摘要:抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)在土壤-蔬菜系統(tǒng)中傳播會威脅生態(tài)環(huán)境和蔬菜質(zhì)量安全,同時食用含有ARGs的蔬菜會進(jìn)一步危害人體健康。本文重點(diǎn)綜述了ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移過程及其機(jī)制,遷移過程涉及微生物菌群間的交互作用,解析了影響ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中傳播和擴(kuò)散的因素,包括抗生素的選擇壓力、非抗生素污染物、土壤類型、蔬菜種類等,系統(tǒng)總結(jié)了現(xiàn)有的土壤ARGs的消減方法,主要包括通過堆肥從源頭消減ARGs輸入、生物消減、物理化學(xué)消減(如添加土壤改良劑等)。最后,基于當(dāng)下研究的不足,提出了ARGs在遷移機(jī)制、影響因素、消減方法3個方面的未來研究方向,以期為土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs風(fēng)險防控提供依據(jù)。
關(guān)鍵詞:抗生素抗性基因;抗性菌;水平基因轉(zhuǎn)移;消減方法;土壤-蔬菜系統(tǒng)
中圖分類號:X53;X17 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1672-2043(2025)03-0605-12 doi:10.11654/jaes.2024-1148
抗生素作為一類藥物,廣泛用于人和動物的疾病預(yù)防、治療,在畜牧業(yè)還被用來促進(jìn)動物生長[1]。據(jù)報(bào)道,我國抗生素年產(chǎn)量超21 萬t,其中85%用于畜牧業(yè)和醫(yī)藥[2-3]。由于抗生素的過量生產(chǎn)和濫用,使得畜禽糞便中檢測出抗生素抗性菌(Antibiotic resis?tant bacteria,ARB)及抗生素抗性基因(Antibiotic re?sistance genes,ARGs)的種類和豐度均較高[4]。其中,四環(huán)素類、磺胺類、大環(huán)內(nèi)脂類和喹諾酮類等抗性基因在畜禽糞便中普遍存在[5]。因此,畜牧糞便不僅是ARGs的重要儲存庫,也是其遷移轉(zhuǎn)化的源頭。目前,水、土壤、大氣中都普遍存在ARGs,顯示了其在不同環(huán)境介質(zhì)中的廣泛傳播。
土壤是ARGs 最直接的承載介質(zhì),土壤-蔬菜系統(tǒng)則是ARB和ARGs重要的暴露環(huán)境。土壤-蔬菜系統(tǒng)中普遍存在一些天然抗生素,同時糞肥施用、污水灌溉、污泥施用等農(nóng)業(yè)措施,不可避免地將抗生素殘留物引入土壤中,這些殘留物改變了土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 和宿主菌的組成,甚至引入新的ARGs[6-7]。與不施肥相比,糞肥施用顯著增加了土壤中ARGs的豐度和多樣性,增幅為104.2%至112.3%[8]。此外,土壤中的ARGs 能夠通過微生物相互作用和食物鏈傳遞等被蔬菜進(jìn)一步吸收和富集[9]。Wang 等在施用畜禽糞便土壤中生長的生菜和菊苣的根內(nèi)生菌、葉片內(nèi)生真菌和葉際微生物中檢測到sulⅠ、sulⅡ、tetC 和tetG等基因,表明糞肥施用促進(jìn)了ARGs從土壤向蔬菜遷移[10]。更為嚴(yán)重的是,通過食用受污染的蔬菜,ARGs 還可能傳播到人類病原菌中,威脅公共健康。據(jù)統(tǒng)計(jì),全球每年因病原菌感染導(dǎo)致的死亡人數(shù)約為70 萬人,預(yù)計(jì)到2050年可能會增加到1 000 萬人[11]。因此,為降低ARGs對土壤環(huán)境和人體健康的潛在風(fēng)險,了解ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移機(jī)制和影響因素至關(guān)重要。目前,許多研究者致力于優(yōu)化不同的畜禽糞便處理方法,以減少ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中遷移和擴(kuò)散的風(fēng)險。
ARGs作為一種新型污染物,近年來引起了廣泛關(guān)注。大量研究集中于ARGs的來源、分布、豐度及多樣性等方面,并已取得了較為系統(tǒng)的成果。近些年研究的重點(diǎn)逐漸聚焦于ARGs 在土壤中的遷移擴(kuò)散及其帶來的生態(tài)風(fēng)險。相比之下,關(guān)于ARGs 在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移和消減的研究仍較為零散,尚缺乏全面的總結(jié)和系統(tǒng)性分析。因此,本綜述匯總了目前關(guān)于土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs遷移及消減的相關(guān)研究成果,分析現(xiàn)有研究的不足,并提出未來研究方向,以期為土壤ARGs污染治理提供理論支持,同時為制定科學(xué)合理的治理措施奠定基礎(chǔ)。
1 土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs的遷移及影響因素
ARGs具有可復(fù)制和易傳播的特性,能夠通過外源輸入并在土壤-蔬菜系統(tǒng)中遷移和擴(kuò)散。微生物是ARGs的主要宿主,外源ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移擴(kuò)散過程受到土壤微生物和植物微生物群落的共同影響。因此,深入研究土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移機(jī)制,綜合考慮外源污染物輸入、土壤理化性質(zhì)、蔬菜種類及動植物對遷移的影響,將有助于有效降低ARB和ARGs在該系統(tǒng)中的傳播風(fēng)險。這可為細(xì)菌耐藥性從土壤向蔬菜傳播的風(fēng)險防控提供重要的理論依據(jù)。
1.1 土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs的遷移過程及機(jī)制
1.1.1 ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移過程
土壤-蔬菜系統(tǒng)是ARGs 遷移的重要場所,植物微生物與土壤微生物之間通過相互作用,促使ARGs從土壤遷移到蔬菜中。植物微生物主要包括葉際微生物、根際微生物和內(nèi)生菌。其中,根際微生物在ARGs遷移中起著關(guān)鍵作用[12]。土壤中的ARGs向蔬菜遷移主要有兩種途徑:一是通過水平基因轉(zhuǎn)移(Horizontal gene transfer,HGT)過程從土壤供體菌轉(zhuǎn)移到植物受體菌中,并進(jìn)一步整合到植物微生物中[13];二是根際土壤中攜帶ARGs的細(xì)菌入侵植物根系,成為植物內(nèi)生菌,將ARGs轉(zhuǎn)移至植物內(nèi)部[14]。
近年來,研究發(fā)現(xiàn)ARGs 廣泛存在于植物中,相關(guān)研究進(jìn)一步揭示了土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs遷移的動態(tài)過程(圖1)[15]。Xiao等研究發(fā)現(xiàn),在種植植物的土壤中,約20.34%的ARGs在根際微生物和塊狀土壤之間發(fā)生了顯著轉(zhuǎn)移,這與土壤-植物系統(tǒng)中微生物功能的顯著變化密切相關(guān)[16]。Shen等發(fā)現(xiàn),ARGs在從根際土壤轉(zhuǎn)移到小麥根系并最終轉(zhuǎn)移到芽的過程中,其相對豐度逐漸降低,同時根際土壤、小麥根系和芽中均檢測到了ARGs和可移動遺傳元件(Mobile ge?netic elements,MGEs)的潛在宿主[17]。Xu等利用熒光標(biāo)記攜帶RP4 質(zhì)粒的大腸桿菌進(jìn)行擬南芥水培實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)RP4 質(zhì)??梢詮拇竽c桿菌轉(zhuǎn)移到植物內(nèi)生菌中。此外,土壤中的細(xì)菌(尤其是變形菌門)能夠從大腸桿菌中捕獲RP4質(zhì)粒,從而顯著促進(jìn)ARGs在植物微生物中的遷移[18]。以上研究表明,根際微生物和葉際微生物是ARGs遷移的重要媒介,能夠?qū)RGs轉(zhuǎn)移至植物內(nèi)生組織,并促進(jìn)ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中傳播。然而,ARGs在遷移的過程中通常會經(jīng)歷豐度下降的現(xiàn)象,這可能是微生物群落的篩選效應(yīng)和植物防御機(jī)制共同作用的結(jié)果。此外,有研究表明,通過HGT過程,ARGs可能會進(jìn)一步轉(zhuǎn)移至人畜共患病原菌中,增加其對公共健康的潛在威脅[19]。因此,為降低ARGs污染對人體健康的風(fēng)險,減少糞肥的施用具有重要意義。
1.1.2 ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的遷移機(jī)制
土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs的遷移是一個復(fù)雜且多層次的過程。從微觀分子水平來看,ARGs 的遷移機(jī)制可分為垂直基因轉(zhuǎn)移(Vetical gene transfer,VGT)和水平基因轉(zhuǎn)移(HGT)。VGT是指攜帶抗性基因的ARB通過繁殖將ARGs傳遞給子代,從而使ARGs在土壤微生物群落中增殖和擴(kuò)散,其傳播范圍有限;而HGT作為ARGs傳播的重要途徑,通過接合、轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)化等方式,將ARGs轉(zhuǎn)移至不同宿主中,實(shí)現(xiàn)ARGs在遠(yuǎn)緣或無親緣關(guān)系的生物個體間的傳播和擴(kuò)散,從而使ARGs由土壤向蔬菜遷移(圖2)[20]。因此,HGT過程是土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs遷移和擴(kuò)散的重要機(jī)制。
接合轉(zhuǎn)移通常由質(zhì)粒、整合子、轉(zhuǎn)座子等MGEs介導(dǎo)。在接合過程中,攜帶ARGs 的質(zhì)粒通過菌毛介導(dǎo)的細(xì)菌間直接接觸,從供體細(xì)菌轉(zhuǎn)移至受體細(xì)菌,促使ARGs 在不同細(xì)菌屬間的傳播。目前,質(zhì)粒介導(dǎo)的接合轉(zhuǎn)移的研究最為深入,也是土壤中ARGs 最普遍的轉(zhuǎn)移方式,主要由于質(zhì)粒具備自我復(fù)制能力,并且其對ARGs轉(zhuǎn)移的效率遠(yuǎn)高于其他類型的MGEs[21]。研究表明,施用有機(jī)肥能夠通過接合轉(zhuǎn)移加強(qiáng)土壤中ARGs的污染。例如,Pu等從豬糞和雞糞的大腸桿菌中分離出兩種可轉(zhuǎn)移抗性質(zhì)粒pRKZ3和pKANJ7,其中pRKZ3包含編碼質(zhì)粒復(fù)制和穩(wěn)定性的基因(repA、repB和repC)及ARGs(arr-3和aacA)[22]。這些質(zhì)粒能夠通過接合轉(zhuǎn)移在土壤-蔬菜系統(tǒng)中傳播,增加土壤-蔬菜系統(tǒng)中的ARGs豐度。此外,ARGs能夠通過接合轉(zhuǎn)移在土壤-蔬菜系統(tǒng)的不同菌屬之間傳播,使其能夠從土壤微生物中遷移到蔬菜中。例如,F(xiàn)an 等使用熒光標(biāo)記(gfp)攜帶RP4 質(zhì)粒的惡臭假單胞菌(KT2442),并將其作為供體菌接種到微型土壤中。經(jīng)過75 d培養(yǎng)后,在土壤的15個菌門中檢測到RP4,其中85.7% 屬于變形菌門[23]。類似地,Zhang 等將熒光標(biāo)記(dsRed 和gfp)攜帶RP4 的KT2442 添加到土壤-萵苣-蝸牛農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中,發(fā)現(xiàn)攜帶ARGs 的RP4質(zhì)粒能夠從土壤轉(zhuǎn)移到植物內(nèi)生菌中,進(jìn)一步進(jìn)入蝸牛腸道內(nèi)[24]。綜上所述,接合轉(zhuǎn)移在土壤-蔬菜系統(tǒng)中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,質(zhì)粒和其他MGEs 介導(dǎo)的HGT 加速了ARGs在不同微生物宿主間的傳播與擴(kuò)散。這一過程受到有機(jī)肥施用等外界因素的顯著影響,進(jìn)一步加劇了ARGs 的環(huán)境污染風(fēng)險。
外源DNA 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化和噬菌體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)導(dǎo)也是土壤中ARGs 轉(zhuǎn)移的重要途徑[25]。細(xì)菌能夠直接吸收胞外游離DNA(eDNA),并通過自然轉(zhuǎn)化將eDNA作為供體,促進(jìn)胞外游離ARGs 的水平轉(zhuǎn)移[26]。由于土壤顆粒可以吸附土壤環(huán)境中存在的大量eDNA,使其免于被DNA 酶降解,因此eDNA 在土壤中能持續(xù)存在數(shù)月,使自然轉(zhuǎn)化廣泛發(fā)生。然而,eDNA 易受環(huán)境因素(如pH值、溫度等)的影響,導(dǎo)致轉(zhuǎn)化效率相對較低[27]。噬菌體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)導(dǎo)是另一個關(guān)鍵機(jī)制。在土壤生態(tài)系統(tǒng)中,噬菌體作為ARGs水平轉(zhuǎn)移的載體,可通過一般性轉(zhuǎn)導(dǎo)和特異性轉(zhuǎn)導(dǎo),將宿主細(xì)胞內(nèi)的DNA 片段轉(zhuǎn)移到另一個宿主細(xì)菌中[28]。研究表明,噬菌體在環(huán)境中的廣泛分布極大促進(jìn)了ARGs的傳播,是ARGs傳播的重要載體和儲存庫[29]。此外,糞肥施用于土壤會進(jìn)一步促進(jìn)噬菌體和細(xì)菌之間的聯(lián)系,增加噬菌體的潛在宿主數(shù)量。例如,Larra?aga 等在土壤和蔬菜中細(xì)菌的噬菌體DNA 中發(fā)現(xiàn)了ARGs的普遍存在,其中β-內(nèi)酰胺酶類抗性基因豐度最高[30]。Wang 等在施肥土壤觀察到噬菌體與細(xì)菌之間有27 個連接,ARGs 與細(xì)菌/噬菌體之間有69 個連接,特別是假單胞菌和假單胞菌噬菌體(MD8)之間有5個ARGs(carA、lmrC、lsaC、vgaD和optrA)連接,其中4個僅在施用糞肥的土壤中觀察到[31]。盡管噬菌體在ARGs傳播中的作用已逐漸受到重視,但目前針對噬菌體介導(dǎo)的ARGs 水平轉(zhuǎn)移潛力的深入研究仍相對有限。進(jìn)一步研究噬菌體在土壤-蔬菜系統(tǒng)中的作用及其在ARGs 傳播中的機(jī)制,對于理解ARGs 在環(huán)境中的遷移路徑及其潛在風(fēng)險具有重要意義。
1.2 影響ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中轉(zhuǎn)移的因素
ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中傳播是多種因素共同作用的結(jié)果,各種環(huán)境因素對不同抗性基因傳播過程中的影響不同,在研究ARGs 的水平轉(zhuǎn)移時應(yīng)充分考慮這些因素。其中,抗生素的選擇壓力和非抗生素污染物是關(guān)鍵的驅(qū)動因素。抗生素長期暴露于環(huán)境中會誘導(dǎo)產(chǎn)生ARGs,且抗生素殘留物進(jìn)入土壤中后,會對土壤微生物菌群施加選擇壓力,促使ARB 的產(chǎn)生,并促進(jìn)ARGs 的增殖和擴(kuò)散。即使在選擇壓力去除后,ARGs 也會持續(xù)存在[32]。例如,亞致死濃度的氟喹諾酮類、氨基糖苷類和β-內(nèi)酰胺類抗生素已被證明能夠引起細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)DNA損傷的整體反應(yīng),這不僅阻止細(xì)菌生長,還誘導(dǎo)DNA修復(fù)和誘變,即SOS反應(yīng),從而促進(jìn)了ARGs的水平轉(zhuǎn)移[33]。同時,抗生素殘留濃度對ARGs的組成和豐度有顯著影響[34]。Zhao等觀察到,sulI的豐度與磺胺類藥物的添加濃度顯著正相關(guān),此外,高濃度的抗生素選擇壓力顯著增加了ARGs的豐度,但同時也明顯降低了ARGs的多樣性[35]。
除抗生素外,重金屬、微塑料(Microplastics,MPs)等非抗生素污染物也是ARGs傳播的重要因素。重金屬經(jīng)常被用作牲畜飼料添加劑,尤其在豬糞中,Cu和Zn的濃度較高[36]。與抗生素相比,重金屬不易降解,會對環(huán)境微生物群施加長期的選擇壓力[37]。重金屬還能夠促進(jìn)ARGs與重金屬抗性基因共選擇,從而通過共選擇促進(jìn)ARGs的增殖和擴(kuò)散。例如,Tan等從施用糞肥的土壤中分離出的大腸桿菌菌株中發(fā)現(xiàn)了10種重金屬抗性基因,其中72.63%的大腸桿菌對Cu具有耐性,實(shí)驗(yàn)表明重金屬抗性基因與ARGs之間存在強(qiáng)共存現(xiàn)象[38]。此外,Wang等發(fā)現(xiàn),重金屬Pb能夠通過影響土壤-植物系統(tǒng)中ARGs和MGEs的相對豐度以及微生物群落結(jié)構(gòu)來促進(jìn)ARGs的遷移擴(kuò)散[39]。
MPs也是一種新污染物,可以和ARGs 在土壤環(huán)境中共存,并對ARGs的遷移擴(kuò)散起到顯著的促進(jìn)作用。MPs 不僅可以作為一種新型生態(tài)位,選擇性地富集ARGs,還能夠通過其表面形成的生物膜,促進(jìn)ARGs 在不同環(huán)境和菌群間的傳播擴(kuò)散[40-42]。MPs上較密集的細(xì)菌群落增強(qiáng)了ARGs 在不同菌群間的水平轉(zhuǎn)移速率。例如,Yu等發(fā)現(xiàn)養(yǎng)雞場的MPs與ARGs之間具有顯著相關(guān)性,共軛轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,MPs提高了細(xì)菌共軛轉(zhuǎn)移頻率1.4~1.7倍[43]。Li等研究發(fā)現(xiàn),MPs 改變了根際土壤和生菜組織中ARGs 的豐度,同時高濃度的聚乙烯促進(jìn)了sul 類抗性基因從根部到菜葉的轉(zhuǎn)移。在這一過程中,MGEs 的豐度以及內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)的變化共同增加了根中ARGs 的相對豐度[44]。此外,如果MPs 經(jīng)歷老化,其物理、化學(xué)和生物特性都會發(fā)生改變,經(jīng)常導(dǎo)致更高的ARGs 吸附率以及中等水平活性氧(Reactive oxygen species,ROS)的產(chǎn)生,這可以通過增加細(xì)胞膜通透性來促進(jìn)HGT過程[45]。
此外,其他環(huán)境污染物也被證明能夠加速ARGs的傳播擴(kuò)散,如殺菌劑、消毒劑、納米材料等[46-47]。這些污染物通過多種機(jī)制影響細(xì)菌的生理狀態(tài),進(jìn)而促進(jìn)ARGs在細(xì)菌群落中的水平轉(zhuǎn)移和進(jìn)化。例如,季銨化合物(Quaternary ammonium compounds,QACs)作為消毒劑和清潔劑,能夠通過增強(qiáng)細(xì)菌細(xì)胞膜的通透性,刺激細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生ROS,從而促進(jìn)ARGs 在細(xì)菌菌株之間的水平轉(zhuǎn)移和進(jìn)化[48]。氧化石墨烯(Grapheneoxide,GO)是典型的納米材料之一,其對ARGs 的傳播擴(kuò)散具有雙重作用,具體效果與環(huán)境條件相關(guān)。GO能夠誘導(dǎo)細(xì)菌氧化應(yīng)激,增加細(xì)胞膜通透性,促進(jìn)攜帶ARGs 的RP4 質(zhì)粒在不同細(xì)菌之間的轉(zhuǎn)移。然而,Wu等在研究ARGs從枯草芽孢桿菌轉(zhuǎn)移到水稻的影響因素時發(fā)現(xiàn),GO 阻止了ARGs 從根瘤桿菌向水稻轉(zhuǎn)移。GO的添加導(dǎo)致水稻營養(yǎng)液的pH值下降,雖然這不利于水稻生長,但水稻營養(yǎng)液中的ARB豐度顯著降低[49]。因此,GO 對土壤-植物系統(tǒng)中ARGs傳播的影響需進(jìn)一步研究。
土壤理化性質(zhì)(如土壤類型、pH、含水量等)對ARGs 在土壤中的遷移與持久性具有顯著影響。這些環(huán)境因子通過調(diào)控土壤養(yǎng)分、微生物群落活性及DNA的吸附行為,進(jìn)一步影響ARGs的豐度與傳播能力[50]。土壤類型對ARGs 在土壤中的時間動態(tài)和持久性具有顯著影響。Song等研究了施用糞肥的6 種不同類型土壤,發(fā)現(xiàn)sul1基因在紅土、黃土、灰鈣土中表現(xiàn)出高度持久性,并且ARGs在這些土壤類型中的傳播能力更強(qiáng)[51]。土壤的pH值和含水量會通過影響土壤養(yǎng)分、土壤中微生物群落活性以及對DNA 的吸附行為等,進(jìn)而影響ARGs 傳播。Tang 等在長期施用糞肥的水稻田中進(jìn)行田間試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)pH 值和含水率與土壤中ARGs 豐度顯著相關(guān)[52]。Peng 等研究了3種土壤中土霉素的行為,發(fā)現(xiàn)土壤pH 值和陽離子交換能力會強(qiáng)烈影響土霉素在土壤中的吸附和解吸行為[53]。此外,土壤中的外源ARGs 還可能受到季節(jié)變化的影響,有研究發(fā)現(xiàn),冬季溫度低,導(dǎo)致土壤中微生物群落活動水平下降,從而使ARB 能夠在土壤中增殖并增加ARGs的豐度,而夏季土壤中ARGs 的豐度最低[54]。
蔬菜種類也是影響ARGs在土壤-蔬菜系統(tǒng)中遷移的重要因素,不同的蔬菜品種中ARGs豐度差異顯著。研究發(fā)現(xiàn),根莖類蔬菜受到ARGs污染的風(fēng)險通常低于葉菜類蔬菜。例如,Cerqueira等的研究表明,生菜的ARGs豐度通常高于西紅柿和豆類,而豆類的ARG 和intI1 豐度則較低[55]。還有研究表明,同一類型的不同蔬菜中ARGs的豐度和多樣性也存在差異。例如,有學(xué)者研究了4種可生食蔬菜(香菜、菊苣、生菜和白菜),發(fā)現(xiàn)蔬菜種類對ARGs的豐度和多樣性的影響顯著,白菜和生菜可食用部分積累的ARGs比其他兩種蔬菜多[56-57]。此外,與傳統(tǒng)蔬菜種植方式相比,有機(jī)種植方式通過促進(jìn)HGT過程增加了ARGs在蔬菜內(nèi)生菌群中的抗性水平,且與根莖類蔬菜相比,葉菜類蔬菜受有機(jī)種植方式的影響更大[58]。
土壤動物作為ARGs 的隱藏儲存庫,對土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 的傳播起著關(guān)鍵作用。土壤動物通過食物網(wǎng)和生命活動改變土壤中的pH值、含水率和有機(jī)質(zhì)含量等,從而影響微生物群落的結(jié)構(gòu)和生存能力,這些因素均對ARGs 的傳播和擴(kuò)散產(chǎn)生影響[59]。Zhu等的研究表明,彈尾蟲能加速ARGs 在土壤生態(tài)系統(tǒng)中的擴(kuò)散[60]。另有研究發(fā)現(xiàn),蚯蚓作為大型土壤動物,其腸道細(xì)菌受到抗生素的選擇壓力,進(jìn)而影響蚯蚓腸道細(xì)菌的多樣性,并增加蚯蚓腸道中ARGs 的豐度。Chao 等的研究表明,蚯蚓腸道細(xì)菌群落中tet和sul 類抗性基因普遍存在,表明蚯蚓腸道是ARB和ARGs 定殖的適宜微環(huán)境,可能有助于ARGs 在土壤中的傳播[61]。植物通過根系分泌物對土壤微環(huán)境產(chǎn)生重要影響,進(jìn)一步促進(jìn)ARGs 的增殖與擴(kuò)散。根系分泌物能通過提供養(yǎng)分、抑制微生物代謝和改變土壤性質(zhì)(如pH)來塑造根際微生物群落結(jié)構(gòu),進(jìn)而促進(jìn)一些攜帶ARGs 的微生物生長和繁殖,促進(jìn)ARGs增殖和擴(kuò)散[62-63]。
2 土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs的消減方法
為減少土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 污染,提升蔬菜的安全性和土壤的健康,必須采取系統(tǒng)性的綜合治理措施,從源頭減少ARGs 進(jìn)入土壤中的可能性。一方面,畜牧業(yè)應(yīng)減少抗生素的使用,通過優(yōu)化抗生素投喂策略降低ARGs的產(chǎn)生與擴(kuò)散風(fēng)險;另一方面,應(yīng)將畜禽糞便進(jìn)行堆肥或熱解制成生物炭,以減少最終產(chǎn)品中ARGs 的豐度。然而,有研究表明,低濃度的抗生素仍能誘導(dǎo)產(chǎn)生ARB 和ARGs。因此,僅靠源頭處理無法完全消除土壤系統(tǒng)中的ARGs。目前,針對ARGs 的消減方法主要包括源頭堆肥、生物消減和物理化學(xué)消減等(表1)。由于單一的消減技術(shù)具有一定的局限性,多種技術(shù)的聯(lián)合應(yīng)用將成為未來研究的重要方向,源頭控制與后續(xù)消減技術(shù)的結(jié)合能夠在實(shí)際土壤系統(tǒng)中實(shí)現(xiàn)更高效的ARGs去除,全面保障蔬菜的安全性和土壤的健康。
2.1 源頭堆肥
堆肥(包括好氧堆肥和厭氧消化)是一種高效的資源化利用技術(shù),廣泛應(yīng)用于畜禽糞便的處理與再利用。研究表明,堆肥能夠有效降低畜禽糞便中的抗生素濃度和ARGs 含量[77]。Deng等對雞糞進(jìn)行堆肥處理后,發(fā)現(xiàn)所有抗生素濃度均顯著下降,與不施肥的土壤相比,施肥后土壤中ARGs 的相對豐度也有所下降[78]。高溫對有機(jī)廢棄物堆肥的影響尤為顯著,研究顯示,在長時間高溫條件下,好氧堆肥能夠顯著降低ARGs的豐度,這可能是由于高溫階段大多數(shù)ARB及ARGs的宿主細(xì)菌失活,或者是高溫下細(xì)菌的相互作用和MGEs數(shù)量減少,從而阻止ARGs的水平轉(zhuǎn)移[79]。
然而,傳統(tǒng)堆肥技術(shù)無法完全去除ARGs,甚至在某些情況下,堆肥后ARGs 的豐度可能會增加[64,80]。因此,許多研究者采用添加外源物質(zhì)的策略來改進(jìn)堆肥,如生物炭、微生物制劑和納米材料等。這些物質(zhì)能夠作為有機(jī)肥改良劑,改善堆肥效果。生物炭作為堆肥中常用的化學(xué)添加劑,能夠重塑微生物群落,并通過降低ARGs的宿主細(xì)菌的豐度來抑制ARGs的增殖。Li等的研究表明,椰殼生物炭改良后的糞肥施用于土壤中,經(jīng)過50 d 后,acrA-01、blaTEM、ermB、ermF、ermX 和tetM -01 的相對豐度分別降低了56.96%、61.63%、56.75%、67.15%、62.22% 和65.10%[65]。此外,特定功能的微生物菌群的加入也能加速堆肥的腐殖化,提升抗生素的去除率。例如,Duan等研究發(fā)現(xiàn),向堆肥中加入0.5%的枯草芽孢桿菌有助于降低intI1的豐度,從而抑制HGT過程,降低ARGs的絕對豐度,其中β-內(nèi)酰胺類耐藥基因的去除能顯著降低對人體健康的風(fēng)險[66]。在堆肥過程中添加的少量納米材料表現(xiàn)出了強(qiáng)大的污染物吸附能力。Jiang 等的研究表明,添加1 g·kg-1 SiO2NPs能夠降低細(xì)胞內(nèi)ARGs 的豐度,完全消除了細(xì)胞外ARGs,并通過抑制ARB 的生長和降低ARGs 與MGEs 的共宿主的豐度,從而降低ARGs的傳播風(fēng)險[67]。還有研究發(fā)現(xiàn)某些植物產(chǎn)生的化學(xué)物質(zhì)不僅能作為抗菌劑,還能與現(xiàn)有抗生素協(xié)同作用,從而有效消除抗生素耐藥性。Abdellah 等在堆肥過程中添加薇甘菊(Mikaniamicrantha),其能夠顯著降低ARGs的豐度,其中sul1和sul2的豐度分別降至2.91%和2.32%,當(dāng)添加薇甘菊與堆肥溫度升高結(jié)合時,ARGs的去除更為顯著,并且薇甘菊的應(yīng)用顯著減輕了整個堆肥過程中的抗生素選擇壓力[68]。盡管使用添加劑改進(jìn)堆肥已在實(shí)驗(yàn)研究中得到廣泛應(yīng)用,但在農(nóng)田實(shí)施時需綜合考慮眾多變量,如環(huán)境條件、經(jīng)濟(jì)成本與實(shí)際操作可行性等。為最大限度地發(fā)揮去除效果和經(jīng)濟(jì)效益,應(yīng)該根據(jù)具體條件選擇適宜的堆肥策略。
2.2 生物消減
生物法消減土壤中ARGs污染具有環(huán)保、經(jīng)濟(jì)有效和長期效果好等優(yōu)勢,利用動物、植物和微生物來加強(qiáng)土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs的去除,有助于恢復(fù)土壤微生物多樣性、改善土壤結(jié)構(gòu)和功能,從而提升土壤健康和食品安全。目前,已有諸多研究探索不同生物消減方法在去除土壤中ARGs 方面的效果,并證明這些方法能夠有效降低ARGs 的豐度。
在植物消減方面,植物過去多用于治理土壤中重金屬污染和改善土壤理化性質(zhì),目前對土壤中ARGs影響的研究相對較少。Lu 等的研究顯示,利用水生植物綠萍改良土壤可消除土壤中轉(zhuǎn)座酶基因的豐度,從而顯著改變土壤中ARGs的多樣性,并且在一定量的綠萍處理后,土壤中ARGs 數(shù)量下降了29.3%,ARGs 豐度降低了27.4%~41.6%[69]。因此,植物在ARGs 去除方面具有顯著的應(yīng)用潛力,未來結(jié)合不同環(huán)境條件和植物種類進(jìn)行系統(tǒng)研究,將有助于開發(fā)更為高效的生物消減策略,進(jìn)一步推動土壤健康與食品安全的可持續(xù)發(fā)展。
蚯蚓對土壤中微生物群落的結(jié)構(gòu)和ARGs 的傳播具有重要影響,蚯蚓腸道及其微生物群落在土壤污染物的轉(zhuǎn)化中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,具有降低土壤中ARGs豐度的潛力。Li等的研究發(fā)現(xiàn),加入蚯蚓能夠降低土壤細(xì)菌共生網(wǎng)絡(luò)的連通性,從而顯著降低了土壤中MGEs 的豐度,并且蚯蚓腸道中ARGs 和MGEs的絕對豐度均低于周圍土壤中的ARGs[81]。蚯蚓等生物堆肥能夠生產(chǎn)環(huán)境友好型生物肥料,通過腐生動物群(如蚯蚓和家蠅幼蟲)腸道微生物群的生物轉(zhuǎn)化能力,將有機(jī)廢棄物轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)、脂肪等有機(jī)物,從而實(shí)現(xiàn)資源的循環(huán)利用。蚯蚓堆肥能夠通過改變微生物群落之間的相互作用,從而降低ARGs的豐度,并通過阻礙質(zhì)粒轉(zhuǎn)移減少ARGs在土壤中的傳播[82]。有研究者進(jìn)行圣甲蟲幼蟲堆肥實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),土壤和根內(nèi)生菌中ARGs 的數(shù)量顯著降低,并且對土壤和蔬菜中ARGs的傳播影響較小[70,83-84]。蚯蚓及其堆肥技術(shù)不僅能夠有效處理有機(jī)廢棄物,還在減少ARGs和MG?Es豐度方面表現(xiàn)出顯著效果,為生物消減土壤ARGs提供了一種綠色、經(jīng)濟(jì)且可持續(xù)的解決方案。
土壤微生物由于其高代謝能力,能夠通過生物降解去除農(nóng)業(yè)活動中產(chǎn)生的有機(jī)污染,這為ARGs 的消減提供了重要的途徑。通過引入外源特定功能菌群,可以進(jìn)一步促進(jìn)土壤系統(tǒng)中ARGs 的去除。外源特定功能菌群在土壤中占據(jù)優(yōu)勢地位后,可能抑制土壤中攜帶ARGs 的ARB 的增殖。然而,目前關(guān)于利用土壤和糞便中分離出的微生物進(jìn)行生物降解去除抗生素和ARGs 的研究報(bào)道較少[85]。Li等從土壤中分離出一株變形桿菌菌株ZQ02,并接種到四環(huán)素和百菌清混合污染的玉米田中。研究發(fā)現(xiàn),ZQ02 的引入使四環(huán)素的降解率高達(dá)97.05%,同時,改變了土壤-植物系統(tǒng)中ARGs和MGEs的分布。該處理顯著降低了根際土壤和玉米根系中ARGs和MGEs的豐度,使得ARGs 風(fēng)險轉(zhuǎn)移。此外,ZQ02的接種對玉米根系的內(nèi)生微生物組成影響甚微,有助于阻止ARGs從土壤遷移至玉米植株內(nèi)[71]。
2.3 物理化學(xué)消減
物理化學(xué)消減是指通過物理手段(如吸附、通氣、熱解等)或化學(xué)反應(yīng)及提供營養(yǎng)元素等方式,改變土壤的結(jié)構(gòu)和性質(zhì),以減少或去除土壤中污染物。物理消減適用于土壤污染的初步處理,包括換土法和熱處理等,能夠有效減少土壤中ARGs 的豐度;化學(xué)消減包括施用土壤改良劑和化學(xué)修復(fù)等方法。與生物消減相比,物理化學(xué)消減不僅成本較高,還可能導(dǎo)致土壤結(jié)構(gòu)破壞和土壤生物量下降等問題,不符合經(jīng)濟(jì)和環(huán)境可持續(xù)發(fā)展理念[6]。因此,物理消減通常與化學(xué)消減或生物消減結(jié)合使用,以提高整體的去除效果。
應(yīng)用土壤改良劑能夠通過改變土壤的結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)(如pH、透氣性、持水能力等),進(jìn)而影響土壤中微生物的豐度和多樣性,從而改變土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 的遷移和擴(kuò)散能力。這一過程同時涉及物理消減和化學(xué)消減,在控制土壤系統(tǒng)中ARGs 的污染方面具有良好的應(yīng)用前景[86]。生物炭作為多功能土壤改良劑,由于其強(qiáng)大的吸附能力,可以直接降低土壤中抗生素濃度,從而有助于降低抗生素的選擇壓力引發(fā)的ARGs 豐度。此外,生物炭還能通過改變土壤的理化性質(zhì)及土壤微生物的豐度、多樣性和酶活性等,抑制細(xì)菌間ARGs的HGT過程,并阻止ARGs向農(nóng)作物遷移和擴(kuò)散[87]。然而,在不同研究中,生物炭對ARGs的消減效果存在差異,其受到活性炭老化[88]、土壤類型[89]、生物炭類型、生物炭施加量[90]等因素影響。目前,有許多研究著眼于生物炭與其他土壤改良劑聯(lián)合使用對ARGs 去除效果的探索[91]。例如,Duan等的研究表明,0.5%納米生物炭和3 g·m?2蠟樣芽孢桿菌的聯(lián)合應(yīng)用能通過改變土壤和生菜中的微生物群落結(jié)構(gòu)和MGEs分布,抑制ARGs 向植物地上部分的傳輸,從而影響土壤-生菜系統(tǒng)中ARGs 的豐度[72]。另外,還有研究者提出生物炭和噬菌體療法聯(lián)用能夠消減土壤植物系統(tǒng)中的ARB和ARGs。Ye等研究發(fā)現(xiàn),相較于單獨(dú)處理,生物炭和多階噬菌體療法聯(lián)用ARGs的去除效果更顯著,其中tetM、tetQ、tetW、ampC和fosA 的水平均顯著下降,且聯(lián)用處理提高了土壤微生物群落和生菜內(nèi)生菌群的多樣性和穩(wěn)定性[73]。此外,納米零價鐵(NZVI)[74]、焦磷酸(PA)[75]等作為土壤改良劑,也被證明可以降低ARGs在土壤中的傳播風(fēng)險。
微生物燃料電池(Microbial fuel cell,MFC)作為一種新型修復(fù)技術(shù),通過結(jié)合微生物代謝和厭氧條件下的電化學(xué)氧化還原反應(yīng)來促進(jìn)污染物的降解,目前已被證實(shí)可以用于廢水和土壤中抗生素和ARGs 的去除[92-93]。例如,Zhao等的研究表明,與對照土壤相比,土壤MFC 中四環(huán)素和ARGs 的豐度分別減少了64% 和17%,其能夠通過減少M(fèi)GEs 的豐度來抑制ARGs的水平轉(zhuǎn)移[76]。與水環(huán)境相比,關(guān)于土壤MFC對ARGs去除的研究仍較少,但越來越多的研究者認(rèn)為,MFC 在減少土壤ARGs 方面具有良好的應(yīng)用前景[94]。一方面,已有研究表明厭氧條件下土壤中ARGs和MGEs豐度顯著降低[95];另一方面,該技術(shù)可以結(jié)合生物處理,無需電源輸入,而是利用微生物作為催化劑將化學(xué)能轉(zhuǎn)化為電能,是一種環(huán)保且可持續(xù)的消減方法[96]。
3 結(jié)論與展望
本文綜述了土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 的遷移機(jī)制、傳播的影響因素以及消減方法。外源添加物,尤其是有機(jī)肥的施用,向土壤持續(xù)輸入大量ARB 及其攜帶的ARGs。這些基因在土壤微生物相互作用和水平轉(zhuǎn)移的影響下,不斷增殖和擴(kuò)散。隨后,ARGs在土壤微生物和植物微生物,尤其是內(nèi)生細(xì)菌的相互作用和驅(qū)動下,進(jìn)一步在土壤-蔬菜系統(tǒng)中遷移和擴(kuò)散。部分ARGs 通過環(huán)境和食物鏈持續(xù)擴(kuò)散,其生態(tài)風(fēng)險增加,并對公共健康產(chǎn)生威脅。目前的研究主要集中于ARGs 的豐度和多樣性方面,而對于“土壤-蔬菜-人體”中的遷移機(jī)制和消減措施的研究仍需進(jìn)一步加強(qiáng)。因此,針對目前的研究現(xiàn)狀,未來土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 的研究應(yīng)關(guān)注以下3個方面:
(1)目前,對于ARGs 由土壤遷移至蔬菜內(nèi)部的研究有限,對蔬菜內(nèi)部ARGs的研究主要集中在豐度和多樣性上,缺乏對其在蔬菜生長過程中的動態(tài)變化監(jiān)測,尤其是在不同生長期內(nèi)ARGs含量的變化。未來應(yīng)建立標(biāo)準(zhǔn)的ARGs監(jiān)測方法,推動長期的土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs監(jiān)測體系的構(gòu)建。
(2)土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 遷移傳播過程極為復(fù)雜,涉及微生物菌群間的相互作用和環(huán)境因素,目前的研究主要集中在單一因素對ARGs遷移的影響,缺乏多因素互作的綜合研究。應(yīng)突破單因素的研究局限,采用綜合實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)來探討實(shí)際土壤-蔬菜系統(tǒng)中不同因素的共同作用對ARGs遷移的影響。
(3)為了有效遏制土壤-蔬菜系統(tǒng)中ARGs 的傳播和擴(kuò)散,應(yīng)研發(fā)具有針對性的多種技術(shù)融合創(chuàng)新消減技術(shù)。研究土壤微生物群落、動植物等對抑制ARGs 傳播的作用,優(yōu)化農(nóng)業(yè)種植模式和施肥制度,尋找強(qiáng)化ARGs 消減的新措施。此外,考慮到消減技術(shù)最終應(yīng)用于土壤環(huán)境中,建議結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)(如熒光定量PCR 技術(shù))加強(qiáng)對ARGs 消減過程的實(shí)時監(jiān)控和風(fēng)險評估。
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