賈志鵬,張新國*,郭廣君,魏亞茹,謝棟棟,范曉英,張 繼,黃麗娜,王鄧拓,朱建寧
(1 蘭州理工大學生命科學與工程學院 甘肅省中藏藥篩選評價及深加工重點實驗室 蘭州 730050 2 西北師范大學生命科學院 蘭州 730060 3 甘肅省食品藥品監(jiān)督管理局審評認證中心 蘭州 730070)
植物內(nèi)生菌,是指定殖于健康植物組織,在植物不同生長階段與植物和諧共生的一類微生物[1]。研究顯示,植物內(nèi)生菌不僅對植物生長發(fā)育起到積極的調(diào)節(jié)作用,有些植物內(nèi)生菌還能產(chǎn)生與宿主相同或相似活性的物質(zhì)[2-3]。近年來,研究人員從不同植物內(nèi)生菌次級代謝產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)了很多具有抗菌、抗氧化、抗腫瘤等生物活性的物質(zhì),植物內(nèi)生菌作為一個亟待開發(fā)的重要資源,正在被越來越多的研究人員所關注[4]。
甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)為豆科甘草屬多年生草本植物,具有“補脾益氣,清熱解毒,祛痰止咳,緩急止痛,調(diào)和諸藥之功效”。作為最常用的大宗藥材,甘草素有“十方九草”和“藥之國老”的美譽[5]?,F(xiàn)代藥理學研究表明,甘草的有效成分以黃酮類和三萜皂苷成分為主[6-8],還包括香豆素類、生物堿類、多糖等化合物[9-11],具有抗?jié)儭⒖鼓[瘤、抗病毒、免疫調(diào)節(jié)、抗氧化和治療心血管疾病等功效[10]。
從植物中分離篩選出具有生理活性的內(nèi)生菌并獲得其次生代謝產(chǎn)物,是藥用植物資源替代的重要嘗試,對于在一定程度上解決我國甘草野生資源的匱乏具有著重要的意義。研究顯示[12-13],不同培養(yǎng)基對內(nèi)生真菌的分離的種類會產(chǎn)生一定的影響,不同培養(yǎng)基分離所得內(nèi)生真菌的多樣性也明顯不同。甘草主要分布于我國東北、西北及華北等地區(qū),其中又以寧夏、甘肅、內(nèi)蒙和新疆等地所產(chǎn)的道地藥材品質(zhì)最佳,是我國在種植和應用上最為廣泛的植物資源[14]。本研究采用9 種分離培養(yǎng)基對甘肅本地野生甘草不同組織中內(nèi)生真菌進行分離,并采用不同的方法評價其代謝產(chǎn)物的抗氧化和抑菌活性,以期增加甘草內(nèi)生菌的豐度并篩選出活性良好的菌株,為甘草深層次應用提供技術資料。
甘草為采集自甘肅省慶城縣野生全株,經(jīng)蘭州理工大學生命科學與工程學院楊林副教授鑒定確系為該種藥材。
標準供試菌使用兩種革蘭氏陰性菌綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)、大腸桿菌(Escherichia coli) 和3 種革蘭氏陽性菌金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、肺炎鏈球菌(Streptococcus pneumoniae)、地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis),以上菌株均由蘭州理工大學生命科學與工程學院實驗中心提供。
二苯代苦味?;杂苫鵇PPH(96%)、抗壞血酸(VC,99%),購自阿拉丁生化科技股份有限公司;水楊酸,鐵氰化鉀,硫酸亞鐵,三氯乙酸等,購自天津福晨化學試劑有限公司,且均為分析純級。
UV2102PC 型紫外-可見分光光度計,上海尤尼柯儀器有限公司);SPX-100B-Z 生化培養(yǎng)箱,上海博迅實業(yè)有限公司。
1.3.1 甘草內(nèi)生真菌的分離純化 取新鮮甘草根、莖、葉清水沖凈泥土,再依次用無菌水清洗、75%酒精消毒、2%次氯酸鈉溶液消毒,最后用無菌水沖洗3 次并保存最后一次沖洗液作為空白對照[15]。采用Gary 等[16]報道的組織塊法將表面消毒過的植物組織剪成10 mm 長的小段,分別接種在表1所示I~IX 共9 種固體培養(yǎng)基中28 ℃培養(yǎng)5~10 d,然后挑取初步分離得到的菌株轉(zhuǎn)接至新的培養(yǎng)基上劃線分離,連續(xù)轉(zhuǎn)接4~5 次,直至得到單菌落然后對菌種進行編號和保藏。
表1 試驗用培養(yǎng)基及成分Table 1 Experimental medium and ingredients
1.3.2 甘草內(nèi)生真菌分子生物學鑒定 將已分離純化的甘草內(nèi)生真菌轉(zhuǎn)接至相應固體培養(yǎng)基,28℃恒溫培養(yǎng)觀察記錄菌株生長狀況、菌落整體形態(tài)、質(zhì)地,菌絲顏色、長短及基質(zhì)顏色等,將部分形態(tài)特異的菌株送至西安一棵樹生物科技公司進行18S rDNA 基因測序,將測序結(jié)果在GenBank 數(shù)據(jù)庫中進行序列比對,獲取菌種注冊號,并用MEGA 7.0 軟件繪制系統(tǒng)進化樹。
1.3.3 甘草內(nèi)生真菌的發(fā)酵及次級代謝產(chǎn)物的制備 菌株在相應液體培養(yǎng)基28 ℃發(fā)酵培養(yǎng)7 d。過濾分離發(fā)酵液和菌絲體,取濾液用等體積乙酸乙酯萃取3 次,合并有機相,55 ℃減壓濃縮蒸干得發(fā)酵液供試樣品;菌絲體用甲醇冷凝回流3 次,合并有機相減壓濃縮蒸干得菌絲體供試樣品。所得樣品均置于冰箱4 ℃保藏備用。
1.3.4 甘草內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物抗氧化活性的評價
1.3.4.1 清除DPPH 自由基活性的測定 清除DPPH 自由基活性的測定參照Du 等[17]報道中的方法。配制并移取待測樣品溶液(50 μL 0.1 mg/mL),加入DPPH-乙醇溶液(50 μL 0.05 mg/mL),渦旋震蕩室溫避光30 min,用無水乙醇調(diào)零于517 nm處測定吸光度值Ai;用無水乙醇替換DPPH 溶液測得Aj;以無水乙醇代替待測樣品溶液測得A0;以抗壞血酸(VC)作為陽性對照,依據(jù)公式計算得DPPH 清除率。
1.3.4.2 清除羥自由基活性的測定 清除羥自由基活性的測定參照Smirnoff 等[18]報道的方法。配制并移取待測樣品溶液(50 μL 0.1 mg/mL),依次加入50 μL FeSO4(6.0 mmol/L)溶液、水楊酸-乙醇(6.0 mmol/L) 溶液、0.1% H2O2溶液,37 ℃水浴反應30 min,用20%乙醇調(diào)零于波長510 nm 處測定吸光度值A1;以無水乙醇代替待測樣品溶液測得A0,用蒸餾水替換0.1% H2O2溶液測得A2;并以抗壞血酸(VC)作為陽性對照,依據(jù)公式計算得羥自由基清除率。
1.3.4.3 總還原力的測定 還原力的測定參照Wei 等[19]的方法。配制并移取磷酸鹽緩沖液(500 μL 0.2 mol/L,pH=6.6),依次加入待測樣品溶液(500 μL 0.1 mg/mL)和500 μL 1% K3[Fe(CN)6],50 ℃水浴后快速冷卻至室溫,加入500 μL 10%三氯乙酸溶液,混勻后5 000 r/min 離心,取上清液100 μL 依次加入80 μL 蒸餾水及20 μL 0.1%的三氯化鐵溶液,充分反應15 min,于波長700 nm處測定其吸光度值,吸光度值越大表明其還原力越強,以500 μL 蒸餾水代替1% K3[Fe(CN)6]溶液作空白,用VC 的總還原力做標準曲線,每組樣品平行3 次,求其均值。
1.3.5 甘草內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物的抑菌活性評價 取經(jīng)活化的5 種受試菌株菌液按1%的接種量接種于100 mL 牛肉膏-蛋白胨液體培養(yǎng)基并將菌液濃度稀釋至0.5 麥氏濃度,作為受試菌懸液[20-21]。制備1.3.1 節(jié)所述牛肉膏-蛋白胨固體培養(yǎng)基(厚度2~3 mm)移取受試菌懸液200 μL,均勻涂布制成含菌平板。取待測樣品溶液 (10 μL 10 mg/mL)滴于直徑5 mm 已滅菌濾紙片并移至含菌平板上,以青霉素鉀和硫酸鏈霉素(0.1 mg/mL)作陽性對照,每個待測樣品溶液作兩個平行。37 ℃恒溫培養(yǎng)觀察并測量抑菌圈直徑大小,以抑菌圈直徑作為評價樣品抑菌效果的指標[2,22]。
研究采用9 種培養(yǎng)基從甘草根、莖、葉中共分離出內(nèi)生真菌128 株,其中根部95 株、莖部9 株、葉部24 株,分別為分離菌株總數(shù)的74.22%、7.03%、18.75%(見表2)。9 種培養(yǎng)基對甘草中內(nèi)生真菌分離的出菌率如圖1所示,以山藥培養(yǎng)基和100 倍稀釋的山藥培養(yǎng)基的出菌率最高,分別為19.53%、13.28%。
圖1 甘草內(nèi)生真菌在不同培養(yǎng)基分離下的出菌率圖Fig.1 Isolation rate of endophytic fungi from licoricein different media
表2 甘草內(nèi)生真菌菌株分布Table 2 Distribution of isolates of endophytic fungi from licorice
(續(xù)表2)
從所分離出的菌中按照不同分離培養(yǎng)基各選取了部分形態(tài)特殊的菌株共計18 株,進行了18S rDNA 測序,提交NCBI 進行GeneBank 注冊(見表3)。將上述菌株的測定序列在Genbank 數(shù)據(jù)庫進行序列比對,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,結(jié)果如圖2所示。真菌經(jīng)分子生物學鑒定歸屬于4 目5 科5 屬,包括曲霉屬、鐮刀菌屬、畢赤酵母屬、叢赤殼屬、枝孢屬,歸屬于4 個不同的目。其中分離出較多的菌屬為鐮刀菌屬和畢赤酵母屬。
圖2 甘草內(nèi)生真菌的系統(tǒng)進化樹Fig.2 Phylogenetic tree of endophytic fungi in licorice
表3 甘草內(nèi)生真菌分子生物學鑒定Table 3 Molecular biological identification of endophytic fungi in licorice
2.3.1 次級代謝產(chǎn)物樣品對DPPH 自由基的清除作用 從根、莖、葉3 個部位所分離的菌株中各選取了部分形態(tài)特殊的甘草內(nèi)生真菌共18 株,制得36 個供試樣品并測定了其對DPPH 自由基清除率,如表4所示。
表4 不同甘草內(nèi)生真菌樣品的DPPH 自由基清除率Table 4 DPPH free radical scavenging rate of different licorice endophytic fungi samples
試驗結(jié)果顯示陽性對照VC 的DPPH 自由基清除率為95.20%。對DPPH 自由基清除率超過60%的樣品有25 個,占總樣品的69.44%;清除率超過80%的樣品有10 個,其中GS-6a、GS-7 菌液粗提物對DPPH 自由基的清除率分別達到了97.54%和96.87%與陽性對照效果相當,具有較強體外抗氧化能力。
2.3.2 次級代謝產(chǎn)物樣品對羥自由基的清除作用 試驗對所得36 個次級代謝產(chǎn)物樣品又進行了羥自由基清除率的測定,測定結(jié)果如下表5所示。
表5 不同甘草內(nèi)生真菌樣品的羥自由基清除率Table 5 Hydroxyl radical scavenging rate of different licorice endophytic fungi samples
試驗結(jié)果顯示陽性對照VC 的羥自由基清除率為95.30%。對羥自由基清除率超過60%的樣品有20 個,占總樣品的55.56%;清除率超過80%的供試樣品有16 個,其中GS-6a、YS-4 菌株菌絲體供試樣品具有強體外抗氧化能力,對羥自由基的清除率分別達到了98.83%和98.32%,與陽性對照效果相當,具有較強體外抗氧化能力。
2.3.3 次級代謝產(chǎn)物樣品的總還原力 將陽性對照VC 配成不同質(zhì)量濃度的標準溶液,以VC 標準溶液質(zhì)量濃度為橫坐標,以波長700 nm 處測定的不同質(zhì)量濃度標準溶液吸光度值為縱坐標作VC標準曲線,如圖3所示。VC 標準溶液在0.02~0.10 mg/mL 的質(zhì)量濃度范圍內(nèi),其吸光度值與質(zhì)量濃度線性關系良好。將各供試樣品溶液吸光度值代入線性回歸方程 Y=7.445X+0.0587(R2=0.994),算出各樣品的VC 當量如表6所示。
圖3 VC 標準曲線Fig.3 VC standard curve
表6 不同甘草內(nèi)生真菌樣品總還原力測定Table 6 Determination of total reducing power of different licorice endophytic fungi samples
試驗結(jié)果顯示,總還原力超過0.060 mg VC當量還原力的待測樣品共有11 個,占到了樣品總數(shù)的30.6%;YS-2、YB-4 菌株發(fā)酵液樣品的總還原力分別達到0.115 mg VC 當量和0.101 mg VC當量,與0.100 mg VC 當量的還原力相當,具有較強體外抗氧化能力。
2.3.4 甘草內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物樣品抑菌活性的評價 試驗采用紙片擴散法[23-24]對36 份甘草內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物樣品進行抑菌活性測定,標準供試菌使用2 種革蘭氏陰性菌綠膿桿菌、大腸桿菌和3 種革蘭氏陽性菌金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、地衣芽孢桿菌,結(jié)果如表7所示。
表7 抑菌活性測定結(jié)果Table 7 Test results of antibacterial activity
(續(xù)表7)
大腸桿菌、綠膿桿菌陽性藥-鏈霉素;地衣芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌陽性藥-青霉素;對供試樣品進行了抑菌活性的測定,部分結(jié)果如圖4所示。圖4分別為各細菌的典型抑菌結(jié)果。
圖4 各供試細菌的典型抑菌結(jié)果Fig.4 Typical antibacterial results of each tested bacteria
結(jié)果表明,菌株YS-6 發(fā)酵液對大腸桿菌的抑菌活性達到鏈霉素的70%,對地衣芽孢桿菌的抑菌活性達到青霉素的67%,對金黃色葡萄球菌的抑菌活性達到青霉素的79%,具有良好的抑菌活性;而GS-12 發(fā)酵液對以上3 種供試細菌也有著僅次于YS-6 的抑菌活性;所有待測樣品對綠膿芽孢桿菌及肺炎雙球菌的抑制作用不明顯,表現(xiàn)出較弱的抑菌活性。由此可知,YS-6 發(fā)酵液供試樣品和GS-6a 菌絲體供試樣品在抑菌活性方面有較好的研究潛力。
植物內(nèi)生真菌作為與植物共存一類微生物,通常與宿主植物具有相同或相似的次生代謝產(chǎn)物合成途徑,其分布廣泛種類多樣,是一種亟待開發(fā)的重要微生物資源[2]。本研究通過不同培養(yǎng)基實現(xiàn)甘草根、莖、葉進行內(nèi)生真菌的分離,結(jié)果證實甘草內(nèi)生真菌在不同組織中都有分布且在不同組織中的分布不同,其中甘草根部組織微生物數(shù)量眾多且種屬各異,提示植物根部內(nèi)生真菌的多樣性最為豐富。
本研究通過9 種不同培養(yǎng)基進行內(nèi)生真菌分離。為了盡可能模擬內(nèi)生菌生長的自然環(huán)境,分離中除了采用經(jīng)典微生物培養(yǎng)通常采用的常規(guī)培養(yǎng)基外,還設計了經(jīng)50 倍和100 倍稀釋的寡營養(yǎng)培養(yǎng)基[25]進行內(nèi)生真菌的分離(見表1)。結(jié)果顯示,常規(guī)培養(yǎng)基從甘草中能分離到內(nèi)生真菌63 株,而寡營養(yǎng)培養(yǎng)基可分離出內(nèi)生真菌65 株。以根部內(nèi)生真菌最常采用的PDA 培養(yǎng)基分離為例,常規(guī)PDA 分離到9 株真菌,經(jīng)50 倍和100 倍稀釋的PDA 分別分離到6 株真菌和13 株真菌,該結(jié)果也提示經(jīng)過稀釋的培養(yǎng)基可以分離到常規(guī)方法難以獲得的菌株,詮釋了寡營養(yǎng)培養(yǎng)基也是一種良好的內(nèi)生真菌分離手段。
為了盡力可能多地分離甘草內(nèi)生真菌,本研究采用了馬鈴薯、山藥、胡蘿卜和百合作為培養(yǎng)基的成分進行培養(yǎng)基的改良,結(jié)果顯示山藥培養(yǎng)基共分離得到42 株內(nèi)生真菌與常規(guī)真菌培養(yǎng)基PDA 分離到的內(nèi)生真菌數(shù)量相當,均占總分離菌株數(shù)的32.81%,而通過百合培養(yǎng)基和胡蘿卜培養(yǎng)基分離到的菌株數(shù)量只有以上兩種的一半,分別占總菌株數(shù)的15.63%和18.75%,該結(jié)果也進一步說明了山藥培養(yǎng)基中營養(yǎng)成分豐富,是一種可用于植物內(nèi)生真菌分離的優(yōu)質(zhì)培養(yǎng)基。PDA 是植物內(nèi)生真菌分離最常用的一種培養(yǎng)基,也有研究采用該培養(yǎng)基進行了甘草內(nèi)生真菌的分離[26-28],與這些結(jié)果相比較,本研究不僅從甘草組織中分離得到了鐮刀菌屬、青霉屬、曲霉屬、鏈格孢屬等已被報道過的甘草內(nèi)生真菌,而且通過山藥培養(yǎng)基和胡蘿卜培養(yǎng)基也分離得到了如畢赤酵母屬、枝孢屬等鮮見報道的內(nèi)生真菌,這顯示出甘草內(nèi)生真菌的數(shù)量眾多且種屬構(gòu)成復雜,常規(guī)PDA 培養(yǎng)基能分離出的內(nèi)生真菌只占植物中內(nèi)生真菌總數(shù)的很少一部分,天然培養(yǎng)基和寡營養(yǎng)培養(yǎng)基的交叉使用對分離培養(yǎng)基種類的增加和菌株分離具有非常重要的意義。
本研究通過紙片擴散法[29]和3 種抗氧化活性測定方法評價了部分甘草內(nèi)生真菌次級代謝產(chǎn)物的抗氧化和抑菌活性,從中篩選出了高活性菌株;GS-6a 菌株經(jīng)分子生物學鑒定與季也蒙畢赤酵母有100%的同源性,初步鑒定為畢赤酵母屬(Pichia.sp.),抗氧化活性測定結(jié)果顯示其發(fā)酵液樣品對DPPH 自由基清除率為97.54%,菌絲體樣品對羥自由基清除率為98.83%,說明了季也蒙畢赤酵母次生代謝產(chǎn)物具有顯著的抗氧化活性潛力[26-27]。此外,研究顯示,季也蒙畢赤酵母也被用于聚乙烯等高分子材料的降解[28],在生物轉(zhuǎn)化[30]和新型生物防菌劑[31]的制備方面也有較好的應用,具有著較高開發(fā)價值。具有較高抑菌活性的YS-6 菌株經(jīng)分子生物學初步鑒定為枝孢霉菌屬(Cladosporium sp.),其主要抗菌成分以異香豆素衍生物為主,顯示了極大的開發(fā)潛力[32-33]。甘草作為一種應用廣泛的中藥,本研究通過其內(nèi)生真菌較為系統(tǒng)的研究證實,甘草內(nèi)生菌資源豐富,是活性化合物發(fā)現(xiàn)的良好資源,研究將為甘草的保護和深層次應用提供重要的技術資料。