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    辣椒響應(yīng)熱脅迫機制的研究進(jìn)展

    2023-09-12 05:04:20張蓓任福森趙洋郭志偉孫強劉賀娟甄俊琦王童童程相杰
    生物技術(shù)通報 2023年7期
    關(guān)鍵詞:耐熱性耐受性組學(xué)

    張蓓 任福森 趙洋 郭志偉 孫強 劉賀娟 甄俊琦 王童童 程相杰

    (新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)科學(xué)院,新鄉(xiāng) 453000)

    辣椒(Capsicumspp.)隸屬茄科(Solanaceae)辣椒屬(Capsicum),是世界第二大食用蔬菜,含有許多人類必需營養(yǎng)物質(zhì),尤其是維生素C、β-胡蘿卜素和鈣。其中,維生素C含量可達(dá)125 mg/100 g鮮辣椒,在所有蔬菜中含量最高[1]。同時,辣椒是一種重要的調(diào)味品,還具有重要的藥用價值和工業(yè)用途[2]。我國是世界上辣椒種植面積最大的國家[3],辣椒每年產(chǎn)生的經(jīng)濟(jì)效益居蔬菜之首。隨著全球氣溫不斷升高,熱脅迫已經(jīng)成為世界范圍內(nèi)重要的農(nóng)業(yè)問題。持續(xù)的高溫會引起細(xì)胞損傷,包括蛋白質(zhì)的錯誤折疊和聚集、細(xì)胞膜損傷、微管組織的破壞和活性氧(reactive oxygen species, ROS)的積累,最終導(dǎo)致植物的生長發(fā)育受阻[4-5]。眾所周知,辣椒在溫暖的地方生長良好,但對高溫敏感。近些年,辣椒設(shè)施栽培面積不斷增加,然而,夏季設(shè)施內(nèi)溫度高,當(dāng)環(huán)境溫度超過32℃[6]時,辣椒就會遭受熱脅迫,嚴(yán)重影響授粉和產(chǎn)量。

    近些年,隨著生物技術(shù)和生物信息學(xué)的不斷發(fā)展,植物響應(yīng)熱脅迫機制的研究有了很大的進(jìn)展。目前,雖然辣椒在響應(yīng)熱脅迫方面的研究與擬南芥等模式植物相比還有很大差距,但一些相對前沿的生物技術(shù)已經(jīng)被用于辣椒應(yīng)答熱脅迫機制的研究中。如Wang等[7]基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)對辣椒在熱脅迫條件下的反應(yīng)進(jìn)行聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn),谷胱甘肽代謝途徑在辣椒對HS的反應(yīng)中起著關(guān)鍵作用。本文從生理生化機制、分子機制、組學(xué)機制的角度闡述了辣椒響應(yīng)熱脅迫機制的研究現(xiàn)狀,旨在推動解析辣椒的耐熱機制和耐熱品種選育進(jìn)程。

    1 響應(yīng)熱脅迫的生理生化機制

    1.1 植物激素對熱脅迫的響應(yīng)

    植物激素與熱脅迫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān)[8-9]。外源噴施適宜濃度的水楊酸(SA)可以通過激活抗氧化防御系統(tǒng)、協(xié)調(diào)滲透調(diào)節(jié)和保持光合作用效率,來有效提高觀賞辣椒種子和幼苗的耐熱性,并顯著改善熱脅迫效應(yīng)[10]。噴施SA和2,4-表油菜素內(nèi)酯(2,4-epibrassinolide, EBR)溶液可以通過提高生長參數(shù)、光合效率、膜熱穩(wěn)定性、花粉活力和高溫下的坐果率來緩解熱脅迫,提高甜椒對高溫的耐受性[11]。高溫下,生長素(indoleacetic acid, IAA)處理能減少脂質(zhì)過氧化、降低花梗中的纖維素酶活性,從而增加辣椒植株的花粉活力和坐果率,減輕植株受熱害的程度[12]。MeJA參與關(guān)鍵的植物發(fā)育過程,并與賦予園藝植物耐熱性有關(guān)[13]。有研究表明,MeJA對辣椒熱脅迫的改善作用明顯受到品種的影響[14]。熱脅迫條件下,向葉面噴施適宜濃度的6-BA,能夠提高抗氧化酶的活性并有利于光能的捕獲與轉(zhuǎn)換,從而有效緩解熱脅迫傷害,維持甜椒幼苗的正常生長[15]??梢?,植物激素主要通過激活抗氧化防御系統(tǒng)、保持光合作用效率以及穩(wěn)定滲透調(diào)節(jié)來改善辣椒熱激效應(yīng)。然而,目前用植物激素緩解辣椒熱脅迫的研究僅停留在生理應(yīng)答方面,并沒有發(fā)現(xiàn)基因?qū)χ参锛に貞?yīng)答的報道,因此,后續(xù)可以進(jìn)一步研究某個基因?qū)χ参锛に氐膽?yīng)答機理。

    1.2 抗氧化系統(tǒng)對熱脅迫的響應(yīng)

    常溫條件下,植物體內(nèi)ROS的產(chǎn)生和清除處于動態(tài)平衡。植物遭遇熱脅迫后,會造成細(xì)胞內(nèi)ROS和超氧化物自由基的積累,引起細(xì)胞結(jié)構(gòu)物質(zhì)氧化損傷。熱脅迫下,超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)、過氧化物酶(peroxidase, POD)和過氧化氫酶(catalase, CAT)的活性會改變以降低膜脂過度氧化程度,從而減輕高溫的傷害[5,16]。為了抵御熱脅迫,與熱敏型辣椒相比,耐熱型積累了更多的蛋白質(zhì)和脯氨酸,表現(xiàn)出更高的SOD和POD等抗氧化酶活性[17-18]。酶類和非酶類抗氧化物質(zhì)的積累有助于緩解熱脅迫導(dǎo)致的過氧化損傷,耐熱辣椒材料17CL30 中抗氧化物質(zhì)的含量明顯高于熱敏材料05S180[19]。熱脅迫對辣椒的酶保護(hù)系統(tǒng)、滲透系統(tǒng)、細(xì)胞膜系統(tǒng)等均有不同程度的損傷,可見,清除熱脅迫下辣椒體內(nèi)過量的ROS涉及一個復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控,其機制有待進(jìn)一步研究。

    1.3 生物膜系統(tǒng)對熱脅迫的響應(yīng)

    高溫可以通過涉及脂質(zhì)組成變化和脂質(zhì)與特定膜蛋白之間相互作用的整體效應(yīng),直接有效地改變細(xì)胞膜的流動性和滲透性。丙二醛(malondialdehyde, MDA)的積累對細(xì)胞具有毒害作用,常用其含量來衡量植物細(xì)胞膜脂過氧化作用[20-21]。遭遇熱脅迫后辣椒耐熱品系和熱敏品系細(xì)胞內(nèi)MDA的含量也都增加,但其含量與辣椒植株的耐熱性呈負(fù)相關(guān),常被作為篩選耐熱性植物的重要指標(biāo)[18,22]。可見,與其他植物一樣,隨著辣椒遭受熱脅迫時間的延長,細(xì)胞膜系統(tǒng)被破壞,進(jìn)而細(xì)胞膜通透性增加,膜脂過度氧化,MAD含量升高。

    1.4 其他物質(zhì)和代謝產(chǎn)物對熱脅迫的響應(yīng)

    可溶性糖、脯氨酸(Pro)、鈣離子、可溶性蛋白、可溶性酚類等滲透調(diào)節(jié)物質(zhì),可以通過調(diào)節(jié)細(xì)胞滲透勢,使植物細(xì)胞維持一定的膨壓,從而抵抗高溫的影響[23-24]。在正常條件下,植物體內(nèi)Pro的含量很低,熱脅迫后其含量大幅度增加以提高植物的耐熱性,且辣椒耐熱品系Pro增幅大于熱敏品系,抵抗熱脅迫的能力更強[18,25]。高溫下穩(wěn)定的光合速率和較高的Pro含量可以使耐熱辣椒植株更快地從熱害中恢復(fù),從而獲得穩(wěn)定的坐果率和坐果數(shù),繼而獲得高產(chǎn)[26]。對辣椒的研究表明,外源Ca2+處理可以使幼苗葉片ROS清除酶活性和滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)含量得到提高,并減輕熱脅迫對細(xì)胞膜的傷害和對葉片中谷胱甘肽(glutathione, GSH)和抗壞血酸(ascorbic acid, ASA)的破壞[27-28]。除上述滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)外,1-甲基環(huán)丙烯[29]、硒[30]、沼液肥[31]等也能減輕高溫對辣椒的傷害。另外,檸檬酸作為三羧酸循環(huán)的關(guān)鍵,是許多相互關(guān)聯(lián)的代謝網(wǎng)絡(luò)的核心,其與辣椒耐熱性的關(guān)系尚不明確,需要進(jìn)一步研究。

    2 響應(yīng)熱脅迫的分子機制

    2.1 熱脅迫轉(zhuǎn)錄因子

    2.1.1 熱激轉(zhuǎn)錄因子 熱激轉(zhuǎn)錄因子(heat shock factors, HSFs)作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的重要調(diào)控因子,通過調(diào)控?zé)峒さ鞍祝╤eat shock proteins, HSPs)等脅迫響應(yīng)基因的表達(dá),在植物響應(yīng)多種非生物脅迫中發(fā)揮重要作用[32]。從辣椒CM334基因組中共鑒定25個辣椒CaHSF基因,在耐熱品系R9葉片中,22個基因表達(dá)上調(diào),2個基因表達(dá)下調(diào),1個基因沒有明顯變化;而在熱敏品系B6葉片中,只有13個基因表達(dá)上調(diào),10個基因表達(dá)穩(wěn)定。CaHSFA2受熱脅迫誘導(dǎo),能增強轉(zhuǎn)基因植株的基礎(chǔ)耐熱性和獲得耐熱性,其中,N-端片段(CaHSFA2△N)也能增強轉(zhuǎn)基因植株耐熱性,但弱于CaHSFA2。此外,CaHSFA2與CaHSP70-2和CaHSP24.2之間存在相互調(diào)節(jié)關(guān)系[6,33-34]。CaHSFA1d是辣椒耐熱性的正調(diào)節(jié)因子,且在耐熱辣椒品系R9中的表達(dá)比在熱敏感辣椒品系B6中更敏感。CaHSFA1d維持了熱脅迫下H2O2的動態(tài)平衡,提高了轉(zhuǎn)基因株系中HSFs、HSPs和抗氧化基因AtGSTU5的表達(dá)。這表明CaHSFA1d通過調(diào)節(jié)脅迫和抗氧化相關(guān)基因的表達(dá)來提高植物的耐熱性[35]。CaHSFB2a通過CaWRKY6和CaWRKY40參與的轉(zhuǎn)錄級聯(lián)和正反饋環(huán)路正調(diào)控植物對RSI的免疫和對高溫高濕(HTHH)的耐受[36]。CaHSFA5沉默植株對熱脅迫更加敏感,且CaHSFA5的沉默阻斷了HTS對CaHSP24和CaHSP70表達(dá)的誘導(dǎo);HTS顯著增強了CaNAC2c與CaHSFA5啟動子片段的結(jié)合,當(dāng)CaNAC2c在HTS攻擊的辣椒植株中沉默時,CaHSFA5表達(dá)水平降低,并能被CaNAC2c的瞬時過表達(dá)上調(diào)。表明CaHSFA5在耐熱性中發(fā)揮正調(diào)控作用,并且CaHSFA5在熱脅迫時由CaNAC2c直接和正向調(diào)控[37]??梢?,與擬南芥、水稻、番茄等植物相比,目前辣椒HSFs的研究還很薄弱,尤其是B類HSFs,并且有研究報道B類HSFs具有共激活和抑制兩種功能,在不同植物中的表達(dá)特性不同,因此,要弄清辣椒HSFs應(yīng)答熱脅迫的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)需進(jìn)一步深入研究。

    2.1.2 其他類轉(zhuǎn)錄因子 除熱激轉(zhuǎn)錄因子外,植物體內(nèi)還有一些轉(zhuǎn)錄因子家族也部分參與熱脅迫應(yīng)答,如WRKY轉(zhuǎn)錄因子、NAC轉(zhuǎn)錄因子和堿性亮氨酸拉鏈bZIP(basic leucine zipper)等,這些轉(zhuǎn)錄因子的異位表達(dá)或抑制可能激活多種耐熱機制[38]。

    WRKY基因家族是高等植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,通過調(diào)節(jié)植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,在植物響應(yīng)各種脅迫中具有重要的生物學(xué)功能和作用機制。有研究表明,CaWRKY17、CaWRKY6和CaWRKY40都是RSI抗性和HTHH耐受性的正調(diào)控因子,但其調(diào)控方式不同。CaWRKY40的表達(dá)受SA、JA和ET調(diào)控,進(jìn)而調(diào)控下游防御和耐熱性相關(guān)基因的表達(dá),參與青枯菌侵染和高溫響應(yīng)調(diào)控途徑。CaWRKY6調(diào)控RSI抗性和HTHH耐受性,部分是通過激活CaWRKY40來實現(xiàn)的,而CaWRKY17與CaWRKY40在細(xì)胞核互作并在辣椒HTHH耐受性以及RSI抗性中起協(xié)同作用[39-41]。CaWRKY27過表達(dá)降低了煙草和擬南芥的基礎(chǔ)耐熱性,同時伴隨著多個耐熱性相關(guān)基因的表達(dá)降低。沉默CaWRKY27提高了辣椒植株的基礎(chǔ)耐熱性,降低了辣椒葉片中H2O2的積累。熱脅迫條件下,CaWRKY27沉默的辣椒植株中編碼ROS清除酶的多個基因,如CaCAT1、CaAPX1、CaAPX2、CaCSD2和CaSOD1的表達(dá)量顯著升高。因此,辣椒CaWRKY27通過H2O2信號負(fù)調(diào)控基礎(chǔ)耐熱性[42]。CaWRKY27b被CaCDPK29磷酸化,并在辣椒響應(yīng)RSI和HTHH的過程中充當(dāng)CaWRKY40的轉(zhuǎn)錄激活因子[43]。CaWRKY20正調(diào)控RSI抗性和高溫耐受性,瞬時過表達(dá)CaWRKY20能夠顯著引起細(xì)胞死亡和H2O2的積累,并誘導(dǎo)免疫相關(guān)標(biāo)記基因CaNPR1、CaDEF1和CaACO及耐熱性相關(guān)標(biāo)記基因CaHSFA2和CaHSP24的表達(dá)上調(diào)[44]。此外,RT-qPCR表明CaWRKY8[45]和CaWRKY14[46]在熱脅迫下表達(dá)量均有所改變,表明其可能參與了辣椒對熱脅迫的耐受性調(diào)節(jié)過程。

    NAM、ATAF和CUC組成NAC轉(zhuǎn)錄因子,是植物特有的基因家族,參與調(diào)控組織發(fā)育以響應(yīng)生物和非生物脅迫。在辣椒中共鑒定出104個CaNAC基因,RT-PCR分析22個CaNAC基因響應(yīng)高溫的表達(dá)模式,其中,CaNAC13、CaNAC20、CaNAC29和CaNAC53的表達(dá)量顯著上調(diào),CaNAC27、CaNAC35、CaNAC37、CaNAC61、CaNAC72和CaNAC102的表達(dá)量也上調(diào)[47]。據(jù)報道,CaNAC2c在耐熱性和抗青枯菌的免疫力方面起積極作用,辣椒生長和防御反應(yīng)之間的權(quán)衡由CaNAC2c轉(zhuǎn)錄和CaNAC2c蛋白通過與CaHSP70相互作用決定,而耐熱性-免疫權(quán)衡則分別由CaHSP70和CaNAC029與CaNAC2c互作依賴的方式調(diào)節(jié)[37]。另外,CaNAC55的表達(dá)受熱激的強烈誘導(dǎo)[48],而CaNAC083在熱脅迫中可能起負(fù)調(diào)控作用[49]。

    在非生物脅迫下,bZIP轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控抗逆相關(guān)基因、調(diào)節(jié)滲透壓和清除活性氧等方式增強植物的抗脅迫能力。有研究發(fā)現(xiàn),CabZIP53和CabZIP63正調(diào)控植物對RSI的免疫和對HTHH的耐受。CabZIP53受CaWRKY40直接調(diào)控,受CaWRKY6間接調(diào)控,而CabZIP63直接或間接地在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)節(jié)CaWRKY40的表達(dá)。此外,CabZIP53和CabZIP63均可在辣椒響應(yīng)RSI或HTHH過程中與CaWRKY40形成正反饋回路[50-51]。

    同時,CaZNF830通過直接或間接轉(zhuǎn)錄調(diào)控防御相關(guān)基因(CaHIR1、CaNPR1、CaPR1、CaABR1和CaHSP24),激活辣椒對RSI的免疫或?qū)THH的耐受[52],而CaBES1通過負(fù)調(diào)控CaHSFA2表達(dá)而降低辣椒的耐熱性[53]。此外,辣椒bHLH[54]、LBD[55]和Dof[56]轉(zhuǎn)錄因子也能響應(yīng)熱脅迫,但其作用機制還有待進(jìn)一步研究。目前辣椒熱脅迫轉(zhuǎn)錄因子的研究還集中在表達(dá)量水平,然而,各轉(zhuǎn)錄因子之間存在較為復(fù)雜的聯(lián)系,為理清辣椒熱脅迫轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),今后還需利用新技術(shù)挖掘更多的轉(zhuǎn)錄因子,如MYB類、DREB類、MBF1c類等。

    2.2 熱激蛋白

    熱激蛋白HSPs作為分子伴侶參與維持蛋白質(zhì)折疊的穩(wěn)態(tài),防止或修復(fù)HS引起的蛋白質(zhì)錯誤折疊和降解,進(jìn)而賦予植物耐熱性[57]。HSPs根據(jù)分子量和序列同源性可分為HSP100s、HSP90s、HSP70s、HSP60s和sHSPs(HSP40s、HSP20s、HSP10s)。從辣椒基因組中鑒定和分析了35個CaHSP20基因,并比較了HS處理下熱敏系B6和耐熱系R9葉片中各CaHSP20的轉(zhuǎn)錄模式。幾乎所有的CaHSP20基因都是由HS處理誘導(dǎo)的,符合B6和R9,表明CaHSP20的積累通過結(jié)合變性蛋白并防止它們不可逆聚集,來有效減少HS的損害并增強辣椒的耐熱性[58]。CaHSP16.4和CaHSP25.9通過減少活性氧的積累,增強抗氧化酶的活性,調(diào)節(jié)脅迫相關(guān)基因的表達(dá),賦予植物耐熱和耐旱性[59-60]。CaHSP22.0沉默和過表達(dá)均提高了植株對熱和鹽脅迫的敏感性。然而,CaHSP22.0沉默的可能機制為質(zhì)膜的損傷,而過表達(dá)的調(diào)控模式可能與CaHSP22.0與其底物結(jié)合水平不當(dāng)導(dǎo)致的ROS破壞有關(guān)[61]。從辣椒基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定到21個CaHSP70基因,啟動子和轉(zhuǎn)錄本表達(dá)分析表明CaHSP70s參與辣椒生長發(fā)育和熱脅迫響應(yīng)。HS可能通過Ca2+參與的調(diào)控途徑誘導(dǎo)了許多CaHSP70基因。此外,胞質(zhì)基因CaHSP70-2(正調(diào)節(jié)因子)的異位表達(dá)調(diào)控了脅迫相關(guān)基因的表達(dá),提高了轉(zhuǎn)基因擬南芥植株的耐熱性[62]。同時,CaHSP70-1可能通過含有Ca2+、H2O2和Put的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑參與HS防御反應(yīng)[63]。CaBiP1可能通過減少ROS積累,提高保水能力,增強UPR途徑和脅迫相關(guān)基因的表達(dá),從而提高辣椒對非生物脅迫(包括熱、鹽、滲透和干旱)的耐受性[64]。有研究者鑒定了辣椒基因組中的16個HSP60基因,分析它們在熱敏B6和耐熱R9系中響應(yīng)HS的動態(tài)表達(dá)譜發(fā)現(xiàn),在R9系中,有15個基因表達(dá)上調(diào),只有1個基因下調(diào),在B6系中,有14個基因上調(diào),2個基因下調(diào),表明HSP60s可能在熱脅迫方面發(fā)揮積極的調(diào)節(jié)作用。此外,CaHSP60-6的敲除增加了對熱脅迫的敏感性,表明CaHSP60-6在防御辣椒免受熱脅迫方面起正調(diào)節(jié)作用[65]。據(jù)報道,辣椒基因組中含有7個CaHSP90家族基因,所有HSP90都響應(yīng)熱脅迫,且大部分在脅迫初期就積極響應(yīng)。分析發(fā)現(xiàn),7個CaHSP90在熱脅迫下有兩種表達(dá)模式,一種為先上調(diào)后下調(diào)再上調(diào);另一種為先下調(diào)后上調(diào),這可能與響應(yīng)脅迫過程中的分工相關(guān)[66]。每類植物熱激蛋白有其特定的功能,但彼此之間又有密切合作,目前辣椒上涉及各類熱激蛋白之間相互作用關(guān)系的研究較少,因此還沒有形成不同的HSPs調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

    2.3 其他重要蛋白基因

    蛋白激酶和蛋白酶是植物信號傳導(dǎo)的關(guān)鍵參與者,在細(xì)胞感知環(huán)境刺激后,將細(xì)胞外信號轉(zhuǎn)化為細(xì)胞內(nèi)反應(yīng),通過介導(dǎo)各種細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)途徑來調(diào)節(jié)相關(guān)的基因表達(dá)、植物激素的產(chǎn)生和蛋白質(zhì)功能,從而激活植物在逆境中的抗性[67-68]。辣椒基因組中存在31個CDPK基因和5個CDPK相關(guān)蛋白激酶(CRK)基因,脅迫表達(dá)譜(熱、鹽和青枯菌)顯示,13個CDPK基因和2個CRK基因在響應(yīng)高溫過程中表達(dá)譜發(fā)生了改變,表明辣椒對高溫的響應(yīng)可能包括由不同CDPK基因和CRK基因介導(dǎo)的多個過程的重編程[69]。CaDPK17和CaCDPK29分別是抗青枯病的負(fù)調(diào)節(jié)基因和正調(diào)節(jié)基因,但在抗HTHH過程中均起正調(diào)節(jié)作用。此外,CaCDPK17和CaCDPK29可分別與CaWRKY17在細(xì)胞膜互作并調(diào)節(jié)CaWRKY17介導(dǎo)的辣椒HTHH耐受性及青枯病抗性,其中,與CaDPK17互作,減弱了CaWRKY17抵御青枯病的能力,增強了耐HTHH的能力,而與CaDPK29互作,CaWRKY17在辣椒抵御青枯病以及耐HTHH的能力均得到了提高[70]。CaFtsH06是一種新型絲狀熱敏蛋白酶基因,通過減少活性氧的積累、誘導(dǎo)脅迫相關(guān)酶的活性和調(diào)節(jié)防御相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄等機制干擾辣椒的生理指標(biāo),從而提高辣椒的非生物脅迫(熱、鹽、干旱)耐受性[71]。編碼HAESA-LIKE(HSL)類受體蛋白激酶(RLK)的CaHSL1在辣椒響應(yīng)HTHH過程中受HTHH或脫落酸誘導(dǎo)且表達(dá)顯著上調(diào)。CaHSL1沉默顯著降低了對HTHH的耐受性并下調(diào)相關(guān)基因CaHSP24的轉(zhuǎn)錄水平,而瞬時過表達(dá)CaHSL1提高了CaHSP24的轉(zhuǎn)錄豐度,增強了對HTHH的耐受性。CaHSL1在轉(zhuǎn)錄水平上受CaWRKY40直接調(diào)控,在辣椒響應(yīng)HTHH過程中發(fā)揮正調(diào)控作用[72]。辣椒中與細(xì)胞壁相關(guān)的RLK-like(WAKL)基因CaWAKL20的轉(zhuǎn)錄水平受熱脅迫下調(diào),而受ABA處理上調(diào)。CaWAKL20沉默增強了辣椒的耐熱性,而過表達(dá)降低了擬南芥株系對熱脅迫的耐受性和對ABA的敏感性,同時降低了ABA響應(yīng)基因的熱誘導(dǎo)表達(dá)。因此,CaWAKL20通過抑制ABA響應(yīng)基因的表達(dá)負(fù)調(diào)控植物的耐熱性[73]。

    非生物脅迫通過誘導(dǎo)蛋白質(zhì)變性負(fù)向影響植物的生長發(fā)育,而自噬會降解受損的蛋白質(zhì)以緩解其毒性。從辣椒全基因組中鑒定到15個核心ATG成員,包含29個具有ATG結(jié)構(gòu)域的蛋白,涉及自噬的所有過程。熱脅迫后,8個基因顯著上調(diào),1個基因下調(diào)。冷脅迫下,14個基因上調(diào),4個基因略有下調(diào)。在熱脅迫條件下,耐熱品系R9中上調(diào)表達(dá)的CaATG基因的數(shù)量和點狀區(qū)域的增量明顯高于熱敏感品系B6,表明細(xì)胞自噬與辣椒耐熱性有關(guān)[74]。CaATG16對辣椒的耐熱性具有正調(diào)控作用[75],而CaATG8c基因的沉默和過表達(dá)均降低了植株對熱和鹽脅迫的耐受性[76]。幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白(chitin-binding proteins,CBP)是發(fā)病機制相關(guān)基因家族,在植物的防御反應(yīng)和生長發(fā)育中起關(guān)鍵作用。從辣椒基因組數(shù)據(jù)庫中檢索到16個假定的幾丁質(zhì)基因(CaChi),HS處理下,14個基因上調(diào),2個基因下調(diào)。CaChiVI2在辣椒耐熱和干旱脅迫中起著重要的作用,并通過減少活性氧(ROS)的積累和調(diào)節(jié)防御相關(guān)基因的表達(dá)來抵抗辣椒疫霉[77-78]。除此之外,CaMLO6[79]、CaSWC4[80]、CaSYT5[81]和CaZhp2[82]在辣椒對HTHH的反應(yīng)中也均起正調(diào)節(jié)作用。這些高溫響應(yīng)基因的發(fā)現(xiàn),為揭示辣椒響應(yīng)熱脅迫的分子機制提供了切入點。

    3 響應(yīng)熱脅迫的組學(xué)機制

    得益于生物信息學(xué)的長足發(fā)展,組學(xué)分析已經(jīng)成為解析植物在環(huán)境脅迫下復(fù)雜響應(yīng)機制的重要研究途徑[83]。目前,已有研究者從轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)或代謝組學(xué)水平挖掘出新的辣椒高溫響應(yīng)基因、蛋白質(zhì)及關(guān)鍵代謝物,以深入了解辣椒適應(yīng)熱脅迫的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為培育優(yōu)質(zhì)耐熱辣椒材料奠定基礎(chǔ)。

    3.1 轉(zhuǎn)錄組

    通過轉(zhuǎn)錄組分析揭示了熱脅迫下熱敏感型辣椒‘S590’和耐熱型辣椒‘R597’的轉(zhuǎn)錄差異,GO和KEGG富集分析確定鑒定的DEGs涉及熱激蛋白、熱激轉(zhuǎn)錄因子、激素以及鈣和激酶信號。此外,發(fā)現(xiàn)35個參與脅迫響應(yīng)的基因,大部分熱激蛋白在2個基因型中均上調(diào)表達(dá),且在‘S590’中的表達(dá)量高于‘R597’;轉(zhuǎn)錄因子和激素信號基因在‘R597’中的表達(dá)量高于‘S590’[84]?;赗NA-seq分析了耐熱品種‘17CL30’和熱敏感品種‘05S180’在苗期響應(yīng)熱脅迫的轉(zhuǎn)錄組應(yīng)答,HS下,有2 455個基因僅在‘17CL30’中特異表達(dá),這些基因和某些共有基因的差異表達(dá)可能與‘17CL30’更耐熱相關(guān)。對DEGs進(jìn)行GO和KEGG分析表明,與‘05S180’相比,‘17CL30’具有更強的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、糖代謝、ROS清除能力,因而具有更強的耐熱性[7]。對熱激和常溫下辣椒(C.annuum(Line, 6421))的葉和根進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析,在根中鑒定到的DEGs多于葉中,6個CaHSFs(CaHSF3/8/10/24在葉中;CaHSF11/18在葉和根中)的表達(dá)受熱誘導(dǎo)。此外,分析了5個響應(yīng)熱脅迫的HSFs在‘17CL30’和‘05S180’中的作用,其既能被熱激活(CaHSF4/9/22),也能被熱抑制(CaHSF3/11),CaHSF3/11的調(diào)控差異與品種的遺傳背景差異有關(guān)[85]。中國辣椒和柔毛辣椒比較轉(zhuǎn)錄組分析表明,HSF中有部分基因在兩個品種中的表達(dá)不同,這可能與中國辣椒和柔毛辣椒的耐溫性差異相關(guān)。差異表達(dá)基因的KEGG富集分析表明,熱脅迫下,玉米素生物合成、苯丙素生物合成、脂肪酸延長作用和植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等通路被顯著富集[86]。這些研究為解析辣椒耐熱性分子機制提供了基因資源。

    3.2 代謝組

    基于LC-MS/MS分析了耐熱品種‘17CL30’和熱敏感品種‘05S180’在苗期響應(yīng)熱脅迫的代謝組應(yīng)答,‘17CL30’中有94種DAMs(42種上調(diào)、52種下調(diào));‘05S180’中有108種DAMs(57種上調(diào)、51種下調(diào))。分析DAMs的組成可知,可溶性糖、氨基酸、氨基酸衍生物、黃酮類物質(zhì)和有機酸類物質(zhì)與辣椒的耐熱性密切相關(guān)。其中,氨基酸類衍生物GSH可能在辣椒的熱脅迫響應(yīng)過程中起關(guān)鍵作用[7]。熱脅迫下,對中國辣椒和柔毛辣椒中的植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路分析表明,柔毛辣椒中的茉莉酸上調(diào)表達(dá),且僅與JAZ相關(guān)的DEGs有顯著性差異表達(dá),其中,中國辣椒中的JAZ略有下調(diào)但無顯著性差異,而柔毛辣椒以上調(diào)表達(dá)為主,且部分基因存在顯著性差異,顯示了其對高溫更加強烈的響應(yīng)[86]。

    3.3 蛋白質(zhì)組

    采用iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法,通過分析熱脅迫下‘17CL30’和‘05S180’幼苗可能的熱響應(yīng)蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn),1 591種蛋白質(zhì)參與了熱應(yīng)激反應(yīng)過程。與‘05S180’相比,‘17CL30’的耐熱性可能與更高的ROS清除、光合作用、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、碳水化合物代謝和應(yīng)激防御有關(guān)[87]。對HS處理的辣椒果實進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組的整合分析發(fā)現(xiàn),HS改變了光合作用、刺激響應(yīng)、碳水化合物代謝過程和蛋白質(zhì)折疊過程相關(guān)基因的表達(dá)和蛋白質(zhì)的豐度。HS顯著降低了屬于脂肪酸的代謝物含量,而誘導(dǎo)了屬于有機含氧化合物和有機酸的代謝物。尤其是HS降低了辣椒素和AsA的含量。此外,發(fā)現(xiàn)了3個轉(zhuǎn)錄因子在熱激條件下調(diào)控CBGs的表達(dá)[88]。

    4 問題與展望

    全球氣候變暖導(dǎo)致極端高溫事件頻發(fā),熱脅迫已經(jīng)成為影響糧食安全的重要問題,是限制植物生長和產(chǎn)量形成的主要非生物脅迫之一。近年來,在擬南芥、水稻和番茄等模式植物中,植物響應(yīng)熱脅迫的分子機制研究已經(jīng)取得了很大的進(jìn)展,然而,有關(guān)辣椒響應(yīng)熱脅迫的分子機制研究仍需進(jìn)一步努力。第一,熱脅迫下多組學(xué)聯(lián)合分析方面的研究較少。雖然目前已有熱脅迫下辣椒組學(xué)方面的研究報道,但大部分都是單一組學(xué)或兩兩聯(lián)合組學(xué)的研究,不能系統(tǒng)闡明辣椒應(yīng)答熱脅迫的分子機理。轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)整合了基因表達(dá)的分子見解,將遺傳信號翻譯成具有特定功能的蛋白質(zhì),控制著細(xì)胞內(nèi)不同初級和次級代謝產(chǎn)物的合成。因此,多組學(xué)聯(lián)合分析能夠?qū)牟煌瑢用嫔汐@取的信息聯(lián)系起來,從而全面解析辣椒響應(yīng)熱脅迫的復(fù)雜機制。第二,辣椒響應(yīng)熱脅迫的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚不完整,還不能用來指導(dǎo)生產(chǎn)實踐。雖然目前已經(jīng)用反向遺傳學(xué)方法或者用轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法鑒定出一些響應(yīng)熱脅迫的基因,但由于辣椒的遺傳體系尚未完全建立,部分基因的功能還沒有得到確切的驗證,加上當(dāng)前大部分研究只局限于零散的單個基因在熱脅迫響應(yīng)方面的功能研究,因此,當(dāng)前無法整合出辣椒完整的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

    得益于現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的長足發(fā)展,未來可將現(xiàn)代生物技術(shù)與產(chǎn)業(yè)實際相結(jié)合,在以下幾個方面開展進(jìn)一步的研究。第一,傳統(tǒng)育種耗時久,育種效率低,應(yīng)該加快開發(fā)與辣椒耐熱性緊密連鎖的分子標(biāo)記,通過分子標(biāo)記輔助選擇,提高辣椒育種效率。第二,目前市場上優(yōu)良的辣椒耐熱品種較少,下一步應(yīng)利用前沿生物技術(shù),對辣椒耐熱性進(jìn)行基因改良,創(chuàng)制性狀優(yōu)良的辣椒耐熱新品種。第三,辣椒對熱脅迫的響應(yīng)是一個多基因控制的復(fù)雜的反應(yīng)機制,接下來應(yīng)該利用新技術(shù)挖掘更多響應(yīng)辣椒熱脅迫的基因,探索出完整的辣椒熱脅迫調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。目前對辣椒響應(yīng)熱脅迫機制的研究主要集中在通過熱激蛋白、活性氧清除以及未折疊蛋白清除參與的植物耐熱調(diào)控途徑方面,隨著研究的不斷深入,今后可以考慮將G蛋白調(diào)控、鈣信號傳導(dǎo)及解碼、蠟質(zhì)代謝通路聯(lián)系起來,闡明一條從上游信號產(chǎn)生到下游生理生化響應(yīng)的調(diào)控通路。第四,對于不同的生育期,辣椒響應(yīng)熱脅迫的程度和機理也可能不同,目前對辣椒耐熱性的研究大部分都集中在苗期,對成株期和果實成熟期的研究較少,下一步應(yīng)加強這方面的研究。

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