蘇丹,孫玉鋒,郝成欣,姜春旭,張雪嬌,叢建民,王佐成
1. 白城醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)校藥學(xué)系,吉林白城 137000
2. 白城市傳染病醫(yī)院質(zhì)量控制科,吉林白城 137000
3. 白城師范學(xué)院理論計(jì)算中心,吉林白城 137000
4. 白城師范學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,吉林白城 137000
過(guò)渡金屬鋅是生命的重要微量元素,在生命體內(nèi)以二價(jià)鋅離子(Zn2+)形式存在,參與蛋白質(zhì)的代謝過(guò)程,對(duì)骨骼和皮膚的發(fā)育及消化和代謝具有重要作用。其氨基酸配合物參與生命體內(nèi)的多種代謝及生理生化過(guò)程,又可用于治療疾病,與傳統(tǒng)無(wú)機(jī)鹽相比,具有生物學(xué)價(jià)值高、利于吸收、污染少等優(yōu)點(diǎn),還具備某些特別的生理和藥理作用[1-3]。
α-丙氨酸(α-alanine,α-Ala)是結(jié)構(gòu)最簡(jiǎn)單的手性氨基酸,是蛋白質(zhì)和酶的基本單元,是生物體內(nèi)的重要配體。根據(jù)旋光性可分為左-丙氨酸(L-α-Ala)和右-丙氨酸(D-α-Ala),根據(jù)構(gòu)型可分為S-α-丙氨酸(S-Ala)和R-丙氨酸(R-α-Ala)。旋光性不同的α-Ala 具有不同的生理作用,生命體內(nèi)L-α-Ala 有活性,D-α-Ala 過(guò)量會(huì)導(dǎo)致某些疾病或衰老[4-6]。金屬離子α-Ala 配合物也具有手性,不同旋光性的手性分子對(duì)生命體具有迥然不同的作用,某種手性對(duì)生命體具有積極的作用,而其手性對(duì)映體則無(wú)用甚至有害。因此,光學(xué)純的手性氨基酸及其金屬配合物是否容易消旋對(duì)生命的健康極為重要。
基于手性氨基酸及其金屬配合物消旋反應(yīng)的重要性,人們對(duì)氨基酸及其金屬配合物的手性轉(zhuǎn)變做了大量的研究。文獻(xiàn)[7-12]研究表明,α-Ala 在氣相不能消旋,在水汽環(huán)境下可微量消旋,在水液相下可少量地消旋,酸堿性環(huán)境能使消旋速度大幅增加。文獻(xiàn)[13]的研究發(fā)現(xiàn),絲氨酸的旋光異構(gòu)可以在水分子簇的催化與水溶劑的助催化作用下實(shí)現(xiàn),羥自由基的存在可以加速絲氨酸的旋光異構(gòu),也可以導(dǎo)致絲氨酸損傷。文獻(xiàn)[14]研究表明,SWBNNT(5,5)對(duì)Ala 的手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)具有明顯的限域催化作用。文獻(xiàn)[15]研究表明,羥自由基水分子簇與MOR 分子篩的共催化可使Ala 極緩慢地消旋。文獻(xiàn)[16-19]的研究表明,氣相環(huán)境下α-Ala 的Cu2+、K+、Ca2+及Zn2+配合物的消旋反應(yīng)難以實(shí)現(xiàn)。
目前,關(guān)于氨基酸鋅的研究?jī)H限于鋅離子及水分子的配位對(duì)甘氨酸和兩性離子甘氨酸結(jié)構(gòu)的影響、鋅離子對(duì)甘氨酸的配位能力、甘氨酸鋅分子內(nèi)的H 遷移以及氣相環(huán)境下α-丙氨酸鋅的消旋反應(yīng)[19-22],對(duì)水液相下α-丙氨酸鋅旋光異構(gòu)的研究鮮見(jiàn)報(bào)道。為揭示α-丙氨酸鋅給生命體補(bǔ)鋅及丙氨酸是否安全,本工作采用密度泛函理論研究了水液相下丙氨酸鋅的手性轉(zhuǎn)變。
采用對(duì)處理含過(guò)渡金屬和弱鍵作用體系具有較高精度的雜化泛函M06 方法[23-24],結(jié)合自洽反應(yīng)場(chǎng)理論的SMD 模型[25]方法。在6-31++G(d,p)基組下優(yōu)化反應(yīng)過(guò)程中單重態(tài)(計(jì)算表明本工作研究的體系在可能的自旋態(tài)1、3、5、7 中,單重態(tài)最穩(wěn)定)勢(shì)能面上的駐點(diǎn)結(jié)構(gòu),同時(shí)獲得吉布斯自由能熱校正;采用自然鍵軌道NBO(natural bond orbital)方法計(jì)算了相關(guān)體系的NPA(natural population analysis)電荷;通過(guò)對(duì)過(guò)渡態(tài)[26]進(jìn)行IRC(內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo))計(jì)算[27],確認(rèn)過(guò)渡態(tài)的可靠性。為得到較高精度的反應(yīng)過(guò)程勢(shì)能面,采用描述過(guò)渡金屬有較好表現(xiàn)的MN15[28]泛函,在6-311++G(3df,2pd)高角動(dòng)量基組下計(jì)算單點(diǎn)能??傋杂赡苡肎total=Gtc+ESP計(jì)算(Gtc和ESP分別是自由能熱校正和單點(diǎn)能,自由能校正溫度是298.15 K)。水液相下S-型Ala與Zn2+的配合物Ala·Zn2+@W記作S-A@W,S-A@W 在a 通道異構(gòu)的第1 個(gè)S-型過(guò)渡態(tài)記作S-T1@Wa,第1 個(gè)S-型中間體記作SI1@Wa;a 和b 通道共用的結(jié)構(gòu)X 記作Xa(b)@W;在a 通道5 個(gè)H2O 分子 與S-A 的Zn 配位,同 時(shí)2 個(gè) 水分子簇與S-A 氫鍵作用的體系,記作S-A_1←5H2O·(H2O)2@Wa,其他體系表示法相似。文中計(jì)算工作采用Gaussian16[29]程序。
把文獻(xiàn)[19]的兩種穩(wěn)定構(gòu)型的Ala·Zn2+配合物在水液相下優(yōu)化,得到S-A_1@W 和S-A_2@W及其手性對(duì)映體見(jiàn)圖1。
圖1 水液相下兩種丙氨酸二價(jià)鋅配合物的幾何構(gòu)型Fig.1 Geometric configuration of two alanine divalent zinc complexes in water/liquid phase
計(jì)算表明,S-A_1@W 相對(duì)于S-A_2@W 的吉布斯自由能是-22.7 kJ·mol-1,S-A_1@W 比S-A_2@W 的穩(wěn)定性好。文獻(xiàn)[19]研究表明,S-A_2@W 經(jīng)過(guò)10O—9C 內(nèi)旋轉(zhuǎn)和螯合環(huán)打開(kāi)的過(guò)渡態(tài)向S-A_1@W 異構(gòu),然后再向R-A_1@W 異構(gòu),是其手性轉(zhuǎn)變的優(yōu)勢(shì)通道。因此為節(jié)省篇幅,本工作只討論S-A_1@W 的手性轉(zhuǎn)變(在下文將S-A_1@W簡(jiǎn)單的標(biāo)記為S-A@W)。
文獻(xiàn)[19]研究表明,S-A 可通過(guò)以氧為橋、氮為橋、鋅為橋、氧與氮聯(lián)合為橋以及氧與甲基碳聯(lián)合為橋等多種途徑進(jìn)行氫遷移,實(shí)現(xiàn)手性轉(zhuǎn)變。其中只以氧為橋的通道為第2優(yōu)勢(shì)通道;螯合環(huán)打開(kāi)與質(zhì)子從質(zhì)子化氨基向羰基氧遷移協(xié)同完成后,α-氫分別以鋅和氮為橋遷移的通道為第1優(yōu)勢(shì)通道和第3優(yōu)勢(shì)通道。其他通道無(wú)法通過(guò)水分子做H 遷移橋梁降低決速步能壘變?yōu)閮?yōu)勢(shì)通道,因此為節(jié)省篇幅,水溶劑環(huán)境下S-A 的手性轉(zhuǎn)變只討論以氧、鋅和氮為H 遷移橋梁的3個(gè)通道,分別命名為a、b和c通道。在水液相下,對(duì)于非H遷移反應(yīng),只需考慮隱性水溶劑效應(yīng),顯性水溶劑效應(yīng)可以忽略;對(duì)于H 遷移反應(yīng),除了要考慮隱性水溶劑效應(yīng),通常還要考慮顯性水溶劑效應(yīng),即水分子(簇)做H 遷移媒介的情況。下面對(duì)a、b和c 通道分別進(jìn)行討論,a、b 和c 通道的反應(yīng)歷程分別見(jiàn)圖2、圖3 和圖4,反應(yīng)過(guò)程的勢(shì)能剖面分別見(jiàn)圖5A、圖5B的b線、圖5B和圖5C的c線。
該通道的2 個(gè)基元反應(yīng)都是水分子(簇)做H遷移媒介的情況。Zn配位數(shù)的最大值是6,反應(yīng)物S-A 的14Zn 已與2 個(gè)O 配位,考慮到水分子的作用,14Zn還要與4個(gè)水分子配位。計(jì)算表明,對(duì)于本體系單個(gè)水分子及3個(gè)水分子簇做媒介時(shí)H 遷移反應(yīng)能壘高于2水分子簇做媒介,為節(jié)省篇幅,本小節(jié)只討論2個(gè)水分子簇做媒介的H 遷移反應(yīng)(單個(gè)水分子及3個(gè)水分子簇做媒介時(shí),過(guò)渡態(tài)構(gòu)象相對(duì)不穩(wěn)定)。因此我們研究2 個(gè)水分子簇在S-A 的前面與1C 和10O 氫鍵作用,形成的反應(yīng)物配合物復(fù)合物S-A←4H2O·(H2O)2m@Wa(m 表示2 聚水在S-A的前面)的異構(gòu)。反應(yīng)歷程及過(guò)渡態(tài)矢量見(jiàn)圖2,反應(yīng)的吉布斯自由能勢(shì)能剖面見(jiàn)圖5A。
圖2 水液相下S-A在a通道的手性轉(zhuǎn)變歷程(鍵長(zhǎng)單位:nm)Fig.2 The chiral transition process of S-A in pathway a in water/liquid phase(Bond length unit:nm)
第1基元反應(yīng),是S-A的α-氫13H在水分子簇作用下從1C 向羰基氧10O 遷移。而后S-A←4H2O·(H2O)2m@Wa經(jīng)過(guò)渡態(tài)T1←4H2O·(H2O)2m@Wa,異構(gòu)成中 間 體I1←4H2O· (H2O)2m@Wa。 從S-A←4H2O·(H2O)2m@Wa到T1←4H2O· (H2O)2m@Wa過(guò) 程, 1C—13H、 15O—20H 和 10O—17H 鍵 從 0.109 9、0.097 5 和0.097 2 nm 分 別 拉 伸 至0.177 8、0.130 6和0.102 4 nm 斷裂,骨架二面角6N—1C—4C—9C 從121.5°變 為133.4°,15O 和31H 以 及18O 和29H 之間的氫鍵斷裂。多個(gè)化學(xué)鍵的拉伸斷裂、骨架的形變以及氫鍵的斷裂需要一定的能量。由于過(guò)渡態(tài)的氫鍵角1C—13H—15O、15O—20H—18O 和18O—17H—10O 分別是159.0°、159.9°和155.7°,接近平角,氫鍵較強(qiáng),導(dǎo)致過(guò)渡態(tài)相對(duì)較穩(wěn)定,但結(jié)構(gòu)分析表明過(guò)渡態(tài)八元環(huán)結(jié)構(gòu)偏離平面,又導(dǎo)致過(guò)渡態(tài)不穩(wěn)定。因此T1←4H2O·(H2O)2m@Wa產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘不很高又不很低,能壘值是159.9 kJ·mol-1。與2.1 節(jié)中氣相的此基元反應(yīng)過(guò)渡態(tài)T1_1a產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘305.9 kJ·mol-1相比較,水分子(簇)及水溶劑效應(yīng)的共同作用使該基元的內(nèi)稟能壘大幅降低。
第2 基元反應(yīng),為使問(wèn)題簡(jiǎn)化,中間體I1←4H2O·(H2O)2m@Wa的繼續(xù)異構(gòu),考慮其(H2O)2m與體系的氫鍵解離,(H2O)2在紙面里與I1←4H2O@Wa通過(guò)氫鍵作用形成與I1←4H2O·(H2O)2m@Wa鏡像對(duì)稱的中間體反應(yīng)物I1←4H2O·(H2O)2n@Wa( n 表示2 聚水在S-A 的前面) 。I1←4H2O·(H2O)2n@Wa向R-型產(chǎn)物的異構(gòu)與第1 基元反應(yīng)鏡像對(duì)稱,I1←4H2O·(H2O)2n@Wa經(jīng)過(guò)渡態(tài)T2←4H2O·(H2O)2n@Wa,異構(gòu)得到產(chǎn)物配合物復(fù)合物R-A←4H2O·(H2O)2@Wa,S-A@W 實(shí)現(xiàn)了手性對(duì)映體轉(zhuǎn)變。從I1←4H2O·(H2O)2n@Wa到T2←4H2O·(H2O)2n@Wa過(guò) 程,15O—13H、 18O—20H 和 10O—17H 鍵 從 0.097 8、0.097 8 和0.098 9 nm 分 別 拉 伸 至0.104 6、0.112 1 和0.154 8 nm 斷裂,3 個(gè)O—H 鍵幅度不大的拉伸所需能量不是很多,小于3 個(gè)C—H 鍵斷裂所需能量,并且過(guò)渡態(tài)的八元環(huán)存在3條較強(qiáng)的氫鍵,導(dǎo)致過(guò)渡態(tài)較穩(wěn)定,因此T2←4H2O·(H2O)2n@Wa產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘不高,只有54.2 kJ·mol-1。
文獻(xiàn)[12]的研究表明,水分子(簇)做H 遷移媒介會(huì)使氨基和羧基間的H 遷移能壘升高,因此對(duì)于氨基和羧基間的H 遷移不討論水分子的作用。計(jì)算表明,水分子存在時(shí)水分子的O 優(yōu)先與S-I2b的14Zn 配位,水分子(簇)無(wú)法在α-C 和14Zn之間傳遞H,因此,對(duì)于α-C 和14Zn 之間的H 遷移不討論顯性水溶劑效應(yīng)。水液相下S-A 在b通道的手性轉(zhuǎn)變歷程見(jiàn)圖3,反應(yīng)勢(shì)能面見(jiàn)圖5B 的b線。水液相下從S-I1@Wb還可以直接實(shí)現(xiàn)13H 向14Zn 遷移,命名為b*分通道,反應(yīng)勢(shì)能面見(jiàn)圖5B的b*線。
圖3 水液相下S-A在b通道的手性轉(zhuǎn)變歷程(鍵長(zhǎng)單位:nm)Fig.3 The chiral transition process of S-A in pathway b in water/liquid phase(Bond length unit:nm)
第1 基元反應(yīng)(b 和b*共用),S-A@W 經(jīng)11O—9C 內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)S-T1@W(b,b*),14Zn從去質(zhì)子羧 基 內(nèi) 側(cè) 轉(zhuǎn) 到 外 側(cè),異 構(gòu) 成S-I1@W(b,b*),ST1@W(b,b*)。S-T1@W(b,b*)產(chǎn) 生 的 內(nèi) 稟 能 壘 是24.2 kJ·mol-1。
第2 基 元 反 應(yīng),S-I1@W(b,b*)經(jīng)8H 從 質(zhì) 子 化氨基向羰基氧10O 遷移的過(guò)渡態(tài)S-T2@Wb,異構(gòu)成S-I2@Wb。S-T2@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是40.4 kJ·mol-1。
第3 基元反應(yīng),S-I2@Wb經(jīng)13H 從1C 向14Zn遷移的過(guò)渡態(tài)T3@Wb,異構(gòu)成I3@Wb。從S-I2@Wb到T3@Wb,1C—13H 鍵 長(zhǎng) 從0.109 9 nm 拉 伸 至0.197 1 nm 斷裂,11O—14Zn 鍵長(zhǎng)從0.196 2 nm 拉伸 至0.232 9 nm;二 面 角6N—1C—4C—9C 從119.2°變?yōu)?53.6°,骨架形變明顯;二面角6N—1C—9C—10O 從-6.8°變?yōu)?59.5°,9C—1C 鍵右視順時(shí)針內(nèi)旋轉(zhuǎn)。因此從S-I2@Wb越過(guò)T3@Wb需很多能量,T3@Wb產(chǎn)生了177.2 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘。該能壘遠(yuǎn)高于氣相下此基元的內(nèi)稟能壘1.1 kJ·mol-1[19],說(shuō)明水溶劑對(duì)此基元反應(yīng)起了極顯著的負(fù)催化作用。原因有兩個(gè),一是S-I2@Wb與S-I2b相比較,1C 的電荷從-0.025 e 增加到-0.183 e,13H 的電荷從0.007 e 增加到0.286 e,1C—13H 鍵長(zhǎng)從0.127 0 nm 縮短到0.109 9 nm,1C 對(duì)13H 的庫(kù)侖引力顯著增加;振動(dòng)頻率分析表明,1C—13H鍵的伸縮振動(dòng)頻率從1 281.6 cm-1增加到3 062.3 cm-1,發(fā)生了極顯著的藍(lán)移。二是從S-I2 @ Wb到T3_1@Wb,雖然13H 的電荷從0.286 e 逐漸變?yōu)?0.51 e,但1C 的電荷從-0.183 e 逐漸變?yōu)?.341 e,對(duì)13H負(fù)離子具有庫(kù)侖引力作用。
第4基元反應(yīng),I3@Wb經(jīng)13H 相對(duì)于14Zn左右翻轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)T4@Wb,異構(gòu)成I4@Wb。T4@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘很小,只有2.4 kJ·mol-1。
第5 基元反應(yīng),I4@Wb經(jīng)6N—1C 和9C—1C 鍵協(xié)同內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)T5@Wb,異構(gòu)成與I4@Wb鏡像對(duì)稱的中間體配合物I5@Wb。從I4@Wb到T5@Wb過(guò)程,9C—1C鍵右視逆時(shí)針轉(zhuǎn)內(nèi)旋轉(zhuǎn)45.0°,還要克服來(lái)自12H 的很大的空間位阻,同時(shí)6N—1C 鍵俯視順時(shí)針內(nèi)旋轉(zhuǎn)127.0°,需要很高的能量,因此T5@Wb產(chǎn)生了197.2 kJ·mol-1的內(nèi)稟能壘。
第6基元反應(yīng),I5@Wb經(jīng)13H 相對(duì)于14Zn左右翻轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)T6@Wb,異構(gòu)成I6@Wb。T6@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘很小很小,只有1.6 kJ·mol-1。
第7 基元反應(yīng),I6@Wb經(jīng)過(guò)渡態(tài)T7@Wb,13H 從14Zn 向1C 遷移,異構(gòu)成R-I7@Wb。從I6@Wb到T7@Wb,13H—14Zn 鍵 從0.154 9 nm 拉伸至0.159 9 nm,T7@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是32.5 kJ·mol-1。
第8 基元反應(yīng),R-I7@Wb經(jīng)8H 從羧基氧10O向氨基氮6N 遷移的過(guò)渡態(tài)R-T8@Wb,異構(gòu)成RI8@Wb。R-T8@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘只有1.1 kJ·mol-1,該基元反應(yīng)幾乎無(wú)勢(shì)壘。
第9 基元反應(yīng),R-I8@Wb經(jīng)11O—9C 內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)R-T9@Wb,14Zn 從去質(zhì)子羧基外側(cè)轉(zhuǎn)到內(nèi)側(cè),異構(gòu)成R-A@Wb,R-T9@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是12.9 kJ·mol-1。結(jié)構(gòu)分析表明,R-A@Wb與SA@W 鏡像對(duì)稱,S-A@W 在b 通道實(shí)現(xiàn)了手性對(duì)映體轉(zhuǎn)變。
S-A@W 在b 通道的反應(yīng)歷程及勢(shì)能面,展現(xiàn)了S-A@W 在b 通道手性對(duì)映體轉(zhuǎn)變的過(guò)程與內(nèi)在美。
b*分通道。
第2 基元,S-I1@W(b,b*)經(jīng)13H 從1C 向14Zn 遷移的過(guò)渡態(tài)T2@Wb*,異構(gòu)成S-I2@Wb*。T2@Wb*產(chǎn)生的能壘是345.6 kJ·mol-1。這遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于T3@Wb產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘,原因是從S-I1@W(b,b*)到T2@Wb*,1C—13H 鍵長(zhǎng)從0.109 5 nm 拉伸至0.199 0 nm,斷裂, 11O—14Zn 鍵 長(zhǎng) 從0.192 2 nm 拉 伸 至0.300 2 nm,斷裂;二面角6N—1C—4C—9C 從119.5°變?yōu)?61.7°,二面角6N—1C—9C—10O從-9.7°變?yōu)椋?9.3°。1C—13H鍵的拉伸、11O—14Zn 鍵的拉伸、9C—1C 鍵的內(nèi)旋轉(zhuǎn)及骨架的形變均大于從S-I2@Wb到T3@Wb過(guò)程許多。此基元能壘太高,反應(yīng)通常無(wú)法實(shí)現(xiàn),接下來(lái)的異構(gòu)不予討論。
S-A 在c 通道的手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)歷程及過(guò)渡態(tài)見(jiàn)圖4,反應(yīng)的自由能勢(shì)能面見(jiàn)圖5B和圖5C的c線。
圖4 水液相下S-A在c通道的手性轉(zhuǎn)變歷程(鍵長(zhǎng)單位:nm)Fig.4 The chiral transition process of S-A in pathway c in water/liquid phase(Bond length unit:nm)
第1、2 基元反應(yīng)b、c 通道公用,氣相第3 基元氨基翻轉(zhuǎn)與羧基旋轉(zhuǎn)協(xié)同進(jìn)行的過(guò)程在水液相下變成了分步進(jìn)行的過(guò)程,分為第3、4 基元,原來(lái)氣相的13H 從1C 向6N 遷移的第4 基元現(xiàn)在變?yōu)榈?基元反應(yīng),是該路徑的決速步。計(jì)算表明,水溶劑環(huán)境下水分子(簇)考慮與否對(duì)非H 遷移反應(yīng)的能壘影響不大,對(duì)H 遷移反應(yīng)的能壘影響較大。因此對(duì)第3、4 基元只考慮水溶劑效應(yīng),而對(duì)第5 基元(H 遷移反應(yīng))相似于c 通道,既考慮水分子與14Zn 配位、水分子簇作H 遷移媒介,同時(shí)又考慮水溶劑效應(yīng)。為節(jié)省篇幅,突出重點(diǎn),并兼顧反應(yīng)的連續(xù)性,本節(jié)對(duì)第3、4 基元做一般討論,對(duì)第5基元進(jìn)行詳細(xì)討論,對(duì)后面的過(guò)程只做簡(jiǎn)單說(shuō)明。
第3 基元反應(yīng),S-I2@W(b,c)經(jīng)7H 與2H 左右翻轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)S-T3@Wc,7H 與2H 從左側(cè)翻轉(zhuǎn)到右側(cè),異構(gòu)成S-I3@Wc。7H 與2H 左右翻轉(zhuǎn)所需能量很少,S-T3@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘只有15.0 kJ·mol-1。
第4 基元反應(yīng),S-I3@Wc經(jīng)10O—9C 鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)S-T4m@Wc(或S-T4n@Wc),羧羥基俯視逆時(shí)針轉(zhuǎn)(或順時(shí)針)旋轉(zhuǎn),8H 從羧基外側(cè)轉(zhuǎn)到內(nèi)側(cè),異構(gòu)成S-I4@Wc?;瘜W(xué)鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)所需能量不多,S-T4m@Wc和S-T4n@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘分別是48.6和48.9 kJ·mol-1。
第5 基元反應(yīng),是S-I4@Wc的α-氫在水分子簇作用下從1C向6N遷移。首先14Zn與5個(gè)水分子配位(Zn 配位數(shù)的最大值是6,14Zn 已與一個(gè)O 配位),2 個(gè)水分子簇與6N、13H、28H 以及23H 氫鍵作用,形成中間體反應(yīng)物S-I4←5H2O·(H2O)2m@Wc。而后S-I4←5H2O·(H2O)2m@Wc經(jīng)過(guò)渡態(tài)T5←5H2O·(H2O)2m@Wc,異構(gòu)成中間體I5←5H2O·(H2O)2m@Wc。 從S-I4←5H2O· (H2O)2m@Wc到T5←5H2O·(H2O)2m@Wc,1C—13H 鍵 從0.110 0 nm 拉 伸 至0.151 8 nm,斷裂,30O—32H 鍵從0.100 1 nm 拉伸至0.102 9 nm,斷裂,33O—34H鍵從0.098 2 nm拉伸至0.098 5 nm;二面角6N—1C—4C—9C 從127.5°變?yōu)?57.5°;二面角14Zn—11O—9C—10O從178.3°變?yōu)?65.1°,14Zn←5H2O 集團(tuán)向紙面里大幅翻轉(zhuǎn);30O—23H 及30O—28H 間的氫鍵斷裂。多個(gè)共價(jià)鍵和氫鍵斷裂、骨架形變、及14Zn←5H2O集團(tuán)的大幅翻轉(zhuǎn)需一定的能量,T5←5H2O·(H2O)2m@Wc產(chǎn) 生 的 內(nèi) 稟 能 壘 較 高, 是140.7 kJ·mol-1。
第6 基元是羧羥基H 和Zn 在紙面里外翻轉(zhuǎn)過(guò)程。羧羥基H 和Zn 在紙面里外翻的能壘與水分子簇是否與質(zhì)子化氨基上的H 有氫鍵作用影響甚微,為使問(wèn)題簡(jiǎn)便,此基元反應(yīng)物不考慮I5←5H2O·(H2O)2m@Wc的(H2O)2m。但由于配位鍵較強(qiáng),且Zn在紙面里外翻轉(zhuǎn)所需能量的多少與是否有水分子與其配位密切相關(guān),此基元仍考慮有5個(gè)水分子與I5 配位。因此,把此基元的反應(yīng)物視為I5←5H2O@Wc。I5←5H2O·(H2O)2m@Wc經(jīng)10O—9C 和11O—9C 協(xié)同內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)T6←5H2O@Wc,8H從紙面外轉(zhuǎn)到紙面里,Zn與5個(gè)水集團(tuán)從紙面里轉(zhuǎn)到紙面外,異構(gòu)成I6←5H2O@Wc。此基元是2 個(gè)化學(xué)鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn),所需能量很少,T6←5H2O@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘大約是6.5 kJ·mol-1。
第7 基元反應(yīng)與本小節(jié)第5 基元反應(yīng)鏡像對(duì)稱。I6←5H2O@Wc的質(zhì)子化氨基的7H 與紙面里的2 個(gè)水分子簇氫鍵作用,形成此基元的反應(yīng)物I6←5H2O·(H2O)2n@Wc。I6←5H2O·(H2O)2n@Wc經(jīng)3 質(zhì)子協(xié)同遷移的過(guò)渡態(tài)T7←5H2O·(H2O)2n@Wc,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物R-I7←5H2O·(H2O)2n@Wc,S-A@W 實(shí)現(xiàn)了手性轉(zhuǎn)變。從I6←5H2O·(H2O)2n@Wc到T7←5H2O·(H2O)2n@Wc,6N—7H、33O—32H 和30O—13H 鍵拉伸斷裂所需能量不是很多,且T7←5H2O·(H2O)2n@Wc的七元環(huán)結(jié)構(gòu)存在較強(qiáng)的氫鍵,構(gòu)象相對(duì)穩(wěn)定,因此T7←5H2O·(H2O)2n@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘不高,是83.2 kJ·mol-1。
第8 基元反應(yīng)與本小節(jié)第4 基元反應(yīng)鏡像對(duì)稱,羧羥基H 的旋轉(zhuǎn)能壘與Zn 是否與水分子配位關(guān)系不大,為使問(wèn)題簡(jiǎn)便,將R-I7@Wc視為此基元反應(yīng)物。R-I7@Wc經(jīng)10O—9C 鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)R-T8m@Wc或R-T8n@Wc,8H 在紙面外(或紙面內(nèi))從羧基內(nèi)側(cè)轉(zhuǎn)到外側(cè),異構(gòu)成R-I8@Wc。R-T8m@Wc和R-T8n@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘分別是46.1和45.9 kJ·mol-1。
第9基元反應(yīng)與本小節(jié)第3基元反應(yīng)鏡像對(duì)稱。R-I8@Wc經(jīng)氨基氫左右翻轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)R-T9@Wc,7H 和12H 從6N 的右側(cè)翻轉(zhuǎn)到左側(cè),異構(gòu)成RI9@Wc。R-T9@Wc產(chǎn)生的內(nèi)稟能壘是4.0 kJ·mol-1。
R-I9@Wc同于R-I7@Wb,其接下來(lái)的第10 和11基元,同于R-I7@Wb的異構(gòu),見(jiàn)2.1.2小節(jié)S-A在b 通道手性轉(zhuǎn)變的第8 和9 基元。最終得到產(chǎn)物R-A@Wc,S-A@W在c通道實(shí)現(xiàn)手性對(duì)映體轉(zhuǎn)變。
S-A@W 在c 通道的反應(yīng)歷程及勢(shì)能面,同樣展現(xiàn)了手性對(duì)映體轉(zhuǎn)變的過(guò)程美與內(nèi)在美。
從圖5 可以看出,S-A@W 手性轉(zhuǎn)變的優(yōu)勢(shì)通道是c,第5 基元是決速步驟,能壘是140.7 kJ·mol-1。亞優(yōu)勢(shì)通道是a,決速步是第1 基元,能壘是159.9 kJ·mol-1。氣相反應(yīng)的優(yōu)勢(shì)通道b 在水液相下變?yōu)榱觿?shì)通道,第5 基元是決速步,能壘是194.2 kJ·mol-1。從前面的討論可知,此能壘來(lái)自α-H 從α-C 向Zn 遷移的過(guò)渡態(tài),然而氣相下該通道的決速步能壘來(lái)自第2 基元9C—1C 鍵內(nèi)旋轉(zhuǎn)的過(guò)渡態(tài)[19]。溶劑效應(yīng)改變了反應(yīng)通道優(yōu)劣的排序及決速步驟。140.7 kJ·mol-1遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于溫和反應(yīng)能壘80.0 kJ·mol-1[30],距離化學(xué)反應(yīng)極限能壘167.0 kJ·mol-1[30]不算太遠(yuǎn),說(shuō)明通常水液相下S-A 只能微量地消旋。
圖5 水液相下S-A手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)的吉布斯自由能勢(shì)能面Fig.5 Gibbs free energy potential energy surface of S-A chiral transition reaction in water/liquid phase
在SMD/MN15/6-311++G (3df, 2pd)//SMD/M06/6-31++G(d, p)雙水平,對(duì)兩性丙氨酸二價(jià)鋅配合物S-A 在水液相下手性轉(zhuǎn)變的研究得到如下結(jié)論:
1)S-A@W 在c 通道的手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)最具優(yōu)勢(shì),決速步自由能壘是140.7 kJ·mol-1,來(lái)自α-H從α-C向氨基N遷移的過(guò)渡態(tài)。
2)S-A@W 在a 通道的手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)是亞優(yōu)勢(shì)通道,決速步自由能壘是159.9 kJ·mol-1,來(lái)自α-H從α-C向羰基O遷移的過(guò)渡態(tài)。
3)S-A@W 在b 通道的手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)為劣勢(shì)通道,決速步自由能壘是194.2 kJ·mol-1,來(lái)自α-H從α-C向Zn遷移的過(guò)渡態(tài)。
結(jié)果表明,丙氨酸鋅在水液相下較難消旋,其用于生命體補(bǔ)鋅及丙氨酸具有比較好的安全性。
中山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)(中英文)2021年4期