胡海琳 徐黎 李曉旭 王晨璨 梅曼 丁文靜 趙媛媛
(1.北京林業(yè)大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 林木遺傳育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100083;2.北京林業(yè)大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,北京 100083;3.北京林業(yè)大學(xué)樹(shù)木與基因編輯研究院,北京 100083;4.北京林業(yè)大學(xué)林木育種與生態(tài)修復(fù)國(guó)家工程研究中心,北京 100083)
小肽激素是一種植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)物質(zhì),即使在飛摩爾(fmol)級(jí)濃度下與特定的蛋白受體相互作用,調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂與伸長(zhǎng)、組織與器官分化、開(kāi)花與結(jié)實(shí)、成熟與衰老等生理過(guò)程,協(xié)調(diào)植物的生長(zhǎng)發(fā)育及響應(yīng)脅迫環(huán)境[1]。隨著肽組學(xué)、基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、遺傳學(xué)的發(fā)展,植物小肽激素的結(jié)構(gòu)、分類(lèi)、功能已有大量的研究。到目前為止,人們已鑒定出幾十個(gè)家族的小肽激素,大多數(shù)成熟小肽激素結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,不具有成熟蛋白質(zhì)的復(fù)雜空間結(jié)構(gòu)[2]。已有的生化實(shí)驗(yàn)和遺傳研究表明,小肽激素在植物體內(nèi)以配體的形式與質(zhì)膜表面相關(guān)受體激酶相互作用,進(jìn)行細(xì)胞間信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),調(diào)控植物根、莖、葉、花、果實(shí)的發(fā)育,以及響應(yīng)病蟲(chóng)害、干旱、鹽脅迫等逆境生理[3-7]。本文就小肽激素的結(jié)構(gòu)、分類(lèi)、生物功能及逆境生理等方面的研究進(jìn)展進(jìn)行了論述,并對(duì)研究前景進(jìn)行了展望。
1991年,首次在植物中報(bào)道了第一個(gè)功能性小肽激素——系統(tǒng)素(systemin, SYS),其成熟肽鏈只有18個(gè)氨基酸,在調(diào)節(jié)番茄(Lycopersicon esculentumMill.)抗蟲(chóng)的防御反應(yīng)中具有重要的作用[8]。此后,隨著研究的深入,將存在于植物體內(nèi)的含量很低、調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育的5-100個(gè)氨基酸肽段,稱(chēng)為小肽激素,又名“小分子信號(hào)肽”。小肽激素在不同植物中的同源基因結(jié)構(gòu)域高度保守,這為研究小肽激素的功能提供了便利。本文對(duì)已報(bào)道的小肽激素的類(lèi)型進(jìn)行回顧與總結(jié)。
1.1.1 根據(jù)來(lái)源分類(lèi) 成熟小肽激素分子量大多數(shù)在20個(gè)氨基酸左右[9]。按來(lái)源將小肽激素劃分為兩大類(lèi)(圖1)[10]:非前體衍生肽和前體衍生肽。非前體衍生肽直接從一個(gè)小的開(kāi)放閱讀框(sORF)翻譯而來(lái),不需要中間前體或進(jìn)一步加工。根據(jù)編碼非前體衍生肽的sORF基因組位置可分為3種類(lèi)型:(1)mRNA 5'端上游ORF編碼的肽;(2)microRNAs初級(jí)轉(zhuǎn)錄本(pri-miRNAs)中sORF編碼的肽;(3)其他轉(zhuǎn)錄本中非編碼的較長(zhǎng)蛋白質(zhì)(>100 bp)中編碼的肽[11-12]。
圖1 小肽激素合成多樣性Fig.1 Diversity of small peptide hormone synthesis
前體衍生肽由前體蛋白加工而來(lái),這類(lèi)小肽一般N端有一段信號(hào)肽,指導(dǎo)其進(jìn)一步加工至成熟小肽。前體蛋白又可分為功能性前體和非功能性前體[10]。功能性前體的前蛋白原、蛋白原或前蛋白具有明確的生物學(xué)功能,通過(guò)蛋白水解酶活性從前體中釋放出來(lái),如大豆(Glycine max)中的Subtilase Peptide(Gm-SUBPEP)等[13-14]。非功能性前體的前蛋白原、蛋白原或前蛋白沒(méi)有明確的生物學(xué)功能,大多數(shù)來(lái)源于一個(gè)較長(zhǎng)的前體[15]。
非功能性前體根據(jù)是否富含半胱氨酸(Cys)以及特定的翻譯后修飾,可以分為三類(lèi):(1)翻譯后修飾肽(PTM),非功能性前體經(jīng)特定修飾后獲得生物活性。常見(jiàn)的修飾有脯氨酸(Pro)羥基化、羥脯氨酸阿拉伯糖基化和酪氨酸硫酸化(sTyr),這些修飾具有化學(xué)穩(wěn)定性和不可逆性,對(duì)于維持植物體內(nèi)擴(kuò)散過(guò)程至關(guān)重要。例如CLE(clavata 3/embryo surrounding region)家族、CIF(casprian strip integrity factor)家族等大多數(shù)小肽均為翻譯后修飾肽。迄今為止,已發(fā)現(xiàn)的植物翻譯后修飾肽中,除PSK(phytosulfokine)家族外,脯氨酸羥基化是普遍存在的一種修飾作用;(2)富含半胱氨酸(Cys)的小肽,含有2-16個(gè)Cys殘基的結(jié)構(gòu)域,通過(guò)形成分子內(nèi)二硫鍵影響小肽的三維結(jié)構(gòu)和活性,如RALF(rapid alkalinization factor)小肽含有4個(gè)Cys殘基;(3)非富含半胱氨酸非翻譯后修飾的小肽(non-Cysrich/non-PTM),初級(jí)結(jié)構(gòu)可以包含具有重要功能的氨基酸(如脯氨酸、甘氨酸、賴(lài)氨酸),主要從原蛋白中釋放,參與植物的防御反應(yīng),如SYS、PEPs(plant elicitor peptides)等[2,16-17]。
1.1.2 根據(jù)N端序列分類(lèi) 根據(jù)N端序列的不同,植物小肽激素可分為非分泌型小肽和分泌型小肽。非分泌型小肽在胞內(nèi)調(diào)控細(xì)胞的生命活動(dòng),也可從受傷的細(xì)胞中釋放到質(zhì)外體直接激活植物的防御反應(yīng)[18]。SYS是典型的非分泌型小肽,當(dāng)植物遭受蟲(chóng)害時(shí),SYS從受傷細(xì)胞釋放,通過(guò)質(zhì)外體途徑運(yùn)送到未傷害部位,激活植物的抗蟲(chóng)防御反應(yīng)。分泌型小肽在胞內(nèi)合成,通過(guò)自由擴(kuò)散運(yùn)輸至胞外,通過(guò)韌皮部或木質(zhì)部運(yùn)輸?shù)狡渌课话l(fā)揮作用,進(jìn)行細(xì)胞間的信號(hào)傳導(dǎo),以調(diào)控胞外相鄰細(xì)胞的生命活動(dòng)[19-20]。富含半胱氨酸的小肽和翻譯后修飾肽均為分泌型肽[18,21],翻譯后修飾肽是最常見(jiàn)的小肽激素類(lèi)型,通過(guò)改變靜電荷、親水性以及構(gòu)象來(lái)改變多肽的理化性質(zhì),進(jìn)而調(diào)控與受體的特異性結(jié)合。
自SYS發(fā)現(xiàn)以來(lái),PSK、CLE等多種小肽參與植物生長(zhǎng)發(fā)育和環(huán)境適應(yīng)被陸續(xù)報(bào)道。傳統(tǒng)的生化方法能夠鑒定到成熟小肽及其氨基酸序列,但小肽激素在植物體內(nèi)含量極低,提取時(shí)技術(shù)難度大、費(fèi)時(shí)費(fèi)力、成本很高,如在鑒定SYS氨基酸組成時(shí),利用傳統(tǒng)的生化方法和多步液相色譜分析僅從27 kg番茄提取出1 μg活性肽[22]。經(jīng)典遺傳學(xué)方法能夠驗(yàn)證小肽在植物中的生物學(xué)功能[23],但對(duì)于小肽的鑒定效果并不理想,只鑒定到為數(shù)不多的小肽[2]。目前,科學(xué)家利用正向遺傳篩選方法僅鑒定到CLV3(CLAVATA3)[24]、IDA(INFLORESCENCE DEFICIENT IN ABSCISSION)[25]兩種小肽。因此,不論傳統(tǒng)的生化分析,還是經(jīng)典的遺傳學(xué)方法,都無(wú)法實(shí)現(xiàn)小肽的精準(zhǔn)鑒定及功能研究。
近幾年,新型的肽組學(xué)分析技術(shù)得到發(fā)展,結(jié)合色譜、高效液相色譜和液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜連用(LC-MS/MS)等技術(shù),一次鑒定出十幾甚至上百種小肽,且能夠鑒定小肽的翻譯后修飾類(lèi)型[26-27],大大提高了鑒定的通量,使得小肽鑒定實(shí)現(xiàn)了從傳統(tǒng)的“自下而上”到“自上而下”的跳躍。2014年,Chen等[28]在植物中建立了新型肽組學(xué)技術(shù),成功從番茄葉片中鑒定到14個(gè)新的參與防御反應(yīng)的信號(hào)肽。然而,由于沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)的小肽數(shù)據(jù)庫(kù),假陽(yáng)性率較高,且無(wú)法判斷其生物學(xué)活性[28]。在此基礎(chǔ)上,科學(xué)家綜合利用新型肽組學(xué)等生物信息學(xué)篩選、結(jié)合生化分析以及遺傳學(xué)驗(yàn)證等方法,不僅克服了傳統(tǒng)生化分析技術(shù)成本高、技術(shù)難度大等問(wèn)題,而且成功避免了基因豐度低和基因冗余帶來(lái)的障礙[2,23,29-30],是目前研究植物小肽的精準(zhǔn)鑒定及功能驗(yàn)證的最好方法。Doblas等[23]利用比對(duì)單個(gè)前體多肽在C端附近保守結(jié)構(gòu)域,通過(guò)翻譯后修飾和蛋白水解過(guò)程篩選出CIF基因,利用納米液相色譜和串聯(lián)質(zhì)譜分析確定了CIF的保守結(jié)構(gòu)域,觀察cif1 cif2雙突變體發(fā)現(xiàn)擬南芥(Arabidopsis thaliana)根凱氏帶發(fā)育不完整,外施CIF肽可彌補(bǔ)這一缺陷,確定CIF基因?yàn)檎{(diào)控凱氏帶完整發(fā)育的關(guān)鍵因子。Ohyama等[30]根據(jù)已知分泌小肽的原蛋白結(jié)構(gòu)特征,結(jié)合生物信息學(xué)及質(zhì)譜分析,鑒定到CEP1(C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDE 1)參與側(cè)根的發(fā)育。
小肽激素作為一種重要的信號(hào)分子,影響植物生長(zhǎng)和發(fā)育的各個(gè)階段,它既可以進(jìn)行細(xì)胞間的短距離通信,也可進(jìn)行遠(yuǎn)程信號(hào)傳遞。擬南芥中有超過(guò)1 000個(gè)基因編碼潛在的肽激素[31],但只有極少數(shù)小肽激素的分子機(jī)制和生理功能被闡明。本文就近幾年人們較為關(guān)注的幾種小肽家族的結(jié)構(gòu)、分子機(jī)制和生理功能進(jìn)行了總結(jié)(表1)。
表1 小肽激素加工過(guò)程及功能Table 1 Processing and function of small peptide hormones
CLE(clavata 3/embryo surrounding region)家族是植物中最大的小肽家族之一,擬南芥中CLE家族至少有32個(gè)成員,水稻(Oryza sativa)中有83個(gè),楊樹(shù)(PopulusL.)中有50個(gè)[34,54]。CLE家族屬于翻譯后修飾肽,前肽經(jīng)水解加工成12-14個(gè)氨基酸的保守區(qū)域,再經(jīng)脯氨酸羥基化和阿拉伯糖基化修飾后,形成成熟小肽發(fā)揮作用[55-56]。擬南芥中的32個(gè)CLE基因可以翻譯成27種不同的CLE,成熟CLE與受體結(jié)合,激活下游信號(hào)通路調(diào)控不同的生理活動(dòng)[54]。
CLE在根、莖、維管組織、氣孔中均有表達(dá),主要參與干細(xì)胞的增殖與分化。CLE家族成員CLV3負(fù)調(diào)控莖尖分生組織中心特異表達(dá)的WUS(Wuschel)基因,形成CLV3-WUS途徑,通過(guò)動(dòng)態(tài)負(fù)反饋調(diào)節(jié),維持干細(xì)胞的穩(wěn)態(tài)[38];在莖尖分生組織區(qū)域表達(dá)的CLE16、CLE17、CLE27也是干細(xì)胞調(diào)控的候選因子[37]。此外,CLE家族在根尖分生組織區(qū)域中也有成員特異表達(dá),例如CLV3能夠維持根尖分生組織的分生能力[36],而CLE45與LRR-RLK(leucinerich repeat receptor-like kinase)受體家族成員BAM3(BARELY ANY MERISTEM 3)結(jié)合則抑制根初生韌皮部篩分子的分化[35];CLV3和CLE25/26/45分別結(jié)合受體CLV1和BAM1/3,維持莖尖和根尖分生組織的穩(wěn)態(tài)[35-36]。
由CLE41/CLE44基因編碼的導(dǎo)管分化抑制因子(TRACHEARY ELEMENT DIFFERENTIATION INHIBITORY FACTOR, TDIF)在韌皮部細(xì)胞中表達(dá),運(yùn)輸?shù)皆纬蓪蛹?xì)胞與受體TDR/PXY(TDIF receptor/phloem inter-calated with xylem)結(jié)合,促進(jìn)原形成層細(xì)胞的增殖,并抑制其分化成木質(zhì)部篩管[37]。此外,近期研究發(fā)現(xiàn),CLE42與CLE41/44存在功能冗余,能夠通過(guò)乙烯通路負(fù)調(diào)控葉片的衰老過(guò)程[57]。擬南芥中CLE12、CLE26、CLE45等CLE家族的小肽參與不同部位的維管組織形成過(guò)程,從而調(diào)控根中木質(zhì)部的發(fā)育[35,58]。CLE9/10通過(guò)與BAM1-LRR-RLKs受體結(jié)合,抑制木質(zhì)部前體細(xì)胞的平周分裂[59];二者還在氣孔細(xì)胞中表達(dá),通過(guò)與LRR受體激酶HSL1(HAESA-LIKE 1)、SERK1形成三元復(fù)合物,通過(guò)脫落酸(ABA)、H2O2、NO介導(dǎo)的方式調(diào)控氣孔關(guān)閉[39]。
植物磺化肽激素(phytosulfokine, PSK)是在植物中普遍存在的具有生物活性的硫酸化肽,屬于翻譯后修飾肽。1996年,Matsubayashi從蘆筍中發(fā)現(xiàn)了二硫化五肽PSK-α,常說(shuō)的PSK泛指PSK -α[60]。PSK-α前體的一級(jí)結(jié)構(gòu)是由小基因家族編碼的80-120個(gè)氨基酸,C端具有氨基酸保守序列YIYTQ,其結(jié)構(gòu)保守性很差[61-62]。前體的二級(jí)結(jié)構(gòu)由一級(jí)序列折疊成3個(gè)α螺旋,該結(jié)構(gòu)相對(duì)保守[62]。PSK-α前體在質(zhì)外體硫酸化,保守序列的兩個(gè)酪氨酸側(cè)鏈硫酸化可使其生物活性提高約1 000倍[63]。
擬南芥PSK受體是定位在質(zhì)膜上的LRR-RLK X亞家族成員AtPSKR1和AtPSKR2,二者具有一個(gè)胞外結(jié)構(gòu)域和一個(gè)C端胞內(nèi)激酶結(jié)構(gòu)域的跨膜蛋白,識(shí)別PSK的兩個(gè)sTyr位點(diǎn)[64-66]。擬南芥AtPSKR1受體的激酶結(jié)構(gòu)域具有自磷酸化和轉(zhuǎn)磷酸化活性。在激酶亞結(jié)構(gòu)域IX中有一個(gè)指定的鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶(GC)催化中心,是鈣調(diào)蛋白(CaM)結(jié)合位點(diǎn),具有絲氨酸/蘇氨酸激酶和鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶活性,確定CAM誘導(dǎo)的磷酸化如何影響下游生長(zhǎng)信號(hào)通路將是一個(gè)挑戰(zhàn)[64,67]。
擬南芥中有5個(gè)基因編碼PSK,其中AtPSK1只在根中特異表達(dá),而其他基因在根和莖中都有表達(dá)[63,68]。PSK前體基因或PSK肽過(guò)量表達(dá)的陽(yáng)性植株中,細(xì)胞壁松弛或原生質(zhì)體擴(kuò)張,根、下胚軸和葉片的生長(zhǎng)速率明顯加快,表明PSK在誘導(dǎo)細(xì)胞伸長(zhǎng)中發(fā)揮重要作用[69-71]。除此之外,PSK信號(hào)還可促進(jìn)多種發(fā)育過(guò)程,包括花粉管生長(zhǎng)、體細(xì)胞胚胎發(fā)生、體外再生能力和豆科結(jié)瘤,并以拮抗的方式調(diào)節(jié)生物營(yíng)養(yǎng)和壞死病原體的免疫反應(yīng)[44,72-73]。
2019年,PSK-γ在大豆中被鑒定,是PSK-α的類(lèi)似物,誘導(dǎo)胚細(xì)胞擴(kuò)增,促進(jìn)了營(yíng)養(yǎng)器官和種子的生長(zhǎng)[46]。2022年,PSK-δ及其前體蛋白在豆科植物根瘤中被發(fā)現(xiàn),增加了豆科植物的根瘤菌數(shù)量,也顯著促進(jìn)了共生結(jié)瘤[47]。
2001年,Pearce等[49]在煙草中發(fā)現(xiàn)能快速升高培養(yǎng)基pH值的快速堿化因子(rapid alkalinization factor, RALF)。RALF是植物中廣泛存在的富含半胱氨酸的多肽,包含4個(gè)保守的半胱氨酸殘基,形成2個(gè)二硫鍵指導(dǎo)RALFs正確折疊[49,74]。成熟RALFs N端上游是一對(duì)精氨酸殘基,它不僅作為肽加工酶的切割位點(diǎn),還參與協(xié)調(diào)免疫反應(yīng)[75];下游YISY基序是RALFs與受體結(jié)合所必需的序列[50]。RALFs C端GASYY和C端RCRR(S)基序可能在穩(wěn)定肽結(jié)構(gòu)或肽之間的相互結(jié)合中發(fā)揮作用[76]。
長(zhǎng)春花類(lèi)受體激酶家族(Catharanthus roseusreceptor-like kinase 1-like, CrRLK1L)能夠特異識(shí)別RALFs[77-78]。RALF1與CrRLK1L家族FER(FERRONIA)結(jié)合抑制植物側(cè)根的發(fā)育[10],與BAK1結(jié)合抑制根生長(zhǎng)和細(xì)胞伸長(zhǎng)[10,79]。在中柱鞘細(xì)胞特異表達(dá)的RALF34直接與CrRLK1L家族THE1結(jié)合,從而調(diào)控側(cè)根發(fā)育的過(guò)程[51,80]。此外,RALFs家族也參與調(diào)控植物的生殖發(fā)育過(guò)程。在花粉中特異表達(dá)的RALF4、RALF19與ANX1/2(ANXUR1/2)-BUPS1/2(Buddha's paper seal l/2)復(fù)合體相互作用,共同調(diào)控花粉管的生長(zhǎng)和完整性;當(dāng)花粉管生長(zhǎng)至胚囊時(shí),RALF34還與RALF4、RALF19競(jìng)爭(zhēng)與ANX1/2-BUPS1/2復(fù)合體結(jié)合,使花粉管破裂釋放精子完成雙受精過(guò)程[53,81]。
2017年,Geldner團(tuán)隊(duì)與Matsubayashi團(tuán)隊(duì)均鑒定出參與調(diào)控凱氏帶完整性的小肽激素——?jiǎng)P氏帶完整性因子(Casprian strip integrity factor,CIF)[5,23]。迄今為止,在擬南芥基因組中共發(fā)現(xiàn)5個(gè)CIF基因——CIF1、CIF2、CIF3、CIF4、TWS1,都為翻譯后修飾肽,且受體為L(zhǎng)RR-RLK亞家族X(qián)I成員SGN3/GSO1(GASSHO1/SCHENGEN3)[40,82]。
成熟CIF1、CIF2的蛋白序列相似性很高,具有21個(gè)氨基酸殘基,且都位于前體高度保守的C端,有一個(gè)sTyr位點(diǎn)和兩個(gè)脯氨酸羥基化位點(diǎn)[5]。CIF1、CIF2的酪氨酸硫酸化位點(diǎn)與受體SGN3/GSO1的結(jié)合具有高度親和力,但非硫酸化的CIF與SGN3/GSO1的結(jié)合親和力較低[5]。SGN3/GSO1-CIF2復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)顯示完全伸展的CIF主鏈與SGN3/GSO1受體的LRR重復(fù)序列相互作用,使SGN3/GSO1和CIF2之間的結(jié)合更牢固,在植物體內(nèi)構(gòu)成受體/肽信號(hào)通路,即SGN通路[40,82]。在維管束中形成的CIF1、CIF2經(jīng)TPSTs(tyrosylprotein sulfotransferase)硫酸化后轉(zhuǎn)運(yùn)至內(nèi)皮層細(xì)胞,與SGN3/GSO1和SERK(somatic embryogenesis receptor kinase)家族蛋白受體復(fù)合物結(jié)合,然后質(zhì)膜錨定激酶蛋白SGN1將受體-肽復(fù)合物的信號(hào)傳遞給RBOHF(respiratory burst oxidase homolog F),使細(xì)胞在質(zhì)外體產(chǎn)生H2O2,過(guò)氧化物酶分解H2O2驅(qū)動(dòng)凱氏帶木質(zhì)素的合成[23,82]。當(dāng)凱氏帶屏障完全形成后,CIF的運(yùn)輸受到阻滯,SGN通路被切斷,木質(zhì)素停止合成[23,83]。此外,SGN通路還參與調(diào)控CASP結(jié)構(gòu)域建立、木栓質(zhì)合成等過(guò)程[83]。
CIF3、CIF4與CIF1、CIF2的核心區(qū)域有較弱的同源性,表明CIF3、CIF4的前體兩端被加工過(guò)。雖然受體SGN3/GSO1與CIF1-4具有高結(jié)合親和力,但研究發(fā)現(xiàn)CIF3能被SGN3/GSO1的同源受體GSO2(GASSHO 2)特異性地識(shí)別[82]。近期,Truskina等[41]觀察gso1 gso2、cif3 cif4、tpst-1突變體不同時(shí)期的花藥發(fā)現(xiàn),其花藥黏連,進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)定位在中間層的GSO1、GSO2受體與在絨氈層表達(dá)的CIF3、CIF4是絨氈層發(fā)育及花粉壁形成過(guò)程中的關(guān)鍵因子。值得注意的是,CIF3、CIF4在硫酸化后能夠被枯草桿菌素絲氨酸蛋白酶SBT5.4加工除去C端延伸,再擴(kuò)散到中間層激活由GSO介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)[41]。
CIF家族的另一成員TWS1(TWISTED SEED 1)在胚中表達(dá),與CIF1的核心區(qū)域序列相似性較弱,其前體通過(guò)角質(zhì)層屏障,在胚乳中經(jīng)ALE1肽酶直接加工C端,加工后的TWS1重新進(jìn)入胚中與SGN3/GSO1和GSO2受體結(jié)合,建立了胚胎表皮形成過(guò)程中細(xì)胞間的聯(lián)系[84]。目前為止,對(duì)植物體內(nèi)CIF肽加工和修飾相關(guān)的報(bào)道仍相對(duì)較少,有待于進(jìn)一步的深入研究。
此外,還有多種類(lèi)型的植物小肽激素在調(diào)控植物生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮了重要作用。例如RGF(ROOT MERISTEM GROWTH FACTOR)/GLV(GOLVEN)/CLEL(CLE-LIKE),可調(diào)控維管形成層分化以及根的生長(zhǎng)分化[29];CEP3(C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDE 3)、CEP5(C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDE 5)、IDA等小肽參與植物側(cè)根的發(fā)育[85];EPF(EPIDERMAL PATTERNING FACTOR)及EPFL(EPF-Like)在調(diào)控氣孔發(fā)育方面發(fā)揮重要的作用[10]。多類(lèi)小肽也參與植物的生殖發(fā)育,例如SP11/SCR(S locus protein 11/S locus cysteine-rich)在花藥中特異表達(dá),與受體SRK(S locus receptor kinase)結(jié)合抑制花粉的水合過(guò)程,誘導(dǎo)花粉自交不親和[86];LUREs、EALs、PCYs等對(duì)花粉的導(dǎo)向具有重要作用[10];ECA1s參與精卵融合過(guò)程[87];PCP-Bs(POLLEN COAT PROTEIN B-class peptides)參與花的授粉過(guò)程[88]。小肽作為植物多肽類(lèi)激素,具有很好的研究潛能和廣闊的應(yīng)用前景。
小肽激素不僅在植物維持正常生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮了重要作用,還能夠在逆境生理方面發(fā)揮重要的作用,本文重點(diǎn)對(duì)其如何調(diào)控植物的逆境生理進(jìn)行了總結(jié)。
系統(tǒng)素(SYS)是一種抑制食草性昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物消化的蛋白酶,在受傷番茄葉片提取物中發(fā)現(xiàn),隨后從茄科其他亞族中也分離出了SYS[8,32]。SYS是非富含半胱氨酸非翻譯后修飾肽,由約200個(gè)氨基酸組成的系統(tǒng)素前體水解而來(lái)。系統(tǒng)素前體是一種本征無(wú)序蛋白,其結(jié)構(gòu)靈活多變,水解后產(chǎn)生不同結(jié)構(gòu)狀態(tài)的SYS,與多種分子選擇性作用,整合不同的信號(hào)通路,協(xié)調(diào)傷口/病原體信號(hào)的傳導(dǎo)[89-90]。然而,到目前為止,有關(guān)系統(tǒng)素前體如何水解釋放系統(tǒng)素的相關(guān)機(jī)理知之甚少,仍需進(jìn)一步的研究[19]。
系統(tǒng)素前體誘導(dǎo)了多種信號(hào)通路,從而保護(hù)番茄免受植食性昆蟲(chóng)、植物病原真菌和鹽脅迫等的影響[19,91]。2018年,F(xiàn)elix團(tuán)隊(duì)研究表明,SYS是一種脅迫傳遞信號(hào),可被質(zhì)膜上的LRR-RLK受體SYR1(SYS RECEPTOR 1)識(shí)別[92]。SYS信號(hào)途徑與胞內(nèi)信號(hào)耦聯(lián),如Ca2+內(nèi)流、H+內(nèi)流和K+外流,使質(zhì)膜去極化,快速激活MAPK(mitogen-activated protein kinase)級(jí)聯(lián)反應(yīng)。MAPK級(jí)聯(lián)反應(yīng)促進(jìn)了茉莉素(jasmonate, JA)合成和過(guò)氧化物酶體的活性,并在細(xì)胞質(zhì)中轉(zhuǎn)化為JA-Ile,JA-Ile和乙烯促進(jìn)防御相關(guān)基因的表達(dá)[33,93]。此外,當(dāng)葉片遭受病原體入侵或機(jī)械傷害后,SYS不僅會(huì)啟動(dòng)植物體內(nèi)的系統(tǒng)防御反應(yīng),還會(huì)釋放綠葉揮發(fā)物,通過(guò)空氣擴(kuò)散激活鄰近的、未受傷害的植物的防御反應(yīng)[94]。
研究發(fā)現(xiàn)擬南芥CLE家族27個(gè)成員能誘導(dǎo)NCED(NINECIS-EPOXYCAROTENOID DIOXYGENASE)酶表達(dá),激活A(yù)BA的合成,從而調(diào)控植物應(yīng)對(duì)干旱、冷或鹽脅迫等逆境環(huán)境。在低濃度的CLE小肽激素處理過(guò)程中,只有CLE25可以誘導(dǎo)NCED3的表達(dá)。干旱脅迫條件下,CLE25在根中表達(dá)量顯著升高并運(yùn)至葉片,與BAM1(BARELY ANY MERISTEM 1)、BAM3(BARELY ANY MERISTEM 3)受體結(jié)合,促進(jìn)了NCED3表達(dá)上調(diào),使ABA含量升高并誘導(dǎo)氣孔關(guān)閉,從而實(shí)現(xiàn)了植物對(duì)缺水環(huán)境的響應(yīng)[95]。擬南芥CLE25能夠從根到葉片運(yùn)輸是CLE肽的一種罕見(jiàn)的長(zhǎng)距離轉(zhuǎn)運(yùn),但并不是所有的CLE都可以長(zhǎng)距離運(yùn)輸,CLV3就只能在幾層細(xì)胞之間穿梭[95]。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析顯示,CLE1、CLE7、CLV3等許多CLE基因能夠參與植物缺氮、缺磷、與細(xì)菌的相互作用等過(guò)程,然而,關(guān)于CLE信號(hào)通路與環(huán)境信號(hào)通路之間關(guān)系的研究仍處于起步階段[37]。
經(jīng)RALF23肽處理的野生型擬南芥或AtRALF23基因過(guò)表達(dá)的陽(yáng)性植株,抑制了其體內(nèi)的免疫應(yīng)答反應(yīng)[48]。因此,AtRALF23是免疫應(yīng)答的負(fù)調(diào)控因子。此外,擬南芥fer突變體對(duì)病原體表現(xiàn)出超敏表型,深入研究發(fā)現(xiàn),AtRALF23-FER可以作為一個(gè)與病原體相關(guān)的分子模式的蛋白支架,或者通過(guò)抑制茉莉素信號(hào)通路,協(xié)同調(diào)控植物的免疫反應(yīng)[48,96]。此外,RALF8是擬南芥植株缺水和線蟲(chóng)脅迫時(shí)轉(zhuǎn)錄上調(diào)的基因之一,表明RALF-FER信號(hào)通路參與調(diào)控植物的先天免疫反應(yīng)[75,97]。研究表明RALF1與FER受體結(jié)合,能夠誘導(dǎo)氣孔關(guān)閉,從而參與調(diào)控植物的免疫應(yīng)答過(guò)程。AGB1是擬南芥基因組中唯一編碼G蛋白β亞基的基因,能夠與FER相互作用參與ABA介導(dǎo)的氣孔運(yùn)動(dòng)[98]。fer和agb1突變體在高鹽條件下氣孔和根系表現(xiàn)出脅迫響應(yīng)狀態(tài),雙突變體表現(xiàn)出對(duì)鹽脅迫更為敏感的超敏表型;當(dāng)用高鹽與RALF1肽同時(shí)處理植株時(shí),也表現(xiàn)出超敏表型,表明RALF在氣孔開(kāi)放和鹽脅迫逆境生理中發(fā)揮重要的作用,RALF-FER信號(hào)通路和AGB1蛋白都參與了ABA介導(dǎo)的鹽脅迫響應(yīng)過(guò)程[98]。
PSK信號(hào)通路能夠調(diào)控植物對(duì)壞死性病原菌的防御反應(yīng)。當(dāng)番茄感染灰霉病菌后,PSK與PSKR1受體結(jié)合,胞內(nèi)Ca2+濃度升高,生長(zhǎng)素信號(hào)通路激活,番茄的免疫能力顯著提高[99]。幼苗中,PSK信號(hào)通路增強(qiáng)了病原體相關(guān)防御基因的表達(dá),然而在成熟植物中,PSK信號(hào)通路反而將降低了防御基因表達(dá),減弱了對(duì)植物病原細(xì)菌Pseudomonas syringaepv.tomatoDC3000和尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)的響應(yīng)[100]。當(dāng)PSK促進(jìn)防御基因(如茉莉酸依賴(lài)的防御基因)表達(dá)時(shí),即使在沒(méi)有病原體的情況下,也可以觀察到其基礎(chǔ)活性[101]。在百日草(Zinnia elagans)中葉肉細(xì)胞再分化的初始階段,PSK能夠抑制相關(guān)應(yīng)激基因的表達(dá),實(shí)現(xiàn)了葉肉細(xì)胞從傷害反應(yīng)向發(fā)育分化的轉(zhuǎn)化,表明PSK有助于在應(yīng)激條件下(如創(chuàng)傷、離體培養(yǎng)或熱應(yīng)激)分生組織的形成和維持[102]。此外,干旱脅迫下,Phyt2(Phytaspase 2)在花梗和維管系統(tǒng)脫落區(qū)附近特異性表達(dá),并對(duì)PSK前體進(jìn)行加工,形成成熟的PSK,PSK誘導(dǎo)細(xì)胞壁水解酶在離層表達(dá),加速花和果實(shí)的脫落[35]。Stührwohldt等[45]發(fā)現(xiàn)PSK1前體的表達(dá)升高后,經(jīng)類(lèi)枯草絲氨酸蛋白酶SBT3.8修飾,形成成熟的PSK,能夠提高擬南芥的耐旱性。
此外,植物中還存在其他類(lèi)型的小肽激素調(diào)控植物的逆境脅迫。水稻中富含半胱氨酸的肽DT11(DROUGHT TOLERANCE 11)過(guò)表達(dá)植株中水分流失顯著減少、氣孔密度增加,ABA表達(dá)量明顯提高,表明DT11介導(dǎo)的ABA信號(hào)途徑增強(qiáng)了水稻的耐旱性[103]。據(jù)報(bào)道,植物誘導(dǎo)肽PEP3與受體PEPR1(PEP Receptor 1)結(jié)合,能夠提高植株的鹽脅迫耐受性[104],與之不同的是,CAPE1(CAP-derived peptide 1)對(duì)植物響應(yīng)鹽脅迫有負(fù)調(diào)控作用[105]。此外,小肽通過(guò)與病原體的直接相互作用或與受體結(jié)合,經(jīng)下游信號(hào)傳導(dǎo)調(diào)控植物的免疫反應(yīng),CEP、DVL1(DEVIL 1)等可調(diào)控植物與細(xì)菌的共生關(guān)系[19]。
小肽激素在植物體內(nèi)廣泛存在,一般為5-100個(gè)氨基酸殘基的小分子肽段,其加工、肽鏈折疊方式、氨基酸修飾、功能等具有多樣性。植物小肽激素?cái)?shù)量多、來(lái)源及加工成熟機(jī)制復(fù)雜、生物學(xué)功能驗(yàn)證難度很高。隨著新型肽組學(xué)等生物分析技術(shù)的飛速發(fā)展,結(jié)合分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、生化分析等方法,不僅可以有效鑒定小肽,還可以驗(yàn)證小肽的生物學(xué)功能。此外,亟需構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)的植物小肽數(shù)據(jù)庫(kù),這樣在鑒定到新的小肽時(shí),僅僅通過(guò)比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù),就可得知小肽的結(jié)構(gòu)、生物學(xué)功能等信息。
小肽激素作為一種信號(hào)分子,不僅調(diào)控植物細(xì)胞增殖、組織分化、器官形成、生殖發(fā)育、成熟與衰老等生理過(guò)程,而且響應(yīng)植物應(yīng)對(duì)病蟲(chóng)害、干旱、冷害、鹽脅迫等逆境脅迫(圖2)。但有關(guān)小肽的許多科學(xué)問(wèn)題仍然沒(méi)有被破解:某些小肽的生物學(xué)功能是什么?小肽之間是否存在功能冗余?配體-受體信號(hào)通路上下游之間存在怎樣的信號(hào)傳遞?
圖2 植物小肽激素的生物學(xué)功能Fig.2 Biological functions of plant small peptide hormones
總之,植物小肽激素是一個(gè)新興的、極具前景的研究領(lǐng)域,我們對(duì)植物肽的研究還處于初級(jí)階段,尋求更簡(jiǎn)便、更精確、更快速的鑒定及功能驗(yàn)證方法是亟待解決的問(wèn)題,構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)的植物小肽數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)極具挑戰(zhàn)與發(fā)展前景的研究領(lǐng)域,同時(shí)也為植物小肽的研究提供了更大的契機(jī)。根據(jù)現(xiàn)有的研究推測(cè),植物小肽激素在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、食品工業(yè)、育種和醫(yī)藥領(lǐng)域等具有巨大的潛在應(yīng)用價(jià)值[106]。相信未來(lái)植物小肽激素可實(shí)現(xiàn)量化生產(chǎn),從而作為肥料調(diào)控植物的生長(zhǎng),提高植物對(duì)病蟲(chóng)害的免疫能力及產(chǎn)量,解決實(shí)際的生活生產(chǎn)問(wèn)題,為我們提供極大的便利。