趙志祥 王殿東 周亞林 王培 嚴(yán)婉榮 嚴(yán)蓓 羅路云 張卓
(1.海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全與標(biāo)準(zhǔn)研究中心,海南省植物病蟲(chóng)害防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海口 571100;2.長(zhǎng)江師范學(xué)院現(xiàn)代農(nóng)業(yè)與生物工程學(xué)院,重慶 408100;3.麻陽(yáng)縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局植保植檢站,懷化 419400;4.湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,園藝作物病蟲(chóng)害治理湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長(zhǎng)沙 410125;5.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,長(zhǎng)沙 410128)
辣椒(Capsicum annuum L.)是一種重要的蔬菜,在中國(guó)種植面積超過(guò)130萬(wàn)hm2。辣椒枯萎病是由尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)侵染引起,在許多國(guó)家均有發(fā)生[1-3],在我國(guó)陜西、甘肅、湖南等地相繼發(fā)生,發(fā)病率一般為15%-30%,嚴(yán)重時(shí)50%以上,甚至絕產(chǎn)[4]。化學(xué)防治是目前使用最多、最有效、最易讓人接受的防治方法。但是長(zhǎng)期大量使用單一化學(xué)藥劑,易誘導(dǎo)病菌產(chǎn)生抗藥性,并且對(duì)土壤生物群落造成較大的影響,導(dǎo)致土壤肥力下降[5-6]。因此減少或取代化學(xué)藥劑在防治辣椒枯萎病中的應(yīng)用,在降低健康危害、環(huán)境破壞和污染等方面顯得尤為迫切。根際是土壤、植物和微生物三者相互作用的生態(tài)環(huán)境[7],而根際微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)中最為活躍的組成部分,在植物生長(zhǎng)過(guò)程中起著重要作用,能把土壤中的有機(jī)物和一些難分解的物質(zhì)分解轉(zhuǎn)化,為植物生長(zhǎng)提供肥沃的土壤[8]。通過(guò)調(diào)控根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)抑制土壤病原菌,將逐步取代傳統(tǒng)的化學(xué)防治手段,具有較為廣闊的應(yīng)用前景。
利用生防細(xì)菌、真菌及放線(xiàn)菌等拮抗微生物的寄生、抗生作用,及其與病原菌的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、生態(tài)位的競(jìng)爭(zhēng)效應(yīng),抑制和消滅病原菌是防治辣椒枯萎病的有效措施之一。芽孢桿菌已被證明對(duì)尖孢鐮刀菌具有較強(qiáng)的拮抗作用,是重要的辣椒枯萎病生防細(xì)菌。本研究中拮抗細(xì)菌Ya-1,經(jīng)鑒定為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis),來(lái)源于海南五指山熱帶雨林土壤,對(duì)辣椒枯萎病菌具有較好的抑制效果。Xu等[9]發(fā)現(xiàn)解淀粉芽孢桿菌SQR9分泌的脂肽類(lèi)化合物芽孢菌霉素D對(duì)尖孢鐮刀菌等土傳病原生物具有較強(qiáng)的抑制活性。吳月等[10]報(bào)道芽孢桿菌或假單胞桿菌等對(duì)辣椒枯萎病菌有較好的抑制作用。郭珺等[11]報(bào)道芽孢桿菌pb-4能明顯抑制辣椒枯萎病菌孢子的萌發(fā)。Jamal等[12]研究發(fā)現(xiàn)施用B.amylliquefaciens Y1可以提高辣椒葉片的葉綠素含量,同時(shí)顯著提高土壤全氮、可培養(yǎng)細(xì)菌和產(chǎn)幾丁質(zhì)酶細(xì)菌的數(shù)量以及幾丁質(zhì)酶和脫氫酶的活性。Cao等[13]分離出高拮抗活性的芽孢桿菌菌株2株,B.velezensis Y6和F7,其對(duì)辣椒枯萎病菌和茄科青枯病菌在室內(nèi)和盆栽條件下均有較好的抑菌活性,其活性物質(zhì)Iturin對(duì)辣椒枯萎病菌具有持續(xù)的抑菌效果。Chowdhury等[14]發(fā)現(xiàn)芽孢桿菌LBF-01對(duì)辣椒尖孢鐮刀枯萎病菌有較好地抑菌活性,同時(shí)促進(jìn)辣椒生長(zhǎng),田間實(shí)驗(yàn)?zāi)芙档?.04倍的枯萎病發(fā)生率,減少50%的多菌靈使用,并能增加種子的萌發(fā)率。Ben等[15]研究發(fā)現(xiàn)枯草芽孢桿菌V26能溶解無(wú)機(jī)磷酸鹽、固氮,產(chǎn)生吲哚乙酸、鐵載體和水解酶,并對(duì)尖孢鐮刀菌具有較好的抑菌活性。
根據(jù)生態(tài)學(xué)原理,通過(guò)對(duì)辣椒根區(qū)土壤接種外來(lái)菌,調(diào)節(jié)植株根區(qū)的微生物群落結(jié)構(gòu),有可能從根本上控制辣椒枯萎病。枯草芽孢桿菌Ya-1作為辣椒枯萎病的生防微生物,其對(duì)罹病枯萎病辣椒根際土壤真菌群落的影響仍然未知。本研究以枯草芽孢桿菌Ya-1為材料,采用高通量測(cè)序技術(shù)重點(diǎn)研究接種生防菌對(duì)罹病辣椒根際土壤真菌群落結(jié)構(gòu)、關(guān)鍵種群的影響及動(dòng)態(tài)變化,從微生物角度為芽孢桿菌調(diào)控微生態(tài)環(huán)境來(lái)抑制辣椒枯萎病的新途徑提供理論依據(jù)。
試驗(yàn)地點(diǎn)位于海南省農(nóng)科院植物保護(hù)研究所,試驗(yàn)辣椒品種為‘乾隆一號(hào)’。供試病原菌為辣椒枯萎病菌鐮刀尖孢菌(Fusarium oxysporum f.sp.capsici),供試生防菌為枯草芽孢桿菌Ya-1(B.subtilis),來(lái)源于海南五指山熱帶雨林土壤,其具有廣譜抗性,對(duì)辣椒枯萎病菌有較好的抑制效果。
1.2.1 樣地概況和根際土壤采集 試驗(yàn)土壤采集自健康辣椒土壤,首先將采集的土壤經(jīng)過(guò)80目過(guò)篩后,再與營(yíng)養(yǎng)基質(zhì)8∶1比例混勻后裝盆。使用1%次氯酸鈉溶液對(duì)‘乾隆一號(hào)’感病辣椒種子表面消毒,無(wú)菌水沖洗3遍,將種子放置在帶有無(wú)菌濾紙的120 mm玻璃培養(yǎng)皿,加入無(wú)菌水使種子沒(méi)過(guò)濾紙片,保濕催芽5 d,待80%以上的種子露白后,播種到事先準(zhǔn)備好的盆中,每盆3顆。待辣椒苗長(zhǎng)出2片真葉時(shí),使用1 000倍液的腐殖酸澆灌,4-5 d/次,每次30 mL/盆,連續(xù)澆灌3次。保證辣椒苗長(zhǎng)勢(shì)均勻、茁壯。待苗長(zhǎng)到6葉1芯時(shí)開(kāi)始處理。
試驗(yàn)共設(shè)置4個(gè)處理,A: 100 mL無(wú)菌水浸根10 min后澆灌;B: 100 mL枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液(1×107CFU/mL)浸根10 min后澆灌;C: 100 mL辣椒枯萎病菌(F.oxysporum)孢子懸浮液(1×107CFU/mL)浸根10 min后澆灌;D:先接種100 mL枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液,24 h后接種100 mL F.oxysporum孢子懸浮液。分別于接種前、接種后10 d、接種后20 d采集土壤樣本,接種前因各盆處理均一致,因而隨機(jī)取5份樣本,每個(gè)處理設(shè)置5個(gè)重復(fù)。采集辣椒根放入裝有100 mL 0.05 mol/L磷酸緩沖液的250 mL錐形瓶中,晃動(dòng)錐形瓶充分清洗辣椒根系,13 000 r/min對(duì)洗脫液進(jìn)行離心,高速離心3 min。離心后棄上清,對(duì)沉淀土壤多次重復(fù)離心洗滌后,將土壤樣品收集至離心管,冷凍干燥[16]。冷凍干燥后將根際土壤放入-80℃冷凍箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 土壤總DNA提取、PCR擴(kuò)增和測(cè)序 每個(gè)土壤樣品稱(chēng)取0.5 g土樣,用FastDNA? Spin Kit for Soil試劑盒提取土壤總DNA。提取的土壤DNA用NanoDrop 2000測(cè)定總DNA濃度和純度。A260/A280值在1.8-2.0之間為合格。將合格樣品DNA進(jìn)行擴(kuò)增前基因組DNA濃度定量。定量后終濃度稀釋為30 ng/μL。以樣品DNA為模板,真菌DNA擴(kuò)增ITS2區(qū)引物序列:ITS3-2024F:GCATCGATGAAGAACGCAGC;ITS4-2409R:TCCTCCGCTTATTGATATGC[17]。對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行2% 瓊脂糖電泳,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用Qubit4.0熒光計(jì)進(jìn)行定量,然后將產(chǎn)物送至武漢天一華煜公司HiSeq平臺(tái)進(jìn)行PE250測(cè)序。
1.2.3 數(shù)據(jù)處理 原始下機(jī)數(shù)據(jù)的上游分析主要采用Mothur和usearch完成。其流程主要如下:對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控,將小于200 bp的序列進(jìn)行去除,剔除模糊堿基序列“N”和序列平均質(zhì)量Q值<20的低質(zhì)量序列,最終獲得effective tags。利用 Mothur軟件包對(duì) tag 序列進(jìn)行了去冗余處理,小于200 bp的序列被丟棄,從中挑選出 unique tag 序列。用 Uparse 軟件對(duì)所有樣品的全部 Effective Tags 序列聚類(lèi),默認(rèn)提供以97%的一致性將序列聚類(lèi)成為OTUs(Operational Taxonomic Units)[18]。使用RDP-Classifier軟件注釋時(shí),采用Fungal ITS(unite database 7.2 version)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)真菌OTU代表序列進(jìn)行序列注釋?zhuān)罱K得到OTU代表序列[19]。將OTU表抽平后獲得75 514條序列,計(jì)算α多樣性指數(shù)。使用R軟件中的Vegan包計(jì)算樣本間Bray-Cutis距離矩陣。采用主坐標(biāo)分析方法分析不同處理下各樣本微生物群落結(jié)構(gòu)差異。同時(shí),使用R軟件中的Vegan包進(jìn)行非參數(shù)多反應(yīng)置換法、相似性分析和非參數(shù)多變量置換法方差分析來(lái)鑒定兩組間的群落差異[20-21],對(duì)微生物種群進(jìn)行相關(guān)性分析。
1.2.4 土壤微生物共發(fā)生模式分析 使用抽平的OTU表,取相對(duì)豐度排名前500的OTU進(jìn)行土壤真菌微生物共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。利用分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)分析(MENA,http://ieg4.rccc.ou.edu/mena/login.cgi),基于Spearman秩相關(guān)矩陣構(gòu)建了真菌4個(gè)類(lèi)群的系統(tǒng)發(fā)育分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)(pMENs),只保留高于特定閾值(真菌:0.82)的相關(guān)性來(lái)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)特征值[22-24]。最后采用Gephi(https://gephi.org/)軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)的可視化操作,得到network網(wǎng)絡(luò)圖,并在Gephi軟件里面進(jìn)行模塊化分析。
1.2.5 辣椒枯萎病發(fā)病率和防治效果 按照參考文獻(xiàn)[25]發(fā)病情況,并計(jì)算辣椒枯萎病發(fā)病率以及相對(duì)防效。統(tǒng)計(jì)方法如下:
辣椒枯萎病的發(fā)病率和病害指數(shù)結(jié)果見(jiàn)表1。結(jié)果表明,單獨(dú)接種病原菌FOC處理(C)第10天和第20天的發(fā)病率分別為32.08%和45.83%,而接種Ya-1+FOC處理(D)的發(fā)病率分別為7.08%和10.42%。接種Ya-1+FOC處理(D)與單獨(dú)接種病原菌FOC處理(C)在第10天和第20天的發(fā)病率差異極顯著(P< 0.01,表1),前者比后者發(fā)病率分別降低了25%和35.41%。另CK處理(A)和單獨(dú)接種Ya-1處理(B)在第10和第20天時(shí)未見(jiàn)發(fā)病植株,僅有少量自然枯死植株(莖基部不變褐色),因而不做防治效果統(tǒng)計(jì)。與單獨(dú)接種病原菌FOC處理(C)相比,接種Ya-1+FOC處理(D)在第10和第20天的相對(duì)防治效果分別為77.93%和77.26%。
表1 拮抗菌Ya-1在不同時(shí)間點(diǎn)辣椒枯萎病發(fā)病率和防治效果Table 1 Incidence rate and control effect of pepper Fusarium wilt with antagonist Ya-1 at different time points
測(cè)序共獲得4 639 049條OTU,每個(gè)樣品OTU數(shù)在75 514和149 265之間。經(jīng)過(guò)抽平后所有OTU條數(shù)為75 514。對(duì)不同處理組和對(duì)照組在不同時(shí)間點(diǎn)的辣椒根際真菌群落進(jìn)行α多樣性分析,結(jié)果如表2。辣椒根際土壤真菌群落的α多樣性指數(shù)(Shannon指數(shù))和豐富度指數(shù)(Chao1)呈不同的變化趨勢(shì)(表2)。接種枯草芽孢桿菌Ya-1組(B)和對(duì)照(A)真菌shannon指數(shù)均先升高后降低,接種辣椒枯萎病菌(C)組先降低后升高,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組(D)真菌Shannon指數(shù)逐漸降低。10 d時(shí)接種辣椒枯萎病菌組Shannon指數(shù)顯著低于對(duì)照,接種枯草芽孢桿菌Ya-1組、同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組與對(duì)照無(wú)顯著差異,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組Shannon指數(shù)顯著高于接種辣椒枯萎病菌組;20 d時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1組、接種辣椒枯萎病菌、同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組Shannon指數(shù)均與對(duì)照無(wú)顯著差異,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組與接種辣椒枯萎病菌組Shannon指數(shù)之間也無(wú)顯著差異。
忽然,十六師第四十六團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)謝士炎電話(huà)報(bào)告,守西門(mén)的連長(zhǎng)報(bào)告,信安江上游浮來(lái)一個(gè)老百姓,說(shuō)有事要見(jiàn)師長(zhǎng)。
表2 辣椒根際真菌α多樣性指數(shù)Table 2 Fungal α diversity indices around pepper rhizosphere soil
接種枯草芽孢桿菌Ya-1組(B)和對(duì)照(A)真菌Chao1值均先升高后降低,接種辣椒枯萎病菌(C)組以及同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組(D)真菌Chao1值均逐漸升高。10 d時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1組、接種辣椒枯萎病菌、同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組Chao1值均與對(duì)照無(wú)顯著差異,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組與接種辣椒枯萎病菌組Chao1值之間也無(wú)顯著差異;20 d時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1組Chao1值均與對(duì)照無(wú)顯著差異,接種辣椒枯萎病菌、同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組Chao1值顯著高于對(duì)照,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組Chao1值顯著高于接種辣椒枯萎病菌組。
在門(mén)分類(lèi)水平上,子囊菌門(mén)(Ascomycota)、捕蟲(chóng)霉門(mén)(Zoopagomycota)和擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)在每個(gè)接種時(shí)間點(diǎn)處理組和對(duì)照組土壤樣品中均占據(jù)真菌群落的優(yōu)勢(shì)地位,其相對(duì)豐度在36.58%-74.11%,如圖1。其中子囊菌門(mén)(Ascomycota)在所有處理中均屬于優(yōu)勢(shì)菌群(相對(duì)豐度>4%)。在第10天時(shí),子囊菌門(mén)(Ascomycota)在對(duì)照組土壤樣品中的相對(duì)豐度最低,在接種辣椒枯萎病菌組土壤樣品中相對(duì)豐度最高(28.79%,66.53%);20 d時(shí),子囊菌門(mén)(Ascomycota)在接種枯草芽孢桿菌Ya-1組土壤樣品中的相對(duì)豐度最低,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌處理土壤樣品中相對(duì)豐度最高(26.03%,60.39%)。在10 d時(shí),捕蟲(chóng)霉門(mén)(Zoopagomycota)在接種辣椒枯萎病菌組土壤樣品中相對(duì)豐度最低,接種枯草芽孢桿菌Ya-1組處理土壤樣品中相對(duì)豐度最高(3.71%,10.09%);20 d時(shí),捕蟲(chóng)霉門(mén)(Zoopagomycota)在同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌組相對(duì)豐度最低,對(duì)照組土壤樣品中的相對(duì)豐度最高(2.40%,10.70%)。在10 d時(shí),擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)在接種病原菌處理土壤樣品中相對(duì)豐度最低,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌組土壤樣品中相對(duì)豐度最高(2.98%,4.31%);20 d時(shí),擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)在接種辣椒枯萎病菌組土壤樣品中相對(duì)豐度最低,接種枯草芽孢桿菌Ya-1處理土壤樣品中相對(duì)豐度最高(5.09%,6.20%)。
圖1 門(mén)分類(lèi)水平上辣椒根際土壤真菌優(yōu)勢(shì)種群Fig.1 Dominant fungal population of pepper rhizosphere soil at phylum level
進(jìn)一步將接種后10 d和20 d的top10真菌屬進(jìn)行了組間差異分析,發(fā)現(xiàn)不同處理之間優(yōu)勢(shì)菌屬群落發(fā)生顯著變化(圖2)。在10 d時(shí),與對(duì)照相比,接種枯草芽孢桿菌Ya-1處理土壤樣品中被孢霉菌(Mortierella)的相對(duì)豐度顯著升高(P<0.05),Boothiomyces、周刺座霉屬(Volutella)的相對(duì)豐度顯著降低(P<0.05);接種辣椒枯萎病原菌處理土壤樣品中鐮刀霉(Fusarium)、木霉屬(Trichoderma)的相對(duì)豐度顯著升高(P<0.05),Boothiomyces、周刺座霉屬(Volutella)的相對(duì)豐度顯著降低(P<0.05);其他組對(duì)比均無(wú)顯著差異。與接種辣椒枯萎病原菌處理相比,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌處理土壤樣品中Fusarium的相對(duì)豐度顯著降低(P<0.05),被孢霉菌(Mortierella)的相對(duì)豐度升高,但差異不顯著。在20 d時(shí),與對(duì)照相比,接種枯草芽孢桿菌Ya-1處理土壤樣品中top10屬在兩者之間無(wú)顯著差異;接種辣椒枯萎病原菌處理土壤樣品中鐮刀菌屬(Fusarium)、木霉菌屬(Trichoderma)的相對(duì)豐度顯著升高(P<0.05);其他組對(duì)比均無(wú)顯著差異。與接種辣椒枯萎病原菌處理相比,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌處理土壤樣品中的被孢霉菌(Mortierella)的相對(duì)豐度顯著升高(P<0.05)。
圖2 辣椒接種10 d和20 d相對(duì)豐度最高的10個(gè)真菌屬Fig.2 Top 10 fungi genera with the highest relative abundance at 10 d and 20 d
對(duì)篩選的相對(duì)豐度為1%以上的OTU進(jìn)行鑒定分析,OTU_1經(jīng)過(guò)NCBI鑒定為病原菌F.oxysporum,其序列與接種病原菌序列相似度在97%以上,在不同處理相對(duì)豐度如圖3。在10 d和20 d同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌處理土壤樣品中OTU_1相對(duì)豐度顯著高于接種辣椒枯萎病原菌處理(P < 0.05);同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌處理土壤樣品在10 d時(shí)相對(duì)豐度顯著高于20 d。
圖3 OTU_1總相對(duì)豐度Fig. 3 Total relative abundance of OTU_1
利用基于 Bray_Curtis距離算法 PCoA 分析對(duì)辣椒根際土壤真菌群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果表明,接種不同時(shí)間點(diǎn)土壤真菌的群落結(jié)構(gòu)存在差異,PCoA1和PCoA2共解釋了29.7%的變異,其中第一軸和第二軸分別解釋了22.8%和6.9%的變異(圖4)?;?Bray_curtis 算法的相似性分析(ANOSIM)結(jié)果,0 d與10 d、20 d根際土壤真菌群落結(jié)構(gòu)間具有顯著差異(R=0.3198,P=0.001;R=0.2697,P=0.031),10 d和20 d之間差異不顯著(R=0.0281,P=0.143)(表3)?;贐ray_curtis 算法的非參數(shù)多元統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)(MRPP和PERMANOVA)與上述結(jié)果一致。
圖4 辣椒不同時(shí)期不同處理根際間真菌群落主坐標(biāo)分析Fig.4 PCoA analysis of fungal community in pepper rhizosphere at different time points under different treatments
表3 不同時(shí)期兩組間辣椒根際真菌群落相異性分析Table 3 Dissimilarity test of pepper rhizosphere soil fungal community between two groups at different time points
基于 Bray_curtis 算法的相似性分析(ANOSIM)可知,在10 d時(shí),接種枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液處理、接種辣椒枯萎病菌處理和同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液和辣椒枯萎病菌處理與對(duì)照處理的根際真菌群落結(jié)構(gòu)差異顯著(R=0.432,P=0.011;R=1,P=0.009;R=0.996,P=0.015);接種辣椒枯萎病菌處理和同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液和辣椒枯萎病菌處理根際真菌群落結(jié)構(gòu)也具有顯著差異(R=1,P=0.006)。在20 d時(shí),接種枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液處理、接種辣椒枯萎病菌處理、同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1發(fā)酵液與辣椒枯萎病菌處理與對(duì)照處理的根際真菌群落結(jié)構(gòu)差異顯著(R=0.256,P=0.029;R=0.528,P=0.01;R=0.684,P=0.01)。接種辣椒枯萎病菌處理和同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌處理根際真菌群落結(jié)構(gòu)也具有顯著差異(R=0.604,P=0.007)。此外,基于Bray_curtis 算法的非參數(shù)多元統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)(MRPP和PERMANOVA)進(jìn)一步表明驗(yàn)證了上述處理之間的差異(表4)。
表4 不同時(shí)間點(diǎn)不同處理間辣椒根際真菌群落相異性分析Table 4 Dissimilarity analysis of pepper rhizosphere soil fungal community at different time points among different treatments
基于不同時(shí)期土壤樣品500個(gè)OTU進(jìn)行分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,采用快速模塊化優(yōu)化方法對(duì)模塊進(jìn)行識(shí)別,構(gòu)建的真菌群落系統(tǒng)發(fā)育分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)(pMENs)顯示了OTUs之間的相互作用(表5,圖5)。處理組和對(duì)照組的節(jié)點(diǎn)和連接數(shù)分別為:A(290,443)、B(292,416)、C(311,406)和D(309,346)。其中,對(duì)照組土壤樣品擁有最少的節(jié)點(diǎn)數(shù)和最多的連接數(shù)。4個(gè)處理的真菌網(wǎng)絡(luò)均以正相關(guān)關(guān)系為主(A:77.20%,B:60.10%,C:61.58%,D:54.05%),相比較對(duì)照,其他三組的正連接比例更低;相比較接種辣椒枯萎病菌處理,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病原菌處理的正連接比例更低。接種枯草芽孢桿菌Ya-1和接種辣椒枯萎病菌處理的平均度低于對(duì)照;同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病原菌處理的平均度低于接種辣椒枯萎病菌處理。
表5 不同處理下真菌種群的經(jīng)驗(yàn)網(wǎng)絡(luò)和隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)性質(zhì)Table 5 Empirical network and random network properties of fungal populations under different treatments
同時(shí)分析4個(gè)處理的經(jīng)驗(yàn)網(wǎng)絡(luò),相比較對(duì)照,接種枯草芽孢桿菌Ya-1和接種辣椒枯萎病菌處理的平均路徑距離、平均聚類(lèi)系數(shù)和模塊化值更高;相比較接種辣椒枯萎病菌處理,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病原菌處理的平均聚類(lèi)系數(shù)更低,平均路徑距離和模塊化值更高(表5)。對(duì)隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,相比較對(duì)照,接種枯草芽孢桿菌Ya-1組和接種辣椒枯萎病菌處理的平均聚類(lèi)系數(shù)更低,平均路徑距離和模塊化值更高;相比較接種辣椒枯萎病菌處理,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病原菌處理的平均聚類(lèi)系數(shù)更低,平均路徑距離、模塊化值更高(表5)。
辣椒枯萎病是由尖孢鐮刀菌侵染引起的一類(lèi)頑固性土傳病害,梁建根等[26]研究表明,生防菌株B-3枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis的發(fā)酵液及其濾液對(duì)辣椒枯萎病的盆栽與大田試驗(yàn)的防效分別為73.6%和64.8%,顯著優(yōu)于100 mg/L多菌靈,對(duì)辣椒枯萎病菌均表現(xiàn)出較好的抑制作用。郭珺等[11]發(fā)現(xiàn)芽孢桿菌Pb-4菌株對(duì)辣椒、番茄、黃瓜枯萎病及辣椒疫霉病等具有較好的防效。本研究中與單獨(dú)接種辣椒枯萎病菌的處理(C)相比,復(fù)合接種的Ya-1+FOC處理(D)在10 d和20 d的防治效果分別為77.93%和77.26%(表1),表明枯草芽孢桿菌Ya-1 對(duì)辣椒枯萎病同樣具有較好的防治效果。其盆栽防效甚至高于梁建根等[26]對(duì)生防枯草芽孢桿菌B-3的報(bào)道。究其因可能與不同來(lái)源的菌株活性差異、對(duì)周?chē)锖头巧锃h(huán)境等的影響,尤其是土壤微生物組的影響有關(guān)。
土壤微生物組在調(diào)控植物生長(zhǎng)、抗逆、抗病等方面起重要作用,微生物組受植物種類(lèi)以及植物生長(zhǎng)狀態(tài)影響[27-28]。受到生物和非生物脅迫后,植物可通過(guò)調(diào)整根際微生物組而緩解脅迫所造成的危害[29]。本研究中,接種枯草芽孢桿菌Ya-1處理組和對(duì)照真菌香農(nóng)指數(shù)均先升高后降低,而接種辣椒枯萎病菌組先降低后升高,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組真菌香農(nóng)指數(shù)均逐漸降低,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病菌組真菌α多樣性在10 d和20 d時(shí)真菌香農(nóng)指數(shù)均高于接種辣椒枯萎病菌組,該結(jié)果表明單獨(dú)接種枯草芽孢桿菌Ya-1處理對(duì)真菌α多樣性指數(shù)的影響較小,在接種辣椒枯萎病菌后同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1能有效降低根際真菌α多樣性。
核心微生物組是影響植物生長(zhǎng)、穩(wěn)定微生物組的關(guān)鍵組成,只有改變核心微生物組,才能徹底改變根際微生物組的群落結(jié)構(gòu)[27]。芽孢桿菌作為一類(lèi)有益微生物菌群,可以產(chǎn)生多種抑菌活性物質(zhì),抑制病原菌的生長(zhǎng),提高植物的抗病能力,有些芽孢桿菌具有解磷、固氮和產(chǎn)生植物激素的能力,通過(guò)改變微生物組的結(jié)構(gòu)可影響植物的生長(zhǎng)和抗逆性[11,13,15]。Qiao等[30]研究發(fā)現(xiàn),外源施用生防枯草芽孢桿菌可以短暫改變番茄根際微生物組。樊祖清等[31]研究表明,施用解淀粉芽孢桿菌菌劑改善了煙田土壤微生物結(jié)構(gòu),增加了有益菌數(shù)量,尤其是鞘氨醇單胞菌屬的數(shù)量,促進(jìn)煙株吸收根際土壤營(yíng)養(yǎng)、釋放根際分泌物。本研究發(fā)現(xiàn)相比較接種辣椒枯萎病菌組,同時(shí)接種辣椒枯萎病菌和枯草芽孢桿菌Ya-1組中被孢霉屬相對(duì)豐度均升高,而被孢霉屬其中一些有益菌可能與植物形成共生關(guān)系[32-33],對(duì)于改善土壤性質(zhì)、促進(jìn)植物的生長(zhǎng)起一定的作用,該結(jié)果表明在辣椒枯萎病發(fā)病后添加枯草芽孢桿菌Ya-1后提高了土壤中有益菌數(shù)量。本研究在辣椒枯萎病病原菌Fusarium oxysporum和生防菌枯草芽孢桿菌Ya-1處理 10 d和20 d 后分析了辣椒根際土壤真菌群落結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)接種外源菌株處理后對(duì)根際微生物的結(jié)構(gòu)影響較大。通過(guò)基于Bray-Curtis距離對(duì)不同處理的辣椒根際土壤真菌群落組成進(jìn)行PCoA分析,發(fā)現(xiàn)接種前處理和接種10 d、20 d處理真菌群落組成距離較遠(yuǎn),接種10 d、20 d相聚較近,同時(shí)相異性分析也展示相同的結(jié)果,該結(jié)果表明在進(jìn)行處理后真菌群落組成發(fā)生了顯著變化,但是接種10 d、20 d樣品整體差異較小。分別比較接種10 d和20 d處理組和對(duì)照組真菌群落,同一時(shí)間點(diǎn)處理組和對(duì)照組真菌群落具有顯著差異,接種辣椒枯萎病菌組和同時(shí)接種辣椒枯萎病菌和枯草芽孢桿菌Ya-1組也具有顯著差異,該結(jié)果表明接種辣椒枯萎病菌組和枯草芽孢桿菌Ya-1均能改變辣椒根際真菌群落,而在接種辣椒枯萎病原菌后接種枯草芽孢桿菌Ya-1也改變了接種辣椒枯萎病菌組辣椒根際真菌群落。
對(duì)不同處理根際土壤真菌群落結(jié)果分析表明,在該試驗(yàn)中,各處理土壤優(yōu)勢(shì)種群分別為子囊菌門(mén)(Ascomycota)、接合菌門(mén)(Zygomycota)、擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)。與單接辣椒枯萎病菌相比,同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和病原菌在10 d時(shí)均提高了捕蟲(chóng)霉門(mén)(Zoopagomycota)和擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)的相對(duì)豐度,降低了子囊菌門(mén)(Ascomycota)的相對(duì)豐度;在20 d時(shí),提高了子囊菌門(mén)(Ascomycota)和擔(dān)子菌門(mén)(Basidiomycota)的相對(duì)豐度,降低了捕蟲(chóng)霉門(mén)(Zoopagomycota)的相對(duì)豐度。子囊菌門(mén)是主要優(yōu)勢(shì)菌門(mén),有研究表明子囊菌門(mén)引起植物病害,多引起根腐、莖腐、果(穗)腐、枝枯和葉斑等癥狀[34],在該試驗(yàn)中不同處理子囊菌門(mén)相對(duì)豐度為26.03%-66.53%,占主導(dǎo)地位。擔(dān)子菌多為土壤腐生真菌, 在土壤木質(zhì)素含量較高的環(huán)境中為優(yōu)勢(shì)菌, 是復(fù)雜化合物及有機(jī)質(zhì)的重要分解者,在養(yǎng)分循環(huán)中擔(dān)任著重要角色[35-36]。擔(dān)子菌可高效分解木質(zhì)化植被碎屑,其滑銹傘屬(Hebeloma)、絲膜菌屬(Cortinarius)可與植物共生形成菌根,增強(qiáng)植株抗性[37-38]。
尖孢鐮刀菌是最重要的植物病原真菌之一,可引起多種植物發(fā)生病害[39-41],同時(shí)也是引發(fā)辣椒枯萎病的病原菌。本研究中,相比較對(duì)照(A),接種辣椒枯萎病菌處理(C)后連接數(shù)減少,而在加入枯草芽孢桿菌Ya-1處理后,節(jié)點(diǎn)數(shù)變化較小,但是正連接數(shù)降低,表明同時(shí)接種枯草芽孢桿菌Ya-1和辣椒枯萎病原菌處理(D)降低了真菌群落的復(fù)雜度。同時(shí)在10 d和20 d,OTU_1(NCBI鑒定為本實(shí)驗(yàn)接種病原菌菌F.oxysporum)相對(duì)豐度在接種辣椒枯萎病原菌組和同時(shí)接種辣椒枯萎病菌組和枯草芽孢桿菌Ya-1組間具有顯著差異,相比較接種辣椒枯萎病原菌組,OTU_1相對(duì)豐度在10 d和20 d時(shí)分別降低了19.03%和6.99%,該結(jié)果表明同時(shí)在接種辣椒枯萎病菌組后接種枯草芽孢桿菌Ya-1顯著降低了根際土壤中病原菌F.oxysporum的相對(duì)豐度,并且在10 d時(shí)效果更加顯著。表明施枯草芽孢桿菌菌劑后有益真菌比例增加,病原菌比例減少,驅(qū)動(dòng)了真菌群落的生態(tài)演替,降低了真菌群落多樣性,進(jìn)而導(dǎo)致土壤中鐮刀菌豐度顯著下降,有效防控辣椒枯萎病發(fā)生。
枯草芽孢桿菌Ya-1處理對(duì)辣椒枯萎病有較好的防治效果,同時(shí)它也改變了接種病原菌辣椒根際真菌群落多樣性和結(jié)構(gòu),降低了真菌群落的復(fù)雜度和根際土壤中病原菌的豐度。