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    毛尖紫萼蘚(Grimmia pilifera)耐旱相關(guān)cDNA文庫中4個(gè)候選基因的表達(dá)分析

    2014-03-15 12:31:36宋曉宏
    關(guān)鍵詞:蘚類復(fù)水毛尖

    宋曉宏, 沙 偉

    (1.長江師范學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,重慶 涪陵 408100;2.齊齊哈爾大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院,黑龍江 齊齊哈爾161006)

    苔蘚植物是自然界的拓荒者之一,在長期的進(jìn)化過程中許多耐旱蘚類植物形成了特殊的形態(tài)、細(xì)胞及大分子等特征,具有很強(qiáng)的耐旱能力,并且在復(fù)水過程中可誘導(dǎo)啟動恢復(fù)機(jī)制,如叢本蘚(Anoectangium compactum)和土生蘚類(Tortula ruralis),經(jīng)受幾個(gè)月甚至幾十年的干旱仍能保持生命力[1-2]。國外從20世紀(jì)70年代起開始研究苔蘚植物抗旱性,其中以土生墻蘚研究較多,已有大量關(guān)于其應(yīng)對嚴(yán)重的水分和干旱脅迫的生理學(xué)、生物化學(xué)、細(xì)胞響應(yīng)及分子生物學(xué)的研究[3-6]。毛尖紫萼蘚(Grimmia pilifera)是紫萼蘚屬(Grimmia)中典型旱生植物,生長在向陽的裸巖上,久旱而不喪失生活力,是很好的抗旱資源。本研究從已構(gòu)建的毛尖紫萼蘚耐旱cDNA文庫中篩選4個(gè)干旱脅迫誘導(dǎo)表達(dá)的基因,分析其在干旱及復(fù)水條件下的表達(dá)模式,試圖找到重要的抗旱相關(guān)基因,為研究毛尖紫萼蘚抗旱分子機(jī)制提供初步的理論基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料及處理

    毛尖紫萼蘚采自黑龍江省北部五大連池風(fēng)景區(qū)的老黑山。清洗后在自然光照條件下,保持水分充足,室溫培養(yǎng)7~10 d至生理指標(biāo)[質(zhì)膜透性、丙二醛(MDA)含量、游離脯氨酸含量等]穩(wěn)定,作為對照材料。然后停止?jié)菜M(jìn)行干旱處理,依據(jù)已有對毛尖紫萼蘚干旱及復(fù)水過程中抗旱相關(guān)生理指標(biāo)測定結(jié)果選擇取材范圍[7],分別取干旱 1 d、3 d、5 d,再復(fù)水 0 h、0.5 h、1.0 h、6.0 h、12.0 h、24.0 h、36.0 h、48.0 h共11個(gè)時(shí)間點(diǎn)材料,液氮速凍后-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2 總RNA提取及cDNA合成

    蘚類植物普遍含有萜類、固醇類、酚類等次生代謝產(chǎn)物,使提取的 RNA易于降解。為此在 SDS法[8]基礎(chǔ)上加以改進(jìn),液氮研磨過程中加入聚乙烯吡咯烷酮(PVP)和抗壞血酸(VC)粉末,裂解步驟中加入終濃度20%的乙醇,沉淀步驟用1/2體積8 mol/L LiCl和1/2體積75%乙醇,-20℃沉淀30 min。RNA純化使用RQ1 RNase-free DNas試劑盒。cDNA合成采用Promega公司的M-MLV RT試劑盒,合成方法參照說明書進(jìn)行。

    1.3 候選基因及引物設(shè)計(jì)

    通過生物信息學(xué)分析,從毛尖紫萼蘚耐旱cDNA文庫[9]中選取與活性氧清除、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)及離子平衡相關(guān)的過氧化氫酶相似基因(GpCAT)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶相似基因(Gp-PAK)、H+-ATP酶相似基因(GpATP)和蔗糖合成酶相似基因(GpSuSy)進(jìn)行表達(dá)分析。根據(jù)這4個(gè)基因的EST序列,結(jié)合熒光定量PCR引物設(shè)計(jì)原則,采用Primer express v3.0軟件設(shè)計(jì)定量PCR引物。引物序列見表1。

    1.4 候選基因表達(dá)分析

    以18SrRNA作為內(nèi)參基因,設(shè)置空白對照,每個(gè)反應(yīng)設(shè)置3次重復(fù)。分別以對照和11個(gè)時(shí)間點(diǎn)材料cDNA為模板,采用熒光定量PCR分析各基因在干旱及復(fù)水條件下的表達(dá)。熒光定量PCR使用TaKaRa公司的 SYBR Premix Ex TaqTMⅡ(Perfect Real Time)試劑盒在伯樂公司的Chromo4熒光定量PCR儀上進(jìn)行,試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用OpticonMonitor3軟件自動分析。

    表1 候選基因熒光定量PCR引物序列Table 1 Fluorescence quantitative PCR primer sequences of the candidate genes

    2 結(jié)果與分析

    2.1 干旱條件下基因的表達(dá)

    以復(fù)水培養(yǎng)7~10 d的毛尖紫萼蘚材料中基因表達(dá)量作為對照,并定義為1個(gè)單位,干旱條件下各基因表達(dá)量如圖1所示。4個(gè)基因在干旱條件下基因表達(dá)均上調(diào),干旱5 d時(shí)GpCAT、GpPAK、GpATP和GpSuSy基因表達(dá)量分別達(dá)到對照的3.5、3.7、4.6和3.2倍,說明4個(gè)候選基因均受干旱誘導(dǎo)表達(dá)。在毛尖紫萼蘚抵御干旱的過程中,GpPAK作為信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)的關(guān)鍵酶,通過可逆的蛋白質(zhì)磷酸化過程在細(xì)胞內(nèi)外形成信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,完成信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程;GpCAT作為活性氧清除酶系統(tǒng)的一員發(fā)揮作用,使細(xì)胞免于遭受H2O2的毒害;GpATP調(diào)節(jié)植物離子及滲透物質(zhì)平衡;GpSuSy調(diào)控蔗糖的合成,從而維持細(xì)胞膨壓,保證其正常生長。

    2.2 復(fù)水條件下基因的表達(dá)

    復(fù)水條件下各基因表達(dá)量如圖2所示。復(fù)水初期(0.5至1.0 h),4個(gè)基因均表達(dá)下調(diào),但之后表達(dá)水平各異。其中,GpCAT基因復(fù)水后1.0 h表達(dá)水平開始大幅上升并呈波動變化,至復(fù)水后48.0 h表達(dá)量仍為對照的2倍;GpSuSy基因復(fù)水后0.5 h表達(dá)水平迅速下降,并逐漸恢復(fù)到對照水平;GpATP基因復(fù)水后1.0 h表達(dá)量大幅上升,復(fù)水24.0 h時(shí)表達(dá)量最高,為對照的7.3倍,干旱5 d的1.6倍;GpPAK基因復(fù)水后與其他基因相比在短時(shí)間內(nèi)表達(dá)量有較大幅度升高,復(fù)水6.0 h表達(dá)量最高,達(dá)到對照的4.2倍,之后逐漸下降到對照水平。說明并不是所有基因都受復(fù)水誘導(dǎo)表達(dá),有些基因可能對毛尖紫萼蘚復(fù)水后快速恢復(fù)生長發(fā)揮作 用,并且分別作用于復(fù)水后的不同時(shí)期。

    圖1 干旱過程中基因的表達(dá)模式Fig.1 Expression profiles of drought stress induced genes during dehydration

    圖2 復(fù)水過程中基因的表達(dá)模式Fig.2 Expression levels of drought stress induced genes during rehydrationn

    3 討論

    耐旱蘚類具有特殊的形態(tài)、細(xì)胞及大分子等特征,既可以適應(yīng)緩慢干旱脅迫,又可以抵御快速干旱造成的傷害,復(fù)水后幾秒鐘外部形態(tài)特征即可恢復(fù)正常,并很快恢復(fù)生長,區(qū)別在于緩慢干旱后復(fù)水生理代謝恢復(fù)速度很快,而快速干旱后復(fù)水要較長時(shí)間恢復(fù)。Hinshiri等[10]研究牛舌蘚(Anomdonviticu losus)和光萼苔(Porella pltyphylla)時(shí)發(fā)現(xiàn),緩慢干旱8~9 d后再復(fù)水,兩種苔蘚的呼吸和光合速率可迅速達(dá)到正常水平,積極的碳平衡幾乎在瞬間建立。

    植物干旱后復(fù)水能繼續(xù)生長也是抗旱性的一種表現(xiàn),多數(shù)復(fù)蘇植物可以在復(fù)水24 h后恢復(fù)正常代謝水平[11-12],并且復(fù)水后的基因表達(dá)與干旱脅迫時(shí)的基因表達(dá)是一個(gè)連續(xù)的過程,很多基因的表達(dá)具有連續(xù)性,在復(fù)水過程中依然起到重要作用[13-14]。耐旱蘚類復(fù)水時(shí)基因表達(dá)有很大變化,Oliver等[15-16]對土生墻蘚的研究結(jié)果表明,復(fù)水時(shí)蛋白質(zhì)的合成受到巨大影響,其中25種蛋白質(zhì)合成終止或大幅度下降,74種蛋白質(zhì)合成開始或大幅度上升,這2組蛋白質(zhì)分別被稱為Hydrins和Rehydrins。在復(fù)水延長期,Rehydrins和Hydrins的合成在恢復(fù)至正常水平的過程中也有所不同,在水化后2~4 h內(nèi),幾乎所有Hydrins的合成達(dá)到正常水平,而一些Rehydrins僅合成不到2 h,另一些10~12 h后仍呈上升趨勢,24 h后所有蛋白質(zhì)均達(dá)到正常水平[17]。因此也有學(xué)者[18]推測,復(fù)水早期的Rehydrins蛋白質(zhì)可能參與修復(fù)質(zhì)膜損傷,而復(fù)水延長期間的Rehydrins蛋白質(zhì)則可能參與細(xì)胞器結(jié)構(gòu)和功能的長期恢復(fù)過程。本研究中,GpSuSy基因在復(fù)水后表達(dá)量大幅下降,推測其可能為編碼Hydrins的基因;GpPAK和GpATP基因在復(fù)水后表達(dá)量高于干旱處理,分別在復(fù)水6 h和24 h時(shí)達(dá)到最高,推測它們?yōu)榫幋aRehydrins的基因,主要受復(fù)水誘導(dǎo),在再水化恢復(fù)過程中對細(xì)胞的質(zhì)膜氧化損傷及細(xì)胞器的結(jié)構(gòu)功能進(jìn)行修復(fù);GpCAT基因在干旱及復(fù)水條件下都有很高的表達(dá)量,無法判斷其是編碼Rehydrins或Hydrins的基因,但證明了毛尖紫萼蘚與土生墻蘚有類似的特點(diǎn),干旱及復(fù)水條件下某些基因表達(dá)具有連續(xù)性。

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