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    lnc-NONHSAT074080調(diào)控靶基因ARL6IP4參與RA-UIP發(fā)病的機制研究

    2023-02-09 10:51:50劉媛魯芙愛王樂楊有國李小芬肖運平
    天津醫(yī)藥 2023年1期
    關(guān)鍵詞:信息學肺纖維化全血

    劉媛,魯芙愛,王樂,楊有國,李小芬,肖運平

    類風濕關(guān)節(jié)炎(RA)是一種以關(guān)節(jié)侵蝕破壞為主要特征的系統(tǒng)性自身免疫病,間質(zhì)性肺疾病(ILD)是RA最常見的系統(tǒng)受累表現(xiàn),也是導致RA患者死亡的主要原因[1]。普通型間質(zhì)性肺炎(UIP)是RAILD 常見的病理類型之一,以肺組織結(jié)構(gòu)明顯破壞和廣泛纖維化為特征,與特發(fā)性肺纖維化的表現(xiàn)和預后相似,是RA-ILD預后較差的病理類型[2]。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是長度大于200 個核苷酸的非編碼RNA,參與細胞分化、免疫調(diào)控、組織纖維化等重要的生物學功能,從多層面調(diào)控基因的表達,參與疾病發(fā)生發(fā)展,為近年來的研究熱點。lncRNA的表達或功能障礙與遺傳性疾病、自身免疫性疾病及腫瘤密切相關(guān)[3-4]。lncRNA 在多種纖維化組織中存在特異性的表達譜,被認為是纖維化的功能調(diào)節(jié)器,某些差異表達的lncRNA 在肺纖維化的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要的調(diào)控功能[5]。然而,lncRNA 在RA-UIP發(fā)病中的具體作用及機制尚不清楚。本研究通過基因芯片篩選RA-UIP 患者全血中表達上調(diào)的lncRNA,并采用實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qPCR)檢測驗證,同時從細胞水平驗證目標lncRNA與肺纖維化的關(guān)系,在肺纖維化進程中的作用及調(diào)控的靶基因,探討其在RA-UIP發(fā)病中的作用。

    1 對象及方法

    1.1 研究對象及分組 選取2019年1—12月就診于包頭醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院的RA 患者8 例,按是否合并UIP 分為RA肺纖維化組(4例),平均(59.25±1.26)歲;RA對照組(4例),平均(59.75±0.96)歲,2組年齡差異無統(tǒng)計學意義(t=0.298,P>0.05),男女比例均為1∶3。納入標準:(1)RA 診斷滿足2010年美國風濕病學會和歐洲抗風濕病聯(lián)盟提出的RA 分類標準。(2)合并UIP 的患者滿足2011 美國胸科學會和歐洲呼吸學會提出的UIP 分級診斷標準。排除標準:(1)有慢性疾病史。(2)合并其他結(jié)締組織病。(3)非初次治療的RA。(4)合并除肺臟外的其他重要臟器系統(tǒng)損害。(5)行肺組織活檢。本研究通過包頭醫(yī)學院倫理委員會審批并獲得研究對象知情同意。

    1.2 材料 RNA 提取試劑盒購自德國Qiagen 公司;體外轉(zhuǎn)錄試劑盒購自美國Ambion 公司;基因片段和標記試劑盒購自美國Affymetrix 公司;SYBR Green 熒光定量反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自日本TAKARA 公司;人腎上皮細胞系(293T)購自美國ATCC;人胚肺成纖維細胞購自中國科學院細胞庫;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清、細胞凍存液及胰酶-乙二胺四乙酸(EDTA)購自美國Gibico;Lipofectamine 2000 轉(zhuǎn)染試劑購自美國Invitrogen 公司;轉(zhuǎn)化生長因子(TGF)-β1 重組蛋白購自美國Selleck 公司;CCK-8 試劑盒購自廣州賽國生物科技有限公司;小鼠抗人α平滑肌肌動蛋白(α-SMA)一抗及羊抗鼠二抗購自美國Sigma-Aldrich 公司;Affymetrix Clariom D 基因芯片檢測和引物設(shè)計委托南寧友田生物科技有限公司;lnc-NONHSAT074080短發(fā)卡RNA(shRNA)慢病毒載體構(gòu)建由南京臨度醫(yī)療科技有限公司構(gòu)建;Ⅰ型膠原和纖連蛋白酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA)試劑盒購自廈門侖昌碩生物科技有限公司。Affymetrix雜交爐、GeneChip Scanner 3000激光掃描儀和Affymetrix Fluidics Station 450 洗脫站均購自美國Affymetrix公司;qPCR儀7500購自美國ABI公司;二氧化碳培養(yǎng)箱購自美國Thermo公司;低溫冷凍離心機購自德國HERMLE公司;酶標儀購自美國Molecular Devices 公司;流式細胞儀購自美國BD公司。

    1.3 方法

    1.3.1 Affymetrix Clariom D 基因芯片檢測差異基因及生物信息學分析 在確診后未開始治療前,收集研究對象的全血樣本3 mL。提取全血總RNA 并質(zhì)檢(保證RNA 的起始質(zhì)量濃度達到17 mg/L,且RNA無明顯降解和樣本污染)。取質(zhì)檢合格的250 ng 總RNA 用配套的體外轉(zhuǎn)錄試劑盒制備生物素標記的cDNA 樣品,將5.5 μg cDNA 樣品于雜交爐中45 ℃條件下滾動雜交16 h,Affymetrix Fluidics Station 450 將芯片進行洗脫、染色后采用GeneChip Scanner 3000 掃描儀進行掃描,然后由Affymetrix GeneChip Command Console(AGCC)讀取其數(shù)據(jù),采用Gene Spring軟件(安捷倫科技有限公司)進行生物信息學分析。

    1.3.2 qPCR檢測上調(diào)lncRNA的表達 選取2組基因芯片比較分析中基因表達差異倍數(shù)>2的10個lncRNA,設(shè)計特異性引物,引物序列見表1。采用Trizol-RNA 提取試劑盒提取患者全血中的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,以此為模板采用SYBR Green 相對定量法進行qPCR 驗證,反應(yīng)條件:95 ℃預變性2 min;95 ℃10 s,55 ℃15 s,72 ℃15 s,共40 個循環(huán)。選擇qPCR 驗證后,RA 肺纖維化組lncRNA 的表達高于RA 對照組,且在生物信息學分析中發(fā)現(xiàn)的與肺纖維化進程相關(guān)的lncRNA進行后續(xù)實驗。

    1.3.3 熒光素酶標記實驗 將lnc-NONHSAT074080結(jié)合序列克隆到表達載體pcDNA3.1 上,構(gòu)建表達質(zhì)粒;靶基因ARL6IP4 的mRNA 3'-UTR 的片段插入到報告載體psiCHECK2,構(gòu)建報告質(zhì)粒。將空載體、lnc-NONHSAT074080表達質(zhì)粒和ARL6IP4報告質(zhì)粒轉(zhuǎn)染人腎上皮細胞系細胞,分為空載體對照組、pCDNA3.1+ARL6IP4-psiCHECK2 負對照組,pCDNA3.1-NONHSAT074080+psiCHECK2 組及pCDNA3.1-NONHSAT074080+ARL6IP4-psiCHECK2組。各組細胞培養(yǎng)48 h后,收集細胞加入細胞裂解液,按照熒光素酶檢測試劑盒的操作說明分別加入各檢測試劑,使用酶標儀讀取各組細胞海腎和螢火蟲熒光強度,以海腎熒光值作為內(nèi)參,計算各組細胞熒光素酶活性的比值。

    Tab.1 Primer sequence of lncRNA表1 長鏈非編碼RNA的引物序列

    1.3.4 人胚肺成纖維細胞的培養(yǎng)及處理 人胚肺成纖維細胞系復蘇培養(yǎng)后以3×106個/mL的密度接種于培養(yǎng)瓶中,37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。24 h后換液,除去未貼壁的細胞及細胞碎片,每2~3 d換液1次。待細胞匯合成片后,傳代及鑒定。

    1.3.5 lnc-NONHSAT074080 shRNA 質(zhì)粒載體的構(gòu)建及細胞轉(zhuǎn)染 針對NONHSAT074080 基因的cDNA 序列設(shè)計shRNA,并構(gòu)建NONHSAT074080 shRNA慢病毒載體,轉(zhuǎn)染人胚肺成纖維細胞,熒光顯微鏡鑒定轉(zhuǎn)染效率,qPCR 檢測NONHSAT074080 的基因表達。lnc-NONHSAT074080 shRNA 轉(zhuǎn)染效率和沉默效果驗證后,將人胚肺成纖維細胞分為空白對照組(未處理)、TGF-β1 組(細胞饑餓24 h,給予5 μg/L TGF-β1)、TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組(5 μg/L TGF-β1處理后給予lnc-NONHSAT074080 shRNA轉(zhuǎn)染48 h),收集細胞及上清液。

    1.3.6 CCK-8 法檢測細胞增殖能力 將人胚肺成纖維細胞以3×103個/孔的密度接種在96 孔板中,每孔100 μL,每組3個復孔,置于常規(guī)培養(yǎng)箱孵育,細胞融合度達80%時,根據(jù)1.3.5分組進行干預,在干預0、24、48、72及96 h后,每孔加入10 μL CCK-8 試劑后繼續(xù)孵育細胞2 h,在450 nm 波長處測定其光密度值,檢測不同時間點人胚肺成纖維細胞增殖水平。

    1.3.7 細胞免疫熒光檢測α-SMA的表達 將人胚肺成纖維細胞以1×104個/孔密度轉(zhuǎn)移至6 孔板制成細胞爬片,當細胞生長密度達到約50%時,除去培養(yǎng)基,磷酸鹽緩沖液清洗后加入1 mL 預冷的95%乙醇置于-20 ℃固定;吸除乙醇,每孔加入1 mL 5%胎牛血清蛋室溫封閉20 min;加α-SMA一抗室溫孵育60 min;PBS 清洗后加入含標記的羊抗小鼠二抗,5%BSA-PBS室溫避光孵育2 h;PBS清洗3次;避光環(huán)境下加入適量6-聯(lián)脒-2'-苯基吲哚(DAPI)染色1 min;甘油封片,共聚焦熒光顯微鏡下觀察α-SMA的表達。

    1.3.8 qPCR 檢測lnc-NONHSAT074080 及ARL6IP4 的mRNA表達 根據(jù)1.3.5分組對人胚肺成纖維細胞進行干預,收集細胞,Trizol-RNA 提取試劑盒提取細胞的總RNA,參照1.3.2 中的qPCR 檢測方法檢測lnc-NONHSAT074080 及ARL6IP4 的mRNA 表達水平。lnc-NONHSAT074080 及ARL6IP4的引物序列見表1。

    1.3.9 ELISA 測定Ⅰ型膠原及纖連蛋白的表達 將各組人胚肺成纖維細胞以1×104個/孔的密度接種于6 孔板中,細胞貼壁后,繼續(xù)培養(yǎng)24 h,1 000 r/min 離心10 min,取各組細胞上清液。在Ⅰ型膠原及纖連蛋白抗體預包被的酶標板反應(yīng)孔中依次加入標準品、對照品和樣品(50 μL/孔),室溫孵育2 h;加100 μL 酶結(jié)合物工作液,室溫避光孵育20 min;加入50 μL 終止液終止反應(yīng)。使用酶標儀在450 nm 測定光密度值,計算Ⅰ型膠原及纖連蛋白的蛋白表達水平。每組重復3次。

    1.4 統(tǒng)計學方法 采用SPSS 17.0 軟件進行數(shù)據(jù)分析,符合正態(tài)分布的計量資料以均數(shù)±標準差(±s)表示,2 組間的比較采用t檢驗;多組間比較采用單因素方差分析,組間多重比較時若方差齊采用LSD-t法,方差不齊采用Tamhane法;不同時間點的多組比較采用重復測量的方差分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

    2 結(jié)果

    2.1 RA-UIP 疾病相關(guān)lncRNA 的篩選和生物信息學分析 基因芯片檢測發(fā)現(xiàn),與RA對照組相比,RA肺纖維化組患者存在192 個上調(diào)表達的lncRNA(差異倍數(shù)>1.1,P<0.05),見圖1。

    Fig.1 Upregulated lncRNA in whole blood in the two groups圖1 2組患者全血中表達上調(diào)的lncRNA

    2.2 qPCR 驗證差異lncRNA 與RA 對照組相比,RA 肺纖維化組lncRNA NONHSAT074080、NONHSAT071210、NONHSAT047350、NONHSAT101272、DPYD-IT1 及NONHSAT082317 的mRNA 表達明顯升高(P<0.05),而RP11-158I9.5.1-2:1、RP11-326I11.5、TMEM140-1:1及NONHSAT115197在2組間差異無統(tǒng)計學意義,見表2。

    2.3 lnc-NONHSAT074080 的生物信息學分析 對上述結(jié)果中qPCR驗證的6個在RA肺纖維化組高表達的lncRNA進行生物信息學分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與纖維化生物學功能相關(guān)的為lnc-NONHSAT074080,見圖2;lnc-NONHSAT074080 可能作用的靶基因包括ARL6IP4,且為上調(diào)靶基因,見圖3;lnc-NONHSAT074080 可能通過分裂原激活蛋白激酶(MAPK)、信號轉(zhuǎn)導子和激活因子(STAT)等信號通路發(fā)揮作用,見圖4。

    Fig.2 Bioinformatics analysis showing biological function of lnc-NONHSAT074080圖2 生物信息學分析lnc-NONHSAT074080的生物學功能

    2.4 lnc-NONHSAT074080 對靶基因ARL6IP4 的調(diào)控作用 熒光素酶基因報告顯示,空載體對照組、pCDNA3.1+ARL6IP4-psiCHECK2 負對照組、pCDNA 3.1-NONHSAT074080+psiCHECK2 組 和 pCDNA 3.1-NONHSAT074080+ARL6IP4-psiCHECK2 組ARL6IP4 的熒光表達量分別為1.491±0.066、0.931±0.027、1.493±0.009 和1.149±0.039,差異有統(tǒng)計學意義(n=3,F(xiàn)=172.570,P<0.05)。與空載體對照組相比,pCDNA3.1+ARL6IP4-psiCHECK2 負對照組ARL6IP4 的熒光表達量明顯降低(P<0.05);pCDNA3.1-NONHSAT074080+psiCHECK2組ARL6IP4 的熒光表達量較pCDNA3.1+ARL6IP4-psiCHECK2負對照組升高(P<0.05)。

    Tab.2 Comparison of upregelated lncRNA expressions in whole blood between the two groups of patients表2 2組患者全血中上調(diào)表達的lncRNA表達水平比較(n=4,±s)

    Tab.2 Comparison of upregelated lncRNA expressions in whole blood between the two groups of patients表2 2組患者全血中上調(diào)表達的lncRNA表達水平比較(n=4,±s)

    *P<0.05,**P<0.01。

    組別RA對照組RA肺纖維化組t NONHSAT074080 1.000±0.002 6.108±2.180 2.343*NONHSAT071210 1.000±0.317 2.447±0.212 6.097**RP11-158I9.5.1-2:1 1.000±0.054 0.637±0.162 2.239 NONHSAT047350 1.000±0.253 3.868±0.728 3.911**NONHSAT101272 1.000±0.002 2.885±0.517 3.646**組別RA對照組RA肺纖維化組t RP11-326I11.5 1.000±0.003 3.396±1.487 1.611 DPYD-IT1 1.000±0.006 2.418±0.447 3.172*TMEM140-1:1 1.000±0.065 3.453±1.300 1.886 NONHSAT115197 1.000±0.012 1.341±0.207 1.649 NONHSAT082317 1.000±0.004 2.099±0.237 4.643**

    2.5 lnc-NONHSAT074080 對人胚肺成纖維細胞增殖的影響 與空白對照組相比,TGF-β1組細胞增殖水平在干預24、48、72 和96 h 后升高(P<0.05);與TGF-β1 組相比,TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組細胞增殖能力在干預48、72 及96 h 后明顯下降(P<0.05),見表3。

    2.6 lnc-NONHSAT074080 對α-SMA 表達的影響 免疫熒光結(jié)果顯示,與空白對照組相比,TGFβ1 組α-SMA 的熒光表達升高;但TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA 組與TGF-β1 組相比,α-SMA的熒光表達明顯減少,見圖5。

    2.7 lnc-NONHSAT074080 及ARL6IP4 與纖維化的關(guān)系 與空白對照組相比,TGF-β1組的人胚肺成纖維細胞中l(wèi)nc-NONHSAT074080 及ARL6IP4 mRNA表達水平明顯升高(P<0.05);TGF- β1+NONHSAT074080 shRNA 組lnc-NONHSAT074080和ARL6IP4 mRNA 表達水平較TGF-β1 組明顯降低(P<0.05),見表4。

    2.8 lnc-NONHSAT074080 對纖維化進程相關(guān)因子表達的影響 ELISA結(jié)果顯示,TGF-β1組Ⅰ型膠原

    Fig.3 bioinformatics analysis showing possible target gene of lnc-NONHSAT074080圖3 生物信息學分析lnc-NONHSAT074080可能調(diào)控的靶基因

    Fig.4 Boinformatics analysis showing signal pathways of lnc-NONHSAT074080圖4 生物信息學分析lnc-NONHSAT074080作用相關(guān)的信號通路

    Tab.3 The proliferation of different interventions in human embryonic lung fibroblasts at different time points表3 不同處理組人胚肺成纖維細胞各時間點的增殖水平(n=3,±s)

    Tab.3 The proliferation of different interventions in human embryonic lung fibroblasts at different time points表3 不同處理組人胚肺成纖維細胞各時間點的增殖水平(n=3,±s)

    *P<0.05,**P<0.01;a與空白對照組比較,b與TGF-β1組比較,P<0.05;F時間=915.877*,F(xiàn)組間=60.625*,F(xiàn)交互=27.388*。

    組別空白對照組TGF-β1組TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組F 0 h 0.063±0.009 0.061±0.006 0.059±0.005 0.524 24 h 0.496±0.034 0.689±0.010a 0.804±0.018 51.234**48 h 0.844±0.040 0.975±0.012a 0.739±0.113b 63.895**72 h 1.088±0.019 1.336±0.016a 1.065±0.025b 39.174**96 h 1.183±0.091 1.528±0.055a 1.098±0.025b 28.110**

    Fig.5 The expression of α-SMA in human embryonic lung fibroblasts treated with different interventions(×400,rhodamine dying)圖5 不同處理組人胚肺成纖維細胞中α-SMA的表達(×400,四乙基羅丹明染色)

    和纖連蛋白的表達高于空白對照組(P<0.05);與TGF-β1 組比較,TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組Ⅰ型膠原和纖連蛋白明顯降低(P<0.05),見表5。

    Tab.4 Comparison of lnc-NONHSAT074080 and ARL6IP4 gene expression between the three groups表4 各組lnc-NONHSAT074080及ARL6IP4基因表達水平(n=3,±s)

    Tab.4 Comparison of lnc-NONHSAT074080 and ARL6IP4 gene expression between the three groups表4 各組lnc-NONHSAT074080及ARL6IP4基因表達水平(n=3,±s)

    *P<0.05,**P<0.01;a與空白對照組比較,b與TGF-β1 組比較,P<0.05。

    組別空白對照組TGF-β1組TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組F lnc-NONHSAT074080 1.000±0.072 3.617±0.150a 1.676±0.177ab ARL6IP4 1.000±0.039 1.862±0.080a 1.072±0.131b 72.644**32.106*

    Tab.5 Comparison of the expression levels of type I collagen and fibronectin between the three groups表5 各組I型膠原和纖連蛋白表達水平比較(n=3,μg/L,±s)

    Tab.5 Comparison of the expression levels of type I collagen and fibronectin between the three groups表5 各組I型膠原和纖連蛋白表達水平比較(n=3,μg/L,±s)

    **P<0.01;a與空白對照組比較,b與TGF-β1組比較,P<0.05。

    組別空白對照組TGF-β1組TGF-β1+NONHSAT074080 shRNA組F I型膠原2.490±0.098 7.008±0.344a 3.160±0.081ab 132.528**纖連蛋白22.906±1.688 40.517±1.978a 23.058±1.505b 34.056**

    3 討論

    肺纖維化是RA-UIP 的主要特征,剖析纖維化發(fā)生發(fā)展相關(guān)的致病因素是深入研究RA-UIP 發(fā)病機制的關(guān)鍵。近年來,隨著非編碼RNA在肺纖維化發(fā)病中的研究不斷深入,lncRNA在纖維化進程中的作用也開始受到關(guān)注[6]。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA ZFAS1在博來霉素誘導的肺纖維化小鼠肺組織及TGF-β1誘導的人胚肺成纖維細胞中高表達,且通過調(diào)控miR-150-5p/SLC38A1 軸發(fā)揮作用[7]。lncRNA AK088388和AK081523在博來霉素誘導的肺纖維化小鼠體內(nèi)高表達,并作用于miR-29b-3p 和let-7i-5p,調(diào)控N4bp2 和plxna4 基因的表達參與肺纖維化的發(fā)病[8];lncRNA CHRF 作用于miR-489 促進二氧化硅誘導的肺纖維化,miR-489 在肺纖維化小鼠巨噬細胞和TGF-β1 處理的成纖維細胞中的表達減低,通過調(diào)控靶基因MyD88 及Smad3 參與肺纖維化的發(fā)病[9];lncRNA uc.77 及l(fā)ncRNA 2700086A05Rik調(diào)節(jié)肺泡上皮的間質(zhì)轉(zhuǎn)化,在肺纖維化的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用[10]。本研究收集RA-UIP 和RA 無ILD 的患者全血,以Affymetrix 基因芯片技術(shù)篩選差異表達的lncRNA,發(fā)現(xiàn)RA-UIP 患者全血中存在192 個上調(diào)表達的lncRNA,選擇上調(diào)表達較明顯的lncRNAs 進行PCR 驗證,發(fā)現(xiàn)與RA 無ILD 的患者相比,lnc-NONHSAT074080 在RA 肺纖維化組患者全血中的表達明顯升高,且生物信息學關(guān)于功能分析提示qPCR 驗證的6 個高表達的lncRNAs 中,lnc-NONHSAT074080與纖維化進程相關(guān)。同時,體外實驗采用TGF-β1 誘導肺成纖維細胞的纖維化進程,發(fā)現(xiàn)人胚肺成纖維細胞經(jīng)TGF-β1 誘導后,lnc-NONHSAT074080表達較空白對照組明顯升高,人胚肺成纖維細胞的增殖水平、肌成纖維細胞標志物α-SMA水平及纖維化進程相關(guān)的Ⅰ型膠原和纖連蛋白的表達水平也明顯升高。為進一步證實lnc-NONHSAT074080在纖維化進程中的作用,筆者構(gòu)建lnc-NONHSAT074080 shRNA 慢病毒載體轉(zhuǎn)染人胚肺成纖維細胞,體外沉默lnc-NONHSAT074080 表達,發(fā)現(xiàn)與TGF-β1誘導后相比,人胚肺成纖維細胞的增殖水平明顯下降,肌成纖維細胞標志物α-SMA表達降低,纖維化進程相關(guān)的Ⅰ型膠原和纖連蛋白的表達也明顯下降,進一步證實了lnc-NONHSAT074080與纖維化進程的關(guān)系。

    ARL6IP4 是Ras 家族的成員,可調(diào)控細胞凋亡[11]。目前關(guān)于ARL6IP4 功能的研究較少,尤其是ARL6IP4在纖維化進程中的作用尚不清楚。本研究通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn)ARL6IP4 可能是lnc-NONHSAT074080 調(diào)控的靶基因之一。進一步驗證發(fā)現(xiàn)lnc-NONHSAT074080 表達載體上調(diào)ARL6IP4基因的熒光素酶報告基因表達水平,沉默lnc-NONHSAT074080 后人胚肺成纖維細胞中ARL6IP4 mRNA表達水平下調(diào),且TGF-β1誘導肺成纖維細胞中ARL6IP4 的mRNA 表達升高,提示lnc-NONHSAT074080 調(diào)控靶基因ARL6IP4 的表達,參與肺成纖維細胞的纖維化進程。

    MAPK 信號通路和PPAR 信號通路是細胞內(nèi)的主要信息傳導系統(tǒng),在肺纖維化發(fā)病中發(fā)揮重要作用[12-13]。在肺炎癥/纖維化進程中,氧化磷酸化信號轉(zhuǎn)導參與了肺成纖維細胞的纖維化進程,與間質(zhì)性肺疾病發(fā)病相關(guān)[14]。MAPK 下游的轉(zhuǎn)錄因子被激活,如核因子κB(NF-κB)、激活蛋白-1(AP-1)及信號轉(zhuǎn)導子和轉(zhuǎn)錄激活子(STAT)等,這些活化的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控一系列纖維化相關(guān)基因的表達,最終導致纖維化的產(chǎn)生[15-16]。筆者利用生物信息學對RAUIP 患者上調(diào)的差異lncRNA 基因進行功能和信號通路分析,發(fā)現(xiàn)這些表達上調(diào)lncRNA 可能與PPAR信號通路和氧化磷酸化有關(guān),同時,對lnc-NONHSAT074080 的生物信息學分析也同樣發(fā)現(xiàn)與MAPK信號通路和下游的STAT信號轉(zhuǎn)導有關(guān),具體的信號轉(zhuǎn)導機制有待深入研究。

    本研究發(fā)現(xiàn)RA-UIP 患者全血中l(wèi)nc-NONHSTAT074080 高表達,且 lnc-NONHSTAT074080 調(diào)節(jié)肺成纖維細胞的增殖及纖維化相關(guān)因子的表達;ARL6IP4 是 lnc-NONHSTAT074080 作用的靶基因,lnc-NONHSTAT074080 與纖維化相關(guān)信號通路MAPK、STAT 可能存在一定的關(guān)系。本研究對lnc-NONHSTAT074080在RA-UIP 發(fā)病中的作用進行初步分析,為更全面闡釋其發(fā)病機制并尋找有效的治療靶點提供實驗依據(jù)。

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