kg-1·d-1) after stress procedure for 21 day .The extractd proteins from hippocampus tissues were digested by equal amount of trypsin and identified by ITRAQ coupled with the cation column and LC-MS/MS technology and then analyzed by Protein Pilot 3.0 search engine.Using bioinformatics to analyze differentially expressed proteins.Results:A total of 5109 proteins were identified,including 41 significantly differentially expressed proteins,which 5 proteins were down-regulated and 36 were up-regulated and involves redox reactions,signal transduction,anabolic metabolism,pressure to external stimuli of reaction process.Conclusion:Screening to four possible with fluoxetine antidepressant effect is closely related to the differences in protein,respectively is Neuronal calcium sensor 1 (NCS-1),Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta,Neurocan core protein and Sodium- and chloride-dependent GABA transporter,but these proteins in the role in the process of the occurrence and development of depression is still not clear and need further study.
Fluoxetine;Depression;Proteomics;Hippocampus;Isobaric tags for relative and absolute quantification
10.3969/j.issn.1005-3697.2016.03.014
四川省衛(wèi)生廳科研課題(120320)
2016-01-06
顏因(1978-),女,碩士,主治醫(yī)生。E-mail:yanyin616@sina.com通訊作者:曹莉莎,E-mail:285714739@qq.com
時間:2016-6-1617∶46
http://www.cnki.net/kcms/detail/51.1254.R.20160616.1746.028.html
1005-3697(2016)03-0336-06
R749.4
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