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    滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用

    2021-11-03 09:20:54張世佳馮建軍郭松林王藝?yán)?/span>
    分析測(cè)試學(xué)報(bào) 2021年10期
    關(guān)鍵詞:探針靈敏度引物

    張世佳,馮建軍,郭松林,王藝?yán)?,?鵬

    (集美大學(xué) 水產(chǎn)學(xué)院,鰻鱺現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)教育部工程研究中心,農(nóng)業(yè)部東海海水健康養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建 廈門(mén) 361021)

    滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)[1]是模擬病毒遺傳物質(zhì)滾環(huán)式復(fù)制而建立的一種擴(kuò)增技術(shù)。1994 年,Nilsson 等[2]合成鎖式探針(Padlock probe)并應(yīng)用到RCA 技術(shù)后,使RCA 技術(shù)得到了極大發(fā)展,開(kāi)始應(yīng)用于醫(yī)學(xué)[3]、食品科學(xué)[4]等領(lǐng)域。相較于常見(jiàn)的分子檢測(cè)手段,由于是恒溫?cái)U(kuò)增,無(wú)需昂貴的儀器,恒溫水浴鍋便可進(jìn)行,避免了復(fù)雜的反復(fù)升降溫過(guò)程,為現(xiàn)場(chǎng)和在線(xiàn)檢測(cè)提供了可能。此外,基于鎖式探針的滾環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)具有極高的特異性,檢測(cè)序列與結(jié)合引物引發(fā)擴(kuò)增的中間序列互不影響,可采用一種引物對(duì)多種鎖式探針擴(kuò)增,實(shí)現(xiàn)多靶標(biāo)檢測(cè)[5],且由于RCA 擴(kuò)增效率高,有效放大了檢測(cè)信號(hào),極大地提高了檢測(cè)靈敏度[6]。RCA技術(shù)在生物傳感領(lǐng)域的研究進(jìn)展已有報(bào)道[7-8],本文首次綜述了RCA技術(shù)在病原菌、病毒以及其它病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用,并對(duì)RCA技術(shù)在該領(lǐng)域的前景進(jìn)行了展望。

    1 RCA技術(shù)原理與分類(lèi)

    通過(guò)模擬病毒或質(zhì)粒的復(fù)制過(guò)程,環(huán)狀DNA 在具有鏈置換活性的聚合酶和引物作用下得以實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增[9],RCA技術(shù)即在此基礎(chǔ)上發(fā)展而來(lái)。RCA反應(yīng)通常需以下條件[10]:①環(huán)狀DNA或RNA模板;②與環(huán)狀模板部分互補(bǔ)的DNA引物;③具有鏈置換性的聚合酶。根據(jù)擴(kuò)增引物數(shù)量可將RCA技術(shù)分為單引物擴(kuò)增RCA(Single-primer RCA)[11]、多引物擴(kuò)增RCA(Multiple-primer RCA)[12]和指數(shù)擴(kuò)增RCA(Exponential RCA)[13](圖1)。單引物RCA 是指在具有鏈置換性聚合酶的作用下由單一引物引發(fā)環(huán)狀模板延伸,產(chǎn)生長(zhǎng)單鏈重復(fù)序列的DNA 分子,可生成幾千倍模板序列的拷貝,連接和擴(kuò)增均在等溫條件下進(jìn)行,無(wú)需復(fù)雜的變溫儀器,但單引物引發(fā)的滾環(huán)擴(kuò)增效率相對(duì)較慢,且對(duì)低豐度序列檢測(cè)能力不足。多引物RCA 則在單引物RCA 基礎(chǔ)上,增加了1條或多條與模板互補(bǔ)的引物引發(fā)擴(kuò)增,其擴(kuò)增效率可達(dá)到單引物RCA的數(shù)倍,但相應(yīng)的背景信號(hào)也有所上升,易造成結(jié)果假陽(yáng)性。指數(shù)RCA是在單引物RCA 的基礎(chǔ)上額外加入一條與模板鏈序列一致的短單鏈作為引物,這條引物結(jié)合到RCA 擴(kuò)增出來(lái)的線(xiàn)性DNA 產(chǎn)物上,開(kāi)始擴(kuò)增反應(yīng),新合成的產(chǎn)物又可作為第一條引物的模板進(jìn)行擴(kuò)增,如此反復(fù),成指數(shù)級(jí)增長(zhǎng),但與多引物RCA一樣,易造成假陽(yáng)性結(jié)果。

    圖1 RCA的分類(lèi)Fig.1 Classification of RCA

    而目前較為流行的基于鎖式探針的RCA[14]其優(yōu)點(diǎn)及創(chuàng)新表現(xiàn)在探針的設(shè)計(jì):該探針設(shè)計(jì)了兩端具有與目標(biāo)靶序列完全互補(bǔ)配對(duì)的兩個(gè)檢測(cè)端T1和T2、與引物結(jié)合的擴(kuò)增序列P1和P2以及用于雜交的識(shí)別序列zip(圖2)。在反應(yīng)過(guò)程中,探針的T1和T2端和目標(biāo)靶序列毗鄰互補(bǔ),在連接酶作用下連接成環(huán),有一個(gè)堿基不能匹配就無(wú)法成環(huán),保證了檢測(cè)的特異性?;阪i式探針的RCA 實(shí)質(zhì)是對(duì)環(huán)化探針進(jìn)行擴(kuò)增,并非對(duì)靶序列進(jìn)行擴(kuò)增,最大限度地減少了交叉污染以及實(shí)際樣品中抑制因子的影響,放大了信號(hào)值,有助于檢測(cè)靈敏度的提高。

    圖2 鎖式探針Fig.2 Padlock probe

    2 RCA在病原檢測(cè)中的應(yīng)用

    病原微生物是指侵入生物體引起感染甚至傳染病的微生物,常見(jiàn)的病原微生物包括細(xì)菌、病毒、真菌、衣原體、支原體等,病原微生物不僅會(huì)造成極大的經(jīng)濟(jì)損失,而且嚴(yán)重威脅人體健康[15]。傳統(tǒng)的微生物檢測(cè)(如染色鏡檢和分離培養(yǎng))[16]靈敏度低、檢測(cè)周期長(zhǎng),本課題組曾采用免疫法檢測(cè)嗜水氣單胞菌[17],該法快速簡(jiǎn)單,但其靈敏度和特異性與細(xì)菌抗體的質(zhì)量密切相關(guān)。常見(jiàn)的分子檢測(cè)手段如聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)特異性強(qiáng)、靈敏度高[18],但需昂貴的熱循環(huán)儀。而RCA 技術(shù)不僅具有分子檢測(cè)手段的優(yōu)點(diǎn),且無(wú)需特殊的變溫設(shè)備,硬件限制少,此外還可進(jìn)行多靶標(biāo)、高通量檢測(cè),操作簡(jiǎn)單、反應(yīng)迅速。

    2.1 細(xì)菌檢測(cè)

    細(xì)菌是許多疾病的病原體,其檢測(cè)具有廣泛的應(yīng)用前景,RCA 技術(shù)可在較短時(shí)間內(nèi)實(shí)現(xiàn)極微量的分子檢測(cè),并結(jié)合電泳[19]等手段進(jìn)行分析,獲得理想結(jié)果。近年來(lái)報(bào)道的RCA檢測(cè)細(xì)菌總結(jié)于表1。

    表1 滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)在細(xì)菌檢測(cè)中的應(yīng)用Table 1 Application of the RCA in bacteria detection

    由表1 可見(jiàn),直接RCA 法(未與其它技術(shù)聯(lián)用)簡(jiǎn)便、快速、靈敏度高、特異性強(qiáng),在細(xì)菌檢測(cè)領(lǐng)域發(fā)揮了獨(dú)有優(yōu)勢(shì)。黃冠軍等[20]根據(jù)柑桔潰瘍病菌(Xanthomonas axonopodispv. citri)獨(dú)有的蛋白基因設(shè)計(jì)鎖式探針,建立了柑桔潰瘍病的RCA檢測(cè)體系,靈敏度可達(dá)20 cfu/μL,高于常規(guī)的PCR法。且其它植物病原菌不干擾測(cè)定,特異性高。但該法需結(jié)合電泳檢測(cè)結(jié)果,步驟較為繁瑣。

    跨越式滾環(huán)擴(kuò)增(Saltatory rolling circle amplification,SRCA)是近年來(lái)RCA研究的熱點(diǎn),傳統(tǒng)RCA擴(kuò)增模板須是閉合環(huán)狀,但SRCA在Bst DNA聚合酶和引物作用下,沿靶序列擴(kuò)增,擴(kuò)增到靶序列兩端缺口時(shí),通過(guò)添加堿基的方式跨越缺口,實(shí)現(xiàn)開(kāi)環(huán)擴(kuò)增,如果再加一條模板鏈序列一致的引物,即形成SRCA的指數(shù)擴(kuò)增(圖3)[21]。這種方式無(wú)需鎖式探針和連接酶環(huán)化,操作步驟簡(jiǎn)單,反應(yīng)過(guò)程縮短,檢測(cè)成本降低。同時(shí)由于其擴(kuò)增產(chǎn)物是雙鏈DNA,加入SYBR Green Ⅰ試劑即可直接實(shí)現(xiàn)結(jié)果的可視化。張?zhí)N哲等[21]利用SRCA檢測(cè)人工污染雞肉中沙門(mén)氏菌(Salmonella enterica),借助SYBR Green Ⅰ直接觀察檢測(cè)結(jié)果,檢出限為5.6 fg/μL。Milton 等[22]將SRCA、PCR 與實(shí)時(shí)定量PCR 法檢測(cè)沙門(mén)氏菌進(jìn)行對(duì)比,SRCA 法的檢測(cè)限最低,可達(dá)40 cfu/g。SRCA 法檢測(cè)嗜酸耐熱菌(Alicyclobacillus acidoterrestris)[23]也被報(bào)道。

    圖3 跨越式滾環(huán)擴(kuò)增原理[21]Fig.3 The principle of SRCA[21]

    RCA 作為一種信號(hào)擴(kuò)增和放大技術(shù),可與多種生物傳感器技術(shù)聯(lián)用,擴(kuò)增產(chǎn)物通過(guò)與帶有信號(hào)的標(biāo)記物相結(jié)合,實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增信號(hào)的直接讀取,克服了直接RCA 法必須電泳才能查看結(jié)果的弊端(圖4),利用熒光法讀取結(jié)果,簡(jiǎn)單方便,靈敏度高。Chen 等[24]將環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)與RCA 技術(shù)結(jié)合,采用分子信標(biāo)配對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物發(fā)射熒光,進(jìn)行鼠傷寒桿菌(Salmonella typhi)的實(shí)時(shí)檢測(cè),檢測(cè)限為32 cfu/μL,該方法利用LAMP技術(shù)替代鎖式探針的環(huán)化過(guò)程,縮短了擴(kuò)增時(shí)間。Sun 等[25]利用金屬有機(jī)骨架化合物可吸附單鏈DNA 和猝滅熒光的能力,熒光的猝滅和恢復(fù)可通過(guò)對(duì)單鏈DNA的吸附和解吸實(shí)現(xiàn),將其與RCA相結(jié)合,檢測(cè)大腸桿菌O157∶H7,方法的特異性強(qiáng),檢出限可達(dá)40 cfu/mL?;跓晒鈾z測(cè)的RCA法也用于檢測(cè)克羅諾桿菌(Cronobacter spp)[26],且顯著提高了檢測(cè)靈敏度。但熒光檢測(cè)需昂貴的儀器,且熒光容易被猝滅,導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)偏差。比色生物傳感器儀器簡(jiǎn)單,更適用于實(shí)時(shí)的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè),但其靈敏度比熒光生物傳感器低,且比色讀取易受體系基質(zhì)干擾,產(chǎn)生誤讀。Zhang 等[27]開(kāi)發(fā)了一種競(jìng)爭(zhēng)性適配體生物傳感器,生物素標(biāo)記的RCA 引物通過(guò)鏈霉親和素連接在適配體上,適配體與單增李斯特菌(Listeria monocytogenes)接觸后,利用競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系釋放出生物素標(biāo)記的引物引發(fā)RCA 反應(yīng),形成生物素標(biāo)記的長(zhǎng)單鏈DNA,與辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的親和素反應(yīng),生成生物素-親和素-HRP-DNA 產(chǎn)物,加入HRP反應(yīng)底物,通過(guò)吸光度確定單核增生李斯特菌的濃度。該方法設(shè)計(jì)新穎,利用適配體的競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系實(shí)現(xiàn)了檢測(cè)?;瘜W(xué)發(fā)光生物傳感器以化學(xué)發(fā)光的形式定量待測(cè)物含量,發(fā)光強(qiáng)度與化學(xué)發(fā)光反應(yīng)速率相關(guān),反應(yīng)速率與待測(cè)物相關(guān),檢測(cè)成本低、快速、靈敏度高。Xu 等[28]結(jié)合適配體探針(Aptamererprobe,AP)、RCA 和切刻酶擴(kuò)增技術(shù)(Nicking enzyme amplification reaction,NEAR),在AP 探針和金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)結(jié)合時(shí),釋放出互補(bǔ)序列作為切刻酶擴(kuò)增反應(yīng)和RCA 反應(yīng)的引物,RCA 在互補(bǔ)序列的引發(fā)下形成大量G四鏈體(G4)結(jié)構(gòu),與血紅素形成G4/血紅素復(fù)合物,催化H2O2完成魯米諾氧化,發(fā)出化學(xué)發(fā)光信號(hào),可檢測(cè)低至5 cfu/mL 的金黃色葡萄球菌。RCA 有核酸原位擴(kuò)增的特點(diǎn),可用來(lái)設(shè)計(jì)固相或半固相生物傳感器,與電化學(xué)信號(hào)轉(zhuǎn)換器相結(jié)合,具有靈敏度高、重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn),但該法需特定儀器,且對(duì)環(huán)境要求比較苛刻。Zhou等[29]開(kāi)發(fā)了一種基于RCA、DNA walker的電化學(xué)生物傳感器,通過(guò)RCA擴(kuò)增產(chǎn)生多個(gè)重復(fù)序列,該重復(fù)序列與DNA walker探針互補(bǔ)形成多足DNA walker,通過(guò)金膜上電流信號(hào)檢測(cè)銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa),最低可檢測(cè)10 cfu/mL。此外,Li等[30]也基于電信號(hào)輸出,設(shè)計(jì)了一種超靈敏的生物傳感器用于檢測(cè)大腸桿菌O157∶H7的靶基因,檢出限為7 cfu/mL。Aissa 等[31]采用磁珠收集濃縮大腸桿菌(Escherichia coli)DNA,通過(guò)測(cè)量電化學(xué)信號(hào)檢測(cè)大腸桿菌,檢測(cè)限為3.0×105cfu/mL。Kordas等[32]將RCA 技術(shù)與壓電式聲學(xué)傳感器結(jié)合,開(kāi)發(fā)了一種無(wú)標(biāo)記的細(xì)菌檢測(cè)手段,并用于沙門(mén)氏菌的檢測(cè),方法可在無(wú)特殊標(biāo)記的情況下利用傳感器對(duì)芯片的聲比率進(jìn)行檢測(cè),從而有效檢出沙門(mén)氏菌的存在。Huang 等[33]另辟蹊徑,將RCA 技術(shù)和納米金探針以及紙基傳感器結(jié)合,檢測(cè)到最低100 pg/μL的總RNA,該方法造價(jià)低廉,且結(jié)果可視化,在現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)領(lǐng)域具有極大潛力。

    除了傳感器讀取信號(hào),Zhang 等[34]設(shè)計(jì)了一種新奇的結(jié)果可視化的RCA 方法,在磁珠上設(shè)計(jì)大腸桿菌O157∶H7 的核酸適配體,利用競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系釋放出RCA 引物,由此引發(fā)兩個(gè)部分互補(bǔ)的環(huán)狀序列進(jìn)行滾環(huán)擴(kuò)增,產(chǎn)生兩個(gè)長(zhǎng)單鏈DNA,它們互相雜交,形成肉眼可見(jiàn)的DNA水凝膠,該方法對(duì)大腸桿菌O157∶H7的檢出限為4.0×103cfu/mL,1 h內(nèi)即可完成檢測(cè),在食品安全檢測(cè)方面具有應(yīng)用潛力。

    2.2 病毒檢測(cè)

    病毒在食品中殘存時(shí)間較長(zhǎng),受污染的食品一旦被食用,會(huì)在體內(nèi)大量復(fù)制繁殖,造成感染。楊金宏等[35]采用直接RCA 對(duì)?;ㄈ~萎縮類(lèi)病毒(Mulberry mosaic dwarf vrioid,MMDVd)的特異性基因設(shè)計(jì)鎖式探針,并結(jié)合凝膠電泳檢測(cè),該方法可檢測(cè)到103拷貝。方法簡(jiǎn)便快捷,且提高了檢測(cè)靈敏度和特異性。

    RCA 同樣也常結(jié)合熒光傳感器用于病毒檢測(cè),Jia 等[36]利用氧化石墨烯熒光猝滅的特性構(gòu)建了ssDNA 生物傳感器,當(dāng)檢測(cè)體系中存在埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)目的基因時(shí),鎖式探針在酶的作用下成環(huán),反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)酶處理后形成大量ssDNA,這些ssDNA 被裝有熒光素標(biāo)記肽的氧化石墨烯吸附后,與熒光素標(biāo)記肽結(jié)合產(chǎn)生大量dsDNA 復(fù)合物,導(dǎo)致氧化石墨烯對(duì)熒光素標(biāo)記肽的吸附力減弱,標(biāo)記肽解脫出來(lái),恢復(fù)熒光,反之熒光素標(biāo)記肽被吸附在氧化石墨烯中,熒光猝滅。Hamidi 等[37]將RCA 與比色讀數(shù)相結(jié)合,DNA 聚合擴(kuò)增時(shí)釋放出大量焦磷酸分子,焦磷酸分子與Mg2+螯合后會(huì)使羥基萘酚藍(lán)(HNB)發(fā)生顏色變化,利用這種特性實(shí)現(xiàn)了對(duì)流感病毒H5N1(Influenza virus H5N1)的檢測(cè),檢測(cè)限為7.6 fmol/L。結(jié)合電化學(xué)傳感器的RCA 檢測(cè)病毒也有報(bào)道,He 等[38]通過(guò)在電極表面修飾一層多孔牛血清白蛋白(BSA),改善捕捉探針在電極表面的分布,使探針位置分布更均勻,能更好地結(jié)合RCA 產(chǎn)物,產(chǎn)物和捕捉探針的結(jié)合改變了電極信號(hào),基于此特性可用于人乳頭瘤病毒16 型(Human papillomavirus,HPV)的檢測(cè)。

    Wang等[39]報(bào)告了一種基于固相RCA 檢測(cè)SARS病毒的方法,加入涂有低聚糖的磁珠,SARS-CoV 3′端上的多聚腺苷酸(Poly A)會(huì)與磁珠上的低聚糖結(jié)合,進(jìn)而通過(guò)磁鐵和磁珠將SARS的RNA從液體中分離出來(lái),從而為RCA反應(yīng)提供有利條件,這種方式的檢測(cè)限可達(dá)單個(gè)拷貝。

    2.3 其它病原微生物檢測(cè)

    真菌在自然界廣泛存在,部分淺部真菌侵害皮膚表層和皮膚淺層,而一些深部真菌侵犯皮下組織、黏膜和內(nèi)臟,威脅生物體的生命健康。Najafzadeh 等[40]建立了外瓶霉(Exophiala;Exophiala isolates)的RCA檢測(cè)體系,可及時(shí)診斷由外瓶霉引起的大腦皮層真菌感染,為后續(xù)治療提供良好的依據(jù)。

    支原體廣泛存在于人和動(dòng)物體內(nèi),無(wú)特定的形態(tài),無(wú)細(xì)胞壁,可通過(guò)黏附作用和宿主的人細(xì)胞結(jié)合,釋放出大量氨,對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生較大傷害。王輝等[41]對(duì)細(xì)胞污染支原體的16SrRNA、16S-23SrRNA間隔區(qū)和23SrRNA 的序列進(jìn)行blast比對(duì),找出高保守序列設(shè)計(jì)5 種探針,并采用公共引物對(duì)其進(jìn)行RCA擴(kuò)增,凝膠電泳檢測(cè),結(jié)果和PCR 法進(jìn)行比較,無(wú)交叉反應(yīng),證明RCA 技術(shù)對(duì)于支原體的檢測(cè)是一種行之有效的手段。

    部分藻類(lèi)在生長(zhǎng)過(guò)程中會(huì)分泌對(duì)水生動(dòng)物、哺乳動(dòng)物乃至人類(lèi)有害的物質(zhì),Liu等[42]針對(duì)劇毒卡爾藻(Karlodinium veneficum)設(shè)計(jì)了一種雙缺口滾環(huán)擴(kuò)增,該擴(kuò)增方式依靠?jī)蓚€(gè)探針LP 和SP,LP 是兩端與目標(biāo)序列互補(bǔ)配對(duì)的一段長(zhǎng)單鏈序列,SP 是一段與目標(biāo)序列互補(bǔ)配對(duì)的序列,且SP 的互補(bǔ)序列在LP兩端互補(bǔ)序列之間,只有兩端都與目標(biāo)序列互補(bǔ)配對(duì)后,才能在連接酶的作用下成環(huán),結(jié)合橫向流試紙條技術(shù)可達(dá)到可視化檢測(cè)的需求。相同技術(shù)也可用于檢測(cè)海洋卡頓藻(Chattonella marina)[43]。如Nie 等[44]針對(duì)海洋卡頓藻設(shè)計(jì)了特異性鎖式探針,并進(jìn)行RCA 反應(yīng),結(jié)果應(yīng)用反向斑點(diǎn)雜交技術(shù)進(jìn)行檢測(cè),2 h 內(nèi)完成全部反應(yīng),該方法可使用肉眼進(jìn)行觀察。此外米氏凱輪藻(Karenia mikimotoi)的檢測(cè)也已見(jiàn)報(bào)道[45]。針對(duì)有害藻的檢測(cè)可以有效避免赤潮和水華的產(chǎn)生,為生態(tài)治理提供預(yù)警。

    3 總結(jié)與展望

    RCA 相較于傳統(tǒng)的分子檢測(cè)手段如PCR 技術(shù),具有高靈敏、高特異、恒溫?cái)U(kuò)增的優(yōu)點(diǎn),這使得RCA 不局限于實(shí)驗(yàn)室使用,可望在養(yǎng)殖現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。但仍存在一些問(wèn)題函待解決:①分子檢測(cè)的前提需提取核酸,但步驟繁瑣,樣品前處理復(fù)雜,檢測(cè)時(shí)間較長(zhǎng),限制了其應(yīng)用范圍;②RCA 擴(kuò)增后結(jié)果需結(jié)合電泳、熒光、電化學(xué)等儀器查看,不易直觀觀察得出結(jié)論;③探針設(shè)計(jì)、連接酶以及聚合酶的成本較高;④高通量檢測(cè)的優(yōu)點(diǎn)并未完全發(fā)揮出來(lái)。

    據(jù)此我們認(rèn)為,RCA 檢測(cè)病原微生物可在以下方面開(kāi)展相關(guān)工作:①簡(jiǎn)化前處理步驟。目前水煮法[46]和自動(dòng)化[47]提取核酸這種簡(jiǎn)化方式為RCA 用于病原微生物的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)提供了條件。②結(jié)合可視化技術(shù)[21],比如通過(guò)與納米金、膠體金等聯(lián)用,使RCA 結(jié)果直接呈現(xiàn),減少操作時(shí)間,結(jié)果更直觀,這是RCA 檢測(cè)規(guī)?;?、標(biāo)準(zhǔn)化的基礎(chǔ)。③在探針設(shè)計(jì)、連接酶和聚合酶的選擇方面降低成本。如Nie等[44]以鎖式探針兩端檢測(cè)序列中間的連接序列為模板,特異性序列為引物合成探針來(lái)降低成本。④實(shí)現(xiàn)高通量檢測(cè)。鎖式探針的設(shè)計(jì)在保證中間連接序列不變的前提下,針對(duì)不同目標(biāo)序列設(shè)計(jì)不同的捕捉序列,用一對(duì)引物擴(kuò)增多種探針,以達(dá)到高通量檢測(cè)[37]的目的。

    RCA 技術(shù)是一項(xiàng)便捷、靈敏、特異性強(qiáng)的快速檢測(cè)基因技術(shù),繼續(xù)完善將使RCA 技術(shù)在病原微生物的檢測(cè)領(lǐng)域產(chǎn)生極大作用,同時(shí)也為新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的快速檢測(cè)提供思路和補(bǔ)充。

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