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      MAFB基因多態(tài)性與非綜合征型唇腭裂的研究進(jìn)展

      2021-11-30 13:07:08王世奎宋慶高蘭雪嬌
      口腔疾病防治 2021年1期
      關(guān)鍵詞:等位基因關(guān)聯(lián)位點(diǎn)

      王世奎, 宋慶高, 蘭雪嬌

      1.遵義醫(yī)科大學(xué),貴州 遵義(563000); 2.遵義醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院口腔頜面外科,貴州 遵義(563000)

      唇腭裂是兒童最常見的先天性出生缺陷之一,在中國新生兒發(fā)病率為1.4‰[1]。不同人群、地域及環(huán)境等狀況下唇腭裂的發(fā)病率有明顯差異[2]。根據(jù)是否伴有畸形分類,非綜合征型唇腭裂約占唇腭裂70%,包括非綜合征型唇裂伴或不伴腭裂和單純性腭裂,可根據(jù)胚胎發(fā)育機(jī)制的不同和遺傳的異質(zhì)性對其進(jìn)行區(qū)分。目前,非綜合征型唇腭裂致病原因不明,主張認(rèn)為是環(huán)境因素和基因因素相互作用的結(jié)果。大量基因被證實(shí)與非綜合征型唇腭裂相關(guān)[3],Beaty 等[4]通過全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)新型易感基因肌腱膜纖維肉瘤癌基因B 型同系物基因(v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B,MAFB)與非綜合征型唇腭裂的致病具有相關(guān)性。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是人類基因組中發(fā)生頻率最高的遺傳變異形式,人群中的表型差異均與SNPs有關(guān),SNPs 的檢測與分析對于了解疾病的病因具有指導(dǎo)作用。以往文獻(xiàn)報(bào)道的與非綜合征型唇腭裂 相 關(guān) 的MAFB 基 因SNPs 包 括rs13041247、rs11696257、rs17820943、rs6072081、rs6065259 及rs61020851等。現(xiàn)本文就近年來對非綜合征型唇腭裂研究較多的MAFB基因SNPs作一綜述。

      1 MAFB 基因的生物學(xué)功能

      MAFB基因位于染色體20q12,該區(qū)域與非綜合征型唇腭裂相關(guān),不存在內(nèi)含子結(jié)構(gòu),Beaty 等[4]檢測出MAFB 基因與非綜合征型唇腭裂相關(guān)的SNPs均在MAFB 基因3’端上游約20~60 kb 的外顯子區(qū),同時(shí)發(fā)現(xiàn)了MAFB 基因罕見的錯(cuò)義突變(H131Q),推測其會破壞蛋白結(jié)構(gòu)并導(dǎo)致非綜合征型唇腭裂發(fā)生。MAFB 基因?qū)儆诖笮蚆AF 蛋白家族,其基因編碼是具有多功能的基本亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)[5],介導(dǎo)蛋白質(zhì)的二聚化和DNA 的合成,參與許多生物過程的調(diào)控并對維持其功能起重要作用。在胚胎發(fā)生過程中MAFB 在后腦脈絡(luò)叢(hindbrain choroid plexus,hChP)上皮細(xì)胞中表達(dá),在早期階段可控制凋亡細(xì)胞及增殖細(xì)胞的數(shù)量,在促進(jìn)hChP發(fā)育中起重要作用[6]。MAFB 通過啟動子區(qū)域的G1 元件激活胰高血糖素基因的表達(dá),是維持和發(fā)育胰島α 細(xì)胞功能的關(guān)鍵調(diào)控因子[7]。Morito 等[8]發(fā)現(xiàn)MAFB 通過調(diào)節(jié)甲狀旁腺激素和細(xì)胞周期蛋白D2 的表達(dá)在繼發(fā)性甲狀旁腺功能亢進(jìn)中起重要作用。MAFB 可誘導(dǎo)補(bǔ)體C1q 基因表達(dá),從而激活經(jīng)典補(bǔ)體途徑以及調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞分化[9]。盡管MAFB 對組織發(fā)育和細(xì)胞分化必不可少,但其基因突變可引起的人類某些疾病的發(fā)生[10]。Miyai 等[11]發(fā)現(xiàn)MAFB 可調(diào)節(jié)表皮角質(zhì)形成細(xì)胞分化,缺乏MAFB的小鼠表皮分化受到了部分損害并且角質(zhì)層更薄。在小鼠胚胎13.5~14.5 d,利用原位雜交和免疫檢測發(fā)現(xiàn)小鼠顱面神經(jīng)外胚層和神經(jīng)嵴分化的中胚層均表達(dá)了MAFB 基因mRNA 和蛋白,在腭板水平向融合期間,腭中嵴上皮也存在表達(dá)。融合后,與間充質(zhì)組織相比,MAFB在口腔上皮細(xì)胞中表達(dá)更為明顯[4],這表明MAFB 基因可作為非綜合征型唇腭裂特異性顱面形態(tài)未來研究的方向。

      2 MAFB 基因SNPs 與非綜合征型唇腭裂

      2.1 rs13041247 與非綜合征型唇腭裂

      Beaty 等[4]在歐洲、亞洲多個(gè)人群的1 965 個(gè)核心家庭樣本中發(fā)現(xiàn)rs13041247 位于染色體20q12.2附近,在對非綜合征型唇腭裂患者中研究最具有意義(P=2.05 × 10-11)。Pan 等[12]在中國漢族人群運(yùn)用病例對照和核心家庭兩種分析方法,證實(shí)了MAFB 基因rs13041247 與非綜合征型唇腭裂存在密切相關(guān)性,研究發(fā)現(xiàn)rs13041247 的C 等位基因在病例組中的頻率(35.6%)比對照組C 型等位基因頻率(49.7%)明顯偏低,而T 等位基因在病例組中的頻率(64.4%)明顯比對照組(50.3%)高,對比基因型可見,攜帶C 型等位基因(CT/CC)與非綜合征型唇腭裂風(fēng)險(xiǎn)降低相關(guān),這說明rs13041247 的C 等位基因在非綜合征型唇腭裂發(fā)生中具有保護(hù)作用。Dunkhase 等[13]通過使用大型全基因組數(shù)據(jù)庫研究發(fā)現(xiàn)染色體20q12 處與非綜合征型唇腭裂相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)SNP rs13041247 在皮膚鱗狀細(xì)胞癌中顯示關(guān)聯(lián),但這兩者等位基因明顯不同。Moreno等[14]側(cè)重母子之間病例對照設(shè)計(jì)經(jīng)Bonferroni 校正后研究發(fā)現(xiàn)MAFB 基因rs13041247 位點(diǎn)與唇裂組及唇腭裂組存在顯著關(guān)聯(lián),存在雙倍次要等位基因可降低非綜合征型唇腭裂發(fā)聲50%的可能。Huang 等[15]通過相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道進(jìn)行Meta 分析,采取不同遺傳模式發(fā)現(xiàn)C 等位基因、CT 基因型和CC+CT 基因模型與降低非綜合征型唇腭裂風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān),支持rs13041247 位點(diǎn)與非綜合征型唇腭裂發(fā)生有關(guān),但也表明這種關(guān)聯(lián)在東亞或高加索人群中并不顯著,說明非綜合征型唇腭裂發(fā)病機(jī)制的復(fù)雜性與人群、地域等有密切關(guān)聯(lián)。綜上,rs13041247 是目前研究較多的單核苷酸位點(diǎn),盡管在不同人群、地域研究結(jié)果存在偏倚,但都揭示了MAFB 基因rs13041247 的C 等位基因是非綜合征型唇腭裂發(fā)生的保護(hù)因素。

      2.2 rs11696257 與非綜合征型唇腭裂

      Babu 等[16]對印度南部人群中173 例非綜合征型唇腭裂患者和179 例正常人進(jìn)行病例對照研究發(fā)現(xiàn)MAFB 基因rs11696257 與非綜合征型唇腭裂有關(guān)聯(lián),rs11696257 等位基因數(shù)據(jù)與rs13041247 相同,兩者處在不完全連鎖狀態(tài),即使經(jīng)過Bonferroni校正后仍然存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。Mi 等[17]采用中國北方漢族人群344 例非綜合征型唇腭裂患者及324例正常人外周血樣本對照研究發(fā)現(xiàn),rs11696257 與非綜合征型唇腭裂患者沒有關(guān)聯(lián),另外rs11696257最小等位基因頻率(MAF=0.4871)高于亞洲地區(qū)(MAF=0.414),這種差異可能是因?yàn)榉N族之間等位基因異質(zhì)性差異所導(dǎo)致的。目前關(guān)于MAFB 基因rs11696257 與非綜合征型唇腭裂的關(guān)系尚未完全清晰,主要與樣本量較少有關(guān)。

      2.3 rs17820943 與非綜合征型唇腭裂

      Zhang 等[18]在中國西部漢族人群中利用多重SNP 分型專利技術(shù)(SNPscan)研究發(fā)現(xiàn)rs17820943中的C/C 純合子在父母與子女之間存在過度傳遞,提示C 等位基因可能增加患病風(fēng)險(xiǎn),單倍型分析顯示在rs17820943 處的C 等位基因和在rs13041247處的T 等位基因組成的單倍型可在非綜合征型唇腭裂中過度傳低。He 等[19]在中國南方漢族人群中利用Taq Man 探針技術(shù),研究發(fā)現(xiàn)與對照組相比,病例組中rs17820943 的T 等位基因頻率比C 等位基因較低,基因型CT 與TT 頻率在病例組中也顯著較低。由此可見,rs17820943 與非綜合征型唇腭裂有相關(guān)性,rs17820943 位點(diǎn)的T 等位基因可能是非綜合征型唇腭裂易感性的保護(hù)因素,而C 等位基因可能是非綜合征型唇腭裂的危險(xiǎn)因素。

      2.4 其他單核苷酸位點(diǎn)與非綜合征型唇腭裂

      He 等[19]在對中國南方人群研究表明rs6072081位點(diǎn)G 等位基因和GG 基因型相比較對照組,在非綜合征型唇腭裂組中顯著降低,攜帶G 型等位基因(AG/GG)與非綜合征型唇腭裂的發(fā)生有一定關(guān)聯(lián)性。Mi 等[17]通過微型測序方法基因分型發(fā)現(xiàn)rs6065259 是MAFB 中重要的SNPs(OR=0.45,95%CI:0.28-0.71,P=0.0027)。Yin 等[20]發(fā)現(xiàn)MAFB 基因rs6129653 與非綜合征型唇腭裂顯著相關(guān),rs6129653 對于非綜合征型唇腭裂發(fā)生中的MAFB表達(dá)也具有轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。

      3 MAFB 基因與其他基因共同作用

      非綜合征型唇腭裂的遺傳機(jī)制錯(cuò)綜復(fù)雜,其中基因之間的相互作用在復(fù)雜的病因?qū)W中也尤為重要。Xiao 等[21]發(fā)現(xiàn)在校正了多次比較之后,MAFB 基因和IRF6 基因的相互作用對歐洲人群非綜合征型唇腭裂的發(fā)生具有顯著作用。Duan 等[22]對單個(gè)SNPs 進(jìn)行了傳輸不平衡測試,發(fā)現(xiàn)MAFB基因rs6072081 和rs6102085 相互作用與漢族人群非綜合征型唇腭裂有關(guān)。Wang 等[23]進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)MAFB 基因附近的每一個(gè)單核苷酸位點(diǎn)相互作用對于非綜合征型唇裂伴或不伴腭裂和單純性腭裂的發(fā)生作用不同,這也說明了兩者之間的病因不同,進(jìn)一步探索了非綜合征型唇腭裂遺傳病因,為全基因組關(guān)聯(lián)分析提供新的見解。

      4 總結(jié)與展望

      綜上所述,MAFB 基因多態(tài)性與非綜合征型唇腭裂存在關(guān)聯(lián),不同的單核苷酸位點(diǎn)在亞洲人群中的研究較多,也體現(xiàn)出明顯的相關(guān)性。這種關(guān)系未能得到具體的解釋,是因?yàn)樵诓煌N族及地域的研究結(jié)論不統(tǒng)一,這也體現(xiàn)出非綜合征型唇腭裂具有相關(guān)的家族聚集性以及遺傳的異質(zhì)性。非綜合征型唇腭裂病因尚未清楚,是多因素、多基因共同導(dǎo)致,盡管功能實(shí)驗(yàn)表明MAFB 基因可能參與腭的發(fā)育過程,但胚胎的發(fā)育涉及基因、轉(zhuǎn)錄因子及信號通路等多種因素的影響,對于MAFB 基因如何參與非綜合征型唇腭裂的形成以及作用機(jī)制尚不可知。目前對MAFB 基因與非綜合征型唇腭裂的關(guān)系研究樣本量較少,需增加研究的樣本量,還要深入探索MAFB 基因與其他易感基因、多種環(huán)境交互作用,為完善非綜合征型唇腭裂的病因提供依據(jù)。

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