孫曉東 王 燕 羅超 王 珺 桑 明,2▲
1.湖北醫(yī)藥學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所,湖北十堰 442000;2.武漢大學(xué)動物實(shí)驗(yàn)中心/ABSL-3 Lab,湖北武漢 430071
核糖體失活蛋白(RIP)是一種能夠使真核細(xì)胞核糖體28s rRNA 第4 324位腺嘌呤糖苷鍵水解、斷裂,從而使真核細(xì)胞蛋白質(zhì)合成受到不可逆抑制的蛋白,廣泛存在于絲瓜種子中。目前分離到的Luffin-a[1-3]、Luffin-b[4]以及新型小分子蛋白 Luffin-s[5]、Luffin-P1[6,7]均屬于Ⅰ型 RIP。進(jìn)年來的研究發(fā)現(xiàn),RIPs 能抑制HIV 病毒在急慢性感染的淋巴細(xì)胞和單核巨噬細(xì)胞中的復(fù)制,具有抗病毒、抗腫瘤、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡等生物活性[5,8]。本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建Luffin-a的原核表達(dá)載體,對Luffin-a的體外表達(dá)做了初步研究。
大腸桿菌TOP10 感受態(tài)細(xì)胞和BL21(DE3)pLys表達(dá)菌株及克隆載體pGM-T均購自TIANGEN公司,原核表達(dá)載體pET-15b(+)由湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬人民醫(yī)院臨床醫(yī)學(xué)研究所贈送。Trizol 購自Invitrogen公司,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自Promega公司,2 ×Taq PCR MasterMix、 質(zhì)粒小提試劑盒、pGM-T 克隆試劑盒、DNA 純化回收試劑盒、DNA Marker D2000、D15000、DNA MarkerⅣ、IPTG 均購自TIANGEN公司,限制性內(nèi)切酶NdeⅠ和BamHⅠ購自Fermentas公司。
1.2.1 提取總RNA 及cDNA 第一鏈合成 用Trizol 常規(guī)提取未成熟絲瓜種子總RNA,用50 μL DEPC H2O 溶解RNA樣品,紫外分光光度儀檢測RNA 樣品濃度與純度,-80℃保存?zhèn)溆谩R? μg 總RNA 為模板,按逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明操作, 反應(yīng)體系:oligdT 2 μL,10 mmol/L dNTP 1.25 μL,加入RNA 適量體積后用 DEPC H2O 補(bǔ)足體積至 18.5 μL,70℃反應(yīng)5 min,立即插冰上;再加入逆轉(zhuǎn)錄酶mmlv(200 U/μL)1 μL,抑制劑 rRNasin(40 U/μL)0.5 μL,5×buffer 5 μL,使總反應(yīng)體系為 25 μL,42℃反應(yīng) 1 h,95℃反應(yīng) 3 min 終止反應(yīng),cDNA 產(chǎn)物-20℃保存。
1.2.2 引物設(shè)計(jì)及Luffin-a 基因PCR 擴(kuò) 增 根 據(jù)Pubmed 中檢索得到的Luffin-a 核酸序列,由上海生工設(shè)計(jì)合成一對引物,在正向引物5'端引入NdeⅠ酶切位點(diǎn),在互補(bǔ)鏈引物5'端引入BamHⅠ酶切位點(diǎn)(斜體),上下游引物之間擴(kuò)增產(chǎn)物長760 bp。上游引物:5'-gcccatatggatgtgaggttcagtttgtc-3';下游引物:5'-ggcggatcctcacgcaacatt ttgtttgta-3'。PCR 反應(yīng)體系:2×Taq PCR MasterMix 12.5 μL,上游引物(10 μmol/L)0.5 μL,下游引物(10 μmol/L)0.5 μL,cDNA 5 μL,ddH2O 6.5 μL,94℃預(yù)變性 5 min,94℃變性 30 s,56℃退火30s,72℃延伸30s,30個循環(huán),最后 72℃延伸 10min;PCR 產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.3 PCR 產(chǎn)物純化及Luffin-a表達(dá)載體的構(gòu)建 根據(jù)DNA 純化回收試劑盒說明操作將PCR 產(chǎn)物進(jìn)行純化,按照pGM-T 克隆試劑盒說明將Luffin-a 基因PCR 產(chǎn)物與pGM-T 載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞TOP10,通過藍(lán)白斑篩選,挑取白色單克隆菌擴(kuò)增,用質(zhì)粒小提試劑盒提取重組質(zhì)粒,0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測,重組質(zhì)粒命名為pGM-T-Luffin-a,采用菌落PCR 和雙酶切鑒定,再用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。將重組質(zhì)粒pGM-T-Luffin-a 和原核表達(dá)載體pET-15b(+)分別進(jìn)行NdeⅠ、BamHⅠ雙酶切,20 μL 反應(yīng)體系(NdeⅠ 1 μL、BamHⅠ 1 μL、10×buffer TangoTM2 μL、 質(zhì)粒 DNA 1 μg、nuclease-free water 補(bǔ)足 20 μL體積),37℃反應(yīng)過夜,瓊脂糖凝膠電泳檢測,回收目的DNA條帶,T4DNA 連接酶定向連接Luffin-a 和pET-15b(+),16℃反應(yīng)過夜,重組質(zhì)粒命名為 pET-15b(+)-Luffin-a;將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化 BL21(DE3)pLys 感受態(tài)細(xì)胞,涂 LB(ampr)平板,挑取單克隆菌劃線培養(yǎng),進(jìn)行菌落PCR 鑒定;將正確的重組子進(jìn)一步接種于含50 μg/mL 氨芐霉素的LB 培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜,少量提取質(zhì)粒,進(jìn)行酶切鑒定和測序驗(yàn)證。
1.2.4 Luffin-a的表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物的檢測 將含有正確表達(dá)載體 pET-15b(+)-Luffin-a 的轉(zhuǎn)化菌 BL21(DE3)pLys接種于20 mL 含相應(yīng)抗生素的LB 培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜,按1∶100 接種至200 mL 含相應(yīng)抗生素的新鮮LB培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)至OD600為0.6~0.7,留部分菌液做為誘導(dǎo)前對照,剩余部分加IPTG 至濃度為1.0 mmol/L 誘導(dǎo)表達(dá)6 h。分別取30 mL 菌液4℃2 000 r/min 離心15 min收集菌體,用PBS 洗滌沉淀2次,加入1 mL 裂解液懸浮沉淀,反復(fù)超聲凍融至菌液變清亮,12 000 r/min 離心取上清,100℃煮沸5 min,進(jìn)行PAGE 電泳檢測。
Trizol 常規(guī)提取未成熟絲瓜種子總RNA,紫外分光光度儀檢測RNA 樣品A260/A280值為1.83,說明樣品純度好。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,EB 染色后在凝膠成像系統(tǒng)中拍照取圖,在760 bp 處有一條強(qiáng)熒光條帶,其大小與預(yù)期片段大小一致(圖1)。
圖1 Luffin-a 基因RT-PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物電泳
PCR 產(chǎn)物切膠回收,與T 載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞TOP10,通過藍(lán)白斑篩選,提取重組的克隆載體,采用菌落PCR 和雙酶切鑒定,再用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(圖2)。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物和原核表達(dá)載體PET-15b(+)分別進(jìn)行NdeⅠ、BamHⅠ雙酶切,T4DNA 連接酶定向連接,16℃反應(yīng)過夜;重組質(zhì)粒pET-15b(+)-Luffin-a 轉(zhuǎn)化 BL21(DE3)pLys 感受態(tài)細(xì)胞,涂 LB(ampr)平板,挑取單克隆菌劃線培養(yǎng),進(jìn)行菌落PCR 鑒定(圖2)。將正確的重組子接種于含氨芐霉素的LB 培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜,少量提取質(zhì)粒,進(jìn)行酶切,用1%瓊脂糖電泳檢測(圖3)。酶切結(jié)果顯示,在750 bp 和5 500 bp 附近各有一條帶,說明Luffin-a 已經(jīng)插入表達(dá)載體pET-15b(+)。
圖2 重組子的菌落PCR 鑒定
圖3 Pet-15b(+)-Luffin-a 重組子的酶切結(jié)果
將重組表達(dá)質(zhì)粒pET-15b(+)-Luffin-a 轉(zhuǎn)化表達(dá)感受態(tài)BL21(DE3)pLys 菌株,在含相應(yīng)抗生素的LB 液體培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng),經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)6 h,在菌液以及超聲上清和沉淀中均可見約27 kD的蛋白被誘導(dǎo)表達(dá),與預(yù)期結(jié)果相符。不含重組表達(dá)質(zhì)粒的空載體工程菌經(jīng)誘導(dǎo)后沒有出現(xiàn)這一條帶(圖4)。從而說明重組表達(dá)質(zhì)粒pET-15b(+)-Luffin-a 在這一宿主菌中可表達(dá)絲瓜核糖體失活蛋白RIP。
圖4 陽性重組子誘導(dǎo)表達(dá)
RIPs是一類毒蛋白,其主要酶學(xué)性質(zhì)是具有RNA N-糖苷酶活力,更確切地說是多聚核苷酸∶腺苷糖苷酶活力,可特異地修飾核糖體大亞基rRNA 3'-端莖環(huán)結(jié)構(gòu)的腺嘌呤殘基而導(dǎo)致核糖體失活,阻止多肽鏈的延伸,從而抑制靶細(xì)胞中蛋白質(zhì)合成。RIPs 不影響自身28s rRNA,但對親緣關(guān)系較遠(yuǎn)生物的核糖體表現(xiàn)不同程度的損傷。核糖體失活蛋白主要存在于植物當(dāng)中,特別是苦瓜、絲瓜等葫蘆科植物的果實(shí)和種子中有多種核糖體失活蛋白。根據(jù)RIPs的物理特性可將其分為3 類:1型、2型和3型, 目前分離到的Luffin-a[1]、Luffin-b[4]及新型小分子蛋白 Luffin-s[8]、Luffin-P1[7,9]均屬Ⅰ型RIP。作為非病原性的一類毒蛋白基因,用做抗病毒的轉(zhuǎn)基因材料,Luffin 具有一定的應(yīng)用前景。對絲瓜核糖體失活蛋白的研究報道較少,最先發(fā)現(xiàn)絲瓜種子中毒蛋白的是Kishida等[10],他們將其命名為Luffin。1988年研究者從絲瓜籽中分離到兩種單鏈核糖體失活蛋白Luffin-a 和 Luffin-b。在1990年和1992年相繼報道Luffin-a的氨基酸序列和cDNA 序列。研究發(fā)現(xiàn),絲瓜種類不同,從其種子中提取的核糖體失活蛋白的氨基酸序列也有不同,其毒性也不同[1]。目前對絲瓜核糖體失活蛋白的體外研究很少,Au等[11]發(fā)現(xiàn)luffin 能有效抑制HIV-1 整合酶的活性。有研究發(fā)現(xiàn),RIPs 能抑制人類腫瘤細(xì)胞,同時又不殺死或很少殺死正常細(xì)胞[4-5]。
總之,絲瓜RIP 有廣泛的應(yīng)用前景,但仍有許多問題有待解決,如各種luffin的同源性,小分子量luffin是完全的新物質(zhì),或是某些大分子luffin的剪切產(chǎn)物,還是某一基因不同時期的表達(dá)產(chǎn)物;幾種luffin的活性位點(diǎn)是否相同等。本研究根據(jù)報道的Luffin-a[2]核酸序列,構(gòu)建其原核表達(dá)載體,體外誘導(dǎo)表達(dá)絲瓜核糖體失活蛋白,為進(jìn)一步研究luffin的酶學(xué)性質(zhì)及其抗病毒、抑制腫瘤、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡等方面的生物學(xué)活性奠定基礎(chǔ)。
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