楊夢雅,劉 楊,田 野,李瑞明*
(1.中國藥科大學(xué)中藥學(xué)院,江蘇 210009;2.天士力控股集團有限公司研究院現(xiàn)代中藥開發(fā)中心,天津 300410;3.天士力醫(yī)藥集團股份有限公司創(chuàng)新中藥關(guān)鍵技術(shù)國家重點實驗室,天津 300410)
溫經(jīng)湯最早出自于張仲景的《金匱要略》,《婦人大全良方》中的溫經(jīng)湯則是根據(jù)《金匱要略》原方加減而來[1],全方由川芎、當歸、肉桂、白芍、人參、牡丹皮、牛膝、莪術(shù)、甘草9味藥組成。該方具有溫經(jīng)散寒,通利血脈,活血祛瘀,調(diào)經(jīng)止痛的功效[2]。古代經(jīng)典名方目錄(第一批)中包含100首方劑,溫經(jīng)湯是百首之一,同時也是古代經(jīng)典名方關(guān)鍵信息表中公布的7首方劑之一。
VOSviewer軟件可用于構(gòu)建和可視化從大量科學(xué)文獻中提取的重要術(shù)語的共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)。利用VOSviewer軟件對溫經(jīng)湯的臨床應(yīng)用文獻進行分析,探討其臨床應(yīng)用特點。
“異病同治”思想源自黃帝內(nèi)經(jīng),中醫(yī)認識疾病和治療疾病的基本原則是辨證論治,異病同治的根本是“證同治亦同”,也是辨證論治的實質(zhì)體現(xiàn)[3]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)利用多種方法,包括網(wǎng)絡(luò)可視化技術(shù)、高通量技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)等,通過探索與中醫(yī)復(fù)方治療疾病相關(guān)的作用機制,可以從整體上來描述復(fù)方與機體之間的相互作用,從而表明“復(fù)方-多成分-多靶點-疾病”的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系[4]。復(fù)方中藥具有多途徑、多成分、多靶點等協(xié)同作用的特點,而且由于其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和作用的機制比較復(fù)雜,所以不管是在整體上還是細胞以及分子水平上,都很難進行全面系統(tǒng)的研究[5]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)就是通過藥物-基因-疾病的共模塊分析來說明復(fù)方中藥方劑配伍的,有助于中藥“異病同治”科學(xué)內(nèi)涵的闡釋。
本研究用VOSviewer軟件可視化分析溫經(jīng)湯的臨床應(yīng)用,采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)系統(tǒng)分析方法,對溫經(jīng)湯治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的有效成分、作用靶點、作用機制進行探討。
1.1 數(shù)據(jù)庫及軟件 中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平 臺 TCMSP(https://old.tcmspe.com/tcmsp.php);Uniprot數(shù) 據(jù) 庫(https://www.uniprot.org/);GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/);DrugBank數(shù)據(jù)庫(https://go.drugbank.com/);Disgenet數(shù) 據(jù) 庫(https://www.disgenet.org/);David(https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp)數(shù)據(jù)庫;CNKI數(shù)據(jù)庫(https://www.cnki.net/);Cytoscape 3.7.1軟件;STRING數(shù)據(jù)庫(https://www.string-db.org/);Venny 2.1網(wǎng)頁(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html);VOSviewer軟件。
1.2 利用VOSviewer軟件統(tǒng)計分析 檢索中國知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(CNKI),以“溫經(jīng)湯”“加減溫經(jīng)湯”為主題詞精確搜索,時間范圍限定在2000年—2021年5月,篩除動物實驗、綜述等文獻,統(tǒng)一關(guān)鍵詞表達方式。將題錄信息導(dǎo)入到VOSviewer中繪圖,設(shè)置關(guān)鍵詞出現(xiàn)次數(shù)≥5,計數(shù)方式為“Fractional counting”。
1.3 活性化合物及其作用靶點信息 以肉桂、人參、川芎、當歸、莪術(shù)、牛膝、牡丹皮、白芍和甘草9味藥材名為關(guān)鍵詞,在中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺中篩選出溫經(jīng)湯中9味藥材的化學(xué)成分,將藥物生物利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18作為篩選條件,篩選檢索到的化學(xué)成分,同時,結(jié)合檢索知網(wǎng)和萬方等中文數(shù)據(jù)庫對有效活性成分進行補充完善。整理已獲得的靶點蛋白將其導(dǎo)入到Uniprot數(shù)據(jù)庫,將已獲得靶點蛋白與基因名進行轉(zhuǎn)換。對靶點進行篩選和校正,選擇物種為“human”,將所有的基因校正為官方名稱。
1.4 溫經(jīng)湯治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的共同靶點查詢 利用GeneCards數(shù)據(jù)庫、Disgenet數(shù)據(jù)庫以及DrugBank數(shù)據(jù)庫,得到痛經(jīng)(dysmenorrhea)、子宮內(nèi)膜異位癥(endometriosis,EMT)和月經(jīng)不調(diào)(menstrual disorder/irregularities)的潛在靶點。將3種疾病的靶點與溫經(jīng)湯中活性成分所對應(yīng)的靶點取交集,得到溫經(jīng)湯治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的共同作用靶點。
1.5 潛在共有靶點的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將潛在共同作用靶點導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫,選擇Multiple proteins并限定物種為Homo sapiens,構(gòu)建共同作用靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)。再將其導(dǎo)入到軟件Cytoscape 3.7.1中,實現(xiàn)可視化。
1.6 GO富集和KEGG通路分析 將上述獲得的核心靶點輸入David數(shù)據(jù)庫,Select Identifier選擇為OFFICIAL-GENE-SYMBOL,List Type選擇為Gene List。選擇物種為Homo sapiens進行KEGG通路和GO功能富集分析。
1.7 溫經(jīng)湯“異病同治”活性成分-靶點-關(guān)鍵通路網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 把溫經(jīng)湯“異病同治”的KEGG通路和相關(guān)靶點反向?qū)踊钚曰衔?,通過Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖。
2.1 VOSviewer統(tǒng)計分析結(jié)果 對檢索到的文獻進行篩選,去除綜述、動物實驗以及不相關(guān)的文獻,共獲得277篇文獻,統(tǒng)一關(guān)鍵詞表達方式,例如“the wenjing decoction”和“wenjing decoction”統(tǒng)一為“溫經(jīng)湯”,“primary dysmenorrhea”和“dysmenorrhea”統(tǒng)一為“痛經(jīng)”,“寒凝血瘀證”和“寒凝血瘀型”統(tǒng)一為“寒凝血瘀”?!爸嗅t(yī)藥療法”更改為“中醫(yī)藥治療”,“療效觀察”更改為“療效”等。將文獻導(dǎo)入到VOSviewer中繪圖,設(shè)置關(guān)鍵詞出現(xiàn)次數(shù)≥5,計數(shù)方式為“Fractional counting”,結(jié)果如圖1所示。從圖可看出溫經(jīng)湯在臨床上主要用于治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥、月經(jīng)不調(diào)和不孕等婦科疾病。
圖1 VOSviewer關(guān)鍵詞共現(xiàn)聚類視圖
2.2 溫經(jīng)湯候選活性化合物的篩選及靶標預(yù)測 通過TCMSP數(shù)據(jù)庫對溫經(jīng)湯中9味中藥進行檢索,篩選條件是OB≥30%和DL≥0.18,去除沒有靶點的化學(xué)成分,同時結(jié)合文獻檢索補充相關(guān)活性成分。共得到173個活性成分,其中白芍8個、莪術(shù)2個、牡丹皮7個、牛膝17個、川芎6個、肉桂14個、人參28個、當歸3個、甘草88個。將整理搜集到候選活性成分的靶點導(dǎo)入Uniprot數(shù)據(jù)庫,對搜集篩選得到的靶點蛋白進行篩選和校正,將9味藥材的靶點合并去重共得到302個靶點。見表1。
表1 溫經(jīng)湯經(jīng)篩選獲得的173個候選活性化合物基本信息
續(xù)表1 溫經(jīng)湯經(jīng)篩選獲得的173個候選活性化合物基本信息
續(xù)表1 溫經(jīng)湯經(jīng)篩選獲得的173個候選活性化合物基本信息
續(xù)表1 溫經(jīng)湯經(jīng)篩選獲得的173個候選活性化合物基本信息
2.3 溫經(jīng)湯“中藥-活性化合物-靶標”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將9味中藥、173個活性化合物與對應(yīng)的302個基因靶點導(dǎo)入Cytoscape 3.7.1,繪制“藥材-活性化合物靶點”網(wǎng)絡(luò)(圖2)。網(wǎng)絡(luò)共466個節(jié)點,3 370條邊。
圖2 溫經(jīng)湯“中藥-活性化合物-靶標”網(wǎng)絡(luò)
2.4 溫經(jīng)湯治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的潛在靶點分析 通過檢索GeneCards數(shù)據(jù)庫、Drug-Bank數(shù)據(jù)庫以及Disgenet數(shù)據(jù)庫,在GeneCards數(shù)據(jù)庫檢索出子宮內(nèi)膜異位癥1 783個靶點,取相關(guān)性得分大于中位數(shù)的靶點有906個。月經(jīng)不調(diào)有2 720個靶點,取相關(guān)性得分大于中位數(shù)的靶點有1 360個。痛經(jīng)有240個靶點。合并3個數(shù)據(jù)庫檢索到的疾病靶點去重后分別獲取痛經(jīng)373個靶點、子宮內(nèi)膜異位癥1518個靶點和月經(jīng)不調(diào)1 382個靶點。通過使用Venny軟件工具把上面3個疾病靶點分別與溫經(jīng)湯活性化合物調(diào)控的靶標取交集,繪制出韋恩圖(圖3),得到了61個溫經(jīng)湯調(diào)控3種疾病的共有靶標。另外,80個與痛經(jīng)調(diào)控相關(guān)的潛在靶標,151個與子宮內(nèi)膜異位癥調(diào)控相關(guān)的潛在靶標,157個與月經(jīng)不調(diào)調(diào)控相關(guān)的潛在靶標。
圖3 溫經(jīng)湯與痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的靶點交集韋恩圖
2.5 溫經(jīng)湯調(diào)控3種疾病的共有靶標PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 把這61個溫經(jīng)湯調(diào)控3種疾病的共有靶標導(dǎo)入STRING來進行PPI網(wǎng)絡(luò)分析,再使用Cytoscape 3.7.1可視化圖像(圖4)。61個節(jié)點,860條邊在圖中。以節(jié)點表示蛋白,節(jié)點間的相互作用用邊表示。圖示中節(jié)點度值與顏色和節(jié)點有關(guān),顏色越深,節(jié)點越大,表示的節(jié)點值就越大,得到這些共有靶標的平均節(jié)點度值是30,有28個蛋白靶標超過該值。其中ESR1、MAPK3、TP53、PTGS2、VEGFA、TNF、AKT1、IL6,degree值顯著高于其余靶點,在PPI網(wǎng)絡(luò)中起著重要的紐帶作用。
圖4 共有靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.6 GO與KEGG富集分析 將上述獲得的溫經(jīng)湯治療痛經(jīng)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)不調(diào)的潛在核心靶點輸入David數(shù)據(jù)庫進行KEGG通路和GO功能富集分析。KEGG通路共有98條,溫經(jīng)湯“異病同治”的主要信號通路選擇P值最小的前15條信號通路,見圖5A。這些通路主要包括癌癥(pathwaysin cancer)、腫瘤壞死因子信號通路(TNFsignaling pathway)、Toll樣受體信號通路(Toll-like receptor signaling pathway)、子宮內(nèi)膜癌(eEndometrial cancer)、HIF-1信號通路(HIF-1 signaling pathway)、雌激素信號通路(estrogen signaling pathway)等。生物過程(BP)條目計284項,將其中P值最小的前15項進行氣泡圖繪制,見圖5B。生物過程主要涉及炎癥反應(yīng)、血管再生、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、激素應(yīng)答等。
圖5 GO功能(A)與KEGG通路(B)富集分析
2.7 溫經(jīng)湯“異病同治”活性成分-靶點-信號通路網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建 將溫經(jīng)湯“異病同治”的活性成分、潛在作用靶點及KEGG篩選出來的前15條信號通路一一對應(yīng),制作溫經(jīng)湯“異病同治”活性成分-靶點-信號通路圖(見圖6)。根據(jù)通路圖中排名前15的活性化合物度值,篩選出活性成分槲皮素、山柰酚、黃芩素、柚皮素、芹菜素等可能是溫經(jīng)湯“異病同治”的主要活性成分。主要涉及的靶點包括PTGS2、ESR1、PPARG、NOS3、AKT1、CASP3、TNF等。
圖6 活性成分-核心靶點-通路圖
溫經(jīng)湯是治療婦科疾病的經(jīng)典名方,通過VOSviewer軟件可視化分析,總結(jié)出在臨床應(yīng)用中,主要用于治療痛經(jīng)、月經(jīng)不調(diào)、子宮內(nèi)膜異位癥和月經(jīng)病等婦科疾病。
在臨床上子宮內(nèi)膜異位癥的癥狀為痛經(jīng)和月經(jīng)不調(diào)[6]。子宮內(nèi)膜異位癥、痛經(jīng)和月經(jīng)不調(diào)三者病理狀態(tài)相互聯(lián)系,病證相互促進,三者在治療方案上也有著一定的相似性。因此,研究溫經(jīng)湯對子宮內(nèi)膜異位癥、痛經(jīng)和月經(jīng)不調(diào)三者的異病同治機制,為后續(xù)深入研究溫經(jīng)湯發(fā)揮藥效作用的物質(zhì)基礎(chǔ)提供了依據(jù),同時為中醫(yī)“異病同治”提供理論依據(jù)。
溫經(jīng)湯“異病同治”的主要活性成分可能是槲皮素、山柰酚、黃芩素、柚皮素、芹菜素等。槲皮素最有效的作用之一是調(diào)節(jié)炎癥。槲皮素的抗炎作用是通過抑制炎癥酶環(huán)氧合酶(COX)和脂氧合酶,從而減少炎癥介質(zhì)[7]。在體外,利用槲皮素處理脂多糖誘導(dǎo)的小鼠巨噬細胞瘤系細胞炎癥模型,槲皮素顯示出較好的抗炎效果,是通過降低炎癥因子IL-1、IL-6、IL-10的表達量[8]。山柰酚可降低促炎細胞因子的產(chǎn)生和mRNA表達,在細胞層面此抗炎作用也得到了證實[9]。黃芩素的藥理作用是抗炎,增強免疫和抗腫瘤。研究表明,黃芩素可抑制炎性遞質(zhì)前列腺素E2(PGE2)、NO的凋亡,改善環(huán)氧化物酶-2(COX-2)蛋白表達水平,且抗炎效果和藥物濃度呈一定程度的正相關(guān)。并且黃芩素也可對腫瘤增殖、生長等機制產(chǎn)生抑制作用。
本研究篩選出溫經(jīng)湯異病同治的潛在作用靶點包括PTGS2、ESR1、NOS3、AKT1、CASP3、TNF等,其中雌激素受體(ESR1),介導(dǎo)大部分的雌激素反應(yīng)。子宮內(nèi)膜異位癥(endometriosis)是一種常見的婦科疾病,其依賴于雌激素,雌二醇(estradiol,E2)作為一種雌激素,能夠促進異位病灶細胞的黏附、侵襲、增殖、抑制凋亡以及維持炎性反應(yīng)[10]。因此通過調(diào)節(jié)體內(nèi)雌激素的水平可有效治療子宮內(nèi)膜異位癥、痛經(jīng)和月經(jīng)不調(diào)[11-12]。腫瘤壞死因子(TNF)是一類能夠參與多種生物效應(yīng)的細胞因子,其通過結(jié)合細胞膜上的受體來激活TNF信號通路,以此來調(diào)控細胞的生長、分化、調(diào)亡及誘發(fā)炎癥等過程,另外對新生血管生成也有一定的潛在誘導(dǎo)作用[13]。研究表明,內(nèi)膜異位有可能會刺激機體產(chǎn)生相關(guān)的免疫反應(yīng),導(dǎo)致腹腔液白細胞中的巨噬細胞大量增加,從而誘發(fā)其產(chǎn)生較多的TNF-α因子,促進間質(zhì)細胞的黏附和增殖,最終導(dǎo)致異位病灶[14]。
溫經(jīng)湯中中醫(yī)異病同治主要涉及到癌癥信號通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路、Toll樣受體信號通路、子宮內(nèi)膜癌、HIF-1信號通路、雌激素信號通路等。子宮內(nèi)膜異位癥雖然在病理組織學(xué)上呈現(xiàn)出良性腫瘤的狀態(tài),但其具有惡性腫瘤的特點,如調(diào)節(jié)子宮內(nèi)膜細胞的遷移、黏附和生成新生血管等[15]。病理學(xué)研究認為,非典型的子宮內(nèi)膜異位癥是良性的子宮內(nèi)膜異位癥到癌癥的一個過渡,所以子宮內(nèi)膜異位癥其實就是卵巢癌的癌前狀態(tài)[16]。有研究[17]發(fā)現(xiàn)EMT患者異位子宮內(nèi)膜以及血清中腫瘤壞死因子、白細胞介素-1β等炎癥因子水平升高,通過控制這些炎癥因子水平有利于EMT的治療。Toll樣受體信號通路可能參與調(diào)節(jié)EMT的發(fā)生、發(fā)展[18]。
Rashidi等[19]通過分析15例患者體內(nèi)的子宮內(nèi)膜組織,證明了TLR4蛋白在子宮內(nèi)膜的間質(zhì)細胞及內(nèi)膜上皮細胞中都有表達,而且子宮內(nèi)膜的間質(zhì)細胞中蛋白表達水平比子宮內(nèi)膜上皮細胞要高,表明TLR4蛋白可能參與對子宮內(nèi)膜中的免疫反應(yīng)調(diào)節(jié)。在分子細胞方面,Khan等[20]發(fā)現(xiàn)子宮內(nèi)膜異位癥患者腹腔液白細胞中的巨噬細胞分泌的炎癥細胞因子(如TNF-α、IL-6等)在雌激素和LPS的聯(lián)合作用下顯著增加,并且發(fā)現(xiàn)在該作用下使得培養(yǎng)的在位和異位子宮內(nèi)膜細胞顯著增多。但是當阻斷了雌激素受體與TLR4的作用后,明顯抑制了炎癥細胞因子的分泌及子宮內(nèi)膜細胞的生長。這表明了雌激素和TLR4信號通路的聯(lián)合有助于促進盆腔炎性反應(yīng),促進子宮內(nèi)膜異位細胞的生長。缺氧誘導(dǎo)因子-1α是HIF-1信號通路中在機體缺氧條件下關(guān)鍵應(yīng)答調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子,通過調(diào)控血管生成素、血管內(nèi)皮生長因子、血小板生長因子等的表達,對異位子宮內(nèi)膜的血管生成發(fā)揮重要作用[21]。
Goteri等[22]通過對子宮內(nèi)膜異位癥患者異位灶局部的檢測,發(fā)現(xiàn)HIF-1α的表達量明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織。結(jié)果表明內(nèi)膜異位癥的發(fā)生發(fā)展和血管的生成及促血管因子表達的上調(diào)密切相關(guān),HIF-1α可能參與了其中的一些促進作用。相關(guān)研究[23]證實HIF-1α在多種病理過程中發(fā)揮很大作用,如腫瘤的血管生成、侵襲和轉(zhuǎn)移等。子宮內(nèi)膜異位癥即使屬于良性的疾病,但是其增殖、浸潤、轉(zhuǎn)移及復(fù)發(fā)等病理學(xué)行為與惡性腫瘤極為相似,所以HIF-1α在子宮內(nèi)膜異位癥中的作用也得到更多的關(guān)注。在黃體中期雌二醇高峰能夠促進月經(jīng)前期子宮內(nèi)膜中PGF2α的生成;孕激素(progesterone,P)可以把雌二醇轉(zhuǎn)化為沒有活性的雌酮,通過降低PG的合成和子宮平滑肌的舒縮活性來緩解痛經(jīng)。國內(nèi)有相關(guān)研究表明雌激素和孕激素與其受體結(jié)合,可以激活血清中的肥大細胞釋放致痛的物質(zhì),與痛經(jīng)的發(fā)生相關(guān)[24]。病灶局部中高雌激素和雌激素受體會導(dǎo)致異位組織的細胞在增殖、凋亡、黏附、侵襲、血管新生和炎性反應(yīng)等多方面發(fā)生異常,對發(fā)生發(fā)展子宮內(nèi)膜異位癥十分有利[25]。
本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)直觀表現(xiàn)了溫經(jīng)湯“異病同治”作用是通過多成分、多靶點的方式發(fā)揮其功效,為進一步實驗驗證和臨床應(yīng)用提供了理論依據(jù)。