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    MMS21通過維持MCM2-7復(fù)合物穩(wěn)定性促進(jìn)肝細(xì)胞癌增殖活性

    2022-04-18 13:56:42李文佳朱元昕胡開順
    關(guān)鍵詞:肝癌水平

    李文佳,朱元昕,胡開順

    (中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院基礎(chǔ)與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心//廣東省惡性腫瘤表觀遺傳與基因調(diào)控重點實驗室,廣東廣州 510080)

    肝癌是世界第六大常見的惡性腫瘤。在中國,肝癌更是位列腫瘤相關(guān)死亡原因第二位;其中,85%~90%屬于肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)。早期診斷率低、有效治療藥物的缺乏、術(shù)后易復(fù)發(fā)等,是導(dǎo)致肝癌患者預(yù)后差的主要原因[1]。因此,深入研究肝癌形成及進(jìn)展的分子機制,尋找新的診斷及治療靶點,仍然是目前肝癌研究的重要內(nèi)容。SUMO E3連接酶MMS21(NSMCE2),結(jié)構(gòu)上包含兩種染色體結(jié)構(gòu)維持蛋白(Smc5/6)和一個Siz/PIAS(激活信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白抑制劑和轉(zhuǎn)錄激活因子)RING 結(jié)構(gòu)域,具有E3 連接酶活性并參與Small Ubiquitin-like Modifier(SUMO)進(jìn)程。當(dāng)E3 連接酶MMS21 的SUMO 活性被破壞時,會導(dǎo)致不同的表型,如DNA 損傷、核仁完整性和端粒聚集缺陷等[2]。MMS21 作為SMC5/6 復(fù)合體的亞基,同時也是停滯叉蛋白質(zhì)組的關(guān)鍵組成部分,能拮抗基因組不穩(wěn)定[3]。Zhao[2]和Branzei 等[4]發(fā)現(xiàn)在芽殖酵母中,MMS21 的缺失是致命的,雖然缺失其部分SUMO活性不完全致死,但造成復(fù)制相關(guān)DNA 修復(fù)缺陷。Richard 等[5]證明MMS21 通過維持DNA 修復(fù)、平衡轉(zhuǎn)錄和基因組穩(wěn)定性等在植物發(fā)育過程起到至關(guān)重要的作用。Kelvin 等[6]發(fā)現(xiàn)MMS21 是復(fù)制應(yīng)激修復(fù)反應(yīng)的基因產(chǎn)物,是細(xì)胞有效拯救折疊的復(fù)制叉以完成DNA 合成所必需的。然而MMS21在肝癌中的功能與作用機制尚未報道,我們將對此問題進(jìn)行全面探討,以期為肝癌的診斷和治療提供新的靶點和理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 材料與試劑

    表達(dá)載體pLVX-DsRed-Monomer-N1(Clontech,632152),胎牛血清(LONSERA,S712-012),總RNA 提取試劑盒(ESscience,RN001),逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(TaKaRa,RR047A-1),SYBR Green qPCRMix(TaKaRa,RR820),ECL 化學(xué)發(fā)光底物(Vazyme,E412-01-AA),高保真酶(TaKa-Ra,R040),限制性內(nèi)切酶BamH1(Thermo Scientific,ER0051),Xho1(Thermo Scientific,ER0691),GeneJET PCR 純化試劑盒(Thermo Scientific,K0702),T4 連接酶(Thermo Scientific,EL0014),粘附載玻片(CITOTEST,80312-3161),顯微鏡蓋玻片(CITOTEST,80340-3610),快速銀染試劑盒(Beyotime,P0017S),RNase(AG,A3A0336),PI(Beyotime,ST511),Lipofectamine?RNAiMAX(Thermo Scientific,13778150),anti-BrdU(ABclonal,A1482),DAPI(Beyotime,C1002),Goat anti-Mouse IgG(H+L)Cross-Adsorbed Secondary Antibody,Alexa Fluor 488(Thermo Scientific,A11001),anti-IdU(Origene,TA190129),anti-BrdU(Abcam,ab6326),Goat anti-Rat IgG(H+L)Cross-Adsorbed Secondary Antibody,Alexa Fluor 555(Thermo Scientific,A-21434),anti-MYC(Servicebio,GB12076),anti-Tubulin(TransGen Biotech,HC101-01),anti-Cyclin A2(CST,4656T),anti-Cyclin B1(CST,4138T),anti-Cyclin D1(PTG,60186-1-Ig),anti-Cyclin D3(CST,2936T),anti-Cyclin E1(PTG,11554-1-AP),anti-MCM2(BD,610700),anti-MCM3(PTG,15597-1-AP),anti-MCM4(PTG,13043-1-AP),anti-MCM5(PTG,11703-1-AP),anti-MCM6(BD,611622),anti-MCM7(PTG,11225-1-AP),anti-NSE2/MMS21(Santa,sc-51747)。

    1.2 細(xì)胞培養(yǎng)

    SK-hep1、Huh7、HepG2、SNU-182 和LO2 細(xì)胞均來自中科院上海細(xì)胞庫,細(xì)胞在37 ℃和5% CO2的培養(yǎng)箱中使用含有10%的FBS 高糖DMEM 培養(yǎng)基培養(yǎng)。

    1.3 PCR擴增MMS21

    以SK-hep1 全基因組cDNA 為模板,高保真酶擴增目的基因。反應(yīng)條件為:98 ℃5 min;98 ℃10 s;55 ℃5 s;72 ℃1 min,進(jìn)行35 個循環(huán)。將PCR 產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,取正確大小的膠帶進(jìn)行回收純化。純化后的產(chǎn)物用BamH1 和XhoI 內(nèi)切酶37 ℃反應(yīng)1 h 后,純化片段,并用T4 連接酶將其連接到同樣酶切過后的Plvx表達(dá)載體中,通過大腸桿菌轉(zhuǎn)化涂板,挑選出單克隆菌落,測序鑒定。MMS21 PCR擴增引物:F(含MYC標(biāo)簽):CCCTCGAGATGGAGCAGAAACTCATCTCTGAAGAGGATCTGAT -GCCAGGACGTTCCAGTTC;R:CGGGATCCTCCTA CTCGGAATGACGATGTC。

    1.4 免疫沉淀與質(zhì)譜

    采用10 cm 大皿擴增Plvx-MYC-MMS21 和Plvx-MYC-Vector 細(xì)胞,待細(xì)胞長到85%,去除上清,用1 mL 含有蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑的NETN buffer(20 mmol/L Tris-HCl[pH 8.0],100 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA and 0.5% Nonidet P-40)裂解液將細(xì)胞在冰上裂解30 min 并收集[7]。再用4 ℃15 000×g高速離心機去除細(xì)胞碎片沉淀,收集上清。在上清中加入用NETN buffer 清洗過三次的MYC標(biāo)簽的瓊脂糖珠,置于4 ℃冰箱搖床孵育過夜。將瓊脂糖珠-抗體-蛋白的混合物清洗三次,取90%樣品進(jìn)行銀染及質(zhì)譜分析,10%樣品在98 ℃高溫變性10 min,置于8%SDS-PAEG電泳膠。

    1.5 DNA Fiber

    在細(xì)胞密度70%~85%時,CIdU(50 μmol/L)處理20 min 后,用PBS 洗兩次,用IdU(500 μmol/L)處理20 min,用胰酶消化細(xì)胞并收集于1.5 mL EP 管中離心,用預(yù)冷的PBS 重懸細(xì)胞沉淀,置于冰上30 min,將1 μL 細(xì)胞滴在載玻片靜置片刻,待液滴邊緣干燥時,加入裂解液7 μL并靜置2 min,再將載玻片傾斜(20°~40°角)使液滴緩慢流下,待玻片風(fēng)干后,固定并變性90 min,用PBS 洗3 min,用免疫熒光封閉液封閉30 min,加入一抗BrdU(Rat)/IdU(M)于4 ℃孵育過夜。第二天用PBST 清洗3 次,每次3 min,熒光二抗Goat anti-Rat IgG(H+L)Cross-Adsorbed Secondary Antibody,Alexa Fluor 555 和Goat anti-Mouse IgG(H+L)Cross-Adsorbed Secondary Antibody,Alexa Fluor 488 混合液常溫孵育1 h,用PBST 洗3 次后,載玻片依次用75%、95%和無水乙醇脫水。載玻片用蓋玻片封片后,在具有63倍物鏡的激光共聚焦顯微鏡下成像。

    1.6 流式細(xì)胞術(shù)

    細(xì)胞用siRNA 處理48 h后,用胰酶將細(xì)胞消化收集在1.5 mL EP 管中,常溫120×g低速離心機離心,細(xì)胞沉淀用預(yù)冷的PBS 清洗1 次后,用1 mL 預(yù)冷的PBS 和75%酒精混合物(1:9)重懸細(xì)胞沉淀。單細(xì)胞懸浮液在4 ℃固定過夜后,離心去上清,避光加入1 mL RNase 和PI 混合液(RNase 工作濃度2 μg/mL,PI 工作濃度50 μg/mL)并避光孵育30 min。處理后的單細(xì)胞懸浮液置流式管中,使用流式細(xì)胞儀測定,數(shù)據(jù)采用ModFit LT 5.0軟件進(jìn)行分析。

    1.7 定量PCR

    總RNA 提取、反轉(zhuǎn)錄、qPCR:均使用購自Takara的提取,反轉(zhuǎn)錄、qPCR 試劑盒,參照說明書操作。β-actin 的qPCR 引物F:5’-TCATGAAGTGTGACGTGGACAT-3’,R:5’-CTCAGGAGGAGCAATGATCTTG-3’;MMS21 的qPCR 引 物F:5-ATGCCAGGACGTTCCAGTTC-3’,R:5’-CCATACCAGA GTTGATACA GGCT-3’。

    1.8 細(xì)胞siRNA轉(zhuǎn)染

    在細(xì)胞密度40%~50% 時,進(jìn)行細(xì)胞siRNA(small interference RNA)干擾。具體實驗步驟如下:分別將5 μL Lipofectamine?RNAiMAX 試劑用150 μL Opti-MEM 培養(yǎng)基稀釋成混合液(1),30 pmol siRNA 用150 μL Opti-MEM 培養(yǎng)基稀釋成混合液(2)。再將混合液(2)加入混合液(1)中,室溫孵育5 min 后,加入細(xì)胞培養(yǎng)皿中。細(xì)胞在37 ℃和5% CO2的培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)48 h。MMS21 siRNA序列如下:siMMS21#1:5’-UUCAACCAUUGCCUUGUCCTT-3’,siMMS21#2:5’-GACUGAAGUGAG UAGUGAAdTdT-3’。

    1.9 統(tǒng)計學(xué)方法

    采用SPSS 25.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析,GraphPad Prism 8.0 軟件作圖。組間數(shù)據(jù)平均值比較采用Student′st-test檢驗。

    2 結(jié)果

    2.1 MMS21 在肝細(xì)胞癌中高表達(dá)且與預(yù)后不良相關(guān)

    為了闡述MMS21 在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用,我們首先分析了MMS21在HCC 中的mRNA 表達(dá)水平。Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)(http://gepia.cancer-pku.cn/)的數(shù)據(jù)顯示,與160 例癌旁組織(N)相比,369 例肝細(xì)胞癌組織(T)中的MMS21 表達(dá)顯著上調(diào)(圖1A)。同時在數(shù)據(jù)庫clinical proteomic tumor analysis consortium(CPTAC)(https://proteomics.cancer.gov/programs/cptac)中,對比HCC的癌旁組織,MMS21(NSMCE2)在肝癌組織中的蛋白水平也呈現(xiàn)高表達(dá)(圖1B)。值得注意的是,MMS21 的高表達(dá)與肝癌患者的不良預(yù)后相關(guān)(圖1C)。接下來,我們收集了正常肝細(xì)胞系LO2 和4 個肝癌細(xì)胞系(Huh7、SK-hep1、HepG2 和SUN-182)以做進(jìn)一步的證明。通過qPCR 和Western blot 分別檢測mRNA 和蛋白表達(dá)水平,結(jié)果顯示肝癌細(xì)胞系中MMS21 的mRNA 和蛋白表達(dá)明顯高于正常肝細(xì)胞系(圖1D)。綜上所述,MMS21與肝癌的惡性進(jìn)展密切相關(guān)。

    圖1 MMS21在肝細(xì)胞癌中高表達(dá)且與患者預(yù)后不良相關(guān)Fig.1 MMS21 was upregulated in HCC tissues and associated with poor prognosis

    2.2 沉默MMS21阻礙肝癌細(xì)胞G1-S期的轉(zhuǎn)換

    接下來,為證明MMS21 在肝癌增殖中的重要作用,我們分別敲低肝癌細(xì)胞SK-hep1 和HepG2中的內(nèi)源性MMS21 蛋白表達(dá)來進(jìn)行功能缺失實驗(圖2A)。細(xì)胞周期分析顯示,在MMS21 敲低的SK-hep1 細(xì)胞中G1 期比例增加,S 期比例減少,G2/M 期的比例減少;同樣在HepG2 細(xì)胞中,敲低內(nèi)源性MMS21 后,G1 期細(xì)胞比例增加,S 期細(xì)胞比例減少,G2/M 期細(xì)胞的比例減少(圖2B、2C)。

    圖2 沉默MMS21阻礙肝癌細(xì)胞G1-S期的轉(zhuǎn)換Fig.2 MMS21 silence blocks the G1-S phase transition in HCC cells

    2.3 沉默MMS21抑制肝癌細(xì)胞的增殖

    為進(jìn)一步探討肝細(xì)胞癌中MMS21 的促增殖作用,我們利用BrdU和克隆形成試驗來評估MMS21對肝癌細(xì)胞SK-hep1和HepG2細(xì)胞增殖能力的影響。如 圖3A、3 所 示,在MMS21 敲低的SK-hep1 和HepG2 細(xì)胞中,SK-hep1 細(xì)胞增殖能力和克隆形成能力顯著降低。在HepG2 細(xì)胞中也得到了一致結(jié)論,敲低內(nèi)源性MMS21后細(xì)胞的增殖能力顯著下降。

    圖3 沉默MMS21抑制肝癌細(xì)胞的增殖Fig.3 Depletion of MMS21 inhibits HCC cells proliferation

    2.4 沉默MMS21減慢DNA復(fù)制叉的速度

    我們進(jìn)行了DNA Fiber 實驗以研究敲低MMS21 后對細(xì)胞復(fù)制叉動力學(xué)的影響,以進(jìn)一步明確MMS21 調(diào)控肝細(xì)胞癌增殖的分子機制。與對照細(xì)胞(~1.154 kb/min)相比,敲低MMS21 的細(xì)胞中表現(xiàn)出平均復(fù)制速度(~0.844 kb/min 和~0.9125 kb/min)顯著降低。這些結(jié)果表明MMS21在肝癌細(xì)胞的DNA復(fù)制過程中發(fā)揮十分重要作用(圖4)。

    圖4 沉默MMS21減慢DNA復(fù)制叉的速度Fig.4 MMS21 knockdown reduces the DNA replication-fork speed

    2.5 MMS21互作蛋白組聚類分析

    我們以上數(shù)據(jù)表明,MMS21 在肝癌細(xì)胞的增殖中發(fā)揮著重要作用。為了更深入地了解MMS21在HCC 形成中的潛在機制,我們采用質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)來鑒定MMS21的下游靶蛋白。在穩(wěn)定過表達(dá)MMS21 的SK-hep1 細(xì)胞中,Co-IP 后的銀染結(jié)果提示,與對照組相比,有較多差異蛋白存在(圖5A、5B)。進(jìn)一步,我們通過質(zhì)譜鑒定了MMS21的互作蛋白質(zhì)組。對比對照組和實驗組質(zhì)譜數(shù)據(jù),鑒定出與MMS21 特異結(jié)合的641 個蛋白(圖5C)。通過對641 個互作蛋白進(jìn)行GO(Gene Ontology)分析,顯示MMS21 及其互作蛋白參與蛋白翻譯、定位、折疊,線粒體翻譯以及免疫反應(yīng)等細(xì)胞過程,同時利用3.6.3 Cytoscape 分析軟件,進(jìn)一步對與MMS21 相互作用的蛋白構(gòu)建蛋白相互作用關(guān)系網(wǎng)。值得注意的是,MMS21 的互作蛋白與細(xì)胞周期調(diào)控密切相關(guān),如Cyclin A2,MCM3/5/6等(圖5D-5F)。

    圖5 MMS21互作蛋白組聚類分析Fig.5 Bioinformatic clustering analyses of MMS21 interactome

    2.6 MMS21參與調(diào)控肝癌細(xì)胞的周期蛋白

    細(xì)胞周期受到細(xì)胞周期蛋白、細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶等的共同調(diào)節(jié)。如圖6A 所示,在經(jīng)典細(xì)胞周期模型中,G1期細(xì)胞受生長因子刺激會導(dǎo)致D型細(xì)胞周期蛋白(Cyclin D1、D2 和D3)上調(diào),進(jìn)而激活細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶CDK4/6,形成的Cyclin D-CDK4/6 復(fù)合物與E 型細(xì)胞周期蛋白(Cyclin E1 和E2)及其相關(guān)激酶(主要是CDK2,但也有CDK1/3)磷酸化并使視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤蛋白Rb 失活。在協(xié)同作用驅(qū)動下細(xì)胞進(jìn)入S 期,此時細(xì)胞周期蛋白A2(Cyclin A2)上調(diào)并與CDK1/2 結(jié)合促進(jìn)S期進(jìn)展。在第二個間隙階段(G2)之后,細(xì)胞周期蛋白B(Cyclin B)易位到細(xì)胞核,激活CDK1,并推動遺傳物質(zhì)分離到子細(xì)胞。通過質(zhì)譜結(jié)果,提示我們MMS21 可能參與調(diào)控細(xì)胞周期蛋白。為了驗證這一假說,我們進(jìn)行了蛋白質(zhì)印跡分析,結(jié)果顯示MMS21 敲低后,可以顯著降低S 期和G2/M 期的周期蛋白表達(dá)量,而對G1 期的前期周期蛋白沒有顯著變化,G1 期的后期周期蛋白E1 水平增加(圖6B)。微小染色體維持蛋白家族(minichromosome maintenance proteins,MCMs)是DNA 復(fù)制所必需的蛋白,MCM2-7形成的六聚體具有DNA解旋酶活性是DNA復(fù)制解旋酶的催化核心,在單個細(xì)胞的S期中確?;蚪MDNA 完全準(zhǔn)確的復(fù)制。為了進(jìn)一步證實MMS21 參與細(xì)胞周期的調(diào)控,我們敲低MMS21 蛋白后檢測MCM2-7 復(fù)合物的蛋白水平,發(fā)現(xiàn)整個復(fù)合物蛋白水平都降低,其中MCM3/6 降低尤其明顯。綜上所述,MMS21 能夠影響細(xì)胞周期蛋白表達(dá)水平進(jìn)而調(diào)控肝癌細(xì)胞的增殖(圖6C)。

    圖6 MMS21參與調(diào)控肝癌細(xì)胞的周期相關(guān)蛋白穩(wěn)定性Fig.6 MMS21 maintained the protein stability of several cell cycle regulators in HCC

    3 討論

    近年來,隨著手術(shù)方案的改進(jìn)以及新的化療方案等的出現(xiàn),雖然肝癌患者的生存率較前有所提高,但是肝癌患者的預(yù)后仍然較差[8]。因此,深入闡明肝癌發(fā)生發(fā)展的分子機制,對于尋找新的診斷及治療靶點、改善肝癌患者的預(yù)后具有十分重要的作用。

    在本課題研究中,我們通過GEPIA 和CPTAC數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),在肝癌組織中MMS21 的mRNA和蛋白水平均呈高表達(dá),并且其高表達(dá)與肝癌患者不良預(yù)后相關(guān)。進(jìn)一步,通過qPCR 和Western blot檢測LO2(人正常肝細(xì)胞)、Huh7、HepG2、SK-Hep1和SUN-182 等細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)在肝癌細(xì)胞系中MMS21 的mRNA 和蛋白水均顯著上調(diào)。提示,MMS21 在肝癌中可能發(fā)揮促癌的功能。同時在GEPIA 數(shù)據(jù)庫中,我們也發(fā)現(xiàn)MMS21 在膽管癌(CHOL)、彌漫大B 細(xì)胞淋巴瘤(DLBC)、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)、胰腺癌(PAAD)和胸腺癌(THYM)中均呈高表達(dá),提示MMS21 在多種腫瘤中扮演促癌基因的角色。對于MMS21 在多種腫瘤中高表達(dá)的原因,我們推測可能有以下三個方面的因素:1、在DNA 水平,通過UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu/)中的TCGA 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),相比于癌旁組織,在肝癌組織中MMS21 的啟動子甲基化水平更低,提示MMS21 啟動子的去甲基化與肝癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān);2、在轉(zhuǎn)錄水平,利用miRDB 數(shù)據(jù)庫(http://www.mirdb.org/)預(yù)測MMS21 可能相互作用的microRNA,發(fā)現(xiàn)其可作為miR-3143,miR-498-5p,miR-302c-5p,miR-6798-3p,and miR-31-3p 等microRNA 的靶基因。Jing 等[9]發(fā)現(xiàn)在宮頸癌細(xì)胞中miR-31-3p顯著下調(diào),體外過表達(dá)miR-31-3p能夠抑制宮頸癌細(xì)胞的惡性行為和EMT,提示我們microRNA 可能參與調(diào)控MMS21 的mRNA 表達(dá)水平;不過我們也不排除還有其他潛在的轉(zhuǎn)錄因子,在轉(zhuǎn)錄水平介導(dǎo)MMS21 的表達(dá),我們后續(xù)將進(jìn)一步實驗研究證明;3、在蛋白水平,通過分析Co-IP聯(lián)合質(zhì)譜鑒定MMS21 的互作蛋白,我們發(fā)現(xiàn)MMS21 與去泛素化酶(DUB)家族中的USP5/33/37/53 有相互作用,這提示我們?nèi)シ核鼗敢矃⑴cMMS21 的蛋白穩(wěn)定性調(diào)節(jié),對此我們將在接下來研究中深入探討。Jacome 等[10]在轉(zhuǎn)基因鼠的研究發(fā)現(xiàn),MMS21 的單拷貝缺失可以增加淋巴瘤等腫瘤的發(fā)生率,而且這種作用并不依賴于其SUMO 化酶活性。Potts 等[11]報道,在骨肉瘤細(xì)胞中,MMS21參與形成的SMC5/6復(fù)合體能夠調(diào)節(jié)端粒結(jié)合蛋白的SUMO 化修飾,介導(dǎo)端粒的同源修復(fù)和延長抑制腫瘤細(xì)胞的衰老。然而,Ni 等[12]發(fā)現(xiàn),在乳腺癌MCF-7 細(xì)胞中,MMS21 參與細(xì)胞DNA 損傷修復(fù)和細(xì)胞有絲分裂進(jìn)程導(dǎo)致細(xì)胞增殖受阻。因此,MMS21 在不同的研究模型或腫瘤中,可能通過不同的機制發(fā)揮著截然不同的作用。然而MMS21 在肝癌中的功能及作用機制目前尚未見報道。在本研究中,我們通過流式細(xì)胞術(shù)、BrdU、DNA Fiber 等多種方法檢測了MMS21 對肝癌細(xì)胞增殖等影響。結(jié)果表明,當(dāng)MMS21 缺陷時能夠明顯抑制肝癌的細(xì)胞周期進(jìn)程,阻礙細(xì)胞由G1 向S 期的轉(zhuǎn)換,從而使其阻滯在G1 期。MMS21 已被證明有助于DSB修復(fù)、暫停復(fù)制叉重啟和HR 的端粒伸長[13]。當(dāng)復(fù)制叉遇到阻力會導(dǎo)致復(fù)制叉停頓,DNA Fiber 技術(shù)已成為直接監(jiān)測DNA 復(fù)制叉動力學(xué)的金標(biāo)準(zhǔn)[14]。DNA Fiber 分析結(jié)果表明,敲低MMS21 能阻礙復(fù)制叉的前進(jìn),抑制DNA合成速度,這提示MMS21與肝癌細(xì)胞復(fù)制叉進(jìn)程有關(guān)。MMS21作為SMC5/6復(fù)合體的一員,在調(diào)節(jié)DNA 損傷修復(fù)過程中具有重要作用,而DNA 損傷與細(xì)胞周期的有序進(jìn)行密切相關(guān)[15]。為了更直接的闡明MMS21 調(diào)節(jié)細(xì)胞周期的作用,我們通過Co-IP 聯(lián)合質(zhì)譜鑒定的方法檢測了MMS21 的互作蛋白組。結(jié)果發(fā)現(xiàn),MMS21 的互作蛋白主要與細(xì)胞周期相關(guān)通路有關(guān)。這提示我們,除了通過調(diào)節(jié)DNA 損傷修復(fù)間接促進(jìn)細(xì)胞周期的正常進(jìn)行,MMS21 還可以通過結(jié)合細(xì)胞周期相關(guān)蛋白直接調(diào)節(jié)細(xì)胞周期。為了證實這一猜想,我們檢測了MMS21對細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的調(diào)節(jié)作用,發(fā)現(xiàn)MMS21能夠調(diào)控細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的表達(dá),敲低MMS21 能下調(diào)S 和G2 期周期蛋白Cyclin A2 和Cyclin B1的蛋白水平同時上調(diào)G1后期蛋白Cyclin E1水平,提示MMS21的缺陷導(dǎo)致細(xì)胞阻滯在G1期,抑制G1/S的轉(zhuǎn)變。MCMs蛋白家族在所有真核生物中具有高度保守性[16]。既往研究將MCM 確定為DNA復(fù)制起始的核心參與者[17]。最近的研究表明,MCM 蛋白也在復(fù)制延長中起作用,可能作為DNA解旋酶[16]。MCMs 在整個細(xì)胞周期中組成性地定位于細(xì)胞核中,它們與染色質(zhì)結(jié)合,受細(xì)胞周期蛋白調(diào)控[18-19],同時MCM 與擴展復(fù)制叉相關(guān)聯(lián),其動力學(xué)與DNA 合成因子相似,隨著復(fù)制叉的擴展而移開[20-21]。我們在質(zhì)譜蛋白互作數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn),MMS21 與MCM2/3/5/6 相互作用,同時敲低MMS21能下調(diào)MCM2-7 復(fù)合物內(nèi)的幾乎所有蛋白的穩(wěn)定性。然而,MMS21 對其結(jié)合的細(xì)胞周期相關(guān)蛋白的調(diào)節(jié)是否依賴于其SUMO 化酶活性以及具體的調(diào)節(jié)靶蛋白是什么,以及MMS21 對于MCM2-7 復(fù)合物的穩(wěn)定性調(diào)節(jié)具體機制,目前尚不清楚。我們將通過后續(xù)研究對此問題進(jìn)行深入闡明。

    綜上所述,本研究證實MMS21 在肝癌中高表達(dá),并促進(jìn)肝癌細(xì)胞的生長,其機制為調(diào)控細(xì)胞周期蛋白和細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶表達(dá),同時影響MCM2-7 復(fù)合物的蛋白水平。這些數(shù)據(jù)表明MMS21 可能是肝癌診治的潛在新靶標(biāo),為肝癌的診斷和治療提供新思路。

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