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    優(yōu)化乳桿菌高產(chǎn)共軛亞油酸的研究進(jìn)展

    2022-11-22 07:03:42成曉艷張丁潔田艾迪陳佳璐陳瑩瑩
    中國食品學(xué)報(bào) 2022年10期
    關(guān)鍵詞:酸乳高產(chǎn)桿菌

    成曉艷,張丁潔,田艾迪,劉 瑛,陳佳璐,陳瑩瑩,洛 雪

    (沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)食品學(xué)院 沈陽 110866)

    共軛亞油酸 (Conjugated linoleic acid,CLA)是亞油酸(Linoleic acid,LA)的一組位置和空間異構(gòu)體的總稱,近年來,大量研究報(bào)道CLA 具有抗癌、抗動脈硬化癥、減肥、提高機(jī)體免疫等功效[1-2]。人們最早了解亞油酸異構(gòu)酶(LAI)是通過反芻動物瘤胃溶纖丁酸弧菌 (Butyfivibfio flbfisolvens)中的LAI 將LA 催化為CLA[3-4]。在CLA 異構(gòu)體中,真正具有生理活性的只有順-9,反-11 和反-10,順-12-CLA 兩種[5-6],其結(jié)構(gòu)式如圖1所示。由于瘤胃溶纖丁酸弧菌在多不飽和脂肪酸生物氫化的過程中產(chǎn)生的cis-9,trans-11 CLA 較少,因此探究如何提高CLA 的產(chǎn)量成為研究重點(diǎn)。

    圖1 c9,t11-CLA 和t10,c12-CLA 結(jié)構(gòu)式Fig.1 Structures of c9,t11-CLA and t10,c12-CLA

    工業(yè)上合成CLA 的方法大多采用化學(xué)合成法和生物合成法?;瘜W(xué)合成法操作簡捷,產(chǎn)量較高,然而生產(chǎn)得到的產(chǎn)物多為混合物,存在多種CLA 的異構(gòu)體,分離純化相對困難,且含有有毒物質(zhì),對食品工業(yè)造成負(fù)面影響[7]。許多科學(xué)家致力于研究生物合成法生產(chǎn)CLA。LAI 具有專一性,在LAI 催化下,LA 的轉(zhuǎn)化程度遠(yuǎn)高于其它脂肪酸。動物瘤胃溶纖丁酸弧菌、植物乳桿菌、嗜酸乳桿菌、德氏乳桿菌、保加利亞乳桿菌及痤瘡丙酸桿菌等細(xì)菌能夠使游離的LA 轉(zhuǎn)化為CLA,在培養(yǎng)基中加入底物L(fēng)A,可顯著提高CLA 的轉(zhuǎn)化率。如表1所示,不同類型菌種的底物及其添加量各不相同,合成CLA 的能力也不同。

    表1 不同類型菌種合成CLA 的能力Table 1 The ability of different types of strains to synthesize CLA

    雖然生物法能夠合成單一的CLA,作用條件溫和,但是其產(chǎn)量還是比較低,而且不同的菌株對應(yīng)不同的反應(yīng)機(jī)制,因此優(yōu)化產(chǎn)LAI 的條件是高產(chǎn)CLA 的重要途徑[8]。本文概述了近年來利用誘變技術(shù)及基因工程技術(shù)生產(chǎn)和改造LAI,進(jìn)而提高CLA 含量的相關(guān)研究。

    1 利用物理方法提高CLA 的產(chǎn)量

    在多數(shù)研究中,通過自然方法篩選獲得的菌株,產(chǎn)LAI 能力有限,因此利用如誘變技術(shù)來提高菌株產(chǎn)酶能力是常用的方法[9]。紫外誘變(Ultraviolet mutagenesis,UV mutagenesis)、低溫等離子體誘變(Low temperature plasma mutagenesis)、常溫常壓等離子體誘變 (Atmospheric and room temperature plasma,ARTP)等技術(shù),可誘變LAI 產(chǎn)生菌,促使菌株高產(chǎn)LAI,從而提高CLA 的轉(zhuǎn)化率,并對該誘變菌株產(chǎn)酶條件進(jìn)行相應(yīng)優(yōu)化,提高CLA 產(chǎn)量。

    1.1 紫外或微波誘變

    紫外線在260 nm 波長下的輻射致死量最優(yōu),紫外誘變在微生物菌種的誘變研究中較常見,也是應(yīng)用較為廣泛的方法[10]。紫外輻射可以引起堿基轉(zhuǎn)換、顛倒互換、移碼突變或缺失。紫外線能量低,對遺傳物質(zhì)造成的傷害小,同時(shí),操作方法簡單安全,誘變效率較高,而且誘變后產(chǎn)生的突變性狀在無光照條件下不容易恢復(fù),因此紫外誘變技術(shù)較廣泛地應(yīng)用于菌種誘變研究[11]。微波誘變是一種低能電磁輻射,它能夠?qū)ι矬w產(chǎn)生熱效應(yīng)和非熱效應(yīng),引起生物體局部溫度上升,產(chǎn)生生化反應(yīng)的便是熱效應(yīng);而非熱效應(yīng)產(chǎn)生的生理生化反應(yīng)與溫度無關(guān)[12]。

    近些年,關(guān)于紫外線誘變,崔瑋等[13]以嗜酸乳桿菌為出發(fā)菌株,經(jīng)15 W 紫外線2 次誘變,得到1 株CLA 高產(chǎn)菌株,對其發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化后,誘變菌株酶活比原始菌株提高了1.51 倍;對培養(yǎng)基的產(chǎn)酶條件進(jìn)行優(yōu)化后,酶活提高了1.1 倍。曹健等[14]采用紫外誘變,在35 ℃,pH 4.0 條件下,保溫48 h,CLA 的產(chǎn)率達(dá)38.1%,之后用超聲波處理細(xì)胞后,CLA 的產(chǎn)率也有顯著提高。此外,柯薇等[15]采用微波間歇誘變的物理誘變方法以乳酸桿菌為出發(fā)菌株,經(jīng)誘變后,篩選得到5 株正突變菌株,其中CLA 產(chǎn)量最高為L4,較誘變前提高了41.4%。

    綜上,經(jīng)過適當(dāng)條件的紫外線誘變,可有效提高出發(fā)菌株產(chǎn)CLA,LAI 酶活也相對提高,并且利用超聲波、微波進(jìn)行微生物誘變,對LAI 活性也有較明顯的提高效果。

    1.2 等離子體誘變

    等離子體誘變是近年來新興的誘變技術(shù),在誘變育種過程中采用等離子體誘變的方法,既解決了化學(xué)誘變高污染和突變單一等缺點(diǎn),又彌補(bǔ)了物理誘變遺傳不穩(wěn)定,突變率不高等缺陷。而且與離子注入誘變法相比,等離子體誘變技術(shù)不會因真空產(chǎn)生的低溫或由離子束產(chǎn)生的高溫而使細(xì)胞失活,該誘變技術(shù)可以在較大程度上提高細(xì)胞存活率及誘變效率[16]。在微生物的誘變應(yīng)用中,主要有低溫等離子誘變和常溫常壓等離子誘變[17-18]。

    1.2.1 低溫等離子體誘變 低溫等離子體誘變技術(shù)是通過中性活性粒子來改變微生物遺傳特性的,可直接改變核苷酸水平的分子結(jié)構(gòu),也可作用于細(xì)胞而間接影響胞內(nèi)遺傳物質(zhì)[19-20]。如孫麗慧等[21]從東北酸菜汁中獲得菌株SC-05,經(jīng)低溫等離子體處理后,篩選得到突變株A-08,其CLA 產(chǎn)量達(dá)到119.24 μg/mL,比出發(fā)菌株增加了83.0%,經(jīng)傳代培養(yǎng)后突變株A-08 的遺傳性狀具有較好的穩(wěn)定性。隨后王慶山[22]將突變株A-08 的培養(yǎng)基利用單因素及響應(yīng)面法進(jìn)行發(fā)酵條件優(yōu)化,產(chǎn)量增加了64.60%,發(fā)酵罐采用批式發(fā)酵和批式流加發(fā)酵的方式進(jìn)行培養(yǎng),CLA 的產(chǎn)量達(dá)到了213.26 μg/mL。由此可見,采用LTP 誘變出發(fā)菌株,改變其遺傳特性,并將其培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,最終得到的CLA 產(chǎn)量顯著提高。

    1.2.2 常溫常壓等離子體誘變 ARTP 誘變作為新的誘變技術(shù),已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于真菌、細(xì)菌、微藻等微生物的基因改良[23-25],ARTP 工作溫度低、操作簡單、成本低、安全無毒,而且誘變效率高于常見的誘變方法,比如紫外線輻射或化學(xué)誘變劑誘變。與其它誘變方法相比,ARTP 突變具有更大的DNA 損傷和更高的突變率,且突變菌株遺傳穩(wěn)定性好、無污染[26-27],ARTP 誘變的基本流程如圖2所示。

    圖2 ARTP 誘變基本流程圖Fig.2 Basic flow chart of ARTP mutation

    ARTP 技術(shù)在其它菌種誘變應(yīng)用比較廣泛,如Liu 等[28]為獲得高產(chǎn)堿性蛋白酶菌株,對枯草芽孢桿菌進(jìn)行了ARTP 處理,結(jié)果表明,該菌株在誘變時(shí)間為50 s 時(shí),有較高的正突變率,最終經(jīng)ARTP反復(fù)誘變獲得高產(chǎn)突變株A59,酶活力由6 835 U/mL 提高到8 433 U/mL,提高了23.38%,最終A59菌株的酶活達(dá)14 026 U/mL,是原菌株的2.05 倍;Qiu 等[29]利用ARTP 技術(shù)誘變蠟樣芽胞桿菌以提高QCG 菌株的1-萘酚產(chǎn)量,經(jīng)誘變后該菌株比原菌株增產(chǎn)47.32%。Cheng 等[30]利用ARTP 誘變得到了高產(chǎn)L-蘇氨酸的抗噬菌體大腸桿菌突變株,其L-蘇氨酸轉(zhuǎn)化率較出發(fā)菌株提高10.9%。而在ARTP 誘變提高LAI 產(chǎn)量的研究中,張珂等[31]對嗜酸乳桿菌進(jìn)行ARTP 多輪誘變處理,篩選出1株LAI 高產(chǎn)突變菌株B5,經(jīng)單因素實(shí)驗(yàn)結(jié)合響應(yīng)面試驗(yàn)對其突變株生長條件進(jìn)行優(yōu)化后,LAI 產(chǎn)量達(dá)到1 214.1 U/mL,是原始菌株的2.84 倍。

    除了單一利用ARTP 誘變技術(shù)來誘變微生物之外,近年來科研人員還將ARTP 與其它技術(shù)相結(jié)合[32],以復(fù)合誘變的方法應(yīng)用于微生物生產(chǎn)中,如EMS-ARTP 技術(shù)結(jié)合誘變選育高產(chǎn)DHA 裂殖壺菌[33]、ARTP-NTG 聯(lián)合選育得到高產(chǎn)中性蛋白酶菌株[34]、ARTP 與微生物微滴培養(yǎng)(MMC)技術(shù)培養(yǎng)篩選幾丁質(zhì)脫乙?;父弋a(chǎn)菌株[35]、ARTP-DES結(jié)合連續(xù)誘變選育高產(chǎn)ε-聚賴氨酸突變株[36]、ARTP-EMS 聯(lián)合多重誘變有效地提高了草酸青霉粗淀粉降解酶的產(chǎn)量[37]、ARTP-UV 復(fù)合誘變選育高性能綠僵菌菌株[38]、ARTP 與5-溴尿嘧啶復(fù)合誘變選育腺苷高產(chǎn)菌株[39]等。復(fù)合誘變相應(yīng)的出發(fā)菌株,最終得到的正突變率遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于負(fù)突變率,且高于運(yùn)用單一誘變方法的突變率,經(jīng)過多次傳代培養(yǎng)后,其突變菌株的遺傳性狀也是穩(wěn)定的。由此可知,復(fù)合誘變能夠形成更豐富的突變位點(diǎn),為以后產(chǎn)生研究所需要的基因性狀提供有效、快捷的方法。

    2 利用化學(xué)方法提高CLA 的產(chǎn)量

    2.1 化學(xué)誘變

    化學(xué)誘變是對菌株使用某些化學(xué)試劑處理,使其直接與菌株DNA 分子鏈上的堿基發(fā)生作用,從而使菌株產(chǎn)生可遺傳的變異,提高菌株突變率。常用的誘變劑主要有烷化劑、堿基類似物和無機(jī)化合物。而烷化劑在微生物變異中應(yīng)用最為廣泛[40],常見為甲基磺酸乙酯(EMS)[41]、亞硝基胍(NTG)[42]、乙烯亞胺(EI)[43]、硫酸二乙酯(DES)[44]等,其中NTG 作為一種超強(qiáng)誘變劑,是公認(rèn)效果顯著的化學(xué)超誘變劑[34]。

    科研人員利用化學(xué)誘變劑,以及物理與化學(xué)方法結(jié)合的方式對菌種進(jìn)行誘變,然而多數(shù)研究表明,物理化學(xué)復(fù)合誘變獲得CLA 突變菌株的效果更好。如甄妮[45]以德氏乳桿菌為出發(fā)菌株,采用紫外和DES 復(fù)合誘變的方法,獲得D-2-2 CLA高產(chǎn)菌株的突變菌株,產(chǎn)量達(dá)0.210 mg/mL,經(jīng)過培養(yǎng)基優(yōu)化后達(dá)0.267 mg/mL,再將CLA 菌株生長條件優(yōu)化后,其產(chǎn)量提高到0.292 mg/mL,且突變菌株高產(chǎn)特性能夠穩(wěn)定遺傳。而在之前相關(guān)研究中,王璟等[46]以植物乳桿菌為出發(fā)菌株,利用紫外和DES 復(fù)合誘變的方法,加入0.1%的高濃度LA 初篩后,再進(jìn)行搖瓶復(fù)篩,最終得到L.pian H3-1 突變株,其CLA 產(chǎn)量高達(dá)0.3067 mg/mL,較出發(fā)菌株提高264.5%。吳榮榮等[47]利用2 株嗜酸乳桿菌HS111 和HS112 經(jīng)紫外和NTG 復(fù)合誘變處理后,HS111 的CLA 產(chǎn)量共提高了19 μg/mL,而HS112 提高了27.7 μg/mL。結(jié)果表明,2 株嗜酸乳桿菌經(jīng)復(fù)合誘變CLA 產(chǎn)量都明顯提高,然而不同種類的嗜酸乳桿菌,產(chǎn)CLA 的能力也有差異。

    采用單一的物理誘變或者單一的化學(xué)誘變可能得到比較單一的突變體,最終產(chǎn)CLA 的效果也不夠好,而采用物理與化學(xué)復(fù)合誘變的方法[48],能夠有效彌補(bǔ)單一誘變的缺陷,從而有效提高菌株的突變率,進(jìn)而提高CLA 產(chǎn)量。

    2.2 離子注入

    離子注入誘變法是離子在真空環(huán)境中被加速和篩選,帶有相同能量的離子被導(dǎo)入反應(yīng)室,離子和目標(biāo)物開始一系列的物理和化學(xué)的相互作用[49],其中N-離子束誘變是其最常見的方法。N-離子束誘變技術(shù)具有突變譜寬、突變率高、重復(fù)性好、易于獲得理想變異菌株等特點(diǎn)[50-52]。

    在多數(shù)研究中,研究人員以植物乳桿菌作為出發(fā)菌株,利用N-離子束將其誘變,以達(dá)到菌株高產(chǎn)CLA 的目的。如蔡玉華[53]以植物乳桿菌為出發(fā)菌株,經(jīng)N-離子束注入并反復(fù)誘變,得到突變菌株ANLP 的CLA 量由出發(fā)菌株的33.04 μg/mL提高到103.26 μg/mL,而且突變株遺傳性狀穩(wěn)定。慈志敏等[54]對植物乳桿菌P8 采用N-離子束注入法進(jìn)行誘變處理,結(jié)果表明,P8 經(jīng)N-離子束誘變,得到產(chǎn)CLA 正突變菌株共36 株,最高CLA 質(zhì)量濃度為0.2751 mg/mL,轉(zhuǎn)化率為27.51%;負(fù)突變菌株共66 株,最低CLA 質(zhì)量濃度為0.0330 mg/mL,轉(zhuǎn)化率為3.30%。之后陳麗娟等[55]對植物乳桿菌ANCLA01 進(jìn)行N-離子注入,結(jié)果顯示,N-離子注入使其CLA 產(chǎn)量從33.44 μg/mL 提高到66.67 μg/mL,且經(jīng)5 次傳代培養(yǎng)后突變菌株產(chǎn)CLA 也很穩(wěn)定。王婧波[56]以植物乳桿菌LL-ZSDS001 菌株為原始菌株,進(jìn)行銫137γ-射線輻照和N-離子束誘變共同處理,最終誘變得到CLA產(chǎn)量為118.921 μg/mL,比原始菌株54.234 μg/mL提高了119.27%。

    通過以上研究發(fā)現(xiàn),離子注入誘變技術(shù)能夠有效提高乳桿菌CLA 的產(chǎn)量,而單一利用離子注入法提高的程度有限,將輻照或其它方法與離子注入相結(jié)合,進(jìn)行出發(fā)菌株的誘變,其產(chǎn)CLA 的能力也會有所改變。

    3 利用基因工程技術(shù)提高CLA 的產(chǎn)量

    為提高出發(fā)菌株CLA 的產(chǎn)量,隨著生物合成及誘變技術(shù)的不斷發(fā)展,近幾年通過基因工程技術(shù)對生產(chǎn)菌株進(jìn)行改造[57],例如菌株能夠通過基因重組獲得新的遺傳型及具有優(yōu)良性狀的高產(chǎn)工程菌株,或者通過微生物間的轉(zhuǎn)基因而獲得新菌種。基因工程育種是按照人們意愿,對目的菌株的基因進(jìn)行設(shè)計(jì)以得到所希望的性狀,是真正意義上的理性選育[58]。

    3.1 基因定點(diǎn)突變

    基因定點(diǎn)突變是指通過PCR 等方法向目的DNA 片段中引入所需變化[59],包括堿基的增加、刪除、易位、點(diǎn)突變等,其原理圖如圖3所示。定點(diǎn)突變能快速篩選目的蛋白所表達(dá)的性狀,將定點(diǎn)突變技術(shù)應(yīng)用于LAI 基因構(gòu)建中是有效的手段[60-61]。

    圖3 定點(diǎn)突變原理示意圖Fig.3 Schematic diagram of mutation principle

    研究表明LAI 可以催化LA 轉(zhuǎn)化為CLA,然而在研究過程中發(fā)現(xiàn)有些菌種屬于厭氧菌或兼性厭氧菌,不利于大規(guī)模產(chǎn)酶培養(yǎng)且生長緩慢,于是構(gòu)建基因工程菌來表達(dá)LAI 就成為生產(chǎn)CLA 的又一重要途徑[62]。黃亮等[63]對嗜酸乳桿菌的LAI 基因進(jìn)行體外定向進(jìn)化,成功構(gòu)建基因突變文庫后,通過IPTG 誘導(dǎo)基因表達(dá)后,最終篩選出1 株重組菌LI-mut2,測定其LAI 活力為8.2 U,嗜酸乳桿菌LAI 活力為17.3 U,可見測得的酶活性并不高,還需進(jìn)一步探索LAI 活力快速測定的方法。劉海霞[64]以植物乳桿菌P8 基因組為模板,構(gòu)建重組菌pQE30-LAI,經(jīng)過LAI 基因序列比對分析,將193 位苯丙氨酸定為突變位點(diǎn),改變578 位堿基T為C,成功構(gòu)建了突變體pQE30-F193LAI,結(jié)果表明突變體表現(xiàn)出了酶活被破壞的特性,然而將表達(dá)的野生型和突變型的酶提取后檢測發(fā)現(xiàn)兩者有相同的條帶,說明LAI 均得到表達(dá)。賈麗[65]對5 個(gè)LAI 活性位點(diǎn)進(jìn)行定點(diǎn)突變研究,且都能夠成功構(gòu)建突變體,最終結(jié)果表明,與野生型LAI 相比,突變體G68A-LAI 幾乎喪失酶活力,突變體R107L-LAI 的酶活力上升,而突變體H172P-LAI的酶活力下降,從而初步確定第68 位、第107 位和172 位均為LAI 的必需氨基酸。時(shí)旭[66]將植物乳桿菌HAC01 和痤瘡丙酸桿菌的LAI 基因成功克隆,結(jié)果顯示pCold-gfp-yclai-p 重組菌產(chǎn)量最高的為39 號菌,CLA 產(chǎn)量為(11.6186±0.0036)μg/mL,較未突變株提高了3.99 倍。

    通過以上研究發(fā)現(xiàn),改變引物中的某些堿基而改變基因序列,進(jìn)行定點(diǎn)突變,而以PCR 為介導(dǎo)的體外定點(diǎn)突變?yōu)榛蛐揎?、改造提供了另一條途徑[67],進(jìn)而得到LAI 重組菌株,同時(shí)較有效地提高了LAI 的酶活力。

    3.2 基因重組

    基因重組法也稱體外重組DNA 方法,經(jīng)過體外剪切、拼接,再將菌株的遺傳物質(zhì)重新組合在一起,然后轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞內(nèi),進(jìn)行無性繁殖,并使目的基因在受體中表達(dá),生產(chǎn)人類所需要的物質(zhì)或生物種類,以達(dá)到定向改變生物性狀的目的[68],其原理圖如圖4所示。體外重組DNA 方法廣泛應(yīng)用于生物界的遺傳工程中,在生物制藥、植物抗病蟲害以及各理論研究方面都有廣泛的應(yīng)用,是一項(xiàng)新潮技術(shù)[69]。

    圖4 基因重組原理圖Fig.4 Schematic diagram of gene recombination

    基因重組技術(shù)廣泛應(yīng)用于細(xì)菌基因的改造,以期獲得具有優(yōu)良遺傳特性的新菌株,其獲得的重組菌株經(jīng)過相應(yīng)分離、純化,進(jìn)而提高LAI 的酶活。李晨曦[70]通過PCR 擴(kuò)增得到植物乳桿菌P-8來源的LAI 基因,連接至表達(dá)載體pKLAC1 上,轉(zhuǎn)化至乳酸克魯維酵母菌CICC 中,測序鑒定,成功構(gòu)建了表達(dá)LAI 的酵母基因工程菌,經(jīng)SDSPAGE 為單一條帶,測得酶活為(9.10±0.01)×103U/mL,并對影響酶活的各因素進(jìn)行優(yōu)化,其中影響最大的為pH、時(shí)間、溫度。劉曉華等[71]提取了從黃牛瘤胃中分離得到的1 株干酪乳桿菌Fx 的基因組DNA,經(jīng)擴(kuò)增及克隆后將得到的重組質(zhì)粒與表達(dá)質(zhì)粒同時(shí)進(jìn)行雙酶切,得到重組表達(dá)載體pET-DsbA-LAI,經(jīng)PCR 鑒定和酶切后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21 中,得到具有LAI 活性的重組菌株,且能夠特異性合成c9,t1l-CLA,表明從出發(fā)菌株Fx 成功克隆LAI,且合成不同CLA 異構(gòu)體的LAI存在特異性,經(jīng)定量測定,酶活力最大可達(dá)206 U/mL。洛雪等[72]將痤瘡丙酸桿菌的LAI 基因擴(kuò)增到大腸桿菌中表達(dá),分離純化上清液中的LAI 后檢測到該蛋白分子質(zhì)量為55 ku,電泳得到的條帶大小與LAI 大小相符,氣相色譜檢測該蛋白催化生成t10,c12-CLA,且酶活為(34.775±0.07)U/mL。

    經(jīng)過基因重組技術(shù)能夠成功構(gòu)建具有LAI 活性的重組菌株,且能特異性合成CLA 異構(gòu)體c9,t1l-CLA、t10,c12-CLA,進(jìn)而有效提高LAI 酶活,并對影響酶活的各因素進(jìn)行優(yōu)化,最終能夠較好達(dá)到提高CLA 產(chǎn)量的效果,是一直以來研究的重要方向。

    3.3 基因敲除

    基因敲除技術(shù)是建立在基因同源重組技術(shù)和胚胎干細(xì)胞技術(shù)基礎(chǔ)上的一種新分子生物學(xué)技術(shù),是用含有一定已知序列的DNA 片段與受體細(xì)胞基因組中序列相同或相近的基因發(fā)生同源重組,整合至受體細(xì)胞基因組中并得到表達(dá)的一種外源DNA 導(dǎo)入技術(shù)[73]。CRISPR-Cas9 是基因編輯的主要表現(xiàn)形式,它能夠通過DNA 剪接技術(shù)選擇性敲除特定蛋白的基因,是對靶向基因進(jìn)行特定DNA 修飾的技術(shù),其原理圖如圖5所示?;蚯贸槍δ硞€(gè)序列已知而功能未知的序列,通過改變生物的遺傳基因,進(jìn)而對生物體造成影響,最終推測出該基因的生物學(xué)功能,是微生物功能基因組學(xué)研究的有力工具之一[75]。

    圖5 CRISPR-Cas9 基因敲除原理圖Fig.5 Schematic diagram of CRISPR-Cas9 gene knockout

    基因敲除技術(shù)采用逆向思維,利用同源重組的方法敲除目的基因,使被研究的基因功能完全失活,從而推測該基因在整個(gè)過程中所起的作用[76],李婭妮等[77]在植物乳桿菌P8 的基礎(chǔ)上,分別在LAI 基因的上游和下游序列設(shè)計(jì)了2 對引物,擴(kuò)增出LAI 基因上下游序列的同源臂,成功構(gòu)建敲除載體pUC18△LAI 以敲除LAI 基因,同時(shí)添加抗性篩選標(biāo)記來快速篩選缺失菌株。倪麗娟[78]成功構(gòu)建了LAI 單基因敲除菌株和雙基因敲除菌株,對比其t10,c12-CLA 降解率,PEX10 降解率最低,穩(wěn)定CLA 產(chǎn)量效果最佳。隨即以PEX10 為出發(fā)菌株,構(gòu)建LAI 多拷貝整合菌株,并篩選得到1株高產(chǎn)t10,c12-CLA 的菌株P(guān)EX10/1292,產(chǎn)量為22.3 mg/L。之后添加紅花籽油優(yōu)化培養(yǎng),結(jié)果顯示t10,c12-CLA 總產(chǎn)量提高到7.6 g/L,是單拷貝菌株的2 倍,且降解率為23.0 mg/L/h,敲除菌株對穩(wěn)定CLA 產(chǎn)量非常有效。

    由此看出,基因敲除在一定程度上避免了質(zhì)粒整合產(chǎn)生的影響,也能夠?qū)Φ孜風(fēng)A 的降解起到緩解作用,同時(shí)也將為有效地提高CLA 產(chǎn)量提供幫助,為工業(yè)化生產(chǎn)CLA 提供一定的理論基礎(chǔ)。

    4 通過優(yōu)化培養(yǎng)條件提高CLA 產(chǎn)量

    在CLA 的生產(chǎn)與應(yīng)用中,其菌株產(chǎn)酶條件及培養(yǎng)基的優(yōu)化必不可少。通過優(yōu)化菌株的產(chǎn)酶條件及培養(yǎng)菌株的培養(yǎng)基條件來提高CLA 的產(chǎn)量是最基本的,也是最便捷的方法。除此之外,一些金屬離子也對CLA 的合成有顯著影響。

    羅玉芬[79]在泡菜中篩選得到1 株CLA 產(chǎn)量較高的明串珠菌QL2,對其發(fā)酵培養(yǎng)基成分進(jìn)行優(yōu)化后,發(fā)酵液中CLA 產(chǎn)量由原來的23.263 μg/mL提高到37.831 μg/mL,LA 轉(zhuǎn)化率提高到6.31%,是未優(yōu)化前的1.63 倍。接著對菌株的發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,CLA 產(chǎn)量達(dá)到40.953 μg/mL,LA 轉(zhuǎn)化率提高到6.83%,是先前的1.08 倍。Zeng 等[80]采用尿素一步絡(luò)合法對黃油中c9,t11-CLA 的富集條件進(jìn)行了優(yōu)化,最終測定生產(chǎn)中c9,t11-CLA 的純度為22.55%,c9,t11-CLA 和t10,c12-CLA 的濃度由原來的17.8 mg/g 和1.02 mg/g FA 分別提升到225.5 mg/g 和13.11 mg/g FA。許媛等[81]采用尿素包合法和響應(yīng)面優(yōu)化法對CLA 的2 種異構(gòu)體進(jìn)行分離,結(jié)果顯示所得樣品中t10,c12-CLA 與c9,t11-CLA 的比值高達(dá)2.47,且共軛亞油酸總量為97.3%,有效提高了CLA 的產(chǎn)量。劉華鼐等[82]利用響應(yīng)面優(yōu)化茶籽油制備CLA 的生產(chǎn)工藝條件,分離純化后茶油的CLA 純度從53.45%提高到了90.4%。Saber 等[83]采用Box-Behnken 和組合設(shè)計(jì),建立了乳酸雙歧桿菌BB12、嗜酸乳桿菌LA5及其共培養(yǎng)物轉(zhuǎn)化CLA 的預(yù)測模型。結(jié)果表明,在最佳條件下,乳酸雙歧桿菌BB12 和嗜酸乳桿菌LA5 生物合成CLA 的量分別為(110.03±4.58)μg/mL 和(82.42±3.66)μg/mL,可見純?nèi)樗犭p歧桿菌BB12 和嗜酸乳桿菌LA5 具有良好的產(chǎn)生物活性CLA 的能力,而乳酸雙歧桿菌BB12 產(chǎn)生的CLA 能力要高于嗜酸乳桿菌LA5。?zer 等[84]在植物乳桿菌AB20-961 和植物乳桿菌DSM 2601 生產(chǎn)的半干發(fā)酵香腸中優(yōu)化其發(fā)酵條件,以此獲得最高含量的CLA,發(fā)酵后植物乳桿菌AB20-961和DSM2601 生產(chǎn)的香腸中CLA 含量分別為4.15 mg/g 脂肪和7.54 mg/g 脂肪,且用植物乳桿菌DSM2601 生產(chǎn)的香腸,發(fā)酵后的CLA 含量比之前測定的CLA 含量增加了121%。曹健等[14]研究發(fā)現(xiàn),Na+、Fe2+、Mg2+有助于提高CLA 的產(chǎn)量,相反Hg2+、Co2+、Cu2+、Mn2+、Fe3+不利于共軛亞油酸的合成。苗世達(dá)等[85]由植物乳桿菌L-29 分離純化得到LAI,分子質(zhì)量達(dá)43 ku;對其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行研究,結(jié)果表明,溫度在37 ℃,pH 6.0 時(shí),酶活性較高;Co2+、Fe2+可提高酶的活性,而Cu2+、Zn2+則對酶活力有抑制作用。

    由此可見,將培養(yǎng)菌株的培養(yǎng)基成分,如碳源、氮源等比例進(jìn)行調(diào)節(jié)優(yōu)化,其CLA 產(chǎn)量會明顯提高,在此基礎(chǔ)上,若將菌株的產(chǎn)酶條件,如發(fā)酵溫度、初始pH、發(fā)酵時(shí)間以及底物添加量等加以優(yōu)化,及添加Na+、Fe2+、Mg2+等化學(xué)元素也能夠有效提高LAI 的活性,顯著提高了CLA 產(chǎn)量。根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn),對不同乳桿菌產(chǎn)CLA 的優(yōu)化條件進(jìn)行了對比總結(jié),如表2所示。

    表2 不同菌種產(chǎn)CLA 的基本優(yōu)化條件對比Table 2 Comparison of basic optimization conditions for CLA production by different strains

    5 總結(jié)與展望

    隨著人們生活水平的日益提高及健康意識的逐漸提高,由于CLA 具有抗癌、抗動脈硬化癥、減肥、提高機(jī)體免疫等重要的生理功能,其市場需求量將會持續(xù)增加,天然來源的CLA 遠(yuǎn)遠(yuǎn)滿足不了人們的需求[86],而傳統(tǒng)獲取CLA 的方法缺陷較多,如化學(xué)合成法生產(chǎn)得到的產(chǎn)物存在CLA 的異構(gòu)體種類較多,分離純化相對困難,而且可能存在有毒物質(zhì);生物合成法較化學(xué)合成法能夠單一合成CLA,然而其產(chǎn)量不高,故傳統(tǒng)方法不是長期穩(wěn)定生產(chǎn)CLA 的最優(yōu)途徑。于是研究人員近年來利用新興技術(shù),例如:物理誘變、化學(xué)誘變、離子注入和等離子體誘變等誘變技術(shù),以及利用基因工程的方法對原菌株的LAI 基因組進(jìn)行改造,重新構(gòu)建LAI 基因整合菌株來提高CLA 的產(chǎn)量。通過研究發(fā)現(xiàn),誘變技術(shù)可以有效提高CLA 的產(chǎn)量,然而采用單一的誘變方法可能得到的突變體比較單一,最終產(chǎn)CLA 的效果也不夠理想,而采用復(fù)合誘變的方法,能夠有效彌補(bǔ)這一的缺陷,從而有效提高菌株的突變率,進(jìn)而提高CLA 產(chǎn)量。基因工程技術(shù)通過重新構(gòu)建LAI 基因突變文庫,改造菌株的性能,使菌株能夠高產(chǎn)CLA。在此基礎(chǔ)上,將得到誘變或重新構(gòu)建的菌株的培養(yǎng)基條件或者產(chǎn)酶條件加以優(yōu)化,其CLA 產(chǎn)量會得到更大的提高。在今后CLA 的研究中應(yīng)順應(yīng)時(shí)代發(fā)展,提高生產(chǎn)CLA 過程的安全性,著重研究通過提高LAI的活性來提高CLA 的產(chǎn)量,同時(shí)也要注重生產(chǎn)CLA 的新技術(shù)的開發(fā)與研究。

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