王利民,劉 鍇
(河北省中醫(yī)院腫瘤科 石家莊 050011)
據(jù)最新癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),肺癌是臨床最常見的癌癥類型及癌癥死亡首要原因,主要以非小細(xì)胞肺癌居多,其中腺癌是非小細(xì)胞肺癌的主要類型[1-2]。在過去的幾十年中,肺癌的病理結(jié)構(gòu)逐漸改變,肺腺癌成為最流行的亞型,約占肺癌總數(shù)的70%,尤其是在東亞[2-3]。并有數(shù)據(jù)顯示,以實(shí)性或亞實(shí)性結(jié)節(jié)為特征的早期肺腺癌的比例顯著增加[4]。因此研究專注于肺腺癌的發(fā)生發(fā)展及其潛在發(fā)病機(jī)制,對(duì)其臨床治療具有積極意義。TUBA1C 是與微管結(jié)構(gòu)相關(guān)的α-微管蛋白亞型,微管結(jié)構(gòu)是一種多功能細(xì)胞骨架蛋白,參與關(guān)鍵的細(xì)胞作用,在有絲分裂和細(xì)胞分裂過程中必不可少[5]。研究表明TUBA1C 與許多癌癥的細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期有關(guān),其表達(dá)上調(diào)可以顯著影響腫瘤的生長和進(jìn)展[6-7]。并發(fā)現(xiàn),TUBA1C 是細(xì)胞周期信號(hào)通路中的關(guān)鍵中介,在多種惡性腫瘤中異常表達(dá),參與腫瘤的增殖、遷移及侵襲,是腫瘤靶向治療的新靶標(biāo)[5,7-8]。基于此本研究擬探究TUBA1C 在肺腺癌中的表達(dá)作用機(jī)制,以期為臨床肺腺癌的診治提供新的研究靶點(diǎn)。
1.1 研究對(duì)象 人肺腺癌細(xì)胞系A(chǔ)549 購于中國科學(xué)院細(xì)胞庫,含10ml/dl 胎牛血清RPMI-1640 培養(yǎng)液,同時(shí)加入青霉素(100 IU/ml)和鏈霉素(100μg/ml),在37℃,5ml/dl CO2飽和濕度培養(yǎng)箱培養(yǎng)。
1.2 儀器與試劑 胎牛血清、DMEN 培養(yǎng)液購自美國Gibco 公司;Lipo2000 試劑盒購自美國Invitrogen 公司;MTS 反應(yīng)液購自南京凱基生物技術(shù)有限公司;酶標(biāo)儀購自美國Bio-rad 公司;胰酶購自美國Gibco 公司;流式細(xì)胞儀購自美國Beckman Coulter 公司;兔抗人E2F1 單克隆抗體、兔抗人MYC 單克隆抗體購自英國Abcam 公司;青霉素、鏈霉素購自北京索萊寶科技有限公司。
1.3 方法
1.3.1 臨床數(shù)據(jù)庫篩選:在臨床數(shù)據(jù)庫GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)[9]中探索目的蛋白的表達(dá)特征以及臨床預(yù)后相關(guān)性。
1.3.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染:取對(duì)數(shù)生長期細(xì)胞以1×106/孔濃度接種于6 孔板,待細(xì)胞融合度達(dá)80%~90%時(shí)按照Lipo2000 試劑盒說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染。
1.3.3 細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn):取轉(zhuǎn)染培養(yǎng)后各組細(xì)胞消化、重懸,5×103個(gè)/孔接種于96 孔板,每孔設(shè)3 個(gè)生物重復(fù),37℃,5ml/dl CO2培養(yǎng)箱孵育48 h;按照MTS∶培養(yǎng)液=1∶20 比例配制MTS 反應(yīng)液,每孔加入100 μl,繼續(xù)培養(yǎng)4 h;采用酶標(biāo)儀在490 nm處測量各孔吸光度值,繪制細(xì)胞增殖曲線,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
1.3.4 克隆形成實(shí)驗(yàn):取對(duì)數(shù)生長期各組細(xì)胞胰酶消化吹打制成單個(gè)細(xì)胞,將細(xì)胞懸浮在含10ml/dl胎牛血清DMEN培養(yǎng)液中;細(xì)胞懸液梯度倍數(shù)稀釋,接種于10 ml 預(yù)溫培養(yǎng)液皿,37℃ 5ml/dl CO2及飽和濕度培養(yǎng)箱培養(yǎng)6~14 天至出現(xiàn)肉眼可見克隆時(shí)終止培養(yǎng);收集細(xì)胞,PBS 洗滌兩次,4g/dl 多聚甲醛固定15 min,0.5g/dl 結(jié)晶紫染色15 min,水洗直至背景紫色洗掉,室溫晾干;倒置培養(yǎng)皿疊加一張透明膠片,于顯微鏡下計(jì)數(shù)克隆數(shù),計(jì)算克隆形成速率。
1.3.5 劃痕遷移實(shí)驗(yàn):取轉(zhuǎn)染培養(yǎng)后各組細(xì)胞胰酶消化,重懸,調(diào)整細(xì)胞密度為2×105個(gè)/ml 接種于6 孔板培養(yǎng)過夜;次日用10 μl 移液器槍頭垂直于6孔板在每孔底部劃線,加入無血清培養(yǎng)液分別培養(yǎng)0 和24 h,于倒置顯微鏡下觀察、拍照,測量細(xì)胞劃痕寬度,計(jì)算細(xì)胞遷移率。
1.3.6 細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn):收集對(duì)數(shù)生長期各組細(xì)胞胰酶消化到離心管,3 000 g離心3 min,收集細(xì)胞沉淀,預(yù)冷PBS 洗滌2 次重懸,滴加等體積預(yù)冷的無水乙醇,吹打混勻,靜置24 h;細(xì)胞離心收集固定細(xì)胞,PBS 洗滌,加入500 μl PI/Triton X-100 染液[Triton X-100(0.10%)5μl, DNAsefree RNAsse A(sigma)2mg,PI(40μg/ml)10μl,補(bǔ)dd H2O 至500μl)]避光孵育30 min,于流式細(xì)胞儀上進(jìn)行檢測分析。
1.3.7 蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn):收集轉(zhuǎn)染后各組細(xì)胞加入裂解液進(jìn)行裂解,提取細(xì)胞總蛋白并測定其濃度和純度;取40 μg 蛋白樣品制樣,SDS-PAGE 凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,5g/dl 脫脂牛奶室溫封閉1 h,加入待測蛋白稀釋一抗室溫孵育4h,搖床洗膜3 次,4℃過夜;次日去除多余一抗,洗膜4 次,加入標(biāo)記二抗室溫孵育1 h,洗膜4 次,每次5 min,暗房顯影。1.3.8 基因功能分析:通過cBioPortal[10-11]臨床數(shù)據(jù)庫找到與TUBA1C 共表達(dá)的基因,利用metascape 進(jìn)行信號(hào)通路分析,找尋TUBA1C 可能參與癌癥進(jìn)程發(fā)揮功能的通路。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件SPSS 25.0 對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,兩組比較采用t檢驗(yàn),多組比較采用one-way ANOVA 分析,組間兩兩比較采用LSD-t法檢驗(yàn);癌組織及癌旁正常組織中基因表達(dá)差異比較采用配對(duì)t檢驗(yàn),P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 TUBA1C 在肺腺癌中的表達(dá)屬性 見圖1。研究通過檢索GEPIA 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),較相比鄰近正常組織,肺腺癌組織中TUBA1C 顯著高表達(dá)(P<0.05)(圖1a),且高表達(dá)與預(yù)后差具有明顯的臨床相關(guān)性(Logrank P=9.3e-5)(圖1b);30 組肺腺癌臨床樣本中TUBA1C 表達(dá)水平(6.4±1.3)顯著高于癌旁正常組織(5.2±0.9),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=4.157,P<0.001),且隨著癌癥的不斷惡化,TUBA1C 表達(dá)逐漸升高(P=0.003 49)(圖1c)。
圖1 TUBA1C 在肺腺癌中的表達(dá)屬性
2.2 TUBA1C 促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移 見圖2。qRT-PCR 檢測顯示,與對(duì)照siCTL 組(1.02±0.13)相比,siTUBA1CA#1 組(0.25±0.06)和siTUBA1 CA#2 組(0.22±0.08) 細(xì)胞中TUBA1C 相對(duì)表達(dá)顯著降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=68.799,P<0.001),表明轉(zhuǎn)染siRNA 介導(dǎo)敲低TUBA1C 表達(dá)的細(xì)胞系構(gòu)建成功,可用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。細(xì)胞實(shí)驗(yàn)檢測顯示,轉(zhuǎn)染培養(yǎng)3,4 和5 天時(shí)siTUBA1CA#1組和siTUBA1CA#2 組細(xì)胞增殖A值明顯低于對(duì)照組(F=7.000~27.780,均P<0.05)(見圖2a,表1)。siTUBA1CA#1 組(41.2±1.5)和siTUBA1 CA#2 組(40.3±1.3)細(xì)胞克隆形成率明顯低于對(duì)照組(72.4±2.2),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=342.482,P<0.001)(如圖2b);兩實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞遷移率為73.4±3.2 和72.1±2.8,也明顯低于對(duì)照組(98.6±1.7),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=95.778,P<0.001)(圖2c);兩實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞周期為52.7%和50.1%,較對(duì)照組(41.8%)顯著阻滯在G1 期(圖2d)。
圖2 TUBA1C 促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移
表1 不同培養(yǎng)時(shí)間點(diǎn)各組細(xì)胞增殖A 值比較(±s)
表1 不同培養(yǎng)時(shí)間點(diǎn)各組細(xì)胞增殖A 值比較(±s)
時(shí)間(天)siCTL 組siTUBA1CA#1 組siTUBA1CA#2 組FP 1 0.20±0.010.20±0.030.19±0.020.2140.813 2 0.32±0.030.28±0.040.28±0.031.4120.314 3 0.41±0.040.31±0.020.33±0.047.0000.027 4 0.52±0.030.36±0.040.37±0.0321.265<0.001 5 0.61±0.050.39±0.030.40±0.0427.780<0.001
2.3 TUBA1C 激活E2F1 和MYC 的表達(dá) 見圖3。通過metacape 網(wǎng)站分析與TUBA1C 共表達(dá)基因參與的信號(hào)通路,發(fā)現(xiàn)TUBA1C 可能參與調(diào)控E2F1和MYC 的表達(dá),從而促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移(圖3a)。細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),siTUBA1CA#1組(0.21±0.02,0.33±0.03)和siTUBA1CA#2 組(0.20±0.03,0.36±0.02)細(xì)胞中E2F1 和MYC mRNA 表達(dá)水平較對(duì)照組(1.01±0.03,1.00±0.02)明顯降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=883.773,758.294,均P<0.001)(圖3b);同時(shí)E2F1 和MYC 的蛋白水平也顯著降低(圖3c)。
圖3 TUBA1C 激活E2F1 和MYC 的表達(dá)
2.4 TUBA1C 通過激活E2F1 和MYC 的表達(dá)促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移 見圖4,表2?;匮a(bǔ)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),敲低TUBA1C 顯著抑制肺腺癌細(xì)胞的增殖和遷移,同時(shí)將細(xì)胞周期顯著阻滯在G1 期。但在敲低TUBA1C 表達(dá)的肺腺癌細(xì)胞中分別回補(bǔ)E2F1 和MYC 以及共回補(bǔ)E2F1 和MYC 后,細(xì)胞增殖速率(圖4a)、遷移速率(圖4b)以及細(xì)胞周期(如圖4c)較單純敲低TUBA1C 組相比均逐漸恢復(fù)正常(P<0.01),證明TUBA1C 通過激活E2F1和MYC 的表達(dá)促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞的增殖和遷移。
圖4 TUBA1C 通過激活E2F1 和MYC 的表達(dá)促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移
表2 不同培養(yǎng)時(shí)間點(diǎn)各組細(xì)胞增殖A 值比較(±s)
表2 不同培養(yǎng)時(shí)間點(diǎn)各組細(xì)胞增殖A 值比較(±s)
注:與siCTL 組相比,*P<0.05.
時(shí)間(天)siCTL 組siTUBA1CA 組 siTUBA1CA+ E2F1 組 siTUBA1CA+ MYC 組 siTUBA1CA+ E2F1+MYC 組FP 10.20±0.010.20±0.020.21±0.010.20±0.030.22±0.021.0910.412 20.32±0.030.25±0.030.30±0.020.30±0.010.40±0.0216.556<0.001 30.41±0.040.32±0.030.39±0.030.39±0.020.52±0.0316.691<0.001 40.52±0.030.36±0.020.50±0.040.50±0.030.63±0.0329.426<0.001 50.61±0.050.38±0.030.58±0.040.58±0.030.74±0.0433.240<0.001
肺腺癌是非小細(xì)胞肺癌最常見的組織學(xué)亞型,目前盡管有多種方法可以治療,但其臨床死亡率仍較高[12]。因此,尋找新的治療目標(biāo)以改善治療方法至關(guān)重要。本研究經(jīng)檢索GEPIA 數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)肺腺癌中TUBA1C 顯著高表達(dá),惡性程度越高其表達(dá)水平越高,具有高表達(dá)預(yù)后差特征,暗示TUBA1C在肺腺癌發(fā)生發(fā)展中的致癌作用。因此研究通過分子生物學(xué)細(xì)胞研究對(duì)TUBA1C 在肺腺癌細(xì)胞中的作用進(jìn)行了驗(yàn)證,首先研究在肺腺癌細(xì)胞中通過轉(zhuǎn)染陰性干擾序列siRNA 介導(dǎo)敲低TUBA1C 表達(dá),分別通過細(xì)胞增殖、遷移、克隆實(shí)驗(yàn)及細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了TUBA1C 對(duì)肺腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響,發(fā)現(xiàn)敲低TUBA1C 表達(dá)明顯抑制了肺腺癌細(xì)胞的增殖、遷移及克隆形成率,阻滯細(xì)胞周期在G1 期,提示TUBA1C 在肺腺癌發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮致癌作用。故進(jìn)一步探究其在肺腺癌發(fā)生發(fā)展中的致癌作用分子機(jī)制具有重要意義。
研究通過分析與TUBA1C 共表達(dá)基因參與信號(hào)通路發(fā)現(xiàn),TUBA1C 可能參與調(diào)控經(jīng)典致癌基因E2F1 和MYC。E2F 是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)與腫瘤抑制因子pRB 結(jié)合的細(xì)胞蛋白,當(dāng)與pRB 家族成員結(jié)合時(shí),E2Fs 充當(dāng)轉(zhuǎn)錄抑制因子,而游離的E2Fs 激活轉(zhuǎn)錄[13]。E2F1 是E2F 之一,并且已知在不同的信號(hào)傳導(dǎo)途徑(例如細(xì)胞周期,細(xì)胞自我更新,分化和凋亡)中上調(diào)靶基因[14]。E2F1 在肝細(xì)胞癌、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、胰腺癌[15-17]等許多癌癥中被下調(diào),而在黑色素瘤的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)E2F1 的過度表達(dá)[18]。在具有促進(jìn)腫瘤作用的功能之后,E2F1 的表達(dá)與腫瘤細(xì)胞的增殖和抗凋亡相關(guān)[19]。c-MYC 癌蛋白在腫瘤發(fā)生中起著重要作用[20]。正常細(xì)胞中,c-MYC的表達(dá)受到轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后機(jī)制的嚴(yán)格控制[21]。通過基因擴(kuò)增,染色體易位或插入誘變,c-MYC 在一半以上的人類癌癥(包括肺癌、乳腺癌和結(jié)腸癌)中被激活[22]。使用細(xì)胞培養(yǎng)和小鼠模型進(jìn)行的廣泛研究已很好地表征了c-MYC 的強(qiáng)致癌活性[23]。既往研究已證明c-MYC 控制基因組中10%~15%基因的表達(dá)[20]。最近研究也表明c-MYC 是已經(jīng)活躍的啟動(dòng)子的全局?jǐn)U增子[24]。通過調(diào)節(jié)靶基因的表達(dá),c-Myc 可調(diào)節(jié)多種細(xì)胞過程,包括細(xì)胞增殖、分化、代謝和基因組不穩(wěn)定性[25]。而本研究通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),敲低TUBA1C 表達(dá)明顯降低了E2F1和MYC mRNA 蛋白表達(dá)水平,說明在肺腺癌細(xì)胞中TUBA1C 正調(diào)控E2F1 和MYC 表達(dá),因此猜測TUBA1C 可能通過激活E2F1 和MYC 從而促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移。為進(jìn)一步驗(yàn)證該猜測,研究經(jīng)細(xì)胞回補(bǔ)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),敲低TUBA1C 表達(dá)的細(xì)胞在回補(bǔ)E2F1 和MYC 后其細(xì)胞增殖、遷移速率及細(xì)胞周期較單純TUBA1C 低表達(dá)組明顯恢復(fù),證實(shí)TUBA1C 通過激活E2F1 和MYC 的表達(dá)從而促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,參與肺腺癌的發(fā)生發(fā)展。
綜上所述,TUBA1C 通過激活E2F1 和MYC的表達(dá)促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞增殖和遷移、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,參與肺腺癌的惡性發(fā)展進(jìn)程。
現(xiàn)代檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志2021年4期