利用cBioPortal分析P53在肌層浸潤(rùn)型膀胱癌中的表達(dá)、突變及臨床意義

梁維朝，高偉偉*

（桂平市人民醫(yī)院腫瘤科，廣西 貴港 537200）

膀胱癌的發(fā)病率越來(lái)越高，是男性第四種常見(jiàn)的癌種，嚴(yán)重危害人類(lèi)的健康[1]。膀胱癌發(fā)生機(jī)制與基因突變及新生血管形成密切相關(guān)。p53突變?cè)谀蚵飞掀つ[瘤最常見(jiàn)的遺傳事件。p53是一種充分表征的腫瘤抑制基因， p53突變與腫瘤進(jìn)展和預(yù)后有關(guān)[2]。本研究應(yīng)用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)提供的數(shù)據(jù)分析p53在肌層浸潤(rùn)型膀胱癌中的表達(dá)、突變及臨床意義。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)材料收集

從http://www.cBioPortal.org/中下載413例 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)提供的肌層浸潤(rùn)型膀胱癌臨床資料數(shù)據(jù)及p53 RNASeq V2的數(shù)據(jù)，進(jìn)行分析。

1.2 數(shù)據(jù)集篩選與臨床參數(shù)資料相關(guān)研究

將標(biāo)本樣品的ID號(hào)將病人信息整合成EXCEL表格，刪除缺失或部分資料缺失的數(shù)據(jù)，按照p53表達(dá)值從高到底排列，取中位數(shù)為截點(diǎn)，分低表達(dá)組206例，高表達(dá)組201例，分析p53的表達(dá)與臨床之間的相關(guān)性。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理方法

使用SPSS 22.0處理數(shù)據(jù)。計(jì)數(shù)資料以率（%）表示，比較采用x2檢驗(yàn)，以P＜0.05表示有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用Spearman相關(guān)分析p53基因表達(dá)與相關(guān)因素之間關(guān)系等。將有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的指標(biāo)納入cox模型行多因素分析。

2 結(jié) 果

2.1 突變情況

413例肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者，P53突變比率50%(207/413)；在207例p53基因突變病例中，錯(cuò)義突變占77.8%（161/207），截短突變32.9%(68/207)，錯(cuò)義突變+截短突變22例，框移突變1例。

2.2 p53的表達(dá)與臨床病理資料及突變的相關(guān)性

p53的表達(dá)與 AJCC P TNM分期、腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移，臨床分期在Spearman相關(guān)分析中呈負(fù)相關(guān)（P＜0.05），而與腫瘤淋巴管浸潤(rùn)和病理分級(jí)呈正相關(guān)（P＜0.05），p53的表達(dá)與突變無(wú)相關(guān)性。t檢驗(yàn)得出，P53按膀胱癌腫瘤病理分型低級(jí)別（2510.44±960.50）和高級(jí)別（1669.41±968.28）的表達(dá)有差異（P＜0.05），其余AJCC p TNM分期、臨床分期、突變的p53的表達(dá)沒(méi)有差異（P＞0.05）。

2.3 p53表達(dá)與肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者預(yù)后分析

Kaplan-Meier檢驗(yàn)法分析p53表達(dá)與肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者總生存期、無(wú)病生存期無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＞0.05），P53的表達(dá)可能與肌層浸潤(rùn)型膀胱癌的預(yù)后無(wú)關(guān).與cBioPortal分析結(jié)果一致。

2.4 p53與肌層浸潤(rùn)型膀胱癌預(yù)后的 COX 多因素分析

將單因素分析中對(duì)預(yù)后有影響的指標(biāo)納入多因素COX分析，結(jié)果提示腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及浸潤(rùn)，腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是影響肌層浸潤(rùn)型膀胱癌預(yù)后的獨(dú)立不良因素（P＜0.05），而P53在肌層浸潤(rùn)型膀胱癌的表達(dá)以及發(fā)生突變，并不是影響肌層浸潤(rùn)型膀胱癌預(yù)后的獨(dú)立因素。

3 討 論

大多數(shù)膀胱癌來(lái)自尿路上皮細(xì)胞，大約75%的患者是非肌層浸潤(rùn)型膀胱癌，而肌層肌層浸潤(rùn)型膀胱癌約占比25%。盡管醫(yī)療技術(shù)不斷發(fā)展，但肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者的治療和預(yù)后基本沒(méi)有改變。P53可分為野生型和突變型。對(duì)于突變型P53，突變方式較多等。而野生型P53為正?；?，其編碼的p53蛋白半衰期短，免疫組化難以檢測(cè)；突變型編碼的p53蛋白空間構(gòu)象發(fā)生改變，半衰期延長(zhǎng)，免疫組化可測(cè)出較高的P53蛋白表達(dá)量，故如果免疫組會(huì)測(cè)到較高的p53表達(dá)量則可以判斷為突變型P53基因。p53可作為細(xì)胞內(nèi)的一個(gè)強(qiáng)大的轉(zhuǎn)錄因子,當(dāng)DNA發(fā)生損傷時(shí)，p53可被不同的信號(hào)通路激活并保持穩(wěn)定, 增強(qiáng)其下游多種基因的轉(zhuǎn)錄而引起細(xì)胞周期阻滯、凋亡或衰老, 以保持細(xì)胞基因組的完整性，清除損傷細(xì)胞，這些生物學(xué)作用取決于不同的應(yīng)激信號(hào)和細(xì)胞類(lèi)型。

本次研究的樣本中，約半數(shù)發(fā)生了p53基因突變，發(fā)生了錯(cuò)義突變、截短突變，少部分樣本錯(cuò)義突變和截短突變同時(shí)存在，發(fā)生突變率高。行p53突變與肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者的預(yù)后分析，p53的表達(dá)與AJCC pTNM分期、腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移，臨床分期呈負(fù)相關(guān)（P＜0.05），而與腫瘤淋巴管浸潤(rùn)和病理分級(jí)中呈正相關(guān)（P＜0.05），與突變無(wú)相關(guān)性（P＞0.05）。生存分析提示，有無(wú)突變對(duì)肌層浸潤(rùn)型膀胱癌患者無(wú)病生存期及總生存期無(wú)影響（P＞0.05）。認(rèn)為p53的突變對(duì)膀胱癌復(fù)發(fā)的預(yù)測(cè)無(wú)多大的作用。但也有學(xué)者認(rèn)為P53的突變可作為評(píng)估膀胱癌預(yù)后的指標(biāo)[3-4]，這與本次研究結(jié)果不一致。筆者分析本次研究的樣本，全部有肌層浸潤(rùn)，分期靠后患者病例數(shù)較多，可能是樣本差異導(dǎo)致結(jié)果的不一致。而其中的機(jī)制，值得深入研究。p53是一個(gè)經(jīng)典的抑癌基因，在多種癌癥中與患者預(yù)后相關(guān)。在肌層浸潤(rùn)型膀胱癌的研究中，其相關(guān)性卻存在爭(zhēng)議。本次研究肌層浸潤(rùn)型膀胱癌P53突變患者與未突變患者行生存分析顯示，兩者的總生存期、無(wú)病生存期尚不能認(rèn)為有差異（P＞0.05）。目前為止，還沒(méi)有充分證據(jù)認(rèn)為p53突變可以作為判斷肌層浸潤(rùn)型膀胱癌預(yù)后的獨(dú)立因素。

綜上所述， P53在肌層浸潤(rùn)型膀胱癌中發(fā)生突變率高，在突變組中和未突變組中生存期和無(wú)病生存期未能發(fā)現(xiàn)有明確差異,尚不能認(rèn)為p53突變可影響肌層浸潤(rùn)型膀胱癌的預(yù)后。