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    關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因的分子特征及其組織表達(dá)分析

    2022-11-09 13:24:32石鵬飛阮涌劉文嬌許家利孫金魁熊訊許厚強(qiáng)
    關(guān)鍵詞:關(guān)嶺犢牛雜交

    石鵬飛,阮涌,劉文嬌,許家利,孫金魁,熊訊,許厚強(qiáng)

    (貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院/高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)試驗(yàn)室/貴州省動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)試驗(yàn)室,貴州貴陽(yáng) 550025)

    0 引言

    【研究意義】脂肪酸結(jié)合蛋白(Fatty acid binding proteins,F(xiàn)ABPs)是一類與脂肪酸高度親和的小分子蛋白,其分子量為14~15 kD,由126~134個(gè)氨基酸殘基組成,在脊椎和非脊椎動(dòng)物的細(xì)胞質(zhì)中廣泛表達(dá)(Niewold et al.,2004;Wang et al.,2005;熊訊等,2022)。FABPs對(duì)脂肪酸的調(diào)控機(jī)制是通過與長(zhǎng)鏈脂肪酸特異結(jié)合,從而將細(xì)胞膜上的脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)至磷脂和甘油三酯的代謝位置(Di Pietro and Santome,2001;Ono and Odani,2010)。心臟型脂肪酸結(jié)合蛋白(H-FABP,F(xiàn)ABP3)與脂肪型脂肪酸結(jié)合蛋白(AFABP,F(xiàn)ABP4)是FABPs家族的重要組成成員。因此,探究牛FABP3和FABP4基因的分子生物學(xué)特征及其組織表達(dá)特性,可為進(jìn)一步揭示FABP3和FABP4對(duì)脂肪酸的調(diào)控機(jī)制提供理論依據(jù)。【前人研究進(jìn)展】FABPs與過氧化物酶體增殖物激活受體(Peroxisome proliferator activated receptors,PPARs)共同作用調(diào)控胞內(nèi)脂肪酸的合成及分解,以維持體內(nèi)葡萄糖和脂肪的平衡(Kusudo et al.,2015)。FABP3基因主要在心臟組織中表達(dá),能與血漿長(zhǎng)鏈脂肪酸結(jié)合,參與心肌及骨骼肌中脂肪酸的運(yùn)輸和利用(Zhang et al.,1999)。敲除FABP3基因的小鼠表現(xiàn)出心肌細(xì)胞無(wú)法有效利用血漿中的長(zhǎng)鏈脂肪酸,從而影響心肌細(xì)胞功能(Binas et al.,1999)。此外,有研究表明FABP3基因?qū)τ谛∈笞厣窘M織的耐寒性和脂肪酸的氧化不可或缺(Vergnes et al.,2011)。FABP4基因高表達(dá)于脂肪細(xì)胞中,是甘油三酯的貯存庫(kù),在甘油三酯的合成及分解過程中發(fā)揮重要作用(Prentice et al.,2019);且FABP4分子中心具有與脂肪酸高度親和的結(jié)合位點(diǎn),能通過非共價(jià)鍵與長(zhǎng)鏈脂肪酸結(jié)合而有利于脂肪酸溶解(Smith et al.,2007)。FABP4基因敲除小鼠的生理狀態(tài)表現(xiàn)正常,但其血漿中的膽固醇和甘油三酯水平明顯降低(Uysal et al.,2000)。在3T3細(xì)胞中,過表達(dá)FABP3基因具有促進(jìn)前體脂肪細(xì)胞成脂的作用(Yi et al.,2014);而過表達(dá)FABP4基因能增強(qiáng)線粒體功能,同時(shí)促進(jìn)脂質(zhì)沉積及脂肪細(xì)胞分化(談笑,2014)。肌內(nèi)脂肪(Intramuscular fat,IMF)是肉品質(zhì)的重要指標(biāo)之一,其含量直接影響肉質(zhì)嫩度、適口性和風(fēng)味(Hocquette et al.,2010)。Gerbens等(2000)研究表明豬FABP3基因遺傳多態(tài)性與IMF含量呈正相關(guān);Lim等(2015)研究證實(shí)牛FABP3基因表達(dá)水平在低IFM組和高IMF組間存在顯著差異;Wang等(2015)研究發(fā)現(xiàn)FABP3和FABP4是影響肉質(zhì)的重要基因,且FABP3基因表達(dá)水平與山羊IMF含量顯著相關(guān);Bartoň等(2016)研究發(fā)現(xiàn)過表達(dá)FABP4基因?qū)ε<?nèi)脂肪細(xì)胞的生成有顯著影響;Yan等(2018)研究證實(shí),綿羊FABP4基因在脂肪細(xì)胞分化過程中顯著上調(diào)表達(dá),且其基因多態(tài)性與IMF含量顯著相關(guān)?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前,有關(guān)FABP3和FABP4基因在豬和羊上的研究較多報(bào)道,但針對(duì)牛FABP3和FABP4基因的具體分子結(jié)構(gòu)、功能及相互作用尚未明確?!緮M解決的關(guān)鍵問題】通過在線生物信息學(xué)分析軟件分析關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因的分子結(jié)構(gòu)及其功能,并運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)這2個(gè)基因在不同年齡段和不同組織中的表達(dá)差異,為揭示牛FABP3和FABP4基因?qū)χ舅岬恼{(diào)控作用機(jī)制提供理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    試驗(yàn)動(dòng)物來自貴州省安順市關(guān)嶺縣關(guān)嶺牛產(chǎn)業(yè)園,隨機(jī)選取相同飼養(yǎng)條件下的3日齡關(guān)嶺犢牛、24月齡關(guān)嶺牛(成年)及24月齡雜交牛(關(guān)嶺?!晾举澟#└?頭,采集心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、背最長(zhǎng)肌、脂肪及小腸等組織樣品,-80℃保存?zhèn)溆谩V饕囼?yàn)試劑:TRIzol購(gòu)自美國(guó)Gibco公司;DL2000 DNA Marker、2×TaqPCR StarMix、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(GenStar)購(gòu)自西寶生物科技(上海)股份有限公司;熒光定量試劑Power UP SYBR GREEN Master Mix購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher公司;膠回收試劑盒購(gòu)自O(shè)MEGA公司,pMD19-T載體購(gòu)自TaKaRa公司。主要儀器設(shè)備:電泳儀(DYY-2C)和水平電泳槽(DYCP-31C)購(gòu)自北京六一儀器廠;超微量紫外分光光度計(jì)(NanoDrop 2000)購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher公司;PCR儀(C1000 TouchTM)、熒光定量PCR儀(Biosens SC710)及凝膠成像系統(tǒng)(Universal HoodⅡ)購(gòu)自美國(guó)Bio-rad公司。

    1.2 引物設(shè)計(jì)與合成

    根據(jù)NCBI已發(fā)布的牛FABP3基因序列(NM_174313.2)和FABP4基因序列(NM_174314.2),使用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)蛋白編碼區(qū)(CDS)序列擴(kuò)增引物及熒光定量分析特異性引物,篩選綜合得分最高的引物序列,并委托擎科生物科技有限公司合成。

    1.3 組織總RNA提取及cDNA合成

    采用TRIzol法分別提取犢牛、成年關(guān)嶺牛與雜交牛各組織總RNA,使用超微量分光光度測(cè)定儀測(cè)定總RNA濃度及OD,質(zhì)量合格的RNA置于-80℃冰箱保存。采用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA第一鏈,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.4 FABP3和FABP4基因克隆

    以cDNA為模板,PCR擴(kuò)增牛FABP3和FABP4基因CDS序列。PCR反應(yīng)體系10.0μL:cDNA模板0.4μL,正、反向引物(10μmol/L)各0.4μL,2×TaqPCR StarMix 5.0μL,ddH2O 3.8μL。擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性2 min;94℃30 s,55℃30 s,72℃60 s/kb,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。采用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,膠回收擴(kuò)增產(chǎn)物后連接至pMD19-T載體,然后在16℃下轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,加入液體培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)1.5 h,取樣涂抹至固體培養(yǎng)基上,37℃過夜培養(yǎng);經(jīng)氨芐青霉素篩選后挑選單個(gè)菌落進(jìn)行搖菌擴(kuò)繁,菌液PCR鑒定呈陽(yáng)性的質(zhì)粒送至擎科生物科技有限公司測(cè)序。

    1.5 FABP3和FABP4基因CDS序列生物信息學(xué)分析

    使用ProtScale(https://www.expasy.org/)和Prot-Param(https://web.expasy.org/protscale/)分別分析FABP3、FABP4蛋白疏水性及其理化性質(zhì),采用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html%5D)和SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/interactive)分別預(yù)測(cè)2個(gè)蛋白的二、三級(jí)結(jié)構(gòu),運(yùn)用TMHMM-2.0、SignalP-5.0及NetPhos-3.1分別預(yù)測(cè)分析FABP3、FABP4蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽及磷酸化位點(diǎn),利用STRING(https://string-db.org/)預(yù)測(cè)FABP3和FABP4蛋白的相互作用蛋白,并以MegAlign和MEGA 7.0分別進(jìn)行FABP3、FABP4氨基酸序列同源比對(duì)分析及構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。

    1.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)FABP3和FABP4基因表達(dá)

    篩選出實(shí)時(shí)熒光定量PCR的特異性擴(kuò)增引物,以GAPDH為內(nèi)參基因,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)犢牛、成年關(guān)嶺牛及雜交牛各組織中的FABP3和FABP4基因表達(dá)水平。實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系:Power UP SYBR GREEN Master Mix 5.0μL,正、反向引物(10μmol/L)0.4μL,cDNA模板0.5μL,滅菌水3.7μL。擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性2 min;95℃15 s,56℃15 s,72℃60 s,進(jìn)行39個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣品設(shè)3個(gè)重復(fù),通過2-ΔΔCt法計(jì)算目的基因相對(duì)表達(dá)量。

    表1 引物序列信息Table 1 Primer sequence information

    2 結(jié)果與分析

    2.1 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因CDS序列擴(kuò)增結(jié)果

    以犢牛背最長(zhǎng)肌cDNA為模板擴(kuò)增FABP3和FABP4基因CDS序列,經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果顯示分別擴(kuò)增出435 bp(圖1-A)和433 bp(圖1-B)的清晰條帶,與預(yù)期結(jié)果相符,可進(jìn)行下一步研究。

    2.2 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因克隆及測(cè)序結(jié)果

    經(jīng)菌液PCR鑒定呈陽(yáng)性的質(zhì)粒送至擎科生物科技有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與NCBI已發(fā)布的牛FABP3和FABP4基因序列進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果顯示,關(guān)嶺牛FABP3基因CDS序列第324位核苷酸(圖2-A)存在堿基突變(G→A),為同義突變,氨基酸不發(fā)生改變;FABP4基因CDS序列第220和327位核苷酸(圖2-B)存在堿基突變(A→G和A→G),致使甲硫氨酸和異亮氨酸突變?yōu)槔i氨酸,第348和396位存在堿基同義突變(G→C和A→G),氨基酸不發(fā)生改變。

    2.3 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白生物信息學(xué)分析結(jié)果

    2.3.1 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白理化性質(zhì)分析結(jié)果ProtParam預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,關(guān)嶺牛FABP3基因CDS序列全長(zhǎng)402 bp,共編碼133個(gè)氨基酸殘基,蛋白分子式為C654H1054N174O204S5,原子數(shù)為2091,分子量為14778.91 Da,理論等電點(diǎn)(pI)為6.73;含量最高的氨基酸為蘇氨酸(占13.5%),含量最低的氨基酸是半胱氨酸和脯氨酸,各占0.8%;蛋白不穩(wěn)定指數(shù)10.51,為穩(wěn)定蛋白。FABP4基因CDS序列全長(zhǎng)399 bp,共編碼132個(gè)氨基酸殘基,蛋白分子式為C645H1041N171O201S7,原子數(shù)為2065,分子量為14631.81 Da,pI為5.52;同樣以纈氨酸含量最高(占12.9%),半胱氨酸、脯氨酸、色氨酸和酪氨酸的含量均較低,各占1.5%;蛋白不穩(wěn)定指數(shù)12.68,為穩(wěn)定蛋白。ProtScale預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,F(xiàn)ABP3蛋白第114位亮氨酸疏水性最強(qiáng)(1.289)、第76位丙氨酸親水性最強(qiáng)(-2.444),親水性總體平均值為-0.247,屬于親水性蛋白(圖3-A);FABP4蛋白第46位天冬酰胺疏水性最強(qiáng)(1.789)、第76位脯氨酸親水性最強(qiáng)(-2.278),親水性總體平均值為-0.183,屬于親水性蛋白(圖3-B)。

    2.3.2 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白二、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)結(jié)果通過SOMPA預(yù)測(cè)得知,F(xiàn)ABP3蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)由4種結(jié)構(gòu)構(gòu)成(圖4-A),其中延伸鏈占36.09%、無(wú)規(guī)則卷曲占30.83%、α-螺旋占23.31%、β-轉(zhuǎn)角占9.77%;FABP4蛋白同樣由4種結(jié)構(gòu)組成(圖4-B),其中占比最高的也是延伸鏈(占37.12%),無(wú)規(guī)則卷曲占31.06%、α-螺旋占21.21%、β-轉(zhuǎn)角占10.61%。通過SWISS-MODEL預(yù)測(cè)關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果(圖5)發(fā)現(xiàn)二者的延伸鏈占比較高,同時(shí)富含α-螺旋結(jié)構(gòu),與蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符。

    2.3.3 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽及磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果通過TMHMM-2.0和SignalP-5.0分別預(yù)測(cè)關(guān)嶺牛FABP3、FABP4蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域及信號(hào)肽,結(jié)果(圖6和圖7)顯示二者均無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽。NetPhos-3.1預(yù)測(cè)顯示,關(guān)嶺牛FABP3蛋白存在26個(gè)磷酸化位點(diǎn),包括6個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)、18個(gè)蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)及2個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn)(圖8-A);關(guān)嶺牛FABP4蛋白存在21個(gè)磷酸化位點(diǎn),包括8個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)、11個(gè)蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)及2個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn)(圖8-B)。

    2.3.4 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4蛋白的互作蛋白預(yù)測(cè)結(jié)果使用STRING對(duì)關(guān)嶺牛FABP3、FABP4蛋白的互作蛋白進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果表明二者與FABP1、FABP6、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPARγ)、脂蛋白脂肪酶(LPL)及激素敏感脂肪酶(LIPE)等存在互作關(guān)系(圖9)。其中,F(xiàn)ABP1和FABP6共屬于FABPs家族成員,F(xiàn)ABP1主要在肝臟內(nèi)發(fā)揮作用,與細(xì)胞質(zhì)中的游離脂肪酸及其輔酶A衍生物共同參與細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn);FABP6可結(jié)合膽汁酸并參與腸肝膽汁酸代謝,是脂肪酸代謝過程中的關(guān)鍵因子(Xu et al.,2019)。PPARγ調(diào)控脂肪酸的過氧化物酶體β-氧化途徑,是脂肪細(xì)胞分化和葡萄糖穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子(Janani and Ranjitha,2015);在硬骨魚類中,PPARγ參與FABPs的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,并與FABPs家族蛋白協(xié)同調(diào)控細(xì)胞中的脂質(zhì)代謝(Venkatachalam et al.,2017)。LIPE主要功能是將儲(chǔ)存的甘油三酯水解為游離脂肪酸,還可將膽固醇酯轉(zhuǎn)化為游離膽固醇以產(chǎn)生類固醇激素,對(duì)脂肪沉積至關(guān)重要(Goszczynski et al.,2014)。LPL則是甘油三酯降解的限速酶,參與各種脂蛋白代謝,是調(diào)控脂肪代謝的關(guān)鍵酶之一(王晶等,2013)。

    2.4 FABP3和FABP4氨基酸序列同源比對(duì)分析結(jié)果

    使用MegAlign對(duì)不同物種的FABP3和FABP4氨基酸序列進(jìn)行同源比對(duì)分析,結(jié)果顯示,關(guān)嶺牛與牦牛、綿羊、馬、人類、小鼠、大鼠、斑馬魚、豬、雞的FABP3氨基酸序列相似性分別為100.0%、96.2%、91.0%、24.1%、85.7%、85.7%、69.9%、92.5%和78.2%,其中與人類的相似性最低(圖10-A);關(guān)嶺牛與牦牛、綿羊、馬、人類、小鼠、大鼠、斑馬魚、豬、雞的FABP4氨基酸序列相似性分別為97.7%、93.2%、78.8%、84.1%、85.6%、83.3%、26.5%、81.8%和72.0%,其中與斑馬魚的相似性最低(圖10-B)。基于FABP3和FABP4氨基酸序列相似性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖11)均顯示,關(guān)嶺牛與牦牛的親緣關(guān)系最近,其次是綿羊,與雞和斑馬魚的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

    2.5 FABP3和FABP4基因在犢牛、成年關(guān)嶺牛及雜交牛不同組織中的表達(dá)規(guī)律

    2.5.1 關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR引物退火溫度的確定根據(jù)引物合成報(bào)告,選擇關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR引物退火溫度范圍,結(jié)果顯示擴(kuò)增條帶明亮單一(圖12),最終確定關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增引物最佳退火溫度分別為59和56℃。

    2.5.2FABP3基因在犢牛、成年關(guān)嶺牛和雜交牛不同組織中的表達(dá)情況FABP3基因在犢牛、成年關(guān)嶺牛和雜交牛不同組織中均有表達(dá),且以心臟的相對(duì)表達(dá)量最高(圖13),具體表現(xiàn):FABP3基因在犢牛中的相對(duì)表達(dá)量排序?yàn)樾呐K>腎臟>小腸>脾臟>背最長(zhǎng)肌>肝臟>脂肪>肺臟,在心臟、腎臟、小腸、脾臟和背最長(zhǎng)肌間的相對(duì)表達(dá)量差異極顯著(P<0.01,下同),且均極顯著高于其他組織中的相對(duì)表達(dá)量;FABP3基因在成年牛中的相對(duì)表達(dá)量排序?yàn)樾呐K>脂肪>脾臟>小腸>肺臟>腎臟>背最長(zhǎng)?。靖闻K,以心臟、脂肪和脾臟的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織;FABP3基因在雜交牛中的相對(duì)表達(dá)量排序?yàn)樾呐K>脂肪>脾臟>腎臟>小腸>肝臟>背最長(zhǎng)?。痉闻K,其中心臟和脂肪的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織。在不同年齡段關(guān)嶺牛中,F(xiàn)ABP3基因在成年牛心臟、脾臟、脂肪、肝臟和肺臟中的相對(duì)表達(dá)量極顯著或顯著(P<0.05,下同)高于犢牛(圖14-A)。此外,F(xiàn)ABP3基因在成年牛心臟、肺臟和背最長(zhǎng)肌中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于雜交牛,而在肝臟和腎臟中的相對(duì)表達(dá)量極顯著低于雜交牛(圖14-B)。

    2.5.3FABP4基因在犢牛、成年關(guān)嶺牛和雜交牛不同組織中的表達(dá)情況FABP4基因在犢牛、成年牛和雜交牛的不同組織中均有表達(dá),在脂肪中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織,而在其他組織間的相對(duì)表達(dá)量差異均不顯著(P<0.05,下同)(圖15)。在不同年齡階段關(guān)嶺牛中,F(xiàn)ABP4基因在犢牛腎臟、背最長(zhǎng)肌和脂肪中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于成年牛,在心臟、肝臟、肺臟和小腸則表現(xiàn)為極顯著或顯著低于成年牛(圖16-A)。此外,F(xiàn)ABP4基因在成年牛心臟、肝臟和脾臟中的相對(duì)表達(dá)量均極顯著低于雜交牛,但在脂肪中的相對(duì)表達(dá)量并無(wú)顯著差異(圖16-B)。

    3 討論

    FABPs是細(xì)胞中重要的脂肪酸載體蛋白,對(duì)脂肪酸的儲(chǔ)存、轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝起重要調(diào)控作用(Furuhashi and Hotamisligil,2008)。FABP3在心肌和骨骼肌細(xì)胞中高度表達(dá)可引導(dǎo)脂肪酸進(jìn)行β氧化,從而導(dǎo)致心肌細(xì)胞葡萄糖氧化增強(qiáng)及血漿脂肪酸水平升高(Smathers and Petersen,2011)。已有研究表明,過表達(dá)FABP3基因能觸發(fā)絲裂原活化蛋白激酶的磷酸化,啟動(dòng)與心肌梗死后心肌細(xì)胞凋亡及重塑相關(guān)的信號(hào)級(jí)聯(lián)反應(yīng),進(jìn)而導(dǎo)致缺血性心臟損傷(Zhuang et al.,2019)。FABP4基因主要表達(dá)于脂肪細(xì)胞和巨噬細(xì)胞,已廣泛用作脂肪細(xì)胞成熟的標(biāo)志(Furuhashi,2019)。此外,F(xiàn)ABP4在能量循環(huán)中發(fā)揮著整合脂肪能量?jī)?chǔ)存及運(yùn)輸?shù)淖饔茫≒rentice et al.,2019)。近年來,有關(guān)FABP3和FABP4基因的研究主要與人類疾病及其免疫相關(guān),在家畜上尤其是針對(duì)牛FABP3和FABP4基因的研究鮮見報(bào)道。

    本研究成功克隆獲得關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因CDS序列,與NCBI已公布的對(duì)應(yīng)序列對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ABP3基因序列僅存在1個(gè)突變位點(diǎn),且為同義突變不改變氨基酸序列,表明該基因在關(guān)嶺牛上遺傳較穩(wěn)定;FABP4基因序列存在4個(gè)突變位點(diǎn),有2個(gè)突變位點(diǎn)會(huì)引起氨基酸序列發(fā)生變化,而導(dǎo)致蛋白結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,其中無(wú)規(guī)則卷曲占比由23.48%提高到31.06%。無(wú)規(guī)則卷曲是蛋白肽鏈中與配體和受體結(jié)合的重要部分(趙采芹等,2022),F(xiàn)ABP4蛋白中的無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)變化可能會(huì)影響其與脂肪酸的結(jié)合活性。FABP3和FABP4蛋白二、三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成,但這2種蛋白均無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)肽,故推測(cè)不是分泌蛋白。FABP3和FABP4氨基酸序列同源比對(duì)分析及構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),關(guān)嶺牛與牦牛、綿羊和豬的FABP3氨基酸序列相似性較高,除了與人類和斑馬魚的相似性較低外,與其他物種的相似性均在78.2%以上;關(guān)嶺牛與牦牛、綿羊和小鼠的FABP4氨基酸序列相似性較高,除了與斑馬魚的相似性較低外,與其他物種的同源性均在72.0%以上??梢?,關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因具有較高的遺傳保守性。

    實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果表明,F(xiàn)ABP3和FABP4基因在關(guān)嶺牛和雜交牛各組織中均有不同程度的表達(dá),F(xiàn)ABP3基因以在心臟中的相對(duì)表達(dá)量最高,與Li等(2016)、姚毅等(2017)、胡江等(2019)的研究結(jié)果相似。陳志輝等(2006)研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ABP3基因在未成熟的動(dòng)物肌肉組織中表達(dá)量較低或不表達(dá),當(dāng)細(xì)胞開始以脂肪酸作為能源物質(zhì)時(shí)其表達(dá)量才不斷提高。本研究也發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ABP3基因在成年關(guān)嶺牛多個(gè)組織(心臟、肝臟、脾臟、肺臟和脂肪)中的相對(duì)表達(dá)量顯著或極顯著高于關(guān)嶺犢牛,但具體原理有待進(jìn)一步探究。FABP3基因在成年關(guān)嶺牛多個(gè)組織(心臟、脾臟、肺臟、背最長(zhǎng)肌和小腸)中的相對(duì)表達(dá)量也顯著或極顯著高于雜交牛,表明FABP3基因?qū)﹃P(guān)嶺牛的影響大于雜交牛。FABP4基因以關(guān)嶺牛脂肪中的相對(duì)表達(dá)量極顯著高于其他組織,與Soliman等(2007)、Li等(2015)、劉可可等(2022)的研究結(jié)果一致。FABP4基因在關(guān)嶺犢牛脂肪中的表達(dá)量極顯著高于成年關(guān)嶺牛,與李文娟等(2006)、屠云潔等(2010)的研究結(jié)果恰好相反,可能是物種差異所致。此外,F(xiàn)ABP3基因在成年關(guān)嶺牛和雜交牛的脂肪中也有較高表達(dá),故推測(cè)其與FABP4基因協(xié)同調(diào)控脂肪細(xì)胞中的脂肪酸代謝。綜上所述,F(xiàn)ABP3和FABP4基因在關(guān)嶺牛和雜交牛各組織中均呈組織特異性表達(dá),且與脂肪酸代謝密切相關(guān)。

    4 結(jié)論

    關(guān)嶺牛FABP3和FABP4基因具有較高的遺傳保守性,且以在心臟和脂肪中的表達(dá)水平較高,與脂肪酸代謝密切相關(guān)。

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