摘要:為了研究魚腥藍(lán)細(xì)菌(Anabaena sp.)PCC 7120中兩個(gè)PP2C類蛋白磷酸酶PrpJ1和PrpJ2的磷酸酶活性,將編碼兩個(gè)蛋白N端至跨膜區(qū)的基因片段重組到質(zhì)粒中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌進(jìn)行原核表達(dá),獲得了可溶性的PrpJ1up和PrpJ2up蛋白。并且以pNPP為底物測定了所得蛋白的磷酸酶活性,雙倒數(shù)作圖法結(jié)果顯示PrpJ1up蛋白的Km為0.30 mmol/L,Vmax為7.10 nmol/min;PrpJ2up蛋白的Km為0.24 mmol/L,Vmax為0.43 nmol/min。
關(guān)鍵詞:魚腥藍(lán)細(xì)菌(Anabaena sp.);PrpJ1;PrpJ2;N端結(jié)構(gòu)域;磷酸酶活性
中圖分類號:Q933 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2012)07-1474-03
Activity Determination of N-domain of Two Phosphatase from Anabaena sp. PCC 7120
XU Xing-jian,CHEN Wen-li,WANG Li
(College of Life Science and Technology/Stat(yī)e Key Laboratory of Agricultural Microbiology, Huazhong Agricultural University,
Wuhan 430070, China)
Abstract: The gene fragments encoding N-domain of two phosphatase proteins PrpJ1 and PrpJ2 were cloned into pET28a. Soluble proteins PrpJ1up and PrpJ2up were obtained by prokaryotic expression, and then purified by Ni-NTA argrose. The kinetic constants of PrpJ1up and PrpJ2up towards pNPP were determined. The results showed that Km and Vmax of PrpJ1up were 0.30 mmol/L and 7.10 nmol/min respectively; While Km and Vmax of PrpJ2up were 0.24 mmol/L and 0.43 nmol/min respectively.
Key words: Anabaena sp. PCC 7120; PrpJ1; PrpJ2; N-domain; phosphatase activity
魚腥藍(lán)細(xì)菌(Anabaena sp.) PCC 7120是一種絲狀的革蘭氏陰性細(xì)菌,能夠進(jìn)行光合作用,屬光能自養(yǎng)型細(xì)菌[1]。當(dāng)環(huán)境中缺乏化合態(tài)氮源時(shí),魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120菌絲上有5%~10%的細(xì)胞會分化成異形胞[2,3],專一地執(zhí)行生物固氮功能。在魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120中有兩個(gè)同源性很高的基因prpJ1(all1731)和prpJ2(all2740),它們的氨基酸序列具有57%的相似性和40%的一致性,在催化結(jié)構(gòu)域區(qū)一致性更是達(dá)到45%。這兩個(gè)基因的編碼產(chǎn)物均為PP2C類蛋白磷酸酶,蛋白質(zhì)N端結(jié)構(gòu)域?yàn)槊傅幕钚灾行?,C端為未知功能結(jié)構(gòu)域,中間有一個(gè)疏水跨膜區(qū),使蛋白定位在質(zhì)膜上[4]。prpJ1基因參與魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120異形胞一種特異性糖脂的合成[5],該基因的缺失會導(dǎo)致異形胞發(fā)育不完全,容易脫落,從而使魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120在缺氮后不能生長。而當(dāng)prpJ1和prpJ2同時(shí)缺失時(shí),魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120則完全喪失了發(fā)育異形胞的功能,而且調(diào)節(jié)異形胞發(fā)育的兩個(gè)關(guān)鍵基因hetR和ntcA的上調(diào)表達(dá)都受到了抑制。由此推測PrpJ2與PrpJ1很可能位于同一調(diào)控途徑中,在異形胞發(fā)育早期共同發(fā)揮著重要作用[6,7],但其作用機(jī)制目前并不清楚。對PrpJ2與PrpJ1的功能進(jìn)行研究,確定其底物或互作蛋白將有助于揭示其參與異形胞發(fā)育調(diào)控的機(jī)制,進(jìn)一步完善異形胞發(fā)育的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。由于PrpJ1和PrpJ2都是跨膜蛋白,原核表達(dá)純化效果較差,存在較多的雜蛋白[8,9],影響了對其的體外研究。本研究分別將兩個(gè)基因編碼跨膜區(qū)及C端結(jié)構(gòu)域的片段截除,再進(jìn)行原核表達(dá),獲得包含N端結(jié)構(gòu)域和活性中心的截短蛋白prpJ1up和prpJ2up(圖1),避免了蛋白跨膜區(qū)對蛋白純化的影響,并且分析了所獲得蛋白的磷酸酶活性,以期為進(jìn)一步研究兩個(gè)蛋白在異形胞生長發(fā)育中的作用和機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 質(zhì)粒、菌株
質(zhì)粒pET28a,大腸桿菌TG1、BL21(DE3)及魚腥藍(lán)細(xì)菌(Anabaena sp.)PCC 7120均為華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室藍(lán)細(xì)菌室保存。
1.2 表達(dá)載體的構(gòu)建
本研究所用引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。引物PrpJ1upNf(5′-GGGGCTCCATATG
GAAAATGATGCGGCAA-3′)和PrpJ1upNr(5′-CGC
GGATCCTTAGGGTAGTTTGCTGATTCTATT-3′)用于擴(kuò)增prpJ1基因5′端1 749 bp的片段;引物PrpJ2upNf(5′-CTTCCATGGGTCTTTCTCGAACGGA
TAAT-3′)和PrpJ2upNr(5′-GCCGCTCGAGTAAAGG
TTGACGGCGTTTT-3′)用于擴(kuò)增prpJ2基因5′端
1 794 bp的片段。
以魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120總DNA為模板進(jìn)行目的基因片段的擴(kuò)增,反應(yīng)體系如下:DNA模板0.5 μL,上下游引物(10 μmol/L)各2 μL,KOD Plus(Toyobo)1 μL,KOD Plus Buffer 5 μL,MgSO4 5 μL,dNTPs 2 μL,用去離子水補(bǔ)足至50 μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋海梗?℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s,退火30 s,68 ℃延伸90 s,30個(gè)循環(huán);68 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。將擴(kuò)增得到的prpJ1基因片段與pET28a質(zhì)粒用NdeⅠ和BamHⅠ雙酶切,乙醇沉淀后用T4連接酶酶連,得到重組質(zhì)粒pET28a-PrpJ1up;將擴(kuò)增得到的prpJ2基因片段插入到pET28a的NcoⅠ和XhoⅠ位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒pET28a-PrpJ2up,將重組質(zhì)粒進(jìn)行酶切驗(yàn)證并測序。
1.3 蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及純化
將所得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21(DE3)中,挑取單克隆接種到5 mL含有50 mg/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),次日以1∶100的比例接種到含有50 mg/L卡那霉素的100 mL LB培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)至A600 nm為0.6左右時(shí),加入終濃度為0.3 mmol/L的IPTG,28 ℃、200 r/min誘導(dǎo)培養(yǎng)6 h左右,離心收集菌體,使用PBS緩沖液重懸細(xì)胞,加入終濃度為1 mmol/L的PMSF,使用壓力破碎儀進(jìn)行細(xì)胞破碎,離心取上清,使用鎳離子親和層析柱進(jìn)行蛋白純化。收集不同濃度咪唑(40、60、80、100、150、200、300 mmol/L)洗脫液,進(jìn)行SDS-PAGE檢測。
1.4 磷酸酶的活性檢測
使用磷酸酶的通用底物對硝基苯酚磷酸二鈉(pNPP)對純化后的蛋白進(jìn)行磷酸酶活性測定。反應(yīng)緩沖液為10 mmol/L Tris-Cl,pH 8.5,2 mmol/L MnCl2,1 mmol/L DTT和50 mmol/L NaCl[10]。本研究使用的pNPP濃度梯度分別為0.10、0.25、0.50、0.75、1.00、2.50、5.00 mmol/L,2 mL反應(yīng)體系加入2 μg蛋白,30 ℃反應(yīng)30 min。反應(yīng)完成后,測定400 nm處的吸光度A400 nm。根據(jù)對硝基苯酚的摩爾吸光系數(shù)16 500 L/(mol·cm)計(jì)算對硝基苯酚的濃度,然后用雙倒數(shù)作圖法分別計(jì)算PrpJ1up和PrpJ2up的Km與Vmax。
2 結(jié)果與分析
2.1 質(zhì)粒構(gòu)建結(jié)果
以魚腥藍(lán)細(xì)菌PCC 7120總DNA作為模板,以PrpJ1upNf、PrpJ1upNr?yàn)橐镞M(jìn)行PCR擴(kuò)增,將得到的擴(kuò)增片段插入到pET28a質(zhì)粒載體的NdeⅠ和BamHⅠ位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒pET28a-PrpJ1up。將重組質(zhì)粒用NdeⅠ和BamHⅠ進(jìn)行酶切驗(yàn)證可以得到預(yù)期的5 369 bp的載體片段和1 749 bp的prpJ1基因片段。采用類似的方法,以PrpJ2upNf、PrpJ2upNr?yàn)橐镞M(jìn)行PCR擴(kuò)增,將得到的擴(kuò)增片段插入到pET28a質(zhì)粒載體的NcoⅠ和XhoⅠ位點(diǎn),得到重組質(zhì)粒pET28a-PrpJ2up。利用NcoⅠ和XhoⅠ進(jìn)行酶切驗(yàn)證也可得到預(yù)期的5 369 bp的載體片段和1 794 bp的prpJ2基因片段。將經(jīng)過酶切驗(yàn)證的重組質(zhì)粒進(jìn)一步進(jìn)行序列分析檢測(圖2),結(jié)果表明已經(jīng)獲得正確的PrpJ1up和PrpJ2up的重組質(zhì)粒。
2.2 蛋白表達(dá)純化結(jié)果
將獲得的重組表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌菌株BL21(DE3)中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),IPTG終濃度為0.3 mmol/L,28 ℃誘導(dǎo)6 h,PrpJ1up和PrpJ2up蛋白可以被大量誘導(dǎo)表達(dá),而且兩種蛋白均主要以可溶的形式存在。收集誘導(dǎo)后的菌體,細(xì)胞破碎后使用鎳離子親和層析柱進(jìn)行純化,將不同濃度的咪唑洗脫液進(jìn)行SDS-PAGE電泳,結(jié)果顯示濃度為150 mmol/L和200 mmol/L的咪唑洗脫液中可以獲得很好的純化蛋白(圖3)。PrpJ1up分子量約為64 ku,PrpJ2up分子量約為65 ku,可以看出所獲得的純化蛋白大小與預(yù)期相符,應(yīng)為目的蛋白。
2.3 磷酸酶活性測定結(jié)果
對硝基苯酚磷酸二鈉(pNPP)是磷酸酶活性測定的通用底物,其磷酸化狀態(tài)下水溶液為無色透明的,經(jīng)磷酸酶脫去磷酸后生成對硝基苯酚(pNP),變?yōu)辄S色,并且在400 nm處有吸收峰,吸光系數(shù)為16 500 L/(mol·cm),測定A400 nm可以計(jì)算pNP的濃度。采用雙倒數(shù)作圖法計(jì)算PrpJ1up和PrpJ2up蛋白對pNPP的Km和Vmax(圖4),結(jié)果顯示PrpJ1up蛋白的Km為0.30 mmol/L,Vmax為7.10 nmol/min;PrpJ2up蛋白的Km為0.24 mmol/L,Vmax為0.43 nmol/min。
3 小結(jié)與討論
魚腥藍(lán)細(xì)菌(Anabaena sp.)PCC 7120是研究絲狀藍(lán)細(xì)菌異形胞發(fā)育及細(xì)胞間信號交流的模式生物[10,11]。PrpJ1和PrpJ2蛋白均為PP2C類蛋白磷酸酶,并且共同參與異形胞發(fā)育早期的調(diào)控[12,13],確定其底物將有助于進(jìn)一步揭示PrpJ1和PrpJ2參與異形胞發(fā)育調(diào)控的機(jī)制。體外研究PrpJ1和PrpJ2的功能及確定其底物需要以純化的蛋白為基礎(chǔ),但PrpJ1和PrpJ2都是定位在質(zhì)膜上的蛋白,跨膜區(qū)的存在將影響蛋白的純化效果。本研究表達(dá)了PrpJ1和PrpJ2蛋白跨膜區(qū)上游片段PrpJ1up和PrpJ2up,避免了跨膜區(qū)對蛋白純化的影響,獲得了更易純化的蛋白。磷酸酶活性檢測顯示PrpJ1up和PrpJ2up蛋白都具有較高的磷酸酶活性,表明PrpJ1和PrpJ2蛋白的疏水跨膜區(qū)及C端結(jié)構(gòu)域?qū)ζ淞姿崦富钚钥赡懿皇潜匦璧?,PrpJ1up和PrpJ2up可以替代其全蛋白進(jìn)行體外實(shí)驗(yàn)。本研究為體外尋找PrpJ1和PrpJ2的底物及互作蛋白,并進(jìn)一步研究PrpJ1和PrpJ2在異形胞調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用奠定了基礎(chǔ)。
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