周漢琛,楊霽虹,徐玉婕,吳瓊,雷攀登
香葉醇生物合成相關(guān)基因的進(jìn)化分析
周漢琛,楊霽虹,徐玉婕,吳瓊,雷攀登*
安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,安徽 黃山 245000
茶樹(shù)中存在2個(gè)亞細(xì)胞定位不同的基因(和),其中定位于細(xì)胞質(zhì)的基因與香葉醇生物合成密切相關(guān)。為探究基因在不同茶樹(shù)品種中的序列、功能差異及其在物種間的進(jìn)化,通過(guò)序列比對(duì)、基因克隆、進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建、代謝物分析、功能驗(yàn)證等分析了該基因在茶樹(shù)與非茶樹(shù)植物中的進(jìn)化以及香葉醇積累差異。結(jié)果表明,不同茶樹(shù)基因庫(kù)中組裝的核苷酸序列存在差異;RT-PCR克隆顯示4個(gè)阿薩姆變種和4個(gè)中國(guó)變種茶樹(shù)中均有和的陽(yáng)性克隆,且核苷酸序列存在差異。利用Phytozome網(wǎng)站數(shù)據(jù)進(jìn)行序列比對(duì)及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建,結(jié)果顯示共有58個(gè)植物中存在同源基因;該基因在植物物種間較為保守,在低等植物藻類(lèi)基因組中也存在;在單子葉禾本科植物中,除短柄草()泛基因組中存在蛋白序列匹配率大于58%的目的基因,其余均較低,尤其是在部分禾本科植物中該基因存在缺失。代謝物分析表明15個(gè)禾本科植物水稻、小麥和玉米品種鮮葉中均未檢測(cè)到香葉醇的合成,而4個(gè)茶樹(shù)品種嫩梢中香葉醇含量為0.87~4.12?μg·g-1。此外,茶樹(shù)基因在幼嫩葉片中有高表達(dá);阿薩姆變種茶樹(shù)佛香3號(hào)的同樣具有合成香葉醇的功能。本研究表明,基因廣泛存在植物基因組中,在茶樹(shù)基因組中存在2個(gè)基因,并與茶樹(shù)葉片中香葉醇的合成相關(guān)。
香葉醇;基因;進(jìn)化分析;Phytozome;茶樹(shù)
萜類(lèi)物質(zhì)是自然界最為豐富的一類(lèi)化合物,包括其衍生物已經(jīng)發(fā)現(xiàn)約80?000種,其中包含植物、細(xì)菌、真菌界等[1]。許多萜類(lèi)物質(zhì)參與了生物體的基礎(chǔ)代謝,如脫落酸、赤霉素和獨(dú)角金內(nèi)酯等萜類(lèi)激素,以及植物萜類(lèi)色素物質(zhì)番茄紅素(Lycopene)、-胡蘿卜素(-carotene)等[2]。這類(lèi)萜類(lèi)物質(zhì)一般不具有揮發(fā)性。而許多小分子萜類(lèi)物質(zhì)具有揮發(fā)特性,比如擬南芥在開(kāi)花過(guò)程中釋放出多種類(lèi)萜類(lèi)物質(zhì),包含單萜類(lèi)化合物芳樟醇、月桂烯、羅勒烯和檸檬烯,以及倍半萜類(lèi)化合物-法尼烯、石竹烯、()-橙花叔醇、()-橙花叔醇、羅漢柏烯等[3],這類(lèi)揮發(fā)性萜類(lèi)物質(zhì)對(duì)植物具有重要的生物學(xué)意義,如吸引昆蟲(chóng)傳粉,防御病原菌侵害等[4]。茶樹(shù)中的研究顯示,倍半萜類(lèi)物質(zhì)橙花叔醇,以葡萄糖苷形式儲(chǔ)存在細(xì)胞中,參與茶樹(shù)防御冷脅迫[5]。
香葉醇是一類(lèi)單萜類(lèi)化合物,具有玫瑰花香,在植物花器官中含量豐富,比如玫瑰花等。香葉醇在茶樹(shù)葉片中大量富集,對(duì)茶葉香氣形成具有重要貢獻(xiàn)。植物中的萜類(lèi)物質(zhì)來(lái)源于異戊烯焦磷酸(Isopentenyl diphospthate,IPP)及其異構(gòu)化合物二甲基烯丙基焦磷酸(Dimethylallyl diphosphate,DMAPP)[6]。在植物體中,一般通過(guò)質(zhì)體中的甲基赤蘚醇磷酸(Methylerythritol phosphate,MEP)途徑和細(xì)胞質(zhì)中的甲羥戊酸(Mevalonic acid,MVA)途徑形成單萜類(lèi)香氣前體牻牛兒基焦磷酸/香葉基焦磷酸(Geranyl diphosphate,GPP)和倍半萜類(lèi)香氣前體法尼烯焦磷酸,再由萜類(lèi)合成酶(Terpene synthase,TPS)催化生成相應(yīng)萜類(lèi)化合物[7]。目前植物中香葉醇生物合成途徑,及相關(guān)功能基因的研究已有相關(guān)報(bào)道[8-10]。甜羅勒中的香葉醇合成酶(Geraniol synthase,GES)基因,能夠直接催化香氣前體物質(zhì)GPP生成香葉醇,將其過(guò)量表達(dá)于番茄中,顯示轉(zhuǎn)基因番茄中的香葉醇積累量極顯著增加[9-10]。
最近的研究表明萜類(lèi)物質(zhì)的生物合成還存在其他代謝途徑。Magnard等[11]發(fā)現(xiàn),核苷二磷酸水解酶(Nucleoside diphosphate hydrolase,Nudix)基因家族中定位于細(xì)胞質(zhì)的基因可以通過(guò)催化單萜前體物質(zhì)GPP生成GP(Geranyl monophosphate),再由磷酸酶去掉一個(gè)磷酸基團(tuán)生成香葉醇,且此途徑可能是玫瑰中香葉醇的主要生物合成途徑。與TPS直接催化香氣前體物質(zhì)GPP相比較,NUDX1則需要其他磷酸酶參與,間接促進(jìn)香葉醇的生物合成。近期研究結(jié)果顯示[12],茶樹(shù)中存在2個(gè)亞細(xì)胞定位不同的同源基因,分別是和;體外酶活顯示定位于細(xì)胞質(zhì)的可催化GPP生成GP,而定位于質(zhì)體的催化底物GPP效率較低;將過(guò)表達(dá)在本氏煙草中,能夠顯著促進(jìn)葉片中香葉基櫻草糖苷的積累,而過(guò)表達(dá)本氏煙草葉片中香葉基櫻草糖苷含量只有少量增加。為進(jìn)一步解析茶樹(shù)中生物學(xué)功能,及基因在植物間的進(jìn)化,本研究利用已發(fā)布的茶樹(shù)基因組數(shù)據(jù)及Phytozome網(wǎng)站139個(gè)植物基因組數(shù)據(jù),深入分析植物中基因的進(jìn)化模式,并檢測(cè)香葉醇在不同植物葉片中的含量,旨在為后續(xù)研究香葉醇生物合成途徑及關(guān)鍵酶基因選擇有重要指導(dǎo)作用。
供試茶樹(shù)品種為皖茶4號(hào)、皖茶91、舒茶早、鳧早2號(hào)、中茶108、浙農(nóng)117、佛香3號(hào)、云抗10號(hào)、雪芽100和紫娟取材于安徽省農(nóng)科院茶葉研究所繁育基地,取樣后立即置于液氮中,并于–80℃冰箱保存。本研究中供試小麥()品種鄭麥366、皖麥50、濟(jì)麥22、矮抗58、煙農(nóng)19;玉米()品種煙玉604、煙玉958、煙玉601、煙玉206、迪卡517;水稻()品種天隆優(yōu)619、甬優(yōu)4901、徐稻63646、圣香1826、早香粳1號(hào)為安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物所提供,以上15個(gè)禾本科植物種子在溫室利用1∶1的營(yíng)養(yǎng)土、蛭石培育1個(gè)月后,取新鮮葉片儲(chǔ)存于–80℃冰箱,用于后續(xù)揮發(fā)物分析。
利用RNA提取試劑盒[DP441,天根生化科技(北京)有限公司]提取茶樹(shù)總RNA,然后使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒[RR036A,寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司]合成cDNA。利用KOD高保真PCR酶[KOD-401,東洋紡(上海)生物科技有限公司]克隆不同茶樹(shù)品種中的(F:GGATCCATGGAAAGCAAGTCTCAGC,R:GAGCTCTCATTTATTATCAGCTGGG)和(F:TCTAGAATGGTGCCCAATCAGCAAGCTT,R:GAGCTCTCATTTTTGATCAGCTGGAAAGGGA)基因。PCR產(chǎn)物純化后,連接克隆載體pEASY-Blunt(CB101,北京全式金生物技術(shù)有限公司)進(jìn)行測(cè)序分析。
利用玫瑰(NCBI登錄號(hào):JQ820249)和擬南芥基因(AT1G68760)蛋白序列,對(duì)Phytozome(https://phytozome-next.jgi.doe.gov)網(wǎng)站蛋白庫(kù)數(shù)據(jù)進(jìn)行BLASTP分析,以獲得不同植物中的同源基因;利用Figtree(http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree)對(duì)獲得的NUDX1蛋白序列進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析;利用ClustalW2對(duì)不同物種NUDX1的Nudix結(jié)構(gòu)域進(jìn)行比對(duì)分析。
茶樹(shù)、小麥、玉米和水稻不同品種鮮葉中的揮發(fā)性化合物分析方法如下:利用液氮將新鮮樣品研磨粉碎后,準(zhǔn)確稱(chēng)取0.2?g樣品,加入2?mL含有200?μL 300?mg·mL-1AR2000(廣譜糖苷酶)的蒸餾水,于37℃水浴下反應(yīng)20?min后,利用SPME萃取頭(50/30μm DVB/CAR/PDMS Stableflex,USA)于60℃水浴下吸附30?min,用于氣相色譜分析。
本研究中利用島津2010 GC(日本島津公司)對(duì)樣品中的揮發(fā)物進(jìn)行分析。檢測(cè)器為FID通道;色譜柱為RTX-MAX(30?m×0.25?mm×0.25?μm)。具體參數(shù):總流量為13?mL·min-1;柱流量為1?mL·min-1;線(xiàn)速率為25.6?cm·s-1;分流比為9∶1;尾吹流量為30?mL·min-1;氫氣流量為40?mL·min-1;空氣流量為400?mL·min-1;火焰溫度為280℃。吸附完成的SPME萃取頭立即于250℃下解吸附5?min。柱溫箱升溫程序?yàn)椋?0℃保留2?min,以4℃·min-1上升至85℃并保留2?min;以3℃·min-1上升至110℃并保留1?min;以4℃·min-1上升至200℃并保留1?min;最后以15℃·min-1上升至250℃并保留5?min。
以香葉醇標(biāo)準(zhǔn)品(中國(guó)默克有限公司)流出時(shí)間對(duì)不同樣品中的香葉醇進(jìn)行鑒定,利用標(biāo)準(zhǔn)品與樣品中香葉醇峰面積之比計(jì)算含量,結(jié)果表示為μg·g-1鮮重(Fresh weight,F(xiàn)W)。
利用一步克隆試劑盒(C112,南京諾唯贊生物科技股份有限公司)將不同茶樹(shù)品種的基因與植物雙元表達(dá)載體PBI121連接,測(cè)序正確后轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101(上海唯地生物技術(shù)有限公司)。配制侵染緩沖液(MES 10?mmol·L-1,MgCl220?mmol·L-1,乙酰丁香酮200?μmol·L-1),將帶有PBI121-質(zhì)粒的農(nóng)桿菌注射本氏煙草葉片。3?d后收取瞬時(shí)表達(dá)葉片并立即置于液氮中研磨,稱(chēng)取0.2?g并加入5?mL超純水和200?μL 200?mg·mL-1AR2000,37℃水浴平衡20?min后,利用65?μmol·L-1PDMS/DVB SPME萃取頭于70℃水浴下吸附30?min,用于GC-MS分析。
利用SPSS 19.0軟件對(duì)不同樣品中香葉醇含量及基因表達(dá)水平差異進(jìn)行方差分析,其中采用Duncan運(yùn)算法,以檢驗(yàn)不同樣品間的顯著性(<0.05,<0.01);基因表達(dá)與香葉醇含量間的相關(guān)性分析是利用SPSS 19.0軟件中的Pearson相關(guān)系數(shù)運(yùn)算方法獲得。
研究表明舒茶早基因組(http://tpdb.shengxin.ren)中含有2個(gè)與同源的茶樹(shù)基因,分別是()和()(表1)。蛋白序列含有220個(gè)氨基酸,具有質(zhì)體信號(hào)肽,亞細(xì)胞分析顯示定位于質(zhì)體中,而定位于細(xì)胞質(zhì)中[12]。茶樹(shù)品種碧云基因組中存在2個(gè)基因,與舒茶早基因組比對(duì)結(jié)果相似;古茶樹(shù)基因組中的與栽培品種舒茶早基因組中的蛋白序列存在5個(gè)氨基酸的差異。在各基因組數(shù)據(jù)中的比對(duì)結(jié)果差異較大,例如龍井43基因組中,序列組裝與舒茶早、碧云基因組中的序列存在差異;在古茶樹(shù)基因組中該基因匹配到2個(gè)基因(表1)。
表1 不同茶樹(shù)基因組中CsNUDX1-cyto和CsNUDX1-chlo序列比對(duì)
序列差異,結(jié)果顯示4個(gè)阿薩姆變種茶樹(shù)佛香3號(hào)、云抗10號(hào)、雪芽100、紫娟和4個(gè)中國(guó)變種茶樹(shù)舒茶早、皖茶91、中茶108、浙農(nóng)117中均有和的陽(yáng)性克?。▓D1-A),以測(cè)序結(jié)果為例,顯示該基因5'端序列在不同茶樹(shù)品種中存在差異(圖1-B);蛋白序列分析顯示,8個(gè)品種的基因在N端存在差異,其中云抗10號(hào)與雪芽100中的蛋白序列完全相同;舒茶早在N端與其他7個(gè)品種中存在2~4個(gè)氨基酸的差異;酶催化位點(diǎn)Nudix結(jié)構(gòu)域在8個(gè)茶樹(shù)品種中均未有序列變異(圖1-C)。
以蛋白序列為靶序列,顯示Phytozome網(wǎng)站中共有6個(gè)植物基因組中存在定位于質(zhì)體中的基因,且均分布在雙子葉植物基因組中,如樟樹(shù)()和向日葵()(圖2)。
目前Phytozome網(wǎng)站共收錄了139個(gè)植物物種的261個(gè)基因組數(shù)據(jù)。以已驗(yàn)證功能的基因蛋白序列為靶序列,對(duì)Phytozome網(wǎng)站蛋白庫(kù)數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)分析。結(jié)果顯示,共有58個(gè)植物中目的基因蛋白序列匹配率(Identity)達(dá)到64%~100%,其中蛋白序列長(zhǎng)度為141~192個(gè)氨基酸。值得注意的是,基因在綠藻類(lèi)植物(Chlorophyte)中也廣泛存在(圖2),但是在禾本科植物(Grass)中,基因存在缺失,如、水稻()、柳枝稷()、粟()、高粱()、玉米()等。
注:(A)RT-PCR克隆,(B)CsNUDX1-cyto測(cè)序序列比對(duì),(C)CsNUDX1-cyto氨基酸序列比對(duì)
以Phytozome網(wǎng)站單子葉植物蛋白庫(kù)為目標(biāo),結(jié)果顯示,蘆筍()菖蒲()、大葉藻()、參薯()和紫萍()基因組中存在與、匹配率大于58%的目的基因;其他單子葉植物基因組中目的基因匹配率均低于50%,為26%~50%。
注:NUDX1-chlo表示預(yù)測(cè)定位于質(zhì)體中的NUDX1基因
Nudix功能結(jié)構(gòu)域(GX5EX7REUXEEXGU)是NUDX1催化底物GPP重要位點(diǎn)[19],且其中精氨酸R后面的谷氨酸E位點(diǎn)對(duì)NUDX1酶活性至關(guān)重要。分析顯示,Nudix結(jié)構(gòu)域在不同植物物種中的保守性均較高,重要活性位點(diǎn)E均未變異。以已鑒定功能的擬南芥的Nudix結(jié)構(gòu)域?yàn)檠芯繉?duì)象,顯示雙子葉植物中Nudix功能結(jié)構(gòu)域變異較小,存在1~3個(gè)氨基酸位點(diǎn)不一致,而藻類(lèi)植物中細(xì)小微胞藻()基因的Nudix結(jié)構(gòu)域與擬南芥中的差異較大,存在9個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異(圖3)。
茶樹(shù)基因Nudix結(jié)構(gòu)域與擬南芥中的基因存在2個(gè)氨基酸位點(diǎn)的差異。以擬南芥基因Nudix結(jié)構(gòu)域?yàn)槟繕?biāo)序列,對(duì)禾本科植物基因組進(jìn)行比對(duì),顯示短柄草()泛基因組(pan-genome,ID:335)數(shù)據(jù)中存在Nudix結(jié)構(gòu)域,且與擬南芥中的基因結(jié)構(gòu)域有6個(gè)氨基酸位點(diǎn)差異,而重要活性位點(diǎn)E未變異,在Genbank中對(duì)該基因進(jìn)行BLASTP比對(duì),結(jié)果顯示該基因?yàn)镹udix基因家族成員,與NUDX23蛋白序列相似度最高。
圖3 植物中NUDX1功能結(jié)構(gòu)域分析
為探究禾本科植物中香葉醇的合成,以水稻、玉米、小麥不同品種鮮葉為材料,同時(shí)分析了4個(gè)茶樹(shù)品種嫩梢中的香葉醇含量。由圖4可知,以香葉醇標(biāo)準(zhǔn)品保留時(shí)間為基準(zhǔn),顯示茶樹(shù)品種舒茶早、皖茶4號(hào)樣品相同時(shí)間內(nèi)出現(xiàn)明顯的離子峰,而水稻品種甬優(yōu)4901、徐稻63646鮮葉中相同時(shí)間內(nèi)未有離子峰出現(xiàn)(圖4-A);相同處理下,小麥品種矮抗58、皖麥50鮮葉中也沒(méi)有明顯離子峰出現(xiàn)(圖4-B);玉米品種迪卡517、煙玉206鮮葉中也均未檢測(cè)到香葉醇的合成(圖4-C)。研究結(jié)果表明4個(gè)茶樹(shù)品種的嫩梢中香葉醇含量為0.87~4.12?μg·g-1,而本研究中15個(gè)禾本科植物品種鮮葉中均未檢測(cè)到香葉醇的合成(圖4-D)。
對(duì)茶樹(shù)品種舒茶早嫩梢進(jìn)行研究,結(jié)果顯示(圖5),2個(gè)茶樹(shù)基因在嫩葉中的表達(dá)量最高,在發(fā)育成熟度高的葉片中表達(dá)量較弱。與Cs在第一葉、莖中的表達(dá)水平差異不大,在第二葉中的表達(dá)量達(dá)到顯著水平(<0.05),而在第三葉中的表達(dá)量達(dá)到極顯著水平(<0.01,圖5-A)。香葉醇含量分析顯示,其在幼嫩葉片中積累量最高,達(dá)到3.3?μg·g-1;在發(fā)育成熟度較高的葉片中含量較低,為0.7?μg·g-1(圖5-B)。相關(guān)性分析表明,葉片中香葉醇的含量與茶樹(shù)、2個(gè)基因的表達(dá)量存在相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)分別為0.897和0.756。
注:(A)2個(gè)水稻品種鮮葉中酶解香葉醇與茶樹(shù)嫩梢酶解香葉醇離子峰比較;(B)2個(gè)小麥品種鮮葉中香葉醇離子峰分析;(C)2個(gè)玉米品種鮮葉中香葉醇離子峰分析;(D)香葉醇含量分析。nd表示未檢出
注:(A)2個(gè)茶樹(shù)NUDX1基因表達(dá)分析;(B)茶樹(shù)嫩梢不同部位香葉醇含量分析;(C)舒茶早和佛香3號(hào)中CsNUDX1-cyto過(guò)表達(dá)產(chǎn)物分析。不同大小寫(xiě)字母代表2個(gè)NUDX1基因在茶樹(shù)嫩梢不同部位的表達(dá)差異(P<0.05);*、**分別代表差異顯著性(P<0.05,P<0.01);ns表明無(wú)顯著差異
基于基因克隆及測(cè)序分析,顯示阿薩姆變種茶樹(shù)佛香3號(hào)和中國(guó)變種茶樹(shù)舒茶早中的蛋白序列存在差異。為探究佛香3號(hào)茶樹(shù)品種中的催化功能,本研究將其過(guò)表達(dá)在本氏煙草葉片中并檢測(cè)香葉醇的合成(圖5-C),結(jié)果顯示,與對(duì)照相比(侵染液處理葉片),過(guò)量表達(dá)FX3-和SCZ-均能促進(jìn)香葉醇的合成。
基因在植物中廣泛存在,研究顯示基因家族成員數(shù)量在植物中屬于中等類(lèi)型,在擬南芥、水稻、楊樹(shù)和葡萄中分別包含32、33、53個(gè)和30個(gè)家族成員[20-21]?;蚣易宄蓡T氨基酸序列一般比較短,由145~320氨基酸序列組成,一般在N-端含有金屬結(jié)構(gòu)域,在C-端含有催化結(jié)構(gòu)域,且該基因家族成員的催化底物比較多樣化,比如GPP、煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide adenine dinucleotide,NADH)以及焦磷酸硫胺素(Thiamine pyrophosphate,TPP)等。同源基因家族成員蛋白結(jié)構(gòu)中含有23個(gè)保守氨基酸序列,為Nudix結(jié)構(gòu)域(GX5EX7REUXEEXGU),是該酶催化底物區(qū)域[12]。
基于Phytozome網(wǎng)站數(shù)據(jù),基因的進(jìn)化分析表明該基因不僅在高等植物中廣泛存在,在低等植物綠藻中也存在,這表示該基因較為原始,由其催化GPP生成GP,再由磷酸酶催化生成香葉醇的生物合成途徑可能廣泛存在植物系統(tǒng)中。有趣的是,部分禾本科植物中該基因存在缺失,且通過(guò)揮發(fā)性物質(zhì)分析,顯示香葉醇在這類(lèi)植物中合成很少,或幾乎沒(méi)有。然而,茶樹(shù)中存在2個(gè)亞細(xì)胞定位不一致的基因,一個(gè)定位于細(xì)胞質(zhì),而另一個(gè)定位于質(zhì)體,且在其他雙子葉植物中也出現(xiàn)同源的定位于質(zhì)體中的基因。在植物進(jìn)化過(guò)程中,存在大量的DNA復(fù)制事件,或全基因組復(fù)制事件(Whole-genome duplication,WGD)。以茶樹(shù)為例,顯示茶樹(shù)基因組曾遭遇WGD事件,使得同源基因得到大量復(fù)制[14],比如糖基轉(zhuǎn)移酶基因家族在低等植物萊茵衣藻()中只有1個(gè)家族成員[22-23],而在茶樹(shù)中存在307個(gè)家族成員[14]。
茶樹(shù)中富含香葉醇,尤其是其嫩梢中[24],對(duì)綠茶、紅茶、烏龍茶的香氣品質(zhì)均有貢獻(xiàn)[25-27]。研究顯示,水稻正常生長(zhǎng)狀態(tài)和逆境下,均未檢測(cè)到香葉醇的合成[28],揮發(fā)性化合物正常生長(zhǎng)狀態(tài)下積累較少,且多為芳樟醇、檸檬烯、水楊酸甲酯、吲哚等;在秋葉蛾侵襲后,大量的倍半萜類(lèi)化合物被釋放,如,石竹烯、法尼烯、姜烯等。本研究顯示禾本科植物水稻、玉米基因組中未匹配到基因,且本研究中15個(gè)禾本科植物品種鮮葉中也均未檢測(cè)到香葉醇的合成,這可能與該基因的缺失相關(guān)。功能分析顯示,阿薩姆變種茶樹(shù)佛香3號(hào)中的同樣具有促進(jìn)香葉醇合成的功能。Takeo[29]研究顯示阿薩姆變種茶樹(shù)中的香葉醇含量明顯低于中國(guó)變種茶樹(shù),后續(xù)研究中可通過(guò)分析的調(diào)控機(jī)制,探究香葉醇合成在兩個(gè)茶樹(shù)變種中存在差異的原因。
綜上所述,香葉醇生物合成相關(guān)基因廣泛存在于低等、高等植物中;在部分禾本科植物基因組中,該基因存在缺失;茶樹(shù)基因組中存在2個(gè)基因,在茶樹(shù)幼嫩葉片中表達(dá)量較高,并與香葉醇合成相關(guān)。
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Phylogenetic Analysis ofGene Involved in Geraniol Biosynthesis
ZHOU Hanchen, YANG Jihong, XU Yujie, WU Qiong, LEI Pandeng*
Tea research institute, Anhui Academy of Agricultural Sciences, Huangshan 245000, China
Geraniol is an acyclic monoterpene alcohol, which plays key roles in plant-environment interactions, such as pest repelling, antimicrobial activity, and pollinator attraction as well as the aroma traits for tea plants. It was reported that a cytosolic Nudix hydrolase (NUDX1) catalyzes geranyl pyrophosphate (GPP) into geranyl monophosphate (GP), followed by dephosphorylation with an endogenous phosphatase to produce geraniol. Two homologues ofwere found in tea genome (and) with different subcellular location. Searching the homologues ofon Phytozome shows that fifty-eight plant species contain the homologues of(with identities>64%)However, no homologue ofwas found in the genomes of grass species, with the exception ofWe thus detected AR2000-enzymed geraniol in fresh leaves of rice, wheat, maize, and tea plants. The results show that free geraniol was undetectable in fresh leaves of rice, wheat and maize, where as young shoots of four tea cultivars had high levels of geraniol (0.87-4.12?μg·g-1). Twogenes were highly expressed in young tea leaves and had a positive correlation (above 0.7) with the accumulation of geraniol. This study shows thats are widely present in plant genome, which are closely related to the formation of geraniol.
geraniol,gene, phylogenetic analysis, Phytozome,
S571.1;Q52
A
1000-369X(2022)05-638-11
2021-11-02
2022-02-17
國(guó)家自然科學(xué)基金(32002096)、安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃(QNYC-202119)
周漢琛,女,博士,研究方向?yàn)椴铇?shù)生物化學(xué)及分子生物學(xué),Tuesday1011@163.com。*通信作者:lpteagle@126.com