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    依加利塞(Eganelisib)的抗炎及其PI3Kγ選擇性抑制機制研究*

    2023-08-14 10:06:12熊文典蔡燕飛朱景宇
    關(guān)鍵詞:氫鍵藥效選擇性

    熊文典 賈 磊 蔡燕飛 陳 蘊 金 堅*** 朱景宇***

    (1)江南大學(xué)生命科學(xué)與健康工程學(xué)院,無錫 214122;2)江南大學(xué)化學(xué)與材料工程學(xué)院,無錫 214122)

    炎癥(inflammation),是機體對外界感染、組織損傷等刺激所產(chǎn)生的,以維持機體自身內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定和正常生命活動為根本的一種保護性反應(yīng)[1]。炎癥疾病發(fā)病機制復(fù)雜,而且常常表現(xiàn)為慢性炎癥,治療困難,從而容易引發(fā)其他疾病,如類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、銀屑病、肺纖維化,甚至腫瘤[2]。大量研究已發(fā)現(xiàn)炎癥反應(yīng)與胞內(nèi)多條信號通路的激活相關(guān), 其中磷脂酰肌醇 3 激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)信號通路備受關(guān)注[3-4]。PI3K是一種胞內(nèi)脂質(zhì)磷酸激酶,根據(jù)其結(jié)構(gòu)和底物的特異性可分為I、II、III型,其中I型PI3K 研究最為廣泛[5]。受多種細胞表面受體激活后,I 型PI3K 可磷酸化靶底物磷酸肌醇(PIP2)肌醇環(huán)的第3 位,產(chǎn)生脂質(zhì)第二信使磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(PIP3),進而啟動廣泛的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)反應(yīng)[6]。其介導(dǎo)的PI3K/Akt 信號通路調(diào)控著一系列細胞生理活動,如細胞存活、遷移、分化和增殖等[7]。I 型PI3K 是由調(diào)節(jié)亞基(p85)和催化亞基(p110)組成的異源二聚體,根據(jù)結(jié)構(gòu)特異性和調(diào)控亞基的差異,進一步分為IA類和IB類。IA類包括PI3Kα、PI3Kβ、PI3Kδ,而IB 類僅含有PI3Kγ[8]。作為唯一的亞型結(jié)構(gòu),PI3Kγ 擁有如下幾個顯著特征:a. IA 型PI3K 主要由酪氨酸激酶受體(recptor tyrosine kinases,RTKs) 激活,而PI3Kγ 主要受G 蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptors,GPCRs)激活[9-10];b. PI3Kα 和PI3Kβ在人體組織中普遍表達,而PI3Kγ和PI3Kδ主要分布于造血系統(tǒng),其中PI3Kγ 主要存在于白細胞中,如中性粒細胞、嗜酸性粒細胞、巨噬細胞、T 細胞、肥大細胞中[11];c. 在受到如GPCR 這些細胞表面受體刺激后,PI3Kγ被大量激活從而可以調(diào)控多種免疫細胞功能[12];d. PI3Kγ 缺陷小鼠模型表明,敲除PI3Kγ不會造成胚胎致死,但會嚴(yán)重影響小鼠的免疫功能[11,13]。大量研究表明,PI3Kγ 的激活有助于中性粒細胞在感染和炎癥部位聚集,從而釋放大量的趨化因子、炎癥因子及活性氧(ROS)等[14]。PI3Kγ 在其他免疫細胞及其功能中也發(fā)揮著重要作用,例如,趨化單核細胞或巨噬細胞在炎癥部位的遷移、激活及發(fā)育T 淋巴細胞等[11]。此外,在多種小鼠模型中,抑制PI3Kγ 可以有效地治療多種炎癥疾病,包括關(guān)節(jié)炎、紅斑狼瘡、哮喘、肺部炎癥和纖維化等[15-17]。因此,PI3Kγ因其在免疫系統(tǒng)中的重要作用而成為一個極具潛力的抗炎藥物靶點。

    目前已有一些選擇性PI3Kγ報道,其中依加利塞(Eganelisib,IPI-549) 已進入臨床實驗(圖1a)[18]。IPI-549 作為一個腫瘤免疫治療候選化合物,主要用于治療尿路上皮癌、乳腺癌、卵巢癌等腫瘤疾病,迄今沒有IPI-549 用于炎癥治療的報道[19]。目前已有多篇論文綜述了PI3Kγ 抑制劑的開發(fā)情況,其中用于抗炎作用的PI3Kγ抑制劑報道較少[16,20-21]。因此,開發(fā)新型的PI3Kγ抑制劑用于炎癥治療具有廣闊的應(yīng)用前景及臨床意義。然而,目前幾乎所有的PI3Kγ抑制劑都是圍繞其ATP結(jié)合口袋進行藥物設(shè)計[22],即ATP 競爭性抑制劑,由于I型PI3K的高度同源及ATP口袋的保守性,使得開發(fā)選擇性PI3Kγ 抑制劑具有極大的挑戰(zhàn)[23],因此,研究現(xiàn)有抑制劑的選擇性機制將有助于選擇性PI3Kγ 的開發(fā)。本文擬采用IPI-549 作為工具藥物,使用體外炎癥模型評價其抗炎作用,同時利用整合的計算模擬技術(shù)來研究其PI3Kγ的選擇性機制,為抗炎PI3Kγ抑制劑的開發(fā)提供一定的理論基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 IPI-549對RAW264.7細胞活性的影響

    取對數(shù)生長期的小鼠巨噬細胞RAW246.7(購自中科院細胞庫),每孔5 000 個細胞接種至96 孔板,置于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)(37℃,5% CO2)。待細胞貼壁后,加入不同濃度的IPI-549,設(shè)置3 個復(fù)孔,同時設(shè)置空白組和對照組,作用24 h后使用CCK-8檢測細胞活力。

    1.2 IPI-549對PI3K信號通路作用評價

    將處于對數(shù)生長期的RAW264.7 細胞鋪于6 孔板,每孔1.5×106個細胞,加入1 ml 無血清的DMEM 培養(yǎng)基后置于培養(yǎng)箱中饑餓過夜處理(37℃,5% CO2)。提前加入不同濃度(0.1、0.5、1.0 μmol/L) 的IPI-549 (0.5% DMSO) 處理30 min后,加入500 μg/L脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)作用30 min。隨后根據(jù)RIPA 裂解液說明書提取蛋白質(zhì),使用BCA 試劑盒測定蛋白質(zhì)濃度并調(diào)節(jié)至同一濃度水平,加入上樣緩沖液(loading buffer)后在水中煮沸5 min使蛋白質(zhì)充分變性,完成上樣液的制備。上樣等量的樣品,并按照預(yù)制膠的說明書進行電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉、孵育抗體,其中封閉使用5%脫脂奶粉,一抗為磷酸化Akt(p-Akt-S473,1∶1 000稀釋)、總Akt(total-Akt,1∶1 000稀釋)抗體,均購置于Cell Signaling Technology公司。最后采用ECL方法顯色。

    1.3 IPI-549抗炎作用的評價

    使用LPS誘導(dǎo)RAW264.7構(gòu)建炎癥模型。將對數(shù)生長期的RAW246.7 鋪于12 孔板,每孔40 萬個細胞,貼壁后,提前30 min 加入不同濃度的IPI-549 (0.1、 0.5、 1.0 μmol/L), 后加入LPS 500 μg/L,共同作用24 h。按照TRIzol (購自Thermo Scientific)的官方操作提取RNA,之后按照PrimeScriptTMRT Master Mix(Takara)官方操作得到相應(yīng)的cDNA,最后加入已合成的目的基因引物(上海生工),使用SYBRTMSelect Master Mix(Thermo Scientific)按照說明書進行PCR定量,引物序列見表S1。GAPDH作為內(nèi)參,使用2-ΔΔCt法進行相對定量分析。

    1.4 PI3Kγ蛋白及小分子數(shù)據(jù)集準(zhǔn)備

    小分子結(jié)構(gòu)均來自Drew 課題組的文獻報道[24]。IPI-549/PI3Kγ 復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)采自RCSB Protein Data Bank 數(shù)據(jù)庫,PDB ID:6XRL[24]。IPI-549的三維結(jié)構(gòu)直接取自6XRL,其余小分子結(jié)構(gòu)使用Discovery studio 3.5 (DS3.5) 軟件中Sketching 工具繪制,共含有41 個小分子結(jié)構(gòu),其活性數(shù)據(jù)采用文獻報道的IC50值(表S2)。所有小分子使用DS3.5 的Minimize Ligands 工具進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化:賦予CHARMm 力場,采用Smart Minimizer算法進行能量優(yōu)化。優(yōu)化后的40 個小分子(除去IPI-549)組成抑制劑數(shù)據(jù)集(Inhibitors dataset),同時根據(jù)抑制劑數(shù)據(jù)集結(jié)構(gòu),使用DUD-E在線工具(http://dude.docking.org/)生成含有850個小分子的數(shù)據(jù)庫,作為非抑制劑數(shù)據(jù)集(Decoys dataset)。

    1.5 構(gòu)建基于分子共同特征的藥效團模型

    采用 DS3.5 軟件中的 Common Feature Pharmacophore Generation 模塊構(gòu)建基于分子共同特征的藥效團模型(HipHop)。首先,從上述的41個抑制劑集中挑選活性最高的6個小分子來構(gòu)建模型(表S2中*標(biāo)識),設(shè)置其Principal值為2,意為有活性的參考分子。根據(jù)DS3.5默認推薦藥效團特征(Features),選定氫鍵供體(D)、氫鍵受體(A)、疏水中心(H)、正電離子中心(PI)、芳香環(huán)中心(R)。其他參數(shù)設(shè)置如下:Conformation Generation 設(shè)置為Best;MaxOmitFeat 值設(shè)置為0,表示構(gòu)建的藥效團模型所有特征元素都要匹配這6個小分子;其余參數(shù)設(shè)置為默認。

    1.6 構(gòu)建基于受體-配體復(fù)合物的藥效團模型

    使 用 DS3.5 軟 件 中 的 Receptor-ligand Pharmacophore Generation 模塊基于IPI-549/PI3Kγ復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)6XRL 構(gòu)建受體-配體復(fù)合物藥效團模型。首先,采用Prepare Protein 工具進行蛋白質(zhì)優(yōu)化:去除水分子;添加氫鍵及缺失的原子;自動質(zhì)子化;賦予CHARMm立場。隨后,采用優(yōu)化的復(fù)合物結(jié)構(gòu)來構(gòu)建藥效團,復(fù)合物蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)作為Input Receptor,復(fù)合物配體小分子作為Input Ligand, 其余參數(shù)設(shè)置如下: Maximum Pharmacophores 為10; Minimum Features 為3;Maximum Features 為6;模型采用GFA(Genetic Function Approximation)算法進行打分[25]。此外,采用已知活性化合物與非活性化合物對產(chǎn)生的藥效團模型進行驗證:Validation 設(shè)置為True,其中抑制劑數(shù)據(jù)集(Inhibitors dataset) 設(shè)置為Active Ligands,非抑制劑數(shù)據(jù)集(Decoys dataset)設(shè)置為Inactive Ligands。模型采用留一法(Leave-oneout)進行驗證,并使用以下指標(biāo)來進行模型評估:包括敏感性(SE)、特異性(SP)、受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)及對應(yīng)ROC曲線下面積(AUC)值。

    其中TP (true positive) 指真陽性,F(xiàn)N (false negative)指假陰性,TN(true negative)指真陰性,F(xiàn)P(false positive)指假陽性。

    1.7 分子動力學(xué)模擬

    采用6XRL為分子動力學(xué)初始構(gòu)象,首先使用Maestro 中Protein Preparation 模塊進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)備和優(yōu)化:去除水分子,加入氫原子;使用OPLS-2005力場進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化至最小化均方根偏差(RMSD)達到最大值0.3 ?。隨后,使用Desmond軟件進行分子動力學(xué)模擬[26],首先使用System Builder 工具構(gòu)建模擬體系:水盒子設(shè)置為orthorhombic,每個方向截斷值為10 ?;使用TIP3P 水模型;添加Na+中和體系電荷;添加0.15 mol/L 濃度的NaCl 溶液;賦予OPLS-2005 力場[27]。隨后,使用Desmond 軟件默認的Relax model 方法對體系進行優(yōu)化。最后,使用Molecular Dynamics 工具運行動力學(xué)模擬:模擬時間設(shè)置為200 ns;模擬體系設(shè)置為NPT,體系溫度為300 K,壓力為1 bar。分子動力學(xué)模擬完成后,使用Simulation interaction diagram 工具進行結(jié)果分析。

    2 結(jié)果與討論

    2.1 IPI-549具有顯著的抗炎作用

    首先檢測 IPI-549 對RAW264.7 細胞活性的影響,從而篩選出活性實驗的安全濃度。使用不同濃度的IPI-549處理RAW264.7細胞,24 h后檢測細胞活力。圖1b顯示即使在藥物高濃度10 μmol/L作用下,細胞存活率仍達80%以上,表明細胞存活受到較小的影響,而在小于1.25 μmol/L藥物作用下,細胞的存活幾乎沒有影響,表明了IPI-549 較小的細胞毒性作用。使用LPS作用RAW264.7構(gòu)建炎癥細胞模型,圖1c 表明,LPS 可以顯著提升RAW264.7中PI3K通路中Akt的磷酸化水平,而使用不同濃度IPI-549 處理后,Akt473 的磷酸化水平(p-Akt-S473)受到顯著抑制,并呈現(xiàn)劑量依賴關(guān)系。對比空白組發(fā)現(xiàn),0.1 μmol/L的IPI-549即可顯著抑制Akt473 的磷酸化,說明IPI-549 可以有效地抑制炎癥細胞中的PI3K信號通路。

    LPS 刺激RAW264.7 細胞為經(jīng)典的炎癥細胞模型,其特征是LPS的誘導(dǎo)會使得細胞大量釋放炎癥介質(zhì),其中TNF-α、IL-1β 和IL-6 較為典型[28-29]。如圖1d~f 所示,隨著LPS 的誘導(dǎo)刺激,細胞中TNF-α、IL-1β 和IL-6 的轉(zhuǎn)錄水平顯著升高。使用不同濃度IPI-549(0.1、0.5、1.0 μmol/L)作用細胞,可以看到IPI-549 顯著抑制炎癥因子的釋放,并且這種抑制呈現(xiàn)濃度依賴關(guān)系。上述結(jié)果表明,IPI-549 可以通過抑制炎癥細胞中的PI3K 通路來有效地抑制炎癥細胞中炎癥因子的釋放,初步驗證了IPI-549的抗炎作用。

    2.2 基于分子共同特征(HipHop)藥效團的分析

    HipHop 可以提取系列化合物中具有相似活性但結(jié)構(gòu)不同或結(jié)構(gòu)柔性較大分子的共同化學(xué)特征,并探索其中的構(gòu)效關(guān)系[30]。由表1 可知,HipHop共生成10 個藥效團模型。其中HipHop_01 藥效團得分(Rank score)最高,為84.783。“Direct Hit”及“Partial Hit”表示生成的藥效特征與訓(xùn)練集分子匹配情況,1 表示完全匹配,0 表示部分匹配。由表1 可知,HipHop_01 的特征與6 個小分子完全匹配。HipHop_01 擁有6 個藥效團特征,包括了4個疏水特征(H)和2 個氫鍵受體特征(A)(圖2a)。其中,氨基吡唑嘧啶基團對應(yīng)的氫鍵特征尤其關(guān)鍵,其產(chǎn)生的氫鍵作用保證了抑制劑與PI3Kγ蛋白的緊密結(jié)合(圖2b)[31]。

    Table 1 Results of HipHop pharmacophore models

    Fig. 2 Assessment of pharmacophore models

    2.3 受體-配體復(fù)合物藥效團模型分析

    利用IPI-549/PI3Kγ 復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)產(chǎn)生了10個藥效團模型,其結(jié)果匯總于表2。其中,1號及2號藥效團具有較高的選擇性分?jǐn)?shù)(selective score),為9.777。兩者分別產(chǎn)生了5個藥效團特征:1號含有2 個氫鍵供體特征(D),2 個疏水特征(H)及1 個芳香環(huán)中心特征(R);2號含有2 個氫鍵供體特征(D)及3個疏水特征(H)。其余藥效團均含有4 個藥效團特征,且基本都包含氫鍵供體特征(D)及疏水特征(H),表明疏水及氫鍵為PI3Kγ與小分子結(jié)合的重要相互作用。

    Table 2 Results of receptor-ligand pharmacophore models

    選擇性分?jǐn)?shù)通過模型命中DS3.5軟件內(nèi)置化合物庫中的drug-like分子數(shù)來進行評分,因而無法準(zhǔn)確驗證藥效團模型對PI3Kγ抑制劑的篩選能力。因此,為了進一步考察模型區(qū)分抑制劑與非抑制劑的真實能力,使用活性化合物及非活性化合物數(shù)據(jù)集對模型進行驗證(表3)。其中,Sensitivity(SE)代表敏感度,表明模型預(yù)測活性化合物的準(zhǔn)確性;Specificity(SP)代表特異性,表明模型預(yù)測非活性化合物的準(zhǔn)確性,兩者數(shù)值越接近于1表示模型具有較準(zhǔn)確的預(yù)測能力。從表3可以看出,生成的10 個模型SE和SP值具有顯著差距:1號及2號藥效團盡管擁有較高的SP值,但是其SE值偏低,原因是這兩個模型的TP值較低,表明模型不能有效預(yù)測出真實的PI3Kγ活性抑制劑;8~10號藥效團均含有較高的SE值,但其SP值較低,原因是其TN值較低,表明這些模型無法區(qū)分出非活性化合物;3號及4號藥效團具有相對較高的SE及SP值,表明這兩個模型可以較為準(zhǔn)確的區(qū)分PI3Kγ抑制劑及非抑制劑。為了對各模型的區(qū)分能力進行全面的評估,計算了各模型的AUC值(表3),一般認為AUC>0.7,代表模型具有較好的預(yù)測能力。其中,3號模型的AUC值得分最高,為0.875(圖2c),顯示較高的預(yù)測能力,因此選擇3號模型進行進一步分析。根據(jù)表2看出該模型共含有4個藥效團特征:2 個氫鍵供體(D),1 個疏水中心(H),1 個芳香環(huán)中心(R)。將該模型與IPI-549 結(jié)構(gòu)進行疊合分析(圖2d),發(fā)現(xiàn)共軛結(jié)構(gòu)連接的碳原子處具有疏水作用(藍色),表明PI3Kγ 蛋白在此處具有顯著的疏水性。IPI-549 的母核喹唑酮結(jié)構(gòu)處對應(yīng)了芳香環(huán)中心特征(黃色),這個母核結(jié)構(gòu)類似于ATP的嘌呤結(jié)構(gòu),對抑制劑與PI3Kγ的結(jié)合發(fā)揮重要作用[32]。第三個特征對應(yīng)于氨基吡唑嘧啶基團,為氫鍵供體特征(紫色),表明PI3Kγ 在此處易與抑制劑產(chǎn)生氫鍵相互作用,這個結(jié)果與上述HipHop結(jié)果吻合。上述結(jié)果表明,氫鍵及疏水是PI3Kγ蛋白與小分子結(jié)合的關(guān)鍵藥效特征。

    Table 3 Predicted results of receptor-ligand pharmacophore models

    2.4 分子動力學(xué)模擬結(jié)果分析

    為了深入分析IPI-549 與PI3Kγ 的動態(tài)結(jié)合過程并進一步揭示兩者的相互作用機制,將IPI-549/PI3Kγ 復(fù)合物進行了200 ns 動力學(xué)模擬。首先,計算了整個模擬過程中PI3Kγ 蛋白主鏈C 原子及IPI-549結(jié)構(gòu)的均方根偏差值(RMSD)及主鏈C原子的均方根漲落(RMSF)。圖S1a顯示,在體系經(jīng)過100 ns后,RMSD基本沒有顯著波動,表明體系經(jīng)100 ns模擬后已達到平衡。圖S1b顯示,在ATP結(jié)合口袋位置處(氨基酸編號560~720),C原子波動較小,表示IPI-549 與PI3Kγ 蛋白ATP 結(jié)合口袋的氨基酸發(fā)生緊密的結(jié)合。圖3a 顯示了IPI-549 與PI3Kγ活性口袋結(jié)合情況,可以發(fā)現(xiàn)IPI-549中吡唑環(huán)中的氮原子和氨基上的氮原子與Val882 形成關(guān)鍵的氫鍵相互作用,這個結(jié)果與上述藥效團結(jié)果對應(yīng),說明這個氫鍵作用在PI3Kγ與抑制劑結(jié)合的過程中發(fā)揮重要作用。此外,圖3b 顯示IPI-549 的甲基吡唑基團與母核結(jié)構(gòu)喹唑酮基本呈垂直狀態(tài),這個構(gòu)象進一步穩(wěn)定了氫鍵作用。同時甲基吡唑基團由于較長的炔基結(jié)構(gòu),使其深入PI3Kγ蛋白的“選擇性口袋”(圖3b),從而進一步增加抑制劑的PI3Kγ選擇性。除了這些作用,IPI-549中的兩個苯環(huán)與TRP812 和THR887 形成顯著的π-π 相互作用,進一步增加了抑制劑與蛋白的結(jié)合(圖3a)。為了進一步定量分析這些相互作用,本文計算了復(fù)合物結(jié)合過程中重要氨基酸與IPI-549 的結(jié)合作用力。如圖3c 所示,縱坐標(biāo)使用“Interaction Fraction”表示,即配體與氨基酸殘基非鍵相互作用力持續(xù)時間占總作用時間的比例。若分?jǐn)?shù)大于1,表示配體與該氨基酸殘基可能同時具備多個復(fù)合作用力。可以看出,Val882 的氫鍵作用發(fā)揮了最大的能量貢獻。此外,疏水相互作用也發(fā)揮了重要作用,如Met804、Trp812、Ile963等,這個結(jié)果與上述藥效團結(jié)果吻合,也進一步證明了疏水及氫鍵作用在PI3Kγ選擇性結(jié)合中發(fā)揮了重要作用。

    Fig. 3 Molecular dynamics simulation of IPI-549/PI3Kγ complex

    3 結(jié)論

    哮喘、神經(jīng)退行性疾病、心血管慢性疾病等通常伴隨著不同程度的炎癥反應(yīng),大量研究已經(jīng)表明PI3K 相關(guān)信號通路與免疫細胞的生存和功能實現(xiàn)具有密切關(guān)系。隨著PI3K 各亞型生物功能研究的深入,發(fā)現(xiàn)PI3Kγ在免疫系統(tǒng)中起著重要且獨特的作用,從而揭示了PI3Kγ 潛在的炎癥治療成靶性。但是,目前鮮有PI3Kγ 抑制劑用于炎癥治療的研究,從而缺乏PI3Kγ 炎癥治療研究的工具藥物。IPI-549是現(xiàn)已進入臨床研究的PI3Kγ抑制劑,其具有活性強、選擇性高的特點。但是其研究主要集中于腫瘤治療,目前尚沒有抗炎作用的評價。因此,本文采用IPI-549 進行其抗炎作用的初步評價。炎癥細胞模型體外實驗表明,IPI-549 沒有明顯的細胞毒性,IPI-549 可以濃度依賴性地抑制炎癥細胞中PI3K 信號通路,從而有效地抑制LPS 誘導(dǎo)的巨噬細胞中炎癥因子TNF-α、IL-1β、IL-6 的釋放。上述實驗表明,IPI-549 可以通過抑制炎癥細胞中PI3K 信號通路來抑制炎癥因子的釋放,從而初步驗證了PI3Kγ 抑制劑在炎癥治療方面的潛在作用,也證明了IPI-549 可以作為PI3Kγ 抑制劑炎癥治療的有效工具藥物。

    隨后使用計算機模擬技術(shù)對IPI-549 的PI3Kγ選擇性機制進行進一步研究。通過分別構(gòu)建基于PI3Kγ小分子抑制劑及PI3Kγ蛋白大分子的藥效團,發(fā)現(xiàn)疏水及氫鍵作用在抑制劑與PI3Kγ結(jié)合過程中發(fā)揮主要作用。動力學(xué)模擬的結(jié)果進一步驗證了藥效團特征:Val882產(chǎn)生的氫鍵作用保證了抑制劑與PI3Kγ 的高效結(jié)合;Met804、Trp812、Ile963 等關(guān)鍵氨基酸提供了顯著的疏水作用;IPI-549 的甲基吡唑基團可以進一步深入PI3Kγ 的“選擇性口袋”位置,從而進一步提高IPI-549 的PI3Kγ 選擇性。上述構(gòu)效關(guān)系研究可以為新型PI3Kγ抑制劑的開發(fā)提供一定的指導(dǎo)作用。

    附件見本文網(wǎng)絡(luò)版(http://www.pibb.ac.cn或http://www.cnki.net):

    PIBB_20220529_ Figure S1.pdf

    PIBB_20220529_Table S1.pdf

    PIBB_20220529_Table S2.pdf

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