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    水液相下兩性α-丙氨酸K+配合物旋光異構(gòu)的理論研究

    2021-10-23 03:29:16趙麗紅彭國強(qiáng)郝成欣叢建民王佐成
    關(guān)鍵詞:旋光能壘過渡態(tài)

    趙麗紅,彭國強(qiáng),姜 豐,郝成欣,劉 芳,叢建民,王佐成

    (1. 白城醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)校 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部,吉林 白城137000; 2. 那丹伯鎮(zhèn)中學(xué),吉林 遼源 136000;3. 白城師范學(xué)院 理論計(jì)算中心,吉林 白城 137000; 4. 白城師范學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院,吉林 白城 137000)

    α-丙氨酸(α-Alanine, α-Ala)是結(jié)構(gòu)最簡單的手性氨基酸,在生命體內(nèi)是重要的配體.根據(jù)光學(xué)活性,分為左旋α-丙氨酸(L-α-Ala)和右旋α-丙氨酸(D-α-Ala);根據(jù)構(gòu)型,分為S型α-丙氨酸(S-α-Ala)和R型α-丙氨酸(R-α-Ala).L-α-Ala在生命體內(nèi)是具有生物活性的優(yōu)構(gòu)體,蛋白質(zhì)的重要成分之一.D-α-Ala 有促進(jìn)細(xì)菌孢子代謝、阻止體內(nèi)脂質(zhì)氧化及清除細(xì)胞毒性的功能,可用作食品的甜味劑,但生命體內(nèi)D-α-Ala超標(biāo)時(shí)會導(dǎo)致很多疾病及衰老速度加快[1-4].

    鉀(K)是主族堿金屬,是生命體必需的宏量元素,在生命體內(nèi)以一價(jià)態(tài)(K+)存在.其有調(diào)節(jié)生命體酸堿平衡以及細(xì)胞內(nèi)滲透壓的功能,還有降血壓及預(yù)防中風(fēng)的作用[5].目前補(bǔ)充鉀離子的主要方法是利用無機(jī)鹽氯化鉀、枸櫞酸鉀和醋酸鉀,有機(jī)鹽谷氨酸鉀和門冬氨酸鉀鎂等.氯化鉀等無機(jī)鹽進(jìn)入生命體內(nèi),鉀離子會以較快的速度解離出來,會使生命體短時(shí)間內(nèi)鉀含量過高,導(dǎo)致血壓降低等問題發(fā)生.已有研究[6-7]表明,氨基酸鐵和氨基酸鋅等過渡金屬螯合物作為補(bǔ)充微量金屬元素產(chǎn)品,在臨床、食品及畜牧業(yè)中已經(jīng)被廣泛應(yīng)用.金屬離子與氨基酸配位緩沖了金屬離子在生命體內(nèi)的濃度,螯合物的緩慢解離保證了金屬離子質(zhì)量濃度的恒定,因此利用氨基酸鉀鹽進(jìn)行鉀與氨基酸同補(bǔ)具有重要意義.

    如果生命體內(nèi)同時(shí)缺少α-Ala和K+,選擇α-Ala與K+的配合物可能是一個極好的選擇.然而,不同旋光性的手性分子一般具有不同的生物效應(yīng),某種旋光性的手性分子對生命體具有生命活性,其手性對映體則無用甚至有嚴(yán)重的副作用.因此,α-Ala·K+在生命體內(nèi)旋光異構(gòu)的研究對指導(dǎo)人們科學(xué)地補(bǔ)充α-丙氨酸和鉀具有重要的實(shí)際意義.

    人們對α-Ala及其金屬配合物的旋光異構(gòu)已經(jīng)做了大量的工作,文獻(xiàn)[8]的研究表明,納米孔道對α-Ala 的旋光異構(gòu)具有一定的限域催化作用;文獻(xiàn)[9-10]的研究表明,水液相下兩性的α-Ala分子構(gòu)象最穩(wěn)定,水分子簇做質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介可使其少量地消旋,酸堿的作用會加速其消旋反應(yīng)的速率.文獻(xiàn)[11-18]的研究表明,兩性α-Ala與K+、Ca2+、Cu2+等配合物在氣相下構(gòu)象穩(wěn)定,它們通常很難消旋.文獻(xiàn)[19-20]的研究表明,水液相下兩性的α-Ala與過渡金屬Zn2+以及堿土金屬M(fèi)g2+的配合物構(gòu)象穩(wěn)定,它們通常只能痕量或微量地消旋,可安全地用于生命體同補(bǔ)鋅和α-丙氨酸以及鎂和α-丙氨酸.

    目前,對水液相下α-Ala·K+旋光異構(gòu)的研究鮮見報(bào)道.為說明α-丙氨酸與堿金屬鉀的配合物用于生命體是否安全,同時(shí)為研究復(fù)雜氨基酸鉀鹽的旋光異構(gòu)奠定基礎(chǔ),基于以往的研究經(jīng)驗(yàn)[17,19-20],本工作采用密度泛函理論研究了水液相下兩性α-丙氨酸與主族堿金屬鉀一價(jià)(K+)離子配合物的旋光異構(gòu).

    1 模型選取及計(jì)算方法

    水液相下α-丙氨酸分子以兩性離子形式存在[9],計(jì)算表明,水液相下S-α-Ala與K+的雙齒配合物比單齒配合物穩(wěn)定,因此本工作把兩性α-Ala與K+的雙齒配合物作為反應(yīng)底物,討論其旋光異構(gòu).

    采用對處理主族元素具有較好表現(xiàn)的雜化泛函M06-2X[21],在6-311+G(d, p)基組下對單重態(tài)勢能面上的駐點(diǎn)結(jié)構(gòu)(自旋多重度的測算表明,本研究體系在單重態(tài)最穩(wěn)定)進(jìn)行全參數(shù)優(yōu)化,通過對過渡態(tài)[22]進(jìn)行內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)計(jì)算[23],確認(rèn)過渡態(tài)與對應(yīng)的穩(wěn)定點(diǎn)存在關(guān)聯(lián)性,水溶劑效應(yīng)均采用SMD模型[24]方法處理.為計(jì)算出相對高水平的反應(yīng)過程勢能面,同時(shí)考慮到計(jì)算資源的有限,在SMD/M06-2X/6-311++G(3df, 2pd)理論水平計(jì)算各駐點(diǎn)物種的單點(diǎn)能,經(jīng)過吉布斯自由能熱校正獲得各駐點(diǎn)物種的高水平自由能(吉布斯自由能熱校正在298.15 K及1個標(biāo)準(zhǔn)大氣壓下進(jìn)行),體系的總自由能等于自由能熱校正加上單點(diǎn)能.S-α-Ala與K+的配合物S-α-Ala·K+記作S-A·K,其在a通道第2個無手性的過渡態(tài)配合物記作T2a,S-A·K在b1通道異構(gòu)的第3個R型過渡態(tài)配合物記作R-T3b1,a和b通道共用的第1個無手性的中間體標(biāo)記為Ia(b);5個水分子與S-I2c的K+配位,2個水分子與5個水分子中的若干個水分子形成氫鍵(分子間氫鍵用虛線表示),同時(shí)2個水分子簇與S-I2c氫鍵作用的體系記作S-I2c←5H2O·2H2O·(H2O)2,其他體系標(biāo)記法相似.計(jì)算采用Gaussian16[25]程序完成.

    2 結(jié)果與討論

    把氣相的兩性S-A·K雙齒構(gòu)型[17]作為初始猜測構(gòu)型,優(yōu)化得到水液相下雙齒的手性對映體S-A·K和R-A·K,見圖1.

    圖1 配合物S-A·K分子及其手性對映體的幾何構(gòu)型Fig.1 Geometric configuration of complex molecule S-A·K and its chiral enantiomer

    對于非質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程,水分子(簇)與底物的氫鍵作用對反應(yīng)能壘的絕對值影響不大,只需考慮溶劑極性的作用,即隱性水溶劑效應(yīng);對于質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程,水分子(簇)做媒介會顯著降低反應(yīng)能壘,并且與K+配位的水分子(簇)會與做質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介的水分子(簇)及其他原子形成復(fù)雜的氫鍵網(wǎng)絡(luò),從而影響反應(yīng)能壘,因此,研究質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程既要考慮溶劑極性的作用,還要充分考慮水分子(簇)的存在,即顯性水溶劑效應(yīng).

    為清晰地呈現(xiàn)水液相下S-A·K在可能的反應(yīng)通道旋光異構(gòu)的歷程,且節(jié)省篇幅,先討論隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·K的旋光異構(gòu),然后討論顯性水溶劑效應(yīng)對質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程的影響.

    2.1 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·K的旋光異構(gòu)

    研究發(fā)現(xiàn),S-A·K的旋光異構(gòu)可在3個通道a、b和c實(shí)現(xiàn),a和b通道共用第1基元反應(yīng),為使討論過程層次清晰,將a和b通道放在一起討論,c通道單獨(dú)討論.

    2.1.1S-A·K在a和b通道上的旋光異構(gòu)

    S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)在a、b通道的歷程見圖2(見第542頁),反應(yīng)過程的勢能剖面見圖3的a線和b線.

    圖2 S-A·K在a和b通道旋光異構(gòu)的歷程(鍵長單位: 納米)Fig.2 Reaction process of optical isomerization of S-A·K in channel a and b(Bond length unit: nanometer)

    圖3 隱性水溶劑效應(yīng)下S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)的吉布斯自由能勢能面Fig.3 Gibbs free energy surfaces of optical isomerism of S-A·K under the effect of recessive aqueous solution

    第1基元反應(yīng)(a、b通道共用):S-A·K經(jīng)質(zhì)子在1C和11O之間遷移的過渡態(tài)T1a(b),13H從1C遷移到11O,異構(gòu)成I1a(b).從S-A·K到T1a(b),1C—13H從0.109 0 nm拉伸至0.151 8 nm斷裂;9C=11O雙鍵從0.125 3 nm拉伸至0.132 6 nm;14K和11O間的配位鍵略有伸長;二面角10O—9C—1C—6N從-3.0°變?yōu)?34.1°,9C—1C鍵右視順時(shí)針內(nèi)旋轉(zhuǎn)31.1°,這些變化導(dǎo)致T1b(a)產(chǎn)生了261.3 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.該能壘與氣相S-A·K旋光異構(gòu)此基元反應(yīng)的能壘242.3 kJ·mol-1[17]相比有所升高,說明水溶劑對此基元反應(yīng)有負(fù)催化作用.原因是S-A·K的偶極矩(5.553 7 D)大于T1a(c)的偶極矩(4.588 5 D),水溶劑的強(qiáng)極性使S-A·K 變得相對更穩(wěn)定些.

    接下來分為a和b兩個分通道.

    a分通道:I1a(b)經(jīng)與T1a(b)鏡像對稱的過渡態(tài)T2a,13H在紙面內(nèi)側(cè)從11O遷移到1C,異構(gòu)成R-A·Ka,S-A·K在a通道實(shí)現(xiàn)旋光異構(gòu).從I1a(b)到T2a,11O—13H鍵從0.096 5 nm拉伸至0.118 6 nm斷裂,T2a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是146.6 kJ·mol-1.T2a與T1a(b)在勢能面的同一高度處,但T2a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘小于T1a(b)產(chǎn)生的能壘許多.原因之一是氧氫鍵較碳?xì)滏I容易斷裂,原因之二是從I1a(b)到T2a,α-碳從sp2雜化向sp3雜化過渡時(shí)釋放了能量.結(jié)構(gòu)分析表明,R-A·Ka與S-A·K鏡像對稱.

    從S-A·K在a通道的旋光異構(gòu)反應(yīng)歷程及勢能面可以看出,在a通道體系構(gòu)象及相對能量均關(guān)于I1a(b)對稱,展現(xiàn)了S-A·K在a通道旋光異構(gòu)外在與內(nèi)在的對稱美.

    b分通道:第2基元,I1a(b)經(jīng)質(zhì)子在紙面里從質(zhì)子化氨基向α-碳遷移的過渡態(tài)T2b,8H從6N遷移到1C,異構(gòu)成R-I2b,S-A·K在b通道實(shí)現(xiàn)旋光異構(gòu).從I1a(b)到T2b,6N—8H從0.102 5 nm拉伸至0.123 2 nm斷裂,1C—6N從0.146 9 nm拉伸至0.153 1 nm,這些變化使T2b產(chǎn)生了164.2 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.

    接下來R-I2b沿b1和b2兩個分路徑異構(gòu),分別得到更穩(wěn)定的產(chǎn)物配合物.

    b1分路徑:第3基元,R-I2b經(jīng)9C—10O—14K做剪式運(yùn)動的過渡態(tài)R-T3b1,異構(gòu)成R-I3b1.從R-I2b到R-T3b1,鍵角9C—10O—14K從99.9°增加到137.3°,同時(shí)配位鍵10O—14K斷裂,這些變化使R-T3b2產(chǎn)生了11.8 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘;第4基元,R-I3b1經(jīng)14K在9C—10O兩側(cè)翻轉(zhuǎn)運(yùn)動的過渡態(tài)R-T4b1,異構(gòu)成R-I4b1.從R-I3b1的R-T4b1,14K從9C—10O的右側(cè)翻轉(zhuǎn)到左側(cè),14K翻轉(zhuǎn)了24.6°,此過程所需能量很小,R-T4b1產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘只有5.0 kJ·mol-1;第5基元,R-I4b1經(jīng)11O—9C內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過渡態(tài)R-T5mb1(或R-T5nb1),13H繞11O—9C仰視順時(shí)針(或逆時(shí)針)旋轉(zhuǎn),13H從羧基外側(cè)轉(zhuǎn)到內(nèi)側(cè),異構(gòu)成較穩(wěn)定的雙齒配合物R-A*·Kb1.從R-I4b1到R-T5mb1,11O—9C內(nèi)旋轉(zhuǎn)94.5°,化學(xué)鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)所需能量不多,R-T5mb1產(chǎn)生了29.5 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.相似的R-T5nb1產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是31.2 kJ·mol-1,不再贅述.

    b2分路徑:第3基元,R-I2b經(jīng)1C—9C內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過渡態(tài)R-T3mb2(或R-T3nb2),1C—19C右視順時(shí)針(或逆時(shí)針)內(nèi)旋轉(zhuǎn)152.0°(或192°),異構(gòu)成R-I3b2.從R-I2b到R-T3mb2,10O—9C—1C—6N從23.8°變?yōu)?61.9°,1C—19C鍵旋轉(zhuǎn)85.7°,R-T3mb2產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是16.9 kJ·mol-1.從R-I2b到R-T3nb2,9C—1C旋轉(zhuǎn)45.8°,比從R-I2b到R-T3mb2的9C—1C旋轉(zhuǎn)角小很多,R-T3nb2產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是10.4 kJ·mol-1;第4基元,R-I3b2經(jīng)質(zhì)子在羧基和氨基間遷移的過渡態(tài)R-T4b2,13H從11O遷移到6N,異構(gòu)成與S-A·K鏡像對稱的R-A·Kb2,S-A·K在b2通道實(shí)現(xiàn)了手性對映體轉(zhuǎn)變.

    2.1.2S-A·K在c通道上的旋光異構(gòu)

    S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)在c通道上的歷程見圖4(見第544頁),反應(yīng)過程的自由能勢能面見圖3的c線.

    圖4 S-A·K在c通道旋光異構(gòu)的歷程(鍵長單位: 納米)Fig.4 Reaction process of optical isomerization of S-A·K in channel c(Bond length unit: nanometer)

    第1基元:S-A·K經(jīng)質(zhì)子在氨基和羧基間遷移的過渡態(tài)S-T1c,12H從6N遷移到10O,異構(gòu)成中間體S-I1c.從S-A·K到S-T1c,6N—12H鍵從0.102 3 nm拉伸至0.136 0 nm斷裂,S-T1c產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是30.5 kJ·mol-1.

    第2基元:S-I1c經(jīng)9C—10O鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過渡態(tài)S-T2mc或S-T2nc,12H俯視逆時(shí)針或順時(shí)針旋轉(zhuǎn),12H在紙面內(nèi)或紙面外從羧基外側(cè)轉(zhuǎn)到內(nèi)側(cè),羧基與14K的螯合環(huán)打開,異構(gòu)成S-I2c.S-I2c的6N的正面已經(jīng)裸露,負(fù)電荷密度增大,為α-H從1C向其遷移創(chuàng)造了條件.從S-I1c到S-T2mc,二面角12H—10O—9C—11O從179.0°變?yōu)?7.7°;二面角10O—9C—1C—6N從8.8°變?yōu)?0.4°,配位鍵14K—11O從0.270 5 nm拉伸至0.290 1 nm,14K—11O從較強(qiáng)的配位鍵變?yōu)槿跖湮绘I,這些變化使S-T2mc產(chǎn)生了56.0 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.相似的S-T2nc也產(chǎn)生了56.0 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘,不再贅述.

    第3基元:S-I2c經(jīng)質(zhì)子在紙面外從1C向6N遷移的過渡態(tài)T3c,異構(gòu)成I3c.從S-I2c到T3c,1C—13H從0.109 0拉伸至0.130 6 nm斷裂,1C—6N從0.146 1拉伸至0.153 1 nm,二面角4C—1C—6N—9C從-121.6°變?yōu)?155.1°,這些變化使T3c產(chǎn)生了241.7 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.

    第4基元: I3c經(jīng)質(zhì)子在紙面內(nèi)側(cè)在1C和6N間遷移的過渡態(tài)T4c,7H從6N遷移到1C,異構(gòu)成R-I4c,至此S-A·K在c通道實(shí)現(xiàn)了旋光異構(gòu).從I3c到T4c,6N—7H鍵從0.102 6 nm拉伸至0.122 7 nm斷裂,1C—6N鍵從0.147 0 nm拉伸至0.153 1 nm,T4c產(chǎn)生了157.4 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.

    第5基元:R-I4c經(jīng)10O—9C鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)過渡態(tài)R-T5mc或R-T5nc,12H從羧基內(nèi)側(cè)轉(zhuǎn)到羧基外側(cè),羧基與鉀的螯合環(huán)形成,異構(gòu)成R-I5c.從R-I4c到R-T5mc(或R-T5nc),二面角12H—10O—9C—11O從-0.3°變?yōu)?7.7°(或從-0.3°變?yōu)?77.0°);10O—9C俯視逆時(shí)針轉(zhuǎn)內(nèi)旋轉(zhuǎn)78.0°(或俯視順時(shí)針轉(zhuǎn)內(nèi)旋轉(zhuǎn)76.7°),R-T5mc和R-T5nc產(chǎn)生的能壘都是42.0 kJ·mol-1.

    結(jié)構(gòu)分析表明R-I5c同于R-I3b2,其接下來的異構(gòu)同于R-I3b2的異構(gòu),最后異構(gòu)到與S-A·K鏡像對稱的R-A·Kc,S-A·K在c通道實(shí)現(xiàn)了手性對映體轉(zhuǎn)變,見b2通道第4基元的討論,這里從略.

    縱觀S-A·K在c通道的旋光異構(gòu)歷程及勢能面發(fā)現(xiàn),體系構(gòu)象及相對能量均關(guān)于I3c對稱,展現(xiàn)了S-A·K在c通道旋光異構(gòu)的過程與內(nèi)在的對稱美.

    由于正負(fù)反應(yīng)能壘小于等于40.0 kJ·mol-1以下時(shí)反應(yīng)物和產(chǎn)物可共存[26],因此從圖3可知,反應(yīng)物是以兩性的S-A·K和中性的S-I1b(c)兩種構(gòu)象共存.由于S-A·K的相對能量低很多,所以S-A·K在反應(yīng)物中的分布要占絕大多數(shù).從圖3可以看出,S -A·K在c通道的旋光異構(gòu)略具優(yōu)勢,決速步能壘是241.7 kJ·mol-1.S-A·K在c通道旋光異構(gòu)的產(chǎn)物是中性的R-I5c與兩性的R-A·Kc共存,后者的分布占絕大多數(shù).S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)的a和b通道略具劣勢,這兩個通道共同的決速步能壘是261.3 kJ·mol-1.S-A·K 在a和b通道旋光異構(gòu)的產(chǎn)物是兩性的R-A·Ka(b2)、中性的R-I3b2、R-I2b和中性的R-A*·Kb1,兩性R-A·K的分布占絕大多數(shù).

    2.2 顯性水溶劑效應(yīng)下S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程

    為獲得可靠的反應(yīng)能壘,考慮水分子簇對質(zhì)子遷移的影響,同時(shí)還要考慮水分子(簇)與鉀配位、水分子簇間的氫鍵作用以及水分子簇與羧基氧等原子的氫鍵作用.計(jì)算表明,2個和3個水分子簇的催化作用差別較小,1個水分子的催化作用遠(yuǎn)小于2個和3個水分子簇,為使問題簡便并節(jié)省篇幅,做氫遷移媒介的水分子簇只考慮2個水分子簇.鉀離子的配位數(shù)是6[29],S-A·K中鉀已經(jīng)與羰基氧2配位,再有4個水分子與鉀離子配位,鉀離子便達(dá)到滿配.水液相下水分子多以水簇的形式存在,基于此并且為了得到參與配位的水分子簇個數(shù)的不同對反應(yīng)能壘的影響,同時(shí)考慮計(jì)算成本和篇幅所限,僅對a和b通道的第1基元,對5、6和7個水分子簇參與配位的情況進(jìn)行討論.對于c通道,S-I2a中鉀已經(jīng)與羰基氧1配位,再有5個水分子與鉀配位,鉀便達(dá)到滿配,只對7個水分子簇參與配位的情況進(jìn)行討論.

    2.2.1 顯性水溶劑效應(yīng)下a和b通道的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程

    S-A·K在a和b通道的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程是第1和2基元.5、6和7個水分子簇參與配位時(shí),形成S-A·K←4H2O·H2O、S-A·K←4H2O·2H2O和S-A·K←4H2O·3H2O.2個水分子簇再與S-A·K的α-氫13H及羰基氧11O形成氫鍵,同時(shí)和與鉀配位的水分子簇形成氫鍵網(wǎng)絡(luò),得到氫鍵網(wǎng)絡(luò)體系S-A·K←4H2O·H2O·(H2O)2m、S-A·K←4H2O·2H2O·(H2O)2m和S-A·K←4H2O·3H2O·(H2O)2m(m表示做H遷移媒介的水簇在底物的前面)等反應(yīng)物配合物絡(luò)合物.反應(yīng)歷程見圖5,反應(yīng)過程勢能面見圖6(見第546頁).為節(jié)省篇幅,對S-A·K←4H2O·H2O·(H2O)2m異構(gòu)的第1基元詳細(xì)討論,其他的基元做一般討論.

    圖5 顯性溶劑效應(yīng)下S-A·K在a和b通道旋光異構(gòu)反應(yīng)的氫遷移過程(鍵長單位: 納米)Fig.5 Hydrogen migration process of S-A·K optically isomerized in channels a and b under the effect of explicit solvent(Bond length unit: nanometer)

    圖6 顯性溶劑效應(yīng)下S-A·K在a和b通道旋光異構(gòu)的氫遷移反應(yīng)勢能面Fig.6 Potential energy surface of hydrogen migration reaction of S-A·K optically isomerized in channels a and b under the effect of explicit solvent

    共用的第1基元反應(yīng)為:S-A·K←4H2O·H2O·(H2O)2m經(jīng)過渡態(tài)T1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)2m實(shí)現(xiàn)了13H從1C向11O的凈遷移,異構(gòu)成I1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)2m.IRC表明,T1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)2m靠近產(chǎn)物是后過渡態(tài).從S-A·K←4H2O·H2O·(H2O)2m到T1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)2,1C—13H從0.109 2 nm拉伸至0.137 1 nm斷裂;30O—32H從0.097 2 nm拉伸斷裂,32H遷移到33O;33O—35H從0.098 0 nm拉伸斷裂,35H遷移到11O;33O—23H之間的氫鍵斷裂.這些變化使T1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)2m產(chǎn)生了136.6 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.該能壘與水液相下丙氨酸旋光異構(gòu)在此基元的能壘(大約是142.0 kJ·mol-1,工作理論水平下是137.3 kJ·mol-1)相差無幾,說明鉀離子對水液相下丙氨酸的旋光異構(gòu)幾乎沒影響.

    相似的S-A·K←4H2O·2H2O·(H2O)2m經(jīng)T1a(b)←4H2O·2H2O·(H2O)2m到I1a(b)←4H2O·2H2O·(H2O)2m基元反應(yīng).從S-A·K←4H2O·2H2O·(H2O)2m到T1a(b)←4H2O·2H2O·(H2O)2m,1C—13H鍵從0.109 1 nm拉伸至0.137 2 nm斷裂;33O—35H鍵長從0.097 2 nm拉伸斷裂;36O—38H鍵長從0.098 2 nm拉伸斷裂;34O—24H之間的氫鍵斷裂,這些變化導(dǎo)致T1a(b)←4H2O·2H2O·(H2O)2m產(chǎn)生了140.8 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.

    相似的S-A·K←4H2O·3H2O·(H2O)2m經(jīng)T1a(b)←4H2O·3H2O·(H2O)2m到I1a(b)←4H2O·3H2O·(H2O)2m基元反應(yīng).從S-A·K←4H2O·3H2O·(H2O)2m到T1a(b)←4H2O·3H2O·(H2O)2m過程,1C—13H鍵長從0.109 0 nm拉伸至0.141 2 nm斷裂;36O—38H鍵長從0.098 0 nm拉伸斷裂;39O—40H鍵長從0.098 1 nm拉伸斷裂,這些變化導(dǎo)致T1a(b)←4H2O·3H2O·(H2O)2m產(chǎn)生了142.0 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.

    T1a(b)←4H2O·H2O·(H2O)m2、T1a(b)←4H2O·2H2O·(H2O)2m和T1a(b)←4H2O·3H2O·(H2O)2m產(chǎn)生的能壘在誤差允許的范圍內(nèi)可認(rèn)為相同,這說明鉀滿配后,參與形成氫鍵的水分子個數(shù)的多少對此氫遷移反應(yīng)能壘的影響甚小.基于此,第2基元只討論5個水分子簇參與配位時(shí),形成I1a←4H2O·H2O,紙面里的2個水分子簇再與I1a的1C及11O氫鍵作用,得到氫鍵網(wǎng)絡(luò)體系I1a←4H2O·H2O·(H2O)2n(n表示做H遷移媒介的水簇在底物的后面,亦即紙面里)的異構(gòu).

    a通道專屬的第2基元:I1a←4H2O·H2O·(H2O)2n經(jīng)過渡態(tài)T2a←4H2O·H2O·(H2O)2異構(gòu)成S-A·Ka←4H2O·H2O·(H2O)2,S-A·K實(shí)現(xiàn)旋光異構(gòu).從I1a←4H2O·H2O·(H2O)2n到T2a←4H2O·H2O·(H2O)2n,11O—13H鍵及34O—33H鍵斷裂,38O—31H鍵長從0.097 3 nm拉伸至0.124 9 nm斷裂,骨架形變,氫鍵網(wǎng)絡(luò)體系的部分氫鍵或斷裂或變?nèi)?,這些變化導(dǎo)致T2a←4H2O·H2O·(H2O)2n產(chǎn)生了22.9 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.該能壘小于第1基元能壘,是因?yàn)閺腎1a←4H2O·H2O·(H2O)2n到T2a←4H2O·H2O·(H2O)2的過程,α-碳從sp2雜化向sp3雜化過渡時(shí)釋放了能量.

    b通道專屬的第2基元:只討論4個水分子簇參與配位時(shí),紙面里的2個水分子簇再與I1b的1C及6N氫鍵作用,得到氫鍵網(wǎng)絡(luò)體系I1b←4H2O·(H2O)2n的異構(gòu).相似于a通道第2基元,I1b←4H2O·(H2O)2n經(jīng)過渡態(tài)T2b←4H2O·(H2O)2n異構(gòu)成S-A·Kb←4H2O·(H2O)2n.從I1b←4H2O·(H2O)2n到T2b←4H2O·(H2O)2n,化學(xué)鍵的拉伸及斷裂見圖5.T2b←4H2O·(H2O)2n產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是89.2 kJ·mol-1,該能壘不是很高的原因同于a通道專屬的第2基元,不再贅述.

    2.2.2 顯性水溶劑效應(yīng)下c通道的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程

    S-A·K在c通道的質(zhì)子轉(zhuǎn)移過程是第3和4基元反應(yīng).考慮7個水分子簇參與和14K的配位,2個水分子簇傳遞質(zhì)子從1C向6N遷移的情況,反應(yīng)歷程見圖7,反應(yīng)過程的勢能面見圖8.

    圖7 顯性溶劑效應(yīng)下S-A·K在c通道旋光異構(gòu)反應(yīng)的氫遷移過程(鍵長單位: 納米)Fig.7 Hydrogen migration process of S-A·K optically isomerized in channel c under the effect of explicit solvent(Bond length unit: nanometer)

    圖8 顯性溶劑效應(yīng)下S-A·K在c通道旋光異構(gòu)的氫遷移反應(yīng)勢能面Fig.8 Potential energy surface of hydrogen migration reaction of S-A·K optically isomerized in channel c under the effect of explicit solvent

    第3基元反應(yīng): 5個水分子直接與S-I2c的14K配位,又有2個水分子與5個水分子氫鍵作用,形成S-I2c←5H2O·2H2O.二聚水再與6N和13H氫鍵作用,形成中間體反應(yīng)物S-I2c←5H2O·2H2O·(H2O)2m.S-I2c←5H2O·2H2O·(H2O)2m經(jīng)過渡態(tài)T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m,13H、38H和40H協(xié)同非同步遷移,實(shí)現(xiàn)了α-H從1C向6N的凈遷移,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物I3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m.IRC路徑計(jì)算表明,T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m是前過渡態(tài).從S-I2c←5H2O·2H2O·(H2O)2m到T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m,1C—13H從0.109 5 nm拉伸至0.156 8 nm斷裂,36O—38H從0.097 3 nm拉伸至0.099 6 nm,39O—40H鍵長從0.098 7 nm拉伸至0.099 3 nm;二面角6N—1C—4C—9C從126.6°變?yōu)?59.6°;36O—28H間的強(qiáng)氫鍵斷裂,21O—26H之間的強(qiáng)氫鍵變?yōu)槿鯕滏I,這些變化使T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m產(chǎn)生了141.5 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.該能壘與T3c產(chǎn)生的能壘241.7 kJ·mol-1相比較顯著降低,說明水分子(簇)對此基元反應(yīng)起了很好的催化作用.T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m產(chǎn)生的能壘與水液相下丙氨酸旋光異構(gòu)過程在此基元反應(yīng)的內(nèi)稟能壘(約110.0 kJ·mol-1[10])相比較顯著增加,說明K+的配位對此基元反應(yīng)有負(fù)催化作用.原因是從S-I2c←5H2O·2H2O·(H2O)2m到T3c←5H2O·2H2O·(H2O)2m的過程,氫鍵網(wǎng)絡(luò)體系部分被破壞需要一定的能量.

    第4基元反應(yīng):相似于第3基元,I3c的14K與5個水分子簇配位,2個水分子與其中的3個水分子氫鍵作用,形成I3c←5H2O·2H2O.二聚水再與6N和1C氫鍵作用,形成中間體反應(yīng)物I3c←5H2O·2H2O·(H2O)2n.I3c←5H2O·2H2O·(H2O)2n經(jīng)過渡態(tài)T4c←5H2O·2H2O·(H2O)2n,7H、39H和36H協(xié)同非同步遷移,實(shí)現(xiàn)了H從6N向1C的凈遷移,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物R-I4c←5H2O·2H2O·(H2O)2n.從I3c←5H2O·2H2O·(H2O)2n到T4c←5H2O·2H2O·(H2O)2n,6N—7H和36O—38H分別從0.103 9和0.097 5 nm大幅拉伸斷裂,37O—36H鍵長從0.097 0 nm拉伸至0.111 6 nm,這些變化使T4c←5H2O·2H2O·(H2O)2n產(chǎn)生了70.5 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘.該能壘不是很高的原因同于a通道的第2基元,不再贅述.

    從圖6和圖8可以看到,水液相下的水分子(簇)作用使S-A·K旋光異構(gòu)反應(yīng)通道孰優(yōu)孰劣變得不明顯,在誤差允許的范圍內(nèi),S-A·K在a、b和c通道上旋光異構(gòu)的決速步能壘大約在140.0 kJ·mol-1左右(或者說在136.6至142.0 kJ·mol-1之間).140.0 kJ·mol-1的能壘只能極緩慢地越過[26],說明水液相下S-A·K的旋光異構(gòu)反應(yīng)進(jìn)行得極緩慢.因此在生命體內(nèi)α-丙氨酸的一價(jià)鉀鹽只能微量地消旋,α-丙氨酸鉀用于生命體同補(bǔ)K+和丙氨酸具有較好的安全性.

    3 結(jié) 論

    在SMD/M06-2X/6-311++G(3df, 2pd)∥SMD/M06-2X/6-311+G(d, p)雙水平,對水液相下兩性S-α-Ala與K+配合物S-α-Ala·K+的旋光異構(gòu)進(jìn)行研究,得到如下結(jié)論:

    1)S-α-Ala·K+的旋光異構(gòu)可在質(zhì)子以羰基O為橋、羰基O和氨基N聯(lián)合為橋、氨基N為橋遷移3個通道a、b、c實(shí)現(xiàn).反應(yīng)物以兩性的S-A·K和中性的S-I1b(c)兩種構(gòu)象共存,S-A·K的分布占絕對優(yōu)勢.

    2) 隱性水溶劑效應(yīng)下,S-α-Ala·K+在c通道的旋光異構(gòu)具有優(yōu)勢,決速步能壘是241.7 kJ·mol-1,來自于α-H從α-C向氨基N遷移的過渡態(tài);a和b通道處于劣勢,決速步能壘是261.3 kJ·mol-1,來自于α-H從α-C向羰基O遷移的過渡態(tài).

    3) 顯性水溶劑效應(yīng)下,S-α-Ala·K+在各個反應(yīng)通道旋光異構(gòu)的決速步能壘基本相同,大約在136.6至142.0 kJ·mol-1之間.

    結(jié)果表明: 水液相下S-α-Ala·K+旋光異構(gòu)反應(yīng)進(jìn)行得極其緩慢,在生命體內(nèi)S-α-Ala·K+用于K+和丙氨酸同補(bǔ)具有較好的安全性.

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